3SUSA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with gal-nag-thiazoline
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 191
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3susA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3susA02
4MJ4A 2D23A 3LPOA 2EQDA 4IPNB 3EMQA 3VGFA 1WDRA 2WWDA 4P7NA 1JAKA 3VM7A 5A8OA 5BROA 2JF7A 4PTVA 1IZKA 1ZB5A 2CEQA 2NT0A 3N18A 3BLKA 1TMQA 4OOZA 1TG7A 2XHYA 1DTUA 3AOFA 2OYMA 2WB5A 4RE3A 2WVUA 1KXHA 2CKSA 2PBGA 1UWUA 2DH3A 3AHYA 3VIMA 1Q6FA 7CGTA 4UQ9A 3TONA 2EPMX 4CU7A 1KB3A 3AMLA 4AEFA 2X0YA 1UR1A 3IJ7A 5A2AA 3SCPA 5BXTA 2YL9A 1G94A 4LQ1A 3T2PA 2ZXQA 2JIWA 3CMGA 2J78A 3B9AA 1TA3B 3DYMA 2BVTA 1JI1A 1JYWA 3ZMRA 4V27A 4J27A 1B0IA 1FA2A 3AZRA 5M03A 2VZOA 4HA3A 4BCEA 3GBEA 4Q22A 2BHZA 2X2YA 4ZENA 3WQ4A 1CBGA 3RCNA 2QMJA 1UD6A 4S3KA 3QHOA 3OLDA 2XFRA 3W6MA 2YLLA 4P7RA 1E15A 4QCFA 5AC4A 1UH3A 4WKFA 1I75A 4M8UA 3K8LA 3WBAA 3B9EA 1WAWA 4R5EA 4HZ8A 3EDEA 2DEPA 5ABFB 1WDSA 1BTCA 5IXEA 4QLKA 2WKGA 3WL0A 3PTKA 1GW1A 3SUWA 1LG2A 2PWEA 3T0DA 2ZUNA 2CYGA 3MO4A 5I5RA 2W91A 3AXHA 4FLRA 2QV4A 1ISYA 5M3WA 5ABEA 3WD2A 2F2HA 5A8QA 1H11A 4H7VA 4OOUA 4ATWA 1GQKA 4W86A 3L4TA 1WE5A 4W7VA 4TTGA 2GK1A 1E3XA 1MW2A 1TFVA 5A6SA 2ZUMA 4OIFA 3FXYA 1UUQA 2XVLA 2YA1A 1GOMA 3BGAA 3OLEA 3W29A 3VMPA 4CUCA 1WDPA 4UQBA 3BH4A 2E0PA 1LLOA 3AZSA 4PCTA 1WDQA 3LPFA 4PN2A 3BMWA 3UEQA 5CGTA 3PN8A 3S2CA 3ARSA 3HU7A 5BCAA 4P7QA 3WFLA 3AS2A 3VVGA 2WBKA 5D9NA 2CCRA 4IISA 3T0BA 3T2OA 1I1WA 4N0RA 4P8VA 4GINA 2FHFA 1LWJA 4D6IA 1E4NA 2Y8VA 3WKZA 3TOPA 3IJ8A 1KCKA 1QNQA 1WZAA 2Z1KA 3ZSTA 4P8XA 2V38A 2WVVB 1O6IA 5CSYA 3ZR5A 1CXFA 4CN6A 3SCRA 1HNYA 3MUZ1 3VNYA 1OT1A 1JFXA 4FLOA 2EPOA 4KH2A 5HDRA 1ISZA 2EEXA 2VRKA 3II1A 2WXDM 3RJYA 2PWHA 1UWSA 3RM4A 2A3AA 1JYNA 4DUXA 3BMVA 1J0ZA 3VD7A 4DWSC 4J3WA 3ZIZA 5DT5A 5JIWA 1QBAA 5I0DA 1KGWA 2YDSA 1E1FA 1V3HA 3VGHA 3WNPA 1EGZA 4ZXOA 1QI3A 3PZUA 1B3YA 3NUKA 1NM9A 2IUZA 4JL2A 1VENA 5FD0A 3WDIA 1AMYA 4HMEA 1RH9A 2RGMA 2VZSA 