3QHMA

Crystal analysis of the complex structure, e342a-cellotetraose, of endocellulase from pyrococcus horikoshii
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGAFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 113
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qhmA00
1WZKA 3F5KA 1P6WA 2EPKX 4JHZA 1E70M 1H5VA 2W92A 1HN1A 3CMGA 4JCLA 1OD8A 2FDMA 1WDRA 1XD1A 4JZ5A 4AD5A 2F8QA 2E4TA 1FP9A 3AIVA 3T2QA 2X8RA 4PUDA 4UOZA 2X0YA 2ZUMA 4CVUA 1GOQA 2GUYA 3MSGA 1UZ4A 5CQ1A 3I3BA 2VX6A 4AWEA 1LL7A 2VQTA 2UWFA 3EMQA 5IXEA 3VGHA 3WQ4A 5DEZA 1QW9A 1W2PA 5A2AA 2PWGA 4J7RA 1KBBA 2W91A 2J7GA 1UHVA 1W1TA 2DPEA 2W5FA 5A6BA 5IHSA 3VIOA 4MNJA 9CGTA 4YN5A 3ZQ9A 1JFHA 4Z2LA 1PX3A 1H4PA 1CBGA 4Z2GA 3VTRA 2GJXB 2VCAA 4JKKA 3ZSTA 1G1YA 3UEQA 2J74A 1M01A 4HPHA 3I3DA 4FLRA 5LA1A 3ARXA 4IUGA 2OWXA 3B9DA 1TVPA 4IM4A 4J3UA 4PCSA 1XCWA 1KGWA 2EPOA 1C90A 1QNOA 4P7NA 3VMPA 3VOCA 1SR0A 2VO5A 4PTXA 2Y8VA 2GFTA 1UOKA 4J3VA 1EHAA 1PZ2A 4JFVA 1JL8A 4W8AA 4UOJA 4E4PA 2J78A 2WC4A 3AIBA 3AMGA 4D1JA 1HL9A 3WF1A 2ESCA 5M03A 1QPKA 5BXTA 3ZIZA 3AIUA 4QP0A 1BSIA 1GQJA 1KCKA 4Q22A 3OGVA 5BXSA 3U5YA 5LA2A 4AZGA 1JFXA 1X6LA 3DYPA 1R7AA 4OBRA 1UH2A 1IT0A 1M7XA 1J18A 1OIMA 2BV9A 4Z2HA 3CHFA 3PHAA 4M1RA 2WVVA 3UCQA 5A69A 4HA1A 5D8WA 4U31A 4Z2JA 1C8YA 2FHCA 3WNMA 4MAVA 1MXDA 2WMHA 1V3KA 3WQ5A 1J11A 1S46A 4P8XA 1UR1A 3VD3A 2BHYA 2VOTA 3MUY1 3K46A 1GOWA 1GQLA 3CHEA 3AS2A 3AYSA 5HNNA 1V6WA 3BAXA 1MQQA 4DUWA 1VFMA 4PSRA 1J0IA 4PBGA 1B3VA 3BAJA 1UKQA 2X09A 3BCDA 1J0HA 3ZT5A 4B3KA 1NOFA 2YDQA 1NWSA 1W9UA 1JZ6A 2DT2A 4FLQA 1NWUA 4DM1A 2QHAA 5I77A 3ZR5A 2NT1A 1V0MA 2Q8XA 1XSKA 2E8YA 3CO4A 1WB0A 1GHRA 5A3HA 2D1ZA 1E73M 3UESA 2VQUA 5JIWA 5C70A 3WDPP 3F5LA 3RIKA 2V5CA 4B9YA 3ARPA 4FMVA 5EBAA 1G0CA 4W85A 