3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
1V6VA 2NMOA 4UW3A 1HKNA 5D62A 4P0KA 1KNMA 4GOVA 5G00A 5F5QA 3IPVB 2P3KA 4PBOA 5BXTA 2NTDA 2Q5TA 4I3NA 1R8OA 4EFRA 3W58A 1MR5A 3WG3A 5IUQA 4OUJA 1GZWA 3PG0A 2D6OX 1BASA 1LOCA 1LOFC 5GZGA 2AUYA 4FPGA 1CPMA 1ENRA 5DZGA 1I3HA 4Z8SB 2DVAA 5E89A 2KH2A 2VW0A 3APBA 3N7LA 3IAGC 3KM5A 5GLVA 4XILA 1HKDA 3N0KA 3AYEA 4I4VA 2MIBA 4KBBA 3WV6A 1DQ6A 3VKLA 3IN9A 1IT0A 3W59A 4JKQA 4LO8B 1AXMA 5H9SA 4DRRA 1WD4A 2ZGRA 4CTEA 1KDKA 3ZXDA 5GLZA 2BQPA 4OZXA 1JY0A 2ZGKA 2VU9A 1MVQA 4FOQA 1ULCA 3AP5A 2VXTI 1A78A 5GJ6A 4I1BA 3V65A 2DVBA 1CVSA 3QLQA 3AJZA 4I4OA 1DBNA 1Q1UA 2KI4A 3IMNA 4FP3A 4P14A 1LHWA 3LCPA 4Y20B 2A6WA 4J2KA 3WDYA 4XBNA 3WNXA 4IZEA 1GLHA 4IHZA 1UKGA 3WG4A 1CQ9A 4YW1A 2PHRA 3VKNA 1M2TB 2SLIA 1W6MA 3PVEA 2DRYA 2ZA9A 4GKXA 4OW4A 3I2XA 3O12A 4YGBA 2LIQA 2E6VA 1QF3A 2K8RA 4PQ9A 2A6ZA 1DGLA 4BLIA 2KI6B 3BADA 4BMBA 1LODA 4Y1YA 1S0BA 4LO0A 3Q7XA 3BAHA 1JXNA 4YLZA 4WV8A 3M2MA 2AH2A 1XYFA 2ZGLA 2E4MC 4IZXA 3WDTA 1EYLA 1DQ4A 3INAA 5DSSB 3WG1A 3ZSMA 41BIA 2LALA 3MW2A 4GAFA 5F8YA 5DG2A 3BA5A 2VSEA 3GNEA 5IK5A 2GO2A 1D2SA 2E53A 4OWKA 1AX2A 1N1SA 1AXKA 1Z2VA 1FV3A 3UJQA 1V6KA 2W08A 3WINA 1HWMB 3WO4A 1RMLA 1QNYA 1JT4A 4ATFA 4FQZA 3QYDA 1H9WA 2OW4A 1IJTA 4XBLA 3MW3A 1LULA 1DQ1A 3VWCA 1N1YA 1V6JA 3NJ5A 2DVGA 1UN1A 4GWMA 4LBLA 1TOOA 2DWRA 4I96A 1FWVA 3T8SA 3LLPA 2MLLB 1DYKA 1SR4C 4DPNA 3NBEA 3ZXLA 1N3QA 3ZXEA 4LO3C 3CRHA 2HYKA 5BXRA 3BODA 2ZGNA 1H30A 1LGBA 1C4RA 3WCRA 3H6RB 2JDZA 2AXMA 4FPHA 4AVVA 1YIFA 1C57A 1V6LA 4P9XA 3SH5A 2D3PA 3SNVA 1QDOA 3SH3A 4YW4A 2VLCA 3V0AB 4LBMA 4DQAA 1IILA 1G9CA 4U2AA 1ONKB 4QBCA 2Q3NB 5EWSA 1AFCA 1LEMA 2WT0A 1AX1A 1NZKA 2FFUA 3C2UA 2ZMLA 4G1RA 4AWDA 1Z0HA 3FJJA 1S0FA 4Y22A 4DS0A 5E8AA 1LESA 3ILFA 1A8DA 4H55A 3ATGA 4M3CB 3MW4A 5T54A 1K5VA 1YI7A 1LGCA 4I30A 3JU9A 5GM0A 3FLRA 1W3FA 3HOMA 5T55A 3O4BA 3PUBA 3S8KA 3N3HA 1JYIA 2UURA 4D0ZA 3BRGC 