3RBTA

Crystal structure of glutathione s-transferase omega 3 from the silkworm bombyx mori
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
230
structure length
230
Chain Sequence
VIPPPALTDKLRLYHVDMNPYGHRVLLVLEAKRIKYEVYRLDPLRLPEWFRAKNPRLKIPVLEIPTDQGDRFLFESVVICDYLDEKYTRHTLHSHDPYVKAQDRLLIERFNELIKGSLECFDTNFAFGSEQIIQTLEIFEKELTNRGTNYFGGNRPGMLDYMVWPWVERLYLLRCVNDRKFVEKKSLFPNFADWGDQMQLDDIVKKHAHSPQEYFDYYKNARAHSMGYYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione transferase o1
publication title Structure-guided activity restoration of the silkworm glutathione transferase Omega GSTO3-3
pubmed doi rcsb
source organism Bombyx mori
total genus 73
structure length 230
sequence length 230
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2011-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3rbtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3rbtA01
3EINA 3EC3A 1J0FA 4IJ3A 4GSSA 1V57A 5C00A 2CZ3A 3WGEA 3MNGA 4G19A 4KH7A 5DDLA 2A4VA 3QMXA 2HSMA 2WB9A 1JLVA 3IOSA 2X8GA 3KCMA 3M9KA 1BYEA 2TRXA 2FWHA 3KH7A 5IMDA 2PERA 1T8EB 2X64A 1ZGNA 2PUKC 2K8SA 4KAEA 4EO3A 2G2QA 1HNAA 2IFQA 2PMTA 5AIVA 1EGOA 4JR6A 2F3MA 3WT2A 3MDKA 3DKSA 4KB3A 2GT5A 1GH2A 3ZMLA 3N5OA 5ECNB 2FA8A 2OE1A 4I5QA 1EV4A 17GSA 2HSMB 2YANA 3K8NA 5IPHA 4H86A 3GX8A 2CVBA 4EDYA 2C8UA 1Q4JA 2IMFA 5HR0A 4N0VA 5EL8A 1PQNA 3A5WA 1NHYA 4OCFA 5ECMB 3GSTA 2OE3A 1AC1A 3F4TA 4MA9A 1TRUA 3CYNA 1DBYA 1QXHA 2FY6A 4POLA 1K0BA 3E0UA 2HZEA 4G9HA 2IFQB 4FIWA 3I9V2 4EF0A 3ISOA 1PX7A 5G1LA 4HQSA 1MDIA 3O76A 3VWUA 4QL7A 3TKPA 1XWCA 2RUFA 4XS4A 1U6TA 1U3IA 4RI6A 1XVWA 4KDUA 5GZZB 5J41A 4AJ8A 3IC4A 2IPAA 1YY7A 5CP1A 6GSTA 3GKXA 3IRAA 1MEKA 2C0FA 4MH3A 3QR6A 3GUSA 4KSOA 4ML6A 2HZEB 