3QTWA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-13
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
294
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 294
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-02-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3qtwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3qtwA01
4YNOA 2X8DA 3ZHPC 4UV0A 3QF9A 3OXIA 5IZFA 4S33A 4EOQA 4RFMA 4G16A 5FTQA 3ZUTA 4NM5A 3E8DA 5FDPA 4XLVA 2VTNA 4UMRA 4GL9A 3RVGA 2ITVA 2G2IA 4E4NA 3A2CA 4NJ3A 3ZRKA 3AXWA 3PY0A 3CS9A 4XG8A 3FMLA 1BKXA 4DFLA 4YLLA 4K2RA 2HWOA 3FZSA 5LCJA 1M7QA 4LUDA 4O2PA 2GCDA 4P90A 2BZJA 5HG8A 5HO7A 5CTPA 5EYKA 3AD5A 4IZYA 4RQKA 3GEQA 2JGZA 1LUFA 5HTIA 2CKPA 4TWPA 4GUEA 4YTHA 3QFVA 3EQFA 4BL1A 4NFNA 4YBJA 3S3IA 3RPOA 3HUBA 4AFEA 4BDGA 2ONLA 2GNHA 3EN5A 5IPJA 3BYVA 3QX2A 5AP3A 4CT2A 4NW5A 4QP4A 3Q4TA 3E88A 3WZDA 5HG5A 3BYUA 3OC1A 5LMKC 4D55A 1XH7A 1YXSA 3O8TA 3H0YA 5J5SA 4BDJA 5ETFA 4YZMA 4ANOA 3K5VA 4YZCA 3ETAA 2P33A 3FLNC 3FWQA 2X8EA 3GOKA 3PJCA 3MH1A 4R1YA 2WNTA 3CTQA 4IWQA 2OK1A 3I0OA 4R7HA 3UO6A 4KIPA 4ZXTA 4EHZA 4FEXA 2ITPA 2WTIA 4PPCA 1GZ8A 1XH9A 2WIHA 4Y5HA 4D9TA 2PVLA 1WZYA 3U55A 4Q9SA 2OFUA 4PNKA 4XX9A 4NK9A 4GYIA 3W2RA 4TL0A 2WMVA 5LVNA 3LCDA 4NKAA 5KZ0A 5A4QA 4YJRA 4FEQA 1JSVA 4WUNA 4F9CA 5CY3A 4CD0A 3N9XA 1PXNA 1FMKA 5HLNA 4AX8A 3RP9A 3ZEPA 3RAIA 2W05A 4A07A 2WB8A 3FXXA 5DE2A 3NW6A 4ERWA 4K77A 3VW8A 5EG3A 5FLFA 4ZMEA 2GFSA 3U6HA 5CVGA 3F2NA 2O65A 3QRJA 1XH8A 4DHFA 2H96A 1P4OA 5F4NA 4MEDA 5ETAA 3FI8A 4IB3A 2XK3A 2IZRA 3QUDA 1NVQA 3LFCA 5ANOA 4ZLOA 4TT7A 1WBSA 3DJ5A 4HYUA 4J97A 5HKMA 3UC4A 3WBLA 3OW3A 1XQZA 5L6PA 2BRBA 2H9VA 4IE9A 4UY9A 3FMMA 1CKPA 5D11A 1JQHA 1FBNA 4Z7HA 4JVGA 4FV0A 2PK9A 3BV3A 3PXZA 1R39A 4U0IA 5AP6A 1SNUA 4RSSA 1FINA 4LGGA 2Y9QA 4N57A 3AT4A 1ZOEA 2X9FA 3ZRLA 2XNEA 2R5TA 4C58A 3D7TB 5JH6A 3QQGA 4ZMFA 1IRKA 4ASXA 4AUAA 2A4LA 3DAKA 2OLCA 2RGPA 2BTRA 2ONLC 2PWLA 4RIYA 4CLJA 