3QQFA

Cdk2 in complex with inhibitor l1
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qqfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qqfA01
2VTNA 4X7QA 2XIZA 5C4KA 4QQJA 4EI4A 3MJ1A 4U43A 4NYEA 2YLFA 3VW6A 4O0TA 4EH5A 2GNLA 3FAAA 3LFEA 4XUFA 1OZ1A 4ZSGA 5FP6A 5BVWA 4C3PA 4FMQA 2EVAA 5CT0A 4XLVA 3MI9A 4XEYA 1YI6A 2W1ZA 2ZOQA 3HMMA 1IA9A 3HMPA 2CJMA 2C1BA 1QMZA 4PDSA 4TYGA 3RJCA 3NW5A 3OWLA 2V7AA 5T68A 5HBEA 1SVHA 1SYKA 4JR7A 3EL8A 5IZFA 3A7IA 3GI3A 4FF8A 3LLTA 5CZIA 4Y46A 4RJ8A 5AUZA 4UXQA 5JFXA 1IAHA 4FEUA 2B53A 3SG8A 5IQEA 1WFCA 3NUPA 5AAFA 4R6VA 4HNIA 3LFSA 3NYXA 2H6DA 1V0OA 4RZWA 4K0YA 1UNHA 2CNUA 4KS7A 5IQDA 4L68A 4WNKA 3VN9A 3FLQA 3HECA 4C4JA 2I7QA 3ORZA 5LMBA 3DNDA 3PSBA 2VRXA 4EOIA 4KINA 5J7HA 3EQRA 4USDA 5EHOA 4L3LA 5DR6A 5HIEA 2XB7A 3BV2A 4FSZA 2WOUA 3IW5A 5KHWA 3BLRA 4JVGA 5BVOA 4EHEA 3TNHA 5LVPA 2QO2A 3QWKA 4DE4A 1Z9XA 4Z16A 3LCOA 4FUXA 3DJ6A 3E8EA 3OXTA 4D28A 4EKKA 5L3AA 2PPQA 3HMOA 2GS2A 4IZYA 3WIGA 3OVVA 3AMBA 3QD0A 4O2PA 1XR1A 5HCZA 4B4LA 4DINA 3LCSA 2WEIA 2B1PA 3HV7A 2Z8CA 3IO7A 4BZNA 5AX3A 4CD0A 4YURA 1R0PA 4HVHA 5DE2A 5IH6A 2E9OA 2IZTA 1O9UA 3T8OA 2HXQA 5C1QB 2BRMA 3RMFA 2WGJA 3QL8A 4FSQA 4L46A 2ZB1A 4XP2A 1FVVA 5CU4A 5TR6A 2BR1A 4O7ZA 5LWMA 4FSMA 3EFKA 2X9FA 5EM8A 5M07A 3MY0A 2OH4A 3R7OA 2PK9A 3R2YA 3P0MA 4AOJA 3RI1A 5J7BA 2NNWB 1CKIA 2XNOA 4W8EA 3QZHA 4J52A 3I0QA 3FQHA 4IJ9A 4NUSA 2QU6A 3JXWA 5DA3A 3QXOA 4BTFA 4AGWA 4F1TA 5B2MA 4BIDA 3SW4A 2A19B 4HZSA 4OBQA 4C34A 5AUWA 4UWYA 4RMZA 3U6HA 1OKWA 3NRMA 5GNKA 3R9NA 2RL5A 3COKA 3D2KA 4JDJA 4DLIA 3V5WA 3G90X 4YSJA 5AR2A 3DQWA 1KE5A 2GQRA 4Y95A 3GUBA 1P14A 4EORA 2YACA 3UVRA 3ZBFA 3KREA 1RDQE 4KKEA 4D4RA 5HTBA 3A8XA 4G16A 1OL6A 3EIDA 3QKMA 5KMOA 5L2SA 4QP9A 5I0BA 4ONAA 2QKRA 4IAKA 5HX6A 3GCSA 4FI1A 4QP8A 4I3ZA 3RINA 5J8IA 3R7EA 2ZV9A 1DS5A 3OTUA 2P33A 3SOAA 3TTIA 5M4FA 4MAOA 4YO6A 4C3FA 3O96A 3V3VA 