The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGLGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Determination of Pathways for Oxygen Binding to Human HbA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
62
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 6HBW B; 1JZL A; 4AVD A; 1Y5J A; 4F4O A; 1G0B B; 4YU3 A; 5E6E A; 1BZZ B; 1FN3 A; 3CY5 B; 2VYZ A; 4UIQ A; 1GVH A; 1Y46 A; 2R1H A; 1LFY B; 1Y8H B; 1EBT A; 2D2M C; 1XYE B; 2Z85 A; 1CIK A; 4MQH B; 2W72 A; 5CMV A; 5F0B A; 5C6E B; 3IC2 A; 2AUO A; 1RPS B; 4PQ6 A; 3EOK B; 1KR7 A; 1IT3 A; 1HBB A; 2MGH A; 1LFQ A; 1QXE B; 2ZSR A; 2ZS1 B; 1M6M A; 2D2N A; 110M A; 5KER B; 1SWM A; 2VHB A; 2VLX A; 5HBI A; 4DC7 A; 3A5B A; 1DWS A; 3UHG A; 4ROM B; 1O1K B; 4DC8 A; 1HBS B; 2ZT3 A; 3HRW A; 4FC3 A; 1N9F A; 5C6Y A; 4MQG A; 3D17 A; 2GRZ A; 2HHE A; 1A9W A; 3S1J A; 4ZVB A; 3BJ3 A; 1V07 A; 1NS6 A; 5AZQ A; 4H0B A; 1Y5K B; 2MYB A; 3HYU B; 1HBR A; 3AQ6 A; 2ZS0 A; 1X9F C; 1YVT B; 5EE4 C; 4HRR A; 1J52 A; 1CMY A; 3WCT B; 2MGB A; 5SW7 B; 1GZX A; 3UH7 A; 1HDB A; 2DHB B; 2O5L X; 2ZWJ A; 2ZST A; 3NMM B; 2E2Y A; 1ASH A; 1JL7 A; 1QXD A; 3ARK A; 1UFJ A; 1Y5J B; 4F4O B; 1SDK A; 1MBN A; 2AV0 A; 4YU3 B; 5E6E B; 1FN3 B; 1MOD A; 1Y0W A; 1Y46 B; 1S0H A; 2R1H B; 1O1M A; 1QSI A; 2FRJ X; 2W72 B; 3E4N A; 3WCU C; 1MNK A; 1BUW A; 1MWC A; 3IC2 B; 2WY4 A; 3D7O A; 3OGB A; 1HHO A; 1JF3 A; 2XKI A; 1Q1F A; 1HBB B; 2ZT1 A; 1V75 A; 3MVC A; 2MGM A; 3ZJO A; 1LFQ B; 3UH3 A; 2D2N B; 1DXC A; 1Y01 B; 1BVC A; 1Y4V A; 1M9P A; 3HRW B; 4FC3 B; 2HCO A; 2GDM A; 4MQG B; 112M A; 1MYG A; 3D17 B; 1M6C A; 2HHE B; 1RQA A; 2G3H A; 2O5T X; 1S69 A; 1X46 A; 1CH2 A; 1YOG A; 101M A; 3K9Z A; 2QSS A; 1NS6 B; 5CNG A; 2MGJ A; 3G52 A; 2Z6N A; 4UUR A; 3UHE A; 1HBR B; 1FSX A; 3NG6 A; 5JDO E; 2ZS0 B; 4HRR B; 1Y7D A; 1CMY B; 1S61 A; 2MGI A; 4TWV A; 1HJT A; 3UHB A; 1GZX B; 1J7W A; 1S5X A; 1WMU A; 1HDB B; 1HAC A; 2QFN A; 1V4U A; 4X0L A; 3GKT A; 1ABW A; 3MJP A; 103M A; 1MYT A; 1O1J A; 1QXD B; 1FHJ A; 2O5O X; 1SDK B; 3UHI A; 3HEN A; 1Y5F B; 1JPB A; 3WCV D; 2QU0 A; 3UHW A; 4OF9 A; 1Y0W B; 1CH1 A; 1S0H B; 3H57 A; 1O1M B; 3KUN A; 5EV5 A; 1QSI B; 1BUW B; 5CN9 A; 3R0G A; 