3TNOA

1.65 angstrom resolution crystal structure of transaldolase b (tala) from francisella tularensis in covalent complex with sedoheptulose-7-phosphate
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
QKSVLEQLKQVTMVVADTGDFELIKKYKPVDATTNPSLILKAVKEQKYSNLVAETISKVKANNPDLNSDDLVKEIAIEILVSFGIKILDVIEGKVSSEVDARVSFNSATTIDYAKRIIARYESNGIPKDRVLIKIAATWEGIKAAKLLQKEGINCNLTLIFDKAQAKACAEAGVYLVSPFVGRITDWQMQQNNLKTFPAIADDDGVNSVKAIYKLYKSHGFKTIVMGASFRNVEQVIALAGCDALTISPVLLEELKNRDEHLEVKLTKNDDVVTQSPQISEADFRWLMNENAMATHKLAEGIRLFTKDTIELENIIKQNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase
publication title Adherence to Burgi-Dunitz stereochemical principles requires significant structural rearrangements in Schiff-base formation: insights from transaldolase complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 144
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tnoA00
3HPZA 1I4NA 4ORMA 2ZRWA 3PBVA 4AEOA 3EXSA 1SFJA 5KITA 4JDYA 4FXSA 2BSLA 5IBXC 1Q6OA 2FPYA 1JULA 3SJ3A 3HG3A 4JTJA 3MHGA 4Z1DA 4MJZA 4A29A 2QDGA 1JCXA 4NUWA 4GWEA 5K7JA 3L2IA 4WY0A 3P82A 3EWYA 1ZENA 1Z41A 2ISVA 3EX1A 3LV6A 4LWWA 3G0UA 3M5YA 4UMAA 3ZFHA 1YDNA 1T99A 1KM5A 3RLVA 3GK0A 2ZRVA 5HR6A 3HBLA 3OVPA 2GJLA 2XN1A 3BARA 5AYXA 1WOBA 4AWUA 1QMLA 1LTDA 1NSJA 3W2KA 1GVFA 4NNAA 5D2YA 2GVJA 4R33A 1W0MA 1W3IA 3BG5A 1W37A 3IRDA 4IXHA 3I7RA 4JTUA 4IX0A 1VHNA 1SW0A 5DCDA 5HWNA 4UTKA 3TNOA 4UTMA 1CI1A 1Q6LA 1R30A 3L0NA 4MFDA 3DHDA 5HR7A 3L9CA 2ISWA 3TV8A 3NQ7A 3GXTA 5AHFA 3MHUA 2GQ8A 2V81A 3NL2A 5LNVA 4CQ9A 1YDVA 5HJLA 2HSAA 1ZALA 4O19A 2A21A 4B5NA 4NJIA 1R2SA 5BRBA 2P0OA 3USBA 2OCZA 4LY8A 3EWWA 1VCFA 1LDCA 4FNUA 1AL7A 1XBVA 1A50A 1I2QA 2E5CA 2VEIA 1JCNA 4EIVA 1JCJA 5I3KA 1F6KA 1KM4A 3G1XA 1OHLA 4RZ5A 2TYSA 1ZAJA 5AHMA 1X8FA 2QCGA 2ZQ0A 5KMYA 3P74A 3E0IA 1S3HA 3WJSA 4ORIA 4PL1A 1FWNA 1KFBA 4BWLC 4CNOA 3EX6A 2X1UA 3I6RA 3DFNA 5I3FA 1OFQA 3TFCA 5KZEA 3PM6A 5DCEA 2GVLA 5EA9A 1RPXA 4ADUA 3BG9A 4ALDA 2E77A 3PBWA 4D2JA 3GX9A 2F7FA 2V5BA 3MJYA 3LCXA 4FO4A 3PBYA 1EWEA 3STCA 3W7EA 2Y7EA 4OV9A 3S5OA 4JTSA 4IX2A 