5GQBA 3WMBA 5CJ5A 1UWSA 1R7OA 2XVGA 4F79A 3WKZA 4HZ6A 1CXFA 2YIHA 3MU7A 5E6YA 1E72M 2Y2WA 4AIEA 1JAEA 4IPNB 2G3MA 3SCOA 4P7RA 4WKFA 1ITCA 2CBJA 4MDOA 4S3KA 2YJQA 1WAWA 3K4AA 5GNZA 1ZL1A 1WDQA 3NSXA 3KZSA 5A2BA 3WY1A 1BPLB 3HMCA 5M5DA 2VRKA 1K9EA 1PX4A 2EBNA 4YHGA 1UD6A 3CUGA 1CDGA 1H49A 4OIFA 1U30A 4QLJA 4AZ6A 3VDAA 3QHMA 2RGLA 1H1NA 5JUVA 3PZUA 3GDBA 3FY1A 4GQRA 1CGXA 5M17A 4E8CA 2WVSA 4XB3A 3L4UA 4HMEA 1KR1A 3JUGA 3WFZA 4GI6A 4CN6A 3GNOA 1E3XA 3VIPA 1OB0A 1E6SM 5A6KA 2VRJA 2WSPA 4WSKA 2E0PA 1SMDA 5FD0A 4AXNA 1GVYA 3N1AA 1LLOA 1E56A 1I1WA 4OJYA 4W88A 4EANA 1EA9C 1HKJA 3IANA 1E9LA 4E8DA 1ZU8A 2ZUVA 2GJRA 2PF0A 4WKHA 2UY3A 5D8ZA 1CIUA 4HOWA 4PTWA 7TAAA 3A4AA 3VIHA 2WAGA 1QHPA 4B16A 2WLYA 3FHAA 2YA2A 1WZMA 2JF7A 5JBDA 1NP0A 1JXKA 3LPGA 5GPRA 1XH1A 3CHDA 2WMIB 1WDPA 2G4FA 2O9OA 1JZ3A 1UD4A 2PBOA 1Z32X 1BVZA 3WNPA 2W63A 2X05A 2UY5A 4GINA 1VIWA 2ZXAA 4U5IA 3I3EA 3EMZA 3TTQA 2J7CA 2RGMA 3U7BA 1PBGA 1BYAA 4GKLA 4HOZA 3ZT6A 3AXHA 3POHA 2D0HA 4UFLA 2BXZA 3AISA 1J12A 1BYBA 1QNQA 4M81A 1MW3A 4UFJA 1C93A 2TAAA 3VIGA 3IJ8A 3FN9A 3TTYA 1GJWA 3SCNA 1FA2A 2D3NA 5HDRA 4MB5A 3NDYA 1Q6EA 3D5HA 4MNLA 4DUXA 3VVGA 4PTVA 2W62A 4B9ZA 4D6DA 3ZO9A 1PEZA 1R8LA 1Q6CA 2WHMA 1J01A 1VJSA 1H0IA 5A95A 3WDIA 1JZ2A 2VCBA 1UWUA 5E0CA 4J27A 3B9EA 3GM8A 3NIYA 1QI2A 2VVNA 2WVTA 5E9AA 2A3EA 1G94A 3BAIA 3FHQA 3PBGA 2V3EA 4C7FA 4AIUA 1E6PA 4P7QA 3WMSA 4M82A 1AQHA 2QPUA 1V02A 4HZ7A 4KMQA 2PWEA 2ZX6A 4JKLA 3WD0A 2WVUA 3WL0A 5F7UA 1D2KA 3WSUA 1UH4A 5BXRA 5CLWA 1J0KA 3L4XA 4HZ8A 3GH7A 3CLWA 5JBEA 3W4RA 3BGAA 3KL5A 4W84A 1KGXA 3CH9A 3K8MA 2OYKA 3NYDA 4MADA 4PYSA 3W25A 4D6FA 8CGTA 3WBEA 1ZJAA 4AY1A 2D22A 3OLIA 2JEPA 1H41A 3O2LA 4AD2A 1M53A 4WLCA 4DWSA 3N04A 1OGSA 1WO2A 1ZJBA 3MS8A 3UR8A 3AHXA 3F5JA 