5AVAA 1VAMA 5GLWA 5KXCA 4L4HA 2VSAA 4QO3A 1JT7A 2V5YA 4L4IA 3A4UA 1IHKA 8I1BA 1RITA 5HPZA 3O44A 3RS6A 3F1RA 4YM1A 4GA9A 4R9DA 3TB0A 4GP3A 3CRGA 4J2SA 3BAVA 2M49A 2D6MA 3OYWA 4FOYA 4XIOA 4X3AA 3N7KA 4WZFA 4IY8A 1QOOA 1N1VA 2X2SA 2C9AA 1W6OA 1EV2A 4AGRA 3SLIA 1UZYA 1G8WA 2JKBA 1LEDA 2KKIA 1ENSA 5DVHA 1BLAA 5FNXA 3ILAA 5DUVA 4EFPA 1I1BA 1C1LA 4FPEA 3OJ2A 4LBJA 1MS9A 4A7YA 4ZBVB 1II4A 2CWSA 1Q8QA 1V6NA 1WBAA 4OEEA 4FPKA 3RG0A 1S0LA 2DUPA 1MZ6A 1ISYA 1W6QA 1ISVA 3L2YA 5JDBA 5CA6A 4I4XA 4F83A 1QOSA 2EXIA 1LCLA 3IIRA 3OBRA 4XXAA 3NV1A 2CNAA 4XBQA 4FPJA 5IT6A 3CRIA 2LIEA 1PZ7A 1FV2A 2F2FC 4YM3A 1W3AA 3A0KA 2HWMA 3E8LC 1TIEA 3P6IA 1LHNA 2RHPA 3Q7WA 2R0FA 2W39A 3AXDA 4IONA 3ZVXA 1RINA 4Q1RA 3M3CA 1CPNA 5IK4A 2DU1A 3PVOA 1IKPA 4GALA 2VH9A 1AF9A 3K1XA 1WLCA 4Y24A 4YZ2A 1MS3A 4K20A 4Q9GA 4I7IA 1QDCA 3AKHA 4NO4A 3WOGA 2JE7A 3CQAA 1DIWA 2ARBA 4EB2B 4I4YA 4WVWA 2WRYA 2UWAA 3BAQA 4I4SA 4QC4A 1LHUA 5DZUA 4DENA 5HCAA 2D1ZA 3WUCA 1WBFA 4X37A 3BAOA 2YY1A 4AGVA 2D7RA 5DUXA 3M3OA 3O4CA 1BXHA 2W52A 3OBTA 1AX0A 2FDBM 2Y9FA 3HR9A 1W0OA 1UMZA 3VT1A 3POSA 3N36A 3WHTA 4X39A 1DFQA 5BVPI 1URXA 1IKQA 1WLDA 4DFSA 1TEIA 1G82A 1N3OA 2CWMA 3CA5A 4HJJA 2P23A 1DQ0A 4ZKTB 1ABRB 3WLUA 2GDFA 3AJ6A 4CJMA 3I4IA 1YXWA 1V6IA 1DQOA 3PHZA 1JT3A 2GMEA 4JP0A 3ZSKA 5GALA 3VKOA 5BP5C 3O49A 4PCRA 3WG2A 1DLLA 3WO2A 3UJOA 1FGAA 4Y1UA 5D61A 3ILRA 1G9FA 3DUIA 3R05A 4JC1A 3AYDA 4XJ9A 5T5OA 1R8NA 5BQUC 1T4QA 3FJDA 2DUQA 4I4PA 1CJPA 1LHVA 5DUWA 2EXHA 2D43A 1IRAX 4Z9WB 2VW1A 3RTIB 3QCWA 4IYBA 2NYYA 1LGNA 4Y1VA 2ES3A 4CZSA 4IQPA 4I8MA 1WUVA 3UDAA 5GZFA 4JPZA 3D5OA 4JKXB 3AJYA 4XTPA 4F34A 3IM7A 3UK9A 3P53A 2DVDA 1IRPA 4I37A 2GNMA 4H04A 1QXMA 1CVNA 3IM6A 1LOAA 2D7FA 3PVNA 4C1WA 2WT2A 5T5LA 1Q04A 1C1FA 4ATEA 4LO1C 2AREA 3OGFA 3FBYA 4XIKA 4XHBA 1OQLB 3POKA 3ZX7A 3FLTA 3AZZA 2ERMA 4Y20A 4RA0A 2YROA 3MALA 5GZCA 2Z42A 1H9PA 3AZWA 3VV1A 1RY7A 1AVUA 3AXEA 3VT0A 