3QICA

The structure of human glucokinase e339k mutation
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
453
structure length
452
Chain Sequence
YFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVKSDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Crystal structure of E339K mutated human glucokinase reveals changes in the ATP binding site.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 452
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2011-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3qicA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3qicA01
5AQLA 3WUHA 5E26A 4MLHA 3CERA 1S22A 2VCPA 3D2EB 3D2FA 1HPMA 5AQIA 5TKYA 1E4GT 3MN7A 3MN5A 3EKSA 3DXMA 2NLXA 4FWRA 4FWKA 5FPDA 2CH5A 4CZIA 3F9MA 3U9ZA 1BA1A 1X3MA 3AARA 3LDQA 2YJEA 5AQKA 1X3NA 4FPAA 1BA0A 5CE3A 1NGBA 4IWVA 4BC4A 3O1BA 3HSCA 3H6EA 5ELZA 2HF3A 3L4IA 1GLEG 5AQSA 1HX1A 3VEWA 4IO8A 1U2VB 3U4LA 5AFUA 5BPLA 4B1VA 4FWNA 4I6MA 3UKRB 4JN4A 3DWLA 2BUPA 4CBXA 1K8KB 3IUCA 4BRNA 3VF4A 4KBOA 3GDQA 4AM7A 1HLUA 2HOEA 3RSEA 3FFKB 3UKUB 4BRHA 1G99A 3QDKA 2ITMA 2P9PB 1RGIA 3AAPA 4H0TB 2FF6A 4ISGA 2FF3B 4YDUC 4BR4A 2W41A 4PKGA 3WQTA 2E2NA 2FSNA 3ULEB 1T44A 5AZIB 4CZEA 2V52B 3CQXA 4A62A 3CJBA 4GY2B 2A6AA 4JD2A 4IJAA 5FPEA 4IZ9A 4BRFA 4C23A 3AAQA 4EFHA 2E20A 3VOVA 5AQRA 4FWLA 1NGFA 2H3GX 4A61A 1JCFA 2P9KA 2D0OA 5FPMA 1RDWX 4CZMA 4H5NA 3ENOA 3LM9A 2HMPA 2QWOA 4BR0A 3MMVA 5JLFA 3FZKA 5JMVA 3ATUA 3BUZB 2I7PA 5ADXA 3DXKB 3UE5A 1HKCA 4XH1A 4L3QA 2VWBA 5EVZA 5BREA 2Q31A 4CZFA 2I7NA 3EO3A 1XQSC 2J4RA 2E88A 2ZGZA 2Q0RA 1C0GA 2VYPA 3DJCA 4H5RA 4QS9A 3BF3A 1ZC6A 3CJ7A 2AA4A 3WT0A 4BR7A 4DCHA 3GE1A 2P9LB 5LJVA 3WQUA 3M1FA 3SJHA 4O8KA 5AQXA 1NGJA 3CHWA 3MCPA 1OKJA 3S41A 5AR0A 4BVPA 2A3ZA 3MDQA 3A0IX 4BG9A 4BRDA 1GLBG 3KVGA 1YUWA 1YVNA 1KAXA 4H0XB 2W40A 4PKHA 5F2RA 4B1ZA 1QZ5A 1ZBSA 4BQZA 4JHDB 2PBDA 1IG8A 1P8ZA 3VGMA 3QFUA 5AFUH 2P9IB 2F9WA 3SMSA 4K25A 3QBXA 1GLFO 3G25A 3EZWA 4XH4A 4BGAA 2QWMA 1U6ZA 4QS7A 5AQPA 3WXIA 5AQYA 3A8YA 3FZMA 2P9UA 3ATVA 4B1WB 3EN9A 