3TSDA

Crystal structure of inosine-5'-monophosphate dehydrogenase from bacillus anthracis str. ames complexed with xmp
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
477
structure length
442
Chain Sequence
QSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSESGVISDPFFLTPEHQVYDAEHLMGKYRISGVPVVNNLDERKLVGIITNRDMRFIQDYSIKISDVMKEQLITAPVGTTLSEAEKILQKYKIEKLPLVDNNGVLQGLITIKDIEKVIEFPNSAKDKQGRLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGERQFKVYRGEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Bacillus anthracis inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in action: the first bacterial series of structures of phosphate ion-, substrate-, and product-bound complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus anthracis
total genus 132
structure length 442
sequence length 477
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2011-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A PF00571 CBS CBS domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3tsdA00
1TCDA 3CEUA 4UTTA 4PCFA 3HMJG 1F5ZA 4XTDA 3CM4A 2YYUA 1OFPA 3QM3A 2UV8G 4JN6A 1IXQA 4HNTA 1Q6OA 3CIWA 3TV8A 1WBHA 3BG5A 3S5YA 3KRUA 4UFJA 5HJLA 3LTSA 2OX1A 3M9YA 3NVTA 4LVBA 1YTEA 4GJ1A 1EIXA 3TSBA 3I6RA 4LS0A 1R2SA 3HPZA 5BOOA 4FNQA 5FEXA 2ZRVA 5I3IA 5LGZA 1ICPA 5EA9A 1DQXA 1K8ZA 4UMBA 1QMLA 4UTLA 2CLEA 4MY8A 4I9AA 1DOSA 2JK2A 1S5TA 1KFJA 1TV8A 3TU9A 4IXHA 3DHDA 2VENA 2I1OA 4JYFA 4NT0A 4UR8A 3C2RA 4UTUA 1VGAA 3P5YA 4H4IA 5AYZA 4NUWA 4OV9A 1QOPA 4DBEA 5F2GA 4JICA 5KMYA 5HR6A 4Y90A 1MEHA 4AWTA 5LNSA 4POCA 1TTIA 4DPPA 4ZQMA 1DV7A 1VCFA 4BWLA 1GEQA 1W1ZA 1EP2A 2WKJA 3NQDA 4N02A 2OT0A 4UNKA 5EBUA 3G0XA 8TIMA 4FIQA 1KM1A 1N55A 4ADSA 2NLIA 1SO5A 4I7VA 1SW3A 5D32A 4U28A 4MZYA 3V1PA 4FX7A 3FLUA 4NNCA 3PC0A 1XFBA 3G1AA 3W7LA 3IIPA 3CWNA 5E1QA 1TPEA 4IMEA 4N9BA 2Y63A 1M6JA 4TIMA 2RKXA 3NQVA 2GVGA 3EWZA 2F84A 3CLMA 2NXGA 3ZFHA 1L6YA 3EB2A 2EAWA 4NQ1A 1OFEA 3USBA 5AHNA 3ZS4A 3INPA 3NQ7A 3UZJA 1TV5A 5CSSA 3RFAA 5CGQA 3MHGA 5CZSA 4OQVA 1ICSA 1KV5A 4PH6A 5HUPA 4MY9A 3I65A 3SGZA 1X7FA 1QO2A 3NM1A 3QSRA 5FF4A 