3QOKA

Crystal structure of putative chitinase ii from klebsiella pneumoniae
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
PLMSVGYFNGGGDVTAGPGGDIDKLDVRQITHLNYSFGLIYNDEKDETNAALKDPAHLHEIWLSPKVQADLQKLPALRKQNPDLKVLLSVGGWGARGFSGAAATAESRAVFIRSAQKIIQQYGLDGIDLDWEFPVNGAWGLVASQPADRDNFTALLKSLREAVGEQKLVTIAVGANAESPKSWVDVKAVAPVLNYINLMTYDMAYGTQYFNSNLYDSSHWPTVAAADKYSADFVVNNYLAAGLKPSQMNLGIGFYGRVPKRAVEPGIDWTKADAQNNPVTQPYFGPQQIALFASLGYDLSKDTYVKYNDIVGKLLNDPQKRFTEHWDDEAKVPWLSVQSAEGKPLFALSYENPRSVAIKADYIKAKGLAGAMFWEYGADDQNQLARQLAESLGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Putative chitinase II
publication title Crystal structure of putative chitinase II from Klebsiella pneumoniae
rcsb
source organism Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae
total genus 124
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3qokA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3qokA01
4UQAA 3QOMA 2ZUTA 5DFAA 4BF7A 5D4YA 2Y4SA 2Z1SA 1V3LA 3VMPA 2WWDA 2YA2A 3AS2A 2D0HA 2BVYA 4PMQA 1CLVA 2VZSA 5I79A 3THDA 1PEZA 1B3WA 3OBAA 3RJYA 4AIEA 2V3FA 4OBSA 4D6IA 1DHKA 3PZUA 2YL6A 4F8XA 4W85A 5CG0A 3AS1A 2J79A 4CVWA 4CUCA 3SCWA 5BXSA 1FH7A 3U5YA 3NJ3A 2E8ZA 3WUFA 1ODZA 3CZLA 3ARTA 2E9LA 5FKYA 2WLZA 3S2CA 3TA9A 5C71A 4TXEA 2CITA 4JHZA 1NOWA 2AMGA 3GBDA 1XSKA 5A8MA 5FL1A 2A3BA 2TAAA 1JD7A 4QFUA 3CZEA 1WDQA 3MSGA 3W26A 3ZJ8A 4W93A 1BHGA 1GQJA 3RDKA 1J12A 4WKFA 4J3XA 5KEZA 5CPTA 2Y8KA 4YHGA 2CBVA 1GUVA 1CXKA 1JDAA 1VEOA 4PMXA 3O2LA 4HA3A 3WF1A 1UR9A 1UR1A 2CERA 3LMYA 3UEQA 5CGMA 3PBGA 3ARYA 2UWFA 5EB8A 4BQ2A 1TMQA 2DT1A 1GQLA 5E6YA 1JI2A 3LPFA 1ZU8A 3ZR6A 4X0NA 1E6NA 4PCSA 3GNRA 3RM4A 3AZSA 1V6XA 3MSDA 4PTWA 4ZFMA 3MU7A 3EDDA 4FK9A 3ZQ9A 3SCTA 1V0MA 2YJQA 5DT5A 3W6LA 1TUXA 4ZE4A 4JKLA 4PTMA 3AXXA 2VR4A 4E4PA 5E6ZA 1AMYA 1UR4A 