4JAXA 1NGHA 5KQDA 4CD1A 5AQWA 2FSKA 4H0PA 5EOYA 2ZF5O 1JCGA 4CBUA 3LDLA 5KQ8A 3GL1A 3H3OB 3O8MA 3SMPA 5E84A 3ZX0A 4BR2A 4EHUA 5BRHA 2GWKA 4BRIA 2QWLA 3BEXA 4I6MB 2D0PA 3O80A 3M3ZA 3D7EO 1E4FT 3GOIA 5AQGA 4B1XB 3B8AX 3D2EA 2P9SB 5AQFA 1GLCG 3RSEB 4BRCA 4CZGA 2KHOA 3HZ6A 4CI6A 4A2BA 1C0FA 3WXLA 5LJWA 2IVPA 4M7XA 2Q0UA 4Y0WA 3FGUA 2CGLA 3L0QA 1DGKN 4FL9A 4A2AA 1XUPO 3VEZA 3ZETB 5KPRA 1Z05A 3CQYA 4H5VA 3U8XA 1V4SA 3FE1A 5ADXH 4DQ8A 4CD3A 4F9OA 4ISFA 4WQ4C 1CZAN 5AQOA 4BREA 4FWSA 1NWKA 1DKGD 4BC2A 1U2VA 1LOTB 2V7ZA 4MO4A 4BRQA 1WUAA 4JD2B 5AZJB 2CGJA 4XEIA 4AM6A 3C0BA 2YJFA 2YHWA 3ZEUA 2YHYA 2WUSA 3LDOA 1QZ6A 4NO7A 2ASOA 1Y64A 3EKUA 2P9PA 3LL3A 1NGAA 5BRFA 4MO5A 4LC9B 2QXLA 3DAWA 1GLJO 1H1VA 3P4IA 3ENHA 3H46O 3JS6A 4FWOA 2DPNA 3VETA 2E1ZA 3C7NB 4ISEA 4FOIA 4H5TA 3QB0A 3VEYA 1HJOA 3QFPA 5AZIA 1SQKA 3FZLA 3OHRA 5BRDA 3IDHA 2FXUA 3IFRA 2IVNA 2QW9A 3R6MA 1MDUB 2F9TA 4J8FA 3M6GA 2OANA 4H0YB 3BP8A 2ZWHA 3VESA 1HUXA 3CI5A 4QS8A 5BR9A 3CJCA 4H03B 2HF4A 1QQOA 2NZTA 3HI0A 3JXUA 3KHYA 2D4WA 3WEEB 2GWJA 4H0OA 4DB3A 4BR9A 1GLAG 1J6ZA 2Q97A 4HWIA 4FWPA 5F1XA 3VF2A 4YDUA 3A5MC 5AQVA 3QBWA 4B1UB 1TYQA 2QWQA 1NGIA 4BRAA 4WQ5C 2P9LA 3D2FB 1D4XA 3VPZA 3VGLA 1HKGA 3I33A 1BWFO 3BF1A 4IJNA 4RWTA 1SAZA 4FWMA 3DXMB 2Q36A 4CZHA 1NMDA 2GELA 4BRPA 4GNIA 2E2QA 4FOEA 1BDGA 2E2PA 1T6DA 2P9NA 3LDNA 1NM1A 3AY9A 1XC3A 3H45C 4RCHA 3H1QA 3LDPA 3VERA 3U9DA 3EL2A 1SZ2A 4BRLA 1X9JA 3FLCO 4DHYA 2V7YA 2ASPA 4BGBA 3FZFA 4CJ7A 3MN6A 4FPBA 1GLDG 5AQHA 3ZX3A 4WYBA 2Q2RA 4XH5A 1NGGA 2P9IA 5AQJA 4EAHD 3IMXA 3SK3A 4B9QA 1JCEA 5JLHA 1YXQA 1ATSA 1S3XA 1MWKA 3J8AA 2A41A 3O08A 2QWRA 2UYTA 3H1VX 1QQNA 5BPMA 1GLLO 3FZHA 3R8EA 2D1KA 5EXWA 4FWQA 1R59O 1BG3A 4PL7A 3O5BA 4H0VB 1Z6RA 4B1YB 4NB4A 3H3NO 5AQNA 3ZX2A 2ASMA 4BRGA 3MN9A 2IVOA 4CZKA 1BU6O 3HTVA 2E2OA 3VEOA 4BVOA 1NGDA 3L6QA 1NBWA 4M63C 3UKRA 3ZEUB 4CBWA 2P9SA 3VEVA 1K8KA 3R9PA 4M7YA 2A40A 1DEJA 1NLVA 2P9KB 4CZJA 1MA9B 1V4TA 4PKIA 4WQ5A 3UKUA 1ESVA 2A5XA 2QWPA 3CIPA 1ATNA 1Q18A 4K42A 5EY4A 3VENA 3ZETA 3ID8A 3GG4A 2E8AA 5BPNA 