3QTSA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-12
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
298
structure length
282
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 282
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qtsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qtsA01
4QTBA 5I9ZA 2W5AA 2FB8A 2UZBA 3PTGA 4P5QA 3FXWA 4DN5A 3D9VA 4CQEA 2X4FA 5GIPE 1UU9A 4YNOA 4JX3A 5HNBA 2CGVA 4KABA 3ROYA 2XBAA 4GK4A 2VGPA 2EUFB 1YXXA 1JQHA 1SVGA 1W8CA 2OZOA 2Z7LA 2R3QA 4HYIA 4XG8A 1VYZA 4DH1A 3B2WA 3EN6A 2ACXA 3D0EA 4J7BA 2WXVA 5D7VA 4F0FA 3ZLSA 5EQEA 2W17A 4ASDA 5HO6A 4FG8A 3LQ8A 1MUOA 5FUTA 3P5KA 5JZJA 5IA4A 4CLIA 3TNWA 3HV4A 4CYJA 3OUKA 5KNJA 4C61A 3G15A 2EWAA 4WNMA 4RJ6A 5E91A 5HGIA 3Q52A 4QQ5A 3Q4TA 3IDBA 4BDAA 2OFUA 1K3AA 1T46A 3NUPA 4JR7A 2H34A 1NXKA 2R3JA 4UXLA 4WNPA 4XG7A 3R9HA 2YITA 1HOWA 3DLSA 3TUCA 3ZONA 3W16A 2XA4A 3AG9A 2IJMA 5FWKK 1TQIA 2C0TA 1ZMVA 4OUCA 4FKPA 5DNRA 2C0IA 3MPTA 1DAYA 4D55A 5I3RA 5GIOE 1GOLA 3ORPA 3L8VA 3AD5A 4X2JA 2I40A 2ZMDA 4RIYA 1Q5KA 1H1SA 1KE5A 2W1DA 2ZB0A 3N4TA 5AX3A 1SNXA 3GU7A 4KKEA 4L6QA 4ZEGA 1PMVA 2XKEA 5AUYA 5HE3A 3R9OA 3HZTA 4HGLA 4M0ZA 4O7LA 2PUUA 2JLDA 4YO6A 3RKBA 4FV6A 2VTOA 3SXFA 3WE8A 3KL8A 3PVBA 4MD9E 3G6HA 4E73A 3GOKA 4C35A 4QQJA 1UV5A 2Y4IB 5M4CA 4QMOA 3TM0A 4KIPA 4KRDA 4FG7A 3MY0A 4D0WA 4XRLA 4YJUA 3MBLA 3DNEA 5J8IA 1URCA 3ENMA 3I7CA 4CMUA 3RGFA 3F61A 3OCBA 4XP0A 4BGGA 2YZLA 5J7HA 4LUEA 2BUJA 4MXZA 2OF2A 3BKBA 2J0KA 1J1CA 4KIOA 2REIA 4YJQA 3EQIA 4LMNA 4X3JA 4DFXE 4EEVA 2C68A 4HPTE 3EKKA 1PRYA 3MVHA 3DAKA 1WCCA 2B7AA 5A4QA 3BBTB 1H00A 5JSMA 4RJ7A 4X3FC 1J7IA 4GUBA 2GQRA 3DTWA 3GU8A 4I1ZA 1J1BA 4Y8DA 3TJCA 3HUCA 1H4LA 3NW6A 4M67A 3KREA 4F7LA 2GS7A 2QU5A 2PZRA 3GI3A 4L43A 4U41A 2VWXA 2WTDA 5CTPA 4EH3A 3CY2A 3NNXA 1GZKA 3DJ6A 3QCYA 4G3GA 4AN9A 3G33A 1WFCA 3I6WA 4U3YA 4LV8A 1MQ4A 2R64A 2F9GA 1JLUE 3NW7A 5D1JA 2RF9A 2Y7JA 4MBIA 1E1XA 3BLQA 