3RZ5A

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rz5A00
1BN4A 4KP8A 3IAIA 3M5TA 4WR7A 1MUAA 3T83A 5CACA 3RJ7A 3L14A 1FR4A 4ZWZA 1BNUA 3MNJA 3V7XA 2ZNCA 4PYXA 3P4VA 4K0ZA 3MMFA 3M1WA 4JSAA 4FVOA 1CRMA 1CIMA 1H9QA 3M1KA 3KLDB 1CNJA 1TH9A 4E3HA 1LG6A 5E2MA 1YO1A 4QSBA 3V5GA 2POVA 5A25A 3BL0A 5SZ6A 1BN3A 1RAZA 3M67A 4WUPA 5E5UA 4MTYA 4CQ0A 4XIWA 3P5LA 4ILXA 1THKA 4Q7VA 3RYJB 5FNLA 4HEYA 3OYQA 3HKNA 1DCAA 4KUWA 3MNKA 3OIMA 3MHIA 5A6HA 4Q8YA 4ZWIA 4QIZA 3DV7A 3CA2A 1CVAA 3DCWA 3N0NA 1ZE8A 5JEPB 1YDCA 4CNWA 1FQMA 4Q49A 5JDVB 3W6IA 4M2VA 1CCTA 4E49A 1RZDA 1FQRA 3MHOA 5JQTA 3M1JA 4YYTA 4L5VA 1I9PA 3DCSA 3M04A 4N0XB 3RYYA 4WW6A 3DBUA 4MDGA 4R5AA 4Q99A 4IDRX 2FOUA 3DAZA 4Q8ZA 3KWAA 1JD0A 2H15A 3PYKA 3KS3A 4JS6A 4YWPA 1IF8A 3SBIA 5FNGA 4K0TA 1EOUA 4FVNA 4CNRA 4DZ7A 1CINA 1G0FA 4XIXA 2WEJA 3VBDA 4QY3A 3T84A 2EU3A 1BN1A 1G6VA 1YDBA 4ZX1A 4Q8XA 5CLUA 1G1DA 4QK2A 1BZMA 5EKHA 3SAPA 3U45X 3HKUA 2X7UA 3UYNA 5FNHA 2AX2A 4YGKA 1CRAA 4Z0QA 1CNYA 3T82A 3U7CA 4Q87A 5JGTB 1V9EA 1CVHA 2ILIA 3RG3A 2NNOA 4RFDA 5CJFA 1TG3A 1BCDA 1BNWA 2WEOA 1HEBA 1I9LA 2NNSA 5JQ0A 4Z1NA 5FNJA 1HEAA 3S75B 3C7PA 3OKVA 1Z93A 3OYSA 4Q08A 5FLRA 2WEGA 1XPZA 4Y0JA 3S76A 1ZSAA 3DC9A 1BNVA 2CA2A 5AMDA 1G54A 2Q38A 4QSIA 3RG4A 3RGEA 3F7UA 3DVBA 4HT0A 5E2KA 1CAIA 5EH7A 4E3FA 8CA2A 5E2RA 5E28A 3P3JA 1I9MA 2HKKA 3HKQA 1CZMA 2NWYA 5SZ3A 2CBBA 3U47A 1HCBA 4YXOA 1CNCA 2HD6A 5FLSA 4WL4A 1G4JA 2NNVA 4RUXA 2FNMA 4M2UA 5IPZA 1CAJA 4Q09A 4R59A 4YGFA 5EKMA 2FOVA 1RZCA 5EIJA 3RZ7A 3BETA 3P55A 4M2WA 5FL5A 5J8ZA 1HVAA 1IF7A 3U3AX 2NWZA 1CVBA 3IBUA 3JXFA 1UGEA 4QJ0A 1RJ6A 4PYYA 2FOQA 5FNKA 1CVFA 1DMYA 1BNTA 3PJJA 5BRUA 4HT2A 1DMXA 4RUZA 1UGAA 3NI5A 2NWOA 1CNBA 2EU2A 3P5AA 3MNUA 1CNXA 4PQ7A 4ZX0A 1F2WA 2OSMA 4YXIA 3F4XA 3KNEA 3HFPA 1BNMA 3TVOX 4QK1A 1CA3A 1J9WA 1G53A 3KIGA 4MLXA 4Q7PA 4X5SA 3RZ1B 1LZVA 3CAJA 5LMDA 3D93A 2H4NA 2NXSA 1HUGA 5AMGA 1TEUX 5EHWA 5JGSB 1KEQA 1TTMA 4K0SA 1RZAA 3ML2A 1FSNA 4FRCA 2CBCA 