3AS3A 4JFTA 3ARUA 2ZWYA 5D9PA 3WH9A 3AI0A 2VQUA 4HPGA 4OBSA 4TVUA 2DIEA 1GQLA 4PSRA 3HN3A 4TVDA 4UFKA 2BFGA 3UG3A 3AHZA 1G01A 1J18A 1JD7A 1X6NA 3WF1A 1H3GA 1GOIA 1WKYA 2BS9A 2JIEA 4W84A 1DEDA 3AROA 4ATLA 3PZQA 1S46A 2J77A 3AS1A 2XFYA 1E6XM 2WLYA 2YL8A 1IV8A 1QI2A 1XV8A 3A3HA 4XZWA 2HISA 3HJEA 1QNRA 1VFMA 2QPSA 1V08A 4UZSA 2BVDA 3VINA 4CCDA 5A69A 2BXYA 1HJWA 2W67A 4YPJA 5DF0A 1TA3A 3LPGA 2YLAA 4WSJA 2XVPA 3PZTA 2OLHA 3CUHA 5IHRA 4NZCA 1VFFA 4W7UA 3A4WA 1JAEA 4PMDA 1UQZA 3KZSA 5ABHA 1QNPA 3MV01 2ZX5A 1BHGA 4UR9A 1EH9A 2YA0A 1E3ZA 1V3LA 1DWAM 3CHEA 2VT0A 1JZ8A 1QVBA 3KE0A 3U7VA 2XTKA 1FH9A 4W93A 1E0VA 2CBUA 4EK7A 1WB0A 3K8MA 3L2MA 2CXGA 3AMGA 5E6YA 1EQPA 2DT3A 3IAPA 1GHSA 5ABFA 1UR4A 5JBFA 1EOKA 1R8LA 1LF1A 4F66A 4V28A 4CCCA 4HOWA 1EO5A 3WQ6A 4H8VA 2VNCA 4PUEA 3PZOA 1MQPA 2ZUTA 1E9LA 3ZOAA 2CIPA 2WW5A 2BY0A 2XIBA 4V2XA 5DT7A 4JCMA 4CVUA 2RGLA 2VUYA 4PEEA 1PIGA 3WQWA 4X0VA 3KL5A 5AYBA 1BVZA 3WNKA 1NWUA 4GZEA 3BC9A 1MW0A 4MDPA 1JNDA 4JCLA 1E4LA 2VMFA 4Z2GA 1EXPA 2CITA 1ECEA 1W1PA 1X1NA 3CTTA 2WNWA 2W5FA 5BWFA 3O9NA 1MQQA 1Q6EA 3FY1A 3VILA 3AS0A 5A3HA 3VM5A 3MMWA 3ZJ7A 4PMZA 1G1YA 5EBAA 4W8LA 4AWEA 3BSHA 2ZUUA 5GPRA 1LL4A 4PCSA 4B9YA 1H5VA 2VC9A 1GOOA 1MXGA 2ESCA 3KL3A 4PMUA 1ISVA 4DM1A 1ISXA 4ZXLA 4KRTA 3FAXA 1FFQA 2BHUA 3PTMA 5BXSA 5HXMA 3GH7A 3VD9A 4R27A 3VMNA 2W61A 8A3HA 2E9LA 1XSIA 3F5KA 1ZBVA 3K4AA 1B1YA 4J3TA 2G4FA 1E4MM 1WPCA 2D1ZA 3CUFA 5HPOA 3SCOA 2VO5A 3VDCA 3A6OA 3AIBA 3TTYA 1DWHM 2ZXDA 2WK2A 1XSJA 3SEPA 4JIEA 2E4TA 3T08A 4GPNA 1DHKA 4MB4A 1OM0A 3ARVA 2ZX9A 1OB0A 4QLJA 5JBEA 2W4XA 3CBWA 3OLIA 3GXDA 3BCDA 2D0GA 2WYSA 1KCLA 4CD7A 2VVNA 4GZJA 1MW1A 1UR2A 2Y5EA 3UCQA 3VPLA 1K9TA 1UA7A 1W91A 4HU8A 1J9YA 2YL6A 4OUEA 1H49A 1UH4A 1XRVA 5IHSA 2A3HA 3VIJA 2WZIA 1OSEA 2BHYA 3ZJKA 5BXPA 1R87A 4UOJA 4F79A 1WCGA 3DYPA 2GJPA 1UKOA 2WKLA 3BAXA 3FHQA 3VU2A 2O9PA 1FOBA 1V6VA 4PTXA 5M17A 4KRUA 3VX1A 2WLZA 4B15A 1JG9A 3WF0A 4ZE5A 5E0FA 2XJ7A 3SCUA 1NH6A 3F4VA 4HA1A 5E0CA 