3LPOA 5I2UA 3AS3A 2J77A 4GPNA 1RH9A 1CNVA 2D20A 2QPUA 1X6LA 1V6UA 1TG7A 2CESA 2ZUWA 4CGTA 3VD7A 5CZKA 4TX8A 1OSEA 2VQTA 4AZ6A 2E9MA 1QI3A 4QCEA 1H1NA 1CYGA 4UQEA 3A4WA 4K68A 4UOJA 1LL7A 2A3AA 5A95A 4CD4A 2WCSA 1UR0A 3AZTA 3FW6A 4EAMA 5C70A 3UETA 3WF3A 3NYDA 3K46A 3ZT5A 1CXIA 4UR9A 4R27A 4LXFA 2WVUA 5AYIA 1JGIA 1MW0A 1RP8A 3VU2A 1GHRA 2VRKA 4Z2GA 1BFNA 4U3CA 7TAAA 4XV0A 3OLDA 1ZJAA 5FL0A 4Q22A 3VNYA 1W1PA 1OD0A 1BYAA 5HXMA 3W25A 3WFLA 3ZOAA 3VINA 3L4TA 3BAWA 2XPKA 1B3ZA 1WO2A 2D24A 2E9BA 4RE3A 1AQHA 1QOXA 2YL9A 1HJSA 2YDRA 1BYCA 5AC4A 1UZ4A 1FP8A 3DYOA 4ML4A 1SYTA 1V0KA 1P6WA 2ZUSA 4PMDA 3WQ5A 3BLKA 1MW1A 5DEZA 2OLHA 5JIPA 1UWUA 1JF5A 4UZSA 3CLWA 1O6IA 4GI6A 4U3AA 2Q8XA 2VQUA 1ZBWA 2HVMA 3CUIA 1PZ3A 4PMOA 3UCQA 1UD6A 3AXHA 1E9LA 5IXEA 1VRXA 4CKQA 5CSUA 6CGTA 2O9OA 4DWSB 2OWXA 4HTYA 2VURA 2DPEA 1GJWA 4ZEPA 2VNCA 2WKLA 1NARA 4H8VA 2J7DA 4RE2A 4H8HA 2JFEX 4BQ3A 2VRJA 2XSBA 2D23A 1HT6A 1H3GA 3T09A 4FLOA 3ZT7A 1R87A 3CHFA 1XGZA 1ZL1A 4J28A 3SUWA 1E4IA 3MV01 4JFUA 1H0IA 1QW9A 4F9JA 2EPNA 3WUBA 1M7XA 1UUQA 2XVNA 1U30A 1Q6FA 2VJXA 3CZGA 4HZ6A 1C7SA 2CPUA 3N9KA 2AOSA 4NF7A 5BROA 1KBBA 1EDQA 1JDDA 1E6QM 3F4VA 4AISA 4S3KA 1JZ3A 3BAYA 1FHLA 2JF6A 1V3HA 4CD5A 1R7OA 1NWSA 3WH7A 1TVNA 1OIMA 3BMWA 4UFJA 4CN1A 1G0CA 1JZ8A 3SCQA 2WNWA 1BSIA 3BLPX 1RPKA 5A6KA 3I3DA 3WD3A 3ARXA 1C8XA 2BFGA 2OYKA 2UY2A 1JNEA 1B1YA 3GTNA 1IV8A 2JIWA 5ABGA 3WMSA 3AMCA 2OWWA 1QHPA 3AI0A 1UH3A 3PZGA 3KL3A 3O6AA 3QHNA 5E9AA 4U31A 1WZAA 4W8AA 3OZOA 2OYLA 3AHXA 5A6BD 1PJ9A 1XC6A 3VGFA 1K9TA 4WSKA 4Z2LA 1E72M 3HJEA 5DMYA 3BXWA 1E70M 3LPGA 1XD1A 4MNLA 5LA0A 1E1EA 1JD9A 2XSAA 5M17A 1UD4A 5BXTA 3AIVA 5A2BA 2ZUMA 2W5FA 4D6DA 2VX4A 4AZBA 1E3ZA 1EOMA 1WZLA 3HMCA 4MJ4A 1QI4A 3W6MA 4HMEA 4WKAA 3T0BA 1QNSA 2FGLA 1EQPA 2PF0A 9CGTA 3BAKA 4C7GA 2EPMX 1R86A 3MUZ1 2J7HA 