3QTUA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-132
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qtuA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qtuA01
5DT0A 2OJGA 3OY1A 3SAYA 2FSTX 1OUKA 2W1EA 5AIRA 3CKWA 3GCQA 4R6VA 3CCNA 3RZFA 5DEWA 4ITIA 1QPEA 4RZVA 5ANGA 3FMJA 1YRPA 4YLKA 5J87A 4JS8A 4WA9A 5IQEA 4YHTA 1WZYA 4FV4A 2YIXA 3V6RA 3E93A 1PKDA 1UU3A 2W1HA 4EK5A 3RGFA 2FSOX 3FXWA 4ZJJA 4CFUA 3DBQA 4RX8A 4RIWB 5E8XA 3FZRA 1ATPE 1GZKA 3HKOA 2JAMA 3OG7A 4IX6A 4G3DA 5E8UA 3F69A 4H3BA 2BFYA 4KKHA 2A19B 3U6HA 2HIWA 2GS2A 5BVFA 3MN3A 3KK8A 4L44A 5CEPA 1Q8WA 4PMPA 4Z3VA 1YI3A 3FMHA 3P78A 3VS0A 3IQ7A 4AFJA 1Q41A 1YWNA 2OFUA 2FA2A 2HZIA 2OGVA 3GU4A 3PRIA 4MF1A 5A14A 2BZHB 3KXGA 5DN3A 2CGUA 4P7EA 5A54A 4MWHA 4OAVB 2ZB1A 4O7WA 1UVRA 1YWRA 3R1NA 2RFSA 3UPZA 1PXPA 4YJSA 3F2NA 4FMQA 5BVKA 2R3NA 2C47A 2XKEA 1J1BA 3DNDA 3BGQA 5HO8A 4JQ8A 5LVLA 4M68A 2BRBA 2C0OA 1DI8A 3QKLA 2OJJA 5EHYA 5EM6A 4YP8A 3DA6A 4UYAA 2XK9A 3ELJA 5IA4A 2XJ2A 2UZTA 2I0HA 4R1VA 3ZXTA 4FTCA 4O82A 5CU3A 3BE2A 3LQ5A 2FYSA 4N4SA 5A9UA 2GNGA 1LP4A 2JEDA 2VTIA 5CSXA 5J7HA 5H8BA 2JAVA 2PMIA 3BELA 5FDXA 3BRBA 3GC8A 1H28A 4PP7A 5CNOA 2NRYA 4ZSJA 3FEGA 3HGKA 2VTAA 3BHUA 4KUJA 5AP7A 4O0WA 1YXUA 5KKRC 3PDTA 5CU4A 5EKOA 4H05A 3QHRA 2X6DA 4E6CA 3F66A 4AX8A 4K9YA 3DJ7A 4K0YA 3UO6A 4PNKA 2F2CB 4PY1A 3PXKA 4D1ZA 3C4ZA 1ZZ2A 4Q2AA 4ANNA 4QPSA 1LR4A 3CD3A 3E8EA 4YZDA 1WVYA 4S34A 4YBJA 1MRYA 3CQWA 3OHTA 4ZLYA 3BYMA 4IB3A 3TNIA 4WOVA 4G6LA 4AUAA 4O1OA 3R2BA 5CQUA 1SNXA 2C5OA 2CGXA 2XEYA 5AV3A 1QPDA 2R3HA 2ZV7A 3L8VA 3TZ9A 4EK6A 1ZRZA 1FOTA 5EM5A 5EQPA 4ACCA 3NW5A 3TCPA 4LGGA 4U81A 5A4TA 1FGKA 2E9PA 2OIQA 3JYAA 2YEXA 2Z60A 4C3RA 5IG1A 4E1ZA 3IG7A 5B2MA 3EJ1A 4CYIA 3C4CA 4U42A 4MX9A 2A2AA 3SOAA 3JS2A 4ACDA 4KSPA 2X2LA 3NUYA 2BFXA 4DAWA 5KBQA 2OBJA 1Z57A 3HYHA 1WFCA 3LCTA 3QL8A 4X7QA 3TJDA 2XBAA 3WIGA 4BDFA 4E5WA 1URCA 2B9FA 