3RSJA

Structure of hcrf in complex with ganglioside gd1a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
413
structure length
406
Chain Sequence
IKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/F
publication title Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 105
structure length 406
sequence length 413
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rsjA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rsjA02
2D43A 2W39A 1GSLA 1IS3A 4GWMA 3PVNA 4YM0A 3O5WB 1RITA 1BKZA 3BODA 4K1YA 3BA7A 3FJJA 1V6OA 3USUB 4R9AA 1CONA 3VT0A 4DEPA 1W3GA 1O4YA 1YBIA 1M2TB 3BAVA 3AZXA 3ZXLA 3UJ0A 3OYWA 3TB0A 4XE9A 1SR4A 4XXPA 1LESA 3O4OA 1N1VA 1URXA 1AJKA 2D6OX 2ZGLA 1IS4A 4OWKA 2YV8A 3AFKA 4I1EA 4Y1XA 4BLIA 2A71A 3MW2A 5BXPA 4P14A 3BOPA 3N7LA 1RZOB 1I1BA 1S0IA 4XTMA 4ZBVB 1DQOA 2L5XA 4YOLA 3NBDA 4FP2A 4QO3A 3I2AA 3V0AA 3FLTA 3N7JA 1FQ9A 3FJKA 5IK5A 2DTWA 4GAFA 1KNMA 1PC8B 3ZC9A 1J0SA 4XJWA 4QKSA 5JOYA 2ENRA 4XJ8A 1G9DA 3LCPA 2F8XC 1S0CA 4OZXA 5GZEA 2GMPA 2LIEA 4YW4A 3FBYA 1W6QB 3OY8A 3VSFA 1IRPA 4M3CE 2VY0A 2UWCA 3BAUA 1KDKA 4A7ZA 5CB7A 2D24A 2P23A 4JPZA 4HR6C 4XILA 3E8LC 1LCLA 3MW3A 1KITA 1DQ2A 1RG8A 3LTQA 1GV9A 2DUPA 3WNXA 1QF3A 3NJ5A 4QKRA 5BP5A 3BRGC 1GNHA 4HANA 1LODA 2Y9WC 3H6RA 3N35A 1RINA 3ILRA 4HJJA 2NMOA 3B01A 1AFCA 2I2SA 3ZC8A 4KEKA 2LIQA 4L8QA 3I2XA 2F2FA 3CA6A 1W6MA 1HIBA 4CJMA 5T5PA 3RTIB 1V6JA 1K5UA 3Q9OA 2JJ6A 4M3CB 5T55A 1D0HA 5JOZA 2V73A 1WW7A 3CAHA 4WBCA 4DPNA 1AZDA 4I4OA 5JLVA 3V0BA 3FUOA 1ILR1 1DYKA 2DS0A 2WJSA 1HCEA 1QNYA 2Y9FA 4QALA 2GNMA 1DYPA 2ZR1B 4FVVA 1CN1A 1LJ7A 4LO7B 1EPWA 1LTEA 4IY9A 2D23A 2NZ9A 2VXTI 1MD6A 4AN7B 2AENA 2WBCA 2OW4A 4PF5A 4R6UB 2A6YA 3V64A 5DUYA 1C1FA 4OWLA 3IM0A 4C1XA 5IK4A 2WNEA 1DZDA 2WT0A 2X2TA 4LBMA 2JKBA 2ZAAA 5JVVA 1GZ9A 3S8KA 3SISA 1BLAA 4I96A 2DURA 3VUOA 3FJCA 1IOAA 1LOFC 1MS9A 2FHRA 4A7YA 1ULGA 4ZLBB 1BA7A 4WVVA 4LBOA 3B3QE 5FZYA 5E89A 1CPMA 1Q8OA 4P0KA 5FZUA 1UPSA 3N36A 1LEMA 1MS4A 2GN3A 2D7FA 4P9WA 3JUTA 