3SW6 | Genus

Total Genus 83

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	83
sequence length	214
structure length	214
Chain Sequence	VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title	Crystal structure of Methanothermobacter thermautotrophicus orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-azido-UMP rcsb
source organism	Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus	83
structure length	214
sequence length	214
ec nomenclature	ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date	2011-07-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3sw6A00

4N9DA 5H2ZA 3MHUA 3NM1A 4IMCA 1JCXA 3SZ8A 1HL2A 1I2QA 2J27A 4WUIA 3UPWA 3W7NA 3GVGA 4JIQA 1RD5A 5CZSA 2GUUA 4AHOA 5FF3A 4AF0B 4MJMA 2OZ0A 2RFGA 5LNRA 3TMLA 4O50A 3QSRA 2YFNA 1GVOA 3PVFA 6TIMA 3W7MA 1H62A 4UTIA 1P4CA 5DCBA 3M9YA 3W74A 4PL2A 1FQ0A 1QPRA 2YYUA 3RMJA 1VCVA 3CB8A 4M5PA 1AW1A 3W2NA 5HUOA 1A5AA 4U4MA 3ZFHA 4E2BA 2HS8A 4MJZA 1JCNA 1TJPA 2Y89A 2PCQA 3W7QA 3NYZA 3LCLA 3I7RA 5G2IA 3E0IA 5EYWA 2YW4A 4LUIA 3W1LA 3EX6A 5FI8A 3WK0A 1DJQA 2YYTA 1RR2A 5AYYA 2GOUA 3W2LA 4LV9A 1G7VA 4IMDA 2OT0A 4R7JA 2ZA3A 4S2BA 3EWZA 2GVGA 4YLWA 3NM3A 1PCKA 4BF9A 1M7PA 4GUGA 1YPFA 5F2LA 5EL1A 1QO2A 3W1QA 4Z1AA 3O15A 1JCJA 4CLMA 3TC7A 4J9JA 1BWKA 3PB2A 4O11A 2BXVA 1YYAA 4GUJA 3L65A 4X9SA 1IIGA 3NEVA 3NOEA 1V7YA 4JX5A 3EXTA 1VLWA 2FQIA 2RDTA 1PS9A 3LXCA 3UXAA 1TPH1 4O53A 4JTLA 2Y6ZA 1Z44A 3MUXA 2J9XA 3HOJA 3SR7A 5EA9A 2ZZ3A 3S1WA 1Q6OA 3FKRA 1KFJA 3BW3A 3TFXA 3C61A 5D30A 3HB9A 4MKNA 2XN0A 3TSMA 1WOBA 2PE4A 4TU1A 1ML1A 1YADA 1KFCA 4M6VA 3TQKA 1F6KA 5AC6A 4NZFA 3LHTA 1AL8A 3NQEA 5I3KA 3M6YA 3W87A 4CNPA 1FWWA 2OJPA 2G97A 3NL5A 2VENA 3MP4A 2GQ9A 4BWLC 4NXSA 3UWVA 1A53A 4DPQA 1OFOA 2DZPA 3SFKA 4EWND 1EUNA 4FNSA 2NX1A 1OFDA 2XN1A 1O5XA 4Z1BA 4H6KA 3BW4A 1W56A 1MEHA 4JS3A 2YPIA 1KFEA 3DAQA 4LOCA 4JXCA 1KM2A 1S3HA 2HMCA 1PHWA 4FEZA 4OV9A 4IX0A 4O15A 1OK6A 1W5OA 3W71A 2A21A 1I2RA 4JN6A 2V8ZA 3GAYA 1W5MA 2DZSA 3QQ1A 3QM3A 4ALDA 3KHJA 