2QCDA 4JR5A 1IF2A 2WJZA 3ATYA 5CZSA 5AYZA 1X7FA 3TR2A 4FNTA 1XI3A 1DV7A 1VH7A 4UTTA 1KM3A 3TIMA 2RDTA 3ZWSA 3HGSA 2A7RA 1HO4A 1P4CA 3KVJA 4E38A 3P60A 4OHQA 2EPHA 1T96A 3BLIA 1G6CA 1XUZA 1YXCA 4HSOA 2TRSA 2GVGA 2Q8ZA 2CLEA 4S1FA 1W5QA 5CG7A 5K9CA 3M1ZA 3WK2A 4Y96A 3NPVA 5KZDA 1TV8A 3T44A 1XKYA 1G7VA 4QITA 4AF0B 3PR2A 1Y0EA 3GAKA 3E9AA 1QPRA 1Q6RA 4M6PA 4DO6A 3TQKA 4LVFA 3CM4A 1G4SA 3W7DA 4AHQA 3HO8A 3P7YA 5AC6A 3TMQA 2E6AA 5AHEA 3G3DA 4FIRA 4JIQA 2NLIA 3BLFA 4E0CA 2I1OA 4O52A 3SIZA 1W5NA 3UXDA 2QUUA 3TQVA 1C29A 2C3ZA 3N9RA 3QH2A 4X22A 1O5KA 3L21A 2PCQA 3T7VA 1R47A 2VFIA 3LM7A 1VYPX 1OK4A 1KFJA 1WBJA 3A21A 2NXGA 1QWGA 2OZ0A 3QC3A 4N9DA 2O7SA 3INPA 1QCWA 4RR4A 3O15A 2VC6A 2VENA 5D02A 3G22A 3EB2A 2CZ5A 3MMTA 4YXGA 4MVAA 3O16A 4DBDA 4GXMA 5CPNA 4NX5A 4C1LA 3C2RA 3P8JA 1MO0A 2QUTA 3HOJA 1YPIA 4Y6GA 1VHCA 4JIPA 3EWZA 5DLCA 3O06A 1GJPA 2A1YA 3CQ0A 3TK7A 3W2LA 4Q33A 4RX0A 3STGA 3VI2A 5E0KA 3T4CA 2A2IA 4NXKA 4NU7A 5C55A 3TMLA 1OFDA 2QEZA 2YX0A 2Y88A 2DZUA 1JCLA 4JNMA 5SWUA 5GVJA 3RF9A 1KBIA 3W23A 3W07A 2G97A 3S0CA 3FIGA 4IMGA 3SR7A 3DFQA 3UWWA 3W88A 4PH6A 3CTLA 3LRLA 3G1YA 4JN6A 1L6SA 2YDAA 2C18A 4PCFA 1G67A 2FQIA 3LHUA 5DN1A 1FUYA 2OJPA 1FDJA 3W85A 4XKYB 1TPFA 2QAFA 1P0NA 4TR9A 4QSHA 7TIMA 4YL2A 1OJXA 3NOEA 4PODA 3BGGA 2X30A 1NAL1 2VFEA 4ONVA 4DF2A 3PG8A 3FS2A 1OF6A 2ATSA 3C56A 5TIMA 3LXBA 4BF9A 3VE7A 3M43A 4AMAA 2ZA1A 2WSYA 1GG1A 3HQ1A 3R89A 3YPIA 1V5XA 3LOTA 3P84A 1NEYA 1DQXA 1O60A 4RXFA 1P1XA 5C6MA 3CIXA 1SO6A 4JDBA 2A85A 2QCMA 3MWAA 3DKJA 3U2OA 3BG3A 1TMHA 1TO3A 4N4PA 4HHPA 5AFDA 2IQTA 3CEPA 3UYCA 1TPB1 4MY8A 3GIYA 2ZTKA 1DHPA 1PS9A 2W0UA 4M6QA 1G4PA 2VFDA 2ZRUA 1F74A 1XBYA 3MUXA 2YGYA 3O8AA 4JYFA 4JTFA 4XZ9A 5G2IA 4KWWA 1AW1A 3G1SA 4M7TA 4YCOA 3CEUA 1XBZA 1W5PA 4UR7A 3NAVA 3TROA 5AB3A 4RV8A 3KVLA 5LNSA 4UNKA 4Z0SA 1H61A 3QPZA 3IIPA 1KW1A 3LHTA 1SZNA 5KSWA 4CNNA 1HUVA 1TCDA 3CPRA 3W7KA 4IMEA 1LCOA 2V5LA 3KRUA 1PCKA 4GC4A 4ZVJA 3RNDA 1ICSA 5K4ZA 3C61A 4KFOA 4MFEA 1H5YA 3NYZA 3PB0A 3IEBA 4JTHA 5IM51 1F73A 1TRIA 5HWMA 3IVTA 3QPYA 1TPWA 4NNCA 5AHLA 2C13A 2ABBA 