3RJX | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	VDKSSAFEYNKMIGHGINMGNALEAPVEGSWGVYIEDEYFKIIKERGFDSVRIPIRWSAHISEKYPYEIDKFFLDRVKHVVDVALKNDLVVIINCHHFEELYQAPDKYGPVLVEIWKQVAQAFKDYPDKLFFEIFNEPAQNLTPTKWNELYPKVLGEIRKTNPSRIVIIDVPNWSNYSYVRELKLVDDKNIIVSFHYYEPFNFTHQGAEWVSPTLPIGVKWEGKDWEVEQIRNHFKYVSEWAKKNNVPIFLGEFGAYSKADMESRVKWTKTVRRIAEEFGFSLAYWEFCAGFGLYDRWTKTWIEPLTTSALGK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endoglucanase FnCel5A
publication title	Crystal structure of hyperthermophilic endo-beta-1,4-glucanase: implications for catalytic mechanism and thermostability. pubmed doi rcsb
source organism	Fervidobacterium nodosum
total genus	113
structure length	313
sequence length	313
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2011-04-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3rjxA00

4H7VA 1O7AA 1Y7VA 1XH0A 2ZICA 3AISA 2GJPA 1M53A 3VGEA 3WD3A 4WKFA 2IXVA 3AJ7A 1GCYA 1VEOA 3CMGA 1OD8A 1E56A 5EFFA 2GSJA 3E1F1 1MFVA 2XUCA 3IJ7A 3PHAA 3WQVA 2X1IA 1KR1A 1I1XA 4X0VA 3VKKA 3NJ3A 1PZ3A 1MXGA 1FHDA 1W32A 5AC4A 4AZGA 2UWFA 4UFJA 2XIIA 1BQCA 1FP9A 4WIWA 3RM4A 4CN6A 7CGTA 4AEEA 4FLRA 2E8ZA 3F5LA 3EDKA 3CIVA 5A6KA 4Z2HA 1D3CA 3J7HA 4B15A 3VD3A 1BGAA 1PBGA 1Q6EA 1LL6A 2OYKA 2DIEA 3WF4A 2J4GA 2W67A 1IT0A 5FL1A 1MW1A 2WANA 3WEMA 1CWYA 2FH8A 1SYTA 1CXEA 4NI3A 3UG5A 3VD5A 5I2UA 7A3HA 2QPSA 1QI4A 1CLVA 2PBGA 1C3FA 2WB5A 1H3GA 4GI9A 1GJUA 1E9LA 1OINA 2VMFA 1DWGM 4CUCA 4P7RA 5M5DA 3QHOA 3GNRA 1UHVA 1TE1A 5I3DA 3CO4A 2PB1A 1ZJAA 2XVNA 1UWRA 1Q6FA 3N04A 4BCEA 3M07A 2VZVA 1GOMA 2VRQA 4GQQA 1K9EA 1QNRA 4AW7A 3SCRA 2BS9A 1WKYA 4N0RA 3ARTA 3CUHA 1UD6A 1QNPA 1US3A 1VFMA 5I5RA 2J8GA 3IANA 5HDRA 3CZLA 3WDHA 3VIKA 4PCSA 2ZUMA 3O2LA 9CGTA 1WNOA 2W63A 4GZEA 3AIRA 1JZ4A 1W9UA 3SCPA 1UR8A 1W9VA 1HVXA 3WY1A 2VX6A 3ARYA 2WAGA 3NUKA 1LL4A 3A4XA 2VCAA 1NARA 4ZXLA 3AZSA 