4Y95A 4O7WA 2J5FA 4TKSA 1H1QA 3MW1A 5AAGA 2NO3A 2R64A 5BUIA 3ORNA 3DPKA 4L42A 4YZDA 3UOLA 3KL8A 3NVMB 4ZSLA 3R7IA 2WOUA 4TWOA 2YN8A 3BRBA 4BIBA 1XHAA 3FY2A 4FUYA 3E87A 4I24A 3C1XA 4G31A 4QYEA 1Q41A 1XO2B 1W82A 3DBEA 5B2KA 4AA4A 4G6LA 4E5WA 5K9IA 4X6RA 2J50A 3SXFA 3BWJA 3VS4A 2C5NA 1MQ4A 3AD6A 4W4VA 5M44A 2XKFA 3BHTA 2V62A 3VUKA 3NUAA 3SXSA 3EQCA 1JSTA 4GT4A 3TWJA 3GU4A 1FVTA 3UQFA 3OF0A 4DFZE 3PXFA 4CCUA 4AN9A 4YGAA 5AWMA 5J5TA 3PZEA 2F7XE 2X8IA 3FYKX 1P2AA 2WTKC 2QR7A 3UBDA 2BRHA 5EI8A 2PL0A 5EW8A 3EWHA 3TIZA 3FMJA 1OITA 2W06A 3F5GA 5DH3A 3K54A 3WIKA 5GIOE 3U4WA 1ZY4A 4PY1A 1H24A 3R83A 3C5UA 4F65A 5GIPE 2BPMA 2CGVA 2WTDA 3PXKA 4FSWA 3ZO1A 4M97A 3MFSA 2YM4A 3VQUA 5FXQA 3DLSA 2W1FA 2YCRA 5AX3A 4HZSA 4I5HA 4WD5A 4TYIA 5GZAA 3ZEWA 3IW8A 5HICA 3LFNA 4NW6A 4PV0A 5JFXA 2BCJA 3C5IA 4FODA 4OTIA 3RPRA 3RWQA 5AUUA 3F2RA 1AQ1A 3PXYA 3LM5A 2ERZE 4D58A 1CTPE 3MPAA 4WSQA 2F7ZE 2HY81 5EOBA 3O7LB 4BY9E 3LFBA 3UP7A 3VN9A 4QP8A 3IGOA 1OKYA 3EN9A 2R3OA 3DBFA 1P5EA 2Z7LA 4M69A 2IW6A 2PE1A 4XNEA 3OT3A 5A4TA 4EHGA 2YM5A 2IVTA 3QYZA 4ASEA 4D5HA 4FV6A 3VQHA 2YACA 2WZJA 5BVNA 4KKGA 4LL0A 3T3UA 1B6CB 1G3NA 3ANRA 3D9VA 2FVDA 5FWKK 2ETMA 4IWOA 3LE6A 2XIKA 1BI7A 2JC6A 2YWPA 1Z9XA 5K0XA 4FIHA 4W4XA 1RQQA 1KUTA 1FVRA 2W1CA 3EMGA 1Y8GA 5HD7A 4BDCA 3O0GA 4WRSA 3VJOA 4C4HA 4DAWA 3F61A 2UW7A 2VTQA 3FLZA 3G33A 4QMYA 4EKKA 4K9YA 3SGCA 4O0UA 5K5XA 4IB1A 2W4OA 3F5UA 3MDYA 4GVJA 3COHA 3K2LA 5HNGA 3U51A 4E1ZA 2UVZA 4NT4A 2XH5A 3H3CA 2BAKA 3DGKA 3SVVA 3FBVA 2Z02A 4I94A 2YZAA 4K11A 3TUCA 3PP1A 4DYMA 2C6IA 2YLFA 2IG7A 3VS1A 3TEIA 3FKNA 2UVYA 2GNIA 2VTOA 1W0XC 3MY1A 4XV9A 3EFKA 3O23A 1WBPA 5AUZA 3COIA 3ZO2A 4MNEA 1URWA 2X0GA 2XNOA 4O81A 4TYEA 3NX8A 5KMNA 1UU9A 4D4VA 4EOKA 4RGJA 4G2FA 1OPJA 4GFGA 4CKIA 4FL2A 5AAFA 5CLPA 4OBOA 4YJVA 5CWZA 3VHEA 4YJNA 4DGMA 4J1RA 5JT2A 2GFCA 5FGKA 4AP7A 2HZ4A 3FY0A 3NSZA 1WBTA 2CKEA 3TI1A 3C51A 4UYNA 3RTPA 5BUJA 3EFWA 3BI6A 4JDKA 1Q8YA 