3SUVA

Crystal structure of beta-hexosaminidase from paenibacillus sp. ts12 in complex with nhac-dnj
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
519
structure length
504
Chain Sequence
HHHHSSGLVPRGSHMSQPSILPKPVSYTVGSGQFVLTKNASIFVAGNNVGETDELFNIGQALAKKLNASTGYTISVVKSNQPTAGSIYLTTVGGNAALGNEGYDLITTSNQVTLTANKPEGVFRGNQTLLQLLPAGIEKNTVVSGVQWVIPHSNISDKPEYEYRGLMLDVARHFFTVDEVKRQIDLASQYKINKFHMHLSDDQGWRIEIKSWPDLIEIGSKGQVGGGPGGYYTQEQFKDIVSYAAERYIEVIPEIDMPGHTNAALASYGELNPDGKRKAMRTDTAVGYSTLMPRAEITYQFVEDVISELAAISPSPYIHLGGDESNATSAADYDYFFGRVTAIANSYGKKVVGWDPSDTSSGATSDSVLQNWTCSASTGTAAKAKGMKVIVSPANAYLDMKYYSDSPIGLQWRGFVNTNRAYNWDPTDCIKGANIYGVESTLWTETFVTQDHLDYMLYPKLLSNAEVGWTARGDRNWDDFKERLIEHTPRLQNKGIKFFADPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title Gaining insight into the inhibition of glycoside hydrolase family 20 exo-beta-N-acetylhexosaminidases using a structural approach
pubmed doi rcsb
source organism Paenibacillus
total genus 192
structure length 504
sequence length 519
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2011-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3suvA01
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3suvA02
4RL3A 1EH9A 3CUJA 4AZHA 2DSKA 3THCA 3VOCA 2WANA 2ZE0A 1TG7A 2JALA 4UCFA 3PZUA 1UH4A 1FH9A 3EMCA 3UERA 2W92A 4MB3A 5JBEA 5AC4A 2PWFA 2W5FA 2J8GA 2W63A 4PCSA 3U5YA 1Q6GA 4AW7A 3TONA 1XYZA 3VIMA 2C7FA 3ZOAA 4OJYA 1V3JA 3BAJA 5A6KA 1KWGA 4L4OA 4UQDA 5HOSA 1FP9A 5KEZA 1GPFA 2V38A 3K1DA 2J7HA 1CENA 5FD0A 1WKYA 3ARZA 1XYFA 4PMDA 3WY1A 4WSKA 1FH7A 2VZTA 5ABGA 4A4AA 3D5HA 3TA9A 2BV9A 2QF8A 1JD7A 1E15A 1NARA 4AZCA 4P7NA 4W89A 5LYRA 4ATWA 1DP0A 3L4WA 3SCVA 5HNNA 2J7EA 5DFAA 3WMCA 1E56A 2WMHA 2WVVA 4U33A 2XVLA 1HJWA 3PHAA 3ZJ8A 5EBAA 1ODZA 2Y8KA 4PMZA 3F5KA 1C8YA 1QI5A 5DO8A 4BQ3A 1Q6EA 5LA2A 4CD8A 4JFWA 1ISZA 2X8RA 4P8XA 2VCCA 5A2AA 4W87A 5E09A 4HOZA 3AYSA 1L0PA 4F9JA 3WL1A 2XFYA 1QHZA 2E0PA 