3U4LA

Cryocooled bovine profilin:actin crystal structure to 2.4 a
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
370
structure length
353
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGDSYVGDEAQSKRGIKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 353
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u4lA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u4lA03
4A2BA 4B1UB 1SZ2A 4QS8A 3FZHA 1HX1A 2AP1A 2GWKA 3CERA 3DXMA 2PBDA 1BO5O 3CJBA 2ASOA 1RFQA 4CBUA 5AZIA 4CZMA 1S3XA 1YAGA 1XUPO 4CZHA 5BPNA 3GDQA 3L4IA 5AQIA 5AQVA 4QS9A 4PKGA 2FSNA 1ATRA 4MLHA 3M6GA 1DEJA 5FPMA 3U4LA 3FR0A 3A5LC 5AQLA 4BRAA 3GBTA 2YHXA 3QBXA 3O6WA 2P9SA 5EX5A 1D4XA 4H0XB 3LDNA 5B8HA 3LDPA 3HSCA 2E2PA 2J4RA 1T6CA 2E1YA 1JCEA 4ISFA 4M7XA 3AAPA 3FZMA 2ITMA 2E2NA 1BOTO 2QWOA 3WT0A 5BPMA 4MLEA 2P9KA 5AQRA 4BQLA 2VYPA 3UKRB 4BR4A 3WEEB 4KBOA 3EKSA 4JN4A 3C7NA 3QICA 2GELA 2HMPA 4WQ5C 1YUWA 1K8KB 5AQUA 1TYQB 1XC3A 4CJ7A 3MK6A 4HWIA 4PKHA 4FWKA 1GLJO 3KVGA 3FGUA 1NGFA 4BC4A 2D0OA 3R8EA 3VGMA 3B8AX 4K43A 1XQSC 1S22A 3OHRA 4JAXA 4WQ5A 4YDUC 3VGLA 4E1JA 3DXKA 4H5RA 2HOEA 3QDKA 5BR9A 3ZX3A 3FZLA 5JLFA 5AQKA 3DAWA 3VENA 3D2FB 3CHWA 5E84A 5BRDA 4CZFA 2I7PA 4RTFD 4K42A 4FWSA 3D7EO 3VF4A 1OKJA 1BWFO 3JXUA 4B9QA 1H1VA 1MWKA 2CGLA 3G25A 2Q0UA 4YDUA 5AQOA 4BC2A 5JICA 3SK3A 3O4WA 5EVZA 1TUYA 1X3NA 3RSEA 3TPQA 5AQQA 4BR2A 3EZWA 2NRHA 4BRMA 3VETA 1C0GA 1NGAA 3CQYA 5BRFA 4JHDA 4GNIA 4CD3A 4BRCA 5ADXA 3O1BA 2D0PA 3SMPA 3WQUA 3UB5A 5AQNA 3VGKA 5JLHA 4A2AA 1GLBG 4FWRA 2PAVA 5AQGA 2HF4A 1BUPA 2F9TA 3HI0A 3P4IA 4DCHA 4H0TB 5AQSA 3UKUB 5KPRA 1BA1A 4XH4A 5AZJA 4FOIA 4BROA 3DXMB 1SAZA 3CI5A 1RGIA 3CIPA 4BR0A 5AZIB 2P9NA 4DHYA 5BPLA 1QZ5A 3FLCO 2YHYA 1X3MA 4DB3A 5AQTA 1Z6RA 1HKCA 3CJ1A 1YVNA 3L0QA 5AFUH 1E4FT 3H6EA 4C23A 3MN9A 3CJ9A 4PKIA 2I7NA 3F9MA 3ZX0A 4FL9A 2P9UB 1BDGA 5AQFA 1C0FA 2H3GX 3QFPA 1R59O 2E2OA 4XEIA 1EQYA 3ULEA 1QZ6A 3GE1A 2QXLA 4CZGA 1ZBSA 1CZAN 1NGEA 2P9PA 2DPNA 2QW9A 3MN6A 4CZEA 2ZGZA 