3D7O B; 3D4X A; 1HHO B; 1GBV A; 2ZLT A; 1HV4 A; 1VXH A; 1J7S A; 3UHT A; 1V75 B; 1SPG A; 3ZJQ A; 3IXF A; 2SPL A; 2WTH A; 2GTL D; 1WLA A; 3UHD A; 1GCW A; 1NIH A; 1QPW A; 4U8U D; 1A3O A; 1H97 A; 1LH1 A; 4NI0 A; 1LH2 A; 1FLP A; 3S48 C; 3A0G A; 1OR4 A; 1Y4B A; 5AZR A; 1Y4G A; 1Y4V B; 1M9P B; 1XZU A; 2G10 A; 2HCO B; 2V1H A; 1J3F A; 1YDZ A; 1VWT A; 1RQA B; 3UGZ A; 1A01 A; 3BA2 A; 1LFZ A; 2EF2 A; 2MYA A; 2QSS B; 3O7N A; 1VXE A; 1G08 A; 1YEU A; 1V5H A; 2Z6N B; 1MWB A; 4F6D A; 1FSX B; 4H2L A; 2VM0 A; 1GLI A; 2ZSO A; 1JEB A; 2AUR A; 1WVP A; 2MYE A; 1Y7D B; 3ZJM A; 3E5O A; 1MYZ A; 4NK1 A; 1URV A; 1TU9 A; 3MOU A; 5E83 A; 1IRC A; 1J7W B; 1S5X B; 1WMU B; 1RQ3 A; 3UI0 A; 4F6B A; 1HAC B; 1KD2 A; 1V4U B; 4X0L B; 1ABW B; 4NS2 A; 1IWH A; 2D6C A; 1Y0T A; 3WI8 A; 1O1J B; 1FHJ B; 1NAZ A; 1CO9 A; 1UVX A; 2W6V A; 4NK2 A; 4O1T A; 5M3S A; 2AUP A; 2MGF A; 2ZSQ A; 3UHZ A; 2QU0 B; 2W31 A; 1A6G A; 5ILE A; 4O2G A; 1YHU D; 2NRM A; 2DN2 A; 1XZ7 A; 1GBV B; 1Y7C A; 2ZLT B; 1HV4 B; 1J7S B; 2ZFO A; 2ZSP A; 1SPG B; 3UHQ A; 1GCW B; 1NIH B; 1QPW B; 1A3O B; 1UC3 A; 1EBC A; 4NI0 B; 2O5Q X; 1AJG A; 3RJ6 A; 4F68 A; 3K3U A; 3ORD A; 1Y4B B; 1Y4G B; 1XZU B; 1MBI A; 1BIJ B; 1VWT B; 1YOH A; 3GLN A; 4HBI A; 1JWN A; 1A01 B; 1MLM A; 1LFZ B; 3EU1 A; 3UHY A; 3DUT A; 3MJU A; 1G08 B; 1YEU B; 3QM8 A; 4H2L B; 5CN5 A; 1GLI B; 1JEB B; 1MYF A; 2FAL A; 3E5I A; 3GYS A; 2FAM A; 3MYN A; 5B84 A; 1B86 A; 2SPO A; 3QJC A; 5E83 B; 1Y31 A; 1RQ3 B; 2DXM A; 1DO3 A; 4HSX A; 3ZJS A; 1KD2 B; 1OFK A; 3S65 A; 1W92 A; 3RJN B; 3UHR A; 1IWH B; 1DUO A; 4M4A A; 1JY7 A; 1ECD A; 1MLF A; 1Y0T B; 2XKH A; 4HHB A; 5CN7 A; 1LUE A; 2D2M A; 2W6V B; 1FAW A; 2ZLX A; 3WCW D; 5HU6 A; 1OFJ A; 1J41 A; 4FH7 A; 2G14 A; 2M6Z A; 1Y7G A; 4C44 A; 5KDQ A; 2DN2 B; 1OR6 A; 1GJN A; 1MLH A; 1XZ7 B; 1Y7C B; 2ZFO B; 1YOI A; 1DTI A; 1BVD A; 2RI4 A; 1MCY A; 2MGK A; 5EYJ A; 2ZLW A; 1RQ4 B; 1UFP A; 2HBD A; 2V1K A; 2LH2 A; 2EVP A; 1NPG A; 5CNC A; 1UX8 A; 1CPW A; 3M3B A; 1X9F A; 3IC0 A; 1JP6 A; 3ZJN A; 3EU1 B; 1V4W A; 2HBS A; 3DUT B; 3FH9 A; 1ITH A; 1SHR A; 1MOC A; 2EVK A; 3GYS B; 3PT7 A; 1LH7 A; 5CN4 A; 1NEJ A; 3SZK A; 2EKT A; 1B86 B; 1CQX A; 1MLS A; 3QJC B; 1Y31 