The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
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sequence length |
58
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structure length |
58
|
Chain Sequence |
DATFGMGDRVRKKSGAAWQGQIVGWYCTNLTPEGYAVESEAHPGSVQIYPVAALERIN
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
Dihydrofolate reductase type 2
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| publication title |
Novel crystallization conditions for tandem variant R67 DHFR yield a wild-type crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Escherichia coli
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| total genus |
12
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature |
ec
1.5.1.3: Dihydrofolate reductase. |
| pdb deposition date | 2011-06-13 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 type barrels. |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RH2 A; 2VV5 A; 2OAU A; 3T9N A; 1VIF A; 2GQV A; 2RK1 A; 3SFM A; 2RK2 A; 2P4T A; 1VIE A; 3UDC A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4AT1 B; 1XJW B; 2DXU A; 1KC8 R; 1PSE A; 2DIL A; 1OYX A; 1YHQ A; 3EH1 A; 3UPU A; 1AHJ B; 3SWN C; 3CCQ A; 1VQN Q; 2K3B A; 3NTH A; 1VIF A; 3QPH A; 1D0X A; 1K1Z A; 4PJL A; 2DFU A; 2QG9 B; 4RMO A; 3I5R A; 3CCS A; 3HP9 A; 4EMK A; 4M75 G; 1N5Z A; 4XAX B; 4BDZ A; 4M77 A; 1FWZ A; 5I22 A; 5GAO p; 1VQ6 Q; 2NUP B; 4BE1 A; 1MMN A; 1QWE A; 4HVW A; 5KYX B; 3RR6 A; 1YJ9 A; 4C0G A; 5AT1 B; 2JUF A; 2J6F A; 1JRI A; 4ZGJ B; 1A0N B; 2D8H A; 1MND A; 1OUL A; 3SWN B; 1K9M R; 1E6H A; 3FB9 A; 1VQP Q; 1VYT A; 4JZ4 A; 2KE9 A; 2JJ9 A; 2BZ8 A; 2B86 A; 2EYX A; 2RB6 A; 3CPW S; 2E65 A; 5GMK m; 1SHG A; 2EYW A; 4HXJ A; 1I81 A; 1LJO A; 2LJ1 A; 4JPB W; 1OI1 A; 2J06 A; 4M75 F; 1SG5 A; 2CSQ A; 2CUB A; 1QCO A; 1U1T A; 4J83 A; 4K11 A; 4AFZ C; 2H3J A; 3HRS A; 3UT1 A; 3OYG A; 1B07 A; 3JSC A; 5GAO m; 5A2Q E; 3EFO B; 2HSE B; 3EGU A; 2PVD B; 1VYV A; 3M56 A; 3VS3 A; 4Y28 E; 4HCC A; 3PE0 A; 1NLO C; 4RKU E; 3LW5 E; 4QQG A; 1RAF B; 1OZ3 A; 3OYF A; 4WF2 A; 3RUX