1H7PA 2Z6IA 1K02A 3NR0A 3O63A 4DELA 4M5PA 3NQCA 3W7QA 3NPVA 4JTHA 2VFGA 1GQNA 1ONRA 3IVSA 3G1FA 2V2CA 4IGHA 1H50A 2R14A 3PB0A 3W72A 1OX5A 1PL9A 3T78A 4NU7A 4NJHA 4KFNA 3SIZA 2RDWA 4CNNA 2OJPA 4WXZA 2H8ZA 3S5ZA 1A5AA 2QCMA 3LHVA 1FCUA 3W86A 5G1TA 3SSJA 5L9FA 3FEMA 2WSYA 5D2YA 3UWZA 4MZ8A 3CQ0A 1O4UA 1SZFA 2CU0A 2G96A 2V81A 3LRMA 2ABAA 4UUIA 3T44A 3B06A 3HG4A 2B4GA 1XXXA 3HGSA 4PTNA 4LTSA 3DI0A 3W7RA 3O6CA 1ZAJA 3FJLA 4QISA 4MUZA 3PWAA 3UWUA 1KM2A 2J27A 2NUXA 4CNPA 3TNOA 3G1XA 1J4EA 1KM4A 5EY5A 4OBTA 3CTLA 3TX9A 3GLCA 5BW6A 2X1RA 2J24A 3KVMA 3W2UA 1V7YA 1V5XA 3UNDA 2X1TA 1TPH1 1GVRA 1Z42A 2ZZ7A 4K36A 1P0NA 1XBYA 5E93A 3LDVA 3NL3A 3S42A 2YW3A 1XKYA 4A29A 2CLLA 4HNUA 4LS1A 1OG0A 5EL1A 1Z48A 1G67A 2C6QA 3IGUA 4AWUA 4E38A 3G3DA 4HT3A 2V2DA 5AC6A 1KFBA 2ISWA 2YFOA 1BWLA 4DO6A 1SU5A 5AB3A 3P60A 3BLFA 4IMGA 4S1FA 3RLVA 1F6PA 3WK2A 1W0MA 1KM6A 1TMHA 3UWYA 2QUVA 1NSJA 3LI1A 2CLKA 3FYOA 1FDJA 4AXKA 1NEYA 3TMQA 4K8HA 4O1CA 1EA0A 2A5HA 3M44A 1WOBA 2J6XA 3P67A 4IX0A 4TMBA 4FNSA 3W7IA 3RU6A 3KVLA 3N34A 1G7VA 3M16A 4RZ5A 2OZ0A 3A23A 2VFHA 3LCFA 1HG3A 3NL5A 4K7YA 2QCLA 3QPYA 1UB3A 1AW5A 2A21A 5KZDA 2W79A 2ISVA 5FF2A 4TMCA 3LXAA 3SGUA 1C9DA 4QITA 1NVMA 1ML1A 3W22A 3TC7A 1TRIA 2QCDB 4XZ9A 1TJRA 3KRSA 1DBTA 3G8RA 4Y6GA 2DU2A 4C1KA 3L66A 2LLEA 4UCGA 3QRHA 3QFEA 3LV6A 1OK6A 3KVJA 5F2MA 3NDOA 2HS6A 5AHLA 1G6CA 1FWSA 4TU1A 4O50A 2Q3OA 3EWBX 3HG2A 3LV5A 3TFXA 2QR6A 4MPQA 4B5NA 3EXRA 3KAOA 2VOMA 2GVLA 3DFOA 4WQ6A 1RQEA 2TRSA 3PS7A 3NL2A 5F4XA 4KKXA 1OX4B 3TSMA 4ZQCA 3FKRA 3C0JA 1OYCA 3W1MA 3N2XA 1FCBA 1F6KA 4HNVA 4E2DA 1ME9A 4ORIA 3JRKA 1EWDA 3T55A 4OE7A 1OF6A 4NJIA 1LRQA 5FF0A 1LBMA 2CZFA 2FPTA 4KFPA 1TPWA 4JDYA 4XKYB 3MJYA 3KVKA 1W31A 2OCZA 1GOXA 5A5WA 4N9CA 4QNWA 2VFFA 4FHAA 1HFBA 3G1SA 3F1QA 3MP5A 2B7PA 1B9BA 4GNJA 3MO7A 2VKZG 1VPXA 3B4UA 3DKLA 2O7QA 4WY0F 4YCOA 3ZWTA 3QW3A 3GDMA 3W71A 1JJKA 5C54A 3L9CA 4O10A 2PRHA 1CX9A 1PHQA 1MO0A 2Y85A 1L6WA 3GXPA 3MUXA 1Q45A 1TSIA 3HIJA 4QSHA 1SR9A 2CFFA 1SO6A 1LLWA 3A21A 3TQKA 3MBFA 4JS3A 2BX7A 1QPRA 1YLVA 1W37A 4ML9A 1LYXA 3P62A 3CU2A 2NV1A 1PHWA 5KTLA 3M0ZA 1MEWA 4XWUA 