3SFK | Genus

Total Genus 133

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	133
sequence length	375
structure length	368
Chain Sequence	YNPEFFLYDIFLKFCLKYIDGEICHDLFLLLGKYNILPYDTSNDSIYACTNIKHLDFINPFGVAAGFDKNGVCIDSILKLGFSFIEIGTITPRGQTGNAKPRIFRDVESRSIINSCGFNNMGCDKVTENLILFRKRQEEDKLLSKHIVGVSIGKNKDTVNIVDDLKYCINKIGRYADYIAINVSSPNQEAGKLKNIILSVKEEIDNLEKNNIMNDEFLWFNTTKKKPLVFVKLAPDLNQEQKKEIADVLLETNIDGMIISNTTTQINDIKSFENKKGGVSGAKLKDISTKFICEMYNYTNKQIPIIASGGIFSGLDALEKIEAGASVCQLYSCLVFNGMKSAVQIKRELNHLLYQRGYYNLKEAIGRK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
publication title	Structure-Guided Lead Optimization of Triazolopyrimidine-Ring Substituents Identifies Potent Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors with Clinical Candidate Potential. pubmed doi rcsb
source organism	Plasmodium falciparum 3d7
total genus	133
structure length	368
sequence length	375
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2011-06-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3sfkA00

3EWBX 2XFWA 1GPWA 3B04A 3N73A 3NQDA 1MSSA 5F4WA 4RJEA 1GTHA 3B0VC 4A21A 5GVJA 1FX6A 1B9BA 1ICQA 5DXXA 3W23A 3DU0A 3QPYA 3S1VA 3W1RA 3QYQA 3W7QA 2QJIA 2YPIA 2CLMA 4UR8A 2ZA3A 1M7PA 1KM3A 1AG1O 4MZ1A 1W3IA 3A21A 1W0MA 4IQLA 5A5WA 1JVNA 5TBOA 1XKYA 2RDUA 4HN4A 4RZ4A 4H6KA 3W7HA 2AAMA 4EVZA 5DY3A 1K03A 1SW3A 3W07A 6ALDA 1SW7A 4JS3A 1QO5A 1IXPA 3MI3A 3R5EA 3CIXA 1T0OA 2DJLA 2A1YA 4UFJA 5FI8A 4ZQCA 2GVLA 5EBUA 3P5YA 3M5XA 4KWVA 3GXPA 3R89A 1P5BA 4O16A 3IGXA 2ZZ3A 4IXXA 2Z2UA 1H7RA 3PSVA 1FUYA 5EL1A 1Q45A 1SSGA 2WNZA 3LXAA 3FEMA 1W5OA 1R2SA 1F76A 4LVGA 4GUGA 2P0OA 3S6DA 2E5BA 3N9SA 5D2YA 3LHZA 4M7SA 4KWWA 3UXDA 3VCRA 1NF0A 3A5VA 2QEZA 2A2IA 2NUWA 4GRSA 1FXPA 4O50A 3L9CA 1VR6A 5I3IA 1AW5A 3KHJA 3DFQA 3W1UA 1CX9A 4O17A 4MJMA 3NQVA 3EEGA 3G1VA 4O28A 4DBDA 4TMCA 1N55A 3DFNA 1G4TA 3H54A 3BG3A 1QFEA 2YZRA 1VYSX 3MP5A 1EIXA 1G6CA 1RV8A 3NQ6A 3ANYA 5DBUA 4AH7A 4UIOA 2PC4A 4JTKA 3WK3A 1FBAA 2Y85A 3EX4A 1YXCA 4K37A 4JY9A 3DH7A 1W3TA 4C1KA 1NAL1 1YTDA 1QDSA 4JY8A 2HS8A 3V75A 4DO4A 1QR7A 3G1FA 2YSWA 4Z1CA 1E51A 3T78A 