3RM6A

Cdk2 in complex with inhibitor kvr-2-80
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
298
structure length
293
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTGVVYKARNKLTGEVVALKKIRTEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Structure-guided optimization of novel CDK2 inhibitors discovered by high-throughput screening
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 293
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3rm6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3rm6A01
1PXJA 5L2WA 2J0LA 5BYYA 4YNOA 2Z2WA 5K0XA 2YIXA 4QTCA 4O2ZA 1XH9A 3IO7A 3VBTA 4QNAA 1URWA 3H0ZA 3FQSA 3ZRLA 1UA2A 3HNGA 4XV3A 2WHBA 4YZNA 4ZS0A 3R9RA 3GVUA 4BVUA 2YIRA 5FG8A 5IQHA 4G6OA 4I92A 2YM7A 4F65A 4ZTQA 1XWSA 3RWPA 4WG5A 2I1MA 3A2CA 4XNEA 2Z7QA 4DFZE 2BVAA 5ANJA 1OKVA 4NM0A 4PMPA 1IAJA 4AF3A 3R7IA 1YW2A 4LM5A 3KCFA 3O17A 2EXEA 5DRBA 4YJVA 3ATSA 4X2KA 3ERKA 4AT4A 2WTVA 2WIPA 2YWPA 4HCVA 2H34A 5EOBA 2BTRA 2QQ7A 2PVMA 1VZOA 3ROYA 4QP1A 3UPXA 5M07A 5L2IA 1Y6AA 3MW1A 2OXDA 3CTHA 3QF9A 4QMNA 4KUJA 4KIKB 5AX9A 4HW7A 3GBZA 4FKPA 4XV2A 2BRNA 3F6XA 4FV8A 3KEXA 1ZY5A 4W8DA 5IQCA 1OKZA 4PMTA 4ACHA 2EB2A 4L00A 1WBNA 4U0IA 3Q6WA 1I09A 2QOFA 1DI9A 3GU5A 5KBQA 5KCVA 3MVJA 3ZXTA 3UBDA 4ZS4A 4YGAA 5FXQA 4DEHA 4EHEA 2WFYA 2OJIA 4KBKA 1Y57A 5FM3A 2JBPA 4O1OA 5E1EA 3LMGA 3CR0A 3FMDA 2V0DA 1CTPE 3MB6A 3LM0A 2XJ0A 3UO6A 3BWJA 3R71A 4ALUA 4OT5A 5E8SA 4EI4A 1RJBA 2ACXA 3IW5A 3PJ3A 4BN1A 4FK3A 2XK9A 3ODZX 3QQHA 3CE3A 4FKGA 4D4SA 4YBKA 4G16A 4IFCA 4JNWA 5J5TA 3ETAA 3O8PA 1ZRZA 4ZTHA 4L3PA 4XG8A 4KNBA 2DUVA 4N4SA 5G6VA 1UVRA 2GS7A 5HD7A 4AACA 4BRXA 4WSYA 1A06A 3QHRA 4XMOA 4EK5A 1CKIA 5E8XA 2B9IA 3AXWA 3LM5A 1UKHA 2WMRA 4W9XA 4YC3A 4CNHA 2QG5A 5HCZA 3DQXA 5DT0A 4IXPA 3DB6A 5T6KA 3FLSA 3RVGA 5LVLA 2A0CX 3B8QA 5BVWA 4BBMA 5HTIA 5M06A 3PXZA 3U8WA 3EYHA 3NNVA 4O0RA 3R8VA 2C1AA 4JG6A 1QMZA 3ULZA 3OC1A 5LMKA 3KF4A 4QPMA 4A07A 2W5AA 3A61A 3R6XA 5FLFA 4E6QA 4F0GA 4F64A 3D5XA 1J7IA 