2R3XA 3IR4A 5A4WA 2B1LA 2K8VA 3HZ8A 4XIHA 2N5FA 3UAPA 4MDCA 1R26A 4MZBA 1XW6A 3GN3A 4X43A 4AJ7A 2E2MA 2J23A 1QUWA 4XS4B 5A4VA 3DXBA 4IHUA 4O32A 2GTUA 1NSWA 2F9SA 1U87A 3RDWA 12GSA 4TN8A 2CAIA 3NOFA 4ACSA 4L5LA 2M80A 1UVZA 1WMJA 3D22A 4MF7A 2CX3A 1O85A 4GCIA 2V6KA 4KCAA 4QQ7A 2YV9A 4KDXA 3NIVA 6GSUA 4PTSA 1ON4A 3KP9A 4N11A 2ON7A 3IK9A 3D4MA 1YQ1A 2MBTA 2CV4A 1SJIA 3CTGA 1OE7A 5AISA 4WF4A 5IMAA 2LQOA 4FQUA 2G0FA 4EUYA 4KDYA 2YN1A 1WJKA 5IQYA 3F0IA 1A2JA 3F63A 2LKUA 2AHEA 2F8FA 2RIIA 4YH2A 2GQLA 1GLPA 2WZ9A 1MDJA 1TDIA 1OC3A 1BX9A 4JBBA 1EV9A 1B4PA 5ENUA 1JZWA 2H76A 2B5XA 3GV1A 5F07A 1K3YA 4ECCA 3J7Yb 1GLQA 2L6CA 4EC0A 3RBTA 2H0GA 5EVOA 3PGTA 1ZMAA 1R5PA 1M2BA 1GSSA 5JWRB 2PGTA 1KEBA 1TRWA 1PMTA 4TKYA 4LL4B 2DJJA 1U3AA 4WBJA 3KTLA 2GSQA 1F3AA 3N9JA 4E8HA 2MMNA 4IQ1A 3PR8A 1GSEA 3APSA 2OBIA 5DCHA 3WD6A 4ZB8A 3VI5A 4TOPA 3EMXA 3HKRA 3UBLA 3VPQA 4V1Ap 2JSZA 2OJLA 5G2ZA 3G9BA 1RQMA 4IKHA 3I69A 4PGTA 1V58A 2B6MA 1DE1A 3F6DA 3UBKA 1FVJA 1SL0B 3DD3A 4YQUA 4NXIA 4KF9A 3G7JA 2C0EA 1ERTA 1VGLA 2WDUA 2JZRA 1WIKA 4K1FA 3IBHA 4TXVA 1K0AA 3GH9A 3ZVJD 2VM2A 3J7Yk 2IJYA 1Z6MA 1RW1A 1X5EA 1Q98A 4NWYA 3VWXA 2H6ZA 1O7UA 2XBQA 5LD0A 5DAKB 2JZSA 2H6XA 4PNFA 4MPGA 4GTUA 2OE0A 4OO5A 3VWVA 4POKA 1TRVA 2VD0A 2BJXA 3H8QA 3HYPA 5IM9A 4HJMA 5FHIA 2X8CA 4HQZA 16GSA 3LSZA 2VCTA 3FHKA 5DQYA 2OBKA 3LGCA 2H0HA 2N5BA 2QGVA 1J08A 2JZTA 1B9XC 3H79A 5LCZA 4MJAA 1FAAA 1GULA 2JADA 3KGKA 4TW5A 4PUAA 4ID0A 3IHQA 3HDCA 1W89A 1I5GA 1FO5A 3D0ZA 4FH8A 4HEA2 2V41A 2GZYA 2DJ1A 1THOA 2CVDA 2OADA 5H5SA 3GH6A 1GRXA 4V2LA 4Q5FA 4FYUA 4K7OA 1Z7PA 2NVLA 2LQQA 1AUCA 5J9CA 3VPTA 1YEXA 4E8EA 3S9FA 5DBQA 3IK7A 5ECQB 1S3AA 3HJMA 3F4SA 13GSA 1Y25A 4JE1A 3CSHA 4NV2A 3P90A 4NAXA 5E59A 2AAWA 7GSSA 