4FKSA 3COMA 4X21A 5CEQA 3D2IA 3GOKA 5IH4A 4GS6A 2GPHA 4KB8A 4O96A 3V51A 3I81A 4JG7A 1YKRA 4YUQA 3UZRA 3DDQA 4NFMA 5M06A 4S30A 5K5NA 5HO7A 2BRNA 4FIGA 3FDNA 1WVXA 4YLLA 3TACA 3P7AA 2AC5A 3ZMMA 2YDKA 3PA5A 4UYNA 3E7VA 1DI9A 4NCTA 1OIUA 1JBPE 3TTIA 4EORA 5BNJA 2IN6A 3CJGA 3DZOA 3FLYA 3AC5A 4EH7A 2WTKB 4NFNA 4L52A 4M14A 3ZHPC 4WHZA 4EH8A 4WNMA 2R3PA 5AV4A 4D2PA 1YXTA 5A46A 3RWPA 3SVVA 5K0KA 4O7RA 1XHAA 2YLEA 4N6YA 5D7VA 5BMSA 1NXKA 4U44A 3N4UA 4C4EA 4BKZA 1OKWA 5AFVA 2VO0A 2C3LA 4FVRA 3NMUF 4F09A 3QUPA 4QMOA 1FQ1B 3LXKA 2UW8A 4PPBA 3U4UA 2PY3A 2IVUA 4ASZA 1RDQE 1NVSA 3HMNA 4MTAA 3QTZA 4FVQA 4II5A 5HE2A 3VBQA 4F6SA 4UX9A 1O9UA 5D1JA 1XH5A 1J7IA 4AAAA 4FV0A 4BWPA 2ITWA 2WU7A 3DS6A 4HZSA 3B2WA 4ANSA 4YTCA 5J79A 5M4UA 3ENHA 4PUZA 4RGJA 4AW1A 5CZHA 2QVSE 2YHVA 4TRLA 2W1IA 4DH3A 3C4FA 5HBEA 2JKMA 3HUBA 4MBLA 2YM8A 1OKYA 1Y8YA 4I0SA 5HIBA 3BGZA 5AA8A 4PTEA 3JXWA 1F0QA 3M2WA 2C3KA 3ROCA 4RQKA 2JIVA 5HNIX 3OEZA 3FE3A 3BKBA 5LOHA 2R7IA 4BCIA 2J2IB 2YWVA 1R3CA 3GC0A 4EZ3A 4F0FA 1VJYA 5CAOA 3EFKA 2Z8CA 4ZS0A 4YJPA 3JUHA 3V5WA 5CANA 4V01A 2CDZA 2VO7A 2WGJA 3OROA 3TV7A 3VAPA 3CPBA 1UWHA 2C4GA 3GVUA 3NUUA 4D2SA 3TZ8A 3BQCA 4C62A 2X8IA 4W8EA 2WMSA 3FBVA 5AUWA 4FTQA 3HV3A 4R3RA 3FI8A 1GIJA 4MYGA 2X7GA 3UG1A 4TXCA 4FODA 2W0JA 3WF6A 2X4ZA 1BX6A 5HESA 2BZKB 5LMAA 1OB3A 1M2QA 2BHEA 4M15A 3HRFA 3NYOA 2QLUA 4C61A 3WZEA 3F5PA 3F6XA 3D5WA 2HAKA 4K6ZA 3RTPA 4CEGA 2FUMA 1J7UA 4QMQA 2IZSA 4I41A 5K4JA 4KIPA 2VWIA 3BEGA 2R3OA 5K0XA 1V0BA 2F7ZE 3KXHA 3AT2A 3R63A 4DLIA 1SYKA 3NZ0A 3R7UA 3GEQA 5J7BA 3GU8A 4CNHA 4FV7A 1XBBA 3COHA 2GQRA 2P3GX 3I0QA 2BTSA 4LQMA 3QC4A 1Q62A 2WMQA 4BBMA 4FTAA 5K5XA 5L2SA 1TQIA 1ZMUA 2IVVA 3G33A 4GK2A 5J9ZA 4R7BA 3KMMA 1UWJA 2XP2A 4D4RA 4K8AA 5I9UA 4BIEA 1XBCA 1KSWA 4BCJA 2ZMDA 4Y73A 4G5PA 5HTBA 2GMXA 3P08A 2Y4IC 3MSSA 5JT2A 5EDQA 5HLNA 1ZWSA 3NCGA 3PE2A 3K2LA 3FC1X 4QP7A 3W16A 3GP0A 2BRGA 3RWQA 