3R9OA

Cdk2 in complex with inhibitor rc-2-143
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
298
structure length
282
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Development of highly potent and selective diaminothiazole inhibitors of cyclin-dependent kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 282
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3r9oA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3r9oA01
4EORA 4M15A 5HCZA 3O23A 2R3OA 5FRIA 3O2MA 1R39A 1BYGA 3RPSA 4JJRA 4IX6A 4IE9A 2GS7A 3BELA 3Q9XA 2ZJWA 5FDXA 1DAWA 3BWJA 4IX5A 4DAWA 4IAFA 3UIMA 4PV0A 3QUPA 5IQAA 1WBOA 2JDTA 3AG9A 3NDMA 4QYFA 4RFYA 4F9YA 2GTNA 2YM3A 2WMRA 3OEZA 3A7GA 4L6QA 1G8SA 2EXEA 2PZ5A 4IACA 4M69B 4I4FA 4UV0A 3V5WA 3DKCA 5EW8A 3OROA 1XR1A 5CALA 5BYZA 3BE2A 4NIFB 4V0GA 3S95A 4P5QA 1KSWA 3L8PA 5AM6A 3W2SA 2WEVA 4UX9A 3LFSA 4OAVB 4CD0A 4FV3A 1PMEA 4R1YA 2C0IA 3O7LD 3PPZA 4YTIA 1O6KA 5JGDA 4WBOA 2IW9A 3VHEA 3VS3A 3GGFA 4TXCA 3GU7A 5JFVA 2F57A 4GFMA 5E92A 3BGQA 4FTCA 4MHAA 1OL1A 2W0JA 3OD6X 4PTEA 4UB7A 5CTPA 5IH6A 4O83A 4G5JA 3M11A 2UW7A 4JRVA 4W4XA 4XBRA 4ZK5A 3WZUA 4FMQA 3CSVA 5IQEA 4PDPA 4PNIA 5HI2A 1FVVA 5HIEA 4D4VA 4K18A 1CMKE 4CZUA 3KXMA 5HX6A 4FTTA 1OIRA 4EHZA 4QMXA 3EIDA 2A27A 3FZSA 4ANBA 3D7ZA 5L8LA 5EM5A 4J8NA 4ZZMA 4FR4A 2XIKA 3ZC6A 3V5LA 3KVXA 4FKOA 5J9LA 3ET7A 2YDKA 3FDNA 3QKMA 4J7BA 4I5HA 5EYCA 1NVRA 3PTGA 1YDSE 3KCKA 4D1SA 5I3RA 3CE3A 4Q5EA 5I3OA 3U9CA 1GZOA 3LM5A 1FBNA 3LIJA 4FTMA 1OPLA 3UIBA 3CQWA 2QI8A 4FIGA 1P14A 4LFIA 2BR1A 3P9JA 2QKRA 4QP4A 1RDQE 3GI3A 2ZDTA 3FSKA 4G17A 5HG8A 3R1NA 4XP3A 5KMIA 5KNJA 1F5QA 1Q4LA 2RFDA 2NRUA 3E88A 2WTDA 1M7QA 3PA3A 4FKPA 4QMWA 4YC3A 4FC0A 3FKLA 4ASDA 2B9JA 3CTHA 1MQBA 2A4LA 2BHEA 4IWOA 4NCTA 3W10A 3W32A 4LGGA 3C0HA 4AOJA 5JZJA 2AYPA 5CSPA 5HG7A 3BYOA 4WNOA 4YC6A 3ZDIA 3N4VA 3GT8A 5HKMA 3FMEA 4B6LA 1YWNA 3R28A 3V5JA 3KREA 3KRJA 4ZJIA 2ZMCA 2V7AA 4K6ZA 3ZLWA 1Q8UA 1M7NA 1AD5A 2OH4A 2OI4X 2QO2A 