3TA9A

Beta-glucosidase a from the halothermophile h. orenii
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
449
structure length
448
Chain Sequence
AKIIFPEDFIWGAATSSYQIEGAFNEDGKGESIWDRFSHTPGKIENGDTGDIACDHYHLYREDIELMKEIGIRSYRFSTSWPRILPEGKGRVNQKGLDFYKRLVDNLLKANIRPMITLYHWDLPQALQDKGGWTNRDTAKYFAEYARLMFEEFNGLVDLWVTHNEPWVVAFEGHAFGNHAPGTKDFKTALQVAHHLLLSHGMAVDIFREEDLPGEIGITLNLTPAYPAGDSEKDVKAASLLDDYINAWFLSPVFKGSYPEELHHIYEQNLGAFTTQPGDMDIISRDIDFLGINYYSRMVVRHKPGDNLFNAEVVKMERPSTEMGWEIYPQGLYDILVRVNKEYTDKPLYITENGAAFDDKLTEEGKIHDEKRINYLGDHFKQAYKALKDGVPLRGYYVWSLMDNFEWAYGYSKRFGLIYVDYENGNRRFLKDSALWYREVIEKGQVEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Glycoside hydrolase family 1
publication title Expression, purification and preliminary crystallographic analysis of the recombinant (beta)-glucosidase (BglA) from the halothermophile Halothermothrix orenii
pubmed doi rcsb
source organism Halothermothrix orenii
total genus 162
structure length 448
sequence length 449
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ta9A00
1OIMA 3W38A 1CGVA 5CSYA 3GNRA 2ZUMA 3DHPA 4P7LA 4BQ3A 3WDJA 5JUVA 1F4HA 3BAJA 4PBGA 3B9EA 4AIEA 4WLCA 1V6YA 1V6UA 1NQ6A 3CZ8A 5D9NA 1E15A 3IJ8A 1D3CA 2Y8VA 3AIBA 4TVCA 1UD3A 1HJSA 2ZUVA 4MB4A 1H3GA 4AD3A 1VFUA 3OIHA 1US3A 1E6XM 3KWXA 4V28A 3S6TA 3TTQA 2YL8A 3W4RA 4P8UA 1VBRA 1UWTA 5IDIA 3W53A 4PSPA 2DH2A 3CLWA 3WQ4A 2NT1A 4UQDA 2EBNA 4E4PA 4LPCA 2Z1KA 2W92A 4YHEA 4KRTA 3HJEA 4TVUA 4JHOA 4ATLA 2CHNA 1PX3A 3VD3A 1KQYA 3TONA 2A3EA 2YDRA 2EPLX 4D6JA 1C3FA 1BF2A 4FF5A 3N12A 8A3HA 5EFFA 1E6ZA 2JF7A 1P6WA 3THCA 1J0IA 1O7AA 5A6MA 1KR1A 3AS2A 1PJ9A 4LQ1A 1E73M 3BGAA 5F7UA 1H49A 1VEOA 2FHBA 4PRWA 4QFUA 3APGA 1UHVA 2J7HA 2FHFA 2W66A 2VCCA 1QPKA 4PUEA 4P7RA 2QMJA 4JKMA 1WCGA 1SFSA 4RL3A 3RO8A 4AMCA 1MW0A 2PB1A 2PC8A 4Y7EA 4AYSA 1AQMA 2BVDA 4H8UA 3WH8A 2J79A 1UQYA 3MO4A 1XD1A 1KWGA 3ZJ8A 4M29A 2PBGA 1GUVA 5ABFA 2D3LA 4PEEA 1W9VA 1UR8A 3ALGA 1H11A 3D5HA 4TVDA 5BXSA 1PAMA 1V0MA 3VD4A 3VX1A 1E0VA 3VM7A 3SUTA 4V27A 4M82A 1JAEA 1JXKA 1CPUA 1M03A 2VTFA 1J0HA 4W7UA 2BXYA 4GI9A 3SCNA 1M7XA 2CITA 1B3ZA 4UQBA 