4DYMA 4OR5A 4QMTA 5CNNA 2I0HA 3IQ7A 3FI3A 4KIQA 4DN5A 1M52A 4M67A 3WZKA 3BHVA 5EH0A 4WKQA 4FKLA 3SX9A 3O7LD 4NU1A 3PP1A 2PL0A 4JBOA 2UUEA 3FHRA 3VF8A 4I6BA 3LFAA 4A06A 1IEPA 2BAQA 2VTTA 2XK9A 3L1SA 2HOGA 4OTWA 5EM6A 4IAAA 5DIAA 2GS7A 1XH8A 5IA5A 2PUPA 4CG9A 3GEQA 2JKOA 4UMTA 4XBUA 2JLDA 2YM4A 2JDTA 5HO8A 3D9VA 4X2FA 4DG3E 2ONLA 4JQ8A 4Y85A 4EOKA 3BRBA 5AV2A 4QMOA 3F3WA 4I6QA 4MTAA 4AZEA 1BYGA 5EW9A 4BKJA 4EQMA 3GU8A 4IVCA 4RJ7A 3PXFA 2UZNA 3QCSA 5KKRB 4G31A 4M15A 4BDAA 2YCFA 5L2WA 1ZZLA 2C47A 1XH9A 2BZHB 3BIZA 4FEQA 4XG4A 3OT8A 5E91A 4OAVB 4Y5QA 2BIKB 4QPMA 2OIQA 4QYYA 3VULA 1KE6A 2W9ZB 2WMAA 5DR2A 4U41A 4EC9A 1PXIA 2UZLA 4NCTC 4V01A 5M51A 3UPZA 1BI8A 3PXZA 1K3AA 2I40A 1ZXEA 3MGYA 3VBTA 1PMUA 1JKKA 3FMJA 4UEUA 4XG2A 1PYEA 2RFEA 3NNVA 3OTVA 4DLJA 5IA2A 3D5UA 3JY9A 5D9HA 3NNWA 2Q0BA 5M56A 3PG3A 4FNYA 4Q2AA 3R71A 4BDDA 3R00A 3DK3A 4BBMA 2R3MA 3K2LA 4LUEA 1ZWSA 3TJDA 3BE2A 2B9FA 4RX9A 4ANSA 3PA3A 1REJA 2E9UA 1ZOEA 3F5PA 3QTQA 2QG7A 3KULA 5FEEA 3QF9A 1YHSA 4KABA 4LMUA 2WQEA 4HPUE 3W10A 5DG5A 3Q9XA 5FBNC 3ZRKA 3WF5A 4EOSA 3FL4A 3PY0A 2ZM4A 3EH9A 3MSSA 3Q4TA 3ZLWA 1Y6AA 4FV9A 1KOAA 5AP0A 4EH2A 2GQGA 4LRMA 2VNWA 4N0SA 4RPVA 1EH4A 4F7SA 4PQNA 3O0GA 4ZLZA 2LGCA 2GNGA 3AD6A 3AD5A 4GFOA 4FSTA 4EEVA 3M42A 3QLFA 4FSYA 4Z9LA 3MESA 1GZOA 2WMVA 3FSKA 1Y6BA 4YLLA 4EH4A 4R77A 5E9EA 4DBXA 3GU7A 3ALNA 3PUPA 3QUEA 4KA3A 3UZPA 1U5QA 2CMWA 4EJNA 1ERKA 2PE2A 1UNLA 2GPHA 2Z7QA 4EH9A 3KKVA 4G3GA 4RZVA 2PMNX 2WTWA 5EHYA 3G9LX 1BX6A 3TUCA 3BBTB 3KULB 3P08A 5E1SA 3ORMA 4I0SA 3W2QA 3L9LA 5C01A 4BIEA 5IDNA 3PPKA 3QU0A 4DEHA 1GOLA 5CVFA 4AN2A 4BHZA 1UU8A 2R2PA 3IG7A 4CT1A 3FLWA 4G6LA 3P23A 4JS8A 1SZMA 3KXHA 4ARKA 4IAYA 1O6KA 1Q8YA 4Y73A 5AP3A 4NTSA 4AT5A 3OBJA 4CYIA 2WTDA 3C4FA 4NH1A 5CU6A 1U4DA 5CEKA 3F3TA 3EN5A 5TE0A 4AGCA 2HELA 2QONA 4FGBA 4OTDA 5AP6A 4A4LA 3TL8A 3KCKA 5ETIA 5M09A 1ZY5A 2A4LA 4HGEA 4O6LA 5AX9A 