3SIMA 2X2YA 3AOFA 1PAMA 1BYBA 1CGUA 2WPGA 2YA2A 1E4NA 4HMDA 2WW5A 5E0FA 1V0NA 1X6LA 2PI6A 3SUWA 2E40A 1JZ3A 1V3MA 3SUSA 4UZSA 1E0VA 4R5EA 2XPKA 3WUGA 3N9KA 4ZXOA 1V03A 2BY2A 3SCUA 1CECA 4W87A 5A6AA 2JEQA 2XM1A 1DTUA 3ZT7A 2E4TA 1BSIA 3LPOA 1HIZA 5BYWA 2DDXA 4HTYA 3WFZA 1HL8A 3EBVA 1ZBCA 4KMQA 3WH9A 1BG4A 2DSZA 4HU8A 4CGTA 2J7GA 1EHAA 4W88A 4FK9A 3HN3A 4ACZA 2OWCA 3BC9A 3K4AA 3WEZA 2WVSA 5E9AA 1GHSA 2WVTA 3ALFA 4AWEA 2CPUA 3GH5A 2YA1A 1ISYA 5TD4A 2WM0A 3MMDA 3MV11 5IXEA 1C8QA 3WMSA 3AMDA 4OJYA 3CZGA 1LWJA 1LQ0A 4P8WA 1UH2A 5M3WA 4Z2IA 2XM2A 3L4XA 2VVSA 4GZJA 4PN2A 1L8NA 2DQXA 1OT2A 3WD4A 3AZRA 3PZOA 4LYPA 4P7NA 3AIWA 2VQUA 4UQ9A 6CGTA 1WP6A 8CGTA 3ZIZA 4AC1X 1LWHA 3SCOA 1GVIA 1C93A 1KGXA 5HNNA 1H1NA 4YHEA 3VGDA 1A3HA 2XTKA 2O9TA 1GOKA 3F5JA 4MDPA 4U5IA 4MNJA 3WL1A 3WNKA 1HL9A 4D72A 3AIVA 3W25A 3AHVA 1TMQA 2G3MA 4UQEA 3UG4A 1E1FA 3N13A 4ZENA 2TAAA 3VX1A 5EB8A 5FD0A 1QNQA 3U5UA 4PMXA 2UY4A 3QGVA 3UG3A 2UY5A 4HZ7A 1JF6A 1SR0A 2CCRA 5AY7A 1UKPA 3A6OA 1B31A 2CHOA 1YQ2A 2WMIA 1JZ6A 1OIMA 4AZCA 3RJXA 3WFLA 3AXXA 3AROA 2MANA 3WDIA 4M81A 3GXMA 2G3NA 3CHFA 2OYLA 2DPEA 1W1VA 3VPLA 3HJEA 3VD7A 5BWFA 1V6XA 4AISA 1F4AA 1J0HA 1ISXA 3WKZA 1WZMA 2YL6A 4E8DA 1V3KA 4PMOA 5LYRA 1PIFA 2ZXQA 2WC7A 2GUYA 1XYFA 1C8YA 3KZSA 4UOZA 4U2ZA 1JG9A 4GO8A 4MPKA 2XSAA 2EPMX 3OLEA 3BH4A 3EMQA 4AIUA 1B90A 3VGFA 2DSUA 4F79A 2D0GA 5A6JA 4AZ6A 3CZ8A 5GQBA 4D6DA 3WBAA 1G0CA 2YL9A 3MUY1 2WYSA 4NRRA 1RH9A 4HZ6A 2WHJA 1IZJA 1UWQA 2NT1A 2EPKX 1HKIA 2V3EA 1E6XM 5I23A 1KQZA 1CGXA 3M46A 1U30A 1E4LA 4J28A 1KXQA 2A3AA 5CLTA 1H49A 4Z2GA 1GOQA 1NQ6A 2W5FA 3TOPA 3MKKA 3CH9A 1VEPA 2X0HA 1WZAA 2CEQA 2E9MA 3TP4A 3AICA 3SEPA 4U3AA 4OOUA 1JDAA 1ODUA 3W26A 3FNDA 2D20A 1E3ZA 5E0CA 5FOOA 1HJVA 3AMGA 2GFTA 1ZU8A 3KL3A 4R27A 2BNJA 2CBJA 1GNXA 1GQJA 4IM4A 2YLLA 3DHPA 3AZTA 3D3AA 4D1JA 2J25A 1J0YA 1WE5A 1CIUA 3TTYA 2PWEA 1QW8A 