1OT2A 3BAXA 1E70M 2VX6A 3WNKA 5CLWA 1CEOA 4XZWA 1RH9A 4HA3A 4QCEA 4AY1A 2BHZA 2TAAA 1XSIA 1B31A 2OWWA 5AYIA 2GJXB 3FN9A 2E40A 3BCFA 2NW0A 3VO0A 3U5UA 3OBAA 2E9BA 4WIWA 3FAXA 3QOMA 4MNKA 1UWIA 3WNNA 1DWAM 5CXPA 4IM4A 1QHOA 1QBAA 1NWTA 1SMAA 1V6XA 2WC3A 1TUXA 3CZLA 3NSMA 1UH2A 1NH6A 5BRPA 1TZ7A 1NOFA 2FGLA 3PTQA 3WH9A 2CNCA 4D6IA 5A95A 2G8ZA 3AHYA 2ZX8A 4GO8A 3HMCA 3POHA 4Q22A 1ZB5A 4W5ZA 1JNDA 4AD0A 3CZKA 1GVYA 2PBOA 3GBDA 1NOUA 1JXJA 3AXHA 1W91A 3VIHA 4K68A 1DTUA 1V0KA 3EDJA 1JZ6A 2VJXA 1QNPA 1B30A 2ZX9A 3PN8A 3BMVA 3SCPA 2XFFA 3MSDA 3KZSA 2WBKA 4D6HA 3E1F1 4H7VA 3EBVA 4J7RA 4GPNA 1W1TA 2G3NA 4AD1A 1H0IA 2F2HA 3WDRA 3K8MA 3N1AA 2J7CA 2V5CA 1QHPA 3OGRA 4CCDA 4U33A 5D9OA 1IV8A 5A2BA 2DT1A 4ACZB 2CBJA 3VIKA 1SR0A 1GQKA 1TA3B 5BXPA 5ABHA 1V0LA 1C93A 4PMYA 3WF4A 1WE5A 3II1A 1ZS2A 4GINA 4ML4A 4A3YA 2XIIA 5TD4A 2VI0A 3DYPA 2WBGA 4BQ5A 3MUZ1 2D1ZA 1UKOA 1E40A 3PZMA 4N0RA 3NUKA 2ZXQA 2CETA 3KEHA 4EAMA 1VAHA 4ZENA 1V08A 2XGIA 1KGXA 4CD7A 2W4XA 1UD2A 3VMOA 5CPSA 2WVTA 3PBGA 1J11A 3G6MA 3K4DA 3ARPA 1OM0A 4LYRA 1UZ4A 1WPCA 2QF8A 3WEMA 2UY5A 4B9ZA 1JL8A 3GXMA 2VURA 2CHOA 2YL6A 3A4WA 1E71M 1H41A 1KFWA 2YLAA 2PWGA 3VILA 3OG2A 1VB9A 1W9BM 1VEPA 2DPEA 5AC5A 3SEPA 3WBEA 4PUDA 2D3NA 1NP0A 1MQQA 2X1IA 1R85A 3NDYA 2UWFA 4D6GA 5A8QA 1UH4A 3VMNA 3WNLA 1BG9A 1JZ7A 3VIGA 3RDKA 2XGBA 3VUPA 2EPOA 2X8RA 2W67A 4PMXA 4LX4A 1UKPA 3AIUA 1ISYA 1DWGM 2D0FA 4X0NA 2VZUA 4YHGA 2XVLA 1XH1A 2GVYA 2XVGA 4AXNA 3RCNA 3ARSA 1OD0A 3BH4A 2O9OA 4UNIA 3UG3A 1W1VA 5IHSA 1UR1A 5D9MA 1V3KA 1JI1A 4H41A 3W29A 4BQ2A 1G5AA 1GCYA 1OSEA 4LYQA 3VOCA 2OSYA 4HZ7A 5IXEA 2ZX5A 1BGAA 1KB3A 1E4NA 4PCSA 1TCMA 2VQTA 3SUSA 3AJ7A 2XM2A 2WMIB 3VD9A 3LPPA 1XCWA 4HMDA 2HISA 3VIJA 1KXQA 3CTTA 3WQVA 2DIJA 3GM8A 2YA1A 3WUGA 4KRUA 3OA5A 2QLYA 3BCDA 2D2OA 2J47A 1V6WA 1RD6A 2VZSA 1J18A 7TAAA 1AQ0A 3BAYA 3ZR5A 2Y8KA 4UOJA 5DO8A 3WMSA 1XH2A 2XPKA 3AXXA 1HJVA 4PYSA 2W91A 2VZVA 2WHLA 1EO7A 3VPLA 2JE8A 2W61A 4U5KA 3GYCA 5GNXA 4EANA 2VZOA 1EH9A 5A69A 3VNYA 1E1EA 1GOIA 1BVNP 3UEQA 1E9LA 3WDHA 1PEZA 2O9PA 1CXEA 2OSWA 4W8BA 1WDQA 2EXOA 3NSXA 1UA7A 3ZOAA 5EB8A 3SCUA 3DC0A 2Y4SA 1E5JA 