4FTLA 4BCFA 4BY9E 4BZOA 3E8NA 4RIWA 2EXMA 2QO7A 4L7FA 1J3HA 4ZY5A 3U55A 3VS2A 3I60A 5KE0A 5IQIA 4HYIA 5EK7A 1UNGA 4G5JA 1RJBA 4ANLA 2UZVA 2J0KA 1WMKA 4PTEA 3E8CA 3WZEA 5CF6A 3NWWA 3R2BA 5HCYA 1Q61A 3S95A 3MV5A 4DFZE 5CI6A 5IEYA 3PJ8A 3PY3A 5CTPA 4GUEA 3ETAA 3L8XA 5HLWA 4FT7A 3U9NA 5IEVA 4MNFA 1U54A 2J0IA 2UZWE 3FC1X 3ZUUA 4FSUA 3OOMA 4FVPA 5BUEA 4HCVA 1ZARA 3PFQA 4E5BA 3JYAA 2C5OA 5HZNA 2Z7SA 2QOBA 4JOAA 4XV2A 4FTAA 2W4JA 2QLQA 4IB0A 3BHTA 4YLKA 1J1BA 1BKXA 2V7OA 3F9NA 4KIPA 4YJRA 3ZCLA 2CGVA 4J1RA 4ASXA 5ANKA 4QMUA 4E5WA 3REPA 3VS1A 5L2QA 2W99B 4IC7A 4RA5A 3GU6A 3WBLA 3VW8A 1PXPA 2VWBA 4QMMA 4RIWB 5HKMA 4QMXA 4D1XA 3DXNA 3CGFA 3QTIA 4U5JA 3LFNA 3SXRA 5HNIX 2PSQA 4I93A 4QD6A 4QMYA 4TZRA 2C1AA 5CAVA 4B8LA 4FTIA 4JR3A 4BF2A 2FUMA 2P3GX 1YOLA 2YJSA 4EH3A 3V6SA 4FKTA 4ZSEA 3BI6A 3UNZA 3UVQA 3DPKA 4IB3A 5CQWA 5A46A 3G9NA 3THBA 2EXEA 3NUNA 1U54B 4FZFB 4HGSA 3QLGA 3VUDA 2R0IA 4BBEA 4C33A 3FMHA 2VUWA 3BYOA 3E3PA 4KSQA 2ITZA 1ZYLA 5FD2A 4YNEA 4PNKA 3UYSA 3OEZA 4W4XA 4CXAA 3NGAA 4XRJA 4C57A 2C3KA 4K33A 4C4EA 3GVUA 4FZ7A 3F3ZA 2F2CB 4R8QA 5IH4A 2A0CX 2JC6A 4EYJA 3RWPA 4ZMEA 2VTJA 4NM0A 2QOHA 3CS9A 3QC9A 2JD5A 1DAYA 3RALA 1OIQA 3KN6A 1VZOA 3R1SA 5HE3A 3U51A 1O6LA 4R3RA 4UZDA 4QNYA 4AA0A 2PUUA 4FL2A 4DGLC 3DU8A 5HO6A 4BI0A 3E64A 4JX7A 2HK5A 2F49A 5EI8A 2XRUA 3I7BA 5I5ZA 5A4LA 4DT8A 4DG0E 4M7IA 4EZ7A 4WOVA 1OIRA 4YTIA 1Q62A 4RFYA 1PXKA 4HPTE 4O0YA 4PPCA 4WSQA 4XCUA 3DBQA 3HVCA 2XS0A 2YEXA 3O7LB 4MBLA 2OF2A 4KKHA 2ZM3A 5IDPA 2GNHA 4YJUA 2REIA 5D10A 2WTKB 3LXNA 5ANEA 3O8TA 3W2RA 4FIIA 4BCHA 4C4IA 1H0VA 1WBNA 4ASDA 2WFYA 5M08A 2DWBA 2EU9A 2W5HA 3GNIB 3E7VA 4FICA 4AW0A 4EWQA 3U54A 4DH7A 3E88A 4EKLA 1YRPA 4IQ6A 3E5AA 3G2FA 4G6OA 5A6NA 3PXQA 3C0GA 3UOHA 4YP8A 3OEFX 1OPJA 4UWCA 3D83A 3DJ5A 4KRDA 2Y4IC 4O7SA 5AIKA 5CU0A 5KNJA 1QPJA 4KWPA 4IX4A 4ASZA 4O7VA 2YERA 4MXZA 3MH0A 3TV7A 3PLSA 1IAJA 3POOA 