4PTCA 3ZM9A 2JDVA 4IZAA 4WRGA 4YZDA 4AN9A 4MAOA 2JDTA 4HVHA 1H0WA 1OM1A 3FQHA 3HYHA 4JLCA 1YWRA 2VTPA 1YDTE 3GXLA 4ANNA 5IU2A 1NT2A 5E8UA 2WTCA 3COIA 4FT5A 3Q3BA 5FTGA 2CKPA 4NUSA 1ATPE 2PY3A 4ZSEA 5FEQA 4BCIA 4JBVA 4O7ZA 3RI1A 4C3PA 3MVMA 3MFUA 3WI6A 3P4KA 3SQQA 4FIIA 4L67A 5D7AA 2RG6A 4NM7A 5HQ0A 4BFMA 4IBMA 4JBQA 1W83A 4Y46A 4F7NA 2IZRA 3QZGA 2XIRA 5L4QA 2VO6A 2QU5A 2WELA 3CEKA 4FX3A 5C9CA 1VR2A 3BV3A 3IG7A 3KCKA 4J98A 4JQEA 3L9MA 5DNRA 4I5HA 2QNJA 4BDJA 2BRBA 5ANOA 4USEA 3VS6A 3NYVA 4MF0A 1GZNA 5HKMA 3R7VA 2YZLA 3Q2MA 1ZAOA 2VD5A 1Q8TA 2QLQA 4A9YA 4ALVA 4B8LA 5KHXA 3BBTB 3ET7A 3A7IA 2WOTA 4QMZA 4EOIA 2UZEA 1PRYA 4BY9E 1YOMA 4QMYA 1HCLA 5J1WA 4R3PA 2ITYA 4GMYA 4Q2AA 1ZMUA 5JFSA 3C51A 4RIWA 3C4ZA 4B9DA 4BKJA 3A60A 5AP2A 2WMVA 4X3JA 4FA2A 4QD6A 2BDJA 2BAQA 2GU8A 3EL8A 2P4IA 4UMQA 4PWNA 3FC2A 3NIEA 4RWJA 3UVPA 3QA8A 3N4VA 2QOOA 4ZP5A 3MTFA 2R3RA 4I4EA 2G01A 4FG8A 4A4LA 1R0EA 4F4PA 3BHVA 4O2PA 4R7HA 2WMSA 2EXMA 5FEEA 5IH5A 3JPVA 5CEQA 5BMSA 4TWPA 3FLWA 4NTSA 4F0IA 4DBNA 5I9UA 5LMAA 4JRVA 3RTPA 2ZJWA 3PIYA 2UVZA 2WTWA 4DTKA 4DT9A 3CY3A 3F5PA 4BYJA 1MP8A 3DK3A 4IZYA 3FZSA 4D1ZA 5C8NA 3AD5A 5CEKA 4EOSA 1ZWSA 1FPUA 2PK9A 2PZPA 5CU6A 2XNPA 4OTPA 3KMWA 5BMMA 4FC0A 2OLCA 2QOIA 2UV2A 4IJ9A 3FZOA 4DH8A 5BX0A 4O7NA 4QP2A 2EUFB 3UIXA 3GT8A 5DR2A 3BCEA 3F82A 2ERKA 4CG9A 2VTHA 4A06A 3WIGA 5M56A 2YHVA 4FNWA 3L8PA 5GINE 2WU6A 3U4UA 3HV7A 4IMYA 4A4OA 4IX6A 3OW3A 5BNJA 3D5VA 3Q4TA 5LJJA 4AFJA 4PL5A 4MKCA 4IX3A 2RFDA 2XKFA 5CTPA 4FV3A 3SDJA 3FMNA 3ZUTA 5A46A 4FKIA 3OWKA 3HMMA 3NUSA 3QTZA 4YSJA 2WQOA 2I0VA 5IH4A 2JKOA 2CLQA 4ENYA 5AX3A 4KKHA 4USFA 2DYLA 3VJOA 4ACDA 5IUIA 4AGUA 3FY2A 3UZTA 2WMAA 4EK6A 3ZOSA 4U5JA 4DH1A 4F09A 4EYMA 3E8EA 4E73A 2W1FA 4EQCA 3IK3A 3UDBA 2W4JA 3LHJA 3D7TA 2G9XA 4ZY6A 5IQFA 4D4RA 4QTEA 1SNUA 1GY3A 2C5VA 2J7TA 3R7OA 2H96A 3GOKA 1KV2A 4MCVA 4E4LA 4CVAA 4U6RA 4ASXA 4FKVA 3CKXA 4YTIA 5AWMA 1V0OA 2VWYA 4C59A 3THBA 2X8DA 1H1QA 4JBOA 4TN6A 2Z7SA 5HO7A 5L2SA 3LJ1A 3ZSHA 