The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
|
sequence length |
67
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structure length |
67
|
Chain Sequence |
GPLGSGRMRVKAIFSHAAGDNSTLLSFKEGDLITLLVPEARDGWHYGESEKTKMRGWFPFSYTRVLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2
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| publication title |
Crystal structure of the SH3 domain from IRSp53 (BAIAP2)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
15
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| structure length |
67
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| sequence length |
67
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-04-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LJ0 A; 2LX7 A; 2OJ2 A; 2RQU A; 1T3L A; 3M0P A; 5IH2 A; 3REA B; 1BK2 A; 3M0S A; 1NLP C; 2YUO A; 1ZUU A; 3REB B; 2RQT A; 3QWX X; 5IXB A; 2JXB A; 3EG0 A; 1UE9 A; 4JZ3 A; 2LMJ A; 5IHI A; 2DF6 A; 2JW4 A; 1UDL A; 1NYF A; 2RN8 A; 2CDT A; 1H3H A; 2ROT A; 2DRK A; 3U23 A; 1YP5 A; 2J06 A; 1WXT A; 4CC2 A; 1ZUY A; 2V1R A; 2IIM A; 4Y92 A; 2CUD A; 2EKH A; 4HVU A; 2DNU A; 1H92 A; 1Z9Z A; 2EBP A; 2KGT A; 4ESR A; 4RTV A; 2DJQ A; 1AOJ A; 2DVJ A; 1Y0M A; 4AFQ C; 2MOX A; 1B07 A; 1RI9 A; 5I22 A; 2EGE A; 4JPB W; 2RF0 A; 1ZUK A; 1WIE A; 2K3B A; 3LH5 A; 1YCS B; 2FEI A; 4KRT A; 2OAW A; 3R6N A; 1UEC A; 4OMM A; 3UAT A; 4AFU C; 2AZV A; 1X43 A; 2HBW A; 1Z9Q A; 1QCF A; 2JMC A; 5IHN A; 2CH4 A; 2FRW A; 1SHF A; 2F2X A; 5L23 A; 2C0T A; 1K9A A; 2EGA A; 3VS4 A; 1UUE A; 1ZBJ A; 2O2O A; 3TSW A; 1E6H A; 4LUE A; 1T0H A; 1G83 A; 1KJW A; 1AZG B; 4J9F A; 2ABL A; 1WYX A; 1U06 A; 2ED1 A; 4Z89 A; 2K79 A; 1HJD A; 1X2Q A; 1X2K A; 2K9G A; 2J6F A; 2DL5 A; 1E7O A; 1MUZ A; 1SRL A; 1UGV A; 1FMK A; 2DYB A; 3CQT A; 2GTJ A; 1JEG A; 1QKX A; 2DE0 X; 1PKS A; 2CSI A; 1YWP A; 2JMA A; 2EYW