3SCSA

Crystal structure of rice bglu1 e386s mutant complexed with alpha-glucosyl fluoride
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITSNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scsA00
6CGTA 2J7CA 1PBGA 3ZJ7A 3VTRA 2WWDA 1W3HA 3DYMA 4ACZB 4PMNA 4CD5A 1TFVA 4S3KA 1UQYA 1VBRA 4GZIA 4F9DA 5HPCA 1C93A 3UETA 5BRQA 3A4AA 1QPKA 1G94A 3SCQA 3PTQA 5BXPA 1V3HA 2CXGA 3WUBA 4LX4A 1G9HA 4OJYA 3SUWA 3RMEA 1FFQA 1OGSA 4AW7A 1VEPA 2UWFA 3GXFA 1J01A 3WNLA 3OGVA 1MWOA 1ITCA 1J0HA 4BQ4A 1PIFA 4MAZA 4WKAA 1OIMA 4EKJA 3NUKA 1E4NA 1UWTA 3FNDA 3U7VA 5A8QA 3QHOA 4ZXOA 2D3NA 3PTKA 4R27A 3U5YA 3NSXA 4W7UA 1W9DM 1N82A 2YBUA 5CZKA 4GO9A 4P8VA 4CCCA 3SCWA 3ALFA 4GIAA 4AZ7A 2XVLA 5A6BA 1V3MA 3PBGA 2WW5A 2XHYA 3CUIA 2ZXBA 5FKYA 1DWAM 1UD8A 1GOWA 4J3TA 3W29A 3QOMA 3WD2A 5A3HA 3AQUA 5AY7A 1EGZA 2GFTA 2J7FA 2VZTA 3T2PA 2NT1A 3NSMA 4ATWA 4AD2A 2O9TA 3WFZA 2WCAA 3UG4A 1HP4A 3AYRA 1JZ4A 2WK2A 1CLXA 2WWCA 4GQRA 2JIWA 3F5KA 2YLAA 3OIHA 2VCBA 4XX6A 1BAGA 1E6ZA 1HX0A 1NOFA 4V27A 2WLZA 2RGLA 1QBBA 1KR0A 2XSAA 4UTFA 5DFAA 4E2OA 1W1VA 1W9UA 3CPUA 5FL1A 1GZJA 1C8QA 3AHTA 3MMDA 3OLDA 1ECEA 2D1ZA 2Y2WA 1EO5A 2CKSA 4HZ6A 4UOJA 3PZQA 1EOKA 1GOKA 3M7SA 4DWSB 1ZBKA 4AWEA 3PZVA 4U33A 2J7GA 1GQKA 3SEPA 4C7DA 4KGLA 4QLJA 1Q6GA 1DP0A 5AC5A 2WXDM 3GYCA 4FLQA 1XH0A 4P7NA 3G6MA 2FHCA 2X0YA 1V0LA 4PCTA 1ZB5A 1J0KA 1W9BM 1LQ0A 1UKSA 3BAWA 3N11A 1EQPA 1UR8A 3AYSA 4JFUA 1TA3A 4U31A 2CEQA 1XH2A 4N42A 4ZXLA 1FHDA 2GDUA 1W2VA 2E9LA 1FP8A 4FF5A 2CBUA 4KMQA 3KZSA 2V3GA 1OCQA 3KE0A 4Z2JA 3MKKA 5BCAA 4N0RA 6TAAA 4MADA 5I23A 5A2CA 2QLYA 4D6GA 1V08A 1H2JA 1KWGA 3PZMA 1XYFA 1UG6A 3ZIZA 3L4UA 2XYLA 4S3JA 4CU7A 2W66A 1JI2A 3OGSA 4HZ7A 3L2LA 4HMEA 5ABFA 1TUXA 3WEZA 2WMFA 1JDDA 1G1YA 2J7DA 