The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKALGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Determination of Pathways for Oxygen Binding to Human HbA
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-01-28 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4U8U C; 1G09 A; 3GKT A; 2Z6T A; 3ONZ A; 1Y22 B; 5ILP A; 1S6A A; 1QPW B; 1C40 A; 1A0U B; 2NRM A; 2HHB B; 3UHS A; 1CQ2 A; 2AUQ A; 1LFY B; 2W72 C; 5CN7 A; 4DWT A; 4TWU A; 1CO9 A; 1QSI A; 5CN4 A; 1YIH A; 2OLP A; 1BZR A; 6HBW A; 1HBR B; 1C7C A; 3RJN B; 4C0N A; 1BIN A; 1DXV B; 4M4B B; 1CG8 B; 1MLS A; 3UH5 A; 4HSW A; 5E29 B; 1MLU A; 1Y22 A; 2W6X A; 4NXC A; 1QPW A; 1AJG A; 1A0U A; 1Y0A B; 1Y4Q B; 2HHB A; 1BUW B; 1LFY A; 1HBB B; 2JHO A; 1AJH A; 3HHB B; 1H97 A; 1HBR A; 5ILE A; 1LH6 A; 1YEU B; 3G4V A; 3PT7 A; 1DXV A; 1S5X A; 1FAW B; 4M4B A; 1CG8 A; 1NZ3 A; 1TES A; 4ZVA A; 5E29 A; 1Y0D B; 1ABY B; 3UHI A; 1PBX B; 3B75 A; 3LHB A; 1UC3 A; 1Y0A A; 5E6E B; 1J40 B; 2H8D B; 1BUW A; 1MWC A; 1QXE B; 3UHE A; 1MNJ A; 1Y0W B; 1HBB A; 1VXH A; 5CNF A; 1K1K B; 2ZSS A; 3OZV A; 3HHB A; 5C6E B; 4AVE A; 1YEU A; 2OH9 A; 3PIA B; 1YCB A; 1FAW A; 4G51 B; 2D5X B; 5EOH A; 1BZZ B; 1NZ5 A; 1RTX A; 1Y0D A; 1ABY A; 1PBX A; 110M A; 5E6E A; 1J40 A; 1LH1 A; 5JDO F; 2H8D A; 2ZS1 D; 1QXE A; 1Y0W A; 5HU6 B; 3UBC A; 1J7W B; 1K1K A; 2NSR A; 1V4W B; 3HEO A; 5C6E A; 4NS2 A; 2ZLT B; 4YU4 A; 4F6J A; 1N9F A; 3VHB A; 1UX9 A; 3PIA A; 2RI4 A; 1EW6 A; 2D2M A; 4G51 A; 3AG0 A; 2D5X A; 2ZS0 B; 3KUN A; 2HCO B; 4MBN A; 1HRM A; 1I3D A; 1MNI A; 1YIE B; 1JW8 A; 1GDJ A; 4MQK B; 1NZ4 A; 2GNV A; 1B86 B; 5HU6 A; 5IKS A; 1JP8 A; 4MQI A; 5D5R A; 1JPB A; 3ZJS A; 1J7W A; 1A3O B; 1YHE B; 1MYG A; 3BJ3 B; 1N9X A; 1Y7G B; 3ZJP A; 1GDL A; 5CHQ A; 2HBD B; 2V1H A; 1O16 A; 2ZS0 A; 1IWH B; 1CBM A; 1Y7C B; 3KMF A; 5HAV A; 1VRF A; 1MOD A; 3VRE B; 2HCO A; 4NI1 B; 1MOA A; 1UX8 A; 1VXE A; 3E4N A; 1YIE A; 4MQK A; 5EE4 C; 5JDO C; 1LJW B; 3ASE A; 1B86 A; 3D7O A; 1X3K A; 5E83 B; 2D2M C; 3BJ2 B; 1A3O A; 1YHE A; 3PEL B; 3VRG B; 1JZL A; 3BJ3 A; 1FHJ B; 1Y7G A; 2EKU A; 1FSL A; 4DC8 A; 3OO5 A; 2HBD A; 1Z8U B; 2HZ2 A; 3UH3 A; 3GOU A; 2EB9 A; 4HRT B; 1Y7C A; 2MBW A; 