3QW3A

Structure of leishmania donovani omp decarboxylase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
255
structure length
250
Chain Sequence
MSFFDLLNERAKRSLLCVGLDPRAKTAAAAVEECKRLIEQTHEYAAAYKPNAAFFEFFGAEGWAALSEVIRAVPAGIPVVLDAKRGDIADTADAYATSAFKHLNAHAITASPYMGSDSLQPFMRYPDKAVFVLCKTSNKGSNDLQCLRVGDRYLYEAVAERAEGPWNVNGNVGLVVGATDPVALARVRARAPTLWFLVPGISLKASLDAGLRADGSGMLINVSRGLARAADPRAAAKELCEEINAIRFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase, lyase
molecule keywords Orotidine-5-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltr
publication title The Leishmania donovani UMP synthase is essential for promastigote viability and has an unusual tetrameric structure that exhibits substrate-controlled oligomerization.
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania infantum
total genus 94
structure length 250
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2011-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qw3A01
1YDVA 3UZJA 3DHFA 4BR1A 1GG0A 5LNUA 3NL2A 1GYNA 5DY2A 1PCWA 4EF9A 3EWWA 4A2RA 3QC3A 3N19B 1QMLA 2VKZG 3OVRA 2HSAA 4GRSA 3K30A 3LHZA 2VEPA 3IIOA 1LROA 3M5XA 3W2KA 3LBCA 3LHVA 2WSQA 3A5VA 4UR8A 1D9EA 1QPNA 1YPIA 4PC8A 4UMCA 1OYCA 2GPTA 2VFDA 2Q8ZA 3WK0A 1YPFA 1SZFA 1OFDA 2A85A 4FX6M 3LCIA 3HQ1A 3S1VA 3IIVA 1G69A 3F1QA 4EOUA 2V2DA 5FF3A 5D04C 1TV7A 1FY6A 1QCWA 1H7OA 3E0IA 3GXPA 1OFAA 4IQLA 1FXPA 3M5ZA 3OA3A 1SR9A 1VCVA 4MYXA 3NPUA 3E12A 3MBFA 4I7UA 4MJMA 1VC4A 2ZZ4A 1GYLA 4JX5A 1FCUA 4A3UA 1FQ0A 2IQTA 3Q2DA 3CIWA 3W7KA 1DL3A 1QPQA 4HSNA 2DZXA 1H60A 3N2MA 1Q6OA 3B0UX 2RHGA 1GQNA 4MJZA 1FXQA 5AHIA 4PH6A 5U4NA 4K39A 3UYCA 4IMDA 4QJ1A 4LS0A 3RLUA 5D2XA 2E5DA 1TREA 3LHUA 5D2YA 4KWWA 1JUEA 1TPH1 4O11A 1WX0A 2VELA 3STFA 3LCHA 1DJQA 1XKYA 5AYZA 1OK4A 1DOSA 1WYIA 4K8HA 2DU2A 1A5AA 1VRDA 1RV8A 4E2BA 4R34A 3MI6A 1XDLA 5G4WA 4JN6A 2VENA 3EXSA 4M6QA 5D38A 1AW5A 1I2OA 2YX0A 3KVLA 4N4QA 1QO5A 5C5YA 4O8RA 5CZJA 3W1LA 5KMYA 5TQLA 5HJLA 3GDRA 5KINA 1H1YA 1HO4A 3EB2A 4IPJA 4WZHA 4MOZA 3QMRA 4NNBA 5LZLA 3SSJA 3TCEA 3W1TA 1VLIA 2OJPA 1I45A 1TV8A 2PE4A 4JGDA 