3TQ0A

Crystal structure of leishmania major dihydroorotate dehydrogenase in complex with fumarate
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
SMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSCPNVPGKPQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase
publication title Crystal structure of dihydroorotate dehydrogenase from Leishmania major.
pubmed doi rcsb
source organism Leishmania major
total genus 110
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date 2011-09-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3tq0A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tq0A01
1W3TA 1PL9A 2PRHA 5D2WA 1A5AA 1KTCA 4GWEA 2E6AA 3P82A 2XFWA 2CLFA 5F4XA 1ZALA 1IXNA 1B57A 1TJPA 3KXQA 1OABA 1VYPX 3PY2A 3SSJA 3DFNA 3L5MA 5C2XA 1DJQA 3SR7A 2NLIA 4FNRA 2CU0A 2C14A 4GE8A 3NA8A 4CNOA 1OF6A 4IMDA 1MEIA 3NL6A 3HJZA 4QITA 3MBDA 1V5XA 3PAJA 1JVNA 3KVKA 1ICPA 3FA5A 1JR1A 4DO6A 1ZNNA 1LOQA 1EP1A 3NEVA 4QAIA 1H61A 3W07A 5CSRA 4OV9A 3W1AA 1J5TA 4MFDA 3GZ3A 2FPTA 2ZRWA 4HPXA 4K6AA 4Z0JA 4JTTA 3LLFA 2B0MA 5HJLA 5J5DA 1TQJA 1K3UA 4MY1A 3HO8A 1T8XA 1OFQA 1SPQA 3L0NA 2V5BA 1F5ZA 2WSYA 1SR9A 4OU1A 1E51A 3O6DA 2A85A 5U4NA 3QC3A 1NSJA 5D2XA 5BRBA 1H7RA 3L5LA 5K3VA 5T26A 5FEZA 1AW1A 2GUUA 5CGQA 1I2RA 1H7PA 3LCGA 4LY8A 1LM1A 2C3ZA 3WFAA 4HT3A 1FX6A 3UXDA 2I1OA 3RMJA 3OEXA 3UQNA 3QZEA 3FIGA 4O1DA 1TREA 1TV5A 4JTUA 1O94A 4GNJA 3E49A 1W5QA 1RQBA 4KWVA 1PCKA 3EX4A 3P60A 1JULA 1JCJA 1HUVA 2OX1A 3T7VA 4TMBA 5TIMA 2YSWA 4ONVA 3BGJA 3TA6A 1QR7A 1RQEA 3WK2A 2QCEA 4TIMA 2X1TA 3TV8A 1LBMA 5D05A 3MW7A 4NT0A 4HPJA 4JIQA 4ADUA 1C9DA 4DPPA 4UTWA 5EL1A 3W9ZA 3C2RA 2CW6A 1J4EA 2HMCA 3L2IA 4NNAA 4UIOA 3O06A 2V30A 3NM1A 5CZ0A 3NNTA 3TXZA 2A7NA 1VH7A 3QYQA 3W7MA 4HHPA 1DKWA 1TV8A 4FO4A 3U2OA 3A23A 5CZSA 1F6KA 4PEKA 1XBXA 3S5NA 3S1UA 5HWNA 1M7OA 1TRIA 4Y96A 3DGRA 3EXSA 4DO5A 1VCFA 4OBTA 4QJ1A 3TSMA 4ADTA 1JRBA 1DL3A 1SZEA 1ME8A 4LRSA 1PV8A 3NM3A 2QCFA 3W22A 2E6YA 3GVGA 3W7CA 4N2YA 2UV8G 1DOSA 3OBKA 3PWAA 3T4CA 