5G1TA 4XBSA 5F1VA 1X6UA 5IBXC 3P82A 1GQNA 5EBUA 3QSTA 3NL6A 4OWGA 4C1LA 2DZUA 3P62A 4K7VA 3QYQA 1ICSA 3M5ZA 5HJLA 3R12A 3W85A 1TQJA 3HJZA 4GC4A 3SGZA 1MSSA 4YCPA 1I2OA 2OMAA 5DCDA 4UFKA 2ISVA 3O05A 2DJLA 2TYSA 2W6RA 3W84A 3W1XA 2QUVA 1ZY9A 3LXBA 3PUEA 4AVFA 1WAUA 4PH6A 4A2SA 3C2RA 4TX9A 4WY0B 4TMCA 4KKXA 3LDVA 1O95A 1SO4A 4LNYA 3GNNA 1A5SA 4PFMA 1I8JA 3NL2A 4Z1CA 5K4XA 2FPYA 3O07A 4ADSA 1GVQA 1I45A 3G1SA 4X3ZA 2JGYA 2VEKA 3L5AA 1GPWA 3TC6A 4AHQA 4AWSA 2QCFA 5AFDA 3STCA 5CSRA 4OGZA 5AC7A 4NJHA 4DO4A 3FKKA 4ZQRA 3QPZA 3ABRA 4FIRA 2E5CA 5CPMA 5KINA 4OBTA 3DBPA 1DQXA 1P1XA 1ZNNA 4M7TA 3TJLA 4Y6GA 2B4GA 4TIMA 1ME7A 1VHNA 1KM1A 3E12A 1FWSA 1TTPA 4UNKA 5D2WA 2BWGA 1H60A 1VCFA 2ZRZA 1LOSA 2QF7A 3G0UA 2WV8A 3A24A 2HSAA 1N8FA 1NSJA 2AGKA 4FNPA 5BMWA 3FJ6A 3S1XA 3CIWA 1KFLA 3RLVA 2QCMA 4MVAA 3PWAA 4QNEA 1HFBA 3S5YA 3LRMA 5FEXA 3M47A 4BWLA 1GYLA 3IEBA 3EXRA 3W75A 4ORIA 5I3HA 3P61A 1R2SA 2RDWA 5D05A 2J9ZA 3IGUA 5AHNA 1KTCA 1X7FA 3CM4A 1TV5A 4I9AA 1OJXA 2YXGA 3TW6A 1F05A 3P81A 3G18A 3KRUA 4AF0A 1LTDA 5D32A 5SWUA 2CLIA 1KM3A 4JX4A 3W70A 1XCFA 3O6CA 2ZZ4A 5D02A 1LYXA 3WJXA 3B0UX 1KTBA 3C0JA 3W7LA 1VYRA 3RFAA 3PF3A 4KFPA 1GG1A 4IXXA 3G0XA 4UR7A 3BG5A 1D9EA 5IBXA 3H54A 1H63A 2QAPA 1OF8A 1THFD 3W7KA 4NX0A 4H3DA 1M7OA 3EWYA 4GNJA 3L2IA 2ZCGA 3NPUA 4XZ9A 3OHIA 1JR1A 4WX2A 1LDCA 3WFAA 1EPXA 3LBMA 2VFHA 5CG7A 3BG3A 4LC6A 2GQ8A 4UNLA 3UXDA 3B06A 1TPEA 4HIBA 2ZZ6A 3RLUA 1OFAA 3I7QA 3BLFA 2BX7A 3M5VA 4NJJA 2RDUA 3S5OA 2WSQA 4IMFA 2V82A 1EB3A 4N4PA 5G2HA 3C8FA 2RKXA 5AC8A 1W37A 5I3FA 1IGSA 2FB3A 4UTMA 4XWUA 2X1SA 3KFTA 5HMSA 3GDLA 3FYOA 1KBIA 3S1VA 3HO8A 3TKFA 3LTYA 3W2JA 2F84A 4PTNA 3N14A 3T78A 1SZFA 3A9IA 4MUZA 5CPNA 1ALDA 1YDOA 4HNNA 1LBFA 1S5VA 4JY9A 1BKSA 4UFHA 3W1MA 3W7GA 2Z6JA 2JKPA 1GTHA 5G2WA 4A3UA 3CTLA 5AHMA 1JQXA 4HN4A 4CQ9A 3STFA 1W1ZA 5DXXA 1KM6A 2E5DA 4RZ4A 3ZR4A 4NNAA 1TYGA 3VFLA 1P0KA 3G1FA 1LOQA 3ZWTA 1IXNA 1H5YA 3LCXA 4PODA 5D38A 3S5NA 4NU7A 4UMBA 1XBZA 1QR7A 5BRBA 1M5WA 4GUIA 1QO5A 1HTIA 2ZFAA 