5D9NA 3W27A 4AD3A 1XRVA 1HN1A 3OGSA 3AJ7A 1CXFA 2QMJA 4CVUA 5A8OA 3RMEA 2G4FA 1AVAA 3PHAA 1JYXA 2QLYA 2J25A 2PB1A 3UG5A 7A3HA 1V6YA 1ISXA 2VL4A 2PI6A 1OM0A 2W4XA 1JFHA 1XV8A 3DC0A 3ZSTA 4JFWA 4UFLA 5IFPA 1BF2A 1BYBA 2DSUA 4H8UA 1EOKA 4QLKA 4ATDA 4HOWA 1JAKA 2CBIA 4GINA 5I3DA 1F4AA 2J7FA 3BAXA 3EDKA 5CQ1A 2QF8A 1UH2A 1JXJA 4UFMA 1E3XA 1CXHA 4PBGA 1QHZA 2BNJA 2DT0A 1SFSA 1V0NA 2WMGA 2CCRA 4PMRA 4AD5A 4BCEA 3VD4A 5HDRA 1D2KA 3RM8A 4W87A 1Q6CA 3A3HA 5GQBA 2XIIA 1E6SM 4JHOA 4P8XA 2E8YA 4U33A 1X6NA 3WMBA 1E0XA 4HP5A 5BWFA 4PSPA 2WVSA 3G6MA 1UA7A 1GCYA 3IJ9A 3VTRA 3WNMA 4WK9A 4KH2A 3SUVA 2BY1A 4IPLA 2VZVA 4UFKA 4AD4A 1MQRA 3W0KA 3SCSA 2UY5A 2BY2A 1E4LA 4WF7A 5GNYA 1J0ZA 8A3HA 1ZBVA 4D72A 4CN4A 1F4HA 3BAJA 3SIMA 2XWDA 1WDRA 2ZUVA 2XFFA 2DQXA 3GXMA 4IUGA 3VIGA 2CKSA 2F61A 3PZMA 5HPCA 3WEMA 1I75A 1Y7VA 3SUSA 1JYNA 1A3HA 2WHJA 2WKGA 3ZMRA 3MANA 2JE8A 3N11A 3SCOA 3IAQA 5LA1A 2VX6A 2OYMA 3RIKA 5A8QA 2CBJA 2WBKA 4AZCA 2QPSA 4BQ4A 3NSXA 2WZEA 3GZAA 4EE9A 3CTTA 3TP4A 3AMDA 5A6MA 4MAVA 4GQRA 1LL6A 2J75A 3OB8A 1W9BM 2WC7A 5CLTA 1XCWA 2PC8A 5IFTA 4W89A 3WUGA 2RGLA 3QHOA 3KE0A 5A6LA 3T0DA 1B0IA 3AIRA 2DDXA 3U7BA 3PZOA 1E0WA 1MVYA 3UESA 3WNLA 1ZBCA 2D2OA 4WLCA 4A3YA 1KGWA 3W37A 3AIUA 4AC1X 3AZRA 3CPUA 4LX4A 3CUFA 1JIBA 3KL5A 1E5NA 3UR8A 1HX0A 1VEPA 1BG4A 2BHUA 3GYCA 1ITCA 5EFFA 3VMNA 3DYMA 3RM9A 4U5KA 1LG1A 1J0HA 1KXQA 4V28A 3CUHA 1CWYA 3GDBA 1G1YA 3VUPA 3UR7A 3ARZA 1CENA 1YQ2A 1G5AA 2W66A 4JFSA 2G8ZA 4KRUA 1BG9A 1UKOA 4KWUA 2GK1B 5DF0A 2O9RA 2YDQA 1B3XA 3VOCA 1EGZA 1NWRA 2VOTA 3DYPA 1ECEA 1E6XM 4XZWA 5CJ5A 2VCCA 2PWDA 2E0PA 5A2CA 4JFVA 3BH4A 1FP9A 4DWSD 3PTQA 4IM4A 1E0VA 4OJYA 1JL8A 2V38A 1M04A 3U7VA 2FGZA 3BCFA 1U33A 3HU7A 1EH9A 2XWEA 2ZXQA 4OKDA 3GNOA 1JAEA 4PTVA 1H5VA 1XH2A 4NRSA 3K8KA 3U57A 3WMCA 1W9VA 3EMQA 1UA3A 2EPOA 4FMVA 