3U87A

Structure of a chimeric construct of human ck2alpha and human ck2alpha' in complex with a non-hydrolysable atp-analogue
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYPVVKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Low-density crystal packing of human protein kinase CK2 catalytic subunit in complex with resorufin or other ligands: a tool to study the unique hinge-region plasticity of the enzyme without packing bias.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3u87A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3u87A02
1YQJA 4IAYA 1YVJA 2ESMA 4EORA 4FKIA 5LQFA 4CKRA 2PYWA 4QMOA 3QYWA 3TN8A 5A4LA 1J7LA 2JEDA 5K5XA 4MHAA 2IWIA 1YDSE 4DFBA 5IQHA 3KKVA 4WO5A 2X81A 3EN9A 3LJ0A 4U6RA 5KZIA 4YU2A 5HU9A 4NM7A 4EHZA 3C4EA 2OIBA 4N0SA 5BYYA 1OBGA 4GW8A 3GFWA 4IVCA 1PXPA 2W1DA 1G5SA 1NA7A 3PXQA 3DCVA 4L52A 4X2KA 4Z55A 4EOIA 4M68A 4E6QA 3I7BA 3P23A 3EQIA 3ZC5A 4UV0A 4TXCA 2CKQA 4AZEA 4DFXE 2J0MB 5LWMA 2BFXA 1P4FA 2C3LA 2UW4A 4FIGA 2X2LA 3D7TA 4X0MA 4MBJA 3QTSA 5DNRA 4FK3A 3ZC6A 4EZ5A 5E4HA 4IXPA 4FKJA 1RE8A 3G33A 4QMSA 4IAFA 3P7CA 4IZYA 4JBOA 4NCTC 5FM3A 4E4MA 4XP3A 5BYLA 1HOWA 2ZV9A 2ITWA 4NTSA 3LOKA 2YM5A 3FZSA 3ZFMA 4AS0A 3D5VA 4TWOA 4GT5A 1XH5A 4IAKA 3TV7A 3PLSA 3W1FA 2JFLA 3IECA 4L53A 3CCNA 4ZP5A 2W0JA 2OICA 4G34A 4QMWA 4YJTA 4FKLA 5D10A 3LKMA 3TXOA 3HKOA 4MXZA 4CNHA 5L2SA 2OZOA 3F5XA 2ITXA 3OXIA 4M14A 3R30A 4OGRA 3ROYA 1QCFA 3TDVA 4J8MA 1QPEA 3OT3A 1SVEA 4XNEA 3BYVA 4WNPA 4F7NA 5IDPA 5AJQA 3KVWA 4O38A 4QMPA 4RA4A 4O7VA 5IUHA 4C36A 2I0HA 3T9TA 4FG7A 2XNBA 3QHWA 1SM2A 2YABA 4GVAA 3BHYA 4JG7A 4IIRA 4JT3A 3ORMA 4WT6A 3SVVA 1GZKA 5FXSA 3QWJA 4FSUA 3HRBA 3KA0A 3V8WA 2GSFA 4DBXA 4LV8A 1H25A 1PMVA 2RG5A 2BHEA 4B8MA 4TYJA 3JS2A 3DDQA 5EOLA 2Y6MA 4DFNA 5AAFA 4D55A 2VX3A 3E8CA 2F2UA 5CSHA 1Y57A 3U51A 3OCTA 4QMUA 3D2KA 4BDKA 4KD1A 3TACA 3FY2A 5A4QA 2VNYA 3FMEA 1XH9A 1GIIA 3QX2A 4FMQA 4QT1A 4GK2A 3Q5IA 3ORLA 2OFVA 4MQ1A 3F6XA 3G51A 2C4GA 2HCKA 4KSQA 4C4FA 5I5ZA 