4J3XA 3VD7A 3T0BA 4C7DA 4CD8A 3NSMA 2OLHA 5CSUA 4QFUA 3CZ8A 4RE3A 3VD4A 1HL8A 4F9DA 1MW2A 3BLPX 1LWHA 5HPOA 1E3ZA 1K9TA 4QLKA 3AIQA 5CXPA 1EDTA 4HA4A 2QMKA 2QLYA 3WQ6A 3ARYA 5AY7A 3DHPA 2DSWA 3GNRA 4YPJA 2O9RA 3HU7A 2G3IA 1XYFA 4NF7A 1DWJM 1W2VA 1JZ8A 4QDMA 1KBKA 3K4DA 3GH5A 4QLLA 5CPQA 2BXYA 2OSXA 2WCSA 3A47A 2AMGA 1EGZA 1XH2A 2WYSA 1LG2A 3ZR6A 4DM2A 5A8PA 3S6TA 3EDDA 1VAHA 1WCGA 1MYRA 4J28A 3A3HA 2D2OA 2J8GA 3BMWA 5CG0A 3UG4A 2G3NA 1UKSA 2J8FA 3VGGA 3ARQA 5I79A 1QI3A 2A3HA 4BQ3A 1K9DA 1NOUA 1V0KA 3MKKA 3L4WA 3CIVA 1PIGA 1XSIA 4WIWA 3AS0A 4AZIA 3U5UA 1LJYA 4B15A 1AMYA 1R87A 4UZSA 4UFIA 3L4YA 2YDSA 1EDQA 4PTMA 1W3LA 1GORA 2VUYA 1XV8A 3WEZA 4CCCA 3N9KA 3ZT7A 3CUHA 4GI9A 1UWRA 2D0GA 4W8LA 4F8XA 2FH8A 1UR8A 4PMNA 2YKKA 2JFEX 5E6ZA 1JZ4A 4OKDA 4XZBA 5EB8A 4W93A 2PB1A 4L4PA 2EPLX 1HP4A 3ARUA 1CZ1A 1BLIA 5A6LA 2BHUA 5EMYA 5FOOA 1Q6FA 1CGVA 1WDSA 4C7GA 2FGZA 4HA3A 5I6SA 2A3CA 3AHVA 4OUEA 4ML4A 5E70A 4D6GA 2O9PA 2ZUWA 3CTTA 4L4OA 1JZ7A 2EEXA 3M07A 3VM5A 1UD2A 5GNXA 1ISXA 1QVBA 4GZJA 3AZTA 1JYWA 4JFUA 4FLOA 5I23A 3VGFA 4XZWA 1HKKA 4WJXA 2BY1A 4W89A 3IAPA 3TONA 5DMYA 1ZS2A 3WNNA 1CTNA 2J7EA 2VMFA 4P7OA 3CGTA 4PMRA 2D24A 2XVKA 4W5ZA 3WF3A 1W3JA 1AVAA 2ZIDA 3DHUA 2ZX7A 1AQ0A 1HF6A 2E8ZA 3LPFA 3SCRA 1WP6A 1V3IA 4AW7A 5DFAA 1BF2A 4CGTA 1GCYA 1OINA 1V6UA 2XHYA 1B90A 3CPUA 2WMFA 4MB3A 1UR0A 4KGJA 1XHGA 3LPOA 1M03A 4MB4A 5AYIA 5CPTA 3GZAA 5A6BD 3WH7A 3NSNA 2IXVA 2G8ZA 3DC0A 3AHZA 1H3GA 5DT5A 2CIPA 3T2PA 4Q7NA 3VINA 1FH8A 1NOWA 2C7FA 2BY3A 4JIEA 2DEPA 3OGSA 1EO7A 1EXPA 3SCSA 3QOKA 4JAWA 4KRUA 3ARSA 1KXHA 4RL3A 3OG2A 1FP8A 3BAKA 3BC9A 3W6MA 1QI4A 3W6LA 1MW0A 2BHZA 2WVVB 1TA3B 3TOPA 4TVDA 2ZUUA 1IV8A 1W91A 5FKYA 3THCA 2WZEA 1ISWA 5E0FA 5A6SA 4A3HA 1W3HA 3L2MA 6CGTA 1K6AA 3W53A 