A; 1WXU A; 3VS1 A; 1NEG A; 2O88 A; 1T0J A; 3I9Q A; 1YN8 A; 2JT4 A; 2LJ1 A; 3TVT A; 3THK A; 2L3P A; 5HCK A; 2CH4 W; 4IIO A; 2YUP A; 1SSH A; 2F2W A; 2EVR A; 4OMQ A; 4JJB A; 2KYB A; 1K76 A; 2BZY A; 2D1X A; 2DRM A; 1AEY A; 3GBQ A; 1TUD A; 1UFF A; 1M3C A; 2X3X D; 1JU5 C; 2HDA A; 3VS3 A; 1I0C A; 2E5K A; 4M4Z A; 3VRZ A; 1OV3 A; 1GRI A; 3A98 A; 1KIK A; 3RNJ A; 4X1V A; 4RUG A; 2GBQ A; 4D8K A; 2BZ8 A; 2EYX A; 4QT7 A; 3PE0 A; 2DL8 A; 4J9H A; 2OI3 A; 1U5S A; 3UF4 A; 2DL3 A; 4Z8A A; 2DIL A; 2M0Y A; 4HCK A; 1AVZ C; 2PZ1 A; 1IO6 A; 4IIM A; 5ECA A; 1Y57 A; 4OML A; 4DEX A; 3EG1 A; 3I5R A; 2YUQ A; 1B3Q A; 1KSW A; 2FPF A; 2PNI A; 2EPD A; 4AG1 C; 1K1Z A; 1W6X A; 2D8H A; 3ZL7 C; 4RTT A; 1UHC A; 1M27 C; 1BB9 A; 2RQR A; 5I11 A; 1JXO A; 2YDL A; 2M51 A; 2JS0 A; 1NLO C; 2J6K A; 1X6G A; 1T3S A; 1GL5 A; 2RPN A; 2L2P A; 1NM7 A; 1PWT A; 1K4U S; 1U3O A; 4RTX A; 2LP5 A; 2K2M A; 3ULR B; 4HVW A; 1UJY A; 3EHQ A; 4CC4 B; 2KRO A; 3VS0 A; 2LQW A; 2AKL A; 1AZE A; 3I5S A; 2W10 A; 1GBR A; 3EHR A; 1QWE A; 2JM8 A; 2O31 A; 1K0S A; 4LNP A; 1PHT A; 2C0I A; 1GBQ A; 3PVL A; 2DBM A; 4R0K A; 2RMO A; 3JV3 A; 1PRM C; 2KRN A; 2K7A A; 2FG0 A; 1CSK A; 2FPD A; 1X6B A; 4J9E A; 2HEQ A; 1EFN A; 2A36 A; 1VYT A; 2FRY A; 1SHG A; 2DLP A; 4JJC A; 1GFC A; 1ARK A; 2GQI A; 3NMZ C; 2J7I A; 1UTI A; 1YWO A; 4RTW A; 2KRM A; 1WLP B; 2AK5 A; 2GTO A; 2EGC A; 3RBB B; 5GJW B; 4ZNX A; 4AFS C; 1RLQ C; 1ABO A; 4CC7 A; 1CKA A; 1QWF A; 4RTY A; 3FJ5 A; 1KFZ A; 2LNH B; 4DEY A; 1PKT A; 1QLY A; 3VS5 A; 1AWX A; 2VWF A; 2HCK A; 1SPK A; 2XMF A; 4F17 A; 2DL7 A; 1WFW A; 2BZX A; 1AWW A; 1ZLM A; 4GLM A; 5FWC A; 2BTT A; 2LZ6 B; 3EGU A; 3H0H A; 2D8J A; 5FWB A; 2J6O A; 3M0T A; 1OPL A; 1UG1 A; 3M0U A; 2LQN A; 1TUC A; 2VVK A; 2EQI A; 2KT1 A; 3QWY A; 4J9D A; 1RUW A; 2VKN A; 3VS6 A; 1GCQ A; 2GNC A; 2DA9 A; 1GFD A; 4HVV A; 1QKW A; 2NWM A; 2A37 A; 2KEA A; 3I35 