2V2DA 2C6QA 2YXGA 4O1AA 5KITA 3BVJA 1QOQA 5C55A 5D2VA 3W70A 4I9AA 4S2BA 3DAQA 4XQ6A 1RPXA 3E0IA 4UFMA 4Y96A 2NX3A 1KBIA 4LRTA 5K4ZA 4WZHA 4LUIA 3C6CA 3BPWA 3TJLA 1O60A 2G97A 3HPSA 1L2UA 3O8AA 3S1XA 5LSMA 3O16A 3UWQA 3OHIA 4OT7A 3B05A 4BFAA 3MMTA 2J9XA 3BO9A 4GC4A 3L0GA 5AC6A 3MW7A 4NU7A 5D38A 1KFKA 4TX9A 4OWGA 3JRKA 4ZQPA 3TA6A 1OABA 4MUZA 3R13A 1K3UA 1SZNA 3TK7A 4Z1BA 2RFGA 1LLZA 3CM4A 3FYPA 2WPBA 3CLMA 2ZZ4A 1C9DA 4RKAA 3SI9A 4RX0A 1HFBA 3AO0A 4M7TA 5IBXA 4PODA 5BMXA 4GUJA 4N02A 2VFIA 3NL3A 2G95A 1XL9A 5LHEA 3TH6A 3B03A 3W2MA 5FF3A 1FCBA 1OJXA 1PCKA 2R14A 1NSJA 4AB4A 4UXDA 3STEA 4OV4A 4CLMA 1RVGA 1VC4A 4QSHA 4LRSA 4QJ1A 3UY8A 4BI7A 1K7FA 3GR8A 4JXCA 4X3ZA 5D09A 3LCIA 5DN1A 1PVNA 2CWNA 3IGUA 4MLJA 3LHWA 3TMQA 1EB3A 3GDMA 3F4NA 3OBKA 4O14A 5BNKA 2YCEA 4JX6A 3A24A 3W1NA 1QPRA 4WX2A 3KVKA 3B0UX 2E5CA 3L5MA 3LTYA 5D2TA 3GIYA 3TROA 3FIGA 2PRMA 3RK8A 3LRLA 2FB2A 4POCA 4ZQMA 3TNOA 4CCEA 3L2IA 3NL2A 4ONVA 3ZR4A 3KAOA 5F1UA 4Z08A 3C52A 2RHGA 5HUPA 5KINA 1ZY9A 3LOTA 2ZTJA 1DOSA 1K7EA 1SSDA 1XBVA 2C1HA 5EA9A 1UASA 3ELFA 3LDVA 2NX1A 4FNSA 4QNEA 3BGGA 4O19A 3KRSA 3G0XA 1TTPA 4N2YA 2B7NA 5K7JA 2E09A 2AGKA 3IVSA 2E6AA 2EKCA 2DU2A 2R94A 1NF7A 3IVUA 1TPH1 3THQA 1ZENA 5T26A 4FX7A 1M6JA 1YLVA 4X22A 1LTDA 4H3DA 1S5WA 2BWGA 1L9WA 3O63A 3QW4B 3QM3A 4Q4KA 3W7RA 1TREA 1SZGA 1KTCA 1SO5A 2CLKA 2FJKA 4UFHA 4GXMA 4JTEA 4GJ1A 4YXGA 3M41A 2PURA 1MZHA 1JCLA 3TUUA 4UTWA 1Y0EA 3QJAA 1WX0A 3W7OA 5AHFA 4LV9A 1U83A 1TIMA 1PL9A 3GX9A 3KOFA 4W9TA 4U28A 4XTDA 4IMCA 1LDCA 4JTLA 3T40A 2FQIA 3NDOA 5G4WA 2E6YA 3NM1A 2QUTA 1VPXA 5AHMA 1IF2A 5L6UA 3M1ZA 4ZVJA 1OFDA 2YR1A 4HPJA 2W6RA 3TV8A 5EYWA 1WAUA 5I3GA 1FDJA 3W1PA 4MY9A 4JYEA 3E12A 4NZFA 5DLCA 7TIMA 4ADUA 1QO2A 2ZQ0A 5I3HA 1XC4A 3C4UA 4Y6GA 4UMBA 2RDWA 2ISWA 4R53A 3U6WA 4AAJA 4FXSA 5HINA 3GR7A 3O1NA 1I8JA 1JCXA 4IMDA 4LVFA 5CKSA 3G24A 4MFEA 5G5IA 1SZEA 4JTUA 5CSSA 1LOQA 3NQGA 4LVAA 5CGQA 4LC8A 2C19A 1W3NA 3N9RA 3E49A 2CZ5A 1FCUA 2Y7DA 5F2MA 2FPTA 4NNCA 4UUIA 1OYBA 5J5DA 3DFSA 1DORA 3Q58A 1GVQA 5U7SA 2H3BA 2BLEA 3GDTA 3HJZA 3TKFA 1Q6QA 2X1TA 3QQ1A 3W6YA 3V1PA 1TV8A 3STCA 4Y90A 