3TA6A

Structure of mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
RKPLIAGNWKMNLNHYEAIALVQKIAFSLPDKYYDRVDVAVIPPFTDLRSVQTLVDGDKLRLTYGAQDLSPHDSGAYTGDVSGAFLAKLGCSYVVVGHSERRTYHNEDDALVAAKAATALKHGLTPIVCIGEHLDVREAGNHVAHNIEQLRGSLAGLLAEQIGSVVIAYEPVWAIGTGRVASAADAQEVCAAIRKELASLASPRIADTVRVLYGGSVNAKNVGDIVAQDDVDGGLVGGASLDGEHFATLAAIAAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structural and functional characterization of Mycobacterium tuberculosis triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 94
structure length 255
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ta6A00
3RNDA 3S1XA 3DFOA 2B7PA 2TYSA 1DVJA 1OFDA 2YGYA 1JR1A 1QPRA 5HMSA 3LHWA 1KM5A 2NUWA 3TH6A 1H7PA 3DFQA 3HF3A 3OEXA 3QRHA 5AN7A 4DO4A 1OF6A 3BK0A 1L9WA 3GKFA 3QW4B 1L6SA 3VNDA 4LNYA 1GVOA 1JCLA 1YTKA 4JX6A 1G67A 4IUOA 5I3FA 2E6AA 4R7JA 3TE9A 4HIBA 3O6CA 2A21A 5DCDA 1JUEA 3LHVA 5EL1A 2OCZA 2V30A 3FYOA 3W83A 3WJZA 2DJXA 3C0JA 4O50A 1HUVA 3TROA 3UZJA 4CQ8A 3FKKA 2RHGA 4N4QA 2LLEA 5FF2A 3RFAA 1QPNA 2A0NA 3NEVA 4GUGA 4N4PA 2H8ZA 3IGSA 3T7VA 2PRHA 4YLWA 2J6XA 3LBCA 4ORMA 2G5WA 1C29A 1IXOA 2B4GA 3MMTA 1IXQA 5D33A 3OVPA 1XUZA 4KFOA 2EPHA 5F4XA 4BFAA 3MI3A 4MVAA 2V2HA 3P7YA 3QC3A 3W70A 1SO6A 3M0ZA 5MHBA 2TMDA 1YDNA 1EP1A 1THFD 4Q32A 4CLMA 4IOTA 3LDVA 3W7DA 3TQ0A 3GAYA 2PRMA 4JYDA 1SW0A 3WK2A 1EUNA 4PA8A 4RR4A 3TXVA 3N2XA 2YDAA 4NJIA 1Q6QA 1W1ZA 4TU1A 2X30A 4WJEA 3P81A 3DFNA 3LCXA 1K7FA 1EB3A 3TJLA 1KM1A 3EX3A 3M16A 5D05A 4O1AA 2A7PA 1R47A 2JGYA 3QPYA 4YL2A 4MYAA 1HTIA 5EYWA 3IVSA 4JX5A 3W9ZA 2Z6JA 5K3VA 3O6DA 1LBLA 4TO8A 2VFFA 1UB3A 2CZDA 3E49A 3B05A 4MZ8A 1LOSA 1TPUA 1N55A 1UJPA 1HO1A 2D73A 3EKZA 2BZNA 4NJKA 5DY2A 3BW3A 4UTTA 3NAVA 4Z0JA 4UTTC 3P74A 3PBYA 5H2ZA 1B57A 4AVFA 1JJKA 3H54A 3W22A 1ZAJA 1O5KA 3N34A 2FJKA 1TQXA 1LOQA 1M7PA 4I7WA 1TV5A 4R33A 1CX9A 1W5MA 1X1ZA 4M19A 3BG3A 2V9DA 1OYAA 1H7OA 4UMAA 2ZBTA 3TFCA 1FWWA 4MLJA 4LV4A 3IIPA 1JUBA 1A5AA 5IBXA 3L67A 4AEOA 5IBXC 3IVTA 3EX2A 1KM4A 5D30A 4O0KA 3TC6A 2NXIA 3W1RA 3B8DA 3EX4A 3KFTA 