5JEHB 4E4AA 1G3ZA 9CA2A 4K13A 3HKTA 3M98A 3M1QA 4LP6A 3ZP9A 3V3FA 1FQNA 3P58A 5FLPA 1YDAA 4TWLA 2FMZA 1AM6A 4Z1JA 1I9NA 1CVDA 3NB5A 1LG5A 5SZ4A 4KNNA 3RZ8A 2VVAX 3N2PA 1CVEA 4MDLA 4Q90A 4Q6EA 3ML5A 4KUVA 3T5ZA 2VVBX 5FLQA 5L6KA 2AW1A 3V3GB 3MYQA 4YX4A 3M96A 5JG3B 4KAPA 3MWOA 4Q83A 1TE3X 5JEGB 1BICA 1UGDA 4HBAA 5DSKA 3FW3A 1UGFA 3DD8A 1CNGA 3B4FA 1G52A 4Q6DA 4BF6A 3SBHA 1UGBA 2CBAA 4RIVA 5AMLA 2HL4A 1TB0X 3TMJA 1CAMA 1CAYA 3DVCA 3S78B 3FE4A 4QK3A 1CAZA 5SZ0A 4RUYA 4JSSA 3M5EA 1G46A 1OKLA 1KWRA 4LHIA 5FL6A 5G0BA 3V2MA 2NXRA 3LXEA 5DSOA 3DC3A 3S8XA 5E2SA 1KOQA 3IEOA 4MLTA 3QYKA 3M3XA 4KNIA 5FL4A 1AVNA 1TBTX 1OQ5A 1UGCA 1ZH9A 2NWPA 3R17B 3K34A 4IWZA 4C3TA 4E3GA 1I8ZA 5DSNA 3P3HA 4QJXA 5G0CA 3KONA 3B1BA 1KOPA 3MZCA 1XQ0A 5HPJA 2X7TA 1CNHA 3HS4A 3MNAA 3MNIA 2F14A 5FLOA 4YGJA 2FOYA 3P44A 4BF1A 5BYIA 3S72B 5BRVA 3EFIA 1DCBA 2NMXA 1CVCA 2CABA 2Q1BA 3BL1A 2CBDA 3HLJA 5DSLA 1CCSA 5SZ2A 4KP5A 5EHVA 4RH2A 1IF5A 5JG5B 5EH5A 5SZ1A 3D9ZA 4PZHA 3MNHA 4R5BA 1CAHA 6CA2A 4BCWA 4YVYA 4MO8A 1V9IC 2FMGA 5E5RA 4KNJA 1JV0A 4E5QA 3KOIA 4YHAA 3V2JA 5EH8A 3V3IB 4Q07A 4QJOA 1I91A 1ZFQA 3CZVA 5L3OA 3K2FA 1YO0A 3F7BA 5DSIA 4YXUA 4WW8A 2GEHA 4E9OX 5FNMA 4QSJA 4LU3A 1CA2A 3D92A 3UYQA 5SZ5A 4Q9YA 5DSRA 5DSQA 3MDZA 3NJ9A 4HF3A 3S71B 7CA2A 1BNQA 1YO2A 4ZWYA 2HOCA 4Q81A 3M2YA 4G7AA 1XEVA 2WEHA 5DOHA 3W6HA 4CNXA 1CANA 1Z97A 1AZMA 2QOAA 2GD8A 2FNNA 1KWQA 1MOOA 5E2NA 5BNLA 2X7SA 4FU5A 4ITOA 3DD0A 1FLJA 1FSRA 1ZNCA 1RAYA 3RZ0B 2WD3A 1HCAA 2FW4A 5G01A 3R16A 4Z1KA 1TG9A 3SAXA 1RZEA 3N3JA 3S9TA 3Q31A 5DSMA 3M2XA 1LGDA 5DSJA 1HUHA 4QIYA 4UOVA 4L5UA 4Z1EA 1RJ5A 1ZFKA 4TWMA 2NN7A 1CNWA 4HEWA 4Q78A 2IT4A 2NN1A 3S97A 3T5UA 4ITPA 4RFCA 4YGLA 3M2NA 1Y7WA 4QTLA 2QP6A 4Q7SA 2NXTA 5SZ7A 3TVNX 4QJPA 4HU1A 4KV0A 1IF6A 3OKUA 3M5SA 4E3DA 3IGPA 5BRWA 3PO6A 4XZ5A 1BV3A 4WUQA 4Q06A 5EKJA 4Q0LA 1H4NA 3OIKA 3ZNCA 2HFWA 3S73B 3V3JA 1IF9A 4COQA 1RZBA 2Q1QA 5G03A 4JSWA 5FNIA 3MHLA 4KNMA 1H9NA 2W2JA 2WD2A 4QSAA 