4Y90A 4DPPA 2ZZ7A 1LZOA 3A23A 3P81A 5D2VA 5LNUA 4ZZ9A 3O6DA 1OX4A 3PSWA 3TCEA 2ZRYA 5AN7A 3V1PA 1WBHA 4NZFA 2A4AA 4R34A 3G8EA 1UJPA 1AMKA 2V30A 3P5ZA 3HG4A 3NO5A 5D04C 1OG0A 4WZHA 4QJ1A 4DO5A 4UTUA 4QM1A 4NT0A 3W7HA 2DORA 4WOQA 4UCGA 2BTMA 3D0CA 3M9YA 1LP6A 4HNNA 1HL2A 4OQVA 3S1WA 2HS8A 2CLFA 3W1MA 3VFLA 1C9DA 5I3HA 3ABOA 4ZQMA 2Q8LA 3LX9A 3HG2A 3O63A 4O28A 4UIOA 1TPDA 3N2XA 4I7VA 4LT9A 5LZLA 4K8EA 1H50A 3LI1A 3W2NA 4LS0A 1IXNA 1H7OA 3VNDA 2Y85A 1EP2A 1A5SA 1LLZA 5FF0A 1ZAHA 1PIIA 2PURA 5BNKA 5FESA 3LHZA 1F05A 5LGZA 1FCBA 1DJNA 2WQPA 3G1VA 2ZZ3A 3QM3A 3C6CA 4IGHA 4LW7A 1EIXA 2Z1BA 1TQJA 4OGZA 5G4EA 3QW4B 3TQ0A 4MLRA 4AXKA 3TSBA 2WOQA 1NF7A 4K7YA 3P8IA 1R2TA 3UWUA 1MEIA 2Z6IA 2X1TA 5C5YA 4A3UA 1Q6QA 1B4KA 1GVSA 4DF1A 3PULA 4HPXA 3T55A 2CLHA 1K7EA 3NQGA 1JCMP 1YXDA 3W7MA 4BFAA 3W1LA 1TQXA 1QOQA 2G5WA 1X1ZA 3TUUA 5DY2A 3U6WA 5F2GA 1T8XA 5HINA 1F2JA 4UUIA 4JTEA 5L9FA 5F1UA 1PV8A 2B7PA 1OVDA 1VCGA 2YCEA 4GE8A 4UTWA 1W31A 2E68A 3R13A 4LVGA 1FDZA 1KA9F 3BW4A 3B0VC 1SQ7A 2CFFA 3DFTA 4M6VA 4MKNA 4WJEA 4FNQA 3M5VA 4O12A 1H7NA 1WDWA 4AB4A 1L9WA 4L4LA 2DZSA 1FCVA 3NPWA 4AHOA 1H1YA 4R7JA 4Z1AA 2BLEA 1UASA 4FX8A 4KFPA 3W1UA 4MZYA 2Z6JA 4NJGA 1VZWA 1I2NA 1IXPA 1TRDA 4BI7A 4GJ1A 4N02A 2FJKA 1TIMA 3EXTA 5F2IA 3G1AA 5BMWA 4NX0A 5HUOA 1BKSA 3BLEA 1FY6A 3W3OA 4CQAA 1B57A 5D33A 3TC6A 2Y70A 2EF9A 5DCBA 5F1VA 1R2RA 1RQHA 1TPC1 4K8HA 3MI2A 3WK3A 1KFCA 3LCIA 4ZQNA 2CWNA 2ZFAA 1K3UA 4ADSA 1NFBA 1PL9A 5LSMA 4HPJA 4UTHA 3A5VA 1AW5A 5EKYA 3HJZA 1QR7A 1SW3A 4FX6M 1M5WA 4O1DA 1TPEA 4MPQA 3GXNA 3NNTA 2OX1A 3A24A 4MUZA 3LI0A 5HMSA 4NVTA 3HF3A 3DZ1A 1IIGA 1PHWA 2NUWA 5U7SA 1BWLA 1KV8A 1VLIA 4MOZA 1UBSA 3UPBA 4O4VA 3GNNA 3W1XA 4FB7A 3NQ8A 1VJIA 2E5BA 5EBUA 1NF0A 2QDHA 3ABSA 1KFKA 3TJXA 3NL5A 4HSNA 1SO3A 5DXYA 4BI5A 4P61A 3TW6A 1OK6A 3GDRA 4JX5A 2NUYA 3OVQA 4JXCA 2VOMA 1I2OA 2C1HA 3BO9A 1K7XA 2GQAA 5C54A 2FDSA 3STEA 3BW3A 1BTMA 5A5WA 5FF7A 3RFAA 3EX3A 2HS6A 3QMTA 1UB3A 3O6YX 1H62A 2EAWA 3QZEA 5K2ZA 1K8YA 1SUXA 4O1BA 1BEUA 4FF7A 3BW2A 3NZ1A 4XWUA 3MI3A 4LVAA 4LV4A 3C2FA 1ICQA 2F84A 5F4XA 4GUGA 