A; 3E9F A; 3EGD A; 1Y0M A; 3OYL A; 1YFN A; 4C92 G; 1J3T A; 1NEB A; 2L8D A; 1ZSZ A; 4J7I A; 3HFN A; 2JM8 A; 2FEI A; 4IUU A; 3QBY A; 1NYF A; 2QTV A; 4D6W A; 1B34 A; 3THK A; 1G3S A; 3BW1 A; 2KSS A; 4N4I A; 2AKL A; 1M2V A; 3VS0 A; 1SF9 A; 3F70 A; 3TVT A; 2A7Y A; 4DBQ A; 2J6O A; 3X28 B; 4RTY A; 1WYX A; 1X6O A; 5D6W A; 2DIG A; 3A8M B; 3JB9 D; 5LJ3 h; 2Z0W A; 2L2P A; 1ABQ A; 1NG2 A; 3GF5 A; 4NL3 A; 1K76 A; 1WLP B; 3PNW C; 3MPU B; 4PFP A; 1B3Q A; 3X20 B; 1G83 A; 1BIB A; 2E3H A; 4FCY A; 2KR3 A; 3JB9 J; 1KD1 C; 1ZLM A; 3EG9 A; 3PIO A; 1GCP A; 3CC7 A; 3CC2 T; 1SSF A; 1AWX A; 4QQD A; 3LYI A; 4ANJ A; 4C8Q E; 4OMQ A; 3QUI A; 4J9B A; 2DER A; 3MJX A; 4JS4 A; 1M27 C; 1XQH A; 3JCM X; 5LJ3 f; 1XTD A; 7AT1 B; 1W2B S; 4AMC A; 4M4Z A; 1MHN A; 2BKD N; 2E5Q A; 3GLX A; 4LDX A; 4EMK C; 3VS5 A; 1V1C A; 4Z02 A; 3QYG B; 2OTJ T; 5HY6 A; 1PCX A; 4KBM B; 3OMC A; 1WJS A; 3QHS A; 5I11 A; 2R58 A; 1EX4 A; 4PNO A; 2VC8 A; 1HD3 A; 4N4G A; 1IGQ A; 1RLQ C; 2LX7 A; 3OW2 S; 2KY9 A; 5IH2 A; 5KYU B; 2EQU A; 2ABL A; 2F69 A; 1H3H A; 5KYY A; 3A8H B; 4HCK A; 1Q81 U; 4PFZ A; 5C0M A; 2HMA A; 2PUO B; 2M1H A; 4EIK A; 3M0U A; 3JCM Q; 3MP1 A; 1IRE B; 5DLO A; 3RER A; 2MAM A; 3CME A; 4PFO A; 1VUB A; 1WPY A; 2RD1 A; 4O5V A; 3REA B; 4JJD A; 4M78 G; 2MWP A; 5M9O A; 2XMF A; 2AK5 A; 3A5Z B; 1AWO A; 2QDL A; 4Z8A A; 2DET A; 1VQK T; 4C8Q D; 2R5M A; 1EFN A; 2MF2 A; 2VAS A; 1ZSG A; 2XHC A; 2RHI A; 5GMK i; 4R0K A; 1RAA B; 4OVA A; 1YJW A; 4RUG A; 2ZZD A; 1Q7Y C; 2L3R A; 1M9S A; 4M75 B; 2F5T X; 1T0J A; 2PUK B; 3M55 A; 2DRK A; 2E64 A; 1VQM Q; 2DZC A; 1QVF S; 2E3I A; 1KQS S; 1UEC A; 3ME9 A; 3S3N A; 1OQK A; 3I56 T; 3M54 A; 1V29 B; 5LJ5 h; 3JCM c; 1RI0 A; 2WAC A; 1R8O B; 3MKD A; 4II1 A; 2QQS A; 2LCL A; 3MEV A; 2EGE A; 4B9X A; 1VQM T; 3LH5 A; 4M7A F; 3MP6 A; 1Q81 R; 1RUW A; 2M16 A; 3P8B B; 1VQL Q; 1JJ2 P; 1UJ0 A; 5J26 A; 2KT1 A; 4LNP A; 1RAG B; 3V7C A; 4J9F A; 4C8Q A; 1X2Q A; 3J80 E; 2FRW A; 3FC3 A; 3WVD B; 1V76 A; 3M5A A; 2EW3 A; 2GQV A; 5KCH A; 3L2U A; 2FPF A; 3G6E Q; 1WHH A; 1RAE B; 2YDL A; 3OQ5 A; 1YIT Q; 1GBR A; 1WDX A; 1IGU A; 