2QWRA 3EN9A 3MCPA 2Q36A 4ISGA 3AY9A 3SMSA 4JD2A 1DGKN 3EO3A 4FPBA 1U6ZA 5AR0A 4CZIA 1DKGD 3HBTA 1Y64A 3W0LA 4LC9B 5LJVA 3D2EB 3CJCA 4H5NA 3HTVA 4O8KA 2QWMA 2E1ZA 3IDHA 3SJHA 1NGJA 5CE3A 4BR5A 2GEMA 2FLOA 3GOIA 5JMVA 5EXWA 3MN7A 2FSKA 3WXJA 1ATNA 3FZKA 1NM1A 1HPMA 2KHOA 1ZC6A 1IJJA 4M63C 4IXCA 2YCHA 2QWNA 3IMXA 4BG9A 4B1WB 5LJWA 3DXKB 1QQMA 5AQPA 1NGBA 4CZKA 4BC5A 2IVOA 4FWNA 3ATUA 1T6DA 4Z94A 2E20A 3U9ZA 3HZ6A 2QM1A 1ZXOA 2GTDA 2P9LA 3QFUA 3U9DA 3EKUA 4H0YB 3UKRA 2WUSA 2AA4A 1BU6O 4AM6A 2VCPA 4BR7A 4FPAA 3WEEA 4IZ9A 3JS6A 4ISEA 4EHUA 3DJCA 4B1YB 1K8KA 5FPNA 3U8XA 1TYQA 4AM7A 3A5NC 4JHDB 4CBWA 3QB0A 4EAHD 2FSJA 4I6MB 2F9WA 5AFUA 3DWLA 1KAXA 3VPZA 1ESVA 3FFKB 3WXKA 3M3ZA 2A41A 4H5WA 3SLCA 2V7YA 4QS7A 4BRKA 4EFHA 3BF3A 3ZEUA 1KAZA 1NGGA 2QWPA 2P9IB 1GLFO 2ZWHA 1MA9B 2OANA 3VEYA 2CGJA 3D2FA 2FF6A 1LCUA 1U2VB 4BVPA 5KPTA 2FF3B 4FWLA 3VOVA 5AZJB 3CQXA 2E8AA 3H3OB 4A62A 3H45C 3ZETB 4FWPA 1WOQA 1QHAA 4IJAA 1Q18A 2ASPA 4FOEA 4M7YA 4B1VA 4BRNA 3KHYA 1V4SA 3AAQA 1GLEG 1MDUB 1X9JA 3LDOA 4H0PA 1GLCG 2CH5A 5KQ8A 5AQHA 1ATSA 3IUCA 3L6QA 4H0OA 4BQZA 4NO7A 3FE1A 3ULEB 3MMVA 5E26A 5KPZA 3A0IX 3H46O 3LM9A 4DQ8A 4J8FA 4BRDA 3H1QA 3VEOA 5TKYA 2Q2RA 2A40A 3A5MC 2P9SB 5KQDA 4L3QA 3J8AA 5F0XA 2ASMA 1NLVA 4JD2B 4BRGA 3UKUA 2E2QA 4NB4A 4WQ4C 4PL8A 2GUPA 4FWQA 4CBXA 2A6AA 2D1KA 2CH6A 3A8YA 2NLXA 3EL2A 4RWTA 2P9KB 4CZJA 4BRLA 1SQKA 3I33A 5F2RA 5ADXH 3MDQA 3C7NB 1NGIA 1TUUA 1QQOA 4IWVA 4WQ4A 3QBWA 1HKBA 2QWLA 3ID8A 1NBWA 4FWOA 2BUPA 3ZX2A 3H3NO 3VF2A 2V52B 2W40A 4H0VB 2IIRA 5FPDA 2P9UA 3WXLA 1JCFA 4MO4A 3O08A 4BRFA 1BA0A 2BTFA 2HF3A 1JCGA 4BRHA 3ENOA 4BC3A 4EHTA 3VEWA 5EY4A 3TU5A 1GLLO 4WYBA 3VERA 3WXIA 4BREA 3CETA 1WUAA 3LDLA 4IO8A 2IVPA 1HUXA 5ELZA 2VWBA 2V51B 2EWSA 3LDQA 3BP8A 5BN9A 2P9LB 4H5VA 3O5BA 1V4TA 2YJFA 4K25A 5BREA 3C0BA 4IJNA 2UYTA 3BEXA 3D2EA 2NZTA 3GL1A 2YHWA 4F9OA 4CI6A 2GWJA 1YXQA 1NWKA 3O8MA 5AQWA 4BVOA 3VEXA 4CZLA 4FSVA 1QQNA 2V7ZA 4JNEA 3RSEB 3O1WA 3VEVA 2IVNA 4BGAA 2FXUA 5EOYA 1T44A 