1VXG A; 4NI1 A; 3ODQ B; 1BZ1 B; 1EBT A; 2ZT3 A; 1LJW A; 1Y4B B; 2XKI A; 4FWX A; 5E83 A; 3K8B B; 3BJ2 A; 1SPG B; 2O5Q X; 2ZS0 C; 3PEL A; 3H57 A; 1O1J A; 3VRG A; 1Y5F A; 1FHJ A; 1S5Y B; 1A9W E; 1IBE B; 2ZSN A; 2V1E A; 2FAM A; 1RQ3 B; 3QMA A; 3MVC A; 2QRW A; 2AUO A; 4G1V A; 2VYZ A; 2V1I A; 1CP5 A; 2AUP A; 4KJT A; 2GL3 A; 1G0B B; 2HHE B; 3LB2 A; 2MGI A; 4F6I A; 1YE2 B; 1GDK A; 3ODQ A; 4GZG A; 3UHX A; 1BBB B; 1BZ1 A; 1MNH A; 3FS4 B; 4G1B A; 1Y4B A; 3UBV A; 4F69 A; 1GBV A; 4WJG 1; 1NQP B; 1NPG A; 1LFQ B; 2MGH A; 1IBE A; 4UIQ A; 4L2M A; 3EU1 B; 1RQ3 A; 1Y4F B; 4WCH D; 2ZT1 A; 1JP9 A; 1A6N A; 2VYY A; 1MLO A; 4TWV A; 1MWB A; 3A5A A; 1MKO B; 2VYW A; 1JL6 A; 5MBN A; 1NWN A; 1T1N B; 1YGF A; 3HF4 B; 3WCU D; 1G0B A; 2HHE A; 3OO4 B; 4N7N B; 1YE2 A; 1Y4V B; 1MLK A; 1BBB A; 1FSX B; 2IG3 A; 3FS4 A; 2R80 B; 4H2L B; 3WFW A; 3UHV A; 1CG5 B; 3WFT A; 3G53 A; 1M6C A; 1NQP A; 1LFQ A; 4QAU A; 1RVW B; 3WFX A; 2MYD A; 3V2Z A; 4UUR A; 2MGE A; 1MNO A; 5SW7 B; 3WCV B; 2Z8A A; 1O1O B; 3EU1 A; 2O5B X; 4L7Y B; 1Y4F A; 1Y35 B; 1YHR B; 3ZH0 A; 5D1V A; 1YMA A; 1BAB B; 1T1N A; 3HF4 A; 3R0G A; 4FH6 A; 2GRF A; 1O1P B; 3OO4 A; 4M4A B; 4N7N A; 3GDJ B; 1Y4V A; 2O5M X; 2HBS B; 2FRI X; 3KUO A; 1YFF B; 1FSX A; 1MLM A; 2QU0 B; 1YHU C; 2R80 A; 4H2L A; 3PI9 A; 1CG5 A; 1VXA A; 1THB B; 3HRW B; 2NSS A; 1MNK A; 3K3U A; 1MYZ A; 4PQB A; 1M6M A; 3QM7 A; 2D2N B; 2BLJ M; 2QSS B; 5SW7 A; 3WCV A; 2GKN A; 1O1O A; 1XZ2 B; 3GQP B; 4L7Y A; 1Y35 A; 1YHR A; 1QI8 B; 2MHB B; 1LFZ B; 3DHT B; 3CY5 B; 1BAB A; 3ARL A; 1UMO A; 1MYM A; 1BVD A; 1GZX B; 2EVP A; 1O1P A; 1DXC A; 4M4A A; 4ZVB A; 3GDJ A; 3S65 B; 2HBS A; 1NS6 B; 1YFF A; 2QU0 A; 1DUK A; 1YH9 B; 1HDS B; 1THB A; 3HRW A; 1VHB A; 1ECO A; 2WTH A; 2ZSP A; 1GLI B; 2D2N A; 2QSS A; 1ASH A; 1MDN A; 2EB8 A; 3ZHW A; 2PGH B; 3VRF B; 1DXT B; 1XZ2 A; 3E5O A; 1A3N B; 1G9V B; 1QI8 A; 1LFZ A; 3A5G A; 3DHT A; 3CY5 A; 2NRL A; 1MLL A; 1DXU B; 1OFK A; 1GZX A; 1A4F B; 1A00 B; 1ECN A; 1YOI A; 2W6V B; 3MYM A; 3WI8 A; 2QSP B; 1O1K B; 2BNL A; 2ZLW B; 2ZST A; 3WCV C; 1YH9 A; 5EU2 A; 1HDS A; 1M9P B; 1A01 B; 1IDR A; 2ZT2 A; 1Y31 B; 3ARJ A; 1GLI A; 2ZSR A; 2PGH A; 3VRF A; 1DXT A; 1A0Z A; 5CNB