3R4SA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
428
structure length
424
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 424
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4sA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4sA02
1KITA 2QN4A 1MS1A 1MS0A 1WW7A 4BMBA 1IKQA 1FQ9A 1JY0A 4GXLA 3AKFA 3K1XA 3ILAA 1W0OA 1IKPA 2UUSA 2ZMKA 1YIFA 1YI7A 1SZ6B 4YG0A 2RQ9A 4DFSA 2EAKA 4X3AA 1FV3A 2KI4A 4XFTA 3EF2A 5LK5A 3O5SA 3HMYA 4XDQA 1AVXB 2HW9A 1KQRA 3A0NA 4ZFWB 1LOFA 4XJZA 2F2FC 3VT2A 3DGTA 4EFPA 2ZGSA 1BFFA 4XBNA 3WUCA 1ZA4A 2ZHNA 1QF3A 2EXKA 4IYBA 1W3FA 3V0BB 3FJHA 1N4KA 1PWAA 1QOTA 1N1YA 1LEMA 1WBLA 3NWKA 3BAHA 5FZYA 2NMOA 3A21A 4WV8A 4EFQA 1QNWA 5IUQA 2V5YA 1FNZA 2JE9A 3W58A 1DQ5A 1WCSA 3PVEA 2D7FA 3BA4A 5GZGA 1QKQA 4EEEB 4LBQD 2R1DA 3H6QA 4LBJA 3SLIA 3VWCA 1LGBA 2RG9B 3ZXFA 4I4XA 2JDZA 2BFHA 3WVJA 4PF5A 3V79C 4AVVA 3HALA 4Q9PA 2PHXA 3N7KA 2EXIA 4FPLA 1RITA 1JT4A 3FJAA 2Z42A 1OFSA 2EALA 3RQ0A 1H9WA 3OPZA 2D3SA 2NN8A 3AP9A 2DWRA 2ZMNA 2IHOA 1R8OA 4KBBA 2DS0A 1LU2A 5AVAA 4LBNA 1E0OA 1W6OB 3VKLA 3FJBA 2ERFA 4FOQA 2A6YA 1V6NA 3AZVA 3AXEA 4NO4A 4GKYA 2GO2A 1M2TB 2A3XA 1S0CA 3NBCA 1LHNA 3WDTA 5F8YA 3V65A 1QQLA 3JU9A 4R6UB 2ZHMA 4AVSA 4ZOTA 2GNMA 4FPJA 5T5LA 2ZMLA 3I2AA 4QO3A 4I4UA 1GBGA 3LSDA 5GAQA 4Y20A 4YFWA 1QMJA 3OBRA 4PC4A 3O0WA 2OVUA 4I4PA 4QD2B 2E4MC 3P6IA 4QKRA 2WJSA 2DUOA 3FLTA 1D0HA 3AYAA 3MEPA 1TIEA 1PZ9A 1BARA 1VAMA 3FJCA 4ZXKA 3O4CA 3M1HA 4XJAA 2ZGQA 3ZC9A 2WBCA 2C5DA 4LBKA 4OW4A 3I29B 2DVGA 2DVBA 1W6OA 5F9TA 3FJ8A 4FQZA 3FLPA 1RMLA 3IM6A 4XJ8A 1ISXA 5BXPA 4ZFYB 1W6PB 4I1BA 1N1TA 3VUOA 4I2SA 2E53A 2KI6B 4LBQB 2Y9WC 2M49A 4YOLA 1QDOA 3I2XA 3F1RA 1VALA 3T8SA 1S0EA 2A7AA 2NTDA 5HCBA 1KDKA 1BFGA 1BLAA 1VIWB 3CRGA 2PHTA 5IK7A 1ULFA 2DU1A 4FP2A 1DBNA 2EIGA 2V73A 1V6WA 5CA6A 4EFRA 3AZXA 1MS5A 1URXA 2A75A 1VLNA 3WZ1A 4BPZA 1NXD1 3NV2A 4A7YA 3HOMA 1SACA 2AR6A 5T55A 3POSA 2K4AB 1IS5A 2D6LX 2YZ4A 4P9XA 4GA9A 2ZGPA 