2V5BA 4ALDA 3LHUA 3S1VA 3EXTA 5CZ0A 3EEGA 4NNAA 2C1HA 2FLIA 4I7UA 3NAVA 5DY3A 3KXQA 3LI0A 1GG0A 3TR2A 3QEZA 3PBVA 2VEIA 4O16A 4JY8A 5D33A 1JCNA 2ZZ4A 4HSNA 2C16A 4JTLA 3PBWA 3FA5A 3CWOX 3LERA 1JRBA 4N4QA 1W3TA 4A3UA 3NQGA 4A2RA 4JTJA 1OABA 1YXDA 3DU0A 4LY8A 5I3HA 3HG5A 4LVGA 5AHFA 3Q94A 3I7SA 2ZZ2A 2QF7A 1FWRA 6ALDA 5KSWA 2I9EA 4PFMA 3O06A 3PSVA 1YPIA 1UCWA 5C6MA 3W9ZA 5CPLA 5CPOA 4RV8A 3OVPA 2GJLA 5LNUA 1Q3NA 1R46A 4OWGA 5HINA 3MI2A 7TIMA 4OGZA 2E77A 3UWVA 5DCBA 1N7KA 1FWNA 1QR7A 3L5MA 4CCCA 4O1AA 3UYCA 2H6RA 2ZCGA 4Q32A 5DXXA 3M7WA 2CLMA 5AYXA 1QOQA 1ZALA 1D3GA 4JTFA 4TX9A 1R2TA 1VH7A 3L5LA 3WJZA 1ZNNA 2NXIA 4BI6A 1JCJA 2CWNA 2W6RA 3S6DA 1NF7A 1LZOA 3JR2A 1FXQA 1W3IA 1IF2A 5G2HA 1F76A 4J9JA 3HQ1A 3P61A 1IIHA 2PE4A 1X6UA 4N9EA 1F73A 3BW4A 2DZWA 3G24A 2DZUA 1VZWA 3PULA 3W6YA 2ISSA 1GJPA 5F4SA 1F05A 2ALDA 3W7MA 1K03A 4JTKA 2ATMA 3IEBA 1P4CA 4M7SA 2E6AA 5I3FA 2X16A 3IVUA 1QPNA 3LGEA 1EPXA 3G1YA 4KFOA 4XTIA 1K7FA 5DXYA 1YDVA 4GBUA 3L0GA 4HIBA 3W7DA 4O57A 1YADA 3W1TA 2E6FA 1E51A 3MHUA 4AHQA 3GXTA 4ZMGA 2QDGA 3R12A 4XUGA 1Q6RA 3W1AA 1AL8A 1A5BA 5DBTA 2C0AA 4LT9A 1OYAA 3E12A 1DJQA 3EWWA 3HG3A 3W7KA 2VEMA 3GVGA 1QPOA 2ZTJA 5C55A 3W76A 3OVRA 3N19B 1UASA 1LP6A 3CPRA 3WK0A 5G1YA 2QUUA 4WY0B 1XC4A 3E49A 3NPWA 3Q37A 4HSOA 2FJKA 1P0KA 5DLCA 3P84A 5D2WA 1SO4A 3M6YA 4IMDA 1AG1O 3A5VA 3WJWA 3LHWA 4O12A 4JYEA 1VR6A 3TCEA 3PBUA 1T0OA 5EPDA 3ABOA 5HMSA 1FQ0A 3W1LA 2CLHA 3IIZA 1PCWA 1PS9A 5CPNA 2QJHA 3NPUA 3NO5A 4YCPA 3G0SA 1LTDA 4JEQA 1DQWA 1TQJA 3LHZA 2NXHA 1JR1A 4IX2A 1GVSA 4X9SA 2WSRA 3MYOA 3MMTA 3STCA 4HHPA 4FNPA 4RXGA 4GUJA 4IQLA 4ZZ9A 4HNNA 3LCHA 3F4WA 2QCEA 4JTGA 1T96A 2E5BA 1ZY9A 3A22A 4A21A 1FDZA 3DFNA 3TH6A 3M41A 4O1BA 4LC8A 3YPIA 1YTDA 3GIYA 3W1UA 4IJBA 4Y8FA 1XBXA 3QSTA 3P7YA 4PEKA 3N2MA 4R33A 2TYSA 2FFCA 3WJXA 3QMTA 1TRDA 3LRKA 4UTHA 3NQAA 3GKAA 3N3MA 1LLZA 4N6EA 1LRNA 2ZTKA 4OT7A 3BLIA 2ZYFA 3UPBA 1FUYA 1GT8A 5F2LA 2C15A 5CG7A 1VYPX 4Z0SA 1TPC1 5HNRA 3BARA 1JCXA 1AL7A 3EWXA 3O07A 3BGJA 3W1XA 2I14A 1XUZA 4QQ3A 3E0IA 2JKPA 3DI1A 3A9IA 3RF9A 3W2JA 2CLFA 4MYAA 5LNVA 4P2VA 1B57A 4LV4A 3TUUA 4AMAA 