3SCVA 4HU0A 4D6CA 2WK2A 1UZ1A 1JDDA 2HVMA 3ECQA 4LYQA 2V38A 2WCGA 1TA3A 2BVYA 4X0VA 1BQCA 1XRVA 1JYXA 1W3KA 3SIMA 1SFSA 2CITA 1EQPA 4FLSA 4TTUA 2D3LA 1CGUA 2QPSA 2VJXA 5IDIA 2W4XA 1QBAA 4ATLA 5IFTA 1GOMA 2ZE0A 4CN1A 2W67A 2VZTA 4W87A 4EAMA 1W32A 4H41A 3WMCA 3APGA 3ARVA 2WC3A 3SUVA 1H09A 3M6DA 2ZUNA 2NW0A 3ZJKA 3PZIA 4PN2A 3PZOA 1C91A 3CZJA 3HN3A 2VCCA 2X0HA 4JFWA 3WN6A 2BVTA 2XM2A 1GVIA 3AS1A 3PZTA 1DWHM 3EDFA 2DGAA 2DIEA 2WNWA 2J7FA 1Q6GA 3OZPA 1O7AA 1NQ6A 4PMZA 4CD6A 1TUXA 2X2YA 4B3LA 4AEFA 1GOIA 4KRTA 1QOXA 1CXLA 4PEEA 1VENA 4AIOA 2O92A 3LPPA 4PMVA 5AC4A 5D4YA 1PX8A 3F4VA 3CUFA 2AOSA 2VL4A 1EOMA 4E2OA 1GNXA 2WMJA 4LYRA 2VNCA 1E5NA 2IXUA 1W9VA 1V0LA 1JXJA 2DT0A 5ABEA 3FAWA 3MUZ1 1ODZA 3OLEA 3RM8A 1G01A 4ACYA 1B0IA 1Q4NX 2DT3A 4D71A 4UCFA 4UOQA 2WMGA 2VZVA 1VFOA 4PMDA 1VBUA 4UQDA 3HJEA 3WNOA 5I0DA 1C92A 3QHNA 3FW6A 5A6MA 3QGVA 5IFPA 2JE8A 1E0WA 4AEEA 1HIZA 1XSJA 4CD7A 4BS0A 4R27A 4CN4A 4W7VA 3VILA 4N42A 3AROA 2CKSA 4PMXA 4NI3A 4DUVA 4P7LA 3WDHA 1BGGA 1BFNA 4K68A 4ACZB 1D7FA 3GYCA 5A6JA 3EDJA 3OA5A 1NWRA 2Y5EA 4BA0A 3VKKA 1CECA 2VZOA 4EE9A 2J7DA 2XTKA 2NSXA 4V27A 1G5AA 1DEDA 4CU6A 5D9OA 3RO8A 1XH0A 1XGZA 3VNZA 4MAZA 4ACZA 1GUVA 2GK1A 1UKTA 4D1IA 1MW1A 3AOFA 1JIBA 3AIWA 1B30A 4MNKA 1QI0A 2WWCA 4S3JA 1KR0A 3ALFA 1F4AA 2WHLA 2FHFA 4U2ZA 1KXVA 2OWWA 3ARRA 5M3WA 1GZJA 4LX4A 4LQ1A 1GONA 1UKPA 5A94A 1GPFA 4X9YA 3SURA 3KWXA 1US3A 1LF1A 1R86A 2BVDA 2UY4A 2YL8A 2WWDA 2B31A 1VEMA 3IJ7A 1UUQA 1E71M 5AYBA 1ESWA 3WQWA 1KWKA 4GZEA 3VIFA 1JI2A 1EHNA 1RH9A 4MDPA 3VO0A 4MTVA 3MMWA 1Q6DA 5CSYA 1C7SA 1KGUA 3PTKA 4D6JA 5DF0A 2A3BA 4AYSA 3SCWA 3WNKA 3W0KA 1ISZA 1N82A 4HMDA 1UYQA 1W1PA 5E09A 2CYGA 4AZBA 1B3XA 1L8NA 2ZXBA 1LG1A 1OBAA 1LWJA 2YA0A 3GXMA 1GJUA 3CZLA 3WBAA 3CMJA 2ZICA 