3RM8A

Amcase in complex with compound 2
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
YQLTCYFTNWAQYRPGLGRFMPDDINPCLCTHLIYAFAGMQNNEITTIEWNDVTLYQAFNGLKNKNSQLKTLLAIGGWNFGTAPFTAMVSTPENRQTFITSVIKFLRQYEFDGLDFDWEYPGSRGSPPQDKHLFTVLVQEMREAFEQEAKQINKPRLMVTAAVAAGISNIQSGYEIPQLSQYLDYIHVMTYDLHGSWEGYTGENSPLYKYPTDTGSNAYLNVDYVMNYWKDNGAPAEKLIVGFPTYGHNFILSNPSNTGIGAPTSGAGPAGPYAKESGIWAYYEICTFLKNGATQGWDAPQEVPYAYQGNVWVGYDNVKSFDIKAQWLKHNKFGGAMVWAIDLDDFTGTFCNQGKFPLISTLKKALGLQSASCTAPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Acidic mammalian chitinase
publication title Identification and Characterization of Acidic Mammalian Chitinase Inhibitors
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 133
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2011-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3rm8A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3rm8A01
2YL8A 2YJQA 2B31A 3ECQA 1V08A 3WNNA 4DM1A 3HMCA 3TTQA 3AIVA 1H0GA 4H8VA 2ZX7A 3PZGA 3B8SA 5ABGA 4MPKA 1RH9A 2WSPA 3LPFA 1K6AA 3AHYA 4UFHA 1XH2A 3RJXA 1IV8A 3QHOA 1CXIA 4V28A 4OKDA 1TFVA 2YL6A 1PBGA 3NJ3A 1HKIA 1OSEA 1TA3B 2Z1KA 3VOCA 9CGTA 4NSBA 1LL6A 2NW0A 3ZR5A 2E4TA 2JIEA 3SCOA 4OUEA 1HL9A 2OSXA 8CGTA 2BXYA 4AIUA 5A8QA 1SMAA 1PEZA 1XD1A 1FFQA 1SFSA 3POHA 4DUWA 1E73M 4HOZA 1CTNA 4RE2A 1E5NA 1EGZA 1RD6A 2O9RA 4GXPA 3SUVA 4GI6A 3BMVA 3VIFA 2YL5A 3T2PA 1CWYA 3BAKA 4GI9A 3RM9A 3THDA 3IAQA 2EJ1A 1XCXA 1YQ2A 4RE3A 2XG9A 1G01A 2VC9A 1OD8A 1GONA 1VFUA 2X0HA 1E6NA 2BHYA 3UG5A 2VMFA 3WEZA 4CGTA 1B3WA 4R5EA 5DEZA 1JXJA 5ABFA 1XV8A 1UWSA 3HU7A 2EEXA 5IFTA 1HP5A 5I77A 1OWQA 2OSYA 4D6DA 3EBVA 2XFRA 4QCEA 2QF8A 1JI1A 4E2OA 3W6MA 5EMYA 3T0DA 1NP0A 2PWFA 1I1XA 2DT2A 2WYSA 2ZUMA 4QAWA 4HZ6A 1OINA 3AMLA 2MANA 1V6VA 4C7GA 3VDHA 1XD0A 1HVQA 3CZ8A 1DWJM 3LMYA 3MUY1 3B9DA 3SUUA 5KZ6A 4PTXA 4CD7A 2WXDM 2CETA 2Y8VA 1E0VA 2VR4A 4UR9A 2WLYA 4CN4A 4U2ZA 5I6SA 2FDMA 4YHGA 4D6CA 4HA4A 1L0PA 1JD9A 2WMKA 4PCSA 2CITA 5BRQA 3G6LA 2E8YA 1FOBA 1V6XA 3SCPA 1BYDA 1BSIA 2A3EA 1W3JA 1H2JA 5LA1A 4W5UA 3WD3A 4HPGA 2VVSA 1I75A 4BCEA 