1EB3A 2ZRWA 4O17A 3LTPA 2J9ZA 2QCFA 2Y7DA 3G1DA 3R8RA 3BW2A 3M5ZA 3W7HA 5IM51 5IBXC 5LNWA 1PVNA 3ANYA 5LKYA 5K2ZA 3SR7A 1JQVA 5F4WA 2ZRXA 4Z1DA 3L2IA 1AMKA 2CZEA 1L6SA 3BG9A 4QIUA 4UC5A 1YDOA 5DY2A 5AHMA 1I8JA 1W5OA 3GXNA 4JX6A 3LBMA 3AJXA 1FWTA 1Y0EA 4LV9A 4UNLA 3OG3A 4UIOA 3GR8A 3PBYA 2E09A 3EWYA 3DKJA 4JGDA 1YYAA 5FEWA 4IWWA 2C13A 3LCIA 2GJNA 4NJGA 3MP3A 2B7QA 4DEFA 2HTMA 4RKAA 4S2BA 1ZENA 2QCNA 4CQ9A 2GUUA 2A7NA 2V8ZA 5D38A 1I2PA 2BXVA 3KOFA 1W5PA 2P0OA 3W88A 2YZRA 1DVJA 5D03A 3GYEA 3UWQA 1KV8A 5C5YA 2CLIA 4JX5A 4X22A 5KZMA 1UBSA 5EMUA 3PAJA 3G8EA 1RV8A 4RR4A 4O18A 2Z1BA 5AC8A 4UXDA 5H2ZA 3GZ3A 1TB3A 1FCVA 4JDBA 1UUMA 3EWUA 3L5AA 3ELFA 3HPXA 2VEPA 4O1DA 3B0PA 4QAIA 4NVTA 3GX9A 2QCDA 2JBMA 2QUTA 2Q8ZA 2ZA3A 4QM1A 3C6CA 1QWGA 3W75A 1GZGA 1DJNA 3S1WA 5CKSA 3N73A 3NA8A 5DCDA 3LCXA 4GUIA 3B03A 3RNDA 1KLZA 2J88A 1W8SA 3W23A 3TW7A 3SJ3A 3TQVA 3TW6A 2VXNA 1UJPA 3CB8A 1ZAIA 4P61A 5J5RA 3I7QA 3QW4B 3NNTA 1R47A 3DHFA 3QPZA 1OX4A 3OA3A 3G1HA 5BMWA 3TKFA 1KTCA 1GYNA 1YTKA 5K9CA 3KHJA 4RK8A 1S3HA 1LORA 1BTMA 3W07A 4AWSA 1TO3A 2QJGA 4O52A 1ZAHA 2AAMA 1VS1A 4UTMA 1B4KA 2JKEA 4XKYA 2XN2A 3O16A 2WV8A 4EF9A 1EP3A 1MZHA 4DPQA 3S0CA 2GOUA 2J9XA 3MYPA 3I7RA 3ABSA 3GKFA 4UTWC 5L6UA 1M7PA 1EUNA 4IOTA 4LW7A 4O11A 4NNBA 1PIIA 3W85A 1PV8A 2VFEA 1ZHAA 5BMXA 4Z1AA 3B0VC 3TXVA 1W5MA 3FOKA 1UUOA 1JCLA 4M19A 3TIMA 2E1DA 2VFIA 1H7XA 3HPSA 3C8FA 3TXZA 4UFLA 2YW4A 5FF3A 3NPXA 4ONVA 4YMZA 1O5KA 3G18A 2NX3A 4ADUA 3W7OA 3SY5A 2PRMA 3PUDA 1SSDA 5SWUA 4HKPA 2Q8LA 1O5XA 2Y7EA 2FB2A 4O54A 1H1ZA 1RZMA 1TJPA 5G2WA 3FJ6A 2ZZ3A 1Q6QA 5EKYA 3QZEA 2DZPA 1H5YA 2WPBA 3W1QA 1VCGA 5LGXA 3W2KA 1I2RA 3STFA 3W70A 5MHBA 3NYZA 4NZFA 4Y9AA 1T8XA 2VELA 4WUIA 4WZHA 5I3GA 2BSLA 3QF0A 3BK0A 4MVAA 4FNTA 2C18A 2QJIA 4UFMA 3M1ZA 1GG1A 1Z41A 3BVJA 2Z0IA 3W1NA 1LROA 3W84A 3UXAA 4HPXA 1H63A 4GUFA 4FF7A 5LSMA 3NEVA 1OHLA 2WNNA 4WOQA 2ATSA 2A6LA 3TFCA 2OT1A 4YLWA 1H7WA 4BI7A 4YL2A 2FPVA 2X30A 2ZZ6A 1XDLA 3GDRA 2ABBA 1QPQA 3TA6A 4DBDA 2VEKA 1J5TA 1KM3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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