5KZDA 1SO3A 3UWQA 5AHFA 2VOMA 3W87A 4UUIA 4TMBA 4LVDA 4AF0B 4XBKA 1B9BA 3TAOA 2H90A 3G3DA 2I14A 3I7RA 3S5YA 5G4WA 3B0UX 3C56A 4ZQNA 3LOTA 3N3MA 5G2WA 1YDVA 5D2TA 3GXTA 1NEYA 1EP2A 4UR7A 1MEIA 3W7PA 3ATYA 3PBUA 5CKSA 3QMSA 3ELFA 4Z1DA 3W3OA 5G2IA 3DH7A 4Y8FA 3QF0A 4O28A 3E0IA 5CSRA 2DU2A 1F05A 1WAUA 3CLMA 2KZHA 1SPQA 4FXSA 1EPXA 1OX4B 3CIWA 3SZ8A 1H60A 3T4CA 4MFEA 1FCQA 5AOUA 4M6PA 4O1CA 4DELA 5TIMA 3LCWA 4M7SA 1AW5A 2A1YA 5G5IA 1A53A 4K39A 1ML1A 3G1HA 3LHYA 3PR2A 2V0TA 4JYEA 3QQ0A 3SGZA 3OVRA 3FFSA 3NQ2A 3PS7A 2QJGA 2HMCA 4ADUA 4UMBA 2VELA 5CZTA 3S5OA 3NL5A 4O1DA 3P80A 1D3GA 5I3JA 4TMCA 1Z44A 2Q8LA 3U6WA 2E1DA 2GQ9A 3C2FA 1VPXA 1O4UA 2OJPA 5D37A 4JY9A 3NL3A 3ANYA 1G4PA 4A3UA 4DO5A 1PHWA 2RKXA 2HS6A 4CCCA 1DV7A 5J5RA 2CWNA 4IMDA 2CLEA 1X7FA 2YSWA 2W6RA 3W7HA 3LRMA 5EY5A 3GDRA 4MFDA 4S2CA 3G1VA 2GUUA 4LT9A 2C14A 5FEXA 1JCYA 5BRBA 3FJLA 4D2JA 3CWOX 2FPYA 2QCHA 1SZEA 5CZJA 3S5ZA 4IWWA 1B3OA 2Y62A 5D2WA 3O16A 5DCBA 2ZZ7A 3W7RA 2TSYA 1SZFA 3GB6A 3LV5A 1DORA 2CZEA 5D2VA 3W7NA 3W2KA 1PS9A 4QNWA 3DHFA 2C6QA 1KW1A 1KFJA 3KOFA 4FNPA 3ABOA 2PURA 1OK6A 2V81A 3BLEA 4NJGA 4FIRA 3TNOA 1W0MA 2VEIA 3S42A 3M6YA 2VFDA 1L2UA 3P5YA 1DKWA 1JRBA 1XL9A 2GJNA 1CI1A 2I9EA 2YFOA 1EP3A 2YCEA 3TR2A 3S1WA 3QH2A 2ZRUA 2R91A 4CQAA 4O11A 3TKFA 5BMXA 3FLUA 4DEFA 1K8YA 3DFSA 3PULA 4LU0A 2DZWA 3GXNA 1VLWA 4DQWA 1JCJA 5AHLA 5AC6A 2WQPA 3HPSA 1TB3A 3PG8A 1NVMA 3IIVA 2Y7FA 1A5SA 4O4WA 1FXQA 3MWAA 4LVBA 4ZQRA 5EA9A 4H4IA 1QR7A 4QNEA 1W3NA 4LS1A 1ONRA 4O18A 3LXBA 3UWZA 2QAFA 1TTQA 5HULA 4ZL1A 5F4SA 4EF8A 2AQWA 5E93A 1QAPA 3VE9A 1OFOA 3P84A 3UWVA 3A5FA 4S1FA 3R5EA 3O1NA 3NXFA 1UUMA 4FEZA 1KV8A 3R13A 1TPVA 2H3BA 1W5PA 3OIXA 2X2GA 4UNLA 2V8ZA 5HNRA 4QISA 3CEUA 5LZLA 1VYPX 4O12A 5I3IA 4K8HA 3WK1A 3SSJA 5F4WA 1VGAA 3BO9A 3TQVA 1I4NA 1OFAA 2VC6A 1GPWA 4IPIA 4RZ6A 1TYGA 4BWLA 2NUXA 5D2XA 4O15A 3W2NA 2G95A 2J88A 4IGHA 1OX4A 3GXPA 4NX0A 4GFSA 2HSAA 4EIVA 1LM1A 1H5YA 4H3DA 5BMWA 5DBTA 1GYLA 3B4UA 4MZYA 2RDTA 4Z08A 1OYBA 1H51A 3NQ8A 3T40A 4FXRA 1H62A 3U2OA 1LROA 