1KQZA 1XH1A 3MUIA 2ZWZA 1Y7VA 2A3BA 3GDBA 3GXFA 2BXZA 1TUXA 1KFWA 2PB1A 5C8BB 3EMZA 3VDHA 1CENA 1XH0A 3WEMA 3AZTA 2V3GA 2XSAA 3W0KA 2QLYA 4A3YA 1E5JA 1CGXA 4WF7A 3ARTA 2XYLA 1SYTA 1JI2A 3OZOA 2VZTA 1L8NA 1QNSA 1HP4A 1VAHA 5CLTA 5C70A 1JZ3A 1HX0A 3ARXA 4B16A 3WNNA 1JZ5A 1UWTA 4L4OA 4C7GA 2C7FA 4GO9A 4D1IA 3AQUA 3M7SA 1SR0A 3UG5A 4TX8A 1A3HA 2YDRA 3NSNA 5GNZA 3WIJA 3AYRA 3MUAA 2BNJA 2Z1SA 2WSKA 4D1JA 3W25A 3BCFA 9CGTA 4RE2A 2J8FA 4AZ7A 4CCEA 4A4AA 1KR1A 4KGJA 2HVMA 4CU6A 5GNXA 4AZ6A 1TCMA 1V6YA 1PIFA 1OGBA 3IK2A 2J25A 1H41A 5D4YA 1K6AA 3AHXA 2E3ZA 3BSGA 3U57A 1OGGA 3K8KA 2WC4A 1XD1A 3ZJ8A 1V3IA 2CHOA 1PPIA 2XFFA 3N1AA 4X9YA 1FFRA 4M81A 3QOKA 2Y24A 2V3FA 4NRRA 5JIPA 1OINA 2D2OA 1JF6A 4W87A 1K9FA 2CBVA 3D5HA 3OBAA 1W9UA 4BQ2A 3DECA 3MUY1 4TUFA 2GJRA 3W24A 1VEOA 4U31A 3U5UA 3BAKA 4IUGA 2WM0A 3VOCA 1R7OA 1ITCA 1NP0A 2UWFA 2WHKA 1AVAA 3PBGA 5KZ6A 3VDAA 1U33A 1BGGA 4UQEA 3M07A 1VBUA 3VIIA 2ZXBA 3WQVA 4UCFA 3NIYA 2E40A 1M53A 3G6MA 7A3HA 1OGSA 4Y7EA 1E1EA 4P7LA 2YL5A 2WMKA 5LYRA 1E70M 2WZEA 2QPUA 2PBOA 4Z2LA 2XWEA 3W38A 1JF5A 1CXHA 3K1DA 2VR4A 4UFLA 4PYSA 1U30A 3WBEA 1W9PA 4H04A 4YN5A 2ZUWA 3WNLA 3FN9A 3MANA 3VD4A 3APGA 1KWGA 4XB3A 4JHZA 2OSYA 4GKLA 4B3KA 3ZT7A 5IFPA 3FNDA 2G3NA 3M6DA 1VF8A 4S3JA 4PUDA 1LWHA 2JALA 2NSXA 5FCZA 1V0KA 3VIGA 4UOQA 1M03A 2J7HA 3FHAA 1QW9A 4H8UA 4KGLA 4EAMA 4ML4A 3MS8A 3W37A 1BF2A 4N42A 4WSKA 4J3VA 1R7AA 1UWIA 1WZLA 3F5JA 1CDGA 1FP9A 3WUFA 4HOZA 3VMOA 5A6KA 2WCSA 1UD4A 2FHBA 5EFFA 5BRQA 2ZUSA 3AIRA 5BRPA 5D9OA 4HMDA 1HIZA 2B31A 2WMJA 4Z2JA 2XIIA 3WD4A 5FL0A 3VGGA 2VVSA 1NWSA 2ZUVA 4QDMA 2J79A 3B9DA 1WO2A 5A6BA 1PX3A 1CYGA 1KXTA 2UY3A 3AISA 1GCYA 3UR7A 1ZL1A 1E6PA 1H0GA 4LX4A 4GIAA 3VIHA 1ODUA 3TTQA 4LYRA 1W1TA 1H1NA 1HJQA 4UFHA 2UY2A 2WVTA 2GJXB 1JZ4A 2D3LA 1UOKA 1GPFA 6A3HA 2OWWA 4P8WA 3GTNA 3DC0A 4MNKA 3OG2A 3CZJA 1NOFA 2F61A 4YHEA 1VEMA 3UESA 3WY1A 4BF7A 4UFJA 4ACZB 4AZGA 4QFUA 3RJXA 4AZIA 4HZ6A 3WL1A 5I79A 4Q7NA 5AY7A 4P7OA 4D6CA 1MWOA 