1O4UA 2J24A 3JR2A 2FFCA 3NA8A 1SO3A 1VH7A 4A22A 1QPQA 3MBDA 1LM1A 2ZFAA 1DVJA 1LORA 3S9YA 4RXGA 2EAWA 2D73A 4UFKA 3LX9A 1C29A 3LXCA 1AW2A 2ZTKA 3LCHA 4JTGA 1I4NA 2VEPA 3W7LA 3R12A 3HGJA 1RQBA 4EOUA 4JTJA 4CCCA 5D37A 1EP2A 2CW6A 3UNDA 3GXNA 5H2ZA 5G4EA 3RU6A 5TQLA 3PS7A 2V82A 2B7QA 4IXHA 1X1ZA 3B8DA 4JTHA 3EXSA 4G1KA 3W7PA 4ZQOA 1K8YA 1OYCA 4O11A 1ICPA 3LI1A 3FOKA 3QW3A 3PBWA 5D05A 3FJLA 4PC8A 3W84A 3IIOA 3G1YA 2FTPA 3VE9A 1TQJA 2QKFA 3GLCA 1F6PA 1SFJA 3W86A 2CLIA 2J88A 4LVDA 3W2LA 1SR9A 5IBXC 1WA3A 1ME7A 4WQ6A 1ME9A 2Q3RA 4HNVA 4EF8A 2QCCA 3NR0A 1XUZA 3LBMA 2VFGA 3TR2A 3WJZA 1KBJA 4QNWA 4Y8FA 2V30A 4DF2A 3OA3A 3HB9A 4QISA 5F4XA 2VFDA 5CPMA 3MP4A 1ICSA 1MEWA 4XBSA 3DFTA 1JUEA 4O4VA 2Z1BA 4AWTA 4OGZA 3UD6A 3L0KA 4E0CA 2YDAA 4O52A 1FCQA 1I2RA 3NL5A 1A5CA 3TXVA 2ATSA 3N2XA 3RNDA 2VELA 4RK8A 3O07A 3WK1A 2QJHA 1X6UA 5CZJA 2H6RA 4M19A 4KFNA 4JTSA 5LNUA 2O7QA 2Z6JA 1GEQA 1H7OA 4PA8A 5FEWA 2CLFA 1FWSA 5LNWA 3NZRA 2C0AA 2V2CA 1IIGA 1PIIA 3HGSA 1UB3A 3W7EA 3W87A 4NZJA 3LTPA 3PBYA 5D33A 3T4CA 1WOBA 3LCWA 5AHNA 3EX1A 1YYAA 3FKRA 3RLVA 4JICA 2J9YA 4UTLA 3IVTA 1PE1A 5FF7A 2CLOA 3QPZA 4Q33A 3SW6A 1XXXA 2V5LA 2ZDRA 3H55A 4NXKA 3UQNA 4UCGA 3OEXA 4NUWA 5KZEA 4MY1A 4AMAA 1ZJIA 3NGJA 5AN7A 4GNJA 1SU5A 1QAPA 1S5VA 3UXAA 4QM1A 3TSMA 3G0SA 3QMTA 5I3KA 5HR6A 3PBVA 2ZZ5A 4K8EA 4UTWC 2IQTA 3W72A 4A2SA 1WV2A 3W7KA 1P0NA 3I7RA 3W22A 4UTJA 2A4AA 2NUYA 3SGZA 3G1XA 3TC7A 2F7FA 1XBZA 3HGRA 5DCEA 5HWMA 3PB2A 5F4SA 4FNUA 3BW2A 3GB6A 3M0ZA 1Z41A 4PFMA 4TO8A 4XKYB 1W56A 3BK0A 2NXHA 3DZ1A 3NQ8A 4Z1DA 1OFQA 2Y89A 3S1UA 4UC5A 3L5AA 3WJWA 4DF0A 4MZ8A 1YPFA 3QC3A 4FX8A 1KM1A 1NFBA 5FF4A 1A53A 2I9EA 3G18A 4LS0A 1W31A 3W76A 1IIHA 3SY5A 3LGEA 3EX3A 4FX6M 2FPYA 4ML9A 1EPXA 3GK0A 3T55A 4NVTA 1CI1A 4GWEA 3QF0A 1WYIA 4M6QA 1SZFA 1CW2A 2FB3A 3LCLA 4R33A 3LHTA 4IX0A 5BMWA 3HG3A 2WQPA 4S2CA 3NQCA 1GVOA 4NJKA 2CFFA 3CWNA 3I68A 5HMSA 1SFLA 5DCDA 3VI2A 3OVQA 1GWJA 4ICNA 2FDSA 2ABAA 4EIVA 5K3VA 3D0CA 3W1TA 2KZHA 1UUMA 3M9YA 1H51A 3T44A 4HT3A 3E96A 2YYTA 3G8EA 2UV8G 5AHIA 4ADSA 3GKFA 4WY0B 4LS2A 2Y62A 4UR7A 3W7JA 2Q8ZA 3CTLA 5K9DA 1M7OA 1TPEA 1GG1A 