4JX6A 4JN6A 4UR8A 3PSVA 5DCEA 1K8YA 1TTQA 1BWKA 4IXXA 5HWJA 1R30A 3G8RA 5DCBA 3P81A 3GX9A 5D30A 5AHIA 4K8EA 3S5OA 4QQ3A 2ZRVA 3DFQA 1TRDA 3PUEA 2WSRA 5F2IA 1UCWA 3OA3A 5LNRA 3GDMA 3O6YX 1F74A 4MIMA 2OT1A 3SGZA 1T96A 4XBKA 3CWOX 2J6XA 4Z1BA 4EWND 3HG5A 3W88A 2GVGA 4DF1A 2YZRA 1X6UA 3W1RA 4WOZA 3HMJG 5AHFA 1SSDA 3SFKA 4FX6M 4A3UA 2VXNA 1OX5A 2PCQA 3P5ZA 4ZL1A 5C5YA 1MSSA 3W7QA 3NYZA 3TKFA 2H3DA 4LVGA 1H7WA 3L67A 1DV7A 3EKZA 5HR7A 1K02A 2EPHA 3KRUA 3MJYA 3NPWA 4NX0A 5CZJA 4AAJA 3L5AA 1UUOA 2FB2A 3OHIA 3ELFA 3NZRA 1HG3A 3QH2A 3UWQA 1KBIA 3INPA 4H3DA 2I14A 3K30A 3IEBA 3B0UX 2FIQA 4NX5A 1ZAIA 4RR4A 2LLEA 3NG3A 1QPRA 3W7IA 3M41A 4UFLA 1FCUA 3ANYA 4WY0B 2YX0A 3WJXA 1GG1A 1L2UA 3G3DA 1CI1A 3UWYA 5FEPA 3NL5A 1TPUA 4N9DA 2VEPA 3EX1A 1H62A 4FF7A 4YL2A 2HSAA 1QPOA 5DELA 1IIGA 5L9FA 4LS1A 1RQHA 3ZS4A 4L4LA 2PC4A 2PRMA 3UZ5A 5AYZA 3MUXA 3W7LA 4N4QA 5E93A 4JY8A 4RXGA 3I7QA 4TO8A 2A1YA 4WUIA 1RV8A 2RDWA 1ZAHA 2V2DA 1QOQA 4M5PA 1XUZA 1OHLA 1TYGA 3UWVA 1TPWA 3G0XA 1GYLA 2CZEA 5I3FA 3SJ3A 3OIXA 3IVTA 1LZOA 1OX6A 2Y63A 3R89A 4LVBA 2RKXA 5CKSA 3IIZA 3NQFA 3W1NA 2NUXA 4CQAA 2BSLA 4MKNA 5D2YA 2DU2A 4JTLA 2ZTJA 3NZ1A 1JCMP 3EWZA 3CLMA 3EWUA 1VHNA 2VC6A 2AQWA 3IGUA 3GNDA 1LROA 4ZQNA 2B7QA 4GJ1A 1G4SA 2Y7EA 3A22A 5AHLA 3BW3A 4XQ6A 4CNNA 1UASA 4UFJA 4EVZA 2IQTA 2V2CA 1VCGA 4DF0A 4NZJA 3A9IA 1OK4A 2Y62A 3NAVA 1VPXA 2DZTA 1VC4A 4NXKA 1WBJA 1Q6QA 3TSBA 1TSIA 2GOUA 4ZVJA 4TMCA 4OV4A 2CFFA 4JTKA 4LVDA 3A5VA 3G8EA 2BXVA 3Q58A 1AG1O 2RDUA 5FESA 3NQCA 4UTTA 4DBDA 1ME9A 1EA0A 3I6RA 2DZXA 4FNSA 1XUUA 3UWZA 4O12A 4MLRA 3RFAA 3M5ZA 4TU1A 3TQKA 5EPDA 3LV6A 3HG4A 3FLUA 3NQ2A 5I3KA 2QUTA 3EXRA 3O63A 4NVTA 1JJKA 4UMAA 3IIOA 4IPIA 3GLCA 3LHVA 2GQAA 2H3BA 2QEZA 5G2HA 3S5YA 1G6CA 2VFDA 3T78A 1V7YA 1A50A 2XN1A 5F2GA 2EKCA 1I2PA 5SWUA 3W7OA 1ZCOA 2P0OA 4FIRA 1PIIA 3P8JA 3MYOA 2AAMA 3TROA 3M5YA 2E5DA 3SI9A 5G2WA 1G4TA 3TIMA 3DU0A 3IVUA 5LNVA 1YPFA 1PS9A 1U5JA 1R46A 3GK0A 2O7SA 4RX0A 4JD4A 1A5CA 1W5PA 3L68A 3PBWA 2FDSA 4HSOA 5LKYA 4JX4A 