3TPQA

Crystal structure of wild-type mal rpel domain in complex with five g-actins
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
371
structure length
346
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVVGDEAQSKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein/transcription
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Sensing actin dynamics: structural basis for G-actin-sensitive nuclear import of MAL
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 120
structure length 346
sequence length 371
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3tpqA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3tpqA03
3CJ1A 5BPNA 1HLUA 3JS6A 2I7PA 4IJAA 3VF6A 2Q0RA 4ISGA 3WEEA 2W41A 4CJ7A 4RWTA 2UYTA 2D4WA 3MK6A 3SMSA 2GELA 3MDQA 2CH5A 4BGBA 3FZFA 3P4IA 1SAZA 4M7XA 5LY3A 3HSCA 4DCHA 1D4XA 2P9IB 1NBWA 4H0PA 2YJEA 3D2FA 3VENA 3WXJA 4BR5A 4JHDA 3UE5A 3C0BA 1QZ6A 4H5WA 1NGDA 3RSEA 4FPBA 3ZETB 3ZX0A 3ULEB 5AQQA 1KXPA 3WXIA 4BR4A 1BOTO 4M7YA 2P9LA 5LJWA 3WUHA 3LDQA 2P9UA 3C7NB 1DGKN 4GY2B 4CZLA 2CGKA 4A61A 3EO3A 4LC9B 1NMDA 2D0PA 1RFQA 4IO8A 1OKJA 2E1YA 1GLBG 1YAGA 5AQWA 3VEXA 1QHAA 1V4SA 4EIAA 3GE1A 1MWMA 5AR0A 3QBWA 4PKIA 4BR9A 2F9TA 3FZHA 4I6MA 3BP8A 4FOIA 2PBDA 4IXCA 3A5MC 2W40A 3IDHA 4CZFA 4H0XB 3WEEB 2QXLA 2FLOA 3CJCA 1Q18A 3R6MA 4EHUA 3QICA 1BA0A 3LDOA 3AAQA 1ATSA 1Z6RA 4H03B 1EQYA 1NGGA 4BRHA 3MN5A 4BRMA 1T6DA 2FF6A 1NGIA 5AQJA 2DPNA 4FPAA 3FZMA 3FZLA 2A6AA 3QFPA 3QB0A 4Z94A 2E88A 4XH1A 1HJOA 3RSEB 2Q31A 4H0VB 2NZTA 1HKGA 1GLEG 4H5TA 1BA1A 1E4GT 1JCFA 5ELZA 4Y0WA 3IFRA 2P9LB 2IIRA 5AQOA 3VGKA 1X3NA 4JN4A 2P9UB 3ENOA 3ID8A 3DWLA 2GEMA 3KZBA 4NO7A 5AFUA 3H3NO 3UKUB 4BR2A 3VGMA 5AQPA 1LOTB 4BRFA 2A41A 2F9WA 2Q1NA 1LCUA 1C0GA 4I6MB 5AQZA 3O8MA 5E26A 1ZBSA 1QQOA 3ATVA 2QWLA 4B1UB 3VESA 4FWKA 5JICA 3WXLA 1NM1A 2CH6A 3M1FA 2CGJA 4C23A 3VEVA 5CE3A 4CI6A 5AQVA 3SJHA 1KAZA 3BF3A 2QW9A 4PKHA 5AQLA 1BO5O 3B8AX 1DKGD 2FSKA 5BRHA 5ADXA 2QM1A 1QQNA 4FWPA 1BG3A 2ASOA 4DB3A 5TKYA 2ASMA 1GLJO 2P9NA 1WUAA 3EZWA 2NRHA 4FWOA 2I7NA 