5DRSA 2POUA 5DSPA 1A42A 1I90A 1ZGFA 1ZSCA 2NNGA 5JESB 3JXHC 5C8IA 2ABEA 1ZGEA 3IBNA 12CAA 1OKNA 4Q7WA 4CA2A 1CILA 2CBEA 3M40A 5FDCA 3RYZA 5FDIA 1I9OA 1XEGA 3DA2A 4ETQC 4YGNA 3F8EA 4XE1A 3RZ5A 5EOIA 1CAKA 1FSQA 1FQLA 4FL7A 2FOSA 3OILA 3MHMA 4MDMA 3GZ0A 4N16A 3M2ZA 4FIKA 4DZ9A 1BNNA 3OY0A 3MHCA 1UGGA 4QJMA 2O4ZA 3IBIA 4GL1X 4QEFA 1G4OA 5DVXA 5CA2A 1FR7A 3JXGA 4ZAOA 3S74B 1JCZA 1LUGA 1CALA 1G0EA 2EZ7A 3D0NA 4XFWA 5FLTA 4ZWXA 4CACA 4M2RA 1T9NA 2HNCA 3RYVB 1ZSBA 4HEZA 3RLDA 3RYXB 1URTA 3N4BA 3CYUA 4JSZA 4KUYA 4CNVA 3T85A 1HECA 1G48A 1CNIA 3DVDA 1I9QA 3M14A 4RN4A 1TEQX 5DOGA 2POWA 1HEDA 3K7KA 1IF4A 2OSFA 1CAOA 2FNKA 1CNKA 1Z9YA 3KOKA 5EHEA 1G45A 1OKMA 3DCCA 1YDDA 4FPTA 2QO8A 5EZTX 1CCUA 3S77B 4L5WA 4G0CA 3V3HB 3IBLA 4QJWA 3EFTA 3FFPX 4RIUA 4PXXA 4K1QA 3D8WA 3KKXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BN4 A;  4KP8 A;  3IAI A;  3M5T A;  4WR7 A;  1MUA A;  3T83 A;  5CAC A;  3RJ7 A;  3L14 A;  1FR4 A;  4ZWZ A;  1BNU A;  3MNJ A;  3V7X A;  2ZNC A;  4PYX A;  3P4V A;  4K0Z A;  3MMF A;  3M1W A;  4JSA A;  4FVO A;  1CRM A;  1CIM A;  1H9Q A;  3M1K A;  3KLD B;  1CNJ A;  1TH9 A;  4E3H A;  1LG6 A;  5E2M A;  1YO1 A;  4QSB A;  3V5G A;  2POV A;  5A25 A;  3BL0 A;  5SZ6 A;  1BN3 A;  1RAZ A;  3M67 A;  4WUP A;  5E5U A;  4MTY A;  4CQ0 A;  4XIW A;  3P5L A;  4ILX A;  1THK A;  4Q7V A;  3RYJ B;  5FNL A;  4HEY A;  3OYQ A;  3HKN A;  1DCA A;  4KUW A;  3MNK A;  3OIM A;  3MHI A;  5A6H A;  4Q8Y A;  4ZWI A;  4QIZ A;  3DV7 A;  3CA2 A;  1CVA A;  3DCW A;  3N0N A;  1ZE8 A;  5JEP B;  1YDC A;  4CNW A;  1FQM A;  4Q49 A;  5JDV B;  3W6I A;  4M2V A;  1CCT A;  4E49 A;  1RZD A;  1FQR A;  3MHO A;  5JQT A;  3M1J A;  4YYT A;  4L5V A;  1I9P A;  3DCS A;  3M04 A;  4N0X B;  3RYY A;  4WW6 A;  3DBU A;  4MDG A;  4R5A A;  4Q99 A;  4IDR X;  2FOU A;  3DAZ A;  4Q8Z A;  3KWA A;  1JD0 A;  2H15 A;  3PYK A;  3KS3 A;  4JS6 A;  4YWP A;  1IF8 A;  3SBI A; 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