3WF4A 2ZOXA 1JL8A 1JDCA 3ARYA 3SIMA 3CUIA 4JZ5A 3DHUA 6TAAA 1PBGA 4AXNA 3TTSA 3CGTA 5FKYA 1H09A 4FLSA 4NSBA 3WH5A 4ZEPA 5DMYA 4JKLA 3UR8A 4HU0A 3MSGA 1V6XA 4KWUA 1WP6A 3FAWA 3WH6A 2WHJA 1XC6A 4M29A 3GXIA 2OSXA 5ECUA 1KBKA 5CZKA 4BZYA 1QOXA 2CESA 4AISA 2DT1A 3TA9A 4FMVA 1KQYA 3WNOA 5A6BD 4TXEA 3OGVA 2ZX8A 3CZEA 1J11A 3MU7A 3KWXA 2DT0A 2EPNA 5CQ1A 5A8NA 5JBDA 1F4AA 4OZOA 1E6RA 3EDDA 4RE4A 3CIVA 3N9KA 1UZ4A 4KMQA 1HVXA 1KWKA 1LQ0A 3W4RA 3BAJA 4EANA 5F7UA 2D20A 2V5CA 4JKKA 4PRWA 3AIEA 4AD3A 2VRQA 4U2YA 3CO4A 3THDA 3AIQA 1HL8A 4W5UA 1FHDA 1D2KA 2X09A 4JFWA 3T0AA 2BY3A 3S6TA 4AYSA 3W26A 4PMQA 1PX4A 4AD1A 4CU8A 2WMHA 1EQCA 2IXUA 1B3VA 4B3LA 1UWQA 2EXOA 4JHOA 4FF5A 1JNEA 1OD8A 5HNNA 3WSUA 1MFVA 1U2YA 4B9ZA 4H41A 4AZ5A 1E72M 4GI8A 4TOQA 2PF0A 1K9EA 1HXJA 1UD5A 1HJSA 4CVWA 5D8ZA 2VX4A 4PTMA 3D3AA 3MMUA 5HBFA 4AIEA 1KR0A 5A94A 4CN1A 4U3AA 3L4UA 1CWYA 2YIHA 2DSKA 2WPGA 1W2VA 3GH5A 3AICA 1CGYA 4F9JA 1PAMA 5LA0A 4AIOA 2PWDA 4PMYA 4J3UA 2DSWA 4WKAA 4WJXA 4AZCB 4MNJA 1MXDA 3BAIA 5E9AA 6CGTA 4QP0A 4UTFA 3IANA 4WK9A 5CPQA 1GOKA 1Q6DA 1EOMA 1M01A 2XG9A 5EMYA 3WMSA 1W2PA 1NWTA 1OIFA 4UZUA 4MTVA 2DSZA 2YOCA 4PMRA 4PSPA 4J3XA 1QW8A 3CZLA 4P8UA 4ACYA 3OZPA 1E6NA 1HKKA 2GVYA 4U2ZA 2E9BA 3WQ5A 3SUTA 1W3KA 5D8WA 1W3HA 1V3MA 1BYCA 3ZJ6A 4ZE4A 3BXWA 4BQ3A 4TX6A 1J0HA 1CIUA 5AC5A 4MADA 3AIUA 3VIOA 1IT0A 3L4XA 2J62A 5LA1A 3B8SA 3RO8A 1EHAA 2NT1A 2A3EA 2J7BA 2FH8A 1ISWA 1GORA 2X0HA 2VI0A 2YDQA 1US3A 3WDJA 1FH8A 3A4XA 1QPKA 3CMJA 1UD3A 4Z2KA 3MV11 4FLQA 4D6DA 4GZIA 2DPEA 5FOOA 1NOUA 1XYZA 4D6EA 2WVVA 1Q6GA 2FGLA 4FK9A 4CD6A 4H8HA 5CJ5A 4CD5A 1NP2A 3BAYA 1C8QA 4U3CA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MJ4 A;  2D23 A;  3LPO A;  2EQD A;  4IPN B;  3EMQ A;  3VGF A;  1WDR A;  2WWD A;  4P7N A;  1JAK A;  3VM7 A;  5A8O A;  5BRO A;  2JF7 A;  4PTV A;  1IZK A;  1ZB5 A;  2CEQ A;  2NT0 A;  3N18 A;  3BLK A;  1TMQ A;  4OOZ A;  1TG7 A;  2XHY A;  1DTU A;  3AOF A;  2OYM A;  2WB5 A;  4RE3 A;  