1GLDG 3DXMA 3ZEUA 4WYBA 1T6CA 3ENHA 3U9ZA 2P9KB 3HBTA 1ESVA 4FSVA 2AP1A 3SK3A 5AQRA 1HPMA 1NGHA 1KAXA 1BU6O 3LL3A 3D7EO 2AA4A 1NGCA 2ZGYA 4EFHA 3BEXA 2P9PA 4HWIA 1K8KA 4CZEA 4KBOA 4B1VA 2VCPA 4BGAA 3CHWA 5AQXA 5AQUA 2P9SB 3U9DA 3DXKA 3BF1A 4FWRA 1HUXA 4FWSA 3GOIA 3L0QA 3O5BA 3VEZA 3MN9A 5EVZA 5BN9A 3O80A 2GWKA 3EL2A 4O5FA 4XEIA 4JD2B 3LDPA 4FWLA 3CJ7A 4M63C 3CETA 2ITMA 2BTFA 3A5OC 4H5NA 2PAVA 3S41A 1IG8A 5KQ8A 2P9NB 4AM7A 3G25A 2FSJA 3BUZB 2KHOA 2E2NA 3FR0A 5KPZA 4BRGA 3DXMB 3ZEUB 3WQTA 4BRAA 1V4TA 2Q36A 5KPRA 4BC4A 4PL7A 3DJCA 2Q2RA 5BRDA 3FFKB 4K42A 5BPLA 4J8FA 4GNIA 4YDUC 1MDUB 3ZX3A 1TYQA 3GDQA 1ZXOA 3QMLA 4H0YB 1YUWA 4ISFA 4BRQA 4BRIA 3A8YA 2E20A 1K8KB 2E8AA 3D2FB 4WQ5C 5JLHA 4JHDB 4CD3A 4CZHA 5AZJA 5EX5A 5AQNA 3H45C 4FWMA 4BRKA 2YJFA 4CZIA 3DXKB 2H3GX 1QQMA 3EN9A 3VETA 5LJVA 3O1BA 3LDNA 3ATUA 3VEWA 1H1VA 2QWQA 5AZIA 1HX1A 1U2VA 5JMVA 2EWSA 3IMXA 1RDWX 1X3MA 4K41A 4RCHA 4A62A 1X9JA 3VPZA 4BQLA 3GL1A 1GLLO 1HKBA 3JXUA 3R8EA 2FXUA 4BROA 5FPNA 1XC3A 3DAWA 3L4IA 5I9EB 4BVPA 3HI0A 5FPDA 3FGUA 1U6ZA 1NWKA 3QBXA 3O08A 5AQHA 1YVNA 5B8HA 3L6QA 4FWQA 3H1VX 4AM6A 4K43A 2YHWA 3H1QA 2NLXA 4IJNA 5AFUH 3M3ZA 3O1WA 2HF4A 2FSNA 4RTFD 4QS7A 2J4RA 5BN8A 3SLCA 2P9IA 4B1YB 4O8KA 2V7ZA 2A3ZA 1E4FT 1RGIA 4CZGA 2V52B 1TYQB 1YXQA 4B1ZA 1TUYA 4H5VA 4EAHD 1J6ZA 1MWKA 3AARA 3CQXA 4MLHA 3HZ6A 3LM9A 4H0OA 5AZJB 2VYPA 1R59O 3TU5A 3CJBA 3FZKA 4ISEA 4CBWA 1S22A 2VWBA 1GLCG 3H6EA 3GG4A 4PKGA 4YDUA 5AQKA 4BR0A 4DQ8A 2ZF5O 5AZIB 1XUPO 5ADXH 3KHYA 4PL8A 4MO5A 1GLFO 2D1KA 3D2EA 3UKRA 4BG8A 5KPTA 4JNEA 5AQIA 3FLCO 2YHXA 4FOEA 4WQ5A 4F9OA 4CZKA 5FPMA 1MA9B 5AQMA 3W3DA 4FWNA 3MN7A 3VEOA 2E2QA 4XH5A 1DEJA 1ATRA 2IVPA 3HTVA 3CIPA 1GLAG 3A0IX 4CZMA 1NGBA 1BDGA 3U4LA 3A5LC 4JAXA 4NB4A 3MMVA 4E1JA 4B1XB 4WQ4C 1XQSC 5AQTA 4BRCA 3QFUA 2Q97A 1ATNA 3R9PA 4BC2A 3F9MA 5F0XA 3FE1A 1SZ2A 1JCEA 3H3OB 1QZ5A 3EKUA 4BVOA 3HM8A 4CBXA 2ZWHA 2QWRA 4FO0A 5KQDA 1WOQA 4BQZA 3M6GA 3TPQA 3VEYA 1G99A 2E1ZA 2IVNA 1S3XA 4CD1A 2GWJA 3ZX2A 2A40A 3UKUA 3MN6A 3D2EB 3UKRB 2A5XA 3VF4A 3AAPA 5AQFA 2QWOA 4A2BA 2P9PB 