4YW5A 3FLRA 2ZGNA 3SNMA 2DRZA 5F8WA 1DQ0A 4FVVA 1AXZA 4GWMA 4FPEA 3MW4A 5T5JA 3WOGA 2VY0A 4CJMA 4AVTA 1W3GA 4RA0A 1V6LA 4CZSA 4DRVA 1HLCA 4LBQA 1GANA 1KJLA 2ERMA 3USUB 2F2FA 1SLTA 5E88A 3CU1B 2ZGMA 4Y1UA 1LOFC 2WT1A 2ZR1B 1XZZA 3AKHA 1JHNA 1D2SA 1V00A 5DG2A 5KXBA 1QU0A 4IONA 1QOSA 4OWLA 1V6MA 4II0A 4XIOA 3OYWA 1AXYA 2XG3A 3S8KA 1ENRA 4Y22B 4AGRA 1CQ9A 4DRRA 4XFSA 4G9MA 3M3QA 1CPMA 3AP7A 4Y1VA 2Z49A 2H0BA 1CPNA 2AH2A 2ZACA 2DU0A 3BIWE 2FFVA 3ZC8A 2DVDA 4OEEA 4I6IA 1C4RA 1YBIA 1KJRA 3AH2A 1JYIA 1CONA 1SR4A 3ZXDA 9ILBA 1GZWB 3AYDA 1WBCA 2P3JA 1S1AA 5GLTA 3IKWA 5JOWA 3ZXLA 2HWMA 2ZGTA 1V6UA 2G4IA 5DUUA 3CA0A 4UW3A 4YZ5A 1FAYA 3A4UA 4SLIA 1SBFA 5B2HA 3AKGA 3WDYA 3WG1A 1W6MA 4OUJA 3UD7A 1NZKA 3ZSJA 4I8MA 1T4QA 1R1ZA 3AZWA 4QKSA 5FNWA 1HKDA 2NM1A 2E7TA 3AK0A 1DZCA 2ENRA 3D5OA 2CWSA 1B09A 2K43A 2C9AA 4Y22A 4Q26A 4P6AA 4ZLBB 4BLJA 3QCWA 4F83A 3LLPA 1W6QB 2NVHA 2D20A 3N7MA 1HWPB 5EHAA 4X37A 1ISZA 4GALA 3A22A 3BRGC 4DCKC 1AX0A 1JT7A 2NZ9A 1S0FA 4XJUA 3O4BA 1N47A 4LO7B 5IK5A 5BXTA 3VSZA 1W6NA 1TWEA 3QLQA 4A7KA 1IHKA 3BAGA 2A5ZA 3T1LA 1JLYA 1GKBA 4OWKA 1V6IA 1CE7B 3UDAA 4U36A 5JLVA 1LGNA 4M3CE 1N1SA 1II4A 5DSSB 1CESA 4QC4A 2FFUA 3PUBA 2Y9FA 1CIWA 4LO3A 3ZYPA 4Q27A 3N35A 5HPZA 3D4KA 1AF9A 2DV9A 3T2TA 1IS3A 1ISVA 2DRYA 1LOCA 4YW3A 1PC8B 2EXHA 5IK4A 1YO8A 1BYHA 3VKOA 3Q7WA 2VSAA 4D0ZA 1LOBA 1QGLA 2NMNA 4YW1A 2PHFA 4FOVA 4KEKA 3AP5A 4A7ZA 4HANA 3INAA 1V6XA 3NBEA 1G9BA 4XTPA 4D8HA 1WUVA 1AVUA 3VT1A 3RMYA 3KQRA 2ZQOA 3PHZA 1PUUB 4QD2C 1GNZA 3ZYRA 1K5VA 3ILNA 5T52A 5BVPI 1S0BA 1YXWA 4X39A 1IRPA 4Q8LA 2UWAA 1RG8A 3POYA 4P9YA 3SISA 2VW2A 4DEPA 2YROA 3CNAA 4JKXB 3WMVA 1G9CA 4JC1A 3H6RB 3ZXEA 1Z78A 4FP3A 2ARXA 2AQZA 1C57A 5IT6A 2D7IA 2D1ZA 2WKKA 4DQAA 5T5OA 4R9DA 1IOBA 1N1VA 4GP3A 3P53A 4FOYA 4M01A 1DGLA 2VU9A 4BM8A 3BX1C 5CAZA 1EVTA 2W08A 3NBNA 3WLUA 2LIEA 41BIA 4FGFA 5BYNA 3H6SE 3AP4A 1JQZA 2ESUA 1EYLA 3BODA 4L4IA 4OEFA 3HSMA 4BMEA 4TLPA 5FRAA 1YF8B 5EYXA 