1FHLA 1V02A 3GNPA 4IPLA 1FA2A 4YHGA 4CU8A 1E1EA 4B3LA 5IHRA 4D6HA 1UKQA 3RM8A 2J74A 3ZSSA 1AQ0A 4C7DA 5I6SA 4AZ7A 5DF0A 1WPCA 2UY3A 2GJXB 2VURA 1NOFA 2W61A 4UQDA 1W3KA 1VFFA 2CHNA 4W93A 3UCQA 1WO2A 1OGBA 4LPCA 3RJYA 3ZSTA 1US2A 1BAGA 4U2YA 4JCLA 3GXFA 3W82A 1MYRA 3RO8A 3U7VA 5LA2A 3VIHA 2W4XA 1UR2A 4PTVA 2YJQA 5A8OA 3ZJ8A 4OZOA 4M29A 4ML4A 2JALA 4UOQA 2VJXA 2X8RA 3AYRA 4ACYA 1L0PA 1E4IA 1GQIA 1UWSA 4D71A 3VINA 5CG0A 2X09A 4M80A 2D24A 1EA9C 1ZB5A 1NWRA 3CHDA 2GK1B 3N17A 3OB8A 4V2XA 2D2OA 3THDA 1MQQA 5A8QA 3VMOA 2YKKA 2BHUA 3OZPA 4HA3A 4KRTA 4ZFMA 3WQ4A 3OGVA 3VNYA 3ARQA 3CGTA 5CPTA 3GZAA 3AIEA 1D7FA 2BVYA 1LF1A 3VTRA 2D0FA 5GNZA 3A4AA 2VUYA 2X0YA 4J3WA 2Z1SA 1MQPA 4MJ4A 1GORA 5JIPA 1FP8A 1JF5A 1BTCA 3WUEA 3LMYA 5BXPA 1C8XA 2JE8A 3RPMA 1UH3A 2DT1A 1V08A 4GIAA 3WDRA 1CLXA 3KL5A 1EDQA 1E3XA 3WQ8A 4DM2A 1VBRA 1PEZA 3G6MA 1B2YA 1TVNA 3IJ9A 2EPNA 4AD4A 4CN1A 2J62A 1R7AA 3CHEA 3RM9A 1HJQA 2EQDA 4IUGA 3CPUA 3SCWA 2DH2A 2ZUVA 3II1A 2EJ1A 4OUEA 4CCCA 4WLCA 1DP0A 2E8YA 4LX4A 2HISA 4W7VA 3ARWA 1H5VA 1J0JA 1V3JA 3SUTA 1GOIA 5D9OA 5EFDA 3WMBA 3W38A 2QMKA 1BG9A 5IFPA 2FH6A 3VIIA 4UR9A 2FHCA 1I1WA 1CXIA 5BRPA 1KBKA 4S3JA 5A1AA 1QI5A 1DWFM 2CIPA 4UFMA 1CNVA 1X1NA 1B3WA 2VCBA 4MADA 4W7UA 1UD8A 2NW0A 3T2PA 2VR4A 1E6ZA 1MWOA 3AXIA 1ISVA 1Q4NX 2OSWA 1CXHA 3M7SA 4Z2LA 3FHQA 1V0KA 1JDCA 4AIOA 3L4TA 4C7FA 3IK2A 4JKLA 2VZSA 5GPRA 4CVWA 2D23A 1C91A 4CCDA 4PUDA 5D8WA 2YDRA 2XJ7A 3GTNA 1DHKA 4KH2A 5A6BD 1DWIM 1UYQA 4HMCA 3WNPA 2BXYA 3CLWA 1UD5A 1V3LA 1PPIA 4KRUA 4QLLA 1XH2A 1BLIA 1R7OA 1GQLA 4PYSA 2X05A 3U57A 2FDMA 5D9NA 3ZM8A 2JIEA 2D22A 1LL7A 3FAXA 5DT5A 1CEOA 1DWAM 2Z1KA 4XZWA 3VUPA 1HVQA 1KQYA 4BQ5A 3AYSA 1BPLB 1E6PA 4E8CA 2VO5A 3AI0A 3AFBA 2WC4A 4F8XA 4LYQA 5GNXA 1E40A 2XVGA 1JZ2A 1BF2A 4JAWA 3BAKA 3F4VA 1TCMA 3L4WA 3MMWA 2DSKA 3AMLA 1KFWA 4WJXA 4WKHA 5CXPA 5ABEA 5BCAA 3OLGA 5I0DA 2RGLA 