3S0CA

Transaldolase wt of thermoplasma acidophilum
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
MKIFLDTANIDEIRTGVNWGIVDGVTTNPTLISKEAVNGKKYGDIIREILKIVDGPVSVEVVSTKYEGMVEEARKIHGLGDNAVVKIPMTEDGLRAIKTLSSEHINTNCTLVFNPIQALLAAKAGVTYVSPFVGRLDDIGEDGMQIIDMIRTIFNNYIIKTQILVASIRNPIHVLRSAVIGADVVTVPFNVLKSLMKHPKTDEGLAKFLEDWKKVSPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Probable transaldolase
publication title Twisted Schiff base intermediates and substrate locale revise transaldolase mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Thermoplasma acidophilum
total genus 81
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-05-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3s0cA00
1FUYA 5DCEA 3NQ8A 4Z0JA 4Z1AA 1DQWA 1PHQA 3C2EA 4R53A 4TIMA 4MIMA 1EWEA 4POCA 4FNRA 5DXYA 1I45A 4PCFA 1J5TA 2YPIA 4JXCA 4FNSA 3DI0A 3NQEA 1G7VA 4UFKA 3LCHA 1O60A 4QJ1A 3O05A 1VR6A 3WFAA 1SO3A 3G1HA 2GQ8A 1FCQA 5AHIA 1R2RA 3VFLA 2TYSA 4HHPA 1OX5A 4IX2A 1SUXA 4JIPA 3M5XA 2IQTA 3C4UA 1KTBA 3KRUA 4GUGA 2NXIA 5CPOA 4Z08A 2Q3RA 1H7NA 2FPYA 3TCEA 3W1PA 2VOMA 3BW3A 2QCMA 1OFAA 2J24A 3W1MA 2WO5A 3IIVA 3FYPA 4LVBA 1KBJA 1OFQA 2W0UA 1ICQA 2ZRXA 4G1KA 2QEZA 2Y88A 3DKLA 1XUZA 1LBMA 2ZBTA 1VZWA 4XKYA 5KZEA 4JYDA 5AHMA 4FHAA 2DZXA 3E9AA 1DOSA 5DXXA 1KV8A 2V8ZA 2PCQA 3TW6A 3LRKA 1QDSA 2EKCA 2CZ5A 2PURA 1W3TA 1NF7A 2B4GA 4IUOA 3HJZA 4Z1CA 3ABSA 3QFEA 3FYOA 1VQTA 4FEZA 4MPQA 1XBXA 3LRMA 2A21A 3STFA 3IGSA 4AHQA 3UQNA 3W22A 2QF7A 1ZJIA 5FF4A 1KA9F 1SZEA 1WX0A 3T44A 4YCOA 1LOLA 4LTSA 2CLOA 5HUOA 3W7QA 3PBUA 2QDGA 3KVMA 2WSRA 1RR2A 4CLMA 1JVNA 2WOQA 4O8RA 2B7NA 1ZAJA 1IIGA 4P2VA 2RDWA 1AW5A 2ZRZA 3BV4A 3PM6A 4R34A 3BG5A 1XCFA 4O52A 2VFGA 4H6KA 4AHOA 1KFKA 3BLFA 3NL5A 1H7WA 1F6KA 4K7VA 3SY5A 2EHHA 1WYIA 2NUWA 2QCGA 1WOAA 2QJGA 1YTDA 4E0CA 4WZHA 2G97A 2VC6A 3C3NA 4RXGA 3W70A 1IXPA 3NQ7A 4UFJA 1WOBA 3N9SA 4GC4A 5MHBA 3GIYA 5K2ZA 5D32A 1O5XA 4UIOA 3TKFA 2Y89A 3W1QA 3MO7A 1S3HA 3PSWA 5AB3A 1I2OA 3C0JA 4OGZA 1MEIA 1FCUA 2RH9A 1W31A 3NQAA 2JKEA 4MY9A 