3BO9A 5E1QA 4I9AA 5K4ZA 1BTMA 4WY0F 3W2NA 3GDLA 5BMXA 1WOAA 1PE1A 5AC6A 4IXHA 1MXSA 4UXDA 4XTDA 1SU5A 1SUXA 2JKEA 4PTNA 4UMBA 3VNDA 1ME7A 1N7KA 3P60A 3UZ5A 1QOPA 3W7MA 1K8YA 3LX9A 2FDSA 3MWAA 5LHFA 1TPEA 3GZ3A 3S5NA 3ZR4A 1JCJA 4D2JA 4ADTA 1GVFA 3T55A 3HGRA 1R2SA 3EX2A 1KTBA 1Q6LA 4GNJA 5CGQA 5G5IA 3I7SA 5L9FA 1RQHA 3W1MA 3NXFA 2GVLA 1VYSX 3W7IA 2Z0IA 2ZRXA 1R46A 4HNNA 4KFOA 3L5AA 5G2WA 2YW3A 3TIMA 3V1PA 2EGZA 1RD5A 1SW3A 3PUEA 1VGAA 3P61A 1FDYA 1GT8A 2PRHA 4IX0A 3BK0A 3C6CA 3Q58A 2A7PA 1ADOA 3BW3A 3TW6A 3SI9A 3MUXA 4N9EA 3A23A 3M5YA 2YW4A 5A8GA 1CI1A 3M9YA 3O05A 2PRLA 1VCGA 2QCCA 3FJLA 1R2TA 1XXXA 1KFKA 1ONRA 3KVJA 2B7PA 3C2VA 1R30A 3HGOA 5LNSA 2E6YA 3LOTA 1JR1A 1TJPA 2Y88A 4H6KA 4AB4A 3O1NA 1F74A 3NZRA 3MHUA 2VOMA 1W5NA 2QCNA 4WY0A 1XCFA 4LC8A 4WUIA 3WJWA 2C15A 2NV1A 3KVKA 3NG3A 3MP5A 3W7OA 3NGJA 1TSIA 1FCVA 1LCOA 3QYQA 3NQ2A 2YGYA 3W1PA 2DP3A 1FCQA 3LRKA 1I2RA 2E77A 4LUIA 4UUIA 2YDAA 4LV9A 2FPVA 3EXTA 3F4NA 4EIVA 3W7NA 1FWTA 1H7PA 2Z1BA 2YPIA 1SO5A 4ADSA 1X1ZA 2ATMA 3C61A 2B7OA 4QNWA 3TUUA 3ATYA 1OF8A 3O6YX 3W86A 4DQWA 3PC0A 2C1HA 5FEWA 3C0JA 1W8SA 5D37A 4JYDA 3W1UA 1KTNA 3CEPA 3L68A 3TMLA 2E6FA 3LV5A 1F2JA 2J88A 2WSRA 3MP4A 3DI1A 3M7WA 5CZ0A 3S5ZA 1KLZA 1ME9A 4ZVJA 5BOOA 3B03A 3P8JA 4OQVA 1GZGA 3DFPA 1Q6RA 4O17A 1V7YA 4M6VA 1EEPA 1EP2A 1TPDA 3O63A 4Y96A 4CNOA 1JCYA 3DFSA 1F05A 3DFOA 1YYAA 2I14A 3HMJG 2I9EA 2ZRVA 1RZMA 1TMHA 3WJYA 4JTSA 3A9IA 3I7QA 5I3HA 5AB3A 3DHDA 3R8RA 2XN1A 5LNRA 3GXTA 1K8ZA 4O13A 2BZNA 2LLEA 1VYPX 2ZRWA 2B4GA 3G0UA 3M16A 3G1YA 3MHGA 4Z0JA 3P81A 2Y63A 2ZBTA 1OABA 5K7JA 4BI5A 3QH2A 4A22A 4UFJA 1ZALA 1VQTA 4S2CA 4Y6GA 4TX9A 5CSSA 3N9SA 3WJXA 4JY8A 5DCDA 4ZZ9A 1AK5A 2YR1A 1K02A 3O6DA 2PURA 2NXGA 2CLFA 3FKKA 3BV4A 1EWDA 2H3BA 4O1DA 4YMZA 2WJZA 1SZNA 3MYOA 4TR9A 1WDWA 1RQBA 3OEXA 4NUWA 4GUJA 1H5YA 4MZYA 1SPQA 4WX2A 2NX3A 2ZZ6A 1OF6A 3GVGA 1SQ7A 1I2NA 3G1AA 3W7HA 4PODA 2OMAA 4XKYA 4ORIA 3E96A 3G1HA 3W7QA 1QR7A 2X1SA 2D73A 1L6YA 2OT1A 2QAPA 4RCXA 1VCFA 4QM1A 2EF9A 1B3OA 2WV8A 3W7DA 1OG0A 1Q3NA 1ZCOA 5DN1A 2HS8A 5I3FA 2YZRA 3W7PA 1EUNA 4JXCA 1TPUA 3MHFA 3BVJA 