B; 2MGL A; 2GNW A; 2DXM B; 4OOD A; 3UGY A; 104M A; 1A0U A; 3S65 B; 3HHB A; 1CG8 B; 4M4A B; 1NZ4 A; 1JY7 B; 5EYS A; 4HHB B; 1HLB A; 1CH4 A; 3GDJ A; 4MBN A; 4DWU A; 3GK9 A; 1BIN A; 4MU5 A; 2D2M B; 2FRF A; 5EQM A; 1FAW B; 2ZLX B; 3WCU A; 3AG0 A; 5HU6 B; 2ZT0 A; 3LB1 A; 1F63 A; 3ZJI A; 1UIW A; 1O1N A; 2MGC A; 1Y35 A; 1J41 B; 2ZS1 D; 3U3E A; 4WJG A; 2V1G A; 5EET A; 2V1I A; 2M6Z B; 1Y7G B; 5KDQ B; 1IRD A; 1Y2Z A; 1YEO A; 1XY0 A; 1CLS A; 1J7Y A; 3TM3 A; 1DXT A; 3GKV A; 3QMA A; 3ZOM A; 2RI4 B; 3ASE A; 2HZ1 A; 1B0B A; 2R4Z A; 1HBH A; 2ZLW B; 2VEB A; 1HSY A; 1TES A; 2HBD B; 3HEP A; 3PI3 A; 3HF4 A; 2DC3 A; 4NI1 A; 1AJ9 A; 1CP5 A; 3WCT D; 1GCV A; 1X9F B; 3IC0 B; 1NS9 A; 1BZ0 A; 1V4W B; 1O16 A; 1Z8U B; 1HDA B; 5IKS A; 2HBS B; 3FH9 B; 1U7R A; 1T1N A; 3WR1 A; 1SHR B; 5HY8 A; 3PEL A; 1DUK A; 3PT7 B; 1CH9 A; 1S56 A; 1VXA A; 1X3K A; 3G4W A; 1NEJ B; 2NX0 A; 3SZK B; 3D1K A; 2LH1 A; 1LH6 A; 3ZOL A; 4O4T A; 1QSH A; 1A0U B; 3HHB B; 3LQD A; 1ECN A; 5B85 A; 2BLI A; 3UHS A; 4L2M A; 3GDJ B; 1A00 A; 3GQP A; 4DWT A; 1SDL A; 2QSP A; 1PMB A; 1UMO A; 3WCU B; 3OJ1 A; 1K0Y A; 3V2Z A; 1MLG A; 1MTJ A; 1UIW B; 1JF4 A; 1O1N B; 1NXF A; 1Y35 B; 3DHR A; 2BLH A; 2XKG A; 1JDO A; 1MTK A; 1Y0D A; 2D2N D; 3QM5 A; 1IRD B; 1YGD A; 3QQR A; 1Y2Z B; 1CBM A; 5EUI A; 1YEO B; 1YIE A; 1BJE A; 1XY0 B; 2QLS A; 1CLS B; 1J7Y B; 1DXT B; 3GKV B; 4F6F A; 1HBH B; 1ABY A; 2O5B X; 1A9W E; 1VXD A; 3MBA A; 3QZZ A; 2C0K A; 1COH A; 2WTG A; 2ZS0 D; 3HF4 B; 3DHT A; 4NI1 B; 5JDO D; 2ZSS A; 3BJ3 B; 1AJ9 B; 3WFU A; 3NFE A; 2FRK X; 2MHB A; 1GCV B; 3A59 A; 1NS9 B; 1KFR A; 3OK5 A; 1BZ0 B; 5JGG A; 1MYM A; 2MGE A; 5F2A A; 2PGH A; 3A9M A; 4FWX A; 2H35 A; 111M A; 1SI4 A; 1T1N B; 3WR1 B; 4NXA A; 5HY8 B; 3PEL B; 4KMV A; 3G4Q A; 1G09 A; 2MGA A; 2OHB A; 1MOA A; 3D1K B; 2HZ3 A; 1MOB A; 3ODQ A; 1Y4F A; 1MBS A; 1QSH B; 1UVY A; 1YCB A; 3LQD B; 3MN0 A; 4FWY A; 3A5G A; 1A00 B; 1O1O A; 1Y0C A; 3GQP B; 2HBF A; 1BAB A; 1C7D A; 2QSP B; 1VXB A; 1K0Y B; 1Y8W A; 2VLY A; 2G0Z A; 3DHR B; 1DKE A; 3A5A A; 3GQR A; 3LHB A; 2YRS A; 2GRF A; 1Y0D B; 1CH3 A; 1YGD B; 5EUI B; 3BOM A; 1LH3 A; 1YIE B; 1VRF A; 3VRG A; 2QLS B; 3G4U A; 2R4Y A; 4M4B A; 2GL3 A; 