3R8RA

Transaldolase from bacillus subtilis
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
MLFFVDTANIDEIREANELGILAGVTTNPSLVAKEANVSFHDRLREITDVVKGSVSAEVISLKAEEMIEEGKELAKIAPNITVKIPMTSDGLKAVRALTDLGIKTNVTLIFNANQALLAARAGATYVSPFLGRLDDIGHNGLDLISEVKQIFDIHGLDTQIIAASIRHPQHVTEAALRGAHIGTMPLKVIHALTKHPLTDKGIEQFLADWNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase
publication title Conservation of structure and mechanism within the transaldolase enzyme family.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 75
structure length 212
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, P, R, T, U, V, W
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3r8rA00
2QCFA 3ABQA 3M7WA 4RCXA 3I68A 1KFEA 5IM51 1T96A 3PSWA 2A21A 4CQAA 2QCNA 1OFQA 5K9XA 2NZLA 1GT8A 2PRLA 8TIMA 4UMBA 3PULA 4E2DA 3IIVA 4RZ4A 3M44A 2Q8LA 3DFPA 3CEUA 4BWLA 4WXZA 3NDOA 4LVFA 1YTKA 3NG3A 3INPA 1ZAJA 5G2HA 2CLFA 1SQ7A 2QUVA 2NUYA 1TO3A 1JCJA 3BPWA 4QM1A 3PWAA 2P1FA 3GKFA 2G95A 4DO4A 3QPZA 4PC8A 3S42A 1MXSA 3BG9A 3GB6A 4LC6A 5FEWA 1TREA 2WSQA 1M7PA 1RQBA 3ZWSA 2H3DA 5I3FA 3LX9A 3C0JA 3W1UA 3UPWA 1H7RA 3F4NA 4UTLA 3NZ1A 2WNQA 1G4EA 4BFAA 5KSWA 3CPRA 3HG5A 3EWZA 4JY8A 4HKPA 2YZRA 3W76A 1ZALA 1QO5A 4WZHA 1LRQA 3STEA 3A23A 2EHHA 5K9DA 3NQCA 3TROA 3LTPA 3KAOA 3BG5A 3DZ1A 4ZZ9A 3S9YA 2ISWA 3L5MA 6ALDA 1TRIA 1DHPA 5TBOA 2CLMA 3WJWA 1XUZA 3DFQA 1H62A 4XKYA 1M5WA 5DY2A 5CKSA 4NJHA 3GZ3A 3QW3A 3NPXA 2QCHA 3S0CA 4DO6A 2CLEA 4I9AA 2WPBA 4O28A 3N34A 5HULA 3JR2A 3WK2A 3FEMA 1KBJA 4NZJA 3GXNA 1SO6A 4JTUA 2DU2A 4NNBA 3G0SA 3M47A 4AWSA 3TIMA 3LHTA 4FX8A 4IMGA 5DCDA 3P8JA 4AF0A 2FB3A 2V2HA 1I8JA 1P0NA 1G4PA 1U83A 3O6YX 3IEBA 2ZRZA 5AHNA 3UWUA 1TB3A 4AHQA 1BWLA 3TE9A 1XL9A 1VQTA 2RFGA 2ZYFA 3FYOA 3LHZA 4PL2A 1PHQA 1VS1A 2WV8A 1YYAA 4R33A 4HNUA 2ATMA 1XBYA 3GVGA 1TPC1 4HPXA 