1FX5A 2DURA 1TWMA 1KJRA 1MD6A 4Q2FA 4XZPA 1M16A 2RSTA 5T5PA 3FJIA 5CBLA 2Y9GA 1S0JA 3VKMA 1CN1A 4ISRA 3OJVA 4ASMB 4CRQA 2YMZA 5CB7A 2VUAA 1BYHA 2AQZA 1BKZA 3HALA 1UPSA 3NV4A 1AZDA 2ZMKA 1NLSA 1ITBA 1SLAA 5F8WA 4FPLA 3PMEA 5FRAA 2FHRA 2ZACA 5DZFA 4PBPA 3W9TA 4LBNA 1MS8A 3VUOA 1W6NA 2LTNA 2CYFA 2DREA 3SH4A 4I4UA 3OY8B 4L8QA 5HCFA 1XQNA 1WW6A 3AH4A 1F5FA 3SITA 1AVAC 3ZSLA 3B3QE 2JD4A 3LSEA 4Y26A 3WUDA 3FUQA 4BM8A 1ISXA 1L2HA 4LBQA 2P37A 3HMYA 2NM1A 2CY6A 2WLQA 1DQGA 2I1BA 5IK8A 3T1MA 4XOGA 2UWBA 1IS6A 3B9CA 4IY9A 2ZHMA 4QALA 3FUOA 3BAUA 1SBEA 3AZVA 3FJKA 1SLBA 4XTMA 3AKIA 3H6RA 1LU1A 3UJ4A 5FREA 4YFZA 4Q8KA 2A7AA 4U36A 4XFTA 4XMAA 7I1BA 3H6QA 4WBCA 3A23A 1CIWA 1ZA4A 5EHAA 1SR4A 1PZ8A 4QD2C 2Q9XA 5EC5A 2ZGTA 3Q7YA 1S0CA 3FGMA 3HSMA 1V00A 1YTOA 3WINC 1YO8A 4A7KA 1ULEA 2UUSA 1KQRA 1VIWB 4XJZA 1IS5A 2ZGPA 1BFCA 2ZHLA 1P63A 2ZGMA 2WQZC 3OJBA 4XXPA 3ZXKA 4M3CA 2D44A 4LO2A 4QD2B 1RIRA 4P6AA 1GICA 3B69A 1GKBA 5KXDA 1E0OA 2CTVA 4I2SA 1AJKA 1I1EA 2VXRA 4YZ1A 1SLIA 2ENRA 2A6VA 1DFCA 3MPPG 3WDWA 2PHUA 1PWAA 4FOVA 5HCBA 4KC3A 4M00A 4XJAA 3CA0A 3ZXFA 1WBLA 2Z49A 5JLVA 2DYCA 1TFMB 4HR6C 1LOEA 1ILR1 1AVBA 1MACA 3A0NA 1AXYA 3NWKA 1QGLA 1HQWA 2JE9A 4PC4A 1N3PA 3KMVA 1J1TA 4JAWA 3C9ZA 2P3JA 4KEJA 5DZEA 9ILBA 4GAIA 4ZGRB 5IK7A 3VT2A 5JMCA 1MC9A 5L73A 1R1ZA 1MS4A 1IOBA 2K43A 4YW3A 5H9PA 1B09A 2E7TA 2ZMNA 4YW2A 3TC2A 1N1TA 4AYUA 3AK0A 4W65A 1AXZA 3AJ5A 2MC2A 1W3GA 5BXSA 2EALA 3CA4A 2ZQNA 3RRDA 1SZ6B 5F9TA 4KEKA 2XB6C 5JOWA 4YFWA 2KM2A 4Y1ZA 1JLXA 1LJ7A 1G9BA 4FQ4A 4YGEA 1DHKB 4JRAA 3BX1C 3AH1A 4QKSA 4G6MA 1V6OA 1HDKA 1DZDA 1CESA 1KDMA 1PC8B 1UAIA 3USUB 2YV8A 3AZYA 1QOTA 3P6JA 3AP7A 1YBIA 3BAGA 3ASIA 3I8TA 5FZUA 4USPA 1BQPA 3O3QA 3QR5A 4Q91A 3PJQA 1ISWA 5F90A 2NZ9A 2VW2A 1GSLA 2R1BA 4YM2A 1LHOA 1HQLA 1PZZA 2ZKNA 2D6NA 1KJLA 3IM0A 1IS4A 3R4SA 2R16A 5EYXA 3WZ1A 1GGPB 3OYWB 4D69A 4M01A 2DTWA 2F2FA 5SV8A 4LO7C 1OKQA 2NP0A 