1OX4B 4NX5A 2R91A 1LRTA 1LLZA 4N9EA 1W5PA 3W76A 3LB0A 4FF7A 3JS3A 5LHEA 1BTMA 3QMSA 2WJZA 3BLEA 3N9RA 5G1YA 1GZGA 3UZ5A 3GYEA 3UWYA 3EB2A 1KW1A 4ZQNA 3O16A 5E93A 1H1YA 3EEGA 1OX5A 3M1ZA 1G4SA 3GDKA 4QSHA 3ABOA 2AQWA 4UCGA 4LVBA 2PRMA 5HQEA 2B7OA 2J88A 1BEUA 1J5TA 1UASA 3M5XA 2FDSA 2WNQA 5FF4A 4HHPA 3G8EA 4IUOA 1KBJA 4O1AA 4UTKA 5DBTA 2E6YA 3VCRA 4FNRA 4JYDA 1DOSA 1WA3A 5AYZA 2Y7GA 3MHFA 3HGRA 5E1QA 5HINA 1JUBA 1B9BA 5T26A 3WJZA 3LV6A 2W0UA 4JTFA 3EKZA 1ZCOA 4O8RA 3AJXA 3MI6A 3B05A 3P67A 1VPXA 2H3BA 2RH9A 3IRDA 4LVGA 4TR9A 1LRQA 1W5NA 2NLIA 2BLEA 3QRHA 2EPHA 4Y9AA 5DN1A 4GXMA 2E6DA 1W5QA 5DLCA 3TFCA 3G1AA 4RXGA 3FFSA 1W3IA 4YL2A 2ZZ5A 2A0NA 2A6NA 1LCOA 4DBDA 1ZJIA 3O06A 4QAIA 1HO4A 3OEXA 1H7OA 1KFKA 1XBVA 5AN7A 4A22A 3EXSA 4JDBA 1UUOA 1T99A 2B7NA 1TRIA 1DV7A 3W72A 5LGXA 1TPUA 4Z0SA 4NJIA 3LX9A 1W0MA 5FEPA 1JJKA 3NQGA 5I3GA 1TJRA 4PCFA 4JD4A 2Z1BA 1EA0A 1OVDA 3B8DA 1OG0A 4RR4A 3CHVA 4ONVA 1XDMA 4R34A 3LCGA 5LNSA 3MO7A 4ZQOA 4CCCA 3S1UA 4UTJA 3CEUA 3FJLA 3WJYA 2V81A 2CZFA 3KVMA 5AHEA 2P0OA 2H8ZA 1T96A 1SO3A 4IMGA 4RJEA 1B57A 2WPBA 3GAKA 3OVPA 4UTLA 5C54A 3KAOA 1WV2A 2CZ5A 3GR7A 5U7SA 4QNWA 5AHIA 2X1UA 4HNTA 2EGZA 1QFEA 3G1HA 4RKAA 5D37A 4QIUA 1TTQA 3P60A 5F2GA 3Q2DA 2FPVA 4WXZA 1A5BA 2QEZA 5K3VA 2ZQ0A 4NZJA 2E1DA 1OX6A 3LHYA 1EWDA 3N19B 4E38A 1VQTA 1K8XA 1PCWA 3DKJA 3W2KA 3W2MA 3G22A 4Q32A 1S5TA 1KTNA 1C29A 1ZENA 3RK8A 3GDRA 4N2YA 1G69A 3JR2A 2DZXA 2YW3A 4M19A 3LI0A 3PY2A 1GVRA 2QCLA 3UY8A 1S5WA 4H4IA 2NV2A 4FNUA 3MWAA 2QJHA 3INPA 2VXNA 3TX9A 1JCMP 1GWJA 1SR9A 2W79A 4JX6A 5LKYA 4KFOA 5EKYA 4BFAA 1H51A 1E51A 3A21A 2X16A 1LORA 1AW2A 1VC4A 1F6PA 2CLHA 2YDAA 1ME9A 6ALDA 1DORA 5LNUA 3QFEA 4K7YA 3VKJA 5C5YA 3IGXA 1ZFJA 3LERA 4OV4A 2PURA 5LGZA 1V5XA 2C13A 2V5BA 1MO0A 5F2IA 5E0KA 2NXHA 3DKLA 1SQ7A 2E6AA 3CPRA 3WJSA 1VGAA 3HMJG 2CWNA 3TXZA 4O18A 2V2CA 4UIOA 5LSMA 3S9YA 2V2DA 2H3DA 4UTWC 2QUUA 2CZEA 3EX4A 4EF8A 2XFWA 2CLKA 2A85A 4XKYB 4L4MA 4AH7A 1FBAA 3MJYA 4A29A 3PUDA 3NA8A 4JR5A 3TDFA 3KX6A 2OX1A 