2V1F A; 3HEO A; 4F6J A; 3BJ2 A; 1XZ2 A; 3BCQ A; 4N7N A; 1MKO A; 3B75 A; 5ILR A; 1BZ6 A; 1AJH A; 1N9H A; 4MPM A; 4UZV A; 1O1L A; 1MBO A; 1ABY B; 1COH B; 3WCV C; 2LH6 A; 3AQ9 A; 3DHT B; 4JAC A; 1YMA A; 1DO1 A; 3ONZ A; 3NFE B; 2MHB B; 1FSL A; 5HLX A; 3A59 B; 1EWA A; 5JGG B; 1Y45 A; 4MQK A; 1DWT A; 2PGH B; 1CO8 A; 2H35 B; 3NG6 B; 1SI4 B; 3KUO A; 4B4Y A; 2LH3 A; 3ZJL A; 2B7H A; 1G09 B; 2LH7 A; 2GTL C; 2BNL A; 3UHX A; 3CIU A; 1YEQ A; 4U8U C; 1XZ4 A; 2OHA A; 4FH6 A; 4IRO A; 3ODQ B; 4SDH A; 4WCH D; 1Y4F B; 4MQC A; 2OH8 A; 3MJP B; 4MXL A; 1YZI A; 1NZ3 A; 1DWR A; 1XQ5 A; 2HHB A; 7HBI A; 4KN3 A; 1J3Z A; 2VRY A; 1O1O B; 1Y0C B; 2HBF B; 1BAB B; 1C7D B; 2ZFB A; 3ED9 A; 2G0X A; 1Y8W B; 1CIO A; 1DKE B; 2Z6T A; 3A2G A; 3GQR B; 2YRS B; 4L7Y A; 3AT5 A; 1MYI A; 3D4X B; 4MQI A; 5E29 A; 1F65 A; 1K1K A; 2HBE A; 3BOM B; 3VRG B; 3V2V A; 3SDN A; 4M4B B; 1LA6 A; 1UX9 A; 2CMM A; 2RAO A; 3BJ2 B; 1F5P A; 3A0G B; 2OH9 A; 4VHB A; 4ROL A; 1XZ2 B; 3BCQ B; 4N7N B; 1MWD A; 1MKO B; 3B75 B; 3LB4 A; 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1Y7Z B; 1HGB A; 4AVE A; 3MJU B; 2G0S A; 5JDO F; 3GOU A; 5CHQ A; 3QQQ A; 5CNB A; 4HRT A; 3OO4 B; 1BBB B; 1CG5 B; 2ZLV A; 2IN4 A; 1Y8K A; 2VEE A; 3ARJ A; 1LFL A; 2D2M D; 1I3D A; 1RSE A; 1YG5 A; 3ZJH A; 1VHB A; 2H8F A; 4BJA A; 2NSR A; 1DO7 A; 1FCS A; 3AT6 A; 2HBC A; 3UHU A; 1XZ5 B; 3S66 B; 3BJ1 A; 2BLJ M; 4N8T A; 4ZVA A; 3PIA B; 1JL6 A; 3W4U A; 2O5S X; 5ILM A; 2MYC A; 1MLN A; 1MOH A; 3VRE A; 3OVU C; 107M A; 1H1X A; 2VLZ A; 1Y4R B; 2R80 B; 3PI1 A; 1HCO B; 1Y4P B; 4YU4 B; 1Y83 B; 3G46 A; 4ILZ A; 3HXN A; 1URY A; 5D1V A; 5CNF A; 1X9F D; 3P5Q A; 5EE4 D; 3ZHW A; 4H07 A; 1O1P A; 2D5Z B; 1THB B; 4MQJ B; 3MKB A; 3AQ7 A; 2DN3 A; 1Y22 A; 1OUT B; 2ZS1 C; 2BKM A; 4ODC B; 3PI9 A; 2ZT2 A; 1YGF A; 1HGB B; 1A4F A; 2GNV A; 1NZ5 A; 1CBL A; 3GOU B; 4HRT B; 1LHS A; 3R5I A; 2ZLV B; 1Y8K B; 1LFL B; 3WCP A; 4PNJ A; 3M38 A; 1YG5 B; 3WCU D; 2H8F B; 2G12 A; 1U7S A; 4ESA A; 1CQ2 A; 3AT6 B; 105M A; 1YEV A; 2HBC B; 1XCH A; 3WCT C; 2D60 A; 3BJ1 B; 3QJB A; 1HAB A; 2W6Y A; 4N8T B; 1HBI A; 3W4U B; 1DXV A; 3EDA A; 3QM9 A; 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