2QCDA 3LLDA 2ZRUA 4JTEA 5BMWA 1SO5A 1IXOA 5HQEA 3PBVA 2ZCGA 1E51A 3GKAA 2OT1A 2B4GA 5K4XA 1OYCA 2ATSA 2YDAA 1TV7A 2G5WA 1LYXA 2RDUA 5L9FA 4N4QA 4J9JA 2Y89A 1EP2A 2OT0A 1GVFA 4KFPA 1Z41A 3G0UA 4Z08A 2GJNA 1WOBA 4FXRA 5BMXA 3WJZA 4O14A 3IIPA 2DJXA 4AWUA 4C1LA 4UNLA 4RLIA 1F2JA 1KA9F 4MIMA 4O54A 3STFA 3A9IA 3ABSA 4MYAA 5DLCA 3VCRA 1JCYA 3ELFA 3KVLA 1YDNA 2CLLA 4Y8FA 3H53A 4JIQA 4JTJA 3MUXA 5EPDA 2DJLA 3DHFA 4R53A 2H8ZA 4MLRA 3G3MA 3IRDA 2R8WA 1VPXA 2J9YA 4LTSA 2CWNA 5H2ZA 2Y85A 1OABA 3NZRA 2QJIA 1AK5A 3B0VC 2ZTJA 3TJXA 4MJZA 3N19B 1ML1A 5FF2A 3TAKA 3P60A 1T0OA 5KTLA 3MBDA 5L6UA 2DORA 2QCCA 3V1PA 3P82A 3LHYA 3TKFA 1MZHA 2B7QA 4K39A 3PF3A 4W9TA 5G4EA 5FF7A 2A5HA 1SR9A 5AHLA 3LHVA 3PBWA 1C9DA 1DV7A 3Q2DA 4O11A 3DXIA 5D2WA 2QDGA 4EOUA 2VOMA 4UR7A 2OX1A 1EEPA 3R89A 3W3OA 3TMLA 3EWXA 5EMUA 3OEXA 1W5MA 3LI1A 1TPWA 2ZRXA 4LW7A 5DBTA 5CSRA 4KWVA 2DP3A 2QEZA 1OX5A 1TYGA 3GX9A 3DFOA 1OF6A 1B9BA 1YXYA 4Z0JA 4Z1BA 5C5YA 1AG1O 2V0TA 4O0KA 2PURA 1GOXA 3TUUA 1UB3A 4LU0A 1F6KA 3TFXA 2E6AA 4BK9A 2X30A 2ZZ3A 2CW6A 3LHUA 3NGJA 5E1QA 1JUKA 5DXXA 5CG7A 3PBUA 2C18A 1LBMA 2R91A 3B03A 4RK8A 1DJNA 4NJGA 3W7EA 3DGRA 1H1YA 3LRKA 3O1NA 4ONVA 1OFPA 2GUUA 2H8XA 1FDJA 4O50A 2ABBA 3SI9A 4IMDA 4I7VA 5D2VA 2HTMA 2V2DA 2NWRA 3UD6A 4ADUA 4JR5A 3NL3A 4OGZA 1J2WA 4FIRA 5FEPA 4EF9A 5LZLA 2HS6A 3DKLA 4QISA 4TU1A 4UCGA 2PRMA 3F03K 3PS7A 5D05A 2CLKA 3O63A 4M5PA 1QPQA 4RR4A 3L65A 1WBHA 3TW6A 1I4NA 3CEPA 4A29A 3W73A 4ALDA 4X22A 3L0GA 5J5RA 4XBKA 1WQ5A 1I2OA 1L9WA 1NVMA 2X1RA 3KHJA 5FI8A 2ZZ7A 1K7FA 5D09A 1X1OA 1IXNA 3TV8A 5HJLA 5I3GA 3HG4A 1IF2A 2YXGA 3N14A 3W7JA 3LCXA 4CNOA 3CT7A 4UFLA 2GQAA 3E96A 1GVRA 2HS8A 3NPWA 1VRDA 1K8XA 4LS2A 5G4WA 2XN0A 4HSOA 4KWWA 4HNVA 4WY0B 4MZYA 1GVQA 2WSRA 4PCFA 1QR7A 2VEMA 4LVDA 5EL1A 2TRSA 5F4WA 1W3TA 2GPTA 3QW4B 4AAJA 1G4SA 1W37A 