2H0IA 2YP6A 3NZNA 3IAS2 1UA5A 5JCGA 2M72A 2PN8A 4HU7A 2OA7A 4G0IA 4WR4A 1X5CA 1F2EA 3LG6A 1OAZA 3BCKA 2L6DA 1DSBA 5IMZA 4KW6A 3TDGA 2WJUA 2PWJA 3UEMA 4GF0A 4LA1A 2MYGA 3Q18A 3FEUA 4JR4A 3IPZA 2FWGA 3GTUB 2B1KA 4XRDA 1PKWA 5HR1A 2O85A 2C0GA 1K0DA 1VF2A 4GQFA 2GSRA 3DYRA 3RHCA 4GSNA 1XFLA 2H01A 5CRDA 5HR2A 5D9XA 1ZYQB 2H71A 4V1Ag 2VUPA 2CA8A 1DUGA 4CHSA 3ZIVA 2B7KA 1TTZA 1A24A 3I43A 1GP1A 4NHZA 2GSSA 4GWRA 2H8LA 3TKQA 1R4WA 2MMOA 3F6FA 1F3BA 2JSYA 2HI7A 3C8EA 4USSA 4I8BA 1G6WA 3TUEA 3ERFA 4KX4A 3QAWA 5ECPB 3R3EA 1LBKA 2KP1A 5F06A 2VM1A 5JWQB 1AQVA 2B3SA 2HRFA 1UN2A 3TKRA 1G7EA 2I3YA 1ZYEA 4BL7A 3G7YA 4FYBA 2LV3A 2HQTA 3HA9A 2KHPA 5JCUA 4ECBA 2R37A 3ZMKA 11GSA 2O7KA 2IMEA 4MPFA 1I9DA 1PL1A 2VCZA 1FB6A 2VIMA 1SJ6A 3UARA 5DQSA 1A0RP 4PXOA 4KUNA 1T3BA 4BWSA 2MZCA 3EVIA 4K0GA 6GSSA 2GLRA 4PQIA 2L4CA 1FB0A 2HNLA 1N8JA 3CXGA 1OC9A 3O3TA 4P3YB 2LNSA 1IYHA 4ECJA 5B8BA 4BL7B 3GFKA 4AGSA 1EWXA 2GVPA 5AGYA 4G0LA 1WRYA 2XHFA 3UMAA 5G5FA 5ELGA 3ZFBA 2AUVA 1SL2B 1XBSA 3WGDA 1U88A 2C3TA 5IMVA 3ZYWA 4F0BA 1H75A 1GTAA 5KN1A 3L4NA 2CZ2A 3HJOA 2LRCA 1A2MA 5E4WA 1G0TA 3HVVA 3E3EA 5B7CA 2GSTA 2HSYA 3UVTA 5HFGA 2KLXA 3D4TA 5ECRB 5ECSA 1OC9B 2MMZA 4N0ZA 4Q5RA 1SK0A 2VL3A 5B6MA 5DALA 4JU5A 3ME8A 2AYTA 6GSYA 2VCXA 2B5EA 3TKSA 4MABA 4OFNA 4MLYA 2DJKA 2ZCTA 3TJKA 2FD3A 1W4VA 3L9UA 2I9HA 3M3MA 1DE2A 5ABRA 5J5NA 3KMNA 3TJJA 1AQWA 3IE3A 1GSDA 1T4YA 4Z7XA 3FK8A 4K7IA 3KEBA 1TU8A 3GURA 1NW2A 1TW9A 19GSA 2YZUA 4ILFA 1AQXA 4F0CA 2H19A 1B4QA 1TI1A 5HR3A 3EURA 4K2DA 2KUCA 5FT3A 1YKAA 5KN3A 2C80A 1M99A 4I2TA 4IQAA 2V32A 5INYA 5BMUA 1EGRA 3FR9A 1XWAA 4L8EA 2V2GA 5IO0A 4HDEA 3ZRDA 1MDKA 5F05A 2O8VB 1K0MA 2WFCA 3ME7A 2M46A 1HNBA 4BA7A 4X0XA 4PX1A 3BJ5A 2R2JA 1M2AA 1X9MB 