2VNCA 3BLPX 3SCUA 1BVNP 2NT0A 4MTVA 3SCRA 1H49A 3ZSTA 3WF0A 4J27A 2EPMX 1BSIA 1OIFA 2IXUA 5I3DA 1UR9A 1JZ8A 2ZUVA 1J9YA 2A3EA 2XVPA 2X05A 5M17A 2V5DA 1SMAA 1QHOA 2WCSA 1UQZA 2BVDA 3PTMA 1GHSA 5A8PA 1E6XM 1U30A 2A3HA 4W5UA 1JFHA 4W8BA 1BF2A 2WZHA 4U3AA 3RILA 2BXYA 4W7WA 4PMYA 4H2CA 3WNPA 3ARXA 4FLSA 3W26A 1ZL1A 1UH4A 3PZOA 4CN1A 2RGMA 2EBNA 4XV0A 1JZ7A 1JYXA 1DEDA 3QR3A 3S2CA 1HL9A 1CLVA 1NWTA 1W3JA 4TTGA 1AQMA 3AHVA 1HKJA 1QI4A 1P6WA 1W3LA 2W63A 3POHA 2AMGA 1M7XA 3IJ8A 1MXDA 1GOOA 2FDMA 1PAMA 2VRJA 5D9OA 1PJ9A 3WF3A 3DC0A 4AZCB 3I3EA 4OOUA 1B0IA 1VRXA 4KGJA 1QNOA 2XGBA 2D23A 4D6HA 2TAAA 2GSJA 2WC4A 3AIUA 1XRVA 1GJUA 2GJPA 1XSKA 3ZT5A 2G3IA 3GH5A 4AIOA 1W2PA 3AISA 1W9XA 5HNNA 4YHGA 5E6YA 2Z1SA 1UKQA 1KWKA 2YDRA 2G3NA 3GH7A 3DYOA 1B31A 2WMGA 1S46A 3WBAA 1V3LA 1TVNA 3WH5A 4AXNA 5M3WA 5IFTA 2XVKA 3WNOA 3W38A 3AJ7A 4D6EA 1CGWA 4BQ3A 4NZCA 1QI3A 1OBAA 1EA9C 2C0HA 2J74A 5CJ5A 1EHNA 4H41A 3N15A 4NI3A 3A4WA 3AZRA 2PC8A 1E15A 4NF7A 5EFDA 3U5UA 1LWHA 4WKFA 2ZXQA 2IUZA 4DWSA 4MJ4A 1NOWA 1V02A 2CITA 4PUEA 1RD6A 1FOBA 1CDGA 2OSYA 1NH6A 3OLGA 1Q6FA 3MMUA 5A6KA 1JAEA 5CQ1A 4UFLA 1V0NA 3CUJA 3CBWA 1XSIA 4RE2A 2GUYA 2WVUA 2UY3A 1HJQA 1O7AA 1SYTA 3WUFA 4P7RA 3CO4A 2J62A 2GDVA 4HOWA 1R8LA 3AIRA 3BMVA 1E6NA 4OBRA 3AZSA 3GXMA 1CGXA 1CZ1A 2DIJA 4IM4A 3VDAA 2PBOA 4CD6A 4GPNA 1UH3A 2AOSA 3AOFA 1UWRA 2MANA 4EE9A 1KB3A 1VFOA 8A3HA 2O9PA 1PIGA 2D0GA 4NRRA 1MQPA 3THCA 3MUIA 1UKPA 2BY2A 1LL4A 3ARTA 4PRWA 1UWSA 4JKMA 4MDPA 5HPOA 3OZPA 3TA9A 1JZ6A 5D9MA 1B3WA 2PF0A 2UY2A 3M6DA 2O9RA 3BC9A 1JF5A 1JAKA 5BXTA 1TVPA 3RM8A 4W89A 3TP4A 3AHYA 1B3YA 1QBAA 1TMQA 1WZAA 4RE4A 5CSUA 3I3DA 1WDRA 1G5AA 1V0MA 3UG3A 5C8BB 1VBUA 5BRPA 4UZSA 4AD4A 2VQUA 1OD8A 3WL0A 4D1IA 2ZX5A 1GPFA 4AZ6A 