3W1RA 1GZGA 3W1QA 1EX5A 3HGJA 3M5XA 4N9BA 3NQ7A 4RXGA 4AWTA 3HO8A 3SY5A 1NSJA 1EWEA 3HPZA 2DZTA 1KM1A 1FWRA 1AW2A 2ZA3A 3E49A 4EVZA 1HUVA 4LY8A 3F1QA 1KFLA 1RQHA 2GVJA 3G8RA 4QIUA 4S2BA 3BW2A 2E5CA 3PVFA 2ISSA 4FNSA 1FCVA 1QPNA 1EA0A 2Y88A 3TCEA 3C2VA 2ZTKA 1S5WA 3GLCA 5G1TA 3RMJA 3TSMA 1I2QA 2CFFA 4UTJA 1H7OA 3NQEA 2ZBTA 3SSJA 1SZFA 3N2MA 3JRKA 2A7PA 1V7YA 4G1KA 1PCKA 3G8EA 3C52A 3NOEA 5D37A 4ZL1A 1ZENA 3A24A 3C56A 3M5VA 5CZJA 4ZQPA 1KFBA 2EAWA 1KBIA 4Q33A 3W85A 3LCWA 1VJIA 4AVFA 4LWWA 3CTLA 4H6KA 4WJEA 3B06A 1B4KA 5F2MA 3U8GA 1S5VA 2RDWA 4MJMA 4JTHA 4N4PA 4AHPA 3TAOA 2Y70A 4MY1A 2G97A 3VFLA 3LCLA 1FXQA 1WYIA 1YTDA 3HOJA 2QJGA 2W0UA 3P62A 3QZEA 4N6EA 1Q6LA 3CU2A 1HTIA 1W5NA 3FYPA 4Z1DA 4DQWA 1WXJA 3NXFA 1FDYA 3KRUA 1W1ZA 5C54A 3MP3A 1W31A 1XKYA 4FNUA 2CZEA 3R8RA 3BVJA 3ABOA 3L5LA 5D2YA 4UTKA 1F74A 3G3DA 1KLYA 2CLOA 3GDTA 3G1AA 5FEXA 1JUBA 4JTKA 3QC3A 1G6CA 1ALDA 2J9ZA 4GUGA 4NXKA 4FX6M 1DKWA 2CZFA 3LI0A 4O13A 4CQ9A 4Z1AA 1F76A 2C6QA 3QEZA 3W7KA 1W8SA 4PL1A 3WJXA 1LP6A 4LS1A 2E77A 1XCFA 1C29A 2Y6ZA 2YYTA 4O16A 3GK0A 3VE9A 3P7YA 3W7OA 3W7LA 4Y90A 4I7WA 2E68A 3WK1A 3W1MA 1OK6A 3EX6A 3H54A 1X7FA 4JTTA 1OFAA 4O1CA 1H63A 3H55A 4WQ6A 3W88A 3A5FA 4E38A 3VI2A 1QOQA 1JVNA 2FFCA 3QM3A 2ABAA 5I3KA 5LNUA 3OVQA 1VGAA 3PUOA 4XZ9A 3S5ZA 1M6JA 3TNOA 3S1VA 5DXYA 5KMYA 1K02A 1OX4B 4XKYB 4FX7A 2FPYA 1PCWA 2VXNA 2QDHA 4WX2A 5C2XA 2A2IA 3GDRA 1GYNA 1QFEA 3TSBA 3ABRA 3E0IA 1RQEA 3DENA 4FEZA 4UTWC 4UFHA 2QCMA 3MP4A 1FBAA 2B0MA 3TQ0A 4LC8A 4JTSA 3GAYA 1TV8A 4N9DA 1C8VA 1YPIA 3OVPA 2C0AA 4UC5A 3T7VA 4AF0B 3LOTA 5AHIA 3S8HA 3W23A 1GTHA 3P67A 2ZQ0A 2RKXA 2QAPA 4HT3A 4LOCA 3DFSA 3FKRA 4DBEA 4K8HA 5HWMA 1THFD 3TDFA 4TMBA 1DOSA 3ANYA 3S5YA 5AHFA 1WDWA 4JYEA 4M7SA 4PFMA 5CPOA 5CSSA 3L66A 4LVGA 2H3BA 4IOTA 2YPIA 3S1XA 4O1DA 4OQVA 3ZS4A 3W86A 5AHMA 3EWBX 