A; 1A3N A; 1G9V A; 4ILZ A; 3MKB B; 1LH3 A; 1IRD B; 2ZSO A; 2GRZ A; 1DXU A; 3PI8 B; 1A00 A; 2W6V A; 3ED9 A; 2GTL D; 2QSP A; 1O1K A; 2ZLW A; 2D2N C; 5JOM A; 3PI2 A; 3ECX A; 1MBO A; 1M9P A; 1XZ7 B; 4FC3 B; 1Y4P A; 1J52 A; 3ZJO A; 1Y01 B; 1HBG A; 2G14 A; 1Y31 A; 4O1T A; 3WCP B; 3SDH A; 1DKE A; 4HHB B; 1DO1 A; 1LHT A; 1A6G A; 1MYT A; 1LFT A; 1MTJ A; 2O5O X; 3MKB A; 1OBM A; 1RQ4 B; 1IRD A; 1J3F A; 1Y0T A; 1NS9 B; 1GBU A; 5CN6 A; 4FH7 A; 5AZQ A; 3PI8 A; 3PT8 B; 1MTK A; 3TM9 A; 3UH7 A; 4FC3 A; 1XZ7 A; 3OK5 A; 1VXB A; 2BW9 M; 1DXD A; 1Y7Z B; 2ZLU B; 1MWD A; 3WCP A; 2D5Z B; 2AUR A; 5EUI B; 5JGG B; 1VXF A; 3G4W A; 3GKV B; 3S48 C; 3WCT D; 2QLS B; 2O5L X; 1JF3 A; 1BZ6 A; 1NS9 A; 4ROL B; 1W92 A; 3ZJL A; 4PQ6 A; 1MBA A; 2VM0 A; 1VRE A; 1GJN A; 2MGJ A; 2GKM A; 2NX0 A; 3MBA A; 1YE0 B; 1Y4R B; 3ARK A; 3LR9 A; 2SPL A; 1WVP A; 5HLX A; 4O4Z A; 5JDO D; 2ZLU A; 1BVC A; 4FWZ A; 1Y4Q A; 3QM5 A; 1XQ5 B; 2D5Z A; 2AA1 B; 1DO3 A; 1YVQ B; 5EUI A; 5JGG A; 1MBD A; 3D4X B; 1YG5 B; 1Y46 B; 3GKV A; 2QLS A; 1WMU B; 3UH6 A; 4ROL A; 1LFV B; 4F6D A; 2MYC A; 1ECD A; 1YOH A; 3ZJN A; 2XYK A; 2ZSX A; 1MLF A; 1NEJ B; 5EET A; 1CIO A; 3FH9 B; 1RPS B; 1Y09 B; 3UHZ A; 1YE0 A; 1Y4R A; 1KR7 A; 2EF2 A; 1YEN B; 3S66 B; 3HEN A; 4F4O B; 2VLZ A; 3AT5 B; 1XQ5 A; 2ZLV B; 1YVQ A; 3D4X A; 1YG5 A; 3IC0 B; 2ZSZ A; 1Y46 A; 3A2G A; 1HBS B; 5HLU A; 4C44 A; 1WMU A; 1O1L B; 1URV A; 1X46 A; 2C0K A; 1CH2 A; 3MOU A; 2EKT A; 1NEJ A; 1A6M A; 1PMB A; 5M3S A; 1RPS A; 1Y09 A; 3ORD A; 1B0B A; 3P5Q B; 1NGK A; 1YEN A; 3S66 A; 1BZZ A; 2LH7 A; 4YU3 B; 2MYA A; 4F4O A; 1UIW B; 2DHB B; 3AT5 A; 3HXN B; 2ZLV A; 5B85 A; 3WCW D; 3IC0 A; 2MGD A; 1G0A B; 2ZS1 B; 3TM3 A; 3OZU A; 1FCS A; 3AQ9 A; 1ABS A; 1O1L A; 1QXD B; 3O7N A; 1OUT B; 3NG6 B; 2Z6N B; 1V4W A; 2MGC A; 3E55 A; 2ZLT A; 5EQM A; 3PI4 A; 4MXK A; 2G0Z A; 4MXL A; 1JWN A; 2VHB A; 3IXF A; 1HDB B; 1DTM A; 1A9W A; 3P5Q A; 4YU3 A; 4O35 A; 1UIW A; 2DHB A; 1OJ6 A; 3QM9 A; 5CHR A; 1DTI A; 3BOM B; 3HXN A; 1XCH A; 3OVU C; 1SDL B; 2D60 B; 2PEG B; 2ZS1 A; 1FDH G; 3WCW B; 2ZT4 A; 1MBI A; 6HBI A; 3NG6 A; 4ODC B; 1LFL B; 5HY8 B; 2D6C A; 2Z6N A; 3QM6 A; 3UHH A; 3WR1 B; 3TLD A; 5C6Y A; 4VHB