3SJHA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp-latrunculin a
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 120
structure length 357
sequence length 366
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3sjhA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3sjhA03
1XC3A 3VEVA 3QFUA 1GLBG 1GLJO 4YDUC 4BRDA 1U2VA 5I9EB 4BRIA 3CJ9A 1TYQA 2GWKA 2D0OA 4CZMA 4BC3A 5AQMA 4FOIA 4AM7A 1NGDA 4CI6A 2GELA 4XH1A 2W41A 5BN8A 3FFKB 3DJCA 3H3OB 3U4LA 4B1UB 4JN4A 1ATRA 3DXKB 4RWTA 5LJWA 3FLCO 1TYQB 4CBWA 4BG9A 3BEXA 5AQUA 2VCPA 1QZ5A 1ZC6A 1MWMA 3DXMA 2J4RA 2NZTA 4CD1A 3A0IX 3JS6A 5CE3A 3OHRA 3MCPA 3ULEB 3KHYA 2BUPA 3M6GA 4IO8A 1SQKA 2QWRA 3H1QA 4BC4A 4CZGA 1BA1A 1H1VA 2P9LB 3IDHA 3O08A 1XUPO 1E4GT 5ELZA 3TPQA 4BR9A 3VERA 3DXMB 3DAWA 4BROA 4BRFA 2UYTA 2QW9A 4H5TA 3LDPA 3O5BA 1BG3A 4NO7A 1ESVA 2ASPA 4H0PA 1HX1A 4DHYA 1NGHA 3A5NC 4B1XB 3JXUA 5EX5A 3D2FA 1NBWA 3BF3A 5KPTA 4XH5A 5AQPA 3IFRA 3GBTA 5B8HA 1JCEA 3HZ6A 4Y0WA 5BPNA 1SZ2A 2FF6A 3FZMA 4AM6A 1GLDG 1K8KB 1WOQA 4WQ5A 2A40A 1BWFO 3SJHA 4O8KA 4BGBA 2QWLA 3UE5A 1RGIA 5AFUA 4JNEA 1LOTB 3H46O 2V52B 3VGMA 4PKGA 2CH6A 2KHOA 3P4IA 4K42A 4FO0A 3I33A 4LC9B 4FWSA 3ZX3A 4CJ7A 3C7NB 3O8MA 1HLUA 4FL9A 4O5FA 5AQRA 5AQGA 3CJBA 5AQNA 4H5WA 4BRPA 1YUWA 2IIRA 3WQTA 1BOTO 3RSEB 3CIPA 3J8AA 1V4TA 4ISFA 2FF3B 4IJAA 2E20A 3SLCA 4B1VA 2VYPA 3VEOA 3QFPA 1KAYA 3VF2A 4CZIA 2Q0UA 5AQYA 4ISEA 2ZGYA 4BRKA 4B1ZA 3WXJA 3AAPA 3A8YA 1Y64A 3VEYA 5AQJA 4CZEA 3H45C 4CBUA 4FOEA 1DEJA 2AP1A 5AQZA 1ZXOA 2P9KB 2Q2RA 1X9JA 4BC2A 5AZJA 1X3MA 3KZBA 4BRAA 4EAHD 3UB5A 1ATSA 1E4FT 2ITMA 3MDQA 1CZAN 3VEWA 1SAZA 3QBWA 4HTLA 4B1WB 3CETA 1OKJA 1RDWX 3LDNA 1NGGA 3QBXA 4XEIA 5AQVA 2ASOA 5AZJB 4ISGA 5LJVA 2P9PA 2P9IB 3A5OC 5EXWA 1QQOA 4BR2A 5AQKA 5EOYA 3R8EA 4FWQA 2IVNA 3CJCA 4FSVA 3CHWA 4MLEA 1IG8A 1U2VB 1ATNA 1NM1A 1NGFA 2GEMA 2WUSA 1BUPA 2E2PA 2QWPA 2E1ZA 3VGKA 3VOVA 3HBTA 3EKUA 4H0XB 1DKGD 2CGJA 3L6QA 2YJFA 3U8XA 3LDOA 3KVGA 4IJNA 1NGIA 