1ZNNA 3O07A 4MUZA 4PCFA 1OFPA 2KZHA 4GUFA 3HIJA 4AAJA 1W5PA 3W71A 4EVZA 2O7SA 5T26A 2X30A 3THAA 1FUYA 1TV5A 1Q45A 2H3DA 4G1KA 5CPOA 3RMJA 1C8VA 4CNPA 4CCCA 4NZJA 4ZQRA 3SY5A 5G4EA 4O18A 2DZSA 1U83A 1JCNA 1WAUA 2ZQ0A 5BRBA 3LTSA 3S1UA 2G5WA 3DXIA 3W7GA 3KRUA 4K7VA 3L5LA 3W6YA 3WK3A 1QFEA 1I2PA 1DHPA 2GJLA 3EX6A 1QDSA 1WV2A 2QCHA 2PCQA 4BI6A 3VE7A 3FEMA 5IBXC 3FFSA 4UTTA 1EA0A 3NR0A 5F4WA 1HFBA 5D03A 4UTKA 4UFIA 3B04A 3TDFA 5GVJA 3TV8A 4JX4A 4ZQNA 2YFNA 1UUOA 1OHLA 2ISWA 3NQMA 1P1XA 1L2UA 4LW7A 2HS6A 4Y90A 3PBUA 3SJ3A 4N9BA 5I3IA 1TTIA 4HKPA 2DORA 3QQ0A 3ABOA 3UWWA 5AYYA 1ZHAA 5BMWA 2C16A 2CLLA 4RXFA 1UBSA 4LS2A 3FS2A 3LI0A 4XBSA 4JTKA 3UXDA 2P0OA 1JULA 4TMCA 1LOSA 2CLEA 1YTKA 4P61A 2V2HA 5D09A 4UFMA 3LCXA 3LXBA 1DQWA 2C18A 2Z6JA 3UY8A 4YLWA 3BLFA 2YYUA 5AHNA 2CZDA 4O54A 3ANYA 3OIXA 2QCDB 2GUUA 4Q32A 4CQAA 1OFEA 2VC6A 3FYOA 3NDOA 3D0CA 1W31A 3BLIA 1TQJA 4M5PA 4MPQA 1LBFA 4CCDA 1PS9A 4IPIA 1VZWA 1HG3A 2XN2A 3QW4B 1O60A 4CNNA 1R2RA 3CU2A 4O10A 3EWBX 4HT3A 4UIOA 3TSDA 3ZFHA 1H7WA 2QCGA 4OWGA 4OGZA 2J9YA 5D33A 1AW1A 3C52A 2QCMA 3M1ZA 2QAFA 3KHJA 5CZTA 1S5WA 1G6CA 1WA3A 4POCA 3LCGA 5EL1A 1N55A 3ZWSA 5G2HA 3NAVA 4WXZA 4FNRA 1MZHA 1IGSA 1M5WA 5HWJA 3MYPA 3W7EA 1THFD 2CZ5A 5CKSA 3IVUA 3SZ8A 4JTHA 2ZRUA 3M43A 5TBOA 3VE9A 4HSOA 2C6QA 1GJPA 1LLWA 4NQ1A 3NVTA 6ALDA 2Q8LA 1XBVA 5D32A 3GKAA 4N6FA 1B9BA 1Z48A 2UV8G 4Z1CA 1H61A 3O16A 4IX2A 4CCEA 3TXVA 2QDHA 2V0TA 3NQAA 3V75A 4JTIA 1KTCA 4HHPA 2RDWA 3G1DA 3T44A 2CW6A 3N3MA 5H2ZA 3LB0A 1IXQA 3DENA 5C55A 1XBYA 3NQVA 1EIXA 1F76A 5K3VA 4E38A 3LM7A 1LYXA 1MO0A 3A21A 3T40A 2OCZA 2A5HA 4OT7A 2QDGA 3G0SA 2ATSA 1H7XA 2CU0A 2JKPA 2QCLA 1RVGA 1LM1A 3W07A 3UY7A 2GVGA 3IEBA 1CX9A 1P0NA 1WBHA 2CLMA 2H6RA 2QCEA 3SIZA 1H1ZA 1M6JA 3BG9A 4AF0A 2RKXA 1A50A 3NL5A 1DQXA 4O16A 3BG5A 4UFKA 3QSRA 1JJKA 1PCKA 5K9CA 1A5SA 1KM3A 3W70A 5F2IA 3TMQA 1VHNA 1JQXA 3GLCA 1QNVA 4GWEA 4LNYA 3RLVA 5SWUA 4Y9AA 4PEKA 1TCDA 5AHLA 5AYXA 1AW2A 2Y7FA 3W74A 2PRMA 3CLMA 3CT7A 3QJAA 4MLRA 2FB3A 3UWUA 2I1OA 5G1YA 1J4EA 5FF2A 4NNCA 3BGJA 3O06A 2AQWA 3GK0A 3HOJA 3TQVA 1KM2A 2WNZA 3DBPA 4JDBA 