5CANA 5C01A 1JBPE 3BHYA 2OKRA 5EH0A 4CD0A 1H01A 3ZZEA 4AUAA 1NY3A 4G5JA 2P3GX 4B0GA 1Q3DA 4TZRA 2PVMA 2B54A 3QRTA 1MP8A 3TV4A 3UQGA 3VJNA 4E6AA 5CF4A 2X0GA 3EMGA 4QNAA 2BRBA 1ZAOA 2UZEA 3QD0A 3ZLYA 4ZOGA 2RKUA 2BAQA 3F3WA 2RFSA 4UB7A 5AP1A 5CF6A 4EQMA 2WAJA 2J2IB 4IEBA 3IW6A 4FV0A 4MQ2A 4YTIA 3EN9A 3TNIA 2QG5A 4BL1A 3HAVA 3JR1A 3HKOA 3EB0A 4FNXA 4AA4A 5GZAA 5M4IA 3CSVA 1LP4A 4FIEA 5ITAA 2WD1A 1JSUA 1PYEA 2RG6A 3CLYA 4AQCA 5M44A 2JBPA 3VAPA 3BU6A 3SG8A 2UW0A 2JDOA 2HCKA 3IW7A 2XCKA 3F5GA 3KXGA 5E8VA 3Q2JA 1RJBA 3AT2A 4RWKA 5EW9A 3DU8A 3FHIA 4FNWA 2BZIB 2HELA 3AC5A 4D2PA 4C62A 2O63A 3OT8A 4GYGA 1QMZA 2PZ5A 3H3CA 3CBLA 3IK3A 3R73A 4FTTA 3HA8A 4FTCA 2IW8A 2UW7A 4RMZA 1P14A 3PRFA 3HRCA 4HGEA 2ZV7A 5E1EA 2UVXA 3DJ7A 2WFYA 4J52A 4LFIA 3VBXA 3V5WA 4EOPA 3SRVB 5IU2A 4XH6A 4XP2A 1ZLTA 4AACA 4MNEB 3VW8A 4R1VA 5D41A 4I21A 5H8GA 4ZJJA 3R2YA 4DE4A 4O86A 3D2IA 3KRLA 1R0PA 2JDTA 4LRMA 1AGWA 4AFJA 4W8EA 3UPZA 4TYEA 2DS1A 4U42A 3HMMA 4GT4A 2PTKA 4MD8E 2ZDTA 3D14A 4HYUA 2I7QA 3H9OA 5D11A 3UIBA 4D9UA 3UZRA 3OZ6A 2I1MA 3E5AA 3LXKA 3NRMA 3OY1A 4U44A 5B0XA 4FV1A 5K3YA 3R9NA 4DG0E 4QMVA 5HLNA 4N70A 4L9IA 4CCUA 5HO8A 3QYWA 3JPVA 3D5XA 3SX9A 4ID7A 4E5BA 4AOJA 3KK9A 1JKTA 4E6CA 1Q4LA 3QQUA 3TTJA 4DA5A 3TI1A 5IQDA 4UMUA 4BCJA 3R04A 4O7YA 3FC1X 4S30A 4EUUA 4I93A 4S34A 4QMMA 5CSXA 4H3BA 5ANKA 4X2GA 1W98A 5EW3A 1IASA 2WTKB 3RINA 3ORZA 4I94A 4JG8A 4GH2A 3JVSA 3SC1A 3ZCLA 4CSVA 1ZOGA 3PP0A 3ORLA 4BCOA 4EKKA 4KKHA 2CJMA 2V22A 2C1AA 5EM5A 2IO6A 3MN3A 3KF4A 4G31A 4H1JA 1O6YA 4RG0A 3KKVA 3LCKA 3OC1A 3SHEA 5IISA 1OUKA 3RAIA 3SOAA 2YABA 2EXCX 4CV9A 4TL0A 4KAOA 2XK9A 3FMDA 5F95A 4E93A 4C59A 3UGCA 3NMUF 5J7BA 1KSWA 4QPMA 4YZCA 4H36A 3AOXA 4EH7A 4HZSA 3H0ZA 4R5YA 3ORIA 4F63A 2SRCA 3GUBA 2IVTA 3I1AA 4BYIA 5CEPA 3COHA 5BMMA 4EUTA 2R2PA 5IUGA 3RTPA 4LOPA 4WA9A 1ZYDA 1M2RA 2A19B 2VN9A 3BQCA 3FMMA 3R22A 5A6OA 3FKLA 1OB3A 5G1XA 4YUQA 2CNQA 1T45A 2C6OA 5I9YA 5FD2A 