4D8K A; 4F04 B; 5A0D A; 5LJ5 g; 4BDY A; 3S3M A; 1M90 C; 1JXO A; 4E7K A; 2J7I A; 2BE9 B; 5I21 A; 3E1S A; 3G6E T; 4J9D A; 1IHV A; 8ATC B; 2FL7 A; 4QT7 A; 2HQH A; 1Y96 A; 4XTZ A; 1YIT T; 2XD0 A; 4B9W A; 3E9G A; 3FJP A; 2CP3 A; 1PM3 A; 4RTT A; 4KUI A; 3CMA Q; 4ZNX A; 1U5S A; 2ZPH B; 4E7L A; 3RMQ A; 1FX7 A; 1I1J A; 1YBY A; 5GJV B; 2YUN A; 2NUP A; 3OYN A; 5KYX A; 1PKS A; 3L1A A; 2O2O A; 1LPL A; 4A63 B; 4X9D A; 2HBP A; 2RMO A; 2M51 A; 1YHQ Q; 2RN8 A; 2RK2 A; 3JB9 I; 3CCQ Q; 3SWN A; 2D0N A; 3C12 A; 2X4J A; 4PJO C; 2NUT B; 2DJQ A; 3H0I A; 2WSF E; 3TSW A; 1NJI U; 3QZ9 B; 2R5A A; 5GAN d; 2ENM A; 3M0R A; 2P4T A; 4CC2 A; 3TQ7 P; 2D9T A; 3CCS Q; 1CKB A; 2E10 A; 1YHQ T; 1UHC A; 2OX7 A; 4HKE A; 1FMW A; 1S72 Q; 2LVM A; 1UFF A; 1IXD A; 3RKW A; 1YJ9 Q; 2CT3 A; 4LDU A; 5CVI A; 1VQ8 T; 4Y91 A; 5GAO q; 2YSQ A; 3EFO A; 2KK4 A; 4IIM A; 1W2B A; 1VQ9 A; 1Q82 C; 5IHI A; 2V26 A; 4ELZ C; 2OTL A; 2ESW A; 2HSP A; 5GMK h; 1BI0 A; 4M77 E; 3OMG A; 2QQA A; 2AIR B; 1Y57 A; 1YJ9 T; 4QVZ A; 1FXX A; 2XDP A; 4ZGD B; 3P8D A; 1G3Y A; 2CP5 A; 2HL5 C; 2V1Q A; 5GAN 4; 5GAM f; 4M7A C; 3A8G B; 4OMM A; 3OA6 A; 1WJR A; 4PLL A; 3RKY A; 4PK4 A; 1YCY A; 3PTA A; 4NS5 A; 5GMK j; 2VXE A; 1W1F A; 4AG1 C; 2RI5 A; 4CRI A; 1I0C A; 4WTO B; 1NJI R; 3HTR A; 4LDV A; 2RQW A; 4BY6 C; 2ZPG B; 5GAN e; 1KC8 U; 3NFC A; 2MI6 A; 1YN8 A; 2CP7 A; 2QGF B; 2LZ6 B; 3C0C A; 3WVE B; 1M5Q 1; 5CKH A; 2ZCF B; 3JCM h; 1ZA1 B; 2JT4 A; 3V7R A; 4M7A B; 3PFS A; 4XTV A; 4V2S A; 1QCF A; 1VIE A; 2JZ2 A; 4KUD K; 5A0G A; 2D0Q B; 1QW1 A; 4LXC A; 2RJC A; 3MCA B; 3ULR B; 2PVG B; 3NMZ C; 5FLX E; 2HEQ A; 5GAN j; 4J9G A; 4BY6 B; 1D1B A; 2LQW A; 3QWX X; 1NYG A; 3E2U A; 2D8J A; 3I5S A; 1K9M U; 2KGT A; 4GY5 A; 5FU6 B; 1K73 U; 1IRX A; 4LN2 A; 2ATC B; 1GRI A; 2DBK A; 2DXC A; 1R0B G; 4OMP A; 4EMG A; 2GTJ A; 3DB4 A; 4KGX B; 2PQW A; 2KMT A; 4BI4 A; 5GAN g; 3CC7 Q; 1MMG A; 3JCM g; 2IVW A; 3URG A; 3TCJ A; 3PT9 A; 2QTX A; 4J5Y A; 3UA6 A; 2MMP A; 2K5I A; 2QEX Q; 4HT9 A; 2COZ A; 4M7D F; 1H3Z A; 1YP5 A; 1Q86 U; 4A4G A; 4Z88 A; 3JAM E; 2LNV A; 2XIC A; 1ABO A; 3EHQ A; 1WXT A; 3VYH B; 3VUZ A; 5CIU A; 5I2S A; 4EPC A; 3EGX B; 2HKQ B; 4XU2 A; 3C94 A; 2XKO C; 1B7T A; 2DL8 A; 1C6V X; 3CC7 T; 4FSS A; 1KJW A; 4M77 G; 1UB4 A; 3HFO A; 1I5O B; 2LNH B; 1M4Z A; 1VQN T; 1KFZ A; 1S72 A; 2MOX A; 1OX9 A; 3CCR A; 2FYK A; 4DA4 A; 3VU3 C; 1NPP A; 1AVZ C; 3CD6 A; 2E41 A; 2RK1 A; 1N8R C; 1ZQ1 A; 2JXB A; 1EZZ B; 2HL3 A; 2DXT A; 5DY9 A; 5LJ3 d; 1P92 A; 2SEM A; 4FM4 B; 1I8F A; 2RHZ A; 1PHT A; 1R0C B; 1UE9 A; 2CZ0 B; 2A08 A; 3GBQ A; 1K73 R; 2CZ1 B; 2XU8 A; 2P0Q A; 2DE0 X; 2FVU A; 1VQ6 T; 1WGS A; 4M75 A; 6AT1 B; 5KYW B; 1RI9 A; 3SB2 A; 2RJE A; 2M0O A; 3L2W A; 3CPW P; 2MWO A; 3PVQ A; 3QII A; 3OYB A; 2LP5 A; 2VUB A; 3CME Q; 2IG0 A; 2RHY A; 2K2V A; 3EG2 A; 2RHU A; 2XDD A; 1VQP T; 4Y92 A; 3X24 B; 1KK7 A; 3A1P A; 4FYV B; 1Q86 R; 1MV0 B; 4MZM A; 4IUV A; 4PJO E; 1FYN A; 2RF0 A; 3IQL A; 1FMK A; 1W6X A; 4XK8 E; 4DEX A; 1WI7 A; 3CME T; 3O5Z A; 1U3O A; 1BI1 A; 2RQU A; 2LTO A; 1YJW Q; 1TG0 A; 3JCM W; 3MEW A; 2E6Z A; 3RIR A; 4RCB A; 1TH7 A; 2DPP B; 5EG2 A; 1HJD A; 3VYG A; 4RTW A; 2QQ9 A; 3JRZ A; 3I35 A; 4MDW A; 3ZFJ A; 1QVG S; 2CUD A; 2DEQ A; 4JRK A; 4F7U E; 2K9G A; 3PGG A; 1SRL A; 5LJ3 e; 3OSS C; 2FPD A; 1UJY A; 1MNE A; 3CCU Q; 2JTF A; 2AHJ B; 3CCV A; 3H0H A; 2HCK A; 2LCC A; 2K3Y A; 4A4E A; 4J9E A; 3SHW A; 1TS9 A; 2MYS A; 3X26 B; 1HSQ A; 4RG8 A; 2ZPI B; 3NPF A; 4JLG A; 1KIK A; 2AZS A; 5HKC A; 4M7A E; 2DEU A; 4N0A C; 4C92 F; 4AFU C; 3OYY A; 2LDM A; 2GFA A; 1PD1 A; 2L3Q A; 3PMI A; 2KYB A; 4C5G A; 5LJ3 j; 3OYA A; 4M7D C; 4IIO A; 2CRE A; 4J7F A; 4ZTJ A; 3JCM P; 2PU9 B; 2ZPF B; 4ME7 A; 4MMK A; 2GTO A; 3G4S A; 3ZEH A; 4PJO D; 3QKJ A; 2QEX A; 2OAW A; 1WHK A; 1NPR A; 3CBO A; 1VA7 A; 2EGC A; 2LT4 A; 1TSF A; 4JZ3 A; 2OJ2 A; 3H41 A; 5GAN 7; 2DL3 A; 1AT1 B; 3JB9 G; 2EQI A; 1MGQ A; 5D7U A; 2EGA A; 3TSZ A; 2CH4 W; 2NUT A; 1M1K R; 3FLG A; 5LJ3 g; 3INZ A; 2CSI A; 1AZG B; 5LJ5 d; 4E7I A; 3D7S B; 4OB2 B; 1W2B P; 2QQB A; 5CKF A; 4FL6 A; 2QK0 A; 4ESR A; 1LVK A; 4M7D B; 3HKS A; 3OYE A; 3UWN A; 4OB3 B; 2EJG A; 2P4R A; 3CC4 A; 2JOY A; 2A3L A; 3M4Y A; 3SDZ A; 1IO6 A; 3GP8 A; 2PZ1 A; 1OEB A; 