1KNMA 2D6PA 1ENSA 1GICA 3C2UA 2ZGOA 3POWA 2W68A 1T9FA 2WSVA 3AP6A 1G7YA 1XHBA 2OUHA 3M3CA 4WVVA 3IN9A 2D3PA 1R8NA 1DLLA 1TTUA 1LHVA 2JE7A 4Q2FA 5IK8A 1UZYA 1QXMA 1PUMB 1ABRB 3ZXJA 1BA7A 2UURA 3B3QE 4FPYA 5JMCA 3IPVB 1WD4A 1SR4C 2D22A 3FUOA 4IZEA 2CNAA 1JLXA 1TWMA 4WBCA 4XMAA 1CN1A 1LU1A 1AFCA 4FOWA 4I4VA 2R49A 1Q8VA 1AXMA 1Z0HA 4I96A 3SH4A 2RSTA 5DZUA 2WT0A 3IM7A 1SBDA 1UL9A 1OQ1A 3GNEA 1WW6A 1BFBA 1FYUA 3V0BA 4AN7B 3AJ6A 3OY8B 1S0GA 1N3QA 3N3HA 3ILRA 1ULGA 2NP0A 2WSUA 4C1WA 2GMEA 5CBLA 1FN0A 3M3EA 3FJJA 3AXDA 4G6JA 2P37A 3O5WB 5JOYA 4P14A 4YZ1A 2E51A 1Y7BA 3D6EA 1UZZA 1HCEA 3WUDA 1KDMA 3FJDA 1UAIA 4FPCA 2AGSA 2PHWA 1CVNA 2J3PA 3WO4A 4R9CA 1FMMS 1S0DA 4XBQA 6I1BA 2ZQNA 2E6VA 2D3RA 3CAHA 1F31A 3AYCA 1Q1UA 5BQUA 2IWTB 4HL0A 4M3CF 1ONKB 3CRHA 1SLIA 1FGAA 1N3OA 4Y1ZA 5EYYA 4BOWA 3B01A 4XTMA 4I37A 4GWNA 2SBAA 3VT0A 1LOAA 3PJQA 3I8TA 3HN1A 1SLLA 2MIBA 1JT3A 2XOAA 2Q5TA 3WG3A 3UJ0A 3VKFC 5FNXA 5EG6C 4YG3A 4J2XA 1CJPA 2AENA 3OY8A 3BA5A 4LO3C 1ZM1A 3WNXA 1LHWA 3F62B 2X2SA 1JXNA 1QQKA 2VUAA 4XILA 1FWUA 1HKNA 3IMNA 5E24E 1AVAC 2UU8A 1IOAA 4XE9A 2Y9XE 3AH4A 2WT2A 4AGGA 2X2TA 4ATEA 2D6MA 1DZDA 1LENA 4YZ4A 4CTEA 4LO7C 1GGPB 3R4UA 2YMZA 4XHBA 4DS0A 4Y24A 5GZCA 4ASMB 3B69A 4YFZA 4Z9WB 3BB2A 3A0KA 1BQPA 4I0YA 1DQ6A 4I30A 3WDVA 5JDBA 3UJ4A 1ISYA 1MC9A 2GN7A 1WD3A 2ZGLA 1SFYA 4YW4A 3VEQA 1MACA 3WDWA 4K20A 3V64A 3O0VA 4Z8BA 2MLLB 1Q56A 3VV1A 1V6KA 4YM1A 3NBDA 2KKIA 1OKQA 3AFKA 4G1RA 1GYKA 1W6PA 4HJJA 2DTWA 1AZDA 2A6ZA 3ATGA 1K5UA 3MPPG 3N7LA 1UPSA 5T54A 1JYCA 3O4OA 3ZPYA 4XXPA 1IRAX 3R4SA 3AYEA 1XG6A 2TEPA 3CRIA 4D69A 4ISRA 2AAIB 4YM2A 4YGDA 3O4DA 4L8QA 4YW2A 3B00A 5GZDA 1Q8QA 1RINA 3HR9A 3PVNA 1KRIA 5DUWA 4YM3A 5BP5A 1RIRA 1Q03A 2D24A 1LCLA 2DURA 2Q3NB 3NJ5A 2K8RA 1WW5A 3BRDA 3TB0A 1MS3A 3NV1A 3W59A 3SH3A 5BOWA 1QOOA 4GAIA 1DQGA 1Z4SA 2ZABA 3KM5A 4H04A 4P0LA 4J2KA 1G9DA 5F8SA 2JD4A 5FREA 3SNVA 3AZZA 1CVSA 4EKXB 3RS6A 5GM0A 1NUNA 3USUA 4HR6C 1DFQA 3BAUA 