3QM3A

1.85 angstrom resolution crystal structure of fructose-bisphosphate aldolase (fba) from campylobacter jejuni
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
355
structure length
350
Chain Sequence
AMGVLDIVKAGVISGDELNKIYDYAKAEGFAIPAVNVVGTDSINAVLEAAKKVNSPVIIQFSNGGAKFYAGKNCPNGEVLGAISGAKHVHLLAKAYGVPVILHTDHAARKLLPWIDGLIEANAQYKKTHGQALFSSHMLDLSEESLEENLSTCEVYLQKLDALGVALEIELGCTGGDNTGIDNSKLYTQPEDVALAYERLGKISDKFSIAASFGNVHGVYKPGNVSLQPEILKNSQKFVKDKFALNSDKPINFVFHGGSGSELKDIKNAVSYGVIKMNIDTDTQWAFWDGVREYELKNRAYLQGQIGNPEGDDKPNKKYYDPRVWLRSGEESMIKRLEIAFEDLNCINKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
publication title 1.85 Angstrom Resolution Crystal Structure of Fructose-bisphosphate Aldolase (Fba) from Campylobacter jejuni
rcsb
source organism Campylobacter jejuni
total genus 140
structure length 350
sequence length 355
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01116 F_bP_aldolase Fructose-bisphosphate aldolase class-II
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qm3A00
3BLFA 4Q32A 2CU0A 4DF0A 2A7NA 3HG5A 1BWLA 3ATYA 2NZLA 3PS7A 2Q8ZA 4MPQA 1OFPA 2B7PA 2QCFA 4PL1A 5BW6A 3C2RA 4ML9A 5LHFA 4O10A 1DORA 1ML1A 2NX3A 2TYSA 1LRNA 2V81A 3G1YA 4RR4A 1T96A 3N2MA 2X2GA 4LC6A 3S1WA 1Z42A 3TU9A 4GXMA 5AN7A 1NSJA 1XI3A 5DCDA 3ZWTA 5K9CA 1H1ZA 1ZNNA 1K8ZA 4DPQA 3QYQA 3M47A 3MP3A 3W7HA 3O1NA 1GT8A 3NQMA 3EX4A 4LV4A 2ISVA 1DL3A 4N2YA 4IMFA 4ZQMA 5ABTA 4I7UA 1WYIA 5K9DA 4IQLA 5E1QA 5HWJA 3NQGA 2DZPA 1W8SA 4XKYA 4DF2A 2WNQA 4BF9A 2BWGA 2J24A 3B4UA 4JTJA 4L4LA 3W7EA 1AG1O 1JCJA 2FTPA 3L5MA 3P80A 2I1OA 3TNOA 1H63A 3GYEA 4NUWA 4KWWA 3C52A 3KVJA 5HINA 2B0MA 5HJLA 2BXVA 4JTTA 1G7VA 2GJLA 3W88A 1ZALA 1C29A 1YTDA 2ZA2A 2Z0IA 1XL9A 3PBUA 2A7PA 1O5XA 4EVZA 5KITA 1H51A 1OVDA 1M7OA 3B04A 3MO7A 3W86A 1TB3A 1OFQA 3PSWA 4NNAA 4XZ9A 4Z1BA 2P0OA 3BK0A 3UWQA 3NAVA 1DJNA 4CCEA 2A0NA 4JYFA 1I2QA 3CC1A 5FF4A 4MY8A 1S3HA 1PCKA 1DJQA 1JUBA 3OHIA 3TV8A 2XFWA 3QSRA 3PC0A 3RF9A 1T99A 1OHLA 4NJKA 4CQ8A 4Z1AA 5AHFA 2YXGA 3HG3A 4EF9A 3EWBX 3N14A 4UFKA 2Q3RA 1RVGA 1TPDA 3PR2A 1ME8A 3GXTA 5HWMA 1AW5A 4X3ZA 