A; 2B86 A; 1AWJ A; 1NEB A; 2MCN A; 4J9B A; 3KFV A; 5IXF A; 2AZS A; 2W0Z A; 4A63 B; 1XOV A; 2O9V A; 1W70 A; 2D0N A; 1ABQ A; 3UA6 A; 1JQQ A; 1V1C A; 2KT8 A; 1JO8 A; 3TSZ A; 1AWO A; 2DM1 A; 2ESW A; 5IHK A; 2L3Q A; 1HD3 A; 1BU1 A; 2FPE A; 4JJD A; 1UHF A; 2SRC A; 3NPF A; 3UA7 A; 4OMO A; 4CC3 A; 3VRY A; 4HXJ A; 3H41 A; 2QDL A; 1JXM A; 4J9G A; 1OEB A; 2RQW A; 1SRM A; 1PNJ A; 2GGR A; 5GJV B; 4J9C A; 1VYU A; 2KXC A; 4K11 A; 2EYY A; 4F16 A; 2KE9 A; 4ORZ A; 2CT3 A; 1VA7 A; 4AG2 C; 2LJ3 A; 4Z88 A; 2JM9 A; 2K6D A; 2DX1 A; 2RNA A; 1M3A A; 4LUD A; 2CSQ A; 3NHN A; 4GBQ A; 4AFZ C; 4RTU A; 1MV3 A; 1WA7 A; 2X3W D; 1WDX A; 1H8K A; 2A08 A; 4OMN A; 1WXB A; 2EYZ A; 2KR3 A; 1LCK A; 1SEM A; 4J9I A; 1X69 A; 4FSS A; 2KRS A; 4E6R A; 2P4R A; 2H8H A; 3SHW A; 2CT4 A; 1OPK A; 3EG3 A; 4F14 A; 1ZX6 A; 3SEM A; 2FO0 A; 2ROL A; 2CUB A; 2JTE A; 2JS2 A; 1VYV A; 4JZ4 A; 5EC7 A; 1ZSG A; 2NUZ A; 3M0R A; 2KBT A; 1NG2 A; 2SEM A; 1K0X A; 1GCP A; 3IQL A; 1OOT A; 3NGP A; 2V1Q A; 1UJ0 A; 2AKK A; 1N5Z A; 4OMP A; 3O5Z A; 3VS2 A; 2RQV A; 2DMO A; 2I0N A; 1BBZ A; 1I1J A; 3PVQ A; 2L3S A; 1MV0 B; 2KYM A; 1FYN A; 1J3T A; 2ED0 A; 1E6G A; 1NYG A; 3EG2 A; 2ECZ A; 2J05 A; 4LN2 A; 1WX6 A; 1A0N B; 3VS7 A; 1S1N A; 1GCQ C; 1HSQ A; 2YUN A; 2F2V A; 3M0Q A; 5FW9 A; 3H0I A; 4EIK A; 1PRL C; 4WCI A; 1G2B A; 1M8M A; 2G6F X; 2L0A A; 1WI7 A; 4RTZ A; 1RLP C; 2YT6 A; 2DL4 A; 1M30 A; 2LCS A; 1TG0 A; 1X27 A; 4LE9 A; 2HSP A; 1I07 A; 3C0C A; 2MIO A; 4D8D A; 1CKB A; 2EW3 A; 2PTK A; 2A28 A; 1M3B A; 2DBK A; 1YNZ A; 2ENM A; 1W1F A; 2O9S A; 1AD5 A; 2YSQ A; 2CRE A; 3H0F A; 2C0O A; 2KNB B; 2KXD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1M1F A; 2K5F A; 1QVG S; 2QK0 A; 3OW2 S; 1WHK A; 5IH2 A; 3REA B; 2QQA A; 3REB B; 3QWX X; 5IXB A; 2JXB A; 4MDW A; 1YJ9 T; 5LJ5 f; 1BIB A; 2DF6 A; 1RAD B; 1VQ4 T; 3WVE B; 5J3B A; 3E1S A; 1KHI A; 1VQP T; 