3WD2A 1QNOA 1J10A 4M81A 2O9OA 4TVUA 1R85A 1JZ5A 4DM2A 2WMJA 2DIJA 4F8XA 1HJXA 1JZ4A 1NQ6A 7A3HA 4A3YA 2GK1B 1TVNA 2YL9A 3PZIA 1HJQA 3ARSA 1B2YA 4PN2A 1C90A 3OLDA 1BG4A 5ABFB 1HVXA 4ATDA 3K4AA 3II1A 4JHZA 4AYSA 1UQZA 2FH6A 1EIBA 1S46A 1RP9A 1ZBCA 1E3ZA 1QNQA 1ZS2A 1KGUA 4MTVA 1PAMA 6TAAA 3L2LA 4PMNA 1VIWA 3AFBA 5BRPA 4W8AA 3ARUA 1Q6FA 3WQ4A 4D72A 3FHAA 1EHNA 4J3XA 2F8QA 3AI0A 4BZYA 1EO5A 1SMAA 1H09A 1VRXA 1JF6A 1DWIM 1GNXA 3WDIA 3ZM8A 1CGWA 2G3JA 5A6BA 3VGHA 3NYDA 3NUKA 2PWHA 1E4IA 2WCAA 1FA2A 3M07A 2IXUA 1CBGA 2VUYA 2VR5A 5D8WA 1W1TA 5C70A 1MW0A 1GORA 3AMLA 4JFSA 2YL6A 4MJ2A 1K6AA 5I0DA 3DHUA 2WHKA 4QAWA 1MW1A 2DIEA 5A8MA 1QI0A 1XH2A 1OD8A 3VUPA 1PJ9A 4AEFA 3RO8A 4CKQA 2VL4A 2VX7A 2AAAA 4DM1A 1E4MM 3PZ9A 2GJXB 1UA7A 4JKLA 3EDFA 1UR9A 2WC3A 1IZJA 1NP2A 1B9ZA 3BMWA 1ISXA 2FGZA 3VGDA 1UR4A 1BG9A 1BQCA 3VDAA 1M7XA 3AXIA 1V0LA 3UEQA 3WDPP 2YDRA 4CUCA 1RH9A 2A3EA 2CCRA 2CHOA 2VR4A 1CXKA 1R8LA 3AS0A 4LGXA 4MNLA 3AIBA 3K8MA 4P7OA 4C7FA 4AEEA 2WHLA 1W3LA 2J78A 4QLJA 5F7UA 5BXRA 2EJ1A 1GCYA 3UG3A 1HJUA 2E9BA 1HNYA 4ZXLA 4DUVA 1QI4A 2WCSA 1C93A 4P8WA 1J0JA 3CHDA 1CNVA 1JYNA 4AISA 1YHTA 1PZ3A 1O7AA 4U3AA 4FLQA 4CU6A 3RM4A 2CHNA 1QOXA 2DH2A 3TP4A 2D0HA 3BGAA 3O2LA 4CCDA 4P7LA 1UD5A 3N04A 4GZEA 4B3KA 5A6AA 1LWJA 3BMVA 1W9UA 1VEPA 2WZHA 1CXHA 1W32A 2DT0A 4OBRA 2J25A 4HOXA 3N17A 1GOMA 2GSJA 2HISA 1EXPA 2BY1A 5IHRA 1CWYA 4GKLA 4D71A 1UWIA 3MUZ1 4FK9A 5D4YA 3WNNA 1V0KA 1ZJBA 3WKZA 5LA0A 4OKDA 4MPKA 1VBRA 1FHLA 3AHVA 2JEPA 3GNRA 2ZX8A 4S3KA 2OSYA 2BHUA 2X2YA 2XHYA 3KL0A 1ITCA 3CZ8A 3AJ7A 1J11A 3QHNA 4KMQA 3W38A 3GYCA 2BVTA 4MDPA 1BYDA 1ISVA 4KRUA 1JZ3A 1WP6A 1W9BM 4M24A 1W9XA 2G8ZA 4NZCA 4ATLA 4UFJA 3A3HA 4PRWA 2NSXA 1WE5A 3ZSSA 5IDIA 2FGLA 1YQ2A 3WF0A 5AYBA 4CVUA 1QNPA 4WF7A 4CVWA 1MXDA 1E5NA 5DT5A 3VMNA 4EKJA 1EDTA 1AVAA 1VB9A 3EYPA 3WDHA 2W66A 3UCQA 1UWSA 3SCQA 1CGVA 4PUEA 5A6JA 3VIJA 1HVQA 1PX4A 3ARYA 3CUIA 2WXDM 4HMCA 2F61A 2PWGA 2PBOA 1MFVA 