4JIKA 4RG0A 5GHVA 3BLHA 5JRQA 5C1QB 4O27B 3F69A 2ITOA 3LJ2A 3PY1A 5C4LA 2P2HA 1XO2B 3IDCA 2H9VA 4JI9A 3Q3BA 4YURA 3F2AA 2H96A 3AGMA 3II5A 2CN5A 3VUIA 1ZYCA 4FTJA 3EMGA 3C4CA 5E91A 1CKIA 4R77A 2JIIA 3A8XA 2GFCA 3PE2A 4BZNA 4JDIA 5CU4A 4RSSA 3NPCA 5D1JA 4BDBA 4UXQA 4QOXA 3ERKA 5FBOA 4KBKA 3KXNA 4W4WA 1KWPA 5L2WA 4FI1A 4H3BA 4I6FA 4YZDA 5HQ0A 2QOOA 5M08A 2Y4PA 4RPVA 2CMWA 4WA9A 3C4ZA 4FOCA 1B39A 1JKSA 4FSNA 4C0TA 3N51A 4FKWA 3FZPA 4L44A 5GINE 4XS2A 2PYWA 3ZSHA 2GNFA 4HCUA 5HLNA 3IW6A 4QPAA 1HCLA 5DA3A 2OJFE 4A7CA 5BYLA 5HBJA 4FEVA 2J0LA 2CGUA 4E6DA 4RGJA 3R7EA 2UW5A 3FHRA 3PVGA 1RJBA 5DH3A 2VO0A 2ONLC 2YITA 4TNBA 4XUFA 3UO6A 4OT6A 3LQ3A 2YA9A 1OKWA 3EFLA 4EL9A 4QP8A 3HMOA 3UMWA 4F0FA 4MXZA 4M68A 2R0UA 3F2RA 4HVGA 3ZS5A 3EZVA 4IC8A 4A9SA 1CSNA 2XUUA 5FGKA 4EWQA 3QZGA 5CVGA 1WMKA 4QTCA 3RALA 4EK6A 2ZM3A 1H28A 4MAOA 2C69A 4ZTNA 3GXLA 4P7EA 3V04A 2OXYA 3B2WA 4K8AA 2W1HA 2J6MA 4BDJA 5GIOE 1A06A 4C2VA 5B7VA 1MRYA 3H0YA 2WQOA 5HE2A 2ITUA 5E8TA 4KIPA 2CCHA 2YIXA 5FXRA 5AUWA 4BIDA 4RC3A 3GB2A 4WRSA 5EW9A 3DZQA 1HCKA 1CM8A 3H9RA 4UEUA 3T3UA 3MH1A 1VR2A 2ITNA 2YZLA 2XZSA 3BEAA 1RE8A 4QNAA 4E1ZA 5ANIA 4BBEA 3W55A 4OTFA 1LEZA 5D12A 5FP5A 3OUKA 5HU9A 2V7OA 4F64A 5FP6A 2E9PA 4DYMA 3AT2A 4ZTSA 4F0IA 1WVWA 3TCPA 3ZUVA 5AR7A 2W06A 4F1MA 5KO1A 3SW7A 2WMUA 3QL8A 4ZTQA 4D2VA 3ZC5A 1YI6A 4NW6A 4AQCA 4DGLC 3S0OA 3R63A 1GY3A 3L9LA 3A60A 3UVPA 3HRFA 4OTGA 5ANOA 5AX3A 3O8UA 5KE0A 2XNGA 3OOGA 1IAHA 2OJJA 2ACXA 3FBVA 4HGEA 4FKIA 1J1BA 2F7EE 4FEQA 2VZ6A 4QP9A 4DHFA 5JH6A 3E87A 3IKAA 4Y5HA 3S00A 4L52A 1ZYDA 4L3LA 1UKHA 4TNDA 3W1FA 4D4SA 3WI6A 1UA2A 3COKA 5K0KA 3BHTA 4CTBA 3QU0A 4TYHB 3ZU7A 3FV8A 5CEKA 4FV8A 4GT4A 3EYHA 2Q0NA 1U46A 4G6OA 4EJ7A 5GZ9A 1H8FA 1XH6A 5EDPA 4WOVA 3HYHA 4FT7A 3PXZA 4EZ7A 4CZYB 3ALOA 2GQRA 3PUPA 5LVPA 3EKNA 1YI3A 4MTAA 3VUTA 2WU7A 3KXXA 3AQVA 4XV1A 2YDIA 3V8WA 5AP2A 2BZJA 4AG8A 3WYXA 3QZHA 4J1RA 4M69A 3UYTA 3PIYA 5HE0A 3HUBA 1IA8A 4IHPA 4P2KA 5E8UA 5HIBA 