1HLCA 1W6NB 3FFZA 2DU1A 4CTEA 1ZM1A 1MVEA 3NV3A 3UK9A 1HCDA 2CTVA 4DRVA 1QOOA 4GWNA 1VALA 1SBFA 1GNZA 1W3AA 4ISRA 2K4AB 5GZFA 4D8HA 3IM5A 3BIWE 4C1WA 4D69A 2A70A 1LGNA 5LK5A 2UURA 2EALA 3DUIA 1S0GA 1BJQA 4OWJA 1ISZA 4J2YA 1PZ9A 1GBGA 1SBDA 2SBAA 4I7IA 3AYAA 5BXSA 3PVEA 3WMVA 1LOBA 3ZSLA 3PHZA 1YXWA 5T52A 1KRIA 3ZYPA 1NXD1 1EVTA 3WG3A 4XKIA 1QDOA 3I29B 4OUJA 3FLPA 2VUAA 3QR5A 2A3XA 3FGMA 4LBNA 1V6UA 2ET2A 1C1LA 3P6JA 4LBJA 2DYCA 1FNYA 4Y22B 2R1BA 2DRYA 1ISVA 1DIWA 2I1BA 2XOAA 1FGAA 4Q26A 5JOWA 1AVUA 4LBLA 2EXIA 4J2KA 2DV9A 2A7AA 3VKOA 5F8YA 1R8NA 1BYHA 1NLSA 4U36A 4XDQA 1TWMA 3WG1A 1LHNA 1AXMA 1TFMB 1JT3A 4AGRA 1GZCA 4GOYA 3KMVA 3FJBA 3VKFC 4KEIA 1XZZA 4EFRA 1MS3A 2D44A 2M49A 1ONAA 5E24E 2ZHKA 3AXEA 1LOEA 2ZGRA 3UL2A 1LEDA 1SR4C 3FJHA 1UZYA 2Q9XA 1QQLA 4AVVA 3BAQA 4JCKA 3ZXDA 2EXHA 1LOFA 1Z78A 5H9RA 2FMDA 4JC1A 3FLRA 4Y1VA 4Y1ZA 4XMAA 1WW5A 2WQZC 3USUA 3PUBA 5EYXA 1H9WA 3MPPG 4J23B 3NBEA 2R1DA 3CA3A 1P63A 1DZQA 1CVNA 1PUMB 3IM7A 3VEQA 1ZA4A 3MW4A 5EG6C 2RHPA 4AN6A 3IM6A 4I0YA 2A3WA 1KDMA 5DZFA 1KQRA 1MR5A 3HBWA 3M1HA 4YM2A 4U2AA 3R4SA 4G6JA 4IONA 1U0AA 4JKQA 4BPZA 2E51A 2ARBA 4Y26A 4GA9A 1QXMA 4YW5A 1DFQA 1N4KA 4LBKA 1JOJA 2UU8A 5E88A 1WLCA 2EXJA 2ES3A 1B09A 3CRIA 4I1BA 4D0TA 2D7IA 1LOAA 3HMYA 3I8TA 3ZXKA 1CJPA 4DRRA 5BP5C 5F8SA 3WHTA 4LO0C 2BEAA 1V6LA 1Q8SA 1PZ7A 2IWTB 1W6QA 5BOWA 2KKIA 2R16A 2ZGSA 2VSEA 1N47A 3BX1C 4I4YA 1CESA 2ZGUA 2F2FC 4YGEA 1BFBA 1Q8PA 3RMYA 1LU2A 3GALA 5CBLA 1LULA 2MLLB 3HR9A 2DU0A 3O0WA 1WW4A 1AVBA 4IZXA 3BA5A 5IK7A 3OJVA 1QU0A 4FPKA 3UJOA 2FGFA 1WUVA 3VT1A 8I1BA 4D0ZA 1A8DA 4YG6A 3HSMA 5G00A 2V5YA 3WV6A 2R9KB 4SLIA 2D6PA 3AJ5A 3WINA 3QYDA 1GLHA 2Z42A 3SH5A 2BEBA 4YZ4A 4Y20B 1VCLA 5E8AA 4I30A 3ASIA 1JT5A 5IUQA 4ZFWB 1UAIA 1Q1UA 4M3CA 5D61A 3POSA 3T1MA 4YZ1A 2NTDA 3ZYRA 3ZXJA 4Q2FA 2MIBA 3B69A 1BLDA 2Z49A 4FPYA 5T54A 1YF8B 4EKXB 4IZEA 2G4IA 1JN2P 2YZ4A 5IT6A 4QD2B 1I1EA 3AKHA 3W9TA 5KXEA 4XFSA 1W0PA 3O49A 4M00A 1VLNA 4EFPA 5DXDA 1CIWA 3WCSA 4LO1A 