2V5DA 2D3LA 3VGEA 4KRTA 1QBAA 2D0FA 2YIHA 4F66A 1ISVA 5I6SA 3AYSA 4M8UA 3K1DA 4W84A 1OWQA 2F8QA 5M5DA 3KWXA 1JG9A 1PIFA 4ZENA 3BC9A 1TFVA 3A47A 2FHFA 1MXDA 2ZX8A 3CIVA 2V5CA 3RJXA 3WDRA 2ZUNA 1UYQA 2O9PA 2J7EA 1VFOA 4X9YA 5AY7A 4XZBA 4CN6A 2VCBA 3AIEA 4OUEA 2ZICA 1KXTA 3MMUA 2WMHA 3OLIA 3SCRA 5JUVA 4JZ5A 3WDHA 3VM7A 3EMZA 4FLSA 2ZUUA 2EBNA 1B3VA 2WWCA 3GBEA 1JZ5A 2J78A 1CGYA 1W3KA 2QHAA 4P8VA 4MJ2A 1J0YA 3APGA 1TR1A 3CUJA 4BS0A 1D7FA 3W81A 1KR1A 1MQPA 2DSKA 3AMLA 1E1FA 3D5HA 2A3CA 1LLOA 4AZIA 1JDCA 2DIEA 3AIQA 1E56A 1JNDA 3OA5A 2XGIA 3NSNA 4N42A 2PBGA 2W62A 1GOKA 3WDQA 1BVNP 2WK2A 4GZJA 1PX4A 3CMJA 4U2YA 1J9YA 4P7NA 2XUCA 4C7DA 1JFXA 1M03A 4OBRA 4TVUA 4W7UA 2WAGA 1CLXA 2D3NA 3VDCA 1QBBA 1W3HA 1JZ6A 1QI5A 2GSJA 2NT1A 1TZ7A 2ZIDA 4TTGA 5CGTA 2CHNA 3N18A 1G9HA 3W53A 1Z32X 1CGXA 3VD5A 2J7CA 4TTUA 1LQ0A 1DWIM 3WEZA 4CCCA 4JKKA 1OT1A 5JBFA 4L4OA 1GJUA 1CZ1A 4AD2A 1K9DA 4AZ5A 3AICA 3WL0A 4PSRA 2YLLA 3ECQA 3WH9A 1ZS2A 5FD0A 4F9DA 3WBAA 2DH3A 5I5RA 1YHTA 1MWOA 1DP0A 1V03A 2PWGA 1GZJA 2XM2A 5D9PA 3ARPA 1LWHA 1SMAA 3DHUA 4MNJA 2WHLA 1VFFA 2YKKA 5CPQA 2F2HA 4MAZA 4BZYA 2WSKA 1PPIA 1XH1A 2BXZA 4Z2JA 1E4NA 3VD9A 4RE4A 3VVGA 2ESCA 4WSJA 1O7AA 3ALFA 1UD8A 3FAXA 1JI1A 4A3HA 5I23A 3WUEA 4C7FA 1TA3A 5DT7A 1UG6A 1UKSA 4GO8A 1XHGA 3N1AA 3OLEA 3E1F1 1WB0A 3WENA 4DWSA 1UWRA 1V6WA 4W5ZA 4UOQA 3ARUA 1EXPA 5D8ZA 2WMIB 1H0GA 1ISYA 4W5UA 2GFTA 2WM0A 4LYRA 1V6VA 1J0JA 1W3LA 4M1RA 4B3KA 1M53A 3I3EA 4M56A 1DWAM 4IISA 4J3TA 3TOPA 3WN6A 1GOIA 2Y24A 1QHOA 1R85A 1W1TA 2VMFA 1E73M 3BAIA 1W9PA 3FN9A 5A69A 1JZ4A 2D0GA 5M3WA 2GVYA 3AISA 1OT2A 3WD2A 2YA1A 3B9AA 4GQQA 1QNOA 2G3IA 1H4PA 1R7AA 3N15A 1BTCA 2J8GA 4B9YA 2G3MA 2J8FA 2WZIA 4EKJA 2FDMA 2WVVB 5GPRA 3VGGA 3L4WA 4PEEA 2FH6A 3WF0A 3GH5A 1WCGA 4P7RA 2VX5A 2O9TA 5DO8A 5JIWA 3EYPA 2VZUA 1FFRA 2Y8VA 