3A5OC 5AQJA 3ZEUB 1NGDA 4B1XB 4CD1A 4XH1A 2ZF5O 3O80A 2A5XA 5LY3A 3QMLA 3VESA 1J6ZA 3BF1A 3WQTA 1NGHA 1E4GT 2E88A 3BUZB 3IFRA 4H03B 5AQXA 3KZBA 4B1ZA 3CJAA 3GG4A 3MN5A 1KXPA 3R6MA 4MO5A 3HM8A 5BN8A 3S41A 3R9PA 2P9NB 1GLDG 2QWQA 3FZFA 4I6MA 1GLAG 1HLUA 2ZGYA 4H5TA 3WUHA 4A61A 1RDWX 5AQZA 5I9EB 2D4WA 1IG8A 4BRPA 1HJOA 3I8BA 5F1XA 4BR9A 4RCHA 4BGBA 2YI1A 3H1VX 1KAYA 2A3ZA 1NMDA 4HTLA 4XH5A 2A42A 3ENHA 1G99A 3M1FA 4O5FA 3VF6A 2CGKA 2P9IA 4GY2B 4BRQA 3CJ7A 1Z05A 2W41A 3UE5A 2Q0RA 5AQYA 5BRHA 3LL3A 4BG8A 2Q97A 1U2VA 4BRIA 1BG3A 4Y0WA 2P9PB 4FWMA 4FO0A 1NGCA 3VEZA 3LM2A 1HKGA 1P8ZA 4K41A 3W3DA 3ZETA 3ATVA 2YJEA 2Q1NA 4EIAA 1LOTB 3AARA 4PL7A 5AQMA 2Q31A 5FPEA 1MWMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHAA 3RMCA 4JI8K 4KREA 2QKKA 3FZHA 1HX1A 3CJBA 1NJYA 1RFQA 4CJTA 3VTHA 4CBUA 5AZIA 2HNZA 4DR5K 2W00A 2X6SA 4LF6K 3L3VA 2HHTA 4DMNA 2RKIA 2WFBA 3C95A 3ZT3A 3ISNC 1VSKA 3A5LC 3HRGA 3CC2N 4BRAA 1REVA 2YNFA 3K2PA 4CK1A 4ISFA 3FZMA 2E2NA 3WT0A 2WOMA 2VYPA 2VWJA 3AVBA 1VSEA 2VQEK 1LV5A 1C1CA 3O4NA 1QHTA 5AQUA 1YUWA 5J2PA 5HRSA 1XC3A 2JWLA 3OTOK 2O8EA 1GLJO 3KVGA 2D0OA 3R8EA 2D0BA 4C8LA 3B8AX 2O8CB 1XQSC 1S22A 3VGLA 4E1JA 1WSJA 4DTNA 5BR9A 1RDAA 4M45A 4KB0A 4Z4IA 4MQ3A 5JLFA 1NJWA 2OZSA 3TI0A 1SKRA 4FWSA 3SV4A 1S1WA 4KI4A 3B6PA 2HMIA 3VN5A 3U3GA 4BC2A 2D0CA 4BE1A 3NF9A 3WNHA 1TUYA 4CIFA 3AVGA 2NRHA 3AVJA 3VETA 4CEQA 1C0GA 4DV3K 4JHDA 4CD3A 1K8AO 2HVIA 3ZT4A 5ADXA 3OVNA 3HOSA 2O8DB 2D0PA 5IWAK 4FWRA 4YHHK 3OYMA 2UXCK 4N41A 3S5TA 3HK2A 2F9TA 3P4IA 4JK7A 2F8TA 3C6HA 3LP2A 1Z25A 4DSLA 5KPRA 4XH4A 4FOIA 4WFBL 4IEEA 4BROA 3DXMB 3NBPA 4KKOA 2ZD1A 3EE9A 4BR0A 5CZ2A 2P9NA 4DHYA 1QZ5A 3FLCO 3SBGA 2NRXA 2ITGA 4DB3A 3SZ2A 1Z6RA 3CPWM 2Y1JA 3K58A 5AFUH 1E4FT 4HVJA 3O4QA 2FBXA 4PKIA 1RBUA 2P5GA 4R79A 2XY5A 3AGRA 1C0FA 1W2BM 4OJRA 4M41A 2DFEA 1QZ6A 3CMEN 3GE1A 1ZBSA 1GOBA 4AQYK 2DPNA 2QW9A 3EN9A 3V4IA 4JV5K 4ID5A 1DGKN 3V9XA 5AR0A 2AJQA 1DKGD 3W0LA 4LC9B 5M1OA 1LWFA 2XHBA 2YV0X 2KZMA 2QXFA 