2TRSA 3TK7A 4QQ3A 3LCGA 3T44A 4QM1A 3NA8A 3HIJA 2Z0IA 2GVLA 1ME9A 1X1OA 1XC4A 1Z42A 3G1DA 2AGKA 1H7XA 1KFKA 1ADOA 3W7JA 1G4EA 1ME8A 2B7NA 2NXGA 2ZTKA 2AAMA 1X8FA 1C9DA 1KFBA 3KRUA 1TRDA 3M5XA 3LXAA 1W5QA 3WJYA 4AWSA 3WJSA 4YCOA 2VFHA 3A5VA 4DF2A 3PF3A 3RMJA 3V75A 4CNOA 5K4XA 1YPFA 1G4SA 3OA3A 5LNVA 3E9AA 2B7QA 3EXSA 1KFEA 4FX6M 4NJHA 4AMAA 5I3HA 3LRLA 3BGGA 4RCXA 3ABSA 3SW6A 3ATZA 4N6FA 5D38A 3EWXA 3BW2A 3QYQA 1JCMP 3W7GA 2NX1A 4DXVA 1T8XA 4ZMGA 5FF4A 4CNPA 3NQ6A 2A7RA 1HL2A 1QFEA 4WZHA 2CU0A 2CLKA 3BVJA 3G0SA 4X22A 1ZCOA 3O05A 4UTKA 3HJZA 1H50A 2BLEA 4N9DA 4I7VA 1WOAA 4MPQA 3W86A 1ZHAA 1JULA 4GUJA 5CSSA 5F2GA 3GLCA 1GEQA 4O14A 4WY0A 1SO4A 4LW7A 4LRTA 4WOZA 2FIQA 4OV9A 3MYPA 5DY3A 1WYIA 3LLDA 3HGJA 3L21A 1H1ZA 1F6PA 2EAWA 3QEZA 3Q2DA 3UYCA 3LHUA 4OHQA 2QDHA 1B4KA 3W7EA 1FCUA 1WDWA 3NPVA 4UFMA 3M43A 4GXMA 4RZ4A 2ISSA 4PODA 1TO3A 1WBHA 3CWNA 4XKYA 3GR8A 4OQVA 3LGEA 4LVAA 3P60A 3GNNA 3RF9A 3NGJA 3NQGA 1XCFA 2DZXA 3FIGA 5AHMA 5DLCA 3T55A 3W7LA 3BGJA 4YCPA 1XI3A 3CTLA 4RZ5A 4UMCA 3P67A 3W85A 3SECA 2FB2A 1RR2A 2X1SA 4UTWA 3GYEA 1TV7A 4AWUA 1FWRA 3VI2A 1SFJA 4ZQMA 1W5NA 1YADA 1K7XA 1K8XA 5FI8A 1QPQA 4RKAA 4HT3A 3W1PA 2CFFA 1OYCA 4LC8A 1H7NA 1BWKA 1BWLA 2VKZG 1J5TA 1GVSA 4HSOA 5K4ZA 3N2MA 2WOQA 3P5ZA 1JQXA 3IGXA 2EKCA 2NX3A 3BW4A 3EB2A 4NUWA 4ML9A 3O07A 2ATSA 2NWRA 1KM6A 1VCGA 4GUIA 1RQHA 1NF7A 2PC4A 4BI7A 2VENA 3A21A 5HWMA 1YXDA 3P8IA 1G4TA 1K8ZA 4ALDA 1JQVA 3S8HA 1KLZA 2YFNA 1A5BA 1MO0A 3PSVA 3NO5A 5HQEA 3KAOA 4YWIA 3CPRA 2GQ8A 2WKJA 3G24A 2NUYA 2H6RA 4ZZ9A 5LNUA 4BI6A 4UXDA 1K3UA 4K7YA 3GVGA 2NWSA 4DBDA 5KITA 1AW1A 4KWVA 8TIMA 2VEMA 5CPOA 3TQKA 3W7OA 4NNAA 5AFDA 1VS1A 1R30A 1GVFA 1ICPA 2B7OA 1JUKA 5DBUA 3TX9A 1GG0A 2P0OA 2QKFA 1Z41A 1LTDA 1TIMA 1ME7A 2RDWA 4MJMA 3L68A 3IIXA 3BG5A 2GOUA 1H1YA 1VQTA 3CB8A 2JGQA 2TPSA 3DFPA 5LGXA 4B5NA 5AYYA 4QIUA 5FEPA 4K6AA 3KXQA 5G4EA 4A2RA 4AHOA 6ALDA 4UCGA 4PFMA 3PBVA 3STGA 3W1XA 1VCVA 5HJLA 5F2LA 1X6UA 4UTIA 3MJYA 3HG3A 3LXCA 4N9EA 2QAPA 5LSMA 2ZZ1A 3FS2A 4JN6A 4EWND 3G1XA 4JTHA 