1QW9A 4DWSC 1ITXA 3CLWA 1XSKA 4AZGA 3AS1A 4TUFA 1WAWA 3VGBA 1QBBA 2O9TA 3EMZA 5DT7A 2OYMA 2VNCA 2YDQA 1V6VA 1GUVA 1E1EA 4AZBA 2XWEA 1BLIA 5BRQA 3VDHA 4CD6A 1SYTA 3WUGA 3PZNA 1NOFA 4TTUA 3VIIA 2RGMA 1XD1A 3CO4A 4GO9A 3BC9A 2WMIB 1FFQA 4UNIA 1JL8A 5D9PA 5A94A 1XGZA 2VC9A 2ZUUA 5ABHA 1GVIA 3HJEA 4WLCA 2ESCA 1HKKA 2D22A 1TZ7A 1W1PA 3MMWA 4E8CA 2XVGA 4B3LA 2PB1A 3QR3A 2XVPA 2J75A 3VIOA 2W62A 1MXGA 1OINA 4ZXOA 1E0XA 4NI3A 4MADA 1QNRA 2DSZA 1E6SM 4LX4A 1G1YA 2NT1A 4TOQA 2OYLA 2GJXA 3WBEA 2Y4SA 1LL7A 1W3KA 3ARXA 1V3LA 4AD4A 4WKHA 3T0BA 5M3WA 1P6WA 3BSHA 4UQAA 3IJ8A 1JAEA 3W6MA 1KGWA 1QI3A 4OIFA 3VTRA 1E72M 4H2CA 2A3BA 2DH3A 3OLIA 3OBAA 3DC0A 5ABEA 1SMDA 5DF0A 3RM9A 1HIZA 1RD6A 3T0DA 5ECUA 1BAGA 2GFTA 3AHTA 1XSIA 3VIHA 1OSEA 2VZUA 1B3WA 2BY2A 1BGAA 1ISYA 4TXEA 3B9DA 1E0VA 3FAWA 4YHEA 4AD3A 5IFTA 2VVSA 4MDOA 3N9KA 3VKKA 1US3A 1XH1A 1XSJA 2MANA 4H7VA 1HF6A 3WSUA 4BQ2A 1AQHA 2D23A 1J0ZA 1XCXA 2DPEA 3NDYA 2YIHA 3RDKA 3OZOA 2NW0A 1BVNP 5A2CA 1VJSA 3BAIA 7CGTA 3MU7A 1HL9A 4FLSA 4D1IA 1PBGA 2W67A 2BNJA 1KQZA 1OIMA 1WZLA 4EK7A 2J7FA 3TTQA 2D3LA 4PBGA 3L4XA 3EDEA 2UY4A 3SUSA 1QHPA 1B3ZA 3SCUA 3VPLA 4AIEA 2XM1A 2E4TA 4PMVA 2PWDA 3WFZA 4ZEPA 1CPUA 5CQ1A 3GXMA 3L4ZA 4Z2HA 5M5DA 3RCNA 3WENA 1JG9A 4E8DA 4QCEA 1F4HA 1JIBA 1SR0A 3SCTA 1EOMA 3S6TA 1JZ8A 2E8ZA 3WQ8A 3WUEA 3BAKA 3VGEA 3CPUA 1UR0A 2ZXQA 3GH4A 1KBKA 3WH7A 1EHAA 5I78A 1DWJM 2GJRA 5HPCA 2GDVA 4ZFMA 1GVYA 3RIKA 2E9LA 4QCFA 1BSIA 1XC6A 2XPKA 9CGTA 5LA1A 4V27A 4JL1A 3GZAA 1MWOA 3I3BA 2YDSA 1BHGA 3WF3A 1M01A 3W25A 2ZXBA 2VURA 4D6GA 3M46A 1CLVA 2EPLX 2XVKA 3WNLA 4M8UA 2OSWA 3WH9A 5GPRA 3KWXA 4WIWA 1FFRA 3G6MA 4RE2A 3CZKA 2OWCA 5E6ZA 2XGIA 3PTKA 2VQTA 2CKSA 4GI9A 3QGVA 4JFTA 1JI1A 2WC4A 4Z2GA 4CGTA 4GXPA 2X05A 1E70M 3GDBA 2CBUA 2UY5A 3APGA 2WBKA 3MS8A 4PYSA 2WMIA 1V6WA 4WKAA 2WM0A 2XG9A 2RGLA 3LPFA 3N1AA 5E6YA 5HPOA 2WBGA 1H4PA 1AMYA 1A47A 1V03A 3AHXA 2QPUA 2Z1SA 3GM8A 3VX0A 1CGYA 3WNPA 3A4WA 2GDUA 