2Y5EA 5JIWA 4J3UA 1K9EA 1HKMA 1HJQA 1NARA 3A6OA 4MNJA 3PZOA 5D4YA 4UFIA 2BNJA 3PHAA 3N04A 2CPUA 1MFVA 4EK7A 3T0BA 2D24A 3F5JA 4MB1A 1MVYA 3WEZA 1B9ZA 2JF6A 3BAWA 3AYSA 2J8GA 2VVSA 1GQLA 3WENA 2J7EA 3ARZA 1WO2A 7A3HA 3T2OA 1RP8A 1H1NA 4JAWA 3SUWA 1I75A 1BHGA 2BY0A 1H5VA 4ZE5A 1Q6GA 2OWXA 1E6PA 1LJYA 2YBUA 3RJXA 4MDOA 2WMHA 4WSJA 2VCAA 1JAKA 1OIFA 3LMYA 5HXMA 1WNOA 1FA2A 3W24A 2J7FA 3CO4A 3W6LA 1OINA 3W25A 3A4XA 1DHKA 3GZAA 2ZX7A 1G0CA 1CXHA 3AROA 1OD8A 3WL0A 4PSRA 4M80A 3EYPA 2C8NA 4NZCA 4U2ZA 1X6NA 3SIMA 3T09A 5CPTA 2WMFA 2XWEA 2BHUA 2WLZA 1V3MA 4GI8A 1EHNA 2PF0A 1C8XA 2C7FA 3OGSA 2XFRA 3KE0A 2WHJA 2WHMA 2AAAA 1C92A 2RGLA 3SCRA 1GQJA 4MJ2A 1KBKA 3K4AA 3VGHA 2VT0A 3CUJA 5HBFA 1JZ2A 3ARTA 3IAQA 1XC6A 2CBUA 1A3HA 2XJ7A 4GQQA 2A3AA 3IANA 4W87A 3VM5A 4CD8A 3T2PA 3CHCA 4JFUA 2FHCA 2EPKX 4AEFA 3NYDA 2WHKA 5FD0A 1XRVA 1VENA 5EBAA 1RP9A 4RE4A 4BCEA 1JI2A 3WDIA 5A6SA 1JF5A 1KQZA 1V02E 4EKJA 5M5DA 3AYRA 5C8BB 1C8QA 2AOSA 4LYPA 2WMGA 4CVWA 1HKKA 1X6LA 3CMJA 1ESWA 1HJUA 3UERA 2W5FA 1HVQA 4F79A 3ZT7A 1DP0A 2DSWA 3AS1A 1EXPA 4UZUA 1ZBVA 1PZ3A 2ZUNA 2DGAA 3CUFA 3VKKA 4HTYA 1PPIA 5I77A 1UD8A 4W5UA 1OWQA 1UOKA 6TAAA 3MUAA 2XG9A 3WF0A 3WQ5A 1HP5A 4URIA 2D22A 1HIZA 1MW2A 1MQPA 4JFWA 3F4VA 4AC1X 2VMFA 5A6JA 1WAWA 3OLEA 1WZAA 3ZJ6A 4UFKA 7CGTA 4JCMA 3WBAA 2WSPA 2ZWYA 2DEPA 4CD4A 1UR0A 4PTMA 3WH5A 1IZJA 1YQ2A 1UWRA 1KBBA 4HP5A 2E9LA 4UR9A 2VNCA 4CU8A 4PTWA 1ZJAA 4CU7A 5A6BA 3CZEA 1US2A 2OSXA 3N18A 1CGTA 3ARUA 3WMCA 2QPUA 2FGZA 1OB0A 2O9RA 4BS0A 1GW1A 1MXDA 4JL1A 3CMGA 3RM8A 2J7DA 1JGIA 2Q8XA 4HOWA 4YN5A 4CCCA 1GQIA 4TTUA 1GJWA 2PWFA 3WQ6A 4OBSA 2A3BA 3AMCA 2FH6A 3CZJA 4WKFA 4AZHA 2J25A 4TX6A 4W86A 4W84A 1GOMA 4OBRA 1HX0A 3ZSTA 3GH7A 5JBEA 1HNYA 4QDMA 2J62A 3L2LA 4J28A 5CPQA 1QOXA 3WF3A 4S3KA 4HZ8A 1XYFA 1JYXA 4CN4A 4W8AA 1C8YA 1M04A 1ISZA 4IISA 4PTVA 3AQUA 3WDPP 2YKKA 1QW8A 4LXFA 2WMJA 1Z32X 4M24A 1PIGA 1QNSA 4J3WA 2YJQA 4DWSB 1K9FA 3ECQA 4UFLA 1HN1A 3BMWA 3MMWA 2VZTA 1ZBWA 1W2PA 1E4LA 4J27A 3B9DA 4JFVA 4ATWA 3UG5A 2HVMA 2D23A 1FP9A 3AS3A 4GXPA 1FFRA 2E3ZA 3GTNA 4KGJA 1LWJA 5CQ1A 5FOOA 5D8WA 3AISA 1G9HA 1QI3A 1G94A 5CJ5A 