3W7KA 1KA9F 3NO5A 3TQVA 1QWGA 1KFLA 3L21A 4O1AA 2V5LA 3GNNA 5AYXA 3MHFA 5EKYA 1W5NA 3NQ7A 3MHGA 1B9BA 3NQVA 3CIXA 4JTHA 5GVJA 1OFPA 1H7NA 3EX3A 3UPBA 2Y88A 2B7OA 3SW6A 4DELA 4HNNA 2H8ZA 3W70A 2ZA1A 4I7WA 2CLIA 4RLIA 2QCNA 4CNPA 1FDYA 1FWNA 2G97A 4O16A 2ATMA 1ICQA 3B05A 1DORA 2WPBA 3LM7A 2NUYA 5IM51 2VFFA 2V8ZA 1Z41A 2V9DA 3O16A 3F03K 3QPZA 3WK1A 1PVNA 3TR2A 3CT7A 3EEGA 3LXAA 1Y0EA 5D33A 4WJEA 3TAOA 3LHTA 5KZDA 1LOLA 4PL2A 2DZSA 2E68A 1WQ5A 3BW2A 4K38A 1K7FA 1RPXA 3W7PA 1XKYA 3VFLA 3LTPA 3WJYA 1AK5A 3FFSA 4HN4A 3PBUA 3BVJA 2JKEA 4HSNA 3KHJA 1X1ZA 3GDLA 4QM1A 4M19A 4UC5A 4JTIA 4EOUA 3BK0A 3LHZA 3QPYA 1S3HA 5I3IA 5EA9A 1JQXA 2NX3A 3P80A 4PL1A 3W2MA 1P5BA 2X1SA 1I2OA 4WZHA 4Y6GA 4JTEA 4IMEA 1GPWA 4XUGA 4YMZA 1YADA 2JKPA 1EWEA 1N8FA 3HBLA 4JS3A 1AW2A 4N9CA 5KSWA 1KFEA 3NQ8A 4TX9A 1L6WA 3UNDA 5K9DA 1DQWA 3C61A 1I45A 4G1KA 4GXMA 3M6YA 5HULA 4WD0A 3B03A 1O5XA 3G1SA 3LCLA 3WJWA 2YW4A 2BLEA 1XBZA 4GUJA 2P1FA 3GDRA 4RCXA 4XTIA 3MO7A 1S5WA 1W54A 2FTPA 3NPVA 3M44A 1H7OA 3G3MA 4X3ZA 1HO4A 3PBVA 4BF9A 3HGJA 3OVPA 2NWRA 1L6YA 2YGYA 4UUIA 4B5NA 4JYEA 1L9WA 1EIXA 4QNWA 2GVJA 1WYIA 4LV9A 4UMBA 3SGUA 1TPVA 2A7RA 3HG3A 1OFRA 1VYRA 2KZHA 3PVFA 3TW7A 5AC6A 3TCEA 5LHEA 4AMAA 3NL3A 3NQEA 2QJHA 1IXQA 3Q94A 4C1KA 1VS1A 4M7SA 3DFOA 3RLVA 4GC4A 3UYCA 4NNBA 3GKAA 2OT0A 3W3OA 1UBSA 1SFJA 1GVRA 4KKXA 1WBHA 2VOMA 3ZFHA 4MY8A 1SQ7A 2YR1A 5HMSA 2V82A 5AYYA 5F1UA 4ZZ9A 3DI0A 4XKYB 3LCXA 3S9YA 4CCEA 4I7UA 2E6DA 4Y90A 4O57A 1HL2A 2C1HA 3OVRA 3TH6A 4XWUA 2WNQA 2G95A 4BFAA 2OMAA 1I4NA 4K7VA 5D2VA 3PF3A 2Q3OA 5K4ZA 1W56A 5CPMA 1X1OA 3LTYA 2DP3A 1N55A 1GOXA 3HG2A 3RU6A 5G2IA 1LRQA 4AEOA 4EIVA 4DXVA 3P61A 3NQDA 5IBXC 3G1XA 4YWIA 3STCA 4X9SA 1OX4A 1VGAA 4MOZA 3TUUA 5DY2A 4AHQA 2VELA 1CW2A 4UTKA 2CLHA 3TDFA 4K37A 2F84A 3PSWA 4UFIA 3C2VA 2HS6A 5D38A 1C29A 5F4WA 2CZDA 2R14A 4CCCA 2YYUA 2FFCA 4WY0A 2OCZA 1SZFA 4UMCA 4JXCA 3HPSA 3ABOA 1WDWA 2FPVA 2WOQA 2CLMA 2DJLA 1FY6A 4R34A 3H55A 1WOAA 2Y7GA 2TPSA 1OYBA 2ZRUA 4CLMA 1FWSA 1GG0A 3OG3A 3O1NA 