4B5NA 3KVLA 3JS3A 1NVMA 4K36A 2P1FA 2V2CA 2ZYFA 2C0AA 5BMXA 4ORIA 1LRQA 1KM6A 1AW2A 1GEQA 1YPFA 3P67A 3WK0A 5DCBA 2C18A 4IUOA 4O8RA 1Z44A 5CPOA 1XC4A 3USBA 1YXYA 2ISWA 4LS2A 2FJKA 1G67A 3G1XA 4LTSA 4FNQA 1VR6A 3LGEA 1SZGA 1LOLA 4MVAA 3TQVA 5C2XA 3H54A 1MXSA 3DAQA 1QO5A 3O8AA 2CLFA 4NJGA 4FX6M 4K37A 3TFCA 4JNMA 3Q94A 2JKPA 3LBMA 4QJ1A 1QOQA 5CPLA 3ABQA 4ICNA 1WDWA 4AWTA 4FNPA 1KV8A 4GUHA 3OEXA 1THFD 4CNNA 2RFGA 3GAKA 2QCDA 5D09A 3LHTA 2JKEA 2PURA 4HHPA 4X2RA 3NQ8A 3IVSA 4QM1A 3TROA 3GK0A 2WSRA 1X7FA 4LT9A 3HBLA 2I9EA 2DU2A 4R34A 1OYAA 1XM3A 1TPFA 4O54A 1LBFA 5AHMA 3SSJA 3TSDA 6TIMA 2CLLA 3CIXA 5HMSA 3NYZA 5G5IA 1ZY9A 5CPNA 3ABRA 2GUUA 5BMWA 1QPRA 1GYLA 1OX4A 4N9BA 3TK7A 3WK1A 2ISSA 3TC6A 4GE8A 4BI5A 2GJNA 5H2ZA 1SZFA 2Z6JA 3FLUA 3RLUA 2C6QA 1EWDA 1XUUA 3PSVA 3DI1A 5KZMA 1N7KA 4WJEA 1W31A 2QCEA 4D2JA 3CEPA 4NX5A 1VCGA 4GFSA 4JY8A 3WJXA 1EEPA 4PC8A 3T44A 4HPJA 4IX0A 3W1LA 5CG7A 4I7WA 3OVQA 4PFMA 1OX5A 1OFEA 3W72A 2P10A 1H5YA 1QPQA 4JYEA 4OE7A 2VOMA 4WUIA 1VHCA 1SZEA 2DZWA 1H50A 2A85A 3GKFA 3DH7A 2PE4A 3CTLA 1JQVA 3YPIA 4IMGA 4AF0A 3CU2A 3QF0A 5LNWA 2FPVA 5CSRA 1EPXA 3IIXA 4JEQA 3NPUA 1FY6A 3UZJA 2ZRWA 3I7SA 4LVGA 2ATMA 3R12A 3NQEA 4I9AA 4DELA 1AMKA 3CWNA 5F4WA 5I3IA 2OCZA 2ZRVA 1KM4A 4CLMA 5F2GA 1I2OA 3O05A 2QAPA 4UTTC 3C56A 3O16A 3QSTA 4H4IA 2Z6IA 3VFLA 1ZENA 2ZRYA 3C2OA 1BWKA 3B8DA 3NPXA 1O60A 3Q2DA 2E5CA 1U83A 2NXHA 3CEUA 3W75A 2C3ZA 4JICA 2BTMA 4UTLA 3W1UA 1WAUA 1ICSA 2A7RA 3O06A 1Q6OA 3S1UA 3L65A 4XQ6A 3PG9A 3TE9A 1U5JA 3KXQA 3HPXA 3QJAA 1KW1A 5GVJA 4U28A 2EHHA 4MOZA 3R5EA 4FX7A 2DP3A 4UMBA 4A22A 5FF3A 2R91A 3QPYA 3L67A 3SJ3A 1D3GA 4XBKA 3LRKA 3P8JA 2CZEA 3GDKA 1GVOA 4CQAA 1LLZA 1IXPA 4LNYA 5U7SA 3PBWA 3VNDA 1YLVA 3NEVA 2CZDA 1HG3A 5E0KA 3DI0A 3EX1A 1IXNA 5HR7A 2QCNA 3W7RA 3GZ3A 4QNEA 4FNRA 2GVGA 3LB0A 5CGQA 5I3JA 3MYOA 2YW3A 1EUAA 1FQ0A 4UTMA 1K02A 1F5ZA 1FBAA 3MJYA 1JQXA 3PULA 3S8HA 2DJLA 2E5DA 3DU0A 2VEKA 3HQ1A 1QCWA 1VYPX 3PBYA 3TKFA 3C61A 4LS1A 1M7PA 5FF2A 4R7JA 5KINA 3E96A 3L66A 4UR8A 1R30A 3D0CA 3G1AA 3IV3A 5F4SA 1Q6LA 2ZCGA 2YR1A 2YDAA 3F4NA 1LCOA 1ZJIA 3G3MA 3M9YA 2EPHA 2NXIA 