3W2PA 1PXLA 4TRLA 2WMXA 3C4CA 4A4OA 4BYJA 2EVAA 4KS7A 1CM8A 1YDRE 2ETKA 3KULA 2NRUA 4V04A 3ATTA 3QUPA 3CTHA 2CGWA 2JKQA 2F7EE 2JIVA 2YIXA 2I0VA 4BZNA 1UU3A 4B8MA 3DFCB 2VO7A 5CEMA 2X8IA 5E7RA 3V5JA 1STCE 3BYVA 1Z57A 4L7SA 4YPDA 4D4RA 2I0YA 2X9EA 3FKNA 3KRRA 3QLFA 3R7GA 4IZ5A 1MQBA 3HV5A 4FYOA 4IIRA 3BWJA 2CKEA 3Q9YA 3QTXA 4RA5A 2C6KA 4UYAA 4ANBA 3VQHA 4F64A 4J1RA 3TV7A 4Z3VA 2F7ZE 2QHNA 4PDSA 3R9DA 3S2PA 4C37A 4F08A 4F9WA 2E9NA 2UV2A 3TT0A 1PY5A 3LZBA 2H8HA 4FVPA 3MIYA 3VHKA 5BVWA 2JIIA 4BVUA 1P5EA 3FPMA 1YHSA 4F65A 4FKLA 3FYJX 3T9IA 4F9AA 2Q83A 4CXAA 4I6QA 3R83A 4G16A 3CEKA 3ALNA 5JQ5A 2FUMA 3R00A 1OECA 3FZPA 3DNDA 3MVMA 4O7TA 3RNIA 3MH3A 4IH8A 4ZSAA 1ZOHA 3CR0A 3F88A 4FTJA 4IM0A 4OLIA 4RJ5A 3O2MA 5CYIA 5I9WA 5L8LA 2XEYA 4K0YA 2ZM1A 3ZBXA 4RX7A 3OBGA 2WMVA 1H1QA 4FGRA 4BRXA 1K9AA 5EHOA 3ZM9A 3GU5A 1H28A 1O9UA 2V55A 1ZWSA 2FYSA 3DBQA 3EKNA 4PPCA 2JBOA 2HZ0A 1YXUA 4FX3A 3TG1A 1P4OA 2HXLA 4BBEA 5M51A 4EZ5A 4KBKA 1DI8A 4HCUA 4L53A 5ICPA 2WO6A 2GNJA 3CGOA 2RGPA 3LHJA 1V1KA 4FTQA 3LIJA 2OXYA 3V51A 5AP3A 5TE0A 2O3PA 3WF6A 2QLQA 2JAMA 3EZRA 4AZTA 2R3LA 3CJFA 4L00A 2Z7SA 3V5PA 5JK3A 3K3JA 2BKKA 4Z55A 5EHYA 3RHKA 3BV2A 2W9ZB 3UODA 4AT3A 3LFDA 5JFVA 3BLRA 3IQ7A 1H08A 4ANQA 1Q41A 2PVNA 4RZVA 3OBJA 3P4KA 3MIAA 4I0SA 3FLWA 3N4UA 2QR7A 3G5DA 3DB6A 2R3KA 4FG9A 4PL4A 4C4IA 4UV0A 1YDSE 4CMTA 4IVBA 4F0GA 4K2RA 3PUPA 3E62A 3SGCA 5ANGA 4MEDA 4BB4A 4R77A 3RP9A 4O0SA 2JEDA 1LEZA 3EN5A 4LRKA 3EL8A 2CSNA 2EB2A 4FSZA 3UOJA 4YR8A 4IC8A 5GJGA 2J5FA 4A06A 4GG5A 2OH0E 1E9HA 3ZDUA 5JMSA 4OGRA 4BCIA 3PRIA 4N0SA 1XH8A 2Z7QA 4BKYA 3LQ5A 3LFSA 1JKLA 3MB7A 3VN9A 4D58A 5JGDA 4FTUA 3HMIA 3U6IA 4WUNA 4CT1A 5EYMA 4JS8A 4GJ3A 3ZFMA 2OXDA 3K2LA 5AV2A 5GJDA 3KA0A 2WMSA 2BALA 4FKWA 4BI1A 5E8ZA 4APCA 2W1GA 1MRYA 2XIYA 3ACKA 3LFBA 4DT9A 3C4XA 3HDMA 3H4JA 4RWJA 5E9EA 2CGXA 3CP9A 3NUNA 4FKTA 2RG5A 3EJ1A 4I4EA 4B6LA 1A06A 3JYAA 3BLHA 3WI6A 1YOLA 4IZAA 3PSCA 4ACHA 