4TYEA 4FV5A 5AP2A 2PZRA 3UVQA 4EOPA 3PA3A 3Q6UA 1PXLA 2R3RA 3W10A 2PL0A 4HOKA 4K2RA 4KA3A 4O2ZA 5F95A 3QCXA 4JBPA 4U79A 5DA3A 3T3VA 5BVOA 1CKJA 2GFCA 3LQ8A 4GCJA 4NM5A 5D11A 1SM2A 3TT0A 2JDVA 3HP5A 1PKGA 1F5QA 3IW6A 2GDOA 3OCSA 2PTKA 4DBNA 5IQCA 2ZDTA 2XRUA 3LVPA 3MH0A 2UV2A 2ITTA 4BCPA 3UC4A 2CKEA 3NR9A 5HVJA 3ZU7A 4BDGA 1YXVA 3LM0A 3R7VA 2QCSA 3MDYA 3QAME 5ANEA 4MF0A 4D4VA 4HGTA 3PVGA 4QP1A 1OM1A 2CGVA 5I9YA 2WXVA 4F6WA 4BDJA 3S1HA 1T45A 4FIHA 4HCTA 4HGSA 4CKIA 4EK4A 4CKJA 3O7LD 4DEAA 3PLAE 5AV1A 3G6HA 2XB7A 2W05A 2VO3A 2XZSA 2EXMA 3FZSA 3N51A 3LFDA 1XWSA 2BROA 2F7XE 2YABA 2RG5A 4X2GA 5GZAA 3O96A 4ZZMA 2VAGA 4XV2A 4FKPA 1YDRE 5A4LA 2RSVA 4RWIA 3PA4A 3GCSA 3KB7A 2EB2A 4FT5A 3F3VA 5EYCA 4K33A 2VN9A 3C51A 4DT8A 2YM6A 4FIFA 2VGPA 2B1PA 4CFFA 3GBZA 4RX7A 1BKXA 2WZJA 3FSKA 1XJDA 2EXEA 3F5XA 5C27A 4ENXA 4I0RA 2J0IA 5C8KA 4RIYA 1NW1A 4JG6A 4NSTA 4CTBA 3KN5A 2HXLA 3GCPA 4QP6A 4X6RA 5EK7A 4USDA 3Q32A 3CSVA 3LCOA 5AP3A 1QCFA 3LFSA 1PMEA 2C1AA 4BCOA 2I1MA 2HWOA 3FL4A 3ZLXA 4F63A 4IM3A 4U41A 3TEIA 4IHPA 4NCTC 2W9FB 2W5BA 3BEAA 3ULIA 4BTKA 2IPXA 2XIXA 5IZFA 4ZXTA 3U4WA 4M7IA 3UE4A 3NYXA 1YOJA 4H1MA 4YC6A 3LMGA 4XG7A 3LFNA 2C68A 1H0WA 3P7CA 4H58A 3O71A 4U80A 2BIKB 5ANKA 4C2WA 1Q3WA 3VS1A 5CQWA 1H27A 3P1AA 3BZ3A 4O7SA 3OBJA 2YM4A 2OIBA 3O51A 4O7VA 4FK3A 4O38A 4V05A 5G6VA 1Y8GA 1PXKA 1M7QA 2ITVA 4QTBA 3HRCA 2A27A 2X6EA 4YNEA 4EL9A 5D41A 4UN0C 1B38A 4H36A 3TV4A 1QPJA 4D5HA 4F64A 2B52A 2R3QA 2E9VA 4HCUA 5CU6A 3R6XA 4FSWA 2XJ0A 2OWBA 2JDSA 1JSUA 3TTJA 2NPQA 4ZZNA 4PDPA 4LOPA 4FKWA 1H25A 3S2PA 3L9PA 5M53A 2UW5A 3UO4A 5C26A 5IQHA 2Y9QA 4BDDA 4IZAA 2JDTA 2PE0A 1NVRA 4I5HA 5AUTA 4C7TA 2P2HA 4EH9A 5FGKA 2ZV8A 3BWJA 3UTOA 3ZLYA 4TPTA 1HCLA 5L6OA 4RIYB 5H3QA 5J5TA 2YFXA 2OU7A 2BPMA 4FR4A 5CSHA 3NRMA 2VUWA 3OTUA 5EQEA 5HICA 4RWJA 2PUPA 2WTCA 3P4KA 4FSNA 3KMWA 1V0PA 1GNGA 4UEUA 2ITPA 2UW6A 4C33A 4YHFA 3GFWA 