3B04A 1K8ZA 4M7TA 3S0CA 1XKYA 2ATMA 1NVMA 2ZCGA 3G1SA 1DKWA 1XDLA 3QZEA 3HBLA 4XUGA 3PUDA 3I65A 1NEYA 2ZZ5A 5FF0A 4LW7A 3WJWA 2GQAA 3BG3A 3NVTA 5AHFA 3MYOA 1P5BA 2RDUA 3G18A 4GBUA 4L4MA 4MKNA 3AJXA 4N4QA 1YXYA 1GVQA 4AMAA 4IMEA 1C8VA 3DKJA 3OEXA 3GK0A 1ADOA 1F6PA 4GXMA 2ZRWA 2FB3A 5G2HA 3TROA 3TQVA 5HR6A 1LLWA 1VYSX 4RJEA 4AXKA 4DQWA 1PIIA 4WUIA 2DP3A 1A5CA 3DFNA 3P67A 3VE9A 3NGJA 4IMCA 4U4MA 4IMFA 3M1ZA 3PBVA 1TTIA 3TQKA 2X1SA 1B3OA 2QCLA 5K7JA 1UBSA 2ZRVA 3L0NA 1H51A 2VKZG 4UMBA 5HWJA 4LS1A 4QM1A 1QCWA 1L6YA 3EXRA 3GLCA 1JRBA 4HKPA 1DL3A 1KM2A 3I7QA 5DELA 4DO6A 3S8HA 5D05A 4OV4A 3PG8A 3IGUA 1TIMA 3P60A 4FXSA 1JR1A 2A85A 1S5TA 4DF0A 2GVLA 4MFDA 3C52A 3KVJA 1IIHA 2TPSA 2X2GA 3SFKA 3QMSA 1ML1A 4BWLA 4WY0F 3M5ZA 4JS3A 1FWTA 2PRHA 4ADUA 2A0NA 3O6CA 1HO4A 4MVAA 2ZFAA 1P0KA 4MYXA 3W1NA 4GFSA 3GDMA 2VEKA 3O06A 3KHJA 3FS2A 1UUOA 4JIQA 4O57A 4AH7A 2CW6A 1SSGA 4LVDA 4RZ6A 3W73A 4K39A 3PB0A 3IGXA 3QM3A 1DJNA 4NX0A 4OU1A 5LGXA 4OV9A 2R14A 1QR7A 3E12A 6ALDA 1Q6QA 4A29A 4ZQCA 3W85A 3OG3A 4I7WA 1H7PA 2P10A 1QO5A 1N7KA 3MP4A 1S5WA 3DFQA 3W7LA 1K7XA 4NQ1A 1GT8A 3NQCA 4CQ9A 5TBOA 3MI2A 3L5MA 5EY5A 2YW4A 1GPWA 2D73A 4U28A 2JGQA 1YDVA 1ALDA 3NQFA 4HT3A 5D38A 4IPJA 5D02A 4LY8A 2VEPA 1HG3A 4JNMA 2Y7GA 3R13A 1GG1A 1GJPA 3OBKA 3G1XA 1CW2A 1PHWA 4TR9A 3S5YA 4FIRA 2QAPA 3IVTA 2QCFA 4K8EA 3CLMA 1ZNNA 2A7NA 3DENA 3O8AA 3MW7A 4FB7A 4PTNA 5AOUA 5FEZA 4M5PA 1SZGA 5J5RA 3W7EA 5D2VA 1N8FA 4OWGA 5C6MA 3NQ2A 2X16A 3CHVA 1T99A 2P1FA 3QJAA 2UV8G 3L67A 3TFXA 3MUXA 5EKYA 3OHIA 4UTTC 4XBSA 5K4XA 4JDBA 5G2WA 3MBDA 4UC5A 1LOSA 4XKYB 3FLUA 1TTJA 2X1UA 1MXSA 3QPYA 3TSBA 2ISSA 4EOUA 5G4EA 1KM0A 4OQVA 2GUUA 3ZWTA 5D2YA 2Z1BA 4AWTA 1QOPA 5LNSA 4JICA 1W0MA 1RZMA 1W3IA 2DZVA 3O63A 3P5YA 2E09A 3CWNA 3MHUA 3LCXA 3NEVA 2E68A 2Z6IA 3ABQA 4UTIA 3SZ8A 3SJ3A 3EWBX 5E93A 2NWRA 5FEPA 1SO4A 3NA8A 3TMQA 5LHFA 3TC7A 3HO8A 3W75A 4BFAA 1VHCA 2YYUA 1KM6A 4ONVA 1QMLA 5EA9A 2V82A 1EEPA 3RF9A 5I3HA 3HB9A 3GXNA 2E6AA 3W1XA 2RFGA 5G5IA 5A5WA 3NM3A 1FXQA 3A21A 2JGYA 2E1DA 1FQ0A 