4EHTA 2YCHA 5EXWA 1P8ZA 1TUUA 2HF3A 5BREA 1T44A 3GBTA 1Y64A 3O6WA 4MLEA 5AQGA 4BC3A 2HMPA 3LDLA 2CGLA 2V7YA 5BRFA 5E84A 5EOYA 2GUPA 4H5RA 3I8BA 2D0OA 4B9QA 1NGJA 3WT0A 3EKSA 5AQYA 1CZAN 2ASPA 5EY4A 3KVGA 3QDKA 2YI1A 1NLVA 2OANA 3VOVA 2IVOA 4BRNA 4XH4A 1SQKA 1BUPA 3H46O 3SMPA 4H0TB 5BPMA 2ZGZA 2WUSA 3IUCA 3W0LA 2HOEA 2P9KA 4B1WB 3WQUA 3UB5A 5JLFA 2E2PA 2BUPA 3VGLA 3VERA 3LM2A 4WQ4A 1NGEA 2FF3B 2GTDA 2QWPA 2QWMA 2QWNA 4DHYA 3U8XA 3WXKA 1HKCA 4BRPA 2Q0UA 5FPEA 4QS8A 1C0FA 3VF2A 3O4WA 4QS9A 4FL9A 1NGFA 4K25A 2P9SA 4L3QA 4BREA 4BG9A 3ZETA 1IJJA 2YHYA 4IWVA 3ULEA 3J8AA 5F1XA 2V51B 1BWFO 1Z05A 3C7NA 4BC5A 4BRDA 5BR9A 3CQYA 3CJAA 5F2RA 5AQSA 4JD2A 1NGAA 3CERA 4HTLA 2A42A 4BR7A 3I33A 3A5NC 1U2VB 3CJ9A 3OHRA 4A2AA 3AY9A 4IZ9A 1JCGA 1ZC6A 3MCPA 1KAYA 4CZJA 4CBUA 4MO4A 2E2OA 3CI5A 4BRLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4V19S 5BPNA 3M5RA 4DWIA 1VSHA 4ISGA 4BE1A 2W6KA 3WEEA 3DLLL 2ZJQL 2WONA 1NMNA 4TSXA 3KK1A 3I8DA 1N36K 2D4WA 1J54A 1LWCA 1NJZA 3MDQA 4W5QA 1C1AA 4CGHA 1DT9A 3P4IA 1TKXA 3HVTA 3SUQA 1SAZA 4M7XA 1WN7A 2D0AA 1NBWA 1HQEA 2YJEA 3PLAA 4BR5A 4GMJB 2HHTA 2UU9K 4HHTA 4FPBA 2E6LA 4CHNA 2HHWA 1KXPA 2P9LA 3TR8A 3LAKA 4HUGA 3KTQA 4RW9A 4NLCA 5T7BA 1SV5A 2CGKA 4CJ3A 4GV9A 2Y1JA 1NMDA 1EX4A 2E1YA 3DLGA 4JI2K 3VEXA 5HP1A 1QHAA 4IFVA 2KW4A 1VQKN 2HHVA 4DTJA 4BR9A 4CJEA 4DTPA 3FZHA 2RPIA 3RMBA 4DTNA 2VWKA 3CJCA 1WSIA 5HRPA 3QICA 2F8TA 3RMCA 3TAQA 1QSSA 3T1AA 2B5JA 4DLEA 3C65A 4H03B 4FLXA 1NGGA 2FF6A 1B92A 1S1TA 3DYAA 1VSIA 3O4NA 4FVMA 4GVEA 3HT3A 1KFSA 3FZLA 2VG6A 3V9UA 4CJRA 3VQ7A 4Z94A 4CW7B 1TL1A 4XH1A 3SZ2A 2NUBA 3RSEB 2Q31A 3V9ZA 2NZTA 1GLEG 2KQ2A 3IFRA 4FW1A 1NG9A 5AQOA 4JI0K 2KKZA 3TSUA 1EO1A 3TAFA 3K9JA 3L2RA 2VWJA 2GEMA 4NO7A 3EE9A 1EXQA 5HLFA 2QK9A 4CGJA 2HNZA 5FRMA 2HNYA 4CECA 3O9SA 3IG1A 3UKUB 1S9GA 3O3HA 1JL1A 1WBBA 1CLQA 4ELUA 2JWLA 3M8SA 2BDPA 4BRFA 1LCUA 3NH1A 4KPYA 2G8IA 3TWHA 1TK0A 4AHVA 4CGDA 4RW8A 2CH6A 4EP4A 3N4PA 4Q0BA 4Z0UA 2O8DA 4PKHA 3THYB 1BO5O 1D8YA 3RR7A 4E1NA 1DKGD 4CF1A 2P9NA 1NOZA 2XHBA 4W5OA 4CF2A 4FJ5A 