5EXOA 2ZABA 4H9WA 2R49A 1YYNA 5GLWA 2PHRA 4Q91A 1VAVA 4BM8A 3WDXA 3RQ0A 3D5OA 1CVSA 4ATFA 1Y7BA 1FATA 1MS0A 4M01A 3WLUA 3ILFA 4H55A 1XQNA 1DQ4A 5BQUA 3ILNA 4XIKA 4UW6A 3R4UA 3O44A 4P0JA 4JRAA 4EEEB 1MACA 2RG9B 2ZMLA 1E0OA 4TLPA 2WRYA 3N3HA 2A3YA 1HQWA 4USOA 3AKIA 2NP0A 1W6NA 3OGGA 4Y1UA 3VKLA 5GAQA 3T8SA 2WKKA 1JXNA 3QCWA 3VSZA 1JHNA 3CRGA 2AREA 4I37A 4LO0A 1BASA 1G9AA 5AVAA 1LGCA 4GP0A 3UD7A 4FGFA 2JE7A 1RMLA 2OUJA 2ZGQA 1MS1A 1GYKA 1N3PA 2ZACA 1YO8A 1APNA 3T2TA 1WBAA 2VH9A 4G6MA 1V6MA 2CYFA 1WLDA 1BFCA 4FPEA 4LO2A 3UD8A 4GKYA 3HOMA 3B00A 2P2KA 1DQ5A 1LGBA 2A5ZA 1TTUA 3Q7YA 3AH2A 3I4IA 5HPZA 1LHOA 5EYYA 3R05A 1Q56A 3CA0A 4IY8A 2D3PA 3BTAA 5DZUA 2NM1A 1FMZA 4Q1RA 3FJFA 3BAGA 1ISYA 1AX1A 2GDFA 3ZSKA 5DZEA 4ASMB 3K1XA 1V00A 4NO4A 2AH2A 1TP0A 2K8RA 3UD9A 4Z9WB 3O12A 3RSJA 4AVSA 1WCSA 2D6KA 3RRDA 4XOGA 4RA0A 3CA1A 1KJLA 5KXBA 4Y22A 4X37A 1G86A 1ONKB 5B2HA 1YIFA 4USPA 2ZGPA 5FNWA 4ZKTB 3M3OA 1ENSA 4FP3A 1QOTA 2ZQOA 3SITA 4FPJA 1AX0A 1AVWB 3O0XA 1ULDA 5JMCA 4FOVA 3ZVXA 4UW3A 4LO8B 2AFGA 3P6IA 3WG4A 1HKNA 2A6VA 3BB2A 1JTCA 2GNTA 2YROA 3O0VA 3WOGA 1CR7A 5BVPI 5IK8A 1HKDA 2PHXA 1HWPB 3TC2A 2P34A 1GZWB 1S1AA 4OEEA 4CZSA 5GZCA 1OFSA 4I4VA 3POYA 1F31A 1WBCA 2A75A 1ULEA 4FQZA 1S0LA 1XHBA 2ZGOA 1IT0A 3H6RB 3WVJA 1V6NA 1QDCA 2MC2A 2GNBA 3NBNA 4I4XA 2VXRA 4R9CA 3CRHA 3S8JA 2ZQNA 2D3RA 1ULCA 3OJ2A 4YM3A 2R0FA 3FUQA 3WO4A 4LBQB 3B9CA 2ERMA 3AP9A 4Z8BA 3NV4A 1MZ6A 2WSVA 4X39A 3POWA 1UX6A 3PVOA 1A3KA 1Z4SA 3BAHA 1TEIA 6I1BA 1IRAX 4YW2A 4CRQA 3U4XA 1SLBA 1AJOA 5D62A 4LBQD 5H9SA 1G7YA 3GNEA 3WHUA 2BFHA 1LOCA 2VSAA 2Z48A 4QBVA 1IHKA 4Q9PA 4GP3A 5FREA 2UUSA 1GGPB 3WG2A 1Z2VA 3AKGA 5EWSA 1LU1A 1SCSA 5GLZA 4XBQA 4YZ2A 4DS0A 3ZXGA 3FJIA 1H30A 5GZDA 3WO3A 3FJDA 3UJ4A 4JP0A 4I4QA 4XFUA 3PJQA 2CWMA 4I2SA 1IOBA 5T50A 1K5VA 1G9FA 2RSTA 3WINC 2NVHA 1BFFA 4P9YA 2WLQA 4G9MA 4P6AA 5HCBA 4XJAA 5D63A 1SLIA 1O4ZA 1N3OA 4I4UA 5DVHA 1TOOA 2AAIB 3O4CA 1VAMA 3RG0A 5KXCA 4J2SA 1AXYA 3A0KA 1ITBA 3H6QA 2Y9GA 2VU9A 