1YXDA 4NNBA 3QQ1A 3EB2A 1OF6A 3FEMA 3B0VC 1TCDA 1TQXA 2E77A 1ONRA 5LSMA 5DCBA 4WOZA 5AYZA 3C2OA 1H7XA 4JYEA 4PODA 5G4WA 2G95A 1G69A 1SO6A 1OFEA 3HQ1A 3W7KA 2A7RA 1YPIA 3G1VA 3P5ZA 3M5VA 1K7EA 4ADTA 2RKXA 3W7PA 2CLLA 4YCPA 4O53A 3EWUA 3W7MA 1Q45A 1DVJA 3G8EA 5G1YA 5LGZA 1KV5A 3E49A 4HNUA 3LHTA 1ICSA 1KM1A 3LXCA 1PS9A 3B0UX 4LT9A 2FTPA 3BLEA 3UY8A 4OE7A 1KFJA 1J4EA 3EKLA 4Y6GA 3EX2A 4ZQMA 5DCDA 1TPWA 1CX9A 4ZL1A 2QCEA 3T4CA 3BGJA 3LI1A 3Q37A 3LI0A 3GNNA 3NAVA 4IMGA 1MSSA 5KZDA 3S5ZA 1KLZA 3VCRA 3QQ0A 1I2QA 3CPRA 5HNRA 4TMCA 1TPEA 3N34A 4X22A 3EX3A 3LHVA 4RK8A 1ZFJA 3NQVA 2FQIA 1W5MA 3F1QA 4O16A 3E96A 1V5XA 1K3UA 2FPVA 2YFOA 4O18A 4XTDA 2Q8ZA 5F2GA 4CCCA 3G8RA 4OBTA 3DHDA 1X7FA 3UYCA 4X2RA 2E5CA 2B7PA 1ME7A 3KAOA 4ZQNA 4JTGA 3W7OA 3NZRA 1TTQA 5AYYA 3PULA 3B4UA 1YDOA 4J9JA 5BMXA 1EP3A 3RLUA 3HG5A 5HJLA 4ADSA 1GQNA 3LV5A 3UWUA 3TC6A 4M6VA 4O14A 1HL2A 1SU5A 1TJPA 3QW4B 3LOTA 2CLEA 5L6UA 2YSWA 4WOQA 2ZRYA 2RHGA 1DBTA 2H8XA 5HWNA 2VFDA 2QCNA 1VPXA 4JX4A 4JTEA 2A1YA 1WQ5A 3KRZA 3G3MA 1W8SA 4NUWA 1JCMP 3KXQA 1SZFA 2QR6A 3W6YA 2V81A 4NJJA 1TRIA 1F05A 3P80A 2FLIA 4JTHA 4JTFA 3MP3A 3NQ6A 1R2SA 3BO9A 3SECA 3HMJG 4UFLA 2NXGA 1JCYA 4CQ8A 3H53A 4ZQRA 5F2LA 4EF8A 1W54A 2E5DA 2QDHA 4IOTA 4K7YA 1QPNA 4FNQA 5BRBA 4DF2A 4DPPA 3H55A 1SZNA 3TJLA 2QUUA 3LHZA 2E6DA 3QC3A 1Q6OA 3W84A 2C19A 5KTLA 1KFEA 1TQJA 2LLEA 3N2XA 4EF9A 3A24A 4O4VA 2Y7FA 4YL2A 4UTKA 3STGA 2ZA2A 1YTEA 1WDWA 1F2JA 1FDJA 4WD0A 4GUJA 3UWZA 1PCKA 2QUTA 4UTLA 5TIMA 4UTWC 1GVOA 1I2NA 5HINA 3WJSA 5I3FA 3HGRA 1BEUA 2FJKA 3LRLA 5IBXA 1TV7A 2A2IA 3EWWA 4O1AA 2WJZA 2ALDA 2NLIA 3INPA 1SFJA 4N9DA 2HS8A 3QW3A 4TX9A 2QCDA 1XDMA 3M44A 3GYEA 4LUIA 3UPBA 1TPDA 4ZVJA 1JJKA 3TXVA 3UZJA 5CSSA 2NWSA 3UY7A 3C2RA 3NL2A 3P82A 3G0UA 1OFRA 2C3ZA 3TR2A 4XZ9A 1A5SA 3O07A 4O0ZA 4UXDA 1G4SA 4NNAA 3W2JA 3O1NA 1S5VA 3LLFA 3HPZA 4LU0A 2R94A 4NU7A 5LNWA 3W9ZA 2CLHA 3SIZA 5I3JA 4ORMA 2Y7EA 4GUFA 4E38A 3OVQA 3ZR4A 1LYXA 3GXTA 2C16A 1L2UA 4RZ4A 4HSNA 3PWAA 3GAYA 5TQLA 2X1TA 3QPZA 5CPLA 3V75A 1EWDA 4DPQA 