4RKU E; 1BI1 A; 4HCC A; 5FRM A; 4C92 E; 2V1R A; 1IZ6 A; 4Y92 A; 1IB8 A; 2E64 A; 3JCM f; 1BCM A; 2DVE A; 4MML A; 1G5V A; 4RTV A; 2KQW A; 3HTR A; 3OSS C; 4BDY A; 4M75 E; 2EGE A; 4R55 A; 3QSU A; 3PNW C; 3QDF A; 4OMM A; 4E7H A; 2AZV A; 2HNI A; 4JJN K; 1Z9Q A; 3CMA A; 1QCF A; 2FRW A; 1YIJ Q; 1Q81 R; 4DOV A; 3X24 B; 2C0T A; 1PD0 A; 1ZSZ A; 1UUE A; 2P4T A; 1ZBJ A; 3R6O A; 2CZ0 B; 1G83 A; 4X9C A; 2COZ A; 2HBP A; 3G6E T; 2O4X A; 3CPW A; 3EGX B; 1BCO A; 2YRC A; 3VUB A; 4JS5 A; 4PJL A; 3EAE A; 1X2K A; 2F5K A; 1JBM A; 2DL5 A; 2VUB A; 3OYG A; 2DXC A; 1MUZ A; 1SRL A; 2ZPI B; 3D7S B; 5A0G A; 2A7Y A; 3DB4 A; 1JB0 E; 1YWP A; 2EYW A; 2QGF B; 2MF2 A; 2LTO A; 5CKF A; 2RJE A; 2O88 A; 2OTJ A; 3I9Q A; 4LD9 K; 3HFO A; 2OTL Q; 1YJW Q; 2LJ1 A; 3OYF A; 2KK4 A; 3THK A; 2L3P A; 1G3W A; 3CME A; 4ELY C; 4X9D A; 4PJO B; 3LW5 E; 5GAM j; 2YUP A; 1SSH A; 2F2W A; 1C6V X; 3UT1 A; 1KD1 R; 2DYI A; 2LDM A; 4VUB A; 1D1B A; 4II1 A; 4P5N A; 3VS3 A; 5AYF A; 4M7A B; 3PMT A; 3CXC A; 2E5K A; 1VQ9 Q; 1KG1 A; 1VQL Q; 1YI2 Q; 2LRQ A; 3QDR B; 3PE0 A; 3UWN A; 1ZQ1 A; 1U5S A; 5IN1 A; 1UB4 A; 2RJF A; 4LDV A; 4A4G A; 4EMK B; 1AVZ C; 1QQJ A; 2YHT A; 1JJ2 P; 3HKS A; 1VIF A; 1KQ1 A; 3M9Q A; 1HXD A; 2YUQ A; 5CO7 A; 1KSW A; 2PNI A; 3HFN A; 2DIQ A; 1BI3 A; 2VGM A; 3A8L B; 4B9W A; 1PC0 A; 2BKD N; 3CCV T; 3OMG A; 2RQR A; 5FU7 B; 4A4H A; 1I5O B; 2GFU A; 1YCY A; 3ASK A; 2JS0 A; 1X6G A; 5HY6 A; 2RPN A; 1BYM A; 1NM7 A; 1U3O A; 4WF2 A; 2LP5 A; 3EGD B; 1I8F A; 1LVK A; 3GF5 A; 3EHQ A; 3CCR Q; 1YIJ A; 4ZN3 A; 3NTH A; 2HZY A; 2LQW A; 3VKI A; 1AZE A; 3QYH B; 2L3R A; 2FYK A; 2XIC A; 3X26 B; 4HA8 A; 2DKG A; 2QEX A; 4M7A F; 1K0S A; 2DTH A; 4QQ6 A; 4QVC A; 3CCL T; 4OF1 A; 1VQ7 A; 2KRN A; 1OI1 A; 1YIT Q; 2FG0 A; 1CSK A; 1D09 B; 2FL7 A; 1H64 1; 1UGP B; 2A36 A; 2QQR A; 2VYT A; 1SHG A; 5LJ3 f; 2X4X A; 3HHT B; 4KUD K; 1S72 A; 3PGG A; 4J8O A; 