3WQWA 2C8NA 3ZR5A 5CLTA 2G3IA 1QNSA 2DEPA 1HKMA 1PIGA 1UR2A 5I77A 1C8QA 3WD3A 4C7GA 1JNEA 4C90A 3L4VA 1V0NA 1OD0A 2WSPA 2O9RA 1OGSA 3WUFA 4ACYA 1DWAM 1GQIA 2VX4A 2CBJA 1X1NA 4GINA 3CGTA 1MVYA 1Y7VA 3W81A 2D0GA 2PC8A 1E40A 3WELA 1DWFM 4X0NA 2XFFA 4ZENA 1GQJA 3SCPA 4UZSA 3S2CA 5E0CA 1DTUA 3MUIA 1WZKA 1UYQA 4IPNB 4Z2KA 1OT1A 1KBBA 2XJ7A 3VGFA 4EAMA 1GOWA 4GZJA 2QMJA 4HZ6A 4W85A 3WQ5A 1TR1A 4UFKA 2Y2WA 1V3IA 2EPNA 1JXKA 1E4LA 1FH8A 4D6JA 3UG5A 1KXTA 3N13A 1QHOA 1UWQA 3KEHA 4MB4A 1E43A 1C91A 3CBWA 2WWCA 3D3AA 3ARVA 3BAXA 1MW2A 4WJXA 2YL5A 4D1JA 3GH7A 2YA2A 2CBVA 2CBIA 5GNXA 1GOQA 1G01A 1UD8A 2VJXA 3ARPA 4MNJA 1CECA 4QLKA 5CGTA 3SCRA 4AD2A 2JEQA 4D6HA 3AISA 4OOZA 4GI8A 1JI2A 2VT0A 1ODUA 4PSRA 3A4AA 4AXNA 2CYGA 3ZSTA 1JDCA 1AQMA 1GW1A 3TOPA 3AZSA 3CZJA 4IM4A 5A69A 5D9NA 2CNCA 4XZBA 3ZJKA 2QPSA 2ZXAA 1VF8A 4MJ4A 3FNDA 1B31A 4TVDA 4W88A 2FH8A 4AWEA 3AZRA 4GPNA 1U30A 1MFUA 2CITA 1UD4A 1UUQA 2WK2A 2WYSA 1XRVA 2UY2A 1TA3A 3K8LA 3AIEA 3NSNA 3RM8A 5I79A 3WL0A 4PEEA 3WF2A 4ACZA 4IISA 4J3SA 1DWHM 4DWSA 3BAYA 6CGTA 4M29A 5A8NA 1CXIA 1R86A 1JYVA 2YKKA 2D1ZA 1C3FA 2WLZA 4B9YA 4HA1A 1VEMA 3WH5A 3WDRA 1LF1A 5A3HA 2XVNA 3GNOA 1CYGA 4IPLA 2J62A 2CKRA 3M6DA 3T2QA 4J3WA 3L2MA 2WVTA 4B15A 2QLYA 3B9AA 1IZKA 4U31A 4A3HA 3THDA 4WK9A 1UZ4A 4GI6A 3AIVA 4X0VA 1RPKA 1D2KA 2WKLA 3GXFA 1VJZA 1BYCA 1E4NA 3VIPA 4EE9A 4IUGA 1VAHA 3DYPA 3W37A 2WVSA 1KR1A 1KGXA 2X0YA 5BYWA 3LPGA 5KZ6A 4W5ZA 3WEZA 4AD0A 5D8ZA 1UG6A 1VFFA 2DT2A 5CPSA 1UD6A 3VINA 2G41A 3T08A 1HKIA 1OBAA 1WNOA 4HA4A 4MNKA 4AZ6A 4URIA 4JHOA 1HT6A 1BGGA 4PTXA 2XTKA 4X9YA 5HDRA 4AMCA 3T2PA 4CU8A 3MUY1 3VM7A 3CZLA 4QLLA 4W8LA 1NWTA 3MANA 4LYRA 1BFNA 1UR8A 3VNZA 2BXYA 3WQVA 3HN3A 2ZX5A 2ZXDA 1UWTA 4UFIA 1KXVA 2VCAA 3UG4A 1C7SA 1GJUA 3N12A 2J74A 5A1AA 1H11A 4AC1X 2VI0A 4UOJA 1UHVA 4UQBA 1J01A 1C92A 2E9MA 1QBAA 3CHEA 1UKSA 4FF5A 4BCEA 1ZB5A 2D2OA 1B3VA 1E6RA 2ZIDA 1GOOA 2BVYA 3WD0A 3A4XA 1B3XA 4GQQA 5M03A 4H04A 