4JKKA 2GJXA 3SCQA 5I2UA 5HPOA 4A4AA 1VRXA 1MXGA 1G1YA 4F9DA 1QI5A 3L2MA 4KGLA 3UCQA 2QPSA 2OYLA 1QW9A 5FKYA 1W3JA 4X9YA 2EQDA 3AI0A 4UOQA 4TOQA 5BWFA 5EFDA 4MPKA 5FCZA 1J10A 4F8XA 4HZ6A 1W9XA 4AZCA 1FFQA 1C7SA 4P7QA 4AZCB 4J3VA 1VIWA 4QP0A 1ECEA 2G4FA 5I5RA 3A47A 1Q6FA 3WD3A 3AS0A 5A1AA 1H0GA 4HPHA 2XYLA 2XSBA 3NSNA 3WQ8A 5A6BD 3VINA 2OWCA 2WKLA 4WKAA 4WSKA 1AVAA 4V2XA 2WCSA 2W63A 3WUBA 3BLPX 2G3IA 4OUEA 5DF0A 4D6DA 1JDCA 2VUYA 4OZOA 3L4ZA 5HNNA 3GDBA 1FH8A 1HVXA 2DSZA 5LA1A 2PWHA 2J77A 4NRSA 5A2AA 5I78A 2WW5A 1QI2A 4DM1A 2ZXDA 4ACZA 4UFHA 1AQHA 4AZ5A 1UD6A 2FH8A 1TA3A 2W62A 4UFJA 4MTVA 4WJXA 1EDGA 5HPCA 3WDQA 2WSKA 1HP4A 3M6DA 5BYWA 2E4TA 3O2LA 2UY2A 3AICA 1OBAA 3BLKA 1WDSA 3EMCA 3K1DA 1B1YA 1M53A 1CDGA 3AZRA 1BAGA 3WMBA 3SCWA 3EMQA 1JFXA 1TR1A 2E0PA 3MUIA 1J9YA 1JD9A 1U33A 4AISA 2JEPA 1UWSA 2D0GA 3CIVA 3KL0A 4W7WA 4Z2IA 1GOWA 5KZ6A 3W82A 3RIKA 4E8DA 5DT5A 1O6IA 1FH7A 4D1JA 3FHAA 1LQ0A 4ACYA 2V3DA 4A3HA 2JEQA 3GXFA 3FY1A 1GONA 4HU0A 4AW7A 2VVNA 3O6AA 5IFTA 2VX7A 4QAWA 3WKZA 1J01A 2J78A 3MS8A 1GVIA 3PTMA 1E5NA 1XH0A 4WF7A 1KXHA 1XSKA 1V03A 1UWUA 1HT6A 5E09A 1UQZA 5I24A 1NWSA 1UD4A 2GK1A 4CCEA 2GK1B 4JHZA 4Z2LA 3PZIA 2GDVA 2BV9A 2XFYA 4IPNB 1NWUA 3I3EA 1QBBA 3WFZA 3ZIZA 4B3LA 1JD7A 2EJ1A 1V3IA 1ZBKA 2WC4A 4MB5A 2OYMA 3DYOA 1JZ4A 1QI0A 2CKRA 1ODZA 3POCA 2YA0A 4XB3A 3VX0A 1BYAA 1CBGA 3ZR6A 3T0DA 5GQBA 3MSGA 4MDPA 4MAZA 2XSAA 3PZTA 1EOKA 1JZ3A 1A47A 1CXFA 2BS9A 1AMYA 1KGUA 4W93A 5BRQA 1GNXA 4CN1A 4NF7A 2WMIA 3RJYA 4PCTA 1VBUA 1CNVA 1WDPA 4DUWA 2ZWZA 2YDQA 1Q6CA 4UQEA 1TE1A 5LA2A 5GPRA 1UR2A 2Y2WA 3N13A 5E6YA 4OIFA 4ATDA 2ZUSA 2WB5A 3RM4A 1E56A 2V38A 1JYWA 3BXWA 2CXGA 2J7GA 3PZQA 4M81A 1XV8A 4P7OA 3VDHA 4MNMA 1FHLA 1E3ZA 1RPKA 1K9DA 4P7NA 3VGFA 3CH9A 4AWEA 1MYRA 3ZJKA 3NIYA 3ZT5A 5A2CA 4M8UA 2YLLA 4AIUA 1IZKA 3N15A 1LL4A 3PZ9A 2V3EA 3W6MA 3QHNA 3G6LA 4J3TA 4H8HA 1R7AA 4LGXA 3ARWA 1JG9A 1OGBA 3BSGA 4C7DA 1MW1A 3AIVA 1XGZA 1V02A 4R5EA 3OLIA 1J0ZA 1D2KA 3PZNA 1XCXA 5ABEA 2GDUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OIM A;  3W38 A;  1CGV A;  5CSY A;  3GNR A;  2ZUM A;  3DHP A;  4P7L A;  4BQ3 A;  