4WQ4C 2Q36A 2P9UA 4RTFD 2GTDA 3G25A 2NLXA 3FE1A 2P9SA 2ZF5O 1T6CA 2A3ZA 3ID8A 4H5VA 3IUCA 1ZBSA 1MWKA 3LDLA 3LDQA 3MK6A 5AQIA 4IWVA 1V4SA 3LL3A 4BR4A 5AR0A 3MN6A 5AQHA 2W40A 2E88A 4E1JA 2HMPA 1C0GA 2P9UB 3HI0A 1YXQA 4IXCA 3O80A 2IVOA 3SK3A 3M1FA 5LY3A 2CGLA 1KXPA 2Q97A 2V7ZA 2V51B 3GE1A 4BRHA 4YDUA 1YVNA 3VESA 1T6DA 4CZLA 2I7NA 4XH4A 3D2FB 3H1VX 5E84A 2ASMA 3MMVA 1TUYA 3M3ZA 3D7EO 2GWJA 3D2EA 1LCUA 3C0BA 4B1YB 1HJOA 4HWIA 1NGBA 1U6ZA 1IJJA 2D4WA 1C0FA 2FLOA 4L3QA 1BO5O 5E26A 3WQUA 2FSJA 1GLLO 5KPRA 3BP8A 3AY9A 4BRGA 3UKUA 3FZKA 4C23A 1QQNA 2ZWHA 3D2EB 4K25A 1GLFO 4JAXA 4QS8A 5AQQA 3WXLA 4CZHA 2V7YA 3ZX2A 3SMSA 3VF6A 5KQDA 5BN9A 2Q31A 1BU6O 5BRDA 4BG8A 1QQMA 4B9QA 4BRQA 3LM2A 1QZ6A 1HPMA 3WUHA 3UKUB 3VPZA 4KBOA 3R9PA 1EQYA 2I7PA 3MN5A 4CBXA 4WYBA 4M7XA 3FR0A 3CQXA 1YAGA 1T44A 4BGAA 4Z94A 3WEEA 3VETA 4BRNA 2OANA 1X3NA 1BA0A 4H03B 3L0QA 3GG4A 4I6MA 5AQFA 4EHUA 1D4XA 3AAQA 3LM9A 5JLHA 3I8BA 3O1WA 5F2RA 3IMXA 2E8AA 2E2NA 2QXLA 4M63C 5ADXH 5AQLA 5F1XA 1JCFA 4IZ9A 5BRFA 3HTVA 4EFHA 2P9NA 5JICA 5AQXA 1WUAA 3CJ1A 3L4IA 4PKIA 5FPEA 1MDUB 2Q0RA 5BR9A 3ATVA 2AA4A 4H0VB 1S3XA 4FPAA 5ADXA 4FWNA 1S22A 3O1BA 4A2BA 1KAZA 3BUZB 3FZFA 3MN7A 3A5LC 3HSCA 2PBDA 4GY2B 4FWOA 4PKHA 2F9WA 5BREA 4BR7A 4RCHA 2P9PB 4WQ5C 3CJ7A 3GOIA 4A2AA 2HOEA 3CERA 5AZIA 1J6ZA 3DXKA 2YI1A 1P8ZA 1GLCG 1Q18A 3ATUA 3ZX0A 1DGKN 3HM8A 4EHTA 5EY4A 4A61A 4BQLA 3TU5A 1NWKA 4FWLA 3SMPA 3ULEA 4H0YB 3U9DA 1NGJA 1NGCA 5AZIB 2E2OA 3FZLA 2A5XA 2P9LA 4J8FA 5AQOA 4FPBA 4H5NA 2YHYA 4CZKA 3U9ZA 2Q1NA 3W3DA 4FWKA 3QDKA 1BDGA 2E1YA 2QWQA 2P9SB 4FWMA 3WXIA 3W0LA 3BF1A 3DWLA 3GDQA 3WT0A 3ZETA 3GL1A 2D1KA 2FSKA 3MN9A 2HF3A 3EZWA 4A62A 2EWSA 5BPLA 4BREA 1GLAG 4MLHA 3ENOA 1K8KA 1G99A 2IVPA 3B8AX 2A41A 4BC5A 1NLVA 2CGKA 3ZETB 2YJEA 5AQSA 2YHWA 4H0OA 3CI5A 3VF4A 5AFUH 2QWOA 3EKSA 2DPNA 3ZEUA 4QS9A 4H0TB 1HKBA 1Z05A 5BPMA 1R59O 3AARA 3C7NA 2H3GX 4NB4A 4EIAA 4BR0A 3O6WA 2A6AA 4BVPA 4DCHA 2F9TA 4CZJA 2YCHA 3ENHA 3EO3A 