3CU2A 3VE7A 4N02A 5AYZA 1BKSA 3MUXA 4O19A 2QCLA 1FQ0A 3QJAA 4XTDA 3M41A 1OFPA 1KFCA 1YXCA 3W73A 1K7EA 4M6VA 1TTIA 1FWSA 7TIMA 4UTJA 1Q3NA 3NQCA 1WOBA 1D9EA 4NU7A 3PUDA 3VCRA 1TJPA 4U4MA 5D04C 3TFXA 4JYFA 3LCHA 3DU0A 3C2EA 3TU9A 4KFNA 3M7WA 4LUIA 3N19B 5D09A 2V82A 4MY1A 4H6KA 3LTSA 3EWBX 2E5DA 3HQ1A 4W9TA 1SZGA 5LNSA 1QWGA 1SU5A 3TJXA 3AJXA 2ABBA 4UFHA 1WXJA 3C3NA 3UWUA 3EX6A 4O52A 3S9YA 3W71A 1JCNA 3AO0A 5FF3A 3GDTA 3W07A 4NNCA 1GYNA 2HTMA 2QR6A 3C61A 4YMZA 1W31A 1O94A 3SR7A 1VH7A 3W7QA 1I45A 4QITA 2XFWA 3A24A 4IX2A 3V1PA 1MXSA 3LHTA 4JTKA 5IM51 3KVJA 1K02A 4K38A 4AHPA 1OFBA 3B0VC 3WJWA 3KVMA 2E77A 1GWJA 2QCCA 2ZYFA 4IMGA 1FCBA 2FDSA 3LCIA 3I65A 1U83A 2RH9A 1Z48A 3CIXA 1H7WA 2X1TA 1LYXA 3TDFA 1LZOA 1LCOA 4K37A 5G1YA 1W3TA 3VFLA 5T26A 3F03K 3QSTA 4DO6A 2PE4A 4TX9A 1PIIA 1EEPA 1TSIA 3CQ0A 3L2IA 2CLLA 3JS3A 3BARA 3GDMA 3LCLA 3TAKA 2QCNA 1OF8A 1F5ZA 3KVKA 5EBUA 5G2HA 1IXPA 4JY8A 5L9FA 3STFA 4YXGA 1Q6LA 3CEPA 2QDGA 3N9RA 1MZHA 1AL8A 2EGZA 2GPTA 3HPXA 3UZ5A 5FESA 3LBMA 3UD6A 1LRNA 3GK0A 4MY9A 4O54A 2CLHA 2EHHA 4IMFA 3MO7A 3UXAA 1ZALA 4PL1A 4NT0A 1U5JA 2H3DA 2PRLA 4UFLA 4UFKA 2XN2A 4GNJA 4LOCA 3N14A 2E6YA 3TC7A 3NL6A 3MBDA 2ZRZA 1T0OA 3G1FA 2WSQA 2ZRXA 3LV6A 3NQDA 3EXTA 4MYXA 2ZQ0A 3TXZA 4RXGA 1HG3A 1M6JA 1ICSA 1LDCA 1P0KA 2A2IA 1XBZA 5C5YA 5F1UA 1EIXA 3NPWA 2DZVA 3MYOA 5AHNA 3LI0A 2Z1BA 5CGQA 3WJXA 1DL3A 1Q6OA 1ZAIA 4LRSA 3TIMA 4MJZA 3GDKA 3DGRA 2QCEA 4WY0B 3LI1A 2ZFAA 4K8EA 4FX8A 3W2LA 3W1AA 1IIHA 2OT0A 4MZ1A 5HWJA 3C52A 3MHUA 1SW7A 2V5BA 5AHIA 1OK4A 2E6FA 1AW2A 1I2RA 3USBA 5EPDA 3W2JA 3R8RA 5LNRA 4Q33A 2J27A 4JIQA 5H91A 3ABQA 2A4AA 4XKYB 2WNQA 1NF0A 3L9CA 3NZRA 3S6DA 4L4LA 3MP3A 3UY8A 1C8VA 1L6WA 3HG4A 1GT8A 4UTLA 2QCFA 3HGRA 3LHZA 2PCQA 1QPOA 5CPNA 3I7QA 4FHAA 1ICQA 3W76A 4C1LA 5FF0A 2CZFA 4A21A 2VFGA 4ORIA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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 2ALD A;  1JRC A;  3I7S A;  2Q3O A;  3ZFH A;  2FPV A;  3W1M A;  3NZ1 A;  4JTL A;  4WXZ A;  4P2V A;  5CZS