4PMUA 9CGTA 2EQDA 4W93A 1GNXA 1AQHA 5EMYA 4B16A 3WSUA 1TG7A 4UFHA 2Y8VA 2XWDA 1G01A 4V2XA 1HT6A 3FY1A 1CBGA 4M24A 2X2YA 1CXKA 2WKLA 3VX1A 4C7FA 1HNYA 1D7FA 1LLOA 4GZJA 2QPSA 2ZUUA 2VURA 3VUPA 3ECQA 4OUEA 4WKHA 1KXVA 1LF1A 4W87A 1I1XA 5GNXA 4PYSA 5E0FA 1HVQA 3GXIA 3NCOA 1E71M 3MUZ1 1MW3A 1KBKA 4HMCA 4AZCA 2J77A 3WQVA 1OGBA 2W67A 4TX6A 4W7VA 2ZXDA 1I1WA 1C7SA 2QMKA 4UOQA 5JUVA 5F7UA 2XWEA 2E9MA 4UQEA 2BS9A 5A95A 4AD1A 5CLWA 1JDAA 1J0IA 1UD6A 3A3HA 4E8DA 2JIEA 1M01A 3B9EA 3GDBA 1R87A 1R7OA 3EYPA 2B31A 1GQJA 1GORA 3LPFA 1JFXA 1W32A 1FH7A 5IHSA 4OBSA 3QGVA 2CHNA 3AS2A 2QV4A 4HOXA 3AS3A 3WQ8A 3ZO9A 1BGGA 2DDXA 4JFTA 2C7FA 2VCAA 2J79A 4B3KA 1TR1A 1CPUA 3VPLA 5AC4A 2CBIA 1WP6A 3N9KA 3FAWA 1VEOA 2BHYA 1E5NA 4P8UA 4JFWA 3M07A 4M82A 1GOQA 1WZMA 1UD3A 3BAJA 1A3HA 5DEZA 3ARSA 4AZBA 4OIFA 3DYPA 3EDJA 4H8VA 4FMVA 4XZBA 2FH6A 4UZUA 5ABFB 4M56A 1E6QM 2WBGA 3RO8A 3MV01 1R85A 2W5FA 3BAKA 1B90A 4BCEA 1UA3A 4NRSA 3WDPP 3BGAA 3IJ9A 2XPKA 1US3A 3N04A 5D8WA 2CIPA 1DTUA 1FHLA 3W25A 2XGIA 4BQ5A 4Z2IA 3W28A 2Y5EA 4PMOA 2VO5A 1NOUA 3ARUA 3TOPA 4P8WA 5M03A 2VX5A 3FHAA 2V3EA 3WMSA 1XCXA 1WB0A 3RM4A 1BTCA 4BF7A 4Q22A 1UZ1A 3WDIA 2D0FA 3NSNA 5IFPA 4J3VA 1C91A 2QHAA 3VIGA 2DT1A 3KWXA 4MB4A 1MFUA 1V3JA 2YJQA 5ECUA 3F4VA 3ZJKA 2DT0A 5I79A 1YQ2A 3TTSA 3GH4A 3UR8A 3L4WA 4JL1A 1ZBWA 1E6SM 2ZOXA 1W91A 3TTOA 2VC9A 5I77A 2ZUTA 3O2LA 4XUYA 4LGXA 1BPLB 2E4TA 4U2YA 3KL3A 4AISA 5IXEA 2JEPA 3OLEA 2YDSA 4H7VA 4DM2A 1XGZA 3LPPA 5A69A 2BY0A 3L2MA 4E8CA 3WQWA 2O92A 2YKKA 1WDPA 1L8NA 4J7RA 1E70M 1UD4A 2F61A 1GONA 4QLLA 1TCMA 5A6MA 8CGTA 3W6MA 3RDKA 3HU7A 4H8HA 5CXPA 1SR0A 2VZOA 1BGAA 3O9NA 4TOQA 3MUAA 4P7QA 1J0YA 3K1DA 3NDYA 3WQ6A 5CG0A 2ZUSA 1PEZA 3D3AA 2Y4SA 2ZICA 3CZJA 4AIUA 3CTTA 1B3ZA 1KXTA 