5FEPA 2YSWA 3P82A 3PAJA 3GXNA 4I7VA 1JRBA 4JD4A 3LCFA 1GVRA 3L5MA 1PV8A 4LTSA 4CQ8A 4M19A 3HPZA 4JIQA 4LT9A 2J6XA 5AC7A 4YCOA 2J9XA 2YCEA 1EP3A 5A5WA 4A21A 3MO7A 3P8IA 4O28A 1EWEA 1SZEA 3LCWA 1G4TA 1VR6A 4N2YA 1AMKA 4NJIA 4BWLC 5C6MA 3WJSA 2NUYA 3PG8A 1SZGA 1JCMP 3W75A 2Q3RA 4XZ9A 1W5QA 3KVMA 1YXDA 4XWUA 4UR7A 3DU0A 3CPRA 3KRZA 2NV2A 3UWVA 3QW3A 1I4NA 2NXHA 3ELFA 1G4EA 4MFDA 1HO1A 3R89A 5EBUA 4WD0A 1PIIA 4GUGA 3NZ1A 4MKNA 3M0ZA 2V5LA 1YLVA 4O4VA 1PVNA 4O50A 4CLMA 4XQ6A 4MVAA 2VFIA 3GIYA 3Q37A 3PB2A 1OX6A 4JTUA 3NPXA 2C19A 4DF1A 1W5OA 2YFOA 4NZFA 2X16A 3HF3A 5HWMA 2VFGA 4ZQCA 4UFLA 3QZEA 1W3NA 3R13A 3INPA 4Q33A 4BK9A 4QISA 1DJNA 2DZTA 3QFEA 1G7UA 3L21A 4OBTA 3VCRA 3W1QA 1UJPA 5ABTA 3P5YA 3R12A 2R91A 2TMDA 3L0KA 1LDCA 3W1AA 4WOZA 3NQDA 3PY2A 1TPB1 4DPQA 1OVDA 3IVTA 4FNUA 3LV6A 2VFHA 3KFTA 2XN0A 1OX4A 4ALDA 5CG7A 5EA9A 4KKXA 4WY0B 3P80A 3TKFA 1OYAA 1ICQA 2ZZ3A 4Q4KA 4AHOA 2V5BA 2QEZA 4AHQA 3GDMA 1H50A 4RK8A 4JTFA 3W2MA 1HL2A 2WQPA 5DBTA 3MBDA 2FJKA 1KM4A 3TSBA 2RH9A 4OHQA 1C29A 2NWSA 2A1YA 4XBKA 1TO3A 1SW0A 2EAWA 2WO5A 3W3OA 2Y85A 5HQEA 3OHIA 2Y89A 1VH7A 4R33A 3RNDA 5K9XA 3ABRA 3S5YA 2F84A 2FB2A 3MMTA 5TIMA 3STGA 4YXGA 1TRDA 3G8RA 2OX1A 3NQ7A 3S1XA 3EKLA 2TPSA 1WBJA 1V5XA 4UFHA 1GPWA 3LTYA 3MI3A 1D3GA 2PC4A 3TFXA 1QWGA 1LOQA 3VFLA 1L9WA 4ZQPA 3CB8A 3G1SA 5FEXA 4HIBA 4U4MA 3C2EA 1ZY9A 4JNMA 1KM1A 1JCXA 2V81A 1TJRA 1TIMA 2V9DA 1YXYA 2C13A 2H8XA 5E93A 3W7JA 4S1FA 1W56A 4O53A 5FF4A 1NSJA 4GBUA 1TQXA 4LVAA 1JQVA 2DZUA 2ZRZA 3O8AA 3PSVA 3W2JA 1AL7A 3T78A 2YYTA 1K7XA 2R94A 2A2IA 1M7OA 4TIMA 1FDJA 1ZFJA 2CZEA 1YDOA 1JUBA 1OX5A 4JTJA 3PB0A 3B8DA 1UASA 2Z2UA 3IGUA 4MFEA 4S2BA 2AAMA 4NU7A 2A0NA 2EPHA 1SFJA 4UTWC 4ZMGA 1FWWA 1A53A 4ML9A 1W3TA 3W73A 3BG3A 4BI7A 1OFOA 4FXSA 3G8EA 2V82A 2VFFA 4FIQA 1OJXA 2JGQA 4OE7A 4AH7A 2BWGA 1LOLA 2ABAA 1MEIA 3UD6A 2BLEA 3HGSA 1VLWA 4XKYB 3KAOA 2A21A 1KLYA 4ZQMA 2GOUA 4K38A 2JK2A 5CZSA 2BX7A 4IMFA 3ABQA 4MZ1A 3W7LA 2ISSA 5DY3A 4NT0A 3OG3A 5LNVA 3PM6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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