A;  1VZW A;  3MI6 A;  1G69 A;  2Y89 A;  1RZM A;  1VLI A;  4XWU A;  3QQ1 A;  4GUH A;  2DZP A;  1RPX A;  3W1N A;  2OT1 A;  4O53 A;  2NX9 A;  3L0G A;  4JTJ A;  3L5M A;  1HO4 A;  4O57 A;  3TML A;  2J9X A;  2WNZ A;  3UXD A;  3LX9 A;  4CCE A;  1TCD A;  2A5H A;  1TRI A;  3SFK A;  3ZWT A;  1WBJ A;  1W56 A;  3DXI A;  4QSH A;  3UQN A;  1YPI A;  3NR0 A;  2VEK A;  1I2P A;  2GVG A;  3DI1 A;  4JEQ A;  1F74 A;  1I8J A;  3LCF A;  2FTP A;  2YXG A;  3UWY A;  3B06 A;  4BR1 A;  1H7R A;  4AAJ A;  2CLF A;  1VR6 A;  4DPQ A;  3RLV A;  2NZL A;  2QUU A;  1YTE A;  3HB9 A;  2YYU A;  3P82 A;  3RLU A;  4GRS A;  4PC8 A;  3MP4 A;  2OX1 A;  3CHV A;  1F73 A;  1VHN A;  5CPL A;  2WNN A;  3GND A;  3CM4 A;  3CC1 A;  1LRT A;  2Y85 A;  2YZR A;  2FLI A;  4HNU A;  4RXF A;  3OVQ A;  4NXK A;  3E12 A;  5TQL A;  3L5A A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EGJ A;  4E3T A;  2XIB A;  1C93 A;  3S1X A;  5I5R A;  1DVJ A;  3BCF A;  4L9Z A;  1OFD A;  3WD4 A;  2YGY A;  4B5X A;  1QPR A;  1KRA C;  3LHW A;  2NUW A;  1HP4 A;  3BCJ A;  2VEG A;  4PFH A;  3GE7 A;  1H7P A;  3VDC A;  2EEX A;  3ARS A;  3HF3 A;  3QRH A;  5AN7 A;  4ZFC A;  3UER A;  2QUM A;  3BK0 A;  4U3A A;  1GVO A;  4AIO A;  1M65 A;  4JX6 A;  5BXP A;  3UR7 A;  3GG7 A;  3LHV A;  2OCZ A;  3WJZ A;  2QII A;  5E9A A;  2IKI A;  2XPK A;  3EOU A;  3N18 A;  1EQC A;  2G50 A;  3N4E A;  2RHG A;  3TLL A;  5FF2 A;  2Y5E A;  1OG6 A;  1IEQ A;  4KER A;  3EA2 A;  1E5N A;  4L6D A;  5AVN A;  1E9L A;  4FP1 A;  3S46 A;  3CH9 A;  3HA1 A;  1EJT C;  4Z2J A;  1C29 A;  1IXO A;  1TE6 A;  4IIS A;  1X8C A;  1XUZ A;  2EBN A;  4KFO A;  3U57 A;  3DGB A;  7ENL A;  3ARV A;  4AIS A;  2E67 A;  5MHB A;  4IL2 A;  1EP1 A;  1PTD A;  3W7D A;  3TQ0 A;  1MUM A;  3WK2 A;  1Q5M A;  5GNX A;  4IIB A;  2X30 A;  1PYM A;  4FAL A;  4ATL A;  4P8V A;  3DG3 A;  4JKK A;  1E1C B;  1KM1 A;  3M16 A;  4O1A A;  4QFU A;  3U4F A;  1HTI A;  5EYW A;  2Z6J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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