3MH2A 1JVPP 4S34A 4U45A 5KO1A 2OGVA 3C4XA 1IAJA 5GNKA 3VULA 4TPTA 3I0QA 4D1SA 4XOZA 4K33A 2YWPA 3WE8A 2PPQA 2QR7A 3DLSA 3IDPA 3R7YA 3HV7A 4YMJA 4A06A 3I6WA 2UZEA 5HG5A 4C57A 3VW8A 1IEPA 3GU4A 3MY0A 3ZOSA 1P2AA 2Z2WA 5BVFA 3P08A 2XK4A 4MD7E 1KWPA 3EKKA 4DGGA 3FMMA 3OFMA 4D4VA 3OW3A 4QRCA 4CXAA 2J50A 3PE2A 5EYCA 3BLRA 4I5CA 4XBUA 3W8LA 3ZUTA 4EBWA 4O0RA 1U5QA 5FEEA 1I09A 4C34A 1PKDA 4WBBB 2C0TA 4I20A 1ZOHA 4ZSAA 3CBLA 2WKMA 4M67A 4CD0A 1XH8A 4E3CA 5CAOA 4AZTA 4AOJA 3ZMMA 4U8ZA 3G15A 5E8WA 1W8CA 5C01A 2EB2A 4YC3A 4FKVA 3QAME 4YURA 3TKHA 4F9YA 4FTJA 5ITAA 3ZU7A 2IVVA 2XNMA 4PMSA 3PYYA 2E9UA 5JGAA 2J0LA 3H10A 4TY1A 3QZGA 5CF6A 3ORZA 4FV7A 3DKCA 5CVGA 4O0UA 1H0WA 5L4QA 3UNKA 2FSLX 2CNVA 4ACMA 3QTRA 3MIYA 4PTGA 3LW0A 4EHVA 3UOKA 3UPZA 4ALUA 5EM8A 3BV2A 3LAUA 2BILB 3NX8A 3QD3A 3P4KA 3ZZEA 2PTKA 3ZLSA 3UG1A 5E8UA 5HX6A 4FTCA 2DWBA 3NWWA 5AFVA 3DZQA 3VC4A 3DBQA 4U80A 3VS2A 2J4ZA 2XKDA 3BCEA 3QTUA 3GOPA 3PUPA 4Y95A 3GCQA 4IM0A 4KKGA 4FVQA 4E6AA 3ZHPC 2P55A 2VWUA 2WOUA 3VRYA 4BHZA 4FV3A 3ZM9A 4PPCA 3BWFA 1UNGA 3R7UA 3BGZA 5AV1A 4Y83A 1Z9XA 2O65A 4J98A 4ZAUA 5C27A 5HI2A 5CAPA 3BI6A 3SXFA 3IW5A 2WELA 4F9AA 3DAEA 4FF8A 2YISA 5AR5A 3CY3A 1GNGA 2PHKA 3JY9A 5CANA 3DTCA 3MS9A 2GHLA 3NYVA 1E1VA 2ITOA 2YZAA 4JBQA 4Z7GA 1R0EA 3FKLA 5DR6A 5HE2A 1OUKA 2F7EE 4KA3A 4F4PA 3I60A 1UNHA 3LFDA 1YXVA 4YZNA 4HVHA 2ITPA 2A0CX 4XLVA 1ZYJA 2WHBA 2XIRA 3HV3A 4FOCA 4FZDB 2LAVA 4F0FA 2WPAA 4L9IA 4BBFA 4GFOA 4YHTA 3ZLWA 4UEUA 3LXPA 2G2IA 4J95A 3TG1A 3BEGA 3KF7A 4JS8A 2J0KA 3R28A 4YGAA 2WMBA 2Z7SA 2GHGA 3L8VA 3BE2A 3NS9A 4L7FA 3FI2A 4ZTMA 3NVMB 4FKWA 4CV8A 1BL6A 2EUFB 4IX3A 3NUAA 3TNPC 3U54A 3DB6A 2BRNA 3FMDA 5CVFA 3U9CA 3CTHA 2BAJA 5IEVA 4GYIA 3VQUA 2PZPA 4EOKA 3DB8A 2O5KA 3FZRA 3G5DA 4PPBA 5CEIA 4TWPA 4RQVA 1B38A 4O0SA 3DDPA 4AU8A 3E7OA 5FTOA 4TYEA 4D4RA 3UIXA 2QOLA 4ZTLA 4CT1A 1XR1A 1OI9A 1XKKA 4Q9ZA 4MBIA 2C3IB 3LM5A 2PE2A 4J7BA 4A9TA 3OTVA 4OTPA 5CSXA 4I92A 1ZY4A 4DH5A 5KMLA 2J51A 2YN8A 5EYDA 4M0YA 4EK3A 3TDWA 