1FAYA 4LO7C 2EXKA 3A07A 4L4HA 3AX4A 2VW1A 1N3QA 4Y20A 5HCFA 3A21A 4XHXA 1S0FA 1AVAC 2YY1A 3H6SE 2GALA 4LO1C 3N7MA 1W6PB 2AGSA 4PC4A 1YRZA 3WO2A 3SH4A 4LO3A 2E4MA 3VT2A 1UZZA 4H04A 2HYKA 4ENDA 3ZXFA 4XXAA 2ZGNA 2GZBA 3L2YA 3M3EA 2LALA 4XHBA 3KM5A 4GKXA 4NOTA 4ZXKA 3ZX7A 1WD4A 1AF9A 2IHOA 1SFYA 5BQUC 3NV1A 3AXDA 1MS8A 4M3CF 2EF6A 5KXDA 5JOXA 2OUHA 3WDVA 1FN0A 2NMNA 3SH3A 3VKNA 2Y9XE 2P37A 3FJ9A 4KBBA 3JRRA 1QGLA 3DGTA 3AP7A 1JW6A 5L73A 1R8OA 4K20A 4YGDA 2C9AA 5CA6A 2D6MA 3LSEA 3WA1A 1GANA 2GMMA 4FPHA 1PWAA 3A23A 3INAA 1D2SA 1W6OB 2D20A 1JBCA 4Q8LA 3OJBA 3P53A 1II4A 2P39A 1Q8VA 1N1SA 2GO2A 2JECA 2C5DA 4EB2B 2XB6C 3AZZA 1IS6A 3AH1A 4LO2C 1I3HA 4FPLA 4AVTA 4DCKC 4XYXA 1KJRA 4G1RA 3D6EA 3AP6A 3VKMA 1PZZA 2AQZA 1DZCA 1AXKA 1CE7B 2CY6A 1DJSB 3BRDA 3APBA 4JKXB 1CPNA 3WDYA 3Q7WA 3BADA 31BIA 1LECA 2WT2A 2DVDA 3ZSJA 1CQ9A 1ISXA 1FWVA 3D4KA 5GM0A 1VIWB 3AZWA 2PHFA 2AXMA 2P3KA 4YW1A 1G82A 3A22A 5T5OA 5SV8A 3CQAA 4FOWA 3NV2A 3AKFA 5DG1A 4IQPA 3O4DA 1ENQA 3WUDA 3VWCA 1XYFA 3O4BA 1LHWA 3IMNA 3AZVA 4GALA 3ILAA 5T5JA 4BMEA 2EAKA 4DFSA 2D1ZA 2JDZA 1C57A 3D7WB 1GICA 3N7KA 5CAZA 3RS6A 5DSSB 3O4AA 1V6KA 3JUUA 3A0NA 4P0LA 4KEJA 1WBFA 5CNAA 2KI6B 3AJZA 2YUGA 1ENRA 1HQLA 2PHWA 3AJYA 2FFUA 1Q03A 2A6XA 2ARXA 3SNVA 1WLWA 3CU1B 3IPVB 3FJ8A 1JYCA 1UMZA 4XBLA 2YXSA 2W68A 3SLIA 3MEPA 1JQZA 2QYIB 3ZSMA 1ABRB 2HWMA 3O5SA 4ATEA 3C9ZA 1DQ1A 1Q8QA 2FO1A 3T1LA 2CL2A 1V6WA 1SLTA 4OEGA 2FFVA 5GLTA 3AJ6A 3OPZA 3CNAA 1GZWA 1BARA 4AYUA 2D7RA 1IKPA 1AVXB 1W0OA 5DUVA 5GLUA 3WDWA 3BAOA 4ZGRB 4BQ1A 4X38A 4F34A 1X50A 5DUWA 1M16A 4ITCA 1OQ1A 2ZHNA 3ZXEA 4FOQA 5BXTA 2P3JA 3M3CA 1SLCA 4BMBA 1XG6A 3F1RA 5F8WA 2E7TA 5EHAA 1T9FA 3AH4A 4TZDA 5GZGA 4QBCA 1H9PA 2A6ZA 4QC4A 1DQ6A 4YZ5A 3UJQA 1NUNA 3A4UA 4R9BA 4Y1YA 1DLLA 1Q04A 1PZ8A 4FQ4A 1SACA 2PELA 4LBQA 4YG3A 2D6NA 4YGBA 2P3IA 1JUIA 3RTJB 1V6IA 2Q3NB 4XJ9A 1PUUB 2CWSA 4TYSA 3NBCA 2HZ9A 4UW5A 2HWAA 3OYWB 2ZGMA 4FPGA 4FPFA 1FWUA 1SLAA 1DHKB 2B7YA 4RL7A 2OVUA 4FOYA 4I3NA 5BYNA 