4QLLA 1MW3A 1FP8A 4UTFA 4OZOA 2WHLA 3AMDA 1EQPA 3CHFA 3FN9A 1B3VA 2PWHA 2DQXA 5CGTA 3AOFA 4PN2A 4U31A 1MFVA 3CZJA 2XTKA 3PTKA 3EDDA 1JF6A 1G94A 4TX6A 1R8LA 2O92A 4TUFA 1WZAA 1HJVA 2VCAA 4JFVA 4TTGA 2CCRA 4XUYA 3W81A 3PZMA 4NF7A 4AZHA 5HXMA 2VZVA 4CU8A 4D72A 4H8UA 1J0JA 4W7WA 2ZE0A 2W61A 3WH7A 3NSNA 4W84A 4LYQA 3EDJA 4M81A 3WQVA 4J3WA 3WUEA 1GNXA 4QFUA 3K8KA 5E70A 4M82A 2ZUUA 4UFIA 1WE5A 4M56A 2RGLA 4WKFA 2V5DA 4UFKA 2O9TA 1SMDA 2O9OA 1V6YA 3WD0A 1JI2A 3GTNA 2WNWA 4GPNA 3W26A 1NWUA 4CCCA 5E0CA 3SCSA 3GNOA 4Q7NA 2J7GA 3KL0A 3OLGA 2WVVB 3M07A 1UR0A 1BAGA 3NDZA 4LQ1A 1JZ6A 2WHJA 1NARA 1XGZA 4TX8A 3TTSA 3W28A 1WNOA 3MMUA 2ZXAA 1C8XA 1E6QM 1V3HA 4D6IA 1JYVA 4K68A 3UEQA 4WKHA 4PRWA 1UD5A 4AZCB 4Z2HA 4PCTA 5BROA 1EQCA 4MB4A 1NOUA 2EPMX 1JNDA 2G3NA 1PX8A 4J3UA 3VIMA 3NDYA 1E3ZA 1A3HA 3WDIA 3OZPA 2ZX8A 5IHRA 2BVTA 5A8MA 2E0PA 2WSKA 1W9XA 3RCNA 2D0HA 1UUQA 1V6WA 1J0YA 3KE0A 7CGTA 3DYMA 1JXKA 3VIHA 2Y2WA 2GJXA 4DWSD 1EOKA 1ZBCA 2VL4A 4TXEA 2DIEA 3WNOA 1WO2A 3ZJ6A 1JGIA 3F5KA 3IJ7A 1B90A 4F66A 3QHNA 2UY2A 3OZOA 2WWDA 2D22A 1EA9C 2CEQA 1B30A 1Q6GA 1QNOA 4HMCA 4U5KA 1C91A 3CBWA 3OLDA 3BCDA 2RGMA 2XFFA 3AICA 4ATWA 1QPKA 1AQMA 1GW1A 4JL1A 1B9ZA 5KEZA 1E6PA 1NWRA 1MXGA 3WNMA 4OJYA 1QBAA 3PZQA 5DF0A 1EHAA 3ARZA 1GOMA 3AYSA 4GI8A 3VVGA 1ZB5A 3RDKA 1UH2A 3CIVA 4CCDA 1UD3A 3T2QA 3S6TA 3WKZA 4AWEA 2DPEA 3ALGA 3ZJ7A 1GVYA 1E71M 3U7BA 3ZM8A 3WBAA 3L4XA 1C7SA 5AC4A 1BG9A 4X9YA 4HPHA 1KXHA 1RPKA 1BVNP 4J3VA 4QLKA 4MNJA 2ZUNA 3N18A 1E1EA 2CBVA 4MADA 1VRXA 2D0FA 3M6DA 4HP5A 2AOSA 4MB5A 4B3LA 4F79A 4MB3A 3CUGA 1I1WA 2X1IA 3N9KA 1BYAA 1D7FA 4Z2GA 5ECUA 1EOMA 4F8XA 4Q22A 3WY1A 5GNYA 2BFGA 3RM8A 2X05A 3GNRA 3AIQA 1GQJA 4UZSA 1XSKA 2WHKA 5JUVA 1KXQA 3AISA 4M29A 1CXHA 1JFXA 5ABEA 3D5HA 2JIWA 4AZGA 1LLOA 3FXYA 2C7FA 4QDMA 3T08A 2UY3A 3GZAA 1QI0A 1W1TA 4Y7EA 1XHGA 3ALFA 1QNRA 2OWWA 1CZ1A 4M80A 1JF5A 2BY0A 5CPTA 3GH7A 4LYRA 3VDAA 5FL0A 3L4ZA 3AZRA 3AS2A 2YDQA 3U5UA 4AZ5A 2W4XA 5D8WA 1KQZA 4AZBA 3WMBA 2PI6A 1CLXA 1UHVA 2FH6A 4MNKA 1B3XA 1KGUA 1MQRA 1ZJBA 2YKKA 3MV01 2G4FA 4JKMA 4D6FA 4HZ7A 