5LVLA 2XRWA 3NIZA 2V22A 1E9HA 3LFQA 2BALA 3LLTA 4CKIA 4ZTQA 1LUFA 4EQUA 2CHLA 2WTKB 4XJ0A 4GL9A 1VR2A 4E73A 2OF2A 2C6MA 4GUEA 4KUJA 2PVMA 3SLSA 1Q8TA 5AM7A 4AT5A 4EH2A 2YACA 3EYHA 4Y46A 5CXHA 5CI7A 1YRPA 3FZTA 4Y5HA 5BX0A 5AX9A 1BYGA 4EWQA 3G90X 5IQFA 5HGIA 4MYGA 4AFJA 2ZMDA 2OBJA 3R22A 5HVKA 4DG3E 4EOOA 3BPRA 3CKWA 4F6UA 5C9CA 4O27B 5H3QA 2ITZA 4A9UA 4CVAA 3BE9A 4J8NA 3HMOA 4F7LA 3VW6A 4LUEA 3UE4A 2YM8A 4TRLA 4CFWA 2GNHA 4AA5A 4QYHA 2VWYA 3Q9WA 4EH9A 2GS6A 3VUIA 5AUTA 4TN6A 2YZLA 4UMTA 2G1TA 4JR7A 4RFYA 4EC9A 3VUGA 5FGKA 5AADA 1Q5KA 3VBWA 4G16A 4WRGA 3VUTA 4FTUA 5F20A 3N4TA 4G6LA 3TJCA 3E87A 2QLQA 4M12A 3HUCA 4BZDA 5C26A 3HX4A 2JDOA 5ANKA 2VNWA 4CLJA 3BQCA 4IADA 2R3MA 3QCSA 3WBLA 3TV6A 4D2TA 3BBTB 4GU9A 3NDMA 4HZSA 3G6GA 3TKIA 1KSWA 3QC4A 4HVGA 5CTPA 5EM5A 3DOGA 5B2LA 1TQPA 3POZA 1PF8A 3U87A 1DAYA 4BWPA 3EQFA 4DH3A 5L2TA 2G2FA 3LCTA 4L3JA 4OBPA 4EC8A 1OL5A 1ZOGA 4EK6A 1YI3A 1M7NA 2QHMA 4D2PA 1PW2A 4AT3A 5AP2A 5D41A 4EJ7A 4JDKA 5FTQA 3E92A 3FI3A 1H26A 3QUEA 3WZKA 2VWBA 3QKKA 5LOHA 3ULZA 3CIKA 1M17A 3EQHA 4BDGA 5B2MA 5LMKC 1WBVA 5KKRB 2CSNA 4ASEA 4C2VA 5GIOE 4DEGA 5IQIA 2WTKC 1YHVA 3R04A 2W1GA 2VX1A 4AGDA 5AUUA 3KGAA 4EI4A 3IGGA 3I81A 2YM6A 4O82A 3F7WA 1XH7A 4I6HA 2GNFA 3HV6A 4FIIA 4ZS4A 2QI8A 3KXHA 2PU8A 1JPAA 4HYUA 1UKHA 4U40A 2JKOA 3ZSIA 4BICA 4PPAA 1PYEA 2GS2A 4L45A 5J9LA 1SYKA 5AUYA 3NAXA 4YHFA 2PMOX 4GK3A 3FPQA 4B6LA 5BUJA 4JBVA 1Q97A 5J5SA 5EDRA 2PVYA 3MVMA 2C5YA 5EHOA 3HRFA 3EQRA 3NCGA 3DK3A 3G9NA 4WOVA 5J79A 3C4CA 4OAUC 2J9MA 1W83A 3B2TA 3R7IA 4NM3A 1JSTA 4UXQA 3PPKA 4UYAA 4ZOGA 3MESA 2EU9A 2H9VA 4IM2A 3R21A 2W1EA 3R9DA 4HYHA 3TNWA 3HEGA 3F69A 3PSCA 3HA6A 2XK3A 5AAGA 1WBSA 3KRXA 5HCXA 4EZ3A 3NAYA 3DAKA 3TEIA 4EKLA 1IRKA 1ZZLA 4FTNA 4ASDA 4BI1A 5HIEA 3R1NA 5I0BA 3O96A 3U6HA 4J53A 4BF2A 5L2WA 3QRUA 2NPQA 4C38A 3UIUA 3RPVA 4IJPA 2VRXA 4U9AA 5HE3A 1H1RA 3F9NA 4HJOA 3WYYA 5H8BA 3UP7A 3PLAE 2YCFA 5EDQA 4ZTRA 4M69B 3IW6A 4CEGA 4DBNA 2GDOA 5J7HA 1QPDA 3V5LA 3CQEA 4MF1A 4GG5A 