3AYCA 2DU0A 4Q26A 1ULFA 1BFFA 4FPFA 3FJHA 3KQRA 1FQ9A 4KEIA 2D3RA 2E51A 4XFSA 4M3CE 1GBGA 1KITA 4I4RA 4LBOA 2WJSA 2ZZJA 4BQ1A 4LO7B 3V79C 2EXJA 2ERFA 1JLYA 3BB2A 3O4OA 4WVVA 4AVSA 1SLTA 4XFUA 3WDXA 3EF2A 1XZZA 1VCLA 2QN4A 2ZAAA 3NBNA 1JOJA 1JQZA 4G9NA 1HCDA 3NV3A 1QQLA 2B7YA 2Y9XE 3F62B 5LK5A 2ZGUA 4H9WA 2A5ZA 4Z8BA 3UD8A 3POYA 3O5WB 2AAIB 1SBFA 4FGFA 4GKYA 5EYYA 1W6PB 2OUHA 1OQ1A 1NUNA 1CONA 1UZZA 4I6IA 2WBCA 2WSUA 1HIBA 4J2XA 3WHUA 4FVVA 4DEPA 4ZFWB 3ZSJA 2ZHNA 1N47A 3IPVA 5D63A 1SFYA 3AZXA 1G86A 2CL2A 4JCKA 2HW9A 1BLDA 3NBDA 4XHXA 2E7QA 5I1BA 2DVFA 1HWOB 4TYSA 2YZ4A 1Q8PA 4ZFUB 4UW4A 3R4UA 3FJAA 3N35A 3ZYPA 3LSDA 3BIWE 3V0BB 2Y9WC 4C1XA 4LBQD 4R9BA 3MEPA 3N7MA 4XJUA 2TEPA 3CA6A 1FYUA 3BA4A 4DCKC 3AFKA 3WVJA 31BIA 2FGFA 4P0JA 1LOFA 5CAZA 4USOA 5BOWA 4GOYA 1SLCA 2YXSA 4YM0A 4BLJA 1GV9A 4OEFA 4FOWA 4GXLA 1JT5A 2J3PA 1Z4SA 1Z78A 5KXBA 3RSJA 1FAYA 4J2YA 1ONAA 1ULGA 4XKIA 2WT1A 3O0WA 1A3KA 2ZR1B 3T2TA 4LO1A 2ZGSA 3RMYA 1GYKA 1GNHA 1DZCA 1V6MA 2I2SA 1AVWB 1T9FA 3RMXA 1SLLA 4YZ4A 4ZLBB 4QBVA 1TWEA 2FMDA 2ET2A 1X50A 5BYNA 3WCSA 5BXPA 4BMEA 2ZHKA 4ISQA 5JOZA 3M1HA 3ZPYA 1S1AA 1FWUA 4GP0A 4RL7A 2PHWA 1WBCA 4Y1XA 5E88A 1DQ2A 3V64A 1QKQA 4D0TA 1GZWB 4AGGA 3VKFC 1IS3A 3BA7A 2BFHA 3UJ0A 1QU0A 1GNZA 1CR7A 2YUGA 3H6SE 1FMMS 1V6XA 3FJBA 1O4YA 5B2HA 1G9DA 3OY8A 3LTQA 1ULDA 1S0IA 2XOAA 2FFVA 4FPYA 3WDUA 1EVTA 3AKFA 1BARA 3O4AA 2PHFA 1FN0A 2ZGOA 1VAVA 1WW4A 2DRZA 2ZABA 1WCSA 2V73A 2E4MA 4HA2A 3SISA 3HN1A 3DGTA 2D6LX 4OWJA 3OPZA 4AN6A 3U4XA 1HLCA 1WLWA 2FO1A 3OJMA 1Q8VA 1VLNA 1V6WA 1Q8OA 2P2KA 4EKXB 2H0BA 1EPWA 1Q56A 2R1DA 1ISZA 4X38A 3AP4A 2HWAA 3JUTA 5DXDA 2BEBA 3B9UA 3AYAA 1F31A 3A22A 4LBKA 2EXKA 1LOBA 1W6MB 2GMMA 4LO0C 1Y7BA 2AGSA 3IM5A 2GALA 1TP0A 4A7ZA 2UWCA 5GLTA 3D7WB 1JN2P 4OEGA 2K4AB 1JBCA 1AJOA 1W6NB 1MZ5A 3BTAA 3UL2A 2GMPA 3CNAA 1PUUB 4XDQA 2IHOA 4G6JA 4YOLA 3O5SA 2XG3A 1N4KA 4M3CF 3V0AA 1ZM1A 4ZOTA 