2Y24A 2JIWA 3CZGA 3GXDA 5M17A 1V02E 2WMFA 3QHMA 2WPGA 1I1XA 1HXJA 3WUBA 1J0HA 3AMCA 5A8OA 4XX6A 3POCA 4BQ5A 3KL3A 4W7WA 2Q8XA 3WMSA 1TE1A 1B0IA 2J7DA 2DQXA 2FHFA 3AOFA 2GK1A 2WCGA 2FHBA 3VD7A 3WD4A 1VFOA 4NF7A 1H3GA 1E73M 4KGLA 4B16A 5ABFA 5EFDA 3IJ9A 2D20A 1H1NA 2Z1KA 1QVBA 1KB3A 1CGTA 1I1WA 4M1RA 2E8YA 1J18A 1H0GA 4TVCA 1JDDA 8A3HA 3CH9A 3W29A 4CN6A 2EPKX 5IHSA 1JXJA 3AMDA 2DT3A 2WSKA 3K4DA 1HX0A 1HP4A 4HU8A 2WAGA 4U3CA 4HMDA 1HL8A 5I23A 2EEXA 1OWQA 5A6BD 4OZOA 1UA3A 3ZQ9A 3OGVA 3WNMA 2B31A 1CXEA 1R7OA 3BLPX 4PUDA 4HMEA 3ZT7A 3GH5A 2WKGA 2X0HA 1NM9A 1LL6A 3MV01 4JFVA 1G0CA 5A6SA 2XIBA 1VFMA 4C91A 3W82A 5I5RA 4RE4A 4UQEA 3VMOA 1KXHA 1WDQA 5BCAA 1KCLA 2ZUTA 3MMUA 4H8UA 4W7VA 3QHOA 3AIQA 5TD4A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RL3 A;  1EH9 A;  3CUJ A;  4AZH A;  2DSK A;  3THC A;  3VOC A;  2WAN A;  2ZE0 A;  1TG7 A;  2JAL A;  4UCF A;  3PZU A;  1UH4 A;  1FH9 A;  3EMC A;  3UER A;  2W92 A;  4MB3 A;  5JBE A;  5AC4 A;  2PWF A;  2W5F A;  2J8G A;  2W63 A;  4PCS A;  3U5Y A;  1Q6G A;  4AW7 A;  3TON A;  1XYZ A;  3VIM A;  2C7F A;  3ZOA A;  4OJY A;  1V3J A;  3BAJ A;  5A6K A;  1KWG A;  4L4O A;  4UQD A;  5HOS A;  1FP9 A;  5KEZ A;  1GPF A;  2V38 A;  3K1D A;  2J7H A;  1CEN A;  5FD0 A;  1WKY A;  3ARZ A;  1XYF A;  4PMD A;  3WY1 A;  4WSK A;  1FH7 A;  2VZT A;  5ABG A;  4A4A A;  3D5H A;  3TA9 A;  2BV9 A;  2QF8 A;  1JD7 A;  1E15 A;  1NAR A;  4AZC A;  4P7N A;  4W89 A;  5LYR A;  4ATW A;  1DP0 A;  3L4W A;  3SCV A;  5HNN A;  2J7E A;  5DFA A;  3WMC A;  1E56 A;  2WMH A;  2WVV A;  4U33 A;  2XVL A;  1HJW A;  3PHA A;  3ZJ8 A;  5EBA A;  1ODZ A;  2Y8K A;  4PMZ A;  3F5K A;  1C8Y A;  1QI5 A;  5DO8 A;  4BQ3 A;  1Q6E A;  5LA2 A;  4CD8 A;  4JFW A;  1ISZ A;  2X8R A;  4P8X A;  2VCC A;  5A2A A;  4W87 A;  5E09 A;  4HOZ A;  3AYS A;  1L0P A;  4F9J A;  3WL1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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