3BO9A 4YCOA 3W1UA 4TMBA 4FB7A 1SU5A 3CLMA 4WZHA 2AAMA 2QDGA 3QH2A 3O1NA 3O6DA 2ZZ1A 3ABSA 3VI2A 1ONRA 4K6AA 3S8HA 4WD0A 3C2VA 2ABBA 2JKAA 1YTDA 2VOMA 3LXAA 5CZ0A 1QNVA 2ZZ2A 2C14A 1FWNA 1G4TA 3C3NA 1RPXA 2E77A 4AMAA 1YPIA 3DH7A 1TPWA 2LLEA 4WQ6A 2QCHA 1SW3A 4JTUA 2Q8LA 2I1OA 1DBTA 1KA9F 1NVMA 3LV5A 1OX4A 4O19A 2C3ZA 1R46A 2QJIA 3IV3A 3PSVA 3ATYA 5MHBA 3GXTA 2VEPA 5AOUA 1O94A 3BLIA 3I68A 2ISWA 3TU9A 2PRLA 1FWRA 2ZRYA 4DO5A 1H1ZA 3VNDA 1AW5A 2CU0A 3Q37A 4UFIA 4HPXA 3IIZA 1QOQA 1VHCA 3C56A 3N34A 3W7IA 4LVFA 2YGYA 3GR8A 2YX0A 3W22A 2EF9A 4JTGA 3EX1A 3QQ0A 3VE7A 4EOUA 1GEQA 5KZDA 1IXQA 4CNNA 4O57A 3SI9A 2HS6A 3SY5A 3NGJA 3UWQA 1C8VA 3PAJA 2NUXA 3NAVA 3TR2A 4O13A 2E68A 3KXQA 4YMZA 3L66A 2ZA2A 3NPWA 3LLFA 2ALDA 1DL3A 4RCXA 4UXDA 3R89A 3M0ZA 3GLCA 3NPVA 3KOFA 3TMQA 4JGDA 4HPJA 1SW0A 3NVTA 1K7FA 3CT7A 3CWNA 3ANYA 4D2JA 1YTKA 4S2CA 5HWNA 4LS0A 1IXOA 4UTTC 1WBHA 3UZJA 4MY1A 4DF2A 3DFTA 1LM1A 3I65A 4LUJA 3TNOA 4JTEA 4M6QA 1AL7A 4Q33A 2A6LA 3C52A 3CEPA 3W7OA 5D09A 4Z08A 4R33A 3G1YA 3W7RA 2CLFA 3PM6A 2A2IA 3TJXA 3L0GA 4MZYA 1XBXA 5BW6A 2ABAA 2ZRWA 1G7UA 2R8WA 4UTWA 1TQXA 3LHZA 1G6CA 2QCNA 3U6WA 1XKYA 3NO5A 4RXFA 2PRHA 3PS7A 3W7PA 2QDHA 1A5CA 1JUKA 2C6QA 2QCDB 4FNTA 3TAOA 5KMYA 3BW2A 2CLLA 3QPYA 4JTKA 4O14A 2GQAA 3YPIA 4BK9A 3W23A 4AAJA 3NQ7A 3PC0A 5ABTA 1R2RA 5TIMA 4OT7A 3LBCA 1XBYA 1UCWA 2F7FA 3PBWA 2A7RA 1WQ5A 1FUYA 1TREA 4JEQA 3K30A 4ADTA 4LVDA 3B4UA 4UFLA 4JYFA 2DU2A 4HSOA 2P1FA 3DU0A 2C0AA 1KLZA 1T8XA 5J5RA 1Q6LA 3GXNA 2VEMA 5C2XA 3B0PA 5DY2A 3G0SA 1L6WA 1FDZA 1K7XA 5HULA 5K7JA 5FEZA 4I7VA 4WJEA 5EMUA 4LTSA 1H7PA 2WNZA 1NFBA 1TPDA 2ATMA 2EAWA 5F4XA 3QZEA 2Z2UA 3ELFA 2WNNA 1XUZA 4NJGA 5LNWA 4DF0A 4O4WA 1GT8A 1UUMA 3V1PA 1KFBA 1KM0A 1KV5A 1M6JA 4NJKA 5DELA 4DBEA 4N6FA 5LZLA 4A2RA 1Z48A 5KTLA 1JCLA 2A1YA 3GB6A 2YR1A 3QW3A 4GE8A 5G5IA 1SFLA 1TCDA 5HWJA 1RZMA 1GYNA 2NUYA 1YDVA 2O7QA 1OFBA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3SW6A

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