4DFLA 1LUFA 2V5QA 2QOCA 4FE2A 5E9EA 1DS5A 3KMUA 4DFUA 3MPTA 3Q60A 1Q41A 3PZHA 2UW5A 3DKGA 2IPXA 4C3FA 4F08A 5HVYA 3QKLA 2UVXA 1PKDA 4CMOA 2C4GA 3ACKA 5KMJA 2R3GA 4ANSA 5G1XA 5M57A 1H27A 3MESA 2FSMX 3EL7A 4KABA 4NCTA 1PXKA 3R7YA 3VHKA 4F9YA 5B2LA 4FKTA 3E7OA 2NRUA 3A99A 5ANGA 4PF4A 4N57A 2B0QA 1R1WA 3R7UA 2JAMA 2BTSA 3OY3A 2F4JA 2GS2A 4U81A 4O96A 4TYGA 4B99A 5A6OA 1BYGA 2ZV2A 1H1WA 3GQLA 3OROA 2IJMA 4RIWB 2EB3A 3R2YA 1XBAA 3HV4A 4KBCA 2ZMCA 2HY81 5BVKA 4HGTA 5LVNA 2C5OA 4KS8A 3VBYA 2PUPA 4YPDA 3W2QA 4FT9A 4FV2A 2YCQA 4MBJA 4TPTA 3TV6A 1GZOA 2O64A 3SHEA 1P4FA 1S9JA 3NWWA 1KE5A 4ANQA 4CYIA 5EI6A 3REPA 4BCKA 1WVYA 4XG2A 4BZDA 2X4ZA 1Q8ZA 2AUHA 2F7XE 4QOXA 2OKRA 3ZRMA 3ZSGA 4ANBA 4AN3A 4FKLA 2YCSA 3D5UA 5AV2A 3QD0A 2GHLA 4R7IA 4JL9A 4BIEA 2F57A 4N0SA 4RX9A 3D0EA 3G6HA 4K8AA 4RFYA 4CQEA 3Q32A 4B7TA 1IRKA 2J2IB 4QMPA 2JDSA 3ZHPC 3RNYA 1R0PA 3ZUVA 4NYEA 4DA5A 2IN6A 2QR7A 5GNKA 5AAEA 2QKWB 3QX4A 4KAOA 2YLFA 3VWAA 5K5NA 4D5HA 3C9WA 4DGMA 4M0ZA 4KWPA 4MX9A 4IH8A 5AR3A 2J9MA 5I9WA 5C4LA 3HRCA 4EJNA 2X7GA 3VS2A 2ONLC 2PULA 3TUDA 1P4OA 2C0TA 3PWDA 4I94A 5L6OA 2VUWA 4OAVB 3QRIA 5GIPE 1OIQA 2ITNA 4FL3A 3ZLSA 4C36A 1P5EA 2F7ZE 3AT2A 1BX6A 2VWUA 3LW0A 3QZFA 4WIHA 5AV4A 2W7XA 5AA9A 4ANMA 5CSPA 2QOLA 4IDVA 4WNOA 3I79A 3GCPA 3IQ7A 3VBQA 5CVGA 3MFSA 3T8OA 1PHKA 3TEIA 4CV9A 4RBLA 4W4VA 3ID6C 4R8QA 4WG4A 3AG9A 3VUGA 5IMEA 3VC4A 4MWIA 5EW8A 4F9AA 3JVRA 2BAKA 2XNEA 5CLPA 3TDVA 3B2WA 2P55A 5HO6A 4AOIA 4F7JA 2W1GA 3POZA 4ANOA 4ZY4A 3D7TB 1J1BA 3AD4A 2PUIA 2X8EA 4X21A 3UC4A 4RVKA 4FEVA 3QAME 4FTOA 4UEUA 3VIDA 4RVTA 5AUTA 3BX5A 5IISA 2C30A 1W82A 4FUYA 3CBLA 3KFAA 3CS9A 4FT0A 5AV3A 4BCOA 4DT8A 2WTKB 3MPMA 1H8FA 3FMLA 4FNXA 3NX8A 4J71A 3ZSIA 1HCKA 3W55A 3HAMA 3PY3A 2BROA 3FKNA 3PJ1A 4EORA 4IVAA 5AADA 4R7BA 3MIAA 1XH6A 3D9VA 4HYUA 2WTDA 2QOBA 4YC8A 3RPSA 3TZ7A 2UZDA 3OT3A 5AIKA 4E6DA 5C4KA 3GEQA 2X1NA 4HYSA 5GJDA 3FL4A 2R3KA 3GOPA 4U41A 3SAYA 4DN5A 4UZHA 4EH9A 3NNWA 2B55A 4IWQA 5KKRC 4OBQA 4FTQA 2CGVA 