2V3GA 2VX7A 1TMQA 2DSZA 1GQIA 3LMYA 1C3FA 4LYPA 3TTSA 1DHKA 1E0XA 3UG3A 5BCAA 1FH9A 5A1AA 2CEQA 2WSKA 4ZEPA 1X6NA 1JZ5A 3W38A 1M04A 2OSWA 4LPCA 5C8BB 1E1EA 1HNYA 1VJZA 2F2HA 2WC7A 4ATDA 3AQUA 2DDXA 2WBKA 3CZEA 3IK2A 4URIA 2X1IA 2XGIA 3QOMA 1XYZA 3MV01 4NSBA 3AMKA 4X0NA 4CD5A 3AYRA 1EO5A 4RE2A 2XIBA 3QHOA 1RD6A 6A3HA 1BAGA 2W66A 1PPIA 1NH6A 1MQPA 1E6QM 1WPCA 2VVSA 4OZOA 4P8WA 4DWSB 5GNYA 4UR9A 1JF5A 2VR5A 3L4ZA 1JNDA 4PSPA 3SUSA 1ISYA 1CLVA 2XJ7A 2PWFA 4AD1A 2Z1KA 3WL1A 2XGBA 1BG4A 1OGBA 1GQKA 1W9BM 2XFFA 2YDRA 1WE5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1WZK A;  3F5K A;  1P6W A;  2EPK X;  4JHZ A;  1E70 M;  1H5V A;  2W92 A;  1HN1 A;  3CMG A;  4JCL A;  1OD8 A;  2FDM A;  1WDR A;  1XD1 A;  4JZ5 A;  4AD5 A;  2F8Q A;  2E4T A;  1FP9 A;  3AIV A;  3T2Q A;  2X8R A;  4PUD A;  4UOZ A;  2X0Y A;  2ZUM A;  4CVU A;  1GOQ A;  2GUY A;  3MSG A;  1UZ4 A;  5CQ1 A;  3I3B A;  2VX6 A;  4AWE A;  1LL7 A;  2VQT A;  2UWF A;  3EMQ A;  5IXE A;  3VGH A;  3WQ4 A;  5DEZ A;  1QW9 A;  1W2P A;  5A2A A;  2PWG A;  4J7R A;  1KBB A;  2W91 A;  2J7G A;  1UHV A;  1W1T A;  2DPE A;  2W5F A;  5A6B A;  5IHS A;  3VIO A;  4MNJ A;  9CGT A;  4YN5 A;  3ZQ9 A;  1JFH A;  4Z2L A;  1PX3 A;  1H4P A;  1CBG A;  4Z2G A;  3VTR A;  2GJX B;  2VCA A;  4JKK A;  3ZST A;  1G1Y A;  3UEQ A;  2J74 A;  1M01 A;  4HPH A;  3I3D A;  4FLR A;  5LA1 A;  3ARX A;  4IUG A;  2OWX A;  3B9D A;  1TVP A;  4IM4 A;  4J3U A;  4PCS A;  1XCW A;  1KGW A;  2EPO A;  1C90 A;  1QNO A;  4P7N A;  3VMP A;  3VOC A;  1SR0 A;  2VO5 A;  4PTX A;  2Y8V A;  2GFT A;  1UOK A;  4J3V A;  1EHA A;  1PZ2 A;  4JFV A;  1JL8 A;  4W8A A;  4UOJ A;  4E4P A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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