3NFAA 3CC4N 3AA5X 3HOTA 2HHIA 4WYBA 3ENHA 3MEEA 3U9ZA 3J80O 3JSMA 5LMNK 4CJVA 4C1NI 4LF5K 2O4GA 2P9KB 3HBTA 1QVGM 2XY6A 2RN2A 3HYFA 3SK3A 5AQRA 1HPMA 4E89A 1NGHA 4LD0A 1BU6O 1NGCA 4CHOA 2BE2A 4N56A 1X1PA 1U47A 3R3LA 2VG5A 3EY1A 4DTUA 3U9DA 4JI3K 1HUXA 3TAPA 2Z1HA 3G4SN 3L0QA 1Q86O 4CFBA 1SL2A 5BN9A 3OYKA 4DSJA 4OVLA 1KCFA 2IDOA 2ETJA 4E1MA 3EL2A 4XEIA 2F7TA 3VA0A 4LSNA 3CJ7A 3SAHA 1YT3A 3CETA 4CCHA 1NJWA 3MCAB 2BTFA 3A5OC 3TAEA 1JLAA 4JRPA 4CJWA 2E2NA 1QQCA 3IAYA 3DXMB 1CZ9A 2YV0X 4KO0A 3WQTA 4BRAA 4WFNL 4I7FA 2Q36A 4BC4A 1VQLN 5GAEP 3FFKB 4K42A 1MDUB 4WFAL 3LAMA 1I94K 2G8FA 4LFCK 1C0TA 3CYGA 1NK0A 3QMLA 2UUAK 4B3RK 4WQ5C 3P38A 5GIOA 4L8RB 4O8UA 3PV8A 4KHNA 4R79A 4FJ8A 4BRKA 3AVLA 2QEXN 4CZIA 3DXKB 4CEBA 5LJVA 2NRXA 3ZSZA 1HNWK 2O8BB 3LDNA 3VEWA 1H1VA 5AZIA 2KFNA 4DQPA 3J7YP 4FXDA 2W42A 1QVFM 4JS5A 4CEFA 4CK1A 3GL1A 1GLLO 4E19A 3L2QA 4KHSA 3JXUA 5M1QA 1EWRA 1FKPA 3AVIA 4ILJA 4E72A 1KVBA 4BVPA 3HI0A 1NKCA 5FPDA 3FGUA 3QBXA 3O08A 4FJKA 5AQHA 2HMIA 3I0SA 3VQCA 2PY5A 1YF5L 4AM6A 4K43A 3LANA 4DMNA 4IDKA 4IJNA 4JKCA 5CZ2A 4QAGA 3O1WA 1RBTA 4QS7A 1RT3A 1C0MA 2P9IA 4B1YB 4B3OA 1BI4A 1EP4A 1BL3A 2V7ZA 4A5AA 3VQDA 2JGUA 4NCGA 4KRFA 4B1ZA 4JKGB 1D9FA 1Z25A 4DR3K 3CQXA 3CPEA 3OVNA 2FBVA 5AZJB 2O8EB 1R59O 5IWAK 1RTDA 3CJBA 1M90O 2YHAA 1YJNN 3NF7A 3OBWA 5HOOA 4DQ8A 2ZF5O 2KFZA 5ADXH 4KTZA 1ZBFA 4MO5A 3UKRA 4JV5K 2XY5A 3HP9A 2YHXA 4F8RA 4DV2K 5AJ3K 3V9SA 5AQMA 3RRHA 4YY3K 3MXIA 1ASWA 2HBLA 2B6AA 1GLAG 3CIPA 4CJTA 3THVA 1LWFA 1NGBA 3NH0A 3VQ5A 3ZSWA 4WFBL 1E3MA 3RTVA 4NB4A 2HHSA 2Q97A 4DV3K 3V9XA 4BC2A 5JS1A 3F9MA 1HMVA 4R5PA 4JI4K 2O8DB 3NH2A 2DFHA 1YITN 1ZBUA 1DTQA 1O13A 1F21A 4GKKK 3AO2A 3EKUA 5GINA 1W7AA 4PY5A 5DM6L 4CBXA 1JKHA 1WOQA 3V81A 3TPQA 2E1ZA 1SL1A 4O0JA 3HJFA 4CD1A 3LDSA 3CFPA 1OVQA 4FLTA 1B9DA 2GX9A 1VSKA 2VGNA 2IS3A 2OPPA 1P8ZA 4CK2A 5BREA 2A1SA 1XMOK 3GBTA 3M8PA 1BHLA 4OKKA 3TARA 1ZBLA 4J2AA 2HMPA 2V7YA 2P1JA 5IT9O 2WC9A 2PZSA 3J81O 3EKSA 4CEOA 3SJJA 4YOVA 1CZAN 3KVGA 4O5BA 3DLHA 1WB9A 4XH4A 4RW4A 1SQKA 1BUPA 3H46O 4H0TB 4DSFA 4AHRA 3SAFA 