1B31A 2BVDA 1KWKA 1V3JA 1DWHM 2YDSA 3ZOAA 4AC1X 1DP0A 2CERA 3CGTA 3NIYA 3QHMA 2UY4A 3PZNA 1E9LA 3WENA 1OIFA 3VD9A 1EDTA 1KXTA 1V3KA 3WH8A 1J10A 4BQ3A 3RMEA 5BXRA 2XSBA 1JZ4A 1RP8A 1V3LA 4UFLA 1MQPA 4UOQA 1DWFM 3CZKA 1JNEA 3CO4A 1H1NA 3VINA 1QVBA 2E8ZA 3T0BA 1TMQA 4S3JA 3N15A 1ZU8A 4Z2KA 5A6MA 3PTQA 3VO0A 2VRJA 2NT1A 4HA1A 5CLTA 1ISWA 1MQQA 4N42A 1VAHA 1XH1A 4C7DA 1J18A 4WLCA 1WPCA 4V27A 3NUKA 1QI2A 3MSGA 2EO7A 4D6HA 1FH8A 4UFJA 3BAYA 3BAIA 3ZJ8A 1NQ6A 4P8XA 3SURA 1DWGM 1VFFA 3IK2A 5BCAA 1E4NA 2VI0A 3DYOA 1V6UA 2QLYA 2JE8A 2GJPA 4AD0A 3VX0A 5ABHA 5IXEA 2FH8A 1UR2A 3A4XA 3AQUA 3K4AA 5D9OA 2XIIA 3WL0A 2XYLA 3B9EA 3WH6A 4KGJA 1MXDA 6A3HA 4P8WA 1BPLB 3VU2A 2C0HA 4KRUA 5CGMA 1WZLA 3KEHA 4WJXA 2WM0A 1VF8A 4ACZB 2G8ZA 4UQAA 3WDPP 1CEOA 1X1NA 3VIGA 5A8PA 3PZIA 2OWXA 4CU7A 1VFMA 4CU6A 1HJWA 2VCCA 3AHVA 3ZO9A 1BF2A 2EBNA 5BRPA 1G9HA 1EDGA 1BHGA 4LYPA 4QP0A 1GZJA 3W24A 1GJWA 1OD0A 3BLKA 5A6KA 4BS0A 3IJ9A 1E6ZA 2VVNA 5D4YA 5DMYA 3W0KA 4UOZA 4Z2IA 1U2YA 1H4PA 4W89A 3VD7A 4HOXA 5A6JA 2CNCA 4PSPA 1XYZA 4UOJA 3CUIA 1ISYA 2QHAA 2IUZA 3I3EA 1OGBA 2WC3A 2ZWYA 3GDBA 1CNVA 2WK2A 1CGWA 2IXVA 2J8GA 3EDEA 2V3EA 4BZYA 4HU0A 4AD2A 4D1JA 3EDKA 4AISA 3VDBA 3NSXA 4MTVA 3U57A 1UR1A 3CMJA 4H2CA 4CN1A 4UZUA 4M24A 2YIHA 1OGGA 1QI5A 2VUYA 1H11A 3WIJA 1D3CA 1B3ZA 1QNSA 1JZ8A 3VGFA 3WEMA 4B9ZA 4P8VA 4XV0A 4PTMA 1A47A 2CKRA 2EPNA 4AXNA 2V3GA 3BCFA 1IT0A 1W9DM 3ZSSA 1O6IA 1IZKA 2VX6A 1S46A 3VX1A 1ZBVA 3UETA 3TA9A 1UH4A 1BGAA 2GJXB 4QCFA 3PZOA 3SCVA 2ZUWA 3SCRA 2CXGA 4ZXLA 5A6LA 2D3NA 2IXUA 2JF7A 2F8QA 1R7OA 1ISVA 2W92A 3W29A 2AMGA 1LG1A 3MUIA 5F7UA 1W1PA 2W63A 1GHRA 4U5IA 4OBRA 5CSYA 4J3TA 4HMDA 2GK1A 1GQKA 3O9NA 5DT7A 2A3AA 1JIBA 2GJRA 3W4RA 4JAWA 2WVUA 1KQYA 2VOTA 5FCZA 3VDCA 2EPOA 1GQLA 1F4HA 3BAWA 1SR0A 1WDQA 4CD8A 1F4AA 1GQIA 3OG2A 5JIPA 3PBGA 1J9YA 3CZGA 5C8BB 1J0HA 1LWJA 3WBEA 2PBOA 1GOIA 2XVLA 1MW1A 3A47A 5A2BA 3VMOA 1UD8A 2ZOXA 3AIUA 3II1A 4EANA 3MKKA 2BV9A 4PMQA 3GXIA 3N17A 1W91A 4DWSC 1PIGA 1BFNA 5BWFA 3I3DA 4W5ZA 5AY7A 4IISA 4J3XA 1XC6A 5A6BD 4RE4A 2XFYA 4DWSB 3RIKA 1LL4A 2WVSA 3APGA 