4JT3A 5G6VA 2WOTA 3V5QA 2VAGA 2P0CA 1JNKA 2YCRA 2IVUA 3R0TA 3UPXA 3CQUA 4X3FC 1GIHA 3W16A 4FV4A 1SNUA 4BDCA 3L8PA 3FZOA 3MW1A 4RFMA 3CJGA 5LMAA 1G8SA 3VNTA 4N4SA 1TVOA 5BQ0A 4FTCA 2JIIA 3LXLA 1PY5A 4W9XA 5HTCA 4I92A 3MTLA 4FV6A 5CY3A 1NW1A 4BWKA 3BWFA 4F7NA 4EK3A 4R7HA 5E92A 3BGQA 3F5UA 4TNDA 2GCDA 3EQBA 4IDVA 2UVZA 3G5DA 3BCEA 1WBPA 4RFZA 4BZDA 2XK7A 3NEWA 4AWIA 2VO6A 4U6RA 2UVYA 3R7YA 3C9WA 4WNMA 4BN1A 4R5YA 3QYWA 4YO4A 4CG8A 4UMQA 2C6TA 3KRRA 4RVTA 5CENA 5IA0A 3ODYX 3BWJA 1Y57A 2AUHA 2R5TA 2PZPA 1GZNA 4YHTA 3VQUA 3JR1A 3RPYA 4GYGA 1DI8A 4RSSA 4YR8A 4FC0A 3TJCA 3BQCA 5LMKC 3FMNA 3U8WA 3ULZA 3V8TA 3QWJA 4TNBA 4PTCA 1JVPP 4I94A 2R3PA 5DT3A 3TNIA 3ATSA 2WTJA 2I0YA 4B7TA 5AUXA 4CV9A 4YPSA 5CEOA 4DEAA 3C50A 2YCQA 3PE1A 2JKQA 3GOPA 4LL5A 5FQDC 4N6ZA 5AA9A 3MH3A 3BPRA 2C6KA 4TYHA 5IUGA 3EYHA 5JFVA 4JQEA 3C4EA 4WNPA 1ZAOA 1UKHA 2H96A 3D15A 3VS6A 2OICA 2X6EA 1PF8A 2C5NA 3VUTA 4O7NA 1WBVA 1Q8WA 1GJOA 1APME 1QPDA 2C5XA 2QHMA 4FKSA 4EH8A 3PE2A 4FG8A 4RT7A 3TNQB 3TKIA 5CAPA 2XMYA 2QI8A 3FZTA 2PYWA 2VTIA 4FGRA 3UIMA 3AD4A 4FTOA 2C3IB 3FV8A 4R3PA 3ZO1A 3IPHA 4F0IA 3W33A 3ORXA 1JQHA 3ZXZA 4FT5A 4GUBA 4P5ZA 3IW7A 2DS1A 5DVRA 1ZRZA 4YJPA 3H9FA 5JEBA 4KD1A 3N4VA 1JOWB 3NAXA 3C5IA 2XIXA 4Q9SA 4AF3A 3SKCA 4FK6A 3ENHA 4YZNA 3SLSA 3I4BA 4ZJJA 4PL3A 4E4MA 4FIEA 3M2WA 4E6AA 1PKGA 5DFPA 4FEVA 2F7EE 3FI2A 5H2UA 5HG7A 4TYHB 3E8DA 2R3FA 3OWPA 5FTOA 3S1HA 3PXYA 3II5A 4UBAA 4YSMA 4FEWA 1DI9A 3AMYA 3DAJA 3MVLA 4K2RA 4ZK5A 3ZZWA 5L6WL 5AIRA 3WYYA 3TACA 4AFEA 3CKWA 2HZ4A 2UZDA 4L8MA 2BKKA 2VWXA 5LXMA 1V0BA 2HY81 3E3BX 2XJ2A 3OS3A 2CN5A 4CT2A 3BHHA 3MWUA 1R78A 3NNXA 3O17A 4EWHA 5A6OA 4DGGA 2JBOA 3VIDA 4PDYA 1E9HA 1XQZA 3KRLA 3MB6A 4FA2A 3KA0A 1V0PA 1FMKA 3R83A 1MRVA 2F2UA 4BGGA 1GZ8A 2XK4A 4ITHA 4M14A 3BGPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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