4D72A 4JAWA 4M80A 2Y8KA 1CGTA 5TD4A 2WMJA 3GBDA 1QI5A 1WZLA 4HP5A 4HU0A 2GJRA 2YLLA 4D6CA 4Z2KA 2YIHA 2W61A 4HZ8A 1BYAA 1OM0A 4CN6A 1LG2A 2ZX6A 2DH2A 3SCSA 3SUTA 4D71A 3ZJ6A 4C7GA 3RIKA 3U57A 1MXGA 4PTMA 4MNLA 5CPQA 3II1A 3K4DA 3VGBA 1KXQA 1HJXA 1M03A 1HJVA 5E9AA 1V3KA 1E1FA 3SURA 3VNYA 1XV8A 1C8XA 1V03A 5CLTA 4LQ1A 4TX8A 3BCDA 1MFVA 2YA1A 1EOMA 2A3BA 3FHQA 3RJYA 1KQZA 4UNIA 1JZ5A 3CIVA 3CHFA 4CVWA 3BAIA 2XG9A 1ZS2A 2VZUA 4PMRA 1OGGA 3WH9A 3VNZA 4HMDA 5D8ZA 3IAPA 3SUSA 2XIBA 4F8XA 3ALGA 5E6ZA 2ESCA 3M46A 3K8LA 1GJWA 3ARZA 3VO0A 2W91A 1K6AA 3CLWA 4RE3A 3GXDA 2J78A 1DHKA 1VJZA 4ZEPA 1H11A 1LG1A 4Z2HA 4MAVA 2ZUNA 1EIBA 2VX4A 2EPLX 4TUFA 1EO7A 4UOZA 4W8LA 2J8FA 3T0BA 5A6AA 3VMNA 3TTQA 5BWFA 3EDKA 2VR4A 3WF2A 5FCZA 1KGUA 2JE8A 1E0WA 1UWUA 3CZEA 4A3YA 1Q6CA 1PZ3A 1JF6A 2VMFA 1ISYA 1A47A 2ZXAA 1KCLA 3ZMRA 4JL2A 1H1NA 1JD7A 3GNPA 4QAWA 1GOIA 5I0DA 2ZX9A 3SCOA 3VGHA 1J12A 2WKGA 1HVXA 2E3ZA 2F2HA 4OOZA 2OWWA 3WD3A 4GQQA 3OB8A 2ZX8A 3VD9A 2CBJA 5DT7A 3BSGA 1JZ2A 2YL6A 3IK2A 4FLRA 4JIEA 3W24A 4MNMA 2EEXA 4PUDA 1GUVA 3WH6A 1KGWA 3OZOA 4HPHA 1LJYA 4RL3A 1B3VA 4GI8A 2XFFA 4GINA 3WNKA 3BH4A 1W9PA 1QI2A 4X0NA 3ARVA 1R86A 2CETA 4MB5A 2DSUA 1QHPA 5A8NA 1R7AA 1OINA 3OG2A 4QLKA 3VD7A 3W53A 4MNJA 1QVBA 1E4LA 3CUHA 1H41A 1V3IA 1V6YA 5AYBA 1E6PA 1FA2A 2WC3A 3FN9A 2VI0A 2XTKA 4IISA 3CGTA 5KZ6A 3FXYA 3CZ8A 2PBGA 3BCFA 4W84A 5ABEA 2WAGA 1FH9A 3SCVA 1JD9A 3ARWA 1M04A 3WNNA 2EPOA 2D0HA 1J18A 3VGDA 3MANA 2CNCA 3N13A 1J0JA 5E0CA 2E0PA 3WDRA 2WVVA 4H8UA 1IZJA 1E4MM 4D6FA 5CGMA 2VTFA 5GNZA 2AAAA 4DM1A 2J47A 2ZE0A 3BAXA 3GNRA 3DHPA 4HA3A 4UQDA 1J11A 1AVAA 4K68A 1UKTA 3UEQA 4W85A 1LWJA 2WMHA 1QNRA 3WEMA 5GNYA 1VJSA 2CHOA 3VIIA 4CD4A 4WSKA 3RCNA 5A2AA 1WPCA 3PZIA 5D9NA 4CD7A 