4BDBA 4I20A 5T3QA 4C3PA 4U43A 3PJ3A 3UO4A 1IG1A 3D5VA 3LPBA 3SQQA 3PJ1A 4O6LA 3COMA 4BR3A 3TTIA 1FGKA 4AZSA 3MI9A 5FDXA 3THBA 4MTAA 5ETCA 4DEEA 5HORA 5IH5A 4C4HA 3FZ1A 3HECA 3CS9A 3HVCA 2W4JA 4EI4A 2VWYA 1XH6A 4JR3A 4FIJA 4WT6A 1WVYA 1IAHA 5CY3A 5FEQA 4YGAA 2XJ0A 2G2HA 2XJ2A 5AR4A 3E8CA 1XH9A 3RALA 4C3RA 4GK3A 2HZ4A 4OT6A 5DFPA 4ZJIA 4ZY5A 3LMIA 3C13A 4FV7A 4Z7HA 4MYGA 4Q2AA 3QRIA 4PMSA 4AU8A 2XJ1A 3T3VA 2J7TA 3OXTA 3PPKA 2P55A 2HW6A 4N4SA 3QGWA 5AA8A 3UQFA 1PXPA 2CHLA 5B2LA 2HK5A 2WEVA 2WTJA 3PDTA 2H96A 4FTKA 3P1AA 3QQLA 2J0LA 3C4WA 3VF8A 5IEVA 3ORTA 4FBXA 5HEZA 3K3IA 2R3RA 4UMRA 1P4FA 4QP7A 2WGJA 3FI8A 2ZVAA 3QXOA 4FEQA 4WG5A 1A9UA 2HW7A 5EK7A 4JQ8A 3RAWA 4EK8A 3EQDA 4C7TA 3PSBA 2KULA 4FF8A 5K0KA 4J8NA 4QP6A 4E4XA 4JL9A 5IH6A 2OSCA 3KXHA 1K2PA 3OVVA 4GIIA 1Y6BA 4U7ZA 4EOSA 1H1RA 4IB3A 4FV9A 5A4EA 1KOAA 2F2CB 5HTCA 4EBVA 2WTWA 5IEXA 3CPCA 3FZTA 2Y6OA 4O0VA 4AX8A 2RIOA 4OTIA 5TO8A 1YI6A 4J97A 1UNLA 5EDPA 3C1XA 1VZOA 3LAUA 3NEWA 3EFJA 2BR1A 3ZMMA 4GV1A 3FMNA 4ERKA 2ITYA 3ETAA 2UW6A 4D2RA 4H1MA 2J5EA 5HHWA 3P7AA 4W4VA 3F9NA 1SVHA 3GBZA 5HU3A 4BZDA 2OIDA 2QODA 5EFQA 5HVKA 2R5TA 4CEGA 2BRMA 5AM6A 5FXSA 1F5QA 4LL5A 3LFNA 1RW8A 1YHVA 2W4KA 5AMNA 3FC2A 3FSFA 3R7EA 3UDBA 3O8UA 2VO3A 5LWNA 3SVVA 3GC8A 2WOTA 3WZDA 3R7YA 2IVVA 3PJCA 3C5UA 4JX7A 1IR3A 5CNOA 5K5NA 3BU3A 4FKSA 4AGUA 3ODYX 1XJDA 2Z8CA 3RK9A 4DGMA 2BVAA 4USFA 5FLFA 3BELA 3W10A 4RPVA 4EH2A 2UZDA 3U9NA 2PWLA 3CQEA 5KMOA 3KY2A 3TACA 2X2KA 3D7TB 3MY1A 2FVDA 4M69B 4GU9A 2YWPA 5TOZA 5LVOA 3I7BA 2Z2WA 5DE2A 2C5NA 3SDJA 1R78A 3KMUA 3UIXA 3V8TA 3NUUA 3V01A 4YZ9A 5CVHA 3FYKX 4HVIA 4BGHA 4YJSA 1YI3A 5HO7A 5ETAA 3ZU7A 4U6RA 3RBWA 4NFMA 3GT8A 4I5MA 4ASEA 3D83A 1KE8A 4XG9A 3KRJA 4QMLA 5HG9A 4RFMA 3VUTA 3ZHPC 2R3NA 3VRYA 3PWDA 4GKHA 3G9LX 3BIZA 5IPJA 4F6SA 3DV3A 4PUZA 1H1WA 2QOBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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