4W65A 4ITCA 3N0KA 5DG1A 4ZBVB 3FJKA 1HWOB 4K1YA 1RZOB 4WVWA 1GZ9A 1JTCA 3N36A 5HCFA 3AKIA 1APNA 3IAGC 1IT0A 2SLIA 4LBOA 4I4RA 2R16A 5T50A 1LHOA 1ITBA 2MC2A 2YV8A 1FX5A 1LHUA 4YGEA 2AFGA 5T5PA 3RTJB 3A23A 2OUJA 3FBYA 1GZWA 2A6XA 1S0IA 5FZZA 1A78A 5JOZA 1AJKA 2AXMA 2DVFA 31BIA 3WINC 1DIWA 2CTVA 1JUIA 4PCRA 4I4OA 3BOPA 5BQUC 4XMIA 2RHPA 4I1EA 1SLBA 4AYUA 4Q91A 4AGVA 3W9TA 4XXAA 1ENQA 3ZVXA 3OJMA 4I7IA 1M16A 3O12A 1JT5A 3N7JA 1IJTA 3CA6A 4J2YA 1F5FA 3WHTA 3B9UA 3WO2A 1DFCA 1MVEA 4GOYA 4XZPA 1ULDA 2DYCA 2R9KB 3U4XA 3UD9A 5GJ6A 2DUPA 4KEJA 1O4YA 2QYIB 2A6VA 1W6QA 4P0KA 3ENRA 3UD8A 5L73A 3M3OA 2FO1A 4PBOA 2LTNA 3SITA 3L2YA 2ZKNA 3M2MA 4FQ4A 2FDBM 3ZSMA 1DQOA 1VAVA 1DJSB 5I1BA 2GALA 1HCDA 1L2HA 1LJ7A 2A3YA 4CRQA 3AJ5A 4H55A 4LO2C 4QBVA 4M3CB 2NYYA 3PVOA 3RTIB 5EWSA 2ET2A 3BTAA 1HIBA 2BEBA 3AH1A 2AYHA 3CQAA 4DENA 3QYDA 4XJWA 5GALA 5E89A 1P63A 4OWJA 3AJYA 1U0AA 4Q1PA 3TC2A 2A3WA 3BAVA 1DHKB 4C1XA 3R05A 2HWAA 4R9AA 2ZGRA 5GLZA 1S0JA 1GNHA 2WLQA 1LGCA 2PELA 4UW5A 4BQ1A 1X50A 2EF6A 1Q8PA 3ZXKA 4ATFA 2W39A 3JUTA 3RSJA 4U2AA 4J23B 4Q1RA 1WBAA 2LALA 2B7YA 1ULCA 3CA3A 4YLZA 1GLHA 4GP0A 1MZ6A 2I1BA 5SV8A 2D23A 3IIRA 3NV4A 3FJIA 3FJ9A 2GZBA 1MVQA 3PMEA 1W3AA 2D6NA 3UJOA 3C9ZA 4M3CA 4JP0A 1JOJA 2KH2A 1ISWA 1BJQA 1ILR1 1I1BA 2E7QA 5BP5C 3ZXGA 2GN3A 1LOEA 4L4HA 2VXTI 2ZZJA 4PBPA 3NV3A 2A6WA 1ONAA 5GLUA 3MW2A 1G8WA 4LBMA 1AXKA 2VSEA 3WCSA 8I1BA 3H6RA 4I4QA 3FFZA 3LSEA 4UW6A 1YYNA 4IQPA 1NLSA 4XOGA 1MS8A 1DYPA 2VXRA 1BLDA 1YTOA 4LO8B 1DYKA 1YRZA 3FUQA 2P23A 1FATA 4YGBA 4USOA 4Y20B 3CA4A 3MALA 4P0JA 5F5QA 5CNAA 1EV2A 4I4YA 3O0XA 3POKA 1FWVA 4ZGRB 2P3IA 4JCKA 1MS9A 1PZ8A 1MR5A 3WA1A 2BEAA 1A8DA 1WLCA 1VCLA 1AX2A 1LODA 3D7WB 3APBA 2GMMA 5JVVA 1JBCA 2ES3A 4G9NA 4G6MA 2F8XC 2VW0A 1WBFA 1TEIA 4P9WA 1I1EA 1LESA 4D0TA 4NOTA 1GZCA 2D6OX 1G86A 1GSLA 4F34A 1C1LA 2YY1A 3BADA 2D7RA 1H30A 3WV6A 3IPVA 2DVAA 4OEGA 4H9WA 2FGFA 4EB2B 2ARBA 4JRAA 2A71A 1XQNA 3ILFA 7I1BA 