4QKRA 5E24E 1JHNA 4P9YA 5FZZA 1MS1A 3A21A 4LO3A 1S0DA 4I0YA 1DYPA 3FJ9A 3TAYA 1O4ZA 1BJQA 2AR6A 4Q8LA 1BA7A 3VSZA 5DG1A 1TTUA 5EXOA 1RG8A 4FPCA 4LBQB 21BIA 5GZDA 2D6KA 2D24A 2C5DA 4K1ZA 4AN7B 4UW6A 3AP6A 4YZ5A 2P3IA 1FNZA 2JJ6A 4XYXA 1G7YA 2GN3A 2PHTA 3FJFA 4P0LA 1JUIA 4XMIA 3D4KA 2PELA 2W68A 1QQKA 3AP9A 3WMUA 4FP2A 1PUMB 4R6UB 2Z48A 2X2TA 5FNWA 4YGCA 5T5JA 1BFBA 3POWA 1F9KA 3ENRA 2GZBA 4LO2C 2UU8A 2G4IA 5CNAA 1OFSA 1LOGA 1SCRA 2DV9A 3CAHA 2A75A 5DUUA 2GN7A 3M3EA 4J23B 1YYNA 3BRDA 3NBCA 4HANA 2WSVA 4GWNA 2WNEA 1D0HA 2EIGA 5F8SA 4G9MA 2D22A 4Q9PA 4OWLA 3T1LA 2VY0A 2D3SA 3UD7A 5DUYA 1HWNB 1ENQA 4Q27A 1UX6A 4ZFYB 1FNYA 1LECA 2GNDA 1RZOB 3AKGA 5EG6C 3JUUA 3BRFA 3USUA 4YG6A 1K5UA 4K1YA 5T52A 4HL0A 4XJ8A 1BZWA 3SNMA 4NOTA 1UL9A 2A71A 4YG3A 1YRZA 4Y22B 3HBWA 4TLPA 2EAKA 2NMNA 1MVEA 4ITCA 2PHXA 2HZ9A 4UW5A 1HCEA 1S0GA 2RG9B 2DTYA 4PF5A 3JRRA 1Q03A 1WD3A 2A3WA 3ZXJA 3FJCA 4SLIA 1QNWA 5H9RA 2WKKA 5GZEA 3FLPA 2D23A 2QYIB 2L5XA 2A6XA 3B00A 1XHBA 1MS5A 1DJSB 2EF6A 1BFGA 2ZBJA 5T50A 1DZQA 4MYEA 2RQ9A 1LU2A 1WW7A 2ESUA 3CA1A 5KXEA 3ZC9A 3RQ0A 2AYHA 2A3YA 1G9AA 3AH2A 3O4DA 1QMJA 3AX4A 2P34A 1S0EA 3FFZA 1LENA 3IKWA 4II0A 1JYCA 2D6PA 4TZDA 3N7JA 1V6UA 4R9CA 5GAQA 1NXD1 4BPZA 1W6OB 4I1EA 2ARXA 5GLUA 5JOXA 3B01A 3ZC8A 5JVVA 1FMZA 3WA1A 1IOAA 2ZGQA 1SBDA 2D20A 4JQ0A 1XG6A 1SACA 3FJEA 2JECA 4EFQA 3Q9OA 2SBAA 3D6EA 2OUJA 4YGDA 4ZXKA 1WW5A 3O0XA 2R0HA 2NVHA 1W6PA 1W6QB 1GZCA 4R9AA 2OVUA 1GZ9A 4XJWA 6I1BA 4YZ3A 2NN8A 3WO3A 1J0SA 1LTEA 4EEEB 3GALA 4AVTA 1CE7B 4YW5A 3M3QA 4DRVA 1MS0A 1GANA 4D8HA 4I4QA 1SCSA 2P39A 3ZXGA 3ILNA 3VSFA 3WMVA 2GNTA 3H0OA 3V0BA 5H9QA 3I2AA 3OGGA 4XE9A 2A70A 2AFGA 2R9KB 1JTCA 2GNBA 3O0VA 4YG0A 5BP5A 3VEQA 1HWPB 2ZQOA 1AVXB 1VALA 3RTJB 2DS0A 2D7IA 1PZ9A 2F8XC 2KLLA 1KRIA 1U0AA 3WDVA 5FZYA 2A6YA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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