1YJ9 Q; 1VQ8 A; 3OYH A; 1VQ4 Q; 1WLP B; 2JNG A; 4CRI A; 2DD4 A; 4LDU A; 5D7U A; 4M7D C; 3WVD B; 4OP0 A; 4DBF A; 1AWX A; 2BZX A; 1UEB A; 1ZLM A; 1ZSZ B; 2E12 A; 2BTT A; 2ZPB B; 1YI2 A; 3M0T A; 5CIU A; 3X25 B; 2QAZ A; 2VVK A; 2EQI A; 2KT1 A; 3QII A; 2O4X B; 2XDP A; 5I2M A; 2VKN A; 3SFM A; 2EJ9 A; 4DBQ A; 1QKW A; 2NWM A; 1O9S A; 1MMG A; 1M8V A; 2CZ7 B; 1AWJ A; 2XDB A; 1W4S A; 1VQ6 A; 4HT8 A; 2X51 A; 2RD1 A; 4A63 B; 4E7I A; 2O9V A; 4D6W A; 5FRN A; 3UA6 A; 2HSE B; 2FZG B; 3SWN A; 1D3B B; 5CKH A; 3TSZ A; 1JO8 A; 5GMK i; 3JB9 D; 3X20 B; 5LJ5 g; 4FL6 A; 3CCR A; 4BI3 A; 4OMO A; 1G3S A; 3OYL A; 4CC3 A; 5CKB A; 2DPP B; 3INZ A; 3G71 Q; 4F7U E; 4JRP A; 4PL6 A; 4DA4 A; 4BY6 B; 4M7D E; 4FW2 A; 1OEB A; 2RQW A; 2ZCF B; 1K9M C; 1MND A; 4K11 A; 4L6V 5; 2D0Q B; 1DJ7 B; 1PM3 A; 4B6M A; 4E7S A; 2ZPF B; 2LJ3 A; 4Z88 A; 5GMK e; 3CC2 Q; 4FM4 B; 3RUX A; 3QUI A; 4AFZ C; 4ME7 A; 1MV3 A; 1WA7 A; 2X3W D; 3V7C A; 4Q5W A; 3G4S A; 5D6W A; 4OGC A; 1IGU A; 1WXB A; 1LCK A; 2RHX A; 1UGQ B; 1RAC B; 2ZPH B; 2DET A; 2L89 A; 5FRO A; 3EG3 A; 1JJ2 S; 3CCS Q; 4C0Z A; 2A0F B; 2JS2 A; 2EAY A; 1VYV A; 3V7R A; 4O5V A; 3M0R A; 3QPH A; 2K4Y A; 1GCP A; 2QYZ A; 2DO3 A; 1N5Z A; 3AHU A; 1QVG P; 2YXY A; 3VS2 A; 1VQN T; 2DMO A; 1AHJ B; 3PVQ A; 3OW2 P; 2I2L A; 3PT9 A; 2OTJ T; 2L3S A; 1MV0 B; 3CCU T; 5GAN e; 2KYM A; 5GAN 8; 2R58 A; 4PJO G; 3CME T; 2GQV A; 1PD1 A; 5KH6 A; 1W2B A; 1G3Y A; 2HKN A; 1K73 C; 4M78 B; 1Q95 G; 5KYX A; 1A0N B; 1KQ2 A; 1M1K C; 1GCQ C; 3E9G A; 1BIA A; 2YUN A; 4M7A G; 4E7Z A; 2MAM A; 4EIK A; 4XTW A; 1PRL C; 4ELZ C; 1G2B A; 3OQ5 A; 4M77 A; 1M8M A; 4BE0 A; 4HCZ A; 2RI2 A; 1WI7 A; 1RLP C; 4IUR A; 3CCE Q; 1D1C A; 1TUG B; 3PMI A; 3HRU A; 3BW1 A; 5I2S A; 1VQK Q; 1I07 A; 5D6X A; 3G71 A; 2WAC A; 5A0L A; 3TU4 K; 3I55 Q; 2DBK A; 1YNZ A; 1D0X A; 1UGS B; 3OSV A; 4XU2 A; 3RDV A; 1U8R A; 4LD6 A; 4BUG A; 4AT1 