3WDJ A;  5JUV A;  1F4H A;  3BAJ A;  4PBG A;  3B9E A;  4AIE A;  4WLC A;  1V6Y A;  1V6U A;  1NQ6 A;  3CZ8 A;  5D9N A;  1E15 A;  3IJ8 A;  1D3C A;  2Y8V A;  3AIB A;  4TVC A;  1UD3 A;  1HJS A;  2ZUV A;  4MB4 A;  1H3G A;  4AD3 A;  1VFU A;  3OIH A;  1US3 A;  1E6X M;  3KWX A;  4V28 A;  3S6T A;  3TTQ A;  2YL8 A;  3W4R A;  4P8U A;  1VBR A;  1UWT A;  5IDI A;  3W53 A;  4PSP A;  2DH2 A;  3CLW A;  3WQ4 A;  2NT1 A;  4UQD A;  2EBN A;  4E4P A;  4LPC A;  2Z1K A;  2W92 A;  4YHE A;  4KRT A;  3HJE A;  4TVU A;  4JHO A;  4ATL A;  2CHN A;  1PX3 A;  3VD3 A;  1KQY A;  3TON A;  2A3E A;  2YDR A;  2EPL X;  4D6J A;  1C3F A;  1BF2 A;  4FF5 A;  3N12 A;  8A3H A;  5EFF A;  1E6Z A;  2JF7 A;  1P6W A;  3THC A;  1J0I A;  1O7A A;  5A6M A;  1KR1 A;  3AS2 A;  1PJ9 A;  4LQ1 A;  1E73 M;  3BGA A;  5F7U A;  1H49 A;  1VEO A;  2FHB A;  4PRW A;  4QFU A;  3APG A;  1UHV A;  2J7H A;  2FHF A;  2W66 A;  2VCC A;  1QPK A;  4PUE A;  4P7R A;  2QMJ A;  4JKM A;  1WCG A;  1SFS A;  4RL3 A;  3RO8 A;  4AMC A;  1MW0 A;  2PB1 A;  2PC8 A;  4Y7E A;  4AYS A;  1AQM A;  2BVD A;  4H8U A;  3WH8 A;  2J79 A;  1UQY A;  3MO4 A;  1XD1 A;  1KWG A;  3ZJ8 A;  4M29 A;  2PBG A;  1GUV A;  5ABF A;  2D3L A;  4PEE A;  1W9V A;  1UR8 A;  3ALG A;  1H11 A;  3D5H A;  4TVD A;  5BXS A;  1PAM A;  1V0M A;  3VD4 A;  3VX1 A;  1E0V A;  3VM7 A;  3SUT A;  4V27 A;  4M82 A;  1JAE A;  1JXK A;  1CPU A;  1M03 A;  2VTF A;  1J0H A;  4W7U A;  2BXY A;  4GI9 A;  3SCN A;  1M7X A;  2CIT A;  1B3Z A;  4UQB A;  1OT2 A;  3BAX A;  1E70 M;  2VX6 A;  3WNK A;  5CLW A;  1CEO A;  4XZW A;  1RH9 A;  4HA3 A;  4QCE A;  4AY1 A;  2BHZ A;  2TAA A;  1XSI A;  1B31 A;  2OWW A;  5AYI A;  2GJX B;  3FN9 A;  2E40 A;  3BCF A;  2NW0 A;  3VO0 A;  3U5U A;  3OBA A;  2E9B A;  4WIW A;  3FAX A;  3QOM A;  4MNK A;  1UWI A;  3WNN A;  1DWA M;  5CXP A;  4IM4 A;  1QHO A;  1QBA A;  1NWT A;  1SMA A;  1V6X A;  2WC3 A;  1TUX A;  3CZL A;  3NSM A;  1UH2 A;  1NH6 A;  5BRP A;  1TZ7 A;  1NOF A;  2FGL A;  3PTQ A;  3WH9 A;  2CNC A;  4D6I A;  5A95 A;  2G8Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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