A; 3H58 A; 1SPE A; 3D1K B; 3V2V A; 5MBA A; 3HC9 A; 1HDB A; 3QQR A; 1NXF A; 2ZT0 A; 2IN4 A; 2MGK A; 1IWH A; 1CH9 A; 1SWM A; 3UHN A; 5JDO E; 3VRE A; 1YHU D; 102M A; 3BOM A; 4F68 A; 5KER B; 2ZFO D; 1SDL A; 1X9F D; 2D60 A; 1XZ5 B; 2PEG A; 2WTG A; 1UFP A; 2W6Y A; 3UGY A; 4F6F A; 4ODC A; 2V1G A; 3SZK B; 3UHR A; 3MJP B; 3KMF C; 2W31 A; 1SHR B; 2HZ3 A; 3WR1 A; 3LB1 A; 1YDZ B; 2OH8 A; 107M A; 3QJC B; 4OOD A; 3AQ5 A; 2ZS1 C; 2FAL A; 1YVT B; 1WLA A; 4HRT A; 3UHY A; 1HSY A; 1HV4 B; 1LTW A; 5KER A; 2R50 A; 3UHQ A; 2MGL A; 3QM8 A; 1Y2Z B; 3D17 B; 2R4X A; 1OUU B; 1CIK A; 2MGG A; 1OR6 A; 3K8B A; 1SPG A; 3SZK A; 3MJP A; 1U7R A; 1S5Y A; 1SHR A; 1MCY A; 3A0G B; 1N9I A; 1DUO A; 5HBI A; 1YDZ A; 4NZI A; 3GLN A; 3QJC A; 2XKH A; 1YVT A; 3OGB A; 3M39 A; 1HV4 A; 3G4R A; 3EOK B; 1Y2Z A; 3D17 A; 1OUU A; 1DM1 A; 1Y8I B; 3NFE B; 1COH B; 4NK2 A; 4PNJ A; 1Y4G B; 1UVY A; 2DN3 B; 4O4T A; 1CBL A; 106M A; 3ZOL A; 3W4U B; 4KN3 A; 3M3B A; 2VRY A; 2G0S A; 4ROM B; 1R1X B; 3ZJH A; 2VEE A; 1Y83 B; 2H35 B; 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1MLH A; 1IOP A; 1CO8 A; 1MGN A; 1MLQ A; 1UFJ A; 3GQR A; 3D1A B; 3S1I A; 108M A; 1VXC A; 103M A; 2B7H A; 3RGK A; 1G08 A; 4MQC B; 1MYH A; 2MB5 A; 2MGA A; 1YOG A; 1HGA B; 3AQ6 A; 2CMM A; 1HGB B; 1O1N B; 2GTL B; 1HDA B; 4TYX A; 1CH3 A; 3G52 A; 2M6Z B; 1LA6 A; 2G3H A; 3G46 A; 2W6W A; 2QFN A; 4MQH A; 1HBI A; 2QMB A; 1MLR A; 3PT7 B; 4HHB A; 1EWA A; 1S5X B; 3D1A A; 4UZV A; 2MYB A; 1FLP A; 4MQC A; 1RQ4 A; 3B75 B; 4FWY A; 1NAZ A; 2O58 X; 1MYJ A; 3DUT B; 3PT8 A; 1XZU B; 1HGA A; 3ZJM A; 1CP0 A; 1MTI A; 1HGB A; 1O1N A; 3ECL A; 2GTL A; 1HDA A; 3AT6 B; 2M6Z A; 4N7P B; 1Y7D B; 1UT0 A; 1YEQ B; 5HLQ A; 5EE4 D; 2ZSY A; 3G4Q A; 1Y7Z A; 1MLN A; 4JYQ A; 3O89 A; 4IRO B; 3UHU A; 2D2M D; 5ILR A; 1AJ9 B; 2V1F A; 1O1I B; 1V75 B; 1CH7 A; 112M A; 1JZK A; 2R4Z A; 3WCT B; 3EDA A; 1XZV B; 4MQJ B; 3DUT A; 1XZU A; 1Y45 B; 3MYN A; 3AT6 A; 3QZZ A; 1BIJ B; 3GK9 A; 4N7P A; 1Y7D A; 1YEQ A; 2OIF A; 5EV5 A; 5AZR A; 4YU4 B; 2AA1 A; 4B4Y A; 4IRO A; 1YMC A; 1AJ9 A; 2RI4 B; 2ZS0 D; 1O1I A; 1JY7 B; 2D2M B; 3M3A A; 2R4Y A; 1V75 A; 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