4LY7A 3IS9A 4IG0A 4KTWA 4DQIA 2Z1JA 4O8KA 2QWMA 1KVBA 3DRRA 1M90O 1KLMA 3SJHA 1NGJA 4LH4A 5CE3A 4NLCA 2GEMA 4I9QA 2FSKA 4LSNA 4YOUA 3K0SA 3FZKA 2FBTA 4FK4A 4M63C 4JI6K 2YCHA 1BIUA 3DXKB 1QQMA 4M3RA 2KFZA 4FVUA 2XY6A 3TAFA 3OJSA 1T05A 3ID6A 1KQSM 1W9HA 1ZXOA 1VSFA 3QFUA 4I2QA 3UKRA 3VQ5A 3HOTA 2VCPA 4FPAA 4KV8A 3PLAA 4LF7K 2A1RA 1G15A 4ISEA 5C25A 3DJCA 2HNDA 1K8KA 1JXEA 1L3VA 1JJ2M 4AM7A 1VQMN 3CCQN 2F9WA 5HLFA 5AFUA 2UUBK 3M3ZA 3UIQA 3SLCA 2V7YA 1S9EA 4OLAA 3TTCA 4JKEA 1NJIO 2XY7A 3LWMA 2ZWHA 2OANA 3KK3A 2W6LA 2F7TA 4BVPA 3VOVA 5AZJB 3CF5L 4AILC 1IKWA 1U04A 4IFVA 4OLBA 4FWPA 2KKZA 1QHAA 4IJAA 4O8UA 4K0KK 4QAGA 1K9MO 2HBLA 2ASPA 5FPEA 3KHYA 1V4SA 3KK2A 1GLEG 4Q5VA 3LDOA 1XMQK 4CF8A 4FK0A 3BZKA 4H0PA 1IBMK 3S3MA 5KQ8A 3QLHA 1DTQA 4YOWA 3L6QA 4E19A 4H0OA 1M1KO 4NO7A 1WAJA 3FE1A 3ULEB 3MMVA 5E26A 4NYFA 1RTIA 1TK8A 1YTAA 4DQQA 2BDPA 3NH2A 4B9SA 1WSEA 2OYQA 2HHSA 1IV0A 1VRUA 4L3QA 2ZM6K 4JD2B 3VQQA 3RMAA 3SPYA 2DY4A 3CXCM 4CBXA 1RDUA 1YT3A 3EL2A 4LD0A 4RWTA 2P9KB 5C12A 4CK3A 3I33A 4EP5A 3MDQA 1NBWA 2BUPA 3ZYYX 3F5TA 3NVMA 2W40A 4H0VB 1NK4A 5FPDA 5M1KA 2P9UA 3WXLA 3O9RA 4PHTX 3T1YK 3O08A 1HQUA 4WYBA 5H1SQ 1NK6A 4IO8A 4DQSA 1A5VA 2IAJA 5ELZA 3BP8A 3R3LA 3KK1A 3CCMN 4FJXA 3O5BA 1V4TA 5I3UA 1S72N 1Q82O 4BWMA 2HHQA 2FBYA 4DV7K 3CYGA 3BEXA 1RT3A 5DK5A 3CG7A 3P83D 4CI6A 4CF2A 3OYHA 4DSKA 1NWKA 3OYFA 1UA1A 1BCOA 4BVOA 1EXQA 4CZLA 3TSQA 4JNEA 1RT6A 3RSEB 3O1WA 3I0RA 2IVNA 1FKPA 2NNWA 1UA0A 5EOYA 4W5OA 3LP1A 1NGDA 1BHLA 4B3SK 4F2SA 2YNHA 4G9ZA 1YITN 4WE1A 4B3MK 4B9MA 5JS1A 1J6ZA 3PUFA 3MEDA 1K73O 2E88A 1L5UA 4O55A 4H4MA 3NH0A 4JKGB 3IFRA 4H03B 4B1ZA 3KZBA 4CJUA 3CCEN 3L3UA 3S9HA 3O3FA 3VQ6A 5BN8A 3S41A 2OCEA 4LF5K 4AHUA 3WUHA 5KRTA 5M1NA 3ZSZA 5I9EB 1HJOA 4CF1A 3I8BA 5F1XA 3AVFA 4DV4K 2YI1A 3VQCA 1YIJN 3P38A 5C24A 2A42A 1G99A 4FJJA 3AVHA 3L2UA 1Z05A 5BRHA 5AQYA 3LL3A 3HVRA 2Q97A 1BG3A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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