3TNHA 4NWMA 3NW5A 4ITIA 4TNDA 3FDNA 3UVRA 3FXXA 3RPSA 1KE8A 2X7GA 3SXSA 4H36A 4RIWB 3FAAA 4AZSA 4I41A 5KMOA 1MQ4A 2HAKA 4DC2A 3NNVA 3D15A 1YWNA 4XG6A 1H1SA 4G3CA 4KSPA 5HNBA 4GIIA 4AF3A 2XNPA 4BTMA 5KX8A 3DQWA 4OTFA 2E2BA 3BGPA 4RVMA 3TV4A 4O7YA 5JT2A 1WBPA 1ZYDA 2BAKA 3AGLA 1CDKA 3VF9A 5AEPA 3ALNA 4ZSJA 1YI4A 4FVRA 2WQNA 3HDNA 4RX5A 4FC0A 5L6WL 1P14A 1WFCA 3AQVA 3BKBA 1QMZA 2JITA 2PVKA 4GT4A 4TYGA 1WAKA 2BROA 4OBOA 3FZ1A 3JY0A 3VJOA 2XVDA 2YM3A 3QC9A 4PDOA 5ANDA 1QPCA 4DH7A 4ZY5A 3R9RA 1J1CA 4FT7A 3AC8A 1SMHA 4BDJA 2OF4A 4X3FC 4GJ3A 3R00A 4GUBA 3ZYAA 5DVRA 2C6KA 5HOAA 4IWQA 5J1VA 4KIQA 1YOLA 5EOBA 3OP5A 2YITA 3FMHA 2BZKB 1XBBA 1XHAA 5T6KA 5FDXA 5A6NA 3BQRA 3JYAA 3CTJA 5GHVA 4BCHA 4ITHA 3P9JA 2W5BA 2JC6A 2EB3A 4XG4A 4DINA 3RP9A 4QQTA 1ZMUA 2DS1A 4L3PA 1PY5A 4GU6A 4IDVA 4UMUA 3N4VA 1H1QA 3NZ0A 4HCVA 2P2IA 3TI1A 5H8GA 1S9JA 4OTGA 5ETFA 4AACA 4BDFA 5J8IA 3DU8A 4AZVA 3S00A 5H2UA 1H8FA 3WOWA 3ZS5A 4DGNA 2XK9A 4WUAA 2ITTA 3QRJA 4NUSA 5IZFA 2XNOA 3R6XA 4NJDA 5DT3A 1SZMA 2X7OA 3C0GA 2G9XA 2R3IA 1SVGA 1FOTA 1Y6BA 3E88A 4R3PA 4TYIA 5I3OA 5HE1A 2WEVA 5TO8A 1H24A 2VZ6A 3ZFYA 5F9EA 3OG7A 3LMHA 4ZTHA 3FQSA 5L8JA 4AE6A 2JKMA 3MVLA 4LV5A 3W2CA 4CMOA 5CNOA 3DNDA 4CZUA 4D9UA 2Y8OA 5A4EA 2RFDA 2YJRA 1TQMA 4K18A 3QHRA 4BN1A 4F08A 2PUNA 3HNGA 3E64A 2I7QA 1VZOA 2CKEA 3N9XA 1PXOA 3I5NA 4S33A 2C30A 4IM3A 5CQUA 4UZDA 4L01A 5AUZA 5TT7A 2HIWA 3NCZA 5CVHA 3P78A 2CGUA 5HEZA 2W99B 4PDSA 3VQHA 2VTTA 4YJVA 3VN9A 3ZO1A 4E4LA 4ERWA 3H9OA 4R78A 3SW7A 3E3BX 5HCYA 4D9TA 2CMWA 3KXZA 4U42A 4O0XA 2JKKA 1MRUA 3OHTA 5KCVA 1PJKA 3Q4ZA 3CQWA 4EK8A 2XEZA 2PUUA 2YM4A 3KC3A 2UW8A 3L9LA 4KKEA 1JWHA 4D1XA 1GOLA 3EN5A 5AX3A 3ELJA 4MQ2A 5ANGA 4OT5A 2CKPA 3PY3A 4X2NA 4TW9A 5AUWA 4RWLA 2VO3A 4E8AA 2HXLA 2XJ1A 4O1OA 1PXLA 4D4YA 5HTIA 3PJ8A 5E7RA 3RTPA 2YIRA 1W84A 3VUHA 1H08A 5IKWA 4GT3A 4I5MA 3C4WA 4YTIA 2QR8A 4H39A 4PNIA 3RNIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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