1RFQA 3VENA 3O4WA 3RSEA 4WQ4A 2QM1A 3ZEUB 2NRHA 5AQWA 4PL8A 4DQ8A 5KPZA 2VWBA 4BRMA 5F0XA 3VGLA 3A5MC 2ZGZA 5FPMA 3CJAA 4H5RA 3H3NO 1HKCA 4FWPA 4K41A 4BRLA 5AQTA 1Z6RA 3F9MA 4JHDA 2E2QA 2FSNA 4JD2A 5BRHA 4BVOA 4BQZA 3R6MA 4GNIA 3FGUA 2YHXA 1TUUA 1JCGA 2GUPA 1XQSC 2FXUA 2A42A 2QWMA 1MA9B 1NGAA 2P9KA 3QICA 3VEXA 1HKGA 5KQ8A 2PAVA 1KAXA 4MO5A 3CQYA 1NMDA 5TKYA 2QWNA 3QB0A 4JHDB 2D0PA 4JD2B 3UKRA 4PL7A 1QHAA 4K43A 5JLFA 4M7YA 3WEEB 5FPNA 2CH5A 3EL2A 1GLEG 4BR5A 2P9IA 3H6EA 4BRCA 3FZHA 3VEZA 5FPDA 4I6MB 5EVZA 3S41A 3QMLA 4MO4A 2HF4A 3WXKA 1HUXA 4FWRA 3UKRB 3EN9A 4F9OA 2BTFA 5JMVA 4CD3A 1NGEA 4QS7A 4CZFA 2P9NB 4DB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRDA 1JL1A 2ZD1A 3U3GA 5I9EB 2GWKA 2DFHA 4WFNL 1VHXA 4CI6A 2VQFK 4DR5K 4DS4A 3NH1A 3H3OB 3U4LA 3HSTB 3CM6A 3DXKB 4KTZA 2O4IA 4BG9A 4LF9K 3JS6A 4FLXA 1WSGA 4FW1A 4M3XA 2HHSA 3E9PA 3CFOA 3VA0A 4ICLA 4CIGA 1TAUA 3T7ZA 3SCXA 2P9LB 4C8OA 3IDHA 3O9TA 2NRTA 1RT5A 4JRQA 1E4GT 3ALYA 1YJNN 4BR9A 4BRFA 2WFBA 3V1QA 2QW9A 3K5NA 3K9JA 2HHVA 3NVKA 1C1BA 4L8RB 5I42A 1LWFA 4DHYA 4B1XB 5EX5A 3OJSA 4YOWA 4B9SA 3CCVN 2BE2A 2OYQA 2YX6A 5J2QA 4FJIA 4DTNA 1N34K 2BANA 2NRVA 4Y0WA 4CJRA 5BPNA 3L8BA 3FZMA 4BE0A 4F8RA 3NHGA 3SJHA 1BWFO 4BGBA 1K73O 4LY7A 1HYZA 2HBJA 2RN2A 4FLVA 4CGFA 2KHOA 3P4IA 1T8EA 2D0CA 4OLAA 1SL0A 3SUQA 3TWHA 5GIOA 4Z4EA 3O9SA 3CFRA 1N33K 3D45A 4DV4K 4FJNA 1CZ9A 1YUWA 2IIRA 3OJUA 1BOTO 3HK2A 3CIPA 1RBTA 3OYNA 1V4TA 2FF3B 1ASWA 3J80O 4FCYA 2E20A 3SLCA 4FJGA 3OS1A 5C10A 4G1QA 4BRKA 1VQMN 1WSFA 3QEVA 3KK2A 3P31A 4IG0A 4CBUA 2AP1A 1Q81O 4UY8O 1KVCA 3S3MA 4EAHD 3J7YP 4LFBK 2VGMA 3LPTA 5M1PA 4IFEA 2ITMA 3MDQA 1VQ5N 1VRTA 3VEWA 4FLZA 1SAZA 2KFNA 4NXNK 1OKJA 2F96A 4NLBA 4FJ9A 5EU7A 3LDNA 3SUOA 1NGGA 4AHVA 4MDBA 4XEIA 5AQVA 4I2QA 4OPAA 1RNHA 3L2QA 4CJUA 4AHSA 3LZIA 2P9PA 2UXDK 4BR2A 3F2KA 1JLFA 4RW6A 4E1NA 1L3SA 4FWQA 2VG5A 3CJCA 1IO2A 5A2QO 2EHGA 1B9FA 1IG8A 4YHHK 1YIJN 1YHQN 4DFPA 3VA3A 1S1UA 5CYQA 1ATNA 