2ZDRA 2Z0IA 5A8GA 4JX5A 4KFOA 3UWZA 4GUIA 3P80A 1FUYA 5AYYA 1UBSA 2TPSA 1H7NA 1YDOA 4FB7A 1MSSA 1AL8A 1DJQA 2EPHA 3C2RA 4CLMA 1O95A 2FDSA 4OBTA 4UTTC 5G5IA 1QMLA 3LCHA 2C3ZA 3RNDA 2A4AA 4MPQA 1Z44A 3T78A 1TJRA 3JS3A 4CCDA 2NWSA 1EP1A 1I45A 1SW3A 2YW3A 3UNDA 3Q94A 5BRBA 3EWUA 3W2UA 3HB9A 1ONRA 2QJHA 3G1FA 4WD0A 1SU5A 2J27A 2ZZ1A 4UIOA 3NQ2A 5I3IA 1XC4A 3GYEA 3IIZA 3LBMA 5F2GA 1HO4A 1XDLA 2PCQA 2WJZA 4A22A 4ZQOA 3SFKA 2DZXA 4MY9A 4UXDA 3MHFA 5KZMA 1ZAHA 5F2IA 1SW0A 2VKZG 4NQ1A 5H91A 3GDLA 4RJEA 1A50A 2VEKA 1KFCA 1LROA 3NL6A 4XQ6A 4DF2A 4BR1A 3ZWTA 3HQ1A 3LRMA 3NEVA 5HWNA 3BLFA 2GQ8A 4K7YA 1LLZA 5HUPA 3RU6A 1JR1A 1KV5A 1W54A 4RX0A 5D02A 4Q32A 3TJLA 4UUIA 4IX0A 1SZGA 4RV8A 4M6QA 4E2BA 3GNNA 1FQ0A 3HJZA 1FWTA 4FF7A 2V30A 3BLIA 3G1SA 1FWSA 4MZ8A 1Z48A 1ICQA 4MVAA 1B57A 3RLUA 2AAMA 3LXCA 1SUXA 3P5YA 1K03A 4K7VA 1KM6A 4UTUA 3W2JA 1YLVA 1KTNA 3PSVA 1I2NA 2NUWA 1R46A 5K4ZA 4R7JA 4UFIA 4JX4A 2AQWA 3M1ZA 7TIMA 4CCCA 2Z6IA 2WNZA 1J5TA 2J88A 1MEWA 4M6VA 4FXSA 2DZSA 3LM7A 1YADA 5AC8A 1OHLA 1VH7A 1AL7A 4A2SA 5CZTA 1HL2A 1P1XA 4O52A 1JQVA 3GDKA 3DKJA 3KFTA 3LTSA 2FQIA 1TRDA 2C1HA 3S5OA 2VENA 5E93A 5HUOA 3G1XA 6TIMA 2Y62A 3HMJG 5MHBA 1XM3A 3S1WA 3B0UX 1OFOA 5LNWA 4TIMA 1OJXA 1W3NA 4OV4A 1N7KA 4FNRA 4JXCA 1GJPA 3DFTA 1XI3A 1RPXA 1NF0A 1LOSA 1KFKA 3NL5A 3PG8A 4C1KA 3P84A 4ZMGA 2C13A 3TSDA 1ADOA 4UFMA 3BGGA 4NX5A 3QMSA 4O1AA 5K7JA 4LVBA 1I2PA 1VCVA 3LBCA 4CCEA 1G67A 4IPIA 4K6AA 3EX4A 1SO4A 1ME7A 4S1FA 1JCXA 2WO5A 1FDZA 3LLFA 3MI6A 1H50A 2F84A 2ZZ4A 1F05A 1BTMA 1VLWA 3WFAA 2A6NA 2WNNA 3A5VA 3N3MA 4Z1CA 5HMSA 3C2OA 1FY6A 1EPXA 3EB2A 4K37A 4O12A 5D30A 4AMAA 3MI3A 4TO8A 3LV6A 2E6FA 3U2OA 1Q6QA 2ZFAA 2Q3RA 1VC4A 1X1ZA 3SGUA 3N9SA 3S5NA 2EF9A 3U6WA 4DO5A 5ABTA 1Y0EA 1JCNA 2I1OA 3NQ6A 1FCUA 3S6DA 2WKJA 2V9DA 4WXYA 3NPUA 5I3HA 1TPEA 5BW6A 1LLWA 5IBXC 