2WVU A;  1KXH A;  2CKS A;  2PBG A;  1UWU A;  2DH3 A;  3AHY A;  3VIM A;  1Q6F A;  7CGT A;  4UQ9 A;  3TON A;  2EPM X;  4CU7 A;  1KB3 A;  3AML A;  4AEF A;  2X0Y A;  1UR1 A;  3IJ7 A;  5A2A A;  3SCP A;  5BXT A;  2YL9 A;  1G94 A;  4LQ1 A;  3T2P A;  2ZXQ A;  2JIW A;  3CMG A;  2J78 A;  3B9A A;  1TA3 B;  3DYM A;  2BVT A;  1JI1 A;  1JYW A;  3ZMR A;  4V27 A;  4J27 A;  1B0I A;  1FA2 A;  3AZR A;  5M03 A;  2VZO A;  4HA3 A;  4BCE A;  3GBE A;  4Q22 A;  2BHZ A;  2X2Y A;  4ZEN A;  3WQ4 A;  1CBG A;  3RCN A;  2QMJ A;  1UD6 A;  4S3K A;  3QHO A;  3OLD A;  2XFR A;  3W6M A;  2YLL A;  4P7R A;  1E15 A;  4QCF A;  5AC4 A;  1UH3 A;  4WKF A;  1I75 A;  4M8U A;  3K8L A;  3WBA A;  3B9E A;  1WAW A;  4R5E A;  4HZ8 A;  3EDE A;  2DEP A;  5ABF B;  1WDS A; 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 2EPO A;  4KH2 A;  5HDR A;  1ISZ A;  2EEX A;  2VRK A;  3II1 A;  2WXD M;  3RJY A;  2PWH A;  1UWS A;  3RM4 A;  2A3A A;  1JYN A;  4DUX A;  3BMV A;  1J0Z A;  3VD7 A;  4DWS C;  4J3W A;  3ZIZ A;  5DT5 A;  5JIW A;  1QBA A;  5I0D A;  1KGW A;  2YDS A;  1E1F A;  1V3H A;  3VGH A;  3WNP A;  1EGZ A;  4ZXO A;  1QI3 A;  3PZU A;  1B3Y A;  3NUK A;  1NM9 A;  2IUZ A;  4JL2 A;  1VEN A;  5FD0 A;  3WDI A;  1AMY A;  4HME A;  1RH9 A;  2RGM A;  2VZS A;  3AS3 A;  4JFT A;  3ARU A;  2ZWY A;  5D9P A;  3WH9 A;  3AI0 A;  2VQU A;  4HPG A;  4OBS A;  4TVU A;  2DIE A;  1GQL A;  4PSR A;  3HN3 A;  4TVD A;  4UFK A;  2BFG A;  3UG3 A;  3AHZ A;  1G01 A;  1J18 A;  1JD7 A;  1X6N A;  3WF1 A;  1H3G A;  1GOI A;  1WKY A;  2BS9 A;  2JIE A;  4W84 A;  1DED A;  3ARO A;  4ATL A;  3PZQ A;  1S46 A;  2J77 A;  3AS1 A;  2XFY A;  1E6X M;  2WLY A;  2YL8 A;  1IV8 A;  1QI2 A;  1XV8 A;  3A3H A;  4XZW A;  2HIS A;  3HJE A;  1QNR A;  1VFM A;  2QPS A;  1V08 A;  4UZS A;  2BVD A;  3VIN A;  4CCD A;  5A69 A;  2BXY A;  1HJW A;  2W67 A;  4YPJ A;  5DF0 A;  1TA3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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