4W8DA 4ORKA 1ZOGA 4FBXA 3HV3A 4AN2A 3QYZA 5ETFA 2GQSA 2R7BA 4QMMA 2WQEA 5FTOA 1CDKA 2UVXA 3CD3A 4QRCA 4B0GA 1ZMWA 3DA6A 4N6YA 4ZSEA 5H8GA 3Q60A 4E4XA 4QQTA 4GKIA 4IXPA 4LRKA 3NCGA 3NW6A 3G9NA 3KCFA 2GDOA 3F9NA 5AV2A 4CMTA 3DLSA 5I9ZA 1YW2A 3R1QA 4YJPA 2JKMA 2IZTA 5H3QA 4WKQA 3OCSA 3AC5A 5FXSA 2OGVA 2VD5A 3CJFA 5J95A 4EKLA 2BMCA 1DAYA 2ZV8A 5AUZA 5ACBC 3U4UA 3IG7A 4OW8A 5DRDA 5HNGA 2WU6A 4I0RA 3PJ2A 5LMBA 5IDPA 1Y6AA 4H58A 5J79A 2C3IB 4KBAA 3MVLA 2PE0A 4I6HA 3BI6A 3DBEA 3AC2A 2ETMA 4D2PA 1H4LA 4K9YA 2HZIA 4XMOA 5E90A 4J95A 4IFCA 3R1YA 3EN7A 4DGNA 4E4NA 2WMTA 4NJ3A 1BKXA 3KF7A 2WMWA 4LUDA 5L6OA 2HW6A 2PVLA 2DS1A 2Q0BA 3P78A 4MD9E 2OIBA 2P0CA 5EHLA 1F0QA 3OBJA 1OIQA 3Q5IA 5BVWA 3W8LA 4UYAA 1Q8WA 3F5PA 1ZZLA 1IG1A 3RGFA 3SRVA 5K0XA 3D94A 3MWUA 2RG6A 2VTQA 3POOA 3HDNA 4L01A 3E5AA 4MBIA 4OT5A 4APPA 1ERKA 2R3FA 1FMKA 5A4EA 4RA5A 1Q24A 4YHTA 5J5TA 3SAYA 4AT4A 4DH8A 4BCKA 2WOUA 3QKKA 4AF3A 5HTBA 3KRWA 1REJA 5M09A 4R5YA 3RCDA 5F4NA 4G9CA 3EZRA 3FC2A 5HVJA 4D28A 2JD5A 3BWFA 4AZSA 5CEPA 4CT1A 3L9PA 4R7HA 3ZONA 4RVLA 4XV3A 5HU3A 2QNJA 3MW1A 5IU2A 3PJCA 5JQ5A 3VUDA 4H39A 3HA8A 4L68A 5FM3A 4QP6A 4KNBA 5L2QA 4H05A 4KSQA 5BUIA 3FHIA 3ZRLA 4AW1A 1OPKA 4HGSA 2X2LA 4V01A 3MBLA 2Y4IB 4XCUA 4QMSA 1M2PA 4EOKA 4KAOA 4UZDA 2IN6A 3TM0A 4EH3A 3NZ0A 4PMSA 2PE1A 3DB8A 4Z55A 5AV4A 1W83A 3NIZA 3U6HA 2WZJA 4JNWA 2VO3A 3V3VA 4BVUA 4XG8A 1ZYSA 3Q4TA 4IB1A 4L45A 3VHKA 2B55A 3M1SA 4KABA 3VF8A 4EQUA 2XBJA 3KULB 4X3FC 5M55A 1PXOA 3MTLA 3O96A 1FVRA 4PTGA 4XLIA 2VTMA 3UE4A 4YSJA 4RVMA 4J53A 2XNNA 2WTKB 2JLDA 5IQGA 3HA6A 4BDGA 4I0TA 2BFXA 3FPQA 1BI7A 3BYUA 4GRBA 3GC8A 4I0SA 4LQMA 4TZRA 3NYOA 1UWJA 1TVOA 3DJ7A 3ORIA 4AA4A 2Z8CA 4AU8A 2XJ1A 5JRSA 1YXVA 4JDKA 4DC2A 3FQHA 4C57A 2BALA 1OBGA 1YOJA 4M7IA 4W4YA 4EZ5A 4JBVA 4FL3A 4NFNA 4Z7HA 5LARA 1ZZ2A 3QAME 3R9OA 4DG0E 1P5EA 5HCYA 4G9RA 3DKOA 3VULA 3ROYA 3TNHA 4CV9A 3NLBA 5EW3A 3I0OA 4FV4A 3R9DA 5ANJA 3NUXA 3F3UA 2ETKA 2C6DA 5FM2A 5E4HA 3C4EA 4I22A 