3L3UA 1J54A 2GEMA 2WUSA 1ZBUA 2E2PA 2QWPA 4PQUA 2P1JA 1QE1A 4H0XB 1DKGD 2CGJA 4FJ7A 4FM1A 2FBVA 3CG7A 4CJQA 1NGIA 4RTFD 3LALA 2IDOA 3AVLA 3FE1A 1T6CA 1RDAA 4H5VA 2X6SA 3IUCA 4DLGA 1MWKA 1U45A 4IWVA 2NRWA 3AVNA 2XRIA 3NGIA 1P90A 4OVLA 4KHQA 3HL8A 4HHTA 4K8ZA 1C0GA 3PUFA 4YOUA 2A1SA 4MDAA 3O80A 3ULDA 1SKWA 4V19S 3HPHA 2ZJQL 3KLIA 1CLQA 5KRSA 5LY3A 2CGLA 1KXPA 2V7ZA 3GE1A 4CE9A 1YVNA 3ZT2A 3VESA 3TR8A 4Z4HA 4CGJA 4KO0A 4XH4A 3ZT3A 4BE7B 1YTAA 3MMVA 1UAXA 3MXMA 3M3ZA 3CC7N 3DLBA 4QOZB 2D0AA 5C42A 4FW2A 1HJOA 4HWIA 1NOYA 1NGBA 4DFMA 2FLOA 1BIZA 1RDDA 2FSJA 1GLLO 1T05A 1HJRA 4C23A 1QQNA 2ZWHA 3D2EB 5AQQA 3WXLA 3ZX2A 3SMSA 3VF6A 2FBTA 2GBZA 2HHQA 1BU6O 1LAVA 1QQMA 3E01A 1VRUA 3G71N 3TAEA 4DF4A 1TK0A 2KW4A 4KBOA 3R9PA 1EX4A 1RDUA 3L2VA 3C6AA 3FR0A 3T1AA 1YAGA 1T44A 1JLCA 1GOCA 4WE1A 3CF5L 3L0QA 3GG4A 4I6MA 4JK9A 3QNNA 3Q7CA 2Q3SA 5JLHA 3O1WA 3SV3A 1VSLA 1FKPA 3THYA 2E8AA 2HMIA 3QO9A 4JKHA 5ADXH 2UXBK 4M3TA 3KD5E 3HTVA 1FKOA 4EFHA 1T03A 5JICA 5AQXA 4OGCA 2XY8A 1JLAA 4CK1A 2O8BA 1REVA 3KWGA 1S3XA 1YJWN 5ADXA 4FWNA 1HNZK 3V1RA 3TAGA 3BUZB 2X78A 2R7YA 2PBDA 1DTQA 3NGZA 1J5EK 4RCHA 2P9PB 2QTDA 1N5YA 4WQ5C 3CJ7A 5C12A 3CERA 4Q5VA 5AZIA 1J6ZA 3SQ0A 3OTOK 4DQRA 2D5RA 2YI1A 4CECA 3ATUA 2Z1IA 3VQQA 3L4QA 3HT3A 4EZ6A 1Y97A 3TU5A 1NWKA 4JKAA 1QSYA 1JL2A 3U9DA 3NMUA 3DLRA 2E2OA 3QEIA 1RT4A 2YHYA 4DSKA 4MQ3A 2B4JA 3DRSA 3U9ZA 4CEOA 4FWKA 2E1YA 3NF6A 3W0LA 3BF1A 3DWLA 2G8IA 1NJWA 1ZBFA 4CJKA 2IC3A 2D1KA 4C1NI 4YORA 4A62A 2EWSA 4YY3K 4F4KA 1EWQA 5BPLA 1A5XA 2IVPA 3NGYA 1Z26A 1NLVA 5T7BA 3THVA 3C95A 3ZSOA 1BHLA 2YHWA 1RBSA 4BACA 4DTSA 3V9WA 5CZ2A 2E5LK 1LWCA 2WOMA 1Z05A 5BPMA 1R59O 3VQ7A 2RF2A 3K59A 4B9NA 3L2RA 2XO7A 4KTQA 4KHUA 4DQSA 1RFQA 3MWPA 3MEEA 4CJWA 1YVUA 4KAZA 4DQ8A 2OTLN 4IOXA 4KHYA 2BH1A 3A5MC 2ZGZA 4B3SK 3H3NO 1TK8A 3OYHA 4KKOA 1C1AA 2B5JA 4HVJA 4JYAK 3R6MA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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