1CZ1A 2VZUA 1M7XA 4HOWA 2PWFA 1V3HA 3QR3A 2ZWZA 4AXNA 2G3IA 1B3ZA 4MB5A 3WH5A 3WF1A 3VIJA 3PN8A 1MVYA 4TX8A 3PBGA 4AZ5A 2J47A 1P6WA 2Y8KA 4J7RA 5HXMA 4FMVA 3TTSA 1SMAA 3M6DA 5I77A 3FY1A 3MUAA 2VRJA 1QI3A 3JUGA 4HA4A 3PZTA 1PX4A 1J0IA 2O9RA 1OD0A 2EXOA 3WF3A 3U7BA 1BVNP 1TUXA 2XFFA 5EBAA 1VIWA 4N42A 5IHSA 3SCQA 4JL1A 2XIBA 4GI6A 2YDQA 3OGSA 1E0XA 3CUIA 3CUFA 3MUZ1 3VILA 3W37A 1W3JA 2YL8A 1TVPA 1VRXA 4X9YA 1ODZA 1QPKA 1S46A 3WDJA 4D6JA 2QHAA 1GZJA 1HKJA 4CD8A 2CESA 1W3LA 1UR9A 3KE0A 5CSUA 2V3FA 2XSBA 2VQTA 1JAEA 1HXJA 4J3UA 2WK2A 4NSBA 3AHXA 3U5YA 3GYCA 4TVDA 1GPFA 2OWWA 1RP8A 1JFHA 2WCGA 3UERA 1J12A 1JD7A 5FCZA 3PTMA 1GW1A 1LJYA 2BXZA 4HU0A 3I3DA 4UTFA 1J10A 1QHPA 1XSIA 3UESA 2WBGA 1UKTA 3GXDA 4H2CA 3B9EA 2BHYA 1JYNA 2GJXA 2WHMA 5BXSA 3D5HA 1G5AA 4LXFA 1G1YA 3T0BA 2WVUA 3F5KA 4AD1A 4L4OA 5A6BA 3MMUA 4FF5A 4CN4A 1B3XA 2VRKA 1JZ7A 3AQUA 3TTOA 4PMUA 3I3BA 4AIEA 3DHUA 4PMNA 4ATLA 3CZJA 1NH6A 1BYCA 1KCLA 3ARXA 1HJSA 4Y7EA 1UR1A 3FW6A 2OYMA 1FFRA 1HT6A 2CBVA 1U2YA 5E6ZA 1W9XA 2CBUA 1LG1A 2WMFA 4UQAA 2A3HA 2BHZA 2B31A 1B3VA 3MSGA 1JXJA 1BFNA 2CKRA 1ZS2A 2VR5A 4W7WA 2AOSA 1CGWA 2PWHA 4AMCA 3QOKA 4KWUA 3T09A 1KXTA 5ABFB 1XSKA 4V27A 1EH9A 4BQ3A 3IAQA 3MV01 3OLDA 3PTQA 5M03A 4D1IA 4RL3A 2Y8VA 3ALGA 3T08A 3CBWA 3W4RA 1XCXA 2GK1A 3W53A 4JFVA 1TG7A 1TFVA 4QFUA 2CITA 2XHYA 3L4YA 1UQYA 3VO0A 4Q7NA 3L4UA 4A4AA 1QBAA 2O92A 1W2VA 4GI8A 3A4WA 4BS0A 2DGAA 3W27A 2WLYA 3SURA 4UFHA 2YIHA 1W9PA 2AAAA 5DO8A 4AYSA 2W91A 3T0AA 4TXEA 5C71A 3FHAA 1WAWA 2G3JA 4PMYA 2O9OA 4K68A 4U5KA 4W84A 1V02E 2ZE0A 1M04A 5D4YA 1C92A 3OGRA 4U33A 3EMZA 4DM1A 3WN6A 1ZBVA 2BVTA 3PZQA 3ZJKA 2J7BA 1HNYA 5JIWA 3VM7A 3TTQA 3VU2A 5CGMA 2VCCA 4Z2JA 3LPGA 2NSXA 4EANA 1ITCA 2WKLA 1DEDA 1E71M 1ZBKA 4D6IA 1E5JA 2ZUSA 4JFWA 4MNLA 3GH4A 3BMWA 4CD7A 1H41A 4B3KA 3DYPA 4DWSB 3L4VA 3OA5A 2WZEA 2OSYA 2VZOA 4PSPA 3WIJA 1G94A 