1TPC1 5U4NA 2PRLA 3UPBA 3IEBA 1KM0A 3H53A 2GQAA 4EF9A 1Z42A 2GUUA 4C1LA 3MO7A 4U4MA 3LHUA 1VYRA 2Z6IA 3W88A 3Q94A 1W54A 1LOSA 3MI2A 1JJKA 3IRDA 1BWLA 5HR7A 1OX5A 2OT1A 3GDLA 3B0PA 3LV6A 4DQWA 4JX5A 5LGXA 3FJ6A 1ONRA 3DBPA 3MHUA 3PC0A 2ZA1A 2GJNA 4N4PA 3A9IA 4HSNA 2A7NA 1V5XA 2V0TA 4JR5A 3S8HA 1FWWA 4WY0F 4A29A 1A50A 4O57A 1YTEA 3ATYA 1H7XA 4CNOA 4RLIA 1IXQA 3LERA 4O10A 3DFOA 4RR4A 4JN6A 4LTSA 3MUXA 5CPOA 1D9EA 5C54A 2GPTA 4OQVA 1BKSA 1EX5A 1SO4A 3C0JA 4MFDA 1QNVA 3M7WA 3PUDA 1B4EA 5D03A 3STFA 4LV4A 3PY2A 5DY2A 1XDLA 1B3OA 1JUKA 4O4WA 2JBMA 2J6XA 1KFEA 3QSRA 3HBLA 3LV5A 5EKYA 4HIBA 4X9SA 3TJXA 1N7KA 4Z0JA 5K9XA 2NXIA 2PRHA 1PCWA 1H7PA 3W74A 5C5YA 4AWUA 3EB2A 4UNKA 1H1YA 1W37A 3W83A 1LRQA 1TB3A 3W73A 2QCDA 1AW1A 3T7VA 1IXNA 5AFDA 2JGYA 4MIMA 1J2WA 4MY8A 4UFLA 4HNUA 4CNPA 1R47A 2QUUA 1WBJA 3PUOA 4DELA 2Y88A 3Q2DA 4AVFA 2NX9A 2GOUA 3M5VA 3F1QA 3UYCA 1O5XA 4IMFA 4KKXA 4O12A 4OE7A 4YCOA 4UFIA 1R2TA 3W75A 5H91A 3ABOA 3TE9A 3ABSA 4UTMA 4MPQA 3B06A 2XN1A 4I7UA 3STGA 2GQ8A 4XTIA 3TQVA 4BWLA 2NV2A 4RZ6A 2VFEA 3MHFA 2I14A 1EUAA 1H50A 5KZDA 3ATZA 4JDBA 3PF3A 2A85A 1EWDA 5HJLA 1BEUA 4IJBA 1WQ5A 1YTKA 2C18A 1KLZA 2EGZA 5G2HA 5A8GA 3W7MA 2C15A 3LI0A 5I3JA 4FNQA 3W71A 1D3GA 3E9AA 1F74A 4CQAA 1UUOA 1P1XA 3SFKA 1KV5A 3AJXA 3KRUA 4GUIA 3GNNA 3I6RA 5EMUA 2HMCA 4GFSA 5F2GA 3P82A 2ZRZA 1GVRA 3B4UA 1H60A 2XN0A 4YL2A 1SUXA 1BWKA 2H8XA 3G1HA 5BOOA 3W2NA 4MYAA 2GVJA 3GAYA 3UZ5A 5SWUA 3CT7A 3HG4A 1JULA 1BTMA 1P4CA 4UTIA 4JTFA 5LGZA 1KFJA 1VQTA 5LHFA 1TPFA 4JDYA 3R2GA 4IMGA 1AL7A 4DPPA 2EHHA 5D04C 1L6SA 1DHPA 1OFAA 4P61A 2TSYA 5AOUA 4WXYA 3MJYA 3P84A 5BW6A 2ZZ6A 3HO8A 5CZ0A 4FXRA 1TCDA 1W5NA 4CCDA 1K02A 1GT8A 4XKYA 2B0MA 2WJZA 4N9BA 4YMZA 3I7SA 1KW1A 3NZ1A 2E5DA 5D32A 1OX4B 1I2PA 3WJYA 4DF1A 1TPDA 4FF7A 3EKZA 4PL1A 2XN2A 3EX6A 2YFOA 4O53A 3G8RA 3EWWA 2E1DA 3PB0A 2WOQA 1P0KA 4WOZA 1FY6A 3SZ8A 2DJXA 3LCFA 2CU0A 1A5AA 3IIVA 4I7WA 5LKYA 4WD0A 4O54A 2A7PA 2QCMA 5KMYA 5KZMA 2DORA 3JS3A 3P74A 1I2OA 3LBCA 3S5OA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3SFKA

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