3QMTA

Crystal structure of the mutant v182a,y206f of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGAGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIFLADNPAAAAAGIIESIKDLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: a structure-based explanation for how the 5'-phosphate group activates the enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
total genus 85
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2011-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qmtA00
5LNVA 3L66A 4CNOA 2P0OA 3BVJA 3UZJA 2V9DA 3DKLA 4GJ1A 3EWUA 1WXJA 1TTPA 1O5XA 4BWLC 3W83A 1SZFA 5KTLA 1GJPA 4IPJA 2IQTA 1A5CA 1EIXA 2HS6A 1OX4A 5DN1A 1MXSA 3FKRA 5TBOA 5DCBA 4Z08A 4N9CA 1KFJA 4M5PA 4Y9AA 3NQ6A 3WFAA 1J5TA 1C9DA 2A5HA 3KHJA 4WY0F 3JRKA 3L5LA 3LCHA 4GE8A 3TK7A 1DJNA 1I8JA 2DZUA 2E5BA 3GNNA 1EA0A 2VKZG 1W3NA 1HO1A 3M16A 4H3DA 1XM3A 2W0UA 4UFMA 1RQHA 1K8ZA 3OEXA 3TAKA 3A24A 4D2JA 3W1RA 2V30A 1SFLA 1EP2A 2ZRZA 3TJXA 4Z1BA 5C55A 4MY8A 1JR1A 1X1OA 3QMRA 1WDWA 3LLFA 3H55A 3MHGA 3W6YA 3A9IA 1R47A 3GXTA 5I3HA 3T55A 1VC4A 1Q6OA 1C8VA 3WJSA 3MI3A 3UXAA 3BPWA 4TMBA 3LCGA 1OFOA 4QSHA 4UR7A 3GDRA 1NFBA 3BW3A 3LHTA 3N9SA 3NDOA 3FFSA 3TQVA 4LS0A 5LHEA 3HGRA 3R13A 4FNPA 3LCXA 1OK4A 5D2WA 3W7DA 5J5DA 1FXQA 4JIQA 1IIHA 2Y63A 4KFOA 4UTWA 4W9TA 3M41A 5F2LA 2C6QA 1L2UA 1FCQA 1OX5A 5EL1A 5DBUA 4DF1A 2ZZ1A 3AJXA 4UCGA 3BG5A 3LI1A 2ZDRA 4EWND 1QPQA 1WBHA 3LHYA 4LVFA 4QNWA 2JGQA 4ADSA 5KSWA 2YPIA 2YYUA 3T40A 3EKLA 1OFQA 4MZYA 2CLHA 3LM7A 2E6DA 1W0MA 5HR7A 3LDVA 1BEUA 1H61A 2Z0IA 3MP5A 3KRSA 4HNNA 3L5AA 4AWTA 2ISVA 4C1KA 2Y7FA 2UV8G 3GAKA 1W3TA 4NJJA 4GUGA 3LCIA 5BNKA 4FXSA 3G1XA 3RNDA 2A2IA 3T7VA 1KFEA 4FB7A 1H5YA 1RD5A 2JK2A 3GK0A 1MEHA 3W7OA 1JCXA 4NXSA 1LROA 4POCA 3CC1A 3W9ZA 4XTDA 2RDTA 3NQCA 5CKSA 3G8RA 1TCDA 3C6CA 1H7NA 1KM6A 1KV8A 4O19A 2R14A 3FJ6A 3NL6A 3PULA 4S2CA 3SGUA 1I2RA 3LGEA 1QOPA 2ZQ0A 3OBKA 4UTIA 4M6QA 1FWSA 1TPB1 4UR8A 3PG9A 2TMDA 4CLMA 1IXQA 1W3IA 2C14A 2OJPA 