1AK5A 5F4XA 5EY5A 3DXIA 1LOSA 4ZQOA 3IIVA 5C5YA 1KFBA 1HFBA 3UWZA 2BSLA 5K3VA 1PIIA 1UCWA 3SR7A 1GVRA 1O94A 4NU7A 4N6EA 3TA6A 3M5VA 3NQ6A 1J4EA 3NXFA 3GB6A 4UNKA 5CSSA 3DKJA 3NL3A 4MZ8A 3QQ1A 1CW2A 3E0IA 4O11A 5HR6A 4UC5A 4LVBA 2QDHA 3NPVA 1B9BA 3LERA 3LV5A 5F1UA 1A53A 1JCMP 2YZRA 4KKXA 3I65A 1OFOA 1EIXA 1XBVA 2Y7GA 3G1VA 4WY0F 1QAPA 5D37A 3O6DA 1KLYA 5DCEA 4UTTA 1JCNA 1TCDA 3A5VA 1PHQA 2FDSA 2YYTA 3FIGA 3QW4B 1A5CA 3L2IA 4HIBA 2HMCA 1R2RA 2PRMA 1JCXA 1KV5A 4XKYB 2BZNA 3DFPA 2ZQ0A 3HO8A 2ZZ5A 3IGUA 3IVUA 4U4MA 5D30A 5BOOA 5DELA 4NZJA 4RXFA 3NL6A 4POCA 4GBUA 5AHEA 3B05A 2JKAA 4O4VA 3RMJA 3P5YA 4O0ZA 3SGUA 2FLIA 2E77A 1GOXA 2QJHA 4OBTA 3KRUA 4KWVA 2YPIA 1A50A 4AWUA 5TIMA 2EF9A 2OT1A 4LVAA 4TR9A 4LV9A 1SR9A 4TMCA 5LNVA 3NPWA 2CLOA 5G1YA 1Z48A 1F76A 4WZHA 3T40A 1PVNA 2OJPA 3PBVA 3ATZA 3G24A 4XTDA 4O13A 1VS1A 4GUIA 4BI7A 4ADTA 1X6UA 1D3HA 5FF0A 4CQ9A 4AXKA 1YYAA 2FQIA 3EKLA 3GDTA 2WV8A 1DV7A 1VRDA 4MFDA 2RHGA 2G95A 3STGA 3O07A 1UUMA 1GWJA 2J27A 1OFBA 3E49A 4DBEA 1ZAIA 2E6AA 3RNDA 1YDNA 1HO1A 3STEA 4O57A 5CZJA 5K9XA 1DQWA 2QAFA 3UY7A 2RDUA 1W1ZA 3G18A 4BFAA 4RXGA 3W1TA 1SSDA 4P2VA 1F74A 1H62A 3G1FA 4PA8A 3M5YA 2B7NA 3MHFA 2Y88A 4LUIA 2R14A 4JN6A 3F03K 1G4TA 2J9XA 4DXVA 1TMHA 4LOCA 1RQBA 3QMRA 1EB3A 4LY8A 3GAYA 1Z41A 1DKWA 1C9DA 3TXVA 5DLCA 5IBXC 3LV6A 1SO4A 3EXRA 1QOPA 1I4NA 1KTNA 1ZAJA 5L6UA 1O5KA 1TPUA 3R2GA 3CQ0A 2F7FA 4PEKA 4O1BA 4IX2A 4IPIA 5I3HA 1VYRA 3W7DA 1AL7A 1UUOA 3QZEA 4XBSA 3DFOA 4MLRA 5G2HA 4GUGA 4ZQRA 1TPH1 1IXQA 3W6YA 2ZRUA 3FFSA 3HG4A 3NG3A 1CX9A 2QEZA 4Z1CA 3M44A 3W7OA 1NF0A 3TQKA 1TJRA 3W87A 4JX6A 3G0UA 1XDLA 3TR2A 3EX6A 2VFIA 2QCDB 4MIMA 5J5RA 4BI6A 3QW3A 2X1UA 3I7RA 3GNNA 5FEPA 2A2IA 2V5LA 4DQWA 2ZZ2A 3LI1A 3N34A 5EA9A 4DPPA 4WOZA 4K6AA 3V75A 5I3KA 1I2NA 3LCGA 1OYCA 3CT7A 4RJEA 1F6PA 2Y7FA 3SY5A 4N02A 4PTNA 3HPZA 2YSWA 4UUIA 1SPQA 1LRTA 2PCQA 3WJWA 3MMTA 5IM51 2EGZA 3EKZA 4MZ1A 4I7VA 2DZSA 1OX4B 1B3OA 5AC6A 4QISA 3N2XA 4Q33A 5AC8A 2YW4A 2ALDA 5LNSA 3ABOA 1AL8A 5D02A 4O53A 3M7WA 4G1KA 5AOUA 4AVFA 4LUJA 3EWZA 1JJKA 5KZEA 3QMSA 2H6RA 5F2LA 1W3NA 3BG5A 3R13A 1KTCA 3W2UA 1RQHA 