2G4FA 1CXKA 6TAAA 5A95A 2ESCA 1EDTA 2DIJA 2V5CA 2XG9A 5A8NA 4JFSA 1XV8A 3WDQA 1OBAA 2ZX9A 4GKLA 4M82A 2D3NA 3VGBA 3ZR6A 2DT3A 1EDGA 4BA0A 4H04A 1XC6A 2WMGA 3BCDA 5C70A 2PC8A 2ZX6A 2J7EA 1UR0A 5KEZA 1MXDA 1ZJBA 3B9DA 3BAYA 1JNEA 5LA1A 3KWXA 1SMDA 1NWTA 2XVKA 2WHLA 5A94A 3T0DA 1XD0A 3MUIA 5KZ6A 2JIWA 3AHYA 4KGLA 3WF2A 4YPJA 1UA7A 1W1TA 2ZXDA 2E3ZA 3HU7A 2ZWYA 1QBBA 3T2QA 3WNLA 3MS8A 2VX7A 4D6GA 4H8UA 1K6AA 1OWQA 3NYDA 1VFOA 3DYOA 5ABGA 2Y2WA 4P8XA 4UQBA 4PSRA 3WQ6A 3VIGA 3VD9A 1KBBA 1TA3B 1CGTA 1XGZA 3VDHA 5GNYA 1KGUA 2A3CA 4NZCA 2C0HA 1AQMA 1EQCA 5HPCA 1E5NA 3VGGA 1MW0A 1XH1A 4HP5A 4PUEA 1GQKA 3ARPA 5A6SA 1JL8A 1A47A 5A2CA 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5DFAA 3O6AA 4PTXA 1Q6DA 2XGBA 1WDQA 1J9YA 4J3XA 1QHZA 1KWKA 3BCFA 1QNSA 4UOJA 3NCOA 3ZT6A 2OWXA 4F9DA 3RCNA 5AYBA 2IXUA 4U3CA 3BLPX 5E6YA 3W0KA 1GHRA 4TVUA 5CSYA 3WD1A 1TR1A 3WELA 1UUQA 2XYLA 3AMKA 3NDYA 4IISA 3ZOAA 2DSWA 1QI0A 3ARSA 2J75A 3N11A 1JGIA 1W2PA 5ABFA 5DMYA 1TZ7A 1JYWA 5CPSA 3GXIA 4RE2A 1W1PA 1FH8A 4HPHA 2VNCA 1OCQA 4GINA 1FH7A 3S6TA 1JI1A 4TX6A 2C7FA 3WD2A 4D6EA 4RE4A 2YL5A 3WNNA 1CPUA 1B1YA 5FL0A 3VNZA 3VMNA 2IUZA 2BVDA 4NF7A 3ARRA 1EOMA 1ZL1A 4TUFA 4PEEA 4S3KA 4MAZA 4JZ5A 4QLJA 2ZX5A 1CYGA 1EO7A 1NP0A 4UFKA 2WZHA 2WSPA 2YBTA 4MB1A 2PWDA 4AY1A 4E4PA 3WEOA 2WXDM 2A3EA 3WH7A 5AC5A 4MJ2A 3IJ8A 3WNMA 1UR4A 1HKKA 3A3HA 4CVUA 1M03A 3VIOA 1GOOA 1HJWA 1MQRA 3EDDA 1UD4A 2J8FA 3HMCA 4LQ1A 3AHTA 4TVCA 3AIUA 1CXFA 1KXHA 3PZUA 4JKKA 1GVYA 1WCGA 4DWSA 1ZBWA 4GPNA 3BLKA 3N12A 3OZOA 3AIQA 5I24A 5AYIA 1CGVA 1C90A 2E9LA 5JBEA 2Y4SA 3BSGA 1EOKA 2CKSA 3W28A 2WMJA 2WKGA 1JI2A 3G6LA 1B3YA 4WSKA 4B9ZA 5JBDA 4AD5A 4B9YA 1QOXA 2ZOXA 3WSUA 1CGYA 1H0IA 1AQHA 3BAIA 2RGMA 5JUVA 1B30A 4PTMA 2UY2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3RJXA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations