3SGZ | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	351
structure length	336
Chain Sequence	PLVCLADFKAHAQKQLSKTSWDFIEGEADDGITYSENIAAFKRIRLRPRYLRDMSKVDTRTTIQGQEISAPICISPTAFHSIAWPDGEKSTARAAQEANICYVISSYASYSLEDIVAAAPEGFRWFQLYMKSDWDFNKQMVQRAEALGFKALVITIDTPVLGNRRRDKRNQLNLEANILKAALFPKASFCWNDLSLLQSITRLPIILKGILTKEDAELAMKHNVQGIVVSNHGGRQLDEVSASIDALREVVAAVKGKIEVYMDGGVRTGTDVLKALALGARCIFLGRPILWGLACKGEDGVKEVLDILTAELHRCMTLSGCQSVAEISPDLIQFSR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Hydroxyacid oxidase 2
publication title	High resolution crystal structure of rat long chain hydroxy acid oxidase in complex with the inhibitor 4-carboxy-5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-1, 2, 3-thiadiazole. Implications for inhibitor specificity and drug design. pubmed doi rcsb
source organism	Rattus norvegicus
total genus	126
structure length	336
sequence length	351
chains with identical sequence	B, C
ec nomenclature	ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date	2011-06-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3sgzA00

1XBXA 3EWUA 1DORA 4O53A 1RD5A 5CZ0A 4MPQA 1YYAA 2V8ZA 3HG2A 3PSVA 3A9IA 3NR0A 4HN4A 1JQXA 1D3HA 3L0NA 4Y9AA 3TV8A 1W5MA 2WPBA 3Q37A 3W7EA 3PBVA 1GVQA 1IXQA 3HOJA 5IBXC 5FF7A 4FXRA 2WNZA 5AC7A 2ZRXA 1OFEA 4QITA 3QMRA 5HUPA 3ZFHA 2BTMA 1O94A 2GQ9A 1LRNA 5LGZA 5D05A 2CWNA 1QFEA 1TV7A 4WXZA 1G6CA 5LSMA 3PY2A 4D2JA 2TMDA 1P4CA 3L5AA 1ZAHA 2A5HA 3KVMA 5HUOA 3HB9A 2ISSA 3W1PA 3D0CA 3G3MA 5I3FA 1SFLA 3LV5A 2DZPA 4R33A 1I2RA 1Z42A 2GUUA 4AWUA 1I2NA 3NQEA 4U4MA 2Y7DA 1XL9A 1N8FA 3W73A 3I6RA 1K02A 2ABAA 1OX6A 4DO4A 2NXGA 1NSJA 4M6PA 5L6UA 2HS8A 3O63A 3ZWSA 1JULA 5AYXA 1F73A 2VENA 3ZS4A 3TMLA 3RLVA 3DI1A 1VPXA 2E5CA 5HQEA 1L6SA 1O4UA 4IQLA 4YCPA 2QDGA 4FIRA 5LKYA 3BGGA 2QEZA 3W85A 5LNVA 1V5XA 4HIBA 1RQBA 3MO7A 3N9SA 4GRSA 4M6VA 5DCBA 3G1XA 1SPQA 1SSGA 4YCOA 4MFEA 2DZWA 5HWJA 1XDMA 2CFFA 3K30A 2EGZA 4JY9A 3OG3A 3O16A 4M19A 4O0ZA 1OYCA 1H7XA 3UWZA 1H1YA 3BG3A 3QYQA 4FX6M 3CEPA 1GG0A 5AHIA 3LCHA 4HNTA 3NPVA 1D9EA 3TH6A 1MSSA 3WJXA 1HUVA 2YYTA 1B4KA 1DVJA 4FNRA 1CX9A 3ABQA 2TPSA 2WJZA 2X1SA 3DFNA 3MBFA 1KLYA 2NZLA 2Q8LA 4AF0A 5EKYA 4QQ3A 3NPXA 4JTUA 2PRMA 5D38A 1TPC1 1W8SA 4GUFA 3TUUA 1YADA 3INPA 1ADOA 2QCGA 5F4SA 1AW5A 1TCDA 4P2VA 2A7RA 1C8VA 1OFBA 3C6CA 3HGOA 5FF0A 4MOZA 3TQ0A 4JY8A 1SO5A 1AW2A 3BW3A 1FWNA 4N4QA 3M1ZA 1SZGA 3FYPA 3IIOA 2A1YA 3LCIA 3L66A 3W7OA 1A5CA 4MZ1A 1I2OA 1H1ZA 2CZEA 1TPB1 3CIXA 7TIMA 5U4NA 2E6FA 1GT8A 3O6CA 4S2BA 1PV8A 2QCEA 1AMKA 2H90A 1YDNA 3UY7A 1W3TA 1A53A 2TRSA 5CSRA 5D2XA 5AOUA 1AK5A 5CZSA 1JUEA 3MW7A 5K7JA 4ZQNA 5E0KA 4LY8A 2ALDA 3VE9A 3PUDA 4NJJA 1LYXA 5G2IA 5BOOA 1FWRA 3DKJA 4PC8A 2R8WA 3NGJA 1KFEA 5F2IA 5CZJA 4AEOA 2YR1A 1WDWA 1FUYA 1H63A 3B05A 4EIVA 4N6FA 5LNWA 1ICPA 3OVQA 1EB3A 5C2XA 3S1XA 4GXMA 3HG4A 3WJZA 1L9WA 3W2JA 2QDHA 3E02A 2OT1A 4X9SA 3PB0A 2H3DA 4C1KA 4JTIA 4UFLA 3S1UA 1F74A 3MYOA 2J9ZA 5EBUA 4LS1A 1W3IA 4ONVA 1JJKA 2WOQA 3M16A 1F76A 5KTLA 1X1OA 1I2QA 2DP3A 2AQWA 1VRDA 4JTSA 2QCLA 4A3UA 4X2RA 4NZJA 1HO1A 2WO5A 1JVNA 2CZDA 5K9CA 2QCDA 4LU0A 3FOKA 2W79A 1VJIA 5LHEA 1BTMA 3QRHA 3W83A 1KM2A 3MP4A 3KVKA 3PB2A 3EB2A 3GIYA 3EWXA 1FY6A 3W7RA 3GVGA 4Z1CA 1TMHA 5EMUA 5CPLA 3NO5A 4KFPA 2J9YA 1Z41A 5F1VA 4JTFA 1FCQA 1JCMP 2NV2A 4DELA 3JR2A 3TXVA 4JTJA 1T0OA 3CIWA 3A23A 1K7XA 1JRCA 3I68A 2JBMA 1TQXA 4AAJA 3TJXA 3B04A 1R2RA 3W7JA 3DFTA 2B0MA 2CLFA 2Y7GA 2QCNA 3W7DA 1K7FA 3NM3A 4UR8A 4O57A 3P60A 4N2YA 5HJLA 1I2PA 3G1AA 4KKXA 1VCVA 4LRTA 3M5VA 4BI7A 2J6XA 1LORA 4K8EA 4JX6A 4LV9A 1JCXA 1ALDA 1FDZA 4YXGA 2R94A 3FKRA 4AHQA 4EVZA 3EWYA 1KV8A 2X16A 3W1XA 4QSHA 2X2GA 3MI2A 4L4LA 5K4ZA 4KWWA 4O8RA 3W1NA 3IEBA 5HULA 4CCEA 3ABSA 4CQAA 1DBTA 3KXQA 2WSQA 3QC3A 4Q33A 4MVAA 1EPXA 4CNNA 3DHDA 3TKFA 5IBXA 4IUOA 4XQ6A 5L9FA 3RFAA 3TDFA 1MZHA 1LLWA 4UMBA 3NQCA 5EPDA 4O11A 3T44A 5DCDA 1WBHA 2CU0A 5CPMA 4PA8A 1IIHA 2H6RA 3CM4A 3QQ1A 4UMCA 4C1LA 3TMQA 3G0SA 4AWTA 4HSNA 3IGXA 1IXNA 2B4GA 3KHJA 5LGXA 2ZFAA 2J9XA 4LNYA 3GAKA 1ZJIA 1XKYA 2ZA3A 2CZ5A 2EAWA 4J9JA 1SU5A 3PAJA 4NXSA 2VEMA 4WD0A 1J5TA 3HG5A 4GNJA 4PODA 3VI2A 3SW6A 3PR2A 5AHEA 4AHPA 2O7QA 3I7QA 3W2UA 2GPTA 5D2TA 1H61A 4PL1A 1QO5A 2XN2A 3SSJA 3W2MA 4YLWA 3UXDA 3TX9A 3E49A 2QUVA 4HSOA 1GZGA 3NQAA 2C14A 3P5ZA 1FXQA 4WY0A 5FF3A 1G4SA 3TC6A 3FLUA 3SI9A 1XM3A 8TIMA 4IJBA 3M0ZA 4MYAA 2RFGA 3W7GA 1YPFA 3CEUA 1SO6A 1R46A 3B0VC 2FPTA 3QSTA 2OJPA 1ZCOA 3H55A 1BWLA 1EWEA 1RR2A 3MHUA 3H53A 3GB6A 5K3VA 3NQMA 4O50A 2YSWA 2NX9A 5FF2A 3HQ1A 4ZQMA 4O16A 3JRKA 1VR6A 5EYWA 3S1WA 1UCWA 4NNCA 3W75A 4GWEA 2QCHA 4MZ8A 2BSLA 1OF8A 1ML1A 4GBUA 1F6PA 1WQ5A 1G69A 3M6YA 1LBFA 4DQWA 2QJIA 3NXFA 1S5TA 5HINA 3QM3A 3BV4A 4Y90A 4RX0A 3UD6A 3OVRA 1ZNNA 4UMAA 4UR7A 1FXPA 1WA3A 1X8FA 4GFSA 5EA9A 2TSYA 3DXIA 2E77A 5F1UA 3G0UA 4RXGA 4ALDA 4X22A 3T7VA 5CZTA 2DZSA 4OBTA 4ZQPA 4ZMGA 2FPVA 5AHFA 1AW1A 5KMYA 3LHTA 1VLWA 1EWDA 4MIMA 1FX6A 3OHIA 1H7RA 1A5BA 3FJLA 1LM1A 1ZENA 4LUIA 1HL2A 5D32A 4Z0SA 1WBJA 5C5YA 5SWUA 4TMBA 3AJXA 2CLLA 2V30A 2V82A 1LBLA 3DH7A 5HNRA 1SZFA 3W1QA 4W9TA 3W88A 2F7FA 1OFQA 4CQ9A 1YTDA 2PE4A 2QAPA 3N3MA 1P0KA 2CZFA 4N9EA 3T78A 3RLUA 4LVBA 3VCRA 2OT0A 4LVFA 2CLKA 3SR7A 1G67A 5I3KA 2JKPA 4OU1A 4TR9A 1A5SA 4MJZA 3G18A 5CPNA 1LDCA 2Z2UA 1PE1A 1XCFA 2RH9A 1DQWA 1EP3A 4JIPA 3NA8A 3F03K 3W7NA 4DO5A 1Q6RA 1W31A 3I7RA 2Y7EA 2FPYA 4LVGA 1PS9A 1QDSA 3N19B 1TPVA 3I65A 3LRMA 3NL2A 3UWWA 2QCDB 4ZVJA 3E12A 3NOEA 3IGSA 4O15A 2X30A 3NZRA 3IVUA 4O0KA 2VKZG 3UY8A 4Z1AA 1GVRA 4POCA 1X6UA 3HPXA 5GVJA 2G97A 5LNRA 3W7IA 5HMSA 5D04C 4CNPA 2X1UA 2X1TA 1O60A 2WNNA 1K7EA 2YW4A 3CB8A 3QMTA 1B3OA 1X7FA 5AHLA 1T8XA 1TRDA 3THQA 4CNOA 4YMZA 2QCMA 4K7YA 3HGSA 1EX5A 1J4EA 1OK4A 3R5EA 2H8XA 3LHWA 4YL2A 2ZBTA 3O6YX 3W87A 3P8IA 1HG3A 3BG5A 5I3JA 3NQ7A 3B03A 3L21A 5DBTA 3W1LA 3ABOA 2EKCA 3LERA 4O4VA 1SW3A 4FXSA 3LCXA 1VS1A 5FEZA 2ISWA 1ICSA 3YPIA 1EP1A 2A7PA 3DKLA 4LS0A 2NXIA 1IXPA 4IMEA 3KAOA 4WOZA 3L67A 4UFIA 4UTIA 2NUWA 3EXSA 5D30A 3MMTA 3B06A 3WK1A 2Y63A 2NX3A 5LNUA 4OV4A 5CG7A 3WK0A 1OX4A 3N14A 2QJGA 4O4WA 3W2NA 4JR5A 3TA6A 4MY1A 1XDLA 5A8GA 1SO4A 3UWUA 4RZ4A 4NU7A 2XN1A 3MHGA 6TIMA 4Z0JA 2ZDRA 3W84A 3M5XA 5LZLA 3G0XA 4JGDA 1NFBA 4UFMA 3L5LA 3NQ2A 3Q58A 4LS2A 5FEWA 3VE7A 3F1QA 4QNWA 4GJ1A 4IWWA 2Y89A 3SIZA 1OFAA 5F4XA 2H3BA 4UIOA 1AL7A 1TTIA 4ZZ9A 1DJQA 4L4MA 4OE7A 3OVPA 1KBIA 3CC1A 3N73A 3QFEA 5H2ZA 1JCYA 4KFOA 1TPWA 2FIQA 2PCQA 3FS2A 1GJPA 1TJRA 4UTLA 1H62A 3BK0A 2V9DA 4Y6GA 1YLVA 3GDTA 4RK8A 3DBPA 1VYRA 2WKJA 3SGUA 1KFJA 1TB3A 3LCGA 4M5PA 3DFQA 4WJEA 1TQJA 4DF2A 4G1KA 3S8HA 4UFKA 1Z48A 3NDOA 1KFLA 1TPH1 2I14A 2DU2A 4LTSA 1OHLA 3L2IA 3KVLA 5D2VA 4N6EA 4O1CA 2PRLA 1K03A 1SSDA 5D33A 4N9BA 3P74A 5IM51 4Z08A 2DJXA 2NWRA 5AYYA 3A21A 3TQKA 4FX8A 2A7NA 3W71A 1EA0A 4NQ1A 4WOQA 2OCZA 4O1BA 1PCKA 2BWGA 4UTWC 4ORMA 3IGUA 4TX9A 3U2OA 4FB7A 5TQLA 3O07A 2C19A 4EWND 1W5QA 1W3NA 2AAMA 4XKYB 1RVGA 1K8ZA 4JTTA 1GTHA 2FDSA 3HGJA 4NNAA 1OFRA 3EEGA 5G1YA 3PG8A 4OT7A 5TBOA 1FWSA 1VHNA 2ZZ5A 4K36A 2VFFA 2ZTKA 4XBSA 5DXXA 3LBCA 2V2CA 3NL6A 3A24A 1KM4A 3GDLA 4NX0A 1GQNA 5DY2A 1OFOA 1B57A 3QZEA 5KSWA 1G4TA 2ZQ0A 3TIMA 1QAPA 3W7KA 1VGAA 3DFOA 2QCCA 2NWSA 3TU9A 4FNQA 4ADTA 3LRLA 2C0AA 2RHGA 5FEXA 3Q2DA 4UNKA 1GVSA 1QPQA 1TTQA 2A2IA 5AHMA 1EEPA 1SZNA 1YTEA 1KM1A 1TIMA 1FWTA 3V75A 5FF4A 1Q6QA 4UTMA 3W2LA 1S5WA 2ZA1A 3NNTA 2CLEA 4DBDA 3M47A 3GNNA 3GXNA 2JGYA 3AO0A 3N2MA 1VHCA 4IPJA 1LTDA 3UZJA 1KM0A 2VFHA 2VOMA 3IVTA 5AN7A 1FBAA 3TSDA 4BI6A 4TO8A 4NX5A 1RV8A 1TSIA 1I45A 2NXHA 1XBYA 4GE8A 2HMCA 5F2MA 1J2WA 5FI8A 3MUXA 2UV8G 4QJ1A 4P61A 5G1TA 1KTCA 4I7UA 3PUEA 1C9DA 4WXYA 3C2FA 3KX6A 3MP3A 2FQIA 1VQTA 4UXDA 1HTIA 2XN0A 3LB0A 4R34A 3CLMA 1SZEA 2QF7A 1H60A 2B7QA 4UTTA 2P0OA 3U8GA 2A6LA 4UFJA 2A0NA 4EOUA 3R8RA 2RDTA 3ABRA 4YWIA 1XUUA 4JYFA 2PURA 3EWZA 3W7CA 2Y62A 1KBJA 3EXTA 2YW3A 1JUBA 4XTIA 3CPRA 4XZ9A 3DENA 1R47A 1VLIA 3VKJA 1NVMA 3L5MA 2ZYFA 1EIXA 2Z0IA 1RZMA 2J24A 3WJSA 1W37A 1XXXA 5E93A 4BFAA 3MI6A 3EKLA 3NM1A 3BVJA 1DL3A 1UUOA 2ATSA 4HNVA 4UUIA 2QJHA 1PHWA 3O6DA 3EX2A 2V81A 1BKSA 4BF9A 1K8XA 1DKWA 3V1PA 1ZAJA 4IXXA 5KITA 5G2WA 1NF0A 2YFOA 5D2WA 1THFD 2JGQA 1ZY9A 3KVJA 5KZEA 1UB3A 3R12A 3WJWA 1GG1A 3LXCA 3G1VA 3C2RA 5BMWA 3N34A 4E2DA 1NAL1 3H54A 2XFWA 4FEZA 2DZXA 3PC0A 5F2LA 5DN1A 4FO4A 1FQ0A 4O52A 4M7SA 4AVFA 4N9DA 4NJHA 3RK8A 2D73A 3BO9A 3ANYA 4HPJA 3UPWA 4PL2A 2YPIA 1VZWA 1GPWA 1B4EA 3MYPA 3QPYA 3STCA 4EF8A 4FF7A 3NZ1A 4OHQA 3TJLA 3TXZA 3DHFA 3E9AA 4RV8A 1UBSA 2C18A 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3HIJA 1XBVA 4QM1A 3LI0A 3HO8A 4FNTA 2WSYA 4IXHA 1TREA 5I3IA 1GOXA 3LHVA 3TE9A 5HR6A 1LOQA 2GJLA 2IQTA 2CLHA 1ZALA 3KOFA 4E38A 5K4XA 1SR9A 4FIQA 3NG3A 2E6DA 4ORIA 3W86A 3KRSA 3GAYA 3HPSA 4BWLC 4IMCA 1UUMA 4JTHA 3MHFA 1DHPA 4GUGA 3TSBA 4BR1A 2KZHA 3C8FA 3UZ5A 4QIUA 1PCWA 3UNDA 1LRTA 4K39A 1P0NA 3S0CA 4Z1BA 2V2HA 5HWNA 1Z44A 1W5NA 3QF0A 4NT0A 3DZ1A 3STGA 1Q6LA 2GJNA 3MBDA 4UTKA 2BZNA 3GXTA 4NJGA 2NV1A 5AHNA 1N7KA 2YX0A 1WX0A 3TCEA 3CWNA 3M7WA 1ME7A 2H8ZA 5AC6A 1KW1A 4FHAA 3W3OA 4DPQA 3L65A 3P62A 4DPPA 2OMAA 5D2YA 3GNDA 2CLMA 3P7YA 3LCFA 3HG3A 4NXKA 1SFJA 3NAVA 4MUZA 1AG1O 3NPUA 2ZRUA 4A21A 5J5RA 3OIXA 3QW4B 4MJMA 3P80A 5K9XA 1OYBA 3P84A 1LROA 3W1RA 3IV3A 5AFDA 1QOQA 4UFHA 1ONRA 1FCVA 3A5VA 1O5KA 4IMFA 2YFNA 4HPXA 2GOUA 2GQAA 2ZZ7A 1H7NA 1FDYA 4DF0A 3LHZA 3C3NA 1SQ7A 1CI1A 1TPDA 3FKKA 1OYAA 3MP5A 4S2CA 3SECA 3LOTA 3QJAA 4JS3A 3O06A 2P1FA 3P81A 1QOPA 2V5LA 1I8JA 3LCWA 4JIQA 5CGQA 2FFCA 1GVFA 1KFKA 3PWAA 4GUJA 4Y96A 4WY0F 5DY3A 1NF7A 3BPWA 2HSAA 3FA5A 4FNSA 3W1UA 4AH7A 1OFDA 2BX7A 3C52A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3SGZA

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