2VTJA 3HZTA 4I93A 4QMVA 1TVOA 2BCJA 3Q4ZA 3UOKA 4FV4A 4U3YA 4L7SA 5DGZA 2W1IA 1WFCA 4EBWA 4UWYA 2C6EA 4AW5A 4E4XA 5CAUA 4PRJA 3TNQB 5HIBA 3KF7A 3ZFYA 3DXQA 5FUTA 5HVJA 4DGLC 5AAGA 5JFVA 3KA0A 2VTMA 5AUUA 4ANLA 3MA3A 2CN8A 2JLDA 3Q6UA 4OTDA 4PUZA 5J9YA 4JIKA 4M97A 5CAQA 4XG6A 4ITHA 2XKCA 3C5UA 1YWNA 3R9DA 4TWOA 4C61A 4FT3A 3HVCA 4U42A 3BGPA 4OTWA 3ODYX 2R3OA 3V8WA 2VX0A 3G9NA 4FSQA 1OL1A 2PZ5A 1Y91A 3MGYA 1B6CB 4G3EA 4O0SA 5D9HA 4AE6A 3BRBA 3DU8A 3Q04A 4QYHA 4YR8A 4GEOA 2XIZA 1GAGA 4ZIMA 4O0UA 2BZIB 2R3LA 2GPHA 2RFNA 3D4QA 2R3JA 4MNFA 1YWVA 2YACA 3F5XA 3GC0A 3HA8A 4L46A 3ULIA 3MWUA 4IAFA 3P0MA 4FZ6A 4IB1A 5FBNC 3OOGA 2GQRA 5EQEA 3GB2A 5CSXA 2VTTA 4BBFA 3NUNA 4FSYA 2HELA 3HMOA 4ORKA 4YJUA 3I6UA 3C4FA 1OL5A 3QQLA 3S2PA 2B7AA 5H8EA 3NNUA 3G2FA 3I0QA 5LMKC 1JSTA 1JBPE 3DB8A 4JDIA 4BDDA 2VWXA 1Q3WA 4EK4A 5J7BA 3SOCA 4O86A 5CY3A 3EHAA 2ZDUA 4YZMA 4RX5A 5IA5A 2XEZA 4FYNA 3R9HA 4CFFA 4JDHA 5HG5A 3VUMA 4G2FA 4U80A 4BDAA 5A9UA 2HENA 4BDEA 3ROCA 3I81A 3VS3A 4HCUA 5DA3A 4AZTA 5GZ8A 5F94A 2FH9A 4FV5A 3O7LD 3DA6A 3EQDA 1OGUA 4L9IA 3MH0A 1WBOA 4QNYA 4FTCA 3F69A 4QPSA 4YZ9A 3UGCA 5DR6A 4YURA 2IZTA 3SG8A 4M14A 3KXNA 3TG1A 3RPVA 4AGDA 2OF2A 2WPAA 3HLLA 4RQVA 5DEWA 3WIKA 2BDFA 2BZJA 4TYJA 1PXIA 3OCSA 3OMVA 5KO1A 5BYLA 1V0PA 3IW4A 3KXHA 3L9PA 4ZY5A 5CF4A 4PL3A 2Y6MA 2ETRA 3LCTA 3EFKA 3GU4A 4O21A 5DG5A 1MRYA 4EH7A 4QYEA 3OHTA 4S31A 5FEDA 3HECA 1PYEA 2OK1A 4K0YA 3B8RA 3GC9A 4APPA 4EOOA 3UNJA 4JS8A 4UN0C 5TR6A 5I9XA 2ITUA 2F49A 5HLPA 4CMUA 2PVYA 4LUEA 3ORPA 5C26A 5JT2A 5L6WL 3G33A 2QONA 4YTCA 5KMOA 4PDYA 4F6UA 2FGIA 2IVSA 3FKLA 5FWKK 2R0UA 4J95A 4EZ7A 2W99B 3M11A 2JIUA 3U9CA 4GVAA 3IS5A 5GJFA 2PMOX 4ZXTA 3KC3A 4F7LA 4WUNA 4PNKA 4EUTA 4GV1A 2F9GA 5AR5A 4DAWA 4Q9SA 3NW5A 3R00A 3EZRA 5K0KA 2ZM4A 3I60A 1Q8WA 3PVGA 3U87A 3EQFA 5IEYA 1JSUA 4XRLA 4NKAA 1LR4A 5KMNA 3OD6X 4L45A 2WKMA 3NAXA 4Z9LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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