1ZXOA 3O4WA 3HBTA 4IXCA 4Z94A 1ATRA 1RFQA 2AP1A 3TU5A 2FLOA 3W0LA 4EHTA 3QMLA 5F0XA 3W3DA 1BO5O 3I8BA 5EX5A 2EWSA 4BR5A 3ULEA 1BUPA 3CJ1A 5AZJA 1QQMA 5KPTA 3VF6A 1NGCA 2GTDA 1EQYA 3O6WA 1NGEA 2Q1NA 2CH6A 2YHXA 1HKBA 4MLEA 3TPQA 4FSVA 3QICA 4EIAA 1KAZA 3CJ9A 3GBTA 5AQUA 3O1WA 1MWMA 4PL8A 4JNEA 5AQMA 2BTFA 5I9EB 3C7NA 3DXKA 4BRMA 5BN9A 5AQZA 3MK6A 3KZBA 1WOQA 2ZGYA 2NRHA 4O5FA 4BRKA 1BOTO 3UB5A 1TUUA 1TYQB 2QWNA 2PAVA 4BC3A 1TUYA 2GEMA 1YAGA 4WQ4A 3WXKA 3WXJA 3SLCA 2QM1A 4H5WA 1QHAA 5BN8A 5AQTA 3A5OC 3HM8A 2IIRA 4E1JA 4CZLA 5LY3A 3CJAA 2P9UB 4K41A 2YCHA 3FR0A 1IJJA 1KXPA 2P9NB 3A5LC 3VGKA 4BQLA 4BG8A 5B8HA 4FO0A 2GUPA 3WEEA 4BC5A 1LCUA 2V51B 4BROA 5JICA 3LM2A 1KAYA 2YI1A 4K43A 4JHDA 4RTFD 5KPZA 5FPNA 4HTLA 2FSJA 1T6CA 2CGKA 5AQQA 3CETA 3VEXA 2A42A 2E1YA 3A5NC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WUHA 4OPHA 4AQYK 1NK8A 2UUCK 5TKYA 1IO2A 3MEDA 3MN7A 1N6QA 4WFNL 3EKSA 4FWRA 4DMNA 3VQ6A 4B9SA 3PIOL 1KRPA 2CH5A 1WAJA 5H1SQ 3U9ZA 2VQFK 1X3MA 5AQKA 1SKRA 1X3NA 4FPAA 4BC4A 3OBYA 3H6EA 1HX1A 4GV3A 1IKXA 1WLJA 3F5TA 1U2VB 1U45A 1A5XA 4JKBA 4FWNA 3DRPA 4K8XA 3ZT4A 4FJIA 1FJGK 4BRNA 1G15A 3CM6A 4AM7A 4PWDA 3FFKB 1ZYQA 3CCLN 1RDBA 1RGIA 4CHNA 2FF6A 1QVGM 2A1SA 5TKWA 4CECA 3DLLL 1JXBA 4YDUC 3TAFA 1UA0A 3D0PA 2JGUA 2FSNA 3ULEB 1T44A 1A5VA 3CCMN 2HHVA 4E7IA 4FK2A 3TR8A 1I94K 4JD2A 1RTHA 2NRZA 1NOZA 1WNSA 3OS2A 3OYBA 5FPMA 1RDWX 3KKRA 3ENOA 3LM9A 5C12A 4JI0K 2QWOA 3MMVA 2KFNA 5JMVA 1R0AA 1X1PA 3V4IA 1QQCA 5ADXA 3CC7N 3DXKB 3HXMA 4DV3K 2YKNA 3TARA 4L3QA 1DT9A 4JV5K 3OY9A 4FJJA 3MECA 1TKDA 1ILYA 4LF5K 3ID6A 2ZGZA 2Q0RA 2VYPA 3DJCA 3C65A 2G8FA 2QTDA 3WT0A 3CJ7A 4OLAA 3KLGA 3P39A 1NK0A 1X9SA 3M1FA 2O4GA 3OBWA 3P5JA 4YORA 3A0IX 4BG9A 4V19S 5GADP 1ZBIA 2G8KA 4JKCA 1YUWA 4CFAA 5J2NA 1ZBSA 4CERA 1TK5A 4CJVA 3I55N 4OPAA 3R1XA 3QEPA 5M1OA 3M8QA 3DYAA 1BCMA 2P9IB 3SMSA 3I0SA 3QBXA 4JS5A 3BZKA 3O9TA 1NK5A 3G25A 3EZWA 4XH4A 1U6ZA 5AQPA 3WXIA 3OS1A 3F9KA 4DSJA 3CFRA 1ZBFA 4B1WB 2G8VA 2D0AA 3AV9A 4CJLA 4CF0A 2E4LA 4CIGA 3GL1A 3H3OB 5E84A 5CR4A 3KLEA 2HHXA 3PV8A 4J2EA 3SPZA 4I6MB 3NE6A 4GW6A 3M3ZA 1B92A 5KI6A 4C1NK 4X66K 1F21A 4CZGA 1HMVA 2KHOA 4A2BA 5LJWA 3MAQA 3OTOK 3AVIA 1Q8IA 2F8TA 4FL9A 3ZSZA 3K57A 3A2FA 1VSJA 4H8KA 1Z05A 5KPRA 4IG3A 4H5VA 3FE1A 3SQ2A 2PYJA 5ADXH 3ZCMA 4CD3A 4CEDA 4JI4K 3TAMA 3O3HA 5HROA 3CCJN 1U47A 4EP4A 3L2UA 1DKGD 5HLFA 1SUQA 4BRQA 4YOXA 4XEIA 2XY7A 3O3FA 3K5NA 2YJFA 3NF6A 1QS4A 1XNRK 1VRTA 3DLKA 3ZEUA 4LSLA 4DUYK 4YNQA 3LWLA 4CHQA 3THYA 2P9PA 1JLGA 1YVUA 4FWOA 3C7NB 3ZYYX 4IFYA 2F8SA 3SNNA 2G8WA 3QFPA 2IS3A 3PX4A 3FZLA 3OHRA 3NH1A 5BRDA 1OH5A 3IDHA 2FXUA 4BACA 2BE2A 1E3MA 3IFRA 5DM7L 5DMRA 1RBTA 4O4GA 3KD1E 1BL3A 4JI3K 3M6GA 3ENBA 4FYDA 2JWLA 3J7AP 4KI6A 4JRPA 3V1OA 3RRHA 1KSPA 4DR7K 3VESA 5J2QA 3JAMO 2O4IA 4AH9A 1LV5A 2HF4A 3AVBA 2E6LA 2D4WA 4DFKA 3WEEB 4H0OA 4L8RB 4E0DA 4M3YA 5IWAK 4HWIA 4WE1A 1JL1A 1EKEA 3QETA 3QBWA 2QWQA 4GVEA 4I9LA 3VPZA 4OGCA 1HKGA 1BWFO 4IJNA 5GIOA 1LWCA 1SAZA 3DXMB 4B3SK 4Z4CA 1QVFM 3B6OA 4X65K 4GNIA 4FJ9A 4YHHK 1YJWN 1QE1A 4CEBA 2OPRA 1T7PA 1XC3A 3H45C 4X62K 2WBNA 3U9DA 3J7ZO 1SZ2A 4BRLA 1RT5A 1YJ9N 1X9JA 3EZ5A 3L8BA 3FZFA 3ZX3A 4CW7B 2NRWA 2VQEK 1LWFA 4AHUA 4B9QA 2UU9K 1CZ9A 4H4OA 4E19A 2XY6A 1VRUA 2XY8A 1HR0K 2RN2A 4Z4EA 3O08A 2UYTA 1VQKN 1D9FA 3VN5A 4BDYA 5EXWA 1SS6A 1BG3A 2YV0X 4CJPA 4CJFA 4FZXC 4AHSA 4O8UA 4H0VB 4CJUA 5C24A 4B1YB 1Q81O 1VQ4N 3H3NO 4JKGA 1RDUA 1QHTA 4F2RA 2P5OA 4CZKA 3LZIA 3VEOA 4BVOA 3O3GA 1JL2A 2VG5A 4CBWA 2NNWA 5KRSA 2OA8A 1ZBUA 4JKAA 4M7YA 1D9DA 3EEQA 1VHXA 1MA9B 1V4TA 4PY5A 3UKUA 2QWPA 3MX2A 4FK4A 4JI1K 1TL3A 2IC3A 3ZETA 4KB0A 1RCHA 1ZXOA 4FLXA 3HBTA 3ZLJA 4KTWA 1MU2A 4B9UA 2FLOA 4EHTA 3QMLA 4JYAK 2LSNA 4DSLA 5C2FA 4BR5A 5AZJA 4UQGA 4Z4GA 4FM0A 1WAFA 4C8NA 4JEPA 1NGCA 2GTDA 1XWLA 1EQYA 2BGGA 3SQ1A 4FSVA 3QICA 3VQAA 4JI5K 1FW6A 4FJHA 3LAKA 1MWMA 2UXBK 4JNEA 3M8RA 1SL2A 1IV0A 2HBKA 1TL1A 4CVNE 5BR8K 4HTUA 4E1MA 2QWNA 3ITHA 4DV4K 2G8HA 1RILA 3JSMA 2GEMA 1RTDA 3TSPA 3V9WA 1NJYA 1C0UA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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