3DH7A 5KZDA 1KTNA 3TSBA 1F05A 3M7WA 4WD0A 2X2GA 2GOUA 2QR6A 4JTLA 3F1QA 1WYIA 3M0ZA 1NF0A 4BI5A 5D03A 1FDZA 2OT1A 3W2UA 1D9EA 2O7QA 1M7PA 2EF9A 2PCQA 2TRSA 4ZQNA 4YMZA 2ZZ5A 1LBFA 4JX6A 4WY0B 2QCCA 1QCWA 5K4XA 5L9FA 2NV2A 2ZZ2A 4N9EA 3HBLA 3M9YA 1TTIA 3L5MA 3EWYA 1K3UA 3HG2A 1UUMA 1Z44A 4KFPA 3P67A 4FXRA 3C2VA 4R34A 5DY3A 5HWNA 2FQIA 3EX2A 4NX5A 3LRMA 3G0UA 1SO5A 1JCNA 1QDSA 4KFNA 2B7NA 4OQVA 2I14A 4A29A 1SO4A 4JEQA 2NUXA 3PBWA 3KRZA 2Y62A 1YDOA 3TV8A 1XBYA 2PURA 1NSJA 4K37A 1TMHA 3O07A 1A50A 1TB3A 1FWNA 1XXXA 5FI8A 3TR2A 4MYAA 1QPRA 3VE7A 3N34A 2QCDA 3S5ZA 5C5YA 3FOKA 2A0NA 2J24A 4U28A 2QEZA 1U83A 2A6NA 4CNPA 1W5QA 1A5SA 3S5OA 2WOQA 4WX2A 3HGJA 4OBTA 4XBKA 3UXDA 3O16A 3B0UX 2QUVA 1JQVA 1YPFA 4WJEA 3NZ1A 3W7CA 1JRBA 1M6JA 4UC5A 3STEA 3UY8A 3S6DA 3MJYA 1OF8A 3E9AA 1CI1A 2ZZ6A 2VFIA 3W1UA 4XBSA 3RLUA 3O06A 1TTJA 4BF9A 5LGXA 2C13A 4NXKA 3N2MA 2FLIA 3SGZA 4I7WA 1DHPA 4O0ZA 1N8FA 1X7FA 1DOSA 4I7UA 3NPWA 1GG1A 3M47A 3DHDA 3EXSA 3JR2A 4RXGA 2E6FA 1F6PA 3A21A 3MHFA 4JYDA 4AB4A 1VLIA 4JX5A 2V2CA 2BTMA 1EUAA 4UFKA 3S5NA 4QM1A 1LYXA 4UMBA 1AL8A 2ISWA 1W8SA 3OVRA 5DCDA 1CX9A 3GX9A 1OFAA 1P0KA 5AC6A 4DQWA 4NJGA 5E1QA 1Q6LA 1A5AA 1IF2A 4HPXA 5HINA 3GDTA 1GPWA 1XDLA 1PIIA 2DJXA 1EP1A 5KZMA 3MWAA 4U4MA 4YXGA 3LRKA 3L0KA 3I6RA 3NR0A 3DGRA 4QJ1A 5KINA 3LHWA 3L0GA 3STFA 1SZNA 4A2RA 4DPQA 3NVTA 1BTMA 3GR7A 1B4EA 3HPXA 4YLWA 1YXYA 1YDNA 3UYCA 3M43A 4UFIA 4YL2A 3L65A 3CLMA 1EUNA 4JY9A 8TIMA 2JKEA 2ALDA 1OFPA 4QIUA 1VYRA 2WPBA 1K7FA 1T0OA 4GUIA 1FCUA 3HG3A 1LBMA 2ATSA 1VPXA 4UTWC 4QQ3A 2RDWA 3C8FA 4EOUA 5AOUA 4XTIA 1VYSX 1XUZA 4WUIA 2CFFA 2B0MA 2YXGA 4IX0A 1H50A 4IJBA 3P5YA 2ATMA 3QSRA 1TPVA 4ZVJA 3SY5A 3R89A 4QNEA 4KKXA 1G4TA 3O6DA 4M7TA 3TU9A 3UWUA 3NYZA 1D3GA 4AHQA 1WBJA 1KM5A 1KLZA 2E5DA 4RKAA 4MUZA 5AHMA 3HPSA 1WAUA 4RR4A 1XFBA 4UFJA 3LCFA 3TMLA 3PG8A 3NQFA 3W1MA 1K7XA 4Z1CA 1QAPA 1WV2A 4LTSA 3U6WA 3TE9A 2QCHA 4FIRA 5K3VA 3S1WA 1YTDA 3QM3A 3I68A 1H1YA 3MYOA 3R2GA 2E68A 1TJPA 3N2XA 5G2HA 3KRUA 1QNVA 4JYFA 2Y70A 1R30A 5I3GA 1V5XA 1VS1A 3PBYA 3C2FA 3LBMA 5FF3A 3EWBX 1U5JA 5I3IA 1G4PA 3S42A 3BW4A 1DKWA 4ZQMA 3LB0A 4CCDA 2WNZA 4XQ6A 1LLZA 2YYTA 4LU0A 2JBMA 2YR1A 4OV4A 4NQ1A 1Q6QA 2A7PA 1ZNNA 3NM3A 3ZWTA 1OFEA 3LHVA 1YTEA 1BWLA 1W5OA 2DZSA 5LNUA 2YX0A 1H63A 1SW0A 5CG7A 4PCFA 1ICQA 3U8GA 2LLEA 3DXIA 1P1XA 4I7VA 2VC6A 1LZOA 5LZLA 1QWGA 3EX3A 2CU0A 3IEBA 3N3MA 4E2DA 2H6RA 2VFGA 3LI0A 1H51A 4OV9A 1YYAA 2R8WA 4UIOA 3W1QA 2V2HA 1IGSA 4UXDA 1I4NA 1SFJA 3E02A 1S5WA 3QC3A 1JCMP 2QJIA 4A21A 4CQAA 2ISSA 4O1AA 5EPDA 3NPUA 5HWMA 4K38A 4NNAA 3RMJA 2VELA 3HMJG 3TDFA 1T8XA 4Z1AA 1ICPA 2D73A 1J4EA 3N73A 1JCLA 5LGZA 4A3UA 2PRHA 4O8RA 4DEFA 5CZ0A 1OFRA 2DU2A 1KFCA 2C16A 4FF7A 3W1AA 3M5XA 1SQ7A 1KM3A 2CZDA 4NNCA 2I9EA 5G4EA 3ABSA 2ZCGA 2J6XA 4DELA 1F2JA 2ZTKA 4IGHA 4RZ6A 3ATZA 3HIJA 1KBIA 1LOQA 3I7RA 3IIZA 3GR8A 5DXXA 3IIVA 4AXKA 4XKYB 1B57A 3LLDA 5AC8A 5D09A 3CWOX 3LCLA 3HG5A 2WO5A 2B7PA 1TV8A 2VFDA 3NL5A 1VCFA 1LM1A 1NAL1 5I3FA 4K39A 5C2XA 3S9YA 4E2BA 2C3ZA 2J27A 4NZFA 2V5BA 3W88A 3C61A 2XN2A 3P62A 3PUDA 3YPIA 2VEMA 1XKYA 3VCRA 1QFEA 5G4WA 3MW7A 1TPH1 4RV8A 3W7PA 1G4EA 3FJLA 1OX6A 3P84A 4LVGA 4CCCA 2YGYA 2GJNA 3B8DA 2QKFA 3BLIA 3NA8A 4Q4KA 1KBJA 4Y90A 4MOZA 2WV8A 5EMUA 4H4IA 3PB0A 1PHWA 3LXBA 2DZXA 1LBLA 4E38A 2CZEA 1ONRA 1Q6RA 3NQGA 1RQBA 5CPLA 2V8ZA 4E0CA 4UTUA 3EKZA 4JY8A 2WJZA 2OCZA 2DJLA 3NL2A 4FX7A 4O16A 1XBZA 3BW2A 3DHFA 1JCJA 3RK8A 3MO7A 1ICSA 1XI3A 1KM1A 1LDCA 3GVGA 4O57A 3W23A 4AWSA 1W5MA 4JICA 4JTJA 4WOQA 1KV5A 1KFLA 3A23A 2NZLA 4O1BA 1BKSA 3SSJA 3NZRA 5KITA 1AW2A 3PAJA 4LOCA 4K8HA 3QYQA 1W5NA 2QCNA 1GEQA 3ANYA 4UTTA 1OJXA 1VGAA 1E51A 3C4UA 3W85A 1QPOA 1JUKA 1UUOA 2VFEA 4N9BA 5K4ZA 3DU0A 3W7MA 5FEZA 2C18A 1OK6A 1W56A 5G2IA 3VI2A 5CGQA 4GUFA 1GVRA 3R8RA 2C0AA 4G1KA 5BW6A 3NPVA 3WJYA 4MZ1A 4LVBA 2EKCA 3G18A 3Q94A 3D0CA 3SI9A 3WK2A 4JDYA 3KFTA 1YPIA 3NO5A 3AO0A 3NQ8A 3VE9A 4IX2A 4OHQA 1CW2A 4HNTA 4O13A 3MI2A 3GXNA 5AFDA 3W3OA 2X1SA 3NQ2A 3JS3A 3LHZA 1OABA 1XDMA 5DLCA 1R2TA 1ADOA 5HJLA 2E77A 1A53A 2Q8ZA 3UPBA 3U2OA 3W74A 3L2IA 4N2YA 3W07A 2C19A 3G1VA 3DFPA 4IPIA 1PV8A 1TRDA 3NQMA 3TC7A 2X16A 5K9CA 1I2PA 1LRTA 1AG1O 2QF7A 4S1FA 5AHNA 3CEUA 4MIMA 5I3JA 3S5YA 1L6YA 1OG0A 1ZENA 4RZ5A 2V2DA 3FS2A 1WQ5A 1QMLA 2Z6IA 1SPQA 5G1YA 3V75A 2NX9A 2GVLA 2GQ9A 3Q58A 5MHBA 1O95A 2VXNA 4FHAA 4AHPA 2BXVA 2Y85A 2DZWA 4BR1A 4I9AA 4OE7A 4PA8A 3O1NA 2Y6ZA 1OVDA 1AL7A 3G1FA 2ZRVA 4P61A 2NWRA 1PCWA 1K03A 1NVMA 3W7LA 5DELA 2PRMA 1GWJA 2ZZ3A 3OVQA 4YCOA 3NG3A 4UFHA 4LV4A 1GVFA 3QF0A 3CQ0A 3GAYA 2WSRA 5K9XA 4GXMA 1SUXA 2FPYA 1GYLA 4JR5A 3LRLA 2YW3A 5CSRA 3GDKA 4EVZA 3P8JA 3PUOA 3CEPA 1OHLA 3IIOA 4AAJA 3T78A 4LS2A 1HUVA 5FEWA 3A5FA 4B5NA 3INPA 1FY6A 2A7RA 2TPSA 5G2WA 3LCWA 3O8AA 3BG9A 4R53A 3GB6A 4IMCA 3O6YX 1TIMA 3HF3A 1I2OA 1JCYA 2GJLA 1HTIA 1I2QA 2CWNA 4TR9A 2OZ0A 5HUOA 4Y8FA 3IRDA 5D05A 3NQDA 3IGUA 4GBUA 2CLIA 4ZZ9A 1SZEA 1T99A 3TAOA 3GLCA 5LHFA 4X9SA 1EX5A 4UNLA 3PUEA 5E0KA 3G3DA 4PL1A 3G0SA 3IIPA 1ME8A 3G1DA 3NQVA 4ZMGA 3Q37A 4LUJA 3THAA 1IXNA 2P1FA 1G4SA 4O4VA 2Z6JA 1G6CA 3TROA 2V0TA 3NEVA 5HWJA 3B0PA 4WY0A 4CCEA 3UD6A 1PHQA 3EB2A 5IBXA 1Z48A 1P0NA 5GVJA 2H3BA 1N7KA 5F1VA 1DV7A 4O12A 3EX6A 2DZPA 4WXZA 3W1PA 1H62A 4MPQA 5D2TA 5LKYA 2OMAA 1MSSA 3BO9A 3IGSA 1GT8A 3WJZA 5DCEA 2EAWA 2AQWA 3NPXA 4HT3A 1RQEA 4J9JA 3TUUA 4UMCA 3FEMA 3WK3A 1VJIA 1EEPA 3TXZA 4L4MA 1LOLA 1JVNA 2V81A 4DO4A 2QDHA 2W6RA 3EEGA 4ML9A 5CPOA 2V82A 5H2ZA 3QH2A 2GQ8A 1OYAA 5HQEA 2GVGA 5D2XA 5EKYA 3W7KA 3I65A 4O15A 1X8FA 4IXXA 1K02A 2EGZA 1M5WA 4JXCA 2WQPA 5C54A 3M44A 1RZMA 4TU1A 3UWYA 4GNJA 2B4GA 3A5VA 4NU7A 3TJLA 3IVTA 1IXOA 3CIWA 3B4UA 1FDJA 1YLVA 4FNUA 3QMSA 4JD4A 4HHPA 3S1UA 3KXQA 4XUGA 1FWRA 4NUWA 2EPHA 3N19B 2ZRWA 2WSQA 3G0XA 4AEOA 1SW3A 1LOSA 4ZQPA 4MFEA 4Q33A 3O05A 4TO8A 1EWEA 3PSVA 3P5ZA 2ABAA 4DO6A 3W70A 5LNSA 1UASA 1THFD 4UMAA 5FF2A 3SFKA 4HSOA 3R12A 5A8GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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