2Y6MA 2VWBA 2XNOA 1PXPA 1DI9A 2HZ4A 3HVCA 3VRYA 5L6PA 4UMPA 4ENXA 2QC6A 3KGAA 1WVYA 3WOWA 3PXKA 5CNOA 4CVAA 4JAJA 3EYGA 3PZEA 2HWOA 1I44A 3AT3A 5CNNA 3UBDA 3NAXA 3G2FA 3DS6A 4Y5QA 5HZNA 1XWSA 4I21A 4DTAA 3G6HA 4I5CA 4TYEA 3TEIA 4PPCA 1ZOEA 2C6MA 4B7TA 4BHNA 2CGWA 1J7LA 1OIUA 2RKUA 4KIOA 2Y0AA 4C38A 1H1WA 2ITZA 4JDHA 3W16A 5K5XA 5AP5A 3V5QA 2OF4A 3IOKA 3DKFA 5LMKA 5CQWA 3JY9A 5DE2A 3R7OA 1QPJA 4FTAA 4RRVA 3POZA 4YNEA 5EYMA 3BX5A 3DY7A 3KXGA 2XJ2A 1MRUA 2QOIA 4E6AA 1YOLA 3ZM9A 4BY9E 3DBDA 4HYIA 3QLFA 4ALVA 3QFVA 4GV1A 4G16A 4JXFA 4FIIA 3COMA 4G34A 3MFRA 5AV1A 5EDQA 5AP7A 4ANMA 2JC6A 3TN8A 4E3CA 3HMIA 2IJMA 3K3IA 4JT3A 3ZBFA 4MCVA 4DH5A 3F3TA 2W1GA 4H1JA 4U0IA 3MPTA 3D5VA 5L3AA 5IA5A 4O7ZA 4L43A 5BYYA 5JFSA 2G1TA 3NUAA 4MH7A 5DRBA 4FF8A 2R4BA 3R8VA 4IC7A 4PQNA 4ZSLA 4HVHA 1V0BA 3H10A 1G3NA 2JGZA 4BCMA 5BVNA 2GU8A 2XK8A 4PMMA 3R7VA 4IH8A 4U45A 3VBTA 2RFNA 1XBCA 4WNPA 3UIUA 3V5PA 4JBOA 2DQ7X 4EWHA 2CLXA 4K11A 2R3PA 4RIOA 4X6QC 2B9HA 3UOLA 1PF8A 2JBOA 3QQLA 4F70A 5CF5A 4OBPA 5M57A 2F2UA 3RBWA 3LFDA 3OVVA 1OBDA 3SXFA 3BU6A 4O7TA 3DT1A 3ZEPA 4I3ZA 3KQ7A 4C3PA 2GHMA 3PY3A 4ZSAA 5CEMA 2KTYA 2CN8A 3ALNA 3NAYA 3ZUTA 4IX4A 2X7GA 3DBQA 3MY0A 4FNYA 4FT3A 4MYGA 4GK3A 4PP9A 3ULIA 4A4LA 2OO8X 3BYSA 2ERKA 5HE3A 2XS0A 4O0XA 4WO5A 3U4WA 3VS7A 4X2FA 3TUDA 2CSNA 2YHVA 3UG1A 4DGMA 3T9IA 4BICA 4V04A 5L2SA 4Q5HA 2WTCA 3RAKA 2IWIA 2A19B 4S34A 3VUGA 4S2ZA 3R8ZA 5AJQA 3RAIA 4D55A 3NYXA 3ZBXA 4MX9A 2EU9A 4EJNA 2Y7JA 4L8MA 2W9ZB 3VWAA 3TACA 4ZSJA 5CEQA 2WTJA 5HX8A 2HY81 5DWRA 4XV9A 4DEEA 4HVIA 4LV8A 3H4JA 4DA5A 4OTRA 1IASA 3KL8A 2WIHA 5ETIA 1OUYA 4OTPA 1PXLA 5GJGA 2C1BA 4XG3A 4HVSA 1WBWA 2NPQA 3GNIB 3R22A 2G15A 2XA4A 2VTIA 2PSQA 5HLWA 4YBKA 4N70A 1J3HA 1U5RA 2I0VA 1J7UA 4NT4A 5I5ZA 3IW5A 5A4LA 2C1AA 1YXXA 5IEVA 4CG8A 1SZMA 4BI0A 1U59A 4GYIA 4YJTA 4YSMA 5KMKA 4IAZA 3NNVA 2B9FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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