3BGGA 3SGUA 1Z42A 3UNDA 3M47A 3PF3A 1OX6A 1GVSA 2GJNA 3ANYA 2ZQ0A 1LTDA 1YLVA 1XC4A 2V2DA 4KKXA 4NJKA 1QOQA 4O28A 1UASA 4PL1A 1W5OA 3O15A 4IMDA 3NO5A 3G1YA 1DV7A 3NYZA 1TB3A 3TAOA 2HSAA 3W7CA 5D33A 1G67A 4C1KA 3TNOA 3WJZA 4LRTA 3WK0A 2OT0A 3NPVA 1TRDA 4AF0A 3ATYA 1XL9A 3G1AA 4HN4A 3NR0A 3P62A 4NZJA 4ZZ9A 3M5YA 5LNUA 4DEFA 1KFLA 4IXXA 5D30A 2TSYA 1UCWA 3V1PA 3LTYA 4KFNA 3MYPA 5F1UA 4FO4A 3L9CA 2YCEA 5SWUA 3GB6A 3PAJA 3R5EA 4I9AA 4NT0A 3N2MA 3QMRA 3NXFA 5KITA 1BWKA 3PR2A 4MOZA 4MLRA 3P7YA 4X9SA 1FDYA 4UFMA 2CZDA 2V0TA 4UTUA 2WPBA 3HPSA 1ZENA 3USBA 1KFBA 3GKFA 1KTNA 4NNCA 2C13A 1J2WA 4WJEA 4NXSA 1OYAA 1UUMA 3WK3A 5I3GA 4MLJA 5T26A 1FCBA 1WAUA 1I2PA 3DGRA 3W87A 1FY6A 1VLIA 3B05A 3U8GA 1Z48A 2ZZ1A 3NNTA 3W7DA 2YX0A 1F5ZA 4LV9A 3GZ3A 2C6QA 3L21A 5D2WA 4S2BA 4YWIA 1X8FA 2ZZ7A 2JK2A 3CWOX 1WA3A 4A2SA 1RV8A 1H60A 3TU9A 5BW6A 3THAA 4N9EA 4MZ8A 2ZA3A 5H2ZA 3IIOA 4DO4A 2QCCA 3M16A 4MY1A 1ICPA 2GOUA 1W56A 1W5QA 3TFCA 7TIMA 1Q6RA 1OX4A 5DY2A 2WNZA 3WK2A 2Q3OA 3STCA 4RKAA 2ZDRA 1M5WA 5AC8A 2DZTA 5FEXA 2V2CA 3DFPA 3HGSA 1IXNA 4LVFA 4M6PA 4RR4A 3EXSA 2ZRUA 3UWYA 2ZA1A 4NVTA 1ZALA 3Q2DA 3FJ6A 3VE7A 3W2LA 3KVKA 4Y9AA 3P84A 4NJGA 3A5VA 2YW3A 3QSRA 5CKSA 2H3BA 3RMJA 4FX7A 3CM4A 4IPIA 3SGZA 4HNTA 3AO0A 3NM1A 1RQBA 3N9RA 4AHPA 1VCFA 4QITA 1OK4A 1QWGA 3WJXA 2YYTA 5AHEA 1JCJA 2YDAA 2CZEA 1MO0A 3W83A 4AWUA 2ZZ4A 3QMTA 2BXVA 1GYNA 5AFDA 5E1QA 2C14A 3IIPA 1ZCOA 1H50A 3FKRA 2BWGA 1GG0A 3BVJA 5F4XA 4O1BA 5AHNA 4TU1A 1TMHA 1RQHA 4KFOA 4AB4A 4HNVA 1OABA 1O5KA 4XBKA 1P1XA 3PY2A 1H63A 3C8FA 5EBUA 3MMTA 3ELFA 2NX3A 3IEBA 1I8JA 4P61A 2WNNA 3ATZA 1K8XA 2C15A 1VH7A 1R30A 4JTTA 1SR9A 4WY0A 4S1FA 1A53A 5EL1A 4K38A 5LNVA 2HMCA 3EX1A 3SI9A 2VEMA 1EPXA 3T55A 3W7GA 5I3IA 4PA8A 2WNQA 3ZWSA 8TIMA 3QF0A 5CZTA 4ZMGA 3F4NA 1TPC1 1WBJA 3HF3A 2VFFA 4UMCA 2FDSA 1VYPX 2Y61A 5DBTA 3N19B 2ABAA 1OFPA 3CEUA 1TPVA 5D2XA 4KWVA 3E02A 4C1LA 3GDKA 3N3MA 2XN2A 1DJQA 2VXNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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