B; 3J80 E; 2LJ0 A; 2CP0 A; 2LX7 A; 2OJ2 A; 3URG A; 2WSE E; 5AT1 B; 4BDZ A; 3CXC S; 4OVA A; 2K3Y A; 3EG0 A; 1UE9 A; 3E19 A; 1F1B B; 4B9X A; 1NYF A; 2CKK A; 4C8Q G; 1X75 C; 2CDT A; 4JDS A; 2AT1 B; 4M78 F; 1SF9 A; 3SWN B; 2DRK A; 2FZC B; 1YP5 A; 3CC4 Q; 2J06 A; 1WXT A; 1HYO A; 3JCM b; 3PFS A; 7AT1 B; 2P84 A; 2CUD A; 3OS2 A; 1Q81 C; 2DNU A; 2QEX T; 5CR2 A; 3GNG A; 4PFO A; 3VYG A; 1NE8 A; 2DJQ A; 3A1P A; 1AOJ A; 1VQ7 T; 3QJY A; 2QTX A; 2MOX A; 4QQG A; 2PVD B; 1B07 A; 4OB1 B; 3C95 A; 4EMG A; 1OU9 A; 1RI9 A; 3EFR A; 5I22 A; 4JPB W; 4C0D B; 1WIE A; 2OAW A; 1S72 T; 1QVF S; 3UAT A; 1D1A A; 4AFU C; 2V8J A; 2YLC A; 5IHN A; 1SHF A; 2F2X A; 3UDC A; 5L23 A; 5A2Q E; 4PJO A; 2LX9 A; 1VQ5 A; 3GLX A; 1AZG B; 1RAH B; 4QKU A; 1MMN A; 3TCJ A; 1WHG A; 4J9F A; 2M9U A; 2ABL A; 2K79 A; 1KD1 C; 4JRK A; 2MWO A; 5KYU A; 3HP9 A; 2J6F A; 3FC3 A; 3DLL A; 1FMK A; 2LCC A; 4PLL A; 4C92 C; 2A3L A; 2GTJ A; 4C5I A; 1JEG A; 1QKX A; 2DE0 X; 1VQK A; 2JMA A; 3CCJ A; 4EMK C; 1IRX A; 1G3T A; 2L5Q A; 3I55 A; 3OBY A; 5LL6 S; 3CD6 Q; 1VQ6 T; 1RAB B; 1YHQ A; 2EVR A; 2PVO B; 1OZ3 A; 2KYB A; 1WHJ A; 3GBQ A; 1UFF A; 4DBR A; 4XU3 A; 3RR6 A; 2JTF A; 4BI4 A; 3OS5 A; 3A98 A; 2K3X A; 3V7S A; 5KYX B; 1N8R R; 4RUG A; 4D8K A; 2COW A; 1U1S A; 3EGD A; 2D6F A; 2DL8 A; 3OB9 A; 3RMQ A; 4V2S A; 3CC7 Q; 2DL3 A; 2NYS A; 2DIL A; 4M77 B; 5DY9 A; 4HCK A; 4C8Q A; 2PZ1 A; 1IO6 A; 4IIM A; 4EMH A; 2RHY A; 2ZPG B; 3CCU Q; 5J26 A; 3MEV A; 3EG1 A; 3I5R A; 4M7A E; 1Q7Y R; 2GCX A; 3N5B B; 4KT0 E; 3KUF A; 2F69 A; 1K1Z A; 2XU8 A; 1UHC A; 2CGH A; 1VQO A; 1BB9 A; 2EWN A; 4A53 A; 4FYX B; 3JCM W; 5IT9 E; 3CCM Q; 2J6K A; 4C0F A; 1GL5 A; 1KQS S; 2NUT A; 3G4S T; 4FU6 A; 4HVW A; 1UJY A; 1O75 A; 2OAU A; 4CC4 B; 2K5I A; 4N0A A; 2AKL A; 4XQ3 A; 4IUT A; 5GAO q; 5LJ5 j; 2VAS A; 1N9R A; 1FX7 A; 3JCM e; 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