4D0WA 3H9RA 1KUTA 5AJQA 4E4XA 4XV9A 5B0XA 4BF2A 2OZOA 4PDOA 3GCUA 4BI0A 4AS0A 5ITAA 4FTTA 5JFWA 4H39A 3GQLA 3VN9A 5F1ZA 3F5GA 4RC2A 4FE2A 5EDRA 1P4FA 5IA5A 3CIKA 3C9WA 2YACA 3HDMA 2F49A 4BRXA 5ANDA 5F94A 5JGDA 5BYYA 4H3PA 2R4BA 4D1XA 3ORMA 4ONAA 4GT5A 3R8PA 5GJFA 5KHWA 2ZJWA 4YTHA 3KULA 3WBLA 1KV2A 4GG7A 4C4JA 4DN5A 3N9XA 3MA6A 2WHBA 4QTDA 2YIWA 5ACBC 4DG0E 4JX7A 3QF9A 4Y5QA 4K18A 3E5AA 4XBRA 5JN2A 3DK3A 2O2UA 4KWPA 4G2FA 4O0UA 2PVYA 4UY9A 4X2NA 4CCBA 4CTCA 4L6QA 1NT2A 4O7YA 5GIPE 5CYIA 5AUUA 5LCKA 2WTVA 3NPCA 4V0GA 4WG4A 4I4EA 3VULA 3S00A 3WF9A 4PMTA 3NVKI 3KRJA 3P5KA 2ITUA 3QQUA 4RFMA 4QMTA 5ETAA 3W2RA 4XP3A 1LEZA 4K77A 2OSCA 4KS7A 5HVKA 1G8AA 3HMIA 4OTIA 5KMOA 3CKXA 4NTSA 3UP7A 5AM6A 5CEOA 4DTKA 4FV9A 3FQSA 3MPTA 3SXRA 3EL7A 3PJCA 4GVJA 4KBAA 3UNZA 4HW7A 2XRWA 3Q9WA 4RWKA 5IKWA 4DFNA 4IZ7A 4Q5EA 4FZAB 3MWUA 5EYMA 2H8HA 3OBGA 3C50A 1WBPA 4C8BA 5M56A 3QRIA 5FEEA 1OI9A 4BDIA 1SVGA 5FBOA 5A4QA 3Q6WA 4FZ7A 3FV8A 4Y95A 5BVEA 2E9OA 2C6OA 5CT0A 4TWOA 3KQ7A 4BWXA 3BE9A 4I1ZA 4CQEA 3GC9A 1ZYLA 3ZM4A 3FLWA 4AZEA 4L46A 5CF6A 4I20A 3OVVA 5BUEA 1K3AA 3R83A 4QNYA 3PLSA 4AWIA 4I5CA 4JT3A 3EQCA 3F7ZA 3Q9ZA 3KEXA 2OH0E 5AR5A 4D2WA 2BRMA 4MNEA 4DHFA 3KULB 4W4XA 3EZRA 1JSVA 1H00A 4QO9A 3FAAA 1QPCA 3CTHA 3RK5A 2UZDA 3GU6A 3IOPA 2HWPA 2PZYA 2XIYA 3D5XA 4W4YA 3AOXA 3UVPA 5CWZA 1QMZA 4EUTA 4YJQA 5AP4A 3FHIA 3U8WA 3PZHA 4V0GB 3ZSGA 4O0SA 3D2KA 1YDSE 3VS4A 4C2VA 4GFGA 1IR3A 4LUEA 3T9TA 3ZTXA 4KIQA 3ORLA 2LAVA 3CEKA 4L67A 1OECA 3QALE 3TKUA 4LM5A 2W06A 4CV8A 2VTSA 2YWPA 1R0PA 1OL2A 4BCNA 5KMLA 4IVCA 3PY1A 3VBWA 4E73A 5HU9A 4U3YA 3AC4A 2YISA 2CN8A 2XK8A 4FKVA 4DCEA 3RP9A 4I6HA 3CGOA 1E1VA 4WSQA 4KNBA 2IJMA 4H3QA 1OBDA 1J1CA 1X8BA 1KE9A 3FKNA 4J99A 3EFLA 1XH9A 4MNFA 5IDNA 3CGFA 2PE2A 4ASXA 5I4NA 4I94A 2W99B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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