3GH7A 4WIWA 1Q6GA 2IXVA 3VO0A 2CXGA 3FHAA 2EPLX 1FH9A 4B16A 2GJPA 2WB5A 5A3HA 2EO7A 3OIHA 4S3JA 4HPGA 1CBGA 2DSVA 1E6RA 1GONA 4R5EA 1HJUA 1NOFA 1US3A 2EQDA 1L0PA 1AQMA 1A47A 4J3SA 5A6SA 2WHMA 3VIKA 4JFTA 4QP0A 2VVNA 4UFHA 1ZB5A 1C91A 3AHZA 2VO5A 2XYLA 3M07A 3PZVA 1GOMA 1NQ6A 3MKKA 2BV9A 1UWIA 1PX8A 1C93A 1AQ0A 3BMVA 5I78A 3CMGA 4UOZA 2WSPA 4P8WA 3ZJ6A 2WC4A 3AROA 1CDGA 1HNYA 1CPUA 3WQWA 1G01A 2ZWYA 3MMWA 3PN8A 3F5JA 4PTXA 1W9DM 3MS8A 5GNZA 1PIGA 1WPCA 4PYSA 5IHSA 2X0YA 4DUWA 1H11A 2ZXAA 2VT0A 2XG9A 1CGVA 4OZOA 1KB3A 3CBWA 2A3EA 2GJRA 1OGGA 1BGGA 1UWSA 5JBEA 3EMCA 2ZXBA 1HP4A 3ARWA 4Z2KA 3W28A 1ODUA 4UQDA 1HJQA 3MV11 3G6LA 2BVTA 2JEQA 5LYRA 1UKTA 2BHYA 1GVIA 4P7LA 3M6DA 4ATLA 5ABHA 1JZ7A 1V3IA 3SCUA 4MNKA 2GDVA 3K4AA 4ACZA 3L2LA 4OOUA 4P7OA 3GXDA 3W82A 1FA2A 1XYZA 5C8BB 2AAAA 1HKMA 1J18A 1C3FA 1BGAA 2J62A 2BS9A 1CEOA 1MFVA 3SCPA 3I3BA 4QLJA 3U5UA 3WH5A 2JF7A 1H49A 4J3WA 3HN3A 1Q6EA 3VX1A 3FNDA 5FIPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 7CGT A;  3VM5 A;  1ZBK A;  4H2C A;  3AHT A;  2NT0 A;  5TD4 A;  1HVX A;  1GOO A;  5LA2 A;  1GPF A;  1UKP A;  2WYS A;  2CNC A;  5E0F A;  2CYG A;  1GVY A;  1JF6 A;  4EAN A;  1EHA A;  3S6T A;  1WDS A;  1NP2 A;  1E71 M;  3NCO A;  4AIO A;  4GI9 A;  3BGA A;  2ZWZ A;  4J7R A;  1WAW A;  1HP5 A;  5D9O A;  4XUY A;  3VDA A;  4W8L A;  3W4R A;  1MXG A;  3EDF A;  1B31 A;  3TTO A;  1HF6 A;  2X2Y A;  3K4D A;  1XCX A;  4B3L A;  4MB1 A;  3WNN A;  4D6C A;  3ZO9 A;  4AMC A;  1SMD A;  1UHV A;  5EBA A;  1E4M M;  3RIL A;  1JYV A;  4CU6 A;  2XM1 A;  3OGV A;  2WVT A;  3IJ8 A;  4AZH A;  4WJX A;  1ZJB A;  1UH4 A;  3SUT A;  2XIB A;  2OSY A;  4FF5 A;  4UQC A;  1WNO A;  1OIF A;  4W7V A;  2Y5E A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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