2JK2A 3NDOA 2NWSA 2C18A 3W1UA 3D0CA 3TFXA 3KX6A 1EEPA 4FXSA 3T40A 4M6QA 2YYTA 3LRMA 3W84A 2Y89A 1KV5A 1XXXA 3N2XA 3CHVA 2GQ9A 5KZEA 1TPC1 1Q45A 4S1FA 1J2WA 1DVJA 3ABSA 3L0GA 4UCGA 2QJGA 3MP4A 3LBMA 3A24A 4MYXA 4DPQA 4O8RA 1Q6LA 3JS3A 2A21A 5HR6A 1K8ZA 3IGXA 1P4CA 1OFAA 1NFBA 1W5MA 3EKLA 4AF0A 2VEKA 1FCVA 3G1AA 1I2QA 1CX9A 3W23A 1LTDA 1XM3A 5FF3A 3DH7A 3DHDA 2QDGA 4O19A 4P61A 4N4PA 3QF0A 5AC7A 5BMXA 3FKRA 4O18A 3IGSA 1BTMA 1G69A 2X16A 3LHUA 3LCHA 2VENA 3E9AA 1HTIA 3VE7A 2Y6ZA 3W1PA 3LGEA 2QCDB 4K7YA 4DBEA 2ZRXA 4RKAA 1LLWA 3GYEA 2QDHA 2RDTA 4RXFA 1KBJA 4JDYA 2B4GA 1ICSA 2Y85A 1N7KA 1TPH1 5LNWA 1GWJA 2QUVA 3R5EA 3S1WA 3O6CA 2X2GA 3KAOA 2GQ8A 3IVSA 1S5VA 2GJLA 4FX7A 3TC7A 4LW7A 2EHHA 4MVAA 1XCFA 3TFCA 2FJKA 4LC6A 2X1RA 2FLIA 1D9EA 4DEFA 2QUUA 3HPXA 3TXVA 5I3HA 1GVSA 4IMFA 3W7DA 4O50A 3TAKA 1FQ0A 3HGSA 1LBFA 1FWTA 6ALDA 4ZQMA 4MY9A 1OX4B 3MP3A 1GZGA 3W7RA 3FKKA 4K8HA 5D09A 3G24A 1DHPA 4E38A 2E77A 1TPFA 4M6VA 1LYXA 2EGZA 3O05A 4NJJA 3I68A 3QMSA 1JUBA 2JGYA 3PULA 3GXTA 4NJKA 1GTHA 4MZYA 3N3MA 1K7XA 1F73A 4Z1DA 2CZ5A 2GPTA 3LDVA 4O1BA 4DO4A 3MI3A 2BTMA 2WV8A 1AL7A 1VYSX 3CEUA 1G67A 3CIWA 3P8IA 2QCLA 2PE4A 2NZLA 2Z1BA 3UWUA 4YXGA 5FF0A 3B0VC 1TMHA 1KFBA 3G22A 1FDZA 1LBLA 4LRTA 1IGSA 1KFKA 2VKZG 1EUAA 2YW3A 4N6EA 3ZWTA 5AFDA 2Q8LA 3GIYA 4OQVA 1QO5A 3M16A 1SW0A 1TTPA 4H4IA 2RFGA 3L0KA 5BNKA 1YDVA 3LLDA 1ML1A 1WXJA 3BG9A 4JGDA 3TC6A 1B4KA 3CM4A 3PUDA 4LC8A 3W85A 2BX7A 5KTLA 4HNUA 1RD5A 2ZZ3A 3LRKA 4BK9A 3S5ZA 1AW5A 4FHAA 3BV4A 3LCFA 4L4MA 2F7FA 4MFEA 4UFKA 5DLCA 3CC1A 5KITA 5DXXA 3M7WA 5D2TA 1UB3A 4AF0B 4IMGA 4AB4A 1ME7A 1G4PA 2CZFA 3HPZA 3GXNA 1ZHAA 4ZQOA 2W79A 4NJHA 2HS8A 3BG5A 3LV5A 2VFEA 3SZ8A 1UJPA 3EB2A 1MXSA 2O7QA 3KOFA 1DBTA 1JCXA 3GDKA 4CQ9A 4O53A 1AL8A 1FUYA 4BI7A 3MMTA 4Q33A 4LV4A 2BWGA 3GR8A 5F2LA 3ZR4A 3EWYA 4HNVA 1TPB1 4I9AA 5G1YA 1F05A 1KM4A 3W86A 3W1XA 3DHFA 1K7EA 1NEYA 3L9CA 1VQTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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