2Q5TA 9ILBA 3WUCA 1IILA 4KC3A 1L2HA 4JAWA 2W08A 5F5QA 1G8WA 1V6VA 4BLJA 3V65A 3BA4A 1F9KA 2LTNA 3N0KA 5GALA 4AWDA 1WBLA 4FPOB 1JLYA 3CA4A 1QMJA 3AYEA 3V0AB 5EC5A 1DBNA 4WV8A 2ZMNA 4I4SA 1OKQA 21BIA 1LENA 3AYCA 3OBTA 1SZ6B 2KLLA 2GNDA 2H0BA 3LLPA 1EV2A 2TEPA 3AYDA 2X2SA 4FPCA 2ZGKA 2J3PA 2NN8A 3NWKA 4X3AA 3OY8B 3AP5A 3JU9A 5DUUA 1C4RA 1UN1A 4LO3C 2E4MC 1ISWA 2E53A 3W59A 2XG3A 1TIEA 4ISQA 3HN1A 2AYHA 4PBPA 1S0JA 3VV1A 1QNWA 2R0HA 4QD2C 2ZMKA 2PHUA 1YI7A 2DWRA 4I4PA 4XIOA 4PQ9A 4GAIA 3IKWA 2ERFA 4ZFUB 3ENRA 4GXLA 1N1YA 4XMIA 4XZPA 5DZGA 1JT4A 1W6PA 3LSDA 1UL9A 1MVQA 4K21A 4GOVA 3HALA 1W6MB 4Q8KA 4YFZA 3IIRA 4OW4A 4AGGA 1QQKA 2KI4A 1FV2A 4PBOA 2AUYA 4WZFA 4BOWA 3F62B 5DUXA 2KM2A 2D3SA 1SBEA 2DRZA 5JDBA 1AX2A 2ZKNA 3EF2A 4W65A 3WDTA 1UKGA 3WZ1A 3V0BB 4YFWA 1MZ5A 2A6WA 2DVBA 1OQLB 4OEFA 5H9PA 1FNZA 1JYIA 4ZOTA 3ZPYA 4Q27A 2E6VA 3PG0A 2DUQA 1G9BA 1MS5A 4UW4A 2FDBM 1BZWA 3WDUA 1V6XA 1DQ0A 2BQPA 2D22A 3OGFA 5T5LA 3ATGA 4HA2A 4ZA3B 1W6OA 1RY7A 1DGLA 3FJAA 1F5FA 1HWOB 5BXRA 3W58A 7I1BA 4R9DA 5HCAA 5FNXA 4DENA 4P9XA 2KH2A 4YG0A 1JLXA 5H9QA 3WMUA 1LOGA 3OJMA 1EYLA 1IKQA 5GJ6A 2AR6A 2ZBJA 1YTOA 4II0A 2RQ9A 4IHZA 3FJEA 2HW9A 2K43A 2VW2A 4YLZA 3SNMA 3TAYA 2CNAA 1BQPA 4L4IA 3O3QA 4Q9GA 1LHVA 2VLCA 1TWEA 2ZA9A 1MC9A 4I4RA 4XJUA 4JQ0A 2UWBA 1S0BA 2ZHMA 1JT7A 4XBNA 5FZZA 4I6IA 2W52A 3V79C 4EFQA 3KQRA 3QLQA 1T4QA 3POKA 4ZFYB 1S0EA 2QN4A 4G9NA 1QOSA 2DVGA 3UDAA 4WVWA 1IJTA 1NZKA 3B9UA 1WD3A 4YW3A 1FMMS 2ZHLA 4DQAA 2UWAA 2WSUA 2SLIA 1BFGA 4HL0A 4AGVA 3M3QA 5I1BA 4YM1A 4MYEA 5GLVA 1IS5A 1JY0A 4XFTA 3H0OA 4YGCA 2DTYA 4I8MA 4Z8SB 3M2MA 4XJZA 3PMEA 2D6LX 1FYUA 4YZ3A 2DVAA 2WT1A 5F90A 1WW6A 2ZZJA 3AP4A 2VW0A 3IN9A 2EIGA 1ULFA 2GMEA 3IPVA 5FRAA 3IAGC 3Q7XA 3AZYA 1N1TA 4PCRA 5DG2A 2DVFA 2E7QA 4Y24A 1A78A 1LHUA 1SLLA 41BIA 1HWMB 2ESUA 1BXHA 4A7KA 1HDKA 1DFCA 2DREA 1RIRA 1W3FA 2JD4A 3OBRA 2PHTA 4Q1PA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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