4EVMA 3W6GA 2CAQA 5KN2A 1JHBA 4OWYA 1TK5B 2MBSA 2GZZA 4TXOA 2H72A 1KBNA 1TU7A 1XCCA 2HLSA 2VO4A 3VFIA 2DSAA 3GHAA 1VRSD 4FYCA 3TRXA 3PINA 3L78A 5A4UA 3FKFA 3RAZA 2MMAA 4F2IA 1EEMA 4MZCA 1PKZA 1WE0A 1YDKA 4XS6A 2E0QA 1GSQA 4IP6A 2EIOA 5DJMA 2PU9C 5D8IA 3DEXA 3D6IA 4MJCA 4ZBBA 2C3QA 2VOCA 3ERWA 1M9BA 3GRXA 3VI7A 3TOTA 2HRNA 2FUG2 4L5OA 3RHBA 2VCQA 3CRTA 2LUSA 4TXOB 2YPMA 4D73A 5CAXA 4ECIA 3DVXA 4ZB6A 3GKMA 2H70A 4MZWA 5EPFA 1YKCA 2RM6A 2OACA 1JZDA 1T00A 4CDOA 4EDZA 10GSA 3GMFA 1HD2A 1WPIA 2GS3A 1GUKA 2VLTA 1T7PB 4ZB9A 5HQPA 3WYWA 1F9MA 1R7HA 1T1VA 3TOUA 2DLXA 1N2AA 3APQA 2KP2A 1QMVA 4Q5QA 4J57E 1MD4A 4LLRA 4ULXA 1O81A 3ED3A 5D9TA 1PL2A 2ZUPA 4L0UA 1SYRA 2FHEA 1VF3A 5CRWA 1TI3A 1YEPA 4TR1A 3QFAC 5IOXA 3F8UA 6GSVA 2CX4A 1URMA 3JCML 2P5QA 3G7IA 2FA4A 2VLUA 2FWFA 1PSQA 4K8MA 3FR6A 3RPPA 3BOAA 2IMDA 5KN0A 4IS0A 1KTEA 2IMIA 3LXZA 2ES7A 1NM3A 8GSSA 3PPUA 2HFDA 3QD9A 1HYUA 3UJ1A 2DJ0A 1MD3A 3ZTLA 1M2DA 1RK4A 1FG4A 1SKWB 1O6JA 4WBRD 1M9AA 1B48A 4XRAA 1IYIA 4MP4A 4BPYA 1TXXA 2YWNA 3KTBA 5ECKB 5COHA 1Z3EA 2YZHA 1M7TA 4MMMA 14GSA 2E2GA 2GGTA 1GTIA 3M1GA 4NMUA 5D9VA 3EYTA 1XW5A 3HJPA 2P31A 5G1KA 2L4QA 2IIYA 3FRCA 4BVXA 3D21A 4PNGA 4ZXGA 3IA1A 4G0KA 5J4UA 1J9BA 3LXTA 4IP1A 1SENA 4N10A 1S3CA 4XHMA 1PX6A 1VF1A 2PVQA 2WRTA 2CQ9A 2QC7A 2A2RA 4TR0A 5ECHB 4N30A 1ST9A 5HFIA 4LMWA 2GDRA 3TJBA 3OR5A 4KA0A 1UC7A 4I97A 6GSWA 1NHOA 3V1WA 1H4OA 5ECOB 1AXDA 4HJ2A 2L59A 3LYKA 3H4KA 2LNTA 4BVXB 1KNGA 3FZ4A 4OCEA 1EOGA 3KM6A 2ON5A 1X0RA 1XOBA 3ZREA 3KJYA 2R4VA 3TB2A 1G7OA 1GTUA 3F4RA 3U5RE 4TR4A 5CYYA 5IOWA 4HOJA 1G6YA 5D93A 4MJEA 3ZITA 4IBPA 1LJRA 2YWIA 3UOMA 1QGVA 5IO2A 4OMVA 1SKSB 2UZ8A 3TRQA 3MWHA 22GSA 1SU9A 1M0UA 2AB6A 2BTOT 4EXJA 3CRUA 3QAVA 3GX0A 1ERUA 