2BY3A 2VCCA 5A94A 4HPGA 1UR1A 1WDQA 2PI6A 3WKZA 3W6LA 1NWRA 3VD5A 2VX6A 1HKKA 1U2YA 4M8UA 2JF7A 3CUGA 1V6XA 1GW1A 2PWGA 1HJWA 4DUWA 2BVTA 1DWIM 2VR5A 1HKIA 1VFMA 1JNDA 1E73M 2UY4A 4Y7EA 2OYKA 1XD1A 2NW0A 3VMOA 5GPRA 4MDOA 1CXEA 2WHKA 5HXMA 3AS1A 3B9DA 2WC7A 2OLHA 2EPKX 3POCA 4W88A 2BV9A 2YL9A 3AIVA 1JDCA 3PZGA 1DWGM 2ZWYA 5M5DA 3L4ZA 3HN3A 2VT0A 1UOKA 1QNPA 2XM1A 2GJXA 5DMYA 3WD1A 1WDSA 1CGVA 4X9YA 2WSPA 1GHRA 2ZWZA 2WB5A 1KCKA 4W86A 2XFRA 3AHXA 1W1TA 2VX7A 3OGRA 3CZKA 3CZLA 1QNQA 1JZ3A 2PWDA 5JBEA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 6CGT A;  2J7C A;  1PBG A;  3ZJ7 A;  3VTR A;  2WWD A;  1W3H A;  3DYM A;  4ACZ B;  4PMN A;  4CD5 A;  1TFV A;  4S3K A;  1UQY A;  1VBR A;  4GZI A;  4F9D A;  5HPC A;  1C93 A;  3UET A;  5BRQ A;  3A4A A;  1QPK A;  1G94 A;  3SCQ A;  3PTQ A;  5BXP A;  1V3H A;  2CXG A;  3WUB A;  4LX4 A;  1G9H A;  4OJY A;  3SUW A;  3RME A;  1FFQ A;  1OGS A;  4AW7 A;  1VEP A;  2UWF A;  3GXF A;  1J01 A;  3WNL A;  3OGV A;  1MWO A;  1ITC A;  1J0H A;  4BQ4 A;  1PIF A;  4MAZ A;  4WKA A;  1OIM A;  4EKJ A;  3NUK A;  1E4N A;  1UWT A;  3FND A;  3U7V A;  5A8Q A;  3QHO A;  4ZXO A;  2D3N A;  3PTK A;  4R27 A;  3U5Y A;  3NSX A;  4W7U A;  1W9D M;  1N82 A;  2YBU A;  5CZK A;  4GO9 A;  4P8V A;  4CCC A;  3SCW A;  3ALF A;  4GIA A;  4AZ7 A;  2XVL A;  5A6B A;  1V3M A;  3PBG A;  2WW5 A;  2XHY A;  3CUI A;  2ZXB A;  5FKY A;  1DWA M;  1UD8 A;  1GOW A;  4J3T A;  3W29 A;  3QOM A;  3WD2 A;  5A3H A;  3AQU A;  5AY7 A;  1EGZ A;  2GFT A;  2J7F A;  2VZT A;  3T2P A;  2NT1 A;  3NSM A;  4ATW A;  4AD2 A;  2O9T A;  3WFZ A;  2WCA A;  3UG4 A;  1HP4 A;  3AYR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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