1FWWA 3EXRA 1GQNA 3GDTA 1R46A 3S1VA 1LRTA 5T26A 2CZEA 4LU0A 1QDSA 2B7NA 1VS1A 5G2HA 2FPTA 4XBKA 4DF0A 4CNPA 5K4XA 3LCFA 2ZZ1A 2RDUA 5G1YA 1RD5A 2E6FA 1MSSA 1QAPA 1G69A 1KM6A 3SZ8A 4JY8A 3TC7A 3NQ2A 2CZDA 3O05A 3FYPA 4MZ8A 1G7UA 3NPUA 1I45A 1OFAA 1LLWA 2CW6A 1ME8A 3S1XA 3DFOA 4M19A 5D05A 2C0AA 3C0JA 4K6AA 1M6JA 1QFEA 3EWXA 3DAQA 4IUOA 4EF8A 3L67A 3ZWTA 3PY2A 2C6QA 4WUIA 1BWKA 1XM3A 1SSGA 3M5XA 1TTPA 1QNVA 4KFNA 5L6UA 1W3TA 2DJLA 1QPQA 4JTTA 3W7IA 3TA6A 1VPXA 4GRSA 4WXZA 4EVZA 3NDOA 3ZS4A 3WJXA 2ZZ5A 1GPWA 1DOSA 1SO4A 1JUBA 3W7OA 3ELFA 4KKXA 3TW7A 3WJZA 4FX7A 3Q37A 4MYXA 1H60A 3GR8A 1M7OA 1H7WA 4QAIA 3UQNA 4K39A 4BR1A 3W7JA 2YZRA 3G1HA 1RQEA 3I7QA 5D2WA 1X1OA 2Y7FA 4ZMGA 4MJMA 3QEZA 1TSIA 1SFLA 3NXFA 3HGOA 3U8GA 5E1QA 4LNYA 1EPXA 5EY5A 3S42A 4LRTA 3G3MA 2H6RA 4RZ6A 3HPXA 2VEMA 3CHVA 5LHFA 1W54A 4IMFA 1SO5A 2ISSA 2ZTJA 3TKFA 4TO8A 4H6KA 3M6YA 1FBAA 2NUXA 2QJGA 1F76A 1ZY9A 3QW3A 1XFBA 3E96A 3EWUA 5K9XA 1RVGA 2DJXA 4RJEA 1E51A 2O7QA 2ZA3A 5G4WA 2QCFA 1SSDA 2YYUA 3F4WA 5D03A 1YTKA 4HNUA 3OBKA 1GYLA 3G0SA 4WXYA 1LBMA 3UZ5A 1GVOA 4N6FA 2J9XA 3S5YA 3MI6A 4A2SA 3UZJA 2CLKA 3W1AA 3S8HA 4Y8FA 3NQVA 4LUJA 4EF9A 4O1CA 3DI0A 2R94A 1TTIA 4S2BA 5EMUA 2YYTA 3VKJA 1J4EA 3NGJA 1N8FA 3LHVA 4UFKA 3C2EA 4XUGA 5E93A 3OIXA 1OFBA 3CU2A 1PHQA 1I8JA 5G2WA 3MBFA 2RKXA 2VXNA 4A2RA 4LUIA 3B8DA 3GDLA 3F4NA 3N73A 3L66A 3PWAA 3P5YA 4E2DA 4ICNA 4XTDA 1VYSX 4O13A 2C16A 2DZPA 3B03A 6ALDA 2FIQA 2WSRA 2VEKA 4AH7A 3Q94A 2H90A 1KBJA 1HG3A 2J27A 3WFAA 1VC4A 5J5DA 3FKKA 1DVJA 2ALDA 1WOAA 1YTEA 3W84A 5CPLA 2CLOA 4X9SA 5F2LA 3BV4A 4RCXA 1OFRA 1LOQA 2H8ZA 4CLMA 2OMAA 4DQWA 2WNNA 4O4WA 3SGUA 1DJQA 3W7PA 2P10A 1XCFA 1HO1A 4IQLA 1JVNA 3TFXA 3UXAA 4UFJA 4GUHA 3W22A 3NR0A 2X1SA 2A6LA 2BWGA 1LOLA 2X1RA 1LROA 4JD4A 2V2DA 3KRZA 4AF0A 5ABTA 5BOOA 2A5HA 1IGSA 3O6CA 4O17A 2J6XA 3SY5A 1YDOA 3O07A 5CSRA 2ZA2A 2C19A 1KV5A 3THAA 3LTYA 1N55A 1PE1A 1WAUA 3QQ0A 4E2BA 1K03A 3PG9A 3UY8A 3OG3A 2ZCGA 3LRKA 4J9JA 3LHWA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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