1VR6A 1TPB1 4NNCA 1YTEA 4HSNA 5FF4A 2ZZ5A 1JCMP 1OFBA 3LRLA 1LCOA 2ZZ6A 2JBMA 2Q3OA 5I3JA 3L5AA 4IJBA 2OMAA 3HG2A 3DI0A 1S5TA 2HMCA 2ALDA 4HIBA 1IGSA 4TX9A 3UQNA 5HWJA 3BARA 1OF8A 2FPTA 2YW4A 1JULA 3EWWA 4NVTA 1P4CA 3CIXA 1ZFJA 3C8FA 2B7PA 2C19A 4K8EA 3DU0A 1SZNA 4ORIA 4ZQMA 5J5DA 1VHNA 1R30A 4GFSA 1R47A 2GVGA 1FXPA 2JKAA 1LM1A 2BZNA 2AGKA 1JRCA 3OA3A 5FEZA 1BWKA 4UTHA 4PEKA 3QSTA 3VKJA 4ADSA 3CWOX 1TJPA 4GUHA 3LHWA 1HG3A 3QQ0A 1SPQA 3OG3A 4XTDA 5LHEA 4X9SA 3FKKA 3LTYA 3M5ZA 2J24A 4GUFA 1ME8A 3O07A 2Y7DA 2H6RA 4POCA 5CGQA 3TQVA 5D38A 1TPDA 4N02A 2J9XA 5DCEA 1QNVA 1G4TA 3MHGA 1LOQA 2GOUA 3G1YA 3O6CA 3W7RA 3TX9A 4Q4KA 4JX6A 5G2IA 1MEHA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ABQ A;  4US5 A;  2YL5 A;  5LIK X;  1ZBV A;  3KL0 A;  1T96 A;  4CQA A;  2X0S A;  1OFQ A;  4QJ3 B;  4HB7 A;  2NZL A;  8TIM A;  4R85 A;  4UMB A;  3PUL A;  3MSR A;  3SQM A;  3IIV A;  4RZ4 A;  1V93 A;  2Q8L A;  1FWC C;  3CEU A;  4BWL A;  1DJI A;  4CN1 A;  2OOG A;  4J3U A;  1A4M A;  2CLF A;  5EMJ A;  3SB0 A;  1TO3 A;  1LQ2 A;  3MUI A;  2P1F A;  2G95 A;  4F0S A;  1CYG A;  1MXS A;  3BG9 A;  2WJD A;  5FEW A;  2WSQ A;  3KBV A;  1M7P A;  3UES A;  4HA1 A;  3ZWS A;  4HNC A;  5I3F A;  3BZJ A;  3C0J A;  3W81 A;  3KW3 A;  1ITU A;  3UPW A;  1ZTV A;  3F4N A;  2WNQ A;  1G4E A;  5KSW A;  3CPR A;  5ABF B;  5C0Q A;  4XVE A;  7CGT A;  3IAP A;  4JY8 A;  4KET A;  1BGG A;  3QY7 A;  4YHE A;  2PLM A;  3ARW A;  4Z1Y A;  4WZH A;  4EXB A;  1B31 A;  3EDF A;  3HFY A;  4GX9 A;  2WMI B;  3TRO A;  4H7V A;  2YDS A;  1E3Z A;  1JD7 A;  1UWU A;  3VOG A;  6ALD A;  1NJJ A;  3JU2 A;  2CLM A;  3NDZ A;  3WJW A;  1XHG A;  3M07 A;  3NDY A;  4JII X;  4MSS A;  2WJF A;  1A3X A;  3GC5 A;  2IKG A;  4S23 A;  1OIF A;  3CMG A;  1M5W A;  2FFI A; 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