4XTSA 3EU4A 2YWOA 3FZAA 2YJ7A 3LYPA 2FLSA 1OE8A 1EOHA 1ZZYA 2DIYA 4QL9A 3L9VA 2IWTA 3F3RA 1K3OA 5GAND 2PBJA 2V6OA 3F9UA 4OO4A 3GL3A 4RQRA 2VL2A 1ERVA 4WETA 4WXTA 2J9HA 5CNWA 3HVSA 4AJ6A 1EZKA 4GQCA 4BVYA 2LEGA 2R5GA 4MH2A 1JFUA 5KEJA 3FY7A 4G10A 2DJ3A 2ZNMA 1PD21 4XS1A 6GSXA 2XC2A 3U6VA 2NPBA 3LJRA 3KMOA 5ECIB 1X9WB 3UVHA 3TGZA 1O73A 1XPVA 2XBIA 1ILOA 1XWGA 2Z9SA 1BEDA 3DWVA 1K0NA 2JU5A 2OKAA 2V1MA 3TJFA 1AIUA 2A2SA 1EP8A 5H5QA 1FVKA 2RLIA 1V9WA 2LTKA 2EIRA 2VCVA 1OC8A 3GKNA 20GSA 4BVYB 1YZXA 4PQ1A 1ERWA 1T4ZA 3P2AA 4IGJA 3BD2A 2HZFA 1V40A 1BG5A 2L5LA 3BBYA 3P8WA 1SJZA 2VAFA 1THXA 2YOIA 4GSTA 3GL5A 3WT1A 1ML6A 4EKZA 2HXKA 3FYGA 5EY6A 2ALBA 2YJHA 4FO5A 3AY8A 4JZQA 3Q6OA 5D73A 2LS5A 4MCUA 2QSIA 1V98A 2JACA 4HZ4A 3WGXA 1EP7A 4ZBDA 3IV4A 5F0GA 3CSJA 3UIWA 3IAM2 2PPTA 1OVNA 1YJ6A 4TRXA 5CO3A 1TK0B 3EE2A 1X5DA 2I4AA 4JEDA 4ZL8A 1AAZA 1TKDB 2K9FA 5G5EA 3FZ9A 4O7HA 2I1UA 3SWLA 4O5RA 1Z6NA 1XVQA 4ML1A 1GSFA 4POMA 2XPEA 4IN0A 5AN1A 2R6KA 3TKSE 3KP8A 3C71A 5DALB 2FNOA 1WWJA 1ZL9A 3TCOA 5AIXA 4K7NA 4ISDA 1Z7RA 1GTBA 2YNXA 2K6VA 1GWCA 2YV7A 2XPDA 4GRFA 3CMIA 4HZ2A 1BAYA 2HSNB 4RI7A 1QK8A 2TIRA 4ZL9A 5D96A 3H1NA 4DSSA 4TR3A 3Q19A 4NHWA 1O8XA 2X8HA 1PA3A 5FWGA 1XWBA 2P5RA 1GUHA 9GSSA 4J2FA 3M0FA 4PUFC 4J56E 5GSSA 1TJDA 5B6NA 5CRHA 2CVKA 4YAVA 4ZILA 1VF4A 4NPBA 4XCSA 3CTFA 3GKKA 3LORA 3C7MA 3TJGA 3KZQA 2H30A 3FR3A 3HY2A 4V2NA 4V2MA 2K18A 4RUVA 1S3DA 2NBSA 18GSA 3CSIA 5F8BA 3M9JA 4IJIA 2LJRA 2IMKA 3GIXA 5J9BA 2IL3A 2NTOA 5JCWA 1E2YA 3GSSA 1Z5YE 1FW1A 4POBA 2DMMA 1GNWA 2GQMA 2GT6A 1A2LA 1B9YC 4LL1B 4DSSB 3TRPA 3GYKA 3APOA 4PURA 5IPGA 2F51A 2H1GA 3DRNA 2HE3A 2WS2A 2C0DA 2WULA 1WP0A 4ZIJA 4O92A 2H73A 2IN3A 2N5AA 3FZ5A 2DJ2A 3QCPA 1CQGA 2YCDA 2L57A 