3OYI A; 1K4U S; 1N9R A; 5EC7 A; 3OW2 P; 2AT1 B; 4A4K A; 1KSW A; 2KRS A; 2RJF A; 4M75 C; 3C95 A; 4L5G A; 3T9N A; 3VS7 A; 4PJO A; 4HCZ A; 4C5H A; 1VQ7 Q; 1YWO A; 1Y71 A; 4M7A D; 1VQ4 Q; 2RQR A; 1UDL A; 2Y90 A; 2KNB B; 1BK2 A; 4C5E A; 4KH0 B; 4GBQ A; 3SEM A; 1LCK A; 2EVR A; 2KXC A; 1QQJ A; 1C0M A; 5J3B A; 1PG5 B; 1UGS B; 3OYD A; 2EBP A; 4KH1 B; 5IAY A; 2WSC E; 3CXC A; 1K8A C; 3Q1J A; 5D6Y A; 2CZ6 B; 3QSU A; 4JRI A; 4F7U A; 2WSE E; 5D6X A; 4P5N A; 1N27 A; 2PTK A; 1W70 A; 2GFU A; 1VYU A; 1JBM A; 4CC7 A; 1VQ9 Q; 4ZN3 A; 3UF4 A; 4LUD A; 2X3W D; 2K7A A; 1TUC A; 3OS1 A; 2OTL Q; 5LJ5 e; 5J39 A; 2JW4 A; 1GXI E; 3LH0 A; 3M0S A; 1PD0 A; 1U06 A; 4J9C A; 1KD1 U; 1QVF P; 3R6O A; 1M3A A; 2VKN A; 1KQS P; 2J6K A; 3RKX A; 4M78 F; 4M7A A; 3MP8 A; 5GAN 6; 4VUB A; 1VQ9 T; 1BCM A; 2F2V A; 2A0F B; 2OTL T; 3FRN A; 4IUQ A; 5FWB A; 1S1N A; 3CCU A; 4RTV A; 1WX6 A; 3NGP A; 4LDW A; 4BD3 A; 1OU8 A; 4C8Q G; 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3VS6 A; 5GMK l; 1QP3 A; 1VQO A; 2L5Q A; 5CQY A; 3CCQ T; 2ROT A; 4OF1 A; 3EFS A; 4OB1 B; 2HQX A; 4RTU A; 3G71 Q; 4GLK A; 3CCR Q; 3VS1 A; 3CD6 Q; 1M2O A; 2YLC A; 3EG0 A; 5GAM j; 2MK5 A; 3H0F A; 1K9M C; 5GJW B; 5GMK e; 5IHN A; 3JB9 H; 2L3S A; 2KEA A; 1BCO A; 1YI2 A; 4NL2 A; 3CCS T; 2HZY A; 3EG3 A; 4WCI A; 2YUQ A; 1RAB B; 4B6M A; 1S72 T; 4KT0 E; 4M78 C; 4HT8 A; 1YCS B; 3CD6 T; 4FYX B; 2F1L A; 3I56 A; 3CCE A; 1ZHI A; 1WXU A; 3GOX A; 4JLI A; 1X6G A; 4HVU A; 5GAM g; 3V8K A; 2QGG A; 2EKH A; 3M0T A; 2DL7 A; 1N6A A; 2KRN A; 1N9S A; 1M90 U; 2C0O A; 2LX9 A; 4Q5W A; 2XG8 D; 2DL5 A; 2V8J A; 4OP0 A; 1T3S A; 4M75 E; 1R77 A; 4DEY A; 2RA2 A; 1TUG B; 5C6S A; 2KAF A; 1TU0 B; 3H6Z A; 3JCM e; 2A37 A; 1NEG A; 3P8H A; 2HQE A; 4M78 B; 4OGE A; 4M7D D; 2D1X A; 5FU6 C; 3OYK A; 3NHN A; 3N5B B; 2QI2 A; 2HBW A; 3DLL A; 1UGV A; 4XTY A; 1AZE A; 1PWT A; 3CCL A; 1G2B A; 2EQM A; 4BE0 A; 3CCV Q; 4EDU A; 3GIB A; 2K4Y A; 5CK9 A; 1UGP B; 4QVC A; 3OBW A; 2DO3 A; 1D1C A; 2R57 A; 2RH2 A; 3QDR B; 2X35 A; 1WHM A; 2CP0 A; 2KT8 A; 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