4TX9A 1VCVA 3G1HA 1R2TA 2ZA3A 3LCHA 3LCLA 4EWND 2WPBA 3B0VC 5KMYA 1K03A 3BV4A 4LRSA 1TIMA 4DO4A 2LLEA 3T55A 4A29A 2WNNA 4UMCA 3LI0A 1OF8A 4AF0B 4YLWA 4GC4A 5A5WA 4JTLA 4QNWA 7TIMA 1W3TA 3STCA 2VC6A 1AW1A 4LC8A 1KFLA 2B4GA 3PUOA 4Y8FA 2ZBTA 2AGKA 3BG3A 2EKCA 3ANYA 4QITA 4WXZA 2TMDA 2QJIA 3RLVA 1TYGA 1FCBA 1YXDA 2FPYA 1NAL1 4E2DA 3DZ1A 2W79A 3HMJG 2E6FA 4R33A 4HPXA 5IBXA 2C13A 3NVTA 2VFHA 2YCEA 2V9DA 3HGRA 3LHYA 1YXCA 1IXOA 3IGSA 1GVFA 4QSHA 4FIQA 4MLJA 2ATSA 3N19B 5LHEA 1VHNA 2W0UA 5D2YA 3KRSA 2ABAA 3S1VA 4J9JA 2WJZA 1VGAA 3W7KA 3VCRA 4MYAA 5EPDA 2BX7A 3OIXA 1KFEA 2JK2A 3S6DA 4JX4A 3TJXA 3W1PA 3EWUA 2ZZ3A 3MP4A 2WKJA 3WK2A 3FYPA 4GNJA 5HULA 5EMUA 4GWEA 1I2RA 1SU5A 4OQVA 3BLEA 3DBPA 1HUVA 1NFBA 2DZTA 1X8FA 3L9CA 2R8WA 3UNDA 2RDTA 4XTIA 5AHNA 4IXXA 2EAWA 2YGYA 3BW4A 1WBHA 4CNOA 4WXYA 1XXXA 3MBFA 2UV8G 2FB3A 3LCFA 3ZWSA 4YWIA 1KLZA 3FEMA 3S5NA 3BLIA 2VENA 2WO5A 5K2ZA 1BTMA 1OJXA 4RV8A 1X1OA 2X1RA 3L0GA 5HQEA 1ZCOA 2Y61A 3Q58A 1S5TA 2G97A 3DFQA 4BWLC 5AC7A 4UTKA 3TX9A 3KRZA 1A5BA 3NL5A 3H53A 4UTIA 3UZ5A 1IIHA 3E9AA 4JY9A 3BW2A 4O14A 2F84A 3M0ZA 4QQ3A 1VZWA 4ALDA 5CPMA 3E02A 4IMEA 4Z1DA 3UPBA 4K38A 1GG1A 4CCCA 1TTPA 4W9TA 1T8XA 4HT3A 5AHIA 3LM7A 1LORA 1TSIA 3TFXA 3CIWA 1SO5A 4TU1A 5MHBA 4KFNA 2DJXA 3C2EA 2H90A 2WOQA 1XBZA 4PCFA 8TIMA 1FWSA 4IWWA 3RK8A 3DKLA 4PL2A 2E09A 5EBUA 1EP3A 5FI8A 3L5AA 2ZDRA 3LLDA 4DEFA 1L6WA 1V5XA 3N3MA 1KM5A 3P8IA 1QWGA 1D9EA 3TQ0A 5D2VA 3A22A 1LZOA 5E93A 1JVNA 1HTIA 2V82A 3NM1A 4FXSA 5FEZA 1TTJA 1KA9F 3W74A 1RV8A 2HS6A 3C2VA 4O18A 2E68A 1RR2A 2C19A 2RH9A 3NQCA 4X9SA 3W1AA 2YX0A 1NEYA 2OT0A 3R8RA 3ZR4A 3A21A 1OABA 1YADA 4MJZA 3ZS4A 1G4PA 1F73A 2ABBA 5G4EA 3NQFA 4JTSA 1R47A 1XUZA 4JTUA 3LCWA 3IEBA 5CZ0A 4FF7A 1FDYA 1SFJA 4UXDA 2RKXA 2Q8LA 3IVTA 4OHQA 5D04C 3W7JA 1EA0A 1VLIA 2CWNA 3P74A 3ABSA 3W2LA 4X22A 1TTQA 2E6YA 4YXGA 4UTJA 2VKZG 3CHVA 3NNTA 5HWNA 1FWWA 3VE7A 3M41A 3W7QA 4AAJA 3QH2A 1DQXA 2QUUA 4QAIA 1QPNA 1H1YA 2TSYA 1TPB1 4CCDA 3U6WA 3NQ2A 3PY2A 2A6NA 1H7RA 3L68A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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