1C1BA 3W0LA 3KWIA 2HOEA 3WQUA 4F2SA 4LFAK 3AA2A 1IBMK 2QWPA 2QWMA 2NRZA 4DQRA 3OY9A 3P5JA 1IKXA 2F96A 3AVFA 5M1FA 2QI2A 2P9SA 4L3QA 1IJJA 3OYEA 1HYVA 2OTLN 3L8BA 1Z05A 1HR0K 4BRDA 5BR9A 3HPOA 1VQ4N 3CQYA 4JEPA 3AVNA 3T19A 4KAZA 2Z1GA 4BR7A 3U6FA 4W5TA 3CJ9A 3TSPA 4IZ9A 3QEVA 4DSIA 4F2RA 1ZC6A 5H1SQ 3MCPA 3K59A 4CBUA 4H8KA 2E2OA 4H0OA 3HM8A 3CI5A 4DV4K 3CJ1A 5HRNA 1OH7A 3AVHA 3JS6A 3SQ2A 3VF6A 2Q0RA 3TAMA 3CG7A 1WNSA 4RWTA 2KTQA 3MK6A 3K5LA 3B6PA 2YKMA 2CH5A 4BGBA 3VQ8A 2HHQA 3NAEA 3U3YA 5LY3A 4DCHA 1D4XA 2P9IB 3LP3A 4H0PA 3WXJA 1BI4B 2NRTA 3UE5A 4O44A 4MDBA 4OKJA 1QZ6A 2D0BA 2FC0A 4B8AB 4FK0A 3RSEA 5GAGP 4DF4A 5J2MA 3ZX0A 2E6MA 5AQQA 4WF9L 4CJFA 1KC8O 4BR4A 4FVUA 1TV6A 4J2BA 3WUHA 1DGKN 1RTHA 4DU4A 2D0PA 3JAMO 1RFQA 5EU7A 1OKJA 1KVAA 3K5OA 4JLHA 5AQWA 1XNRK 3S3MA 4FCYA 3K0SA 3CXCM 5AR0A 3QBWA 4PKIA 1UAXA 1K8AO 1KD1O 3SQ0A 3AVMA 3O9UA 2BGGA 4HUEA 1Q18A 4RW6A 4KH5A 3OBYA 3AAQA 4JKHA 4AH9A 4N41A 3MN5A 4BRMA 1T6DA 1NGIA 3OYBA 1XHZA 2P51A 4Y1CA 3IS9A 2YNFA 5BR8K 1YTUA 3SUPA 3QB0A 3NCIA 4FZYA 2E88A 3CMAN 3E66A 1BA1A 1JCFA 1VQMN 3QINA 2IIRA 3VGKA 2OCEA 3T1HK 2P9UB 4CK3A 1K9MO 1X9WA 3F5TA 3DWLA 3ID8A 3OYAA 4B9LA 3KZBA 4CEAA 4DV7K 4FJ9A 2DTUA 3HVRA 1Q9YA 4AF1A 1RBVA 3C6UA 1XC9A 1FJGK 3NF9A 1RT1A 5AFUA 1I39A 3QNOA 2XRIA 4AQYK 5AQPA 4I6MB 3O8MA 3ATVA 2QWLA 1SKSA 1TKZA 4HCBA 3WXLA 3OA9A 4IKFA 2CGJA 4CI6A 3WXMB 3AVGA 1VQ9N 2WFBA 1Q8IA 3FFIA 3B8AX 4K0KK 2QM1A 1QQNA 1J9AA 2ASOA 4DB3A 2ASMA 3EYZA 1WUAA 3EZWA 3G10A 1L3SA 3RMAA 5M1NA 1GLDG 3DXMA 4AILC 3OYIA 1BQMA 1T6CA 4AHTA 4FJNA 2DY4A 1BCOA 4U7BA 4AHUA 3CPWM 4FJ7A 2AP1A 4YOXA 1NNEA 4KHUA 4OPHA 4Q5VA 3KLEA 4BWMA 3AVBA 5C24A 1S1XA 1TK8A 1HNVA 4Z4HA 4FJGA 3TANA 1Q82O 5AQXA 2P9SB 3KK7A 1SKRA 1QSYA 4BACA 3DXKA 2O8BA 3ULDA 1TAQA 4FWSA 3GOIA 4BECA 4DS5A 1REVA 3O9RA 1WSJA 4YORA 3MN9A 1XHXA 3TAGA 3O80A 4YOYA 4FZZA 3RR8A 4O5FA 3AA4A 4FLVA 3LDPA 5HBMA 2G8WA 1ZYQA 1GOCA 1U4BA 5CHIA 5CZ1A 3O9QA 3LP1A 4CFAA 3CCQN 2ITMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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