1K0CA 2DBCA 4OFTA 1CQHA 5H5RA 3A3TA 2EC4A 2QKEA 4ZBAA 5IMFA 2HRAA 3VURA 2LSTA 3BCIA 1OKDA 4EL1A 3E9JB 1XW9A 2VCWA 1ZCPA 5B8AA 1V2AA 3IDVA 4K6XA 2KOKA 2VD1A 4PQHA 5HFKA 3IXRA 1XWKA 1F37A 3ZIJA 3ZL5A 4MF5A 2H6YA 1ABAA 3LWAA 1GUMA 1JZOA 4DSRA 2AJQB 2AV4A 2H1DA 1E6BA 2E7PA 3DGQA 3EMPA 3Q74A 4IELA 2LJAA 4YQVA 2WCIA 2O87A 1ACVA 3C1SA 2DC5A 2C1YA 5DAKA 1QQ2A 2VL9A 4I6XA 3HD5A 1A8LA 3W8SA 3I6AA 4TVEA 1A23A 1HQOA 2RM5A 3DVWA 3GA4A 4DVCA 4D73B 1GNEA 4BWQA 1O8WA 5G30A 4K0NA 2F8AA 2P0GA 1GSYA 3W8JA 4MF6A 4YAPA 5IMCA 1GSUA 1SL1B 2VL2C 3GNJA 3LFLA 3A2WA 2NDOA 3QPMA 4OD7A 3DMLA 3HCZA 3P7XA 4F82A 4NV5A 1F6MC 4KNDA 1A8YA 2GQKA 2VLVA 3H93A 3HVXA 3A2VA 4HS1A 3EWLA 4GXZA 5ECLB 3HZ4A 4HUAA 1HNCA 5IIZA 3KH9A 1SKRB 4RQXA 4WF5A 2FWEA 3R2QA 1XOAA 4IVFA 1FHEA 4TR1B 2C4JA 4WKWA 4AF2A 3O6TA 4EE0A 1YF0A 2LJKA 5J3RA 5D9WA 1SD8A 3SBCA 4KSMA 4OFMA 4DSQA 3HXSA 3ZVJA 5ID2A 3MAKA 2LRNA 5GAPD 4WR5A 2C3NA 5GSTA 4KE3A 2EIQA 3IC8A 3FW2A 5CRGA 1XZOA 4MK3A 1OYJA 3QFBC 3US3A 3UL3A 3C73A 1OKTA 1XXUA 2H66A 5C04A 2H1BA 2FCHA 5DJLA 1A0FA 3MSZA 2B5YA 2TRCP 5DVBA 4KGIA 3VLNA 2PVOC 2HT9A 3CBUA 3LEFA 3GTUA 3ERGA 1SK2A 2D2ZA 1EEJA 5ELAA 5A5KA 1GL8A 5ID2B 4ZL7A 1C72A 3VK9A 1FOVA 4G2EA 2I81A 3EU3A 4KCEA 1Y6EA 1SK1A 4Q5NA 3VWWA 1YF1A 4L0WA 3TKSC 1R5AA 5JWOB 1BJXA 2HSHA 2HRKA 2X99A 3QAGA 3L0HA 1B8XA 3KD0A 3QOUA 4YQMA 2DIZA 3ZLPA 4LMVA 2YWMA 4F03A 1AW9A 4JRRA 4K9ZA 3ZZXA 2L5OA 1XIYA 2FGXA 5CREA 2GZPA 3KIJA 3HHVA 1SD9A 3M8NA 2DMLA 3D5JA 1PRXA 3LQ7A 4GLTA 4F9ZA 3L9SA 2LRTA 4CW9A 1PGTA 2H1AA 2RUEA 3F3QA 1Z9HA 1TP9A 1WOUA 2O89A 3PH9A 3ZFLA 1JLWA 4MJBA 4HU9A 5L71A 2H74A 4HI7A 1SYXA 1LU4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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