1QBBA 1W32A 1J0KA 4S3KA 4F9DA 2QPSA 1X6NA 5CG0A 1HT6A 3T2OA 2WAGA 1UKSA 5A6SA 1H09A 1PJ9A 4MDPA 2OWCA 2CBIA 4WKAA 3VGBA 2W91A 3AXHA 2OYLA 2J7FA 3BH4A 2YA1A 5CSUA 4PUDA 3WQ5A 1E3XA 3BC9A 3VM7A 1FH9A 4AD1A 1KFWA 4JHZA 2CPUA 1W1VA 1NOFA 1V3IA 3VIPA 3DC0A 1H0IA 1WB0A 1O7AA 4M8UA 2XM2A 3ZQ9A 3FNDA 3KWXA 3MS8A 1HNYA 3ZJKA 2D23A 4H7VA 1ODUA 1M04A 4DUXA 2WHMA 1HN1A 4OIFA 1E6XM 5HBFA 1W9BM 1GOOA 3BMWA 2VR5A 4ACYA 3WF0A 1LWHA 3RILA 1EO7A 3K46A 1QW9A 3VMNA 2WMFA 3AXXA 2J25A 1FFRA 1HVXA 3EDFA 3WQWA 5JIWA 1KWGA 1VEPA 4B9YA 3ARTA 1E4IA 3PZ9A 3VIKA 1Q6DA 2WMIB 1C3FA 2E9BA 2PC8A 1BYCA 4TOQA 1UKOA 3N11A 4KH2A 2ZWZA 1BQCA 5HNNA 3EMZA 2J7BA 1JYNA 3AXIA 2E3ZA 2BNJA 5TD4A 4W93A 7TAAA 1VEOA 2VX7A 1GCYA 5BXTA 5E6ZA 3SCQA 1MWOA 3ZMRA 3CUHA 4CKQA 4Z2JA 4JKKA 4PYSA 4LX4A 3AHXA 3GYCA 3WL1A 1BVZA 2PWGA 2VCBA 4L4OA 4FLQA 3KL5A 4NRRA 4CD5A 3QR3A 4YPJA 1K9TA 3W53A 2XGIA 5FIPA 1AQHA 2CESA 2NT0A 5C71A 2QPUA 1JZ5A 2PWEA 2XIBA 4EAMA 3N12A 1C8QA 4TVUA 2J78A 4CUCA 2WLZA 2OYKA 2A3HA 3MU7A 3LPGA 1M01A 1C8YA 2JALA 2WKLA 5A8NA 3WQ6A 1NWTA 1XYFA 1E72M 3VGGA 1W1YA 1QHOA 2PWDA 2G3JA 3KL3A 5BXSA 3WD4A 1CECA 3GM8A 5HDRA 3CUFA 2WCAA 4MAVA 1UWUA 3BSGA 2VNCA 3WNLA 2WKGA 5GQBA 2EXOA 5I79A 4P8UA 1CDGA 1V0MA 3WDJA 3M46A 2VZSA 2Y5EA 1UR4A 4W8LA 1CGVA 1ISZA 4BA0A 1Q6CA 1JYXA 1UA3A 2DIJA 3WUGA 4C7FA 1PPIA 2CYGA 2XUCA 4MNMA 3MMWA 4RL3A 4PBGA 1E56A 1AQ0A 1CIUA 1GHSA 2CBUA 1VJSA 3AIRA 4CVUA 1LF1A 4PMDA 1G5AA 1VENA 4CCEA 2ZUVA 1GOWA 4ZENA 1V0NA 4AZ6A 2QMKA 1UD2A 3OGVA 4JKLA 3WMSA 5A6AA 2XWEA 2WVTA 1TG7A 2EQDA 3FAXA 1X6LA 2BS9A 1XSIA 5DT5A 3SUWA 2VRKA 4PMRA 4PMYA 1HKJA 3QOKA 3WQ4A 2BY3A 4PUEA 3WDRA 1KBBA 1EXPA 2W67A 4UQ9A 1EHNA 4JFUA 1JG9A 4A4AA 1LL7A 2XSAA 4BQ2A 3UESA 3VD3A 3WFZA 2V5CA 1OBAA 2VO5A 2BHZA 3WN6A 4CD6A 1UKQA 4WK9A 1FA2A 3WH5A 4UNIA 3VGDA 2D1ZA 3L4UA 1DWIM 3MO4A 1UA7A 3CLWA 1DWAM 1TZ7A 5EFDA 5E09A 1TUXA 2XJ7A 2D2OA 3AHTA 1JDAA 3PZVA 4U2YA 3WDQA 5HPCA 1JD7A 2XM1A 4KRTA 4PMNA 3AZSA 5ABFB 5GPRA 1J11A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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