3KRJA 3ZC5A 3KF4A 1L8TA 2CNVA 3ZDUA 3ZSGA 3E7VA 2WQBA 2J7TA 3Q9XA 5D41A 3HP5A 5I9XA 3W2QA 2BZHB 2PE2A 4YTIA 3FKLA 4DEHA 4X0MA 4FOCA 3VUDA 2R9SA 2OFVA 1Q97A 3LCKA 4RBLA 3ENHA 5CEPA 4KIKA 2PUIA 4NCTA 5HG7A 1B38A 5ACKA 3D0EA 4FSMA 4ZS0A 3RNIA 4QQJA 4AXAA 2X4ZA 2A0CX 3RPVA 3S95A 4QMQA 4X6QC 3GCPA 3VS0A 3W16A 3W8LA 4AA5A 5M4IA 3ORPA 3BBWA 3SRVB 5A9UA 3QCSA 4E93A 2PVFA 4UB7A 3PSCA 4MWHA 1ZMUA 4YC8A 3C4WA 1GIIA 2PVYA 3R2BA 5K4JA 3WI6A 4AGWA 5M53A 2Q0NA 5A4LA 5HU3A 2QLQA 1JAMA 3CEKA 3LVPA 5JZNA 4AA0A 4CSVA 3CKXA 3D5WA 4GT3A 4YHTA 4FEWA 5BPYA 2H6DA 3OHTA 2PVRA 2HYYA 5CU6A 2QG7A 2XNGA 4A4XA 2ZMCA 4D2SA 3CPBA 4PX6A 5LWNA 2ZM4A 1G8SA 1PF8A 5FUTA 5CAOA 4U7ZA 3K3JA 3R8MA 2J5EA 5ANKA 3ZH8A 2XM9A 4R6VA 5CS6A 2V5QA 3C50A 4O91A 2OI4X 1URCA 3O96A 3ZBXA 1UA2A 4L46A 2OW3A 5IA5A 5B7VA 3MVHA 3VUTA 3GENA 4I1ZA 4MK0A 1PMEA 5E8VA 4TN6A 1UNGA 3KEXA 2ZB1A 5DGZA 3RHXA 4YBKA 2XNBA 1KWPA 4LOQA 4QMZA 1PRYA 4MBIA 2WQMA 3VS7A 1STCE 4U6RA 4H05A 3RINA 3IW5A 3MBLA 3NNXA 3TV4A 3W2PA 3DAJA 4GJ3A 3GGFA 3PG1A 4S32A 4F99A 4BBEA 3AGMA 4FSQA 5J1WA 2CSNA 3AT2A 3REPA 5J8IA 2I0EA 3PIZA 5E4HA 1YXUA 5LWMA 1VZOA 4GKHA 3HNGA 1NT2A 5T3QA 4DCAA 4AOJA 1WVYA 3MB7A 3NUSA 4QO9A 2PZ5A 2X2KA 4ACDA 3G6GA 4FI1A 4D4RA 3QBNA 3EN4A 1M2PA 1SVEA 3QWJA 3FC2A 4EK6A 4H36A 1SZMA 4DFBA 2QOLA 3DKGA 4MCVA 3L9NA 3QKMA 4NCTC 5HU9A 3KA0A 5DMZA 4FV3A 2OGVA 2R3HA 3KXXA 4V05A 4DEGA 2EB2A 5DRDA 2CNUA 2WQOA 3TN8A 4PL3A 5LVMA 3SHEA 3AMBA 3V04A 4RX5A 1U5RA 2FSLX 3EFJA 2PYWA 2HXQA 3OW4A 5HBEA 1DM2A 3VF9A 2PVNA 4OAVB 2PULA 1JNKA 1REJA 5CEIA 2Z2WA 3DK7A 3DB6A 3KF7A 2X39A 4FSRA 2ZJWA 3CPCA 4CEGA 3BHVA 4KUJA 1ZZ2A 3G9LX 3QHRA 4BTMA 4QMPA 4TYJA 2H34A 3UVRA 5L6OA 3NRMA 3UIUA 4BTJA 3RHKA 3WZUA 1FOTA 2UUEA 2ITTA 1QPEA 4PL5A 3I5NA 3T8OA 5H8BA 1GIHA 3CGOA 2WTKB 4XCUA 3HMIA 4OTRA 3MH0A 3F88A 3BQCA 4O7ZA 2AYPA 3JUHA 5K4IA 2R3NA 5E8TA 5CEMA 5LOHA 4PF4A 5AP0A 3QUEA 4ZAUA 2VU3A 2XKEA 3MI9A 4CKRA 2F2UA 5EYCA 5ANIA 3WZKA 5HI2A 