4USPA 1HQLA 4DPNA 2UWCA 5DUYA 2YXSA 3WINA 3FGMA 2L5XA 4KC3A 1JW6A 2W52A 4JQ0A 2GNDA 4GOVA 2UWBA 2I2SA 3Q7YA 1MZ5A 1G82A 1UX6A 4JKQA 5H9RA 1SBEA 1MD6A 2VW1A 2KM2A 2Q9XA 2P3KA 4RL7A 3IM0A 4Q9GA 1CR7A 1HQWA 4IZXA 3O4AA 2D44A 4HA2A 3T1MA 4XBLA 2GNTA 1BKZA 1HDKA 4UW4A 2JKBA 4WZFA 3RRDA 1DZQA 1HWMB 3I4IA 1IILA 1TP0A 2ZHLA 5KXEA 3ZX7A 2ZBJA 3CA1A 4Y1YA 2VLCA 4TZDA 1ULEA 1Q04A 3OGFA 4YZ2A 1DQ4A 1LECA 1TOOA 2ZAAA 2CL2A 3AJZA 4R9BA 3WG2A 1DQ1A 4XYXA 4LO2A 4XKIA 1I3HA 3PG0A 1AJOA 3OJVA 3VKMA 1EPWA 3V0AB 4LO0C 1A3KA 3O44A 5GLVA 1LEDA 4ENDA 5BXRA 4K1ZA 2GDFA 4LO1A 4YM0A 1XYFA 3WCRA 4X38A 3OBTA 3LTQA 3A07A 4ZA3B 3OYWB 5H9PA 1BFCA 4OZXA 2WNEA 2ZGKA 1GV9A 4FPKA 3FJFA 3VKNA 2CWMA 2GMPA 2Y9GA 1UMZA 4JAWA 4XFUA 1OQLB 3JUUA 3FJEA 3VSFA 1FV2A 1MS4A 2D6KA 2ZHKA 3BAOA 4K21A 1RY7A 1SLAA 2FHRA 1PZZA 3OGGA 3BRFA 4Q8KA 2R0HA 1S0LA 5DZGA 4AN6A 1PZ7A 3V0AA 2KLLA 4FPHA 1W6MB 5DZFA 1J1TA 1V6OA 4QALA 5FZUA 4J2SA 5JOXA 5EC5A 1O4ZA 4QBCA 1BXHA 3TAYA 4I4SA 2Z48A 3RMXA 2CYFA 3LCPA 2PHRA 3RG0A 5BXSA 4M00A 5H9SA 1SCSA 4GAFA 1IS4A 2DTYA 1DQ2A 5DUXA 3IM5A 3H0OA 2DREA 1WLWA 2R1BA 3AZYA 1V6VA 5DZEA 4FPOB 4IY8A 3AX4A 1LULA 3WO3A 5DXDA 5HCAA 1LTEA 4ZFUB 2D43A 3WG4A 5D61A 4Z8SB 1TFMB 2YUGA 2OW4A 5G00A 2WQZC 3WDXA 2JECA 4LBLA 1IS6A 5DVHA 4AWDA 1W6NB 5KXCA 5GLWA 2LIQA 1AVBA 1G9AA 1AVWB 1J0SA 3Q7XA 1V6JA 2DUQA 2HZ9A 2BQPA 4KEIA 1H9PA 3WDUA 4Y1XA 1FMZA 21BIA 5GZFA 2R0FA 1BZWA 1WLDA 3GALA 5H9QA 4IY9A 1Z2VA 1WW4A 1BASA 1C1FA 3O3QA 5CB7A 2AREA 4YGCA 3KMVA 4YG6A 4JPZA 3B9CA 5KXDA 3BAQA 5F90A 1W0PA 4XJ9A 3JRRA 1F9KA 1AX1A 2ZGUA 4YZ3A 3UL2A 4I3NA 3HBWA 3DUIA 1HWNB 3UJQA 2E4MA 1SCRA 4ISQA 4XIKA 4IHZA 5DUVA 4MYEA 4ZKTB 1UKGA 2A70A 1G9FA 3OJ2A 5D63A 2GNBA 2XB6C 4FPGA 3S8JA 1N3PA 4GKXA 2FMDA 3MW3A 2CY6A 5EXOA 2EXJA 2P2KA 1JN2P 4TYSA 3OJBA 3WMUA 4Y26A 4XHXA 4BLIA 3ASIA 4PQ9A 3ZSLA 3ZSKA 2JJ6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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