3SV0A 5CAPA 3R1YA 1F5QA 3CIKA 4M7IA 3R22A 4FKVA 4TTHB 4UXQA 3K3IA 4EOOA 3EL8A 5BVOA 4UN0C 4MD7E 3SA0A 3RZBA 4QPMA 5EW3A 1BYGA 4F6SA 3SXRA 4RVMA 4C57A 4FKLA 1UWJA 4ZY4A 2W7XA 4AACA 3SKCA 4JR3A 3ELJA 4QD6A 5F94A 1LP4A 3Q9WA 3C4XA 2X2MA 3FLWA 3PTGA 2C3KA 4K6ZA 3ZONA 3ZM9A 2HZIA 3Q60A 4IB0A 4GG5A 4FC0A 3UP2A 4GG7A 1ERKA 4S30A 2P0CA 3RCDA 2QO7A 4I23A 4FK3A 3OY1A 4IQ6A 4PL4A 4PUZA 3UGCA 4RIYB 4H3PA 4O0SA 4FGRA 4UX9A 4EHVA 4X21A 3BEGA 4TPTA 4IADA 5AP1A 5G1XA 3VUMA 3BCEA 2FB8A 3GC8A 3KK9A 4DTKA 4ZTMA 4H3BA 5ITAA 4ZZOA 4M15A 4CYJA 2XIRA 1WMKA 4IHPA 1BI8A 1SVHA 4LG4A 3ZLXA 3LQ8A 4Z9LA 4EOJA 3MH2A 5HG9A 5E9EA 2V7AA 2PPQA 4FNWA 4YMJA 4FIIA 3CJFA 2RFNA 3PY1A 3QA0A 3UVQA 3ZUVA 5C03A 4XEYA 1XH5A 2JIVA 1Q5KA 3KCFA 2GTMA 3NR9A 4S2ZA 4OBPA 2CCIA 4IVAA 3FYJX 2C5YA 4RLKA 4MYGA 5IA2A 2IVUA 5JGAA 2X2LA 5IQEA 4LL5A 5BVEA 4LGHA 4ASZA 3WARA 3WE4A 3AC4A 2J2IB 1W8CA 2CKOA 4XBRA 3Q4CA 4GIHA 1CSNA 2BRNA 4FV9A 4U5JA 2JDTA 4QPAA 3AMYA 4PQNA 3ZU7A 4C7TA 5BMSA 5CSHA 2KULA 1U4DA 2JDSA 3H9FA 1J7IA 4RJ6A 4F6WA 3F2AA 2QVSE 1R78A 3BYOA 2JKQA 3IO7A 2UV2A 5E7RA 5JFVA 1ZXEA 2GDOA 2W0JA 2XIZA 2R2PA 4B99A 4XOZA 3UNJA 4O0RA 1GZNA 4IDTA 2QG5A 3TTJA 2HCKA 2ZV7A 5CX9A 3E3PA 2PU8A 4KIOA 1DAYA 3TUDA 4U79A 3W2OA 4Y46A 4FKWA 5D10A 1WBNA 2BRGA 2ZM1A 2XRUA 2OH0E 5IH5A 2XIXA 3VBWA 4PPBA 3PRFA 5I5ZA 2QOQA 3ANQA 3PJ8A 3R63A 4EORA 3E8NA 2BIKB 4P2KA 5L8JA 4E6CA 3KQ7A 4EQUA 4QMLA 2B9JA 4FZFB 1H1PA 3POZA 4J95A 4QYFA 3U8WA 4CXAA 4M69B 1Q4LA 4O6EA 5CQWA 4NM3A 3UVPA 3ZCLA 3BBTB 4BI2A 4KS8A 5AR2A 3LIJA 4ZOGA 5HO6A 5M55A 2LGCA 4QTBA 5AAEA 3VC4A 3B8QA 2ZAZA 3LJ1A 2IO6A 2HY0A 1YRPA 3MY0A 3PA4A 1Q8ZA 1ZYJA 3LOKA 2BROA 3R02A 3RJCA 4QQTA 4R77A 2DUVA 4IM2A 4IX4A 2EB3A 3RAWA 3FQHA 1YOJA 4DH5A 4I5PA 3DB8A 4USDA 5D9HA 4BVUA 3OBGA 3HMPA 4QP6A 5HX8A 3MFTA 3I7CA 4JQ7A 4ALVA 3F7ZA 4LM5A 3KXGA 1KOAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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