3U8XA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-29) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 18-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 112
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u8xA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u8xA03
1NGAA 1RFQA 4BR0A 2GEMA 5FPMA 3H1VX 2E2PA 2F9WA 2Q1NA 1NGGA 1BWFO 2D0PA 3WXIA 3MCPA 5AQWA 3ZETA 3R6MA 2E1YA 4K41A 4BR4A 2UYTA 1LOTB 4ISGA 1JCGA 3FGUA 3O80A 3GE1A 3BF1A 3A5MC 4FWLA 5AQUA 4MO4A 3RSEA 3UKRA 4IO8A 1E4GT 4BVOA 5KQ8A 4JHDA 3W3DA 5F0XA 3H3OB 2QWMA 3ZX0A 1QHAA 3P4IA 4H03B 3ULEB 2ASOA 4CZIA 3WXKA 5FPDA 3CQYA 2GWKA 3QBXA 3H3NO 1NGFA 4ISFA 3CHWA 4DHYA 3SK3A 1BA1A 2A40A 1GLJO 1JCEA 1T6CA 2CH6A 5AZJB 3G25A 3CJ1A 4M7YA 5AQRA 4FWKA 1YXQA 3VEXA 5BN8A 4FWRA 4HWIA 1XQSC 4BGAA 2Q2RA 2BUPA 2FSKA 4FL9A 3B8AX 1T6DA 4O8KA 5AQVA 3KZBA 3M3ZA 5AQIA 2E2NA 2VYPA 1EQYA 3AY9A 4E1JA 2VCPA 2P9LA 5BPLA 1V4TA 1GLLO 1MWKA 2W40A 3BP8A 1NGDA 3UKUB 3L4IA 2WUSA 1RGIA 2ASMA 3BEXA 4BGBA 3CJAA 4RCHA 3J8AA 3A5OC 4XH5A 3QICA 3LM2A 2CH5A 3ID8A 2P9SA 3WQUA 1R59O 3H1QA 2YHWA 3EZWA 1YAGA 4B1YB 3VF6A 1TUUA 3GBTA 3CETA 1C0FA 3O1BA 5BR9A 3HSCA 3L0QA 2A5XA 5BRHA 1TYQA 2A41A 4BRAA 3ZETB 1IJJA 4CD1A 2VWBA 3VETA 3O4WA 4XEIA 3FZLA 2V7ZA 1NGCA 3RSEB 4H5VA 1T44A 3UKRB 2P9IB 4JAXA 4JHDB 2KHOA 3IMXA 4BR2A 3VESA 1CZAN 3WQTA 1ZBSA 4H0TB 2GTDA 1MWMA 3MN5A 4AM7A 1ESVA 3O5BA 4PKGA 5AQXA 4FWQA 4B1ZA 3H45C 2Q0RA 4EFHA 3FLCO 3O8MA 4FWPA 2I7PA 1DEJA 4EIAA 1NWKA 3QMLA 5AQMA 2YCHA 1NBWA 2BTFA 3FZMA 3FR0A 4CBWA 5JICA 3EN9A 1X3MA 3CQXA 3H46O 3U8XA 4GNIA 4PKHA 4RWTA 1X3NA 4QS7A 3EKSA 4CBXA 1ATRA 4BG9A 5AQSA 3FE1A 2V51B 2CGLA 4NO7A 1XUPO 2D1KA 1GLBG 4FWNA 4BG8A 3MK6A 4BRIA 5AQLA 3CIPA 4PL7A 4QS9A 4A61A 4FWSA 2PAVA 2HF4A 3CJ9A 1V4SA 2HF3A 4BR9A 2P9LB 5BRDA 2QWLA 5FPNA 3ZX3A 4H0VB 2P9IA 1HPMA 4B9QA 3WT0A 1MA9B 3TU5A 2EWSA 3LDLA 1KAYA 2Q31A 2ZGYA 4CZJA 1LCUA 4BRLA 5E84A 2A3ZA 2GELA 5AQQA 4EHTA 2DPNA 3M6GA 4CBUA 2AP1A 2P9SB 5TKYA 2ZF5O 2QW9A 3VF2A 1SQKA 1HKGA 4BRFA 4BRDA 2D4WA 1NGBA 2QWRA 5AQJA 3GG4A 4JD2A 2NZTA 4A2AA 3GOIA 1Z05A 4K42A 3EO3A 3FZKA 2E88A 1MDUB 3VPZA 4CZGA 5FPEA 1TYQB 2IVPA 4CZKA 3QDKA 4H5NA 3ENOA 4BRCA 4CZMA 3SJHA 4LC9B 4F9OA 1OKJA 5AQKA 4A62A 5LJVA 4IJNA 4IXCA 4Y0WA 5ADXH 3QB0A 4WQ5A 3AAQA 5AQTA 4BRQA 2NLXA 4CZHA 5EVZA 5AQOA 2A6AA 2NRHA 5EY4A 2H3GX 2YI1A 4WYBA 5CE3A 5AR0A 2CGKA 1BU6O 3HZ6A 5KQDA 3I8BA 1P8ZA 4BROA 1GLCG 1NMDA 3U9DA 1IG8A 1S3XA 4K43A 4DCHA 2QM1A 2OANA 1HLUA 2FSJA 3LDPA 1YVNA 2FF6A 2FF3B 4DQ8A 5AQFA 4B1VA 3BUZB 2FSNA 3SMPA 3IFRA 4CD3A 1Z6RA 1KAXA 3LDQA 3R8EA 1SAZA 1ZC6A 3MN6A 3DXKB 4H5WA 3EL2A 4FWMA 3WUHA 5AQHA 3EKUA 4CZLA 4BC2A 3WEEB 4BR7A 2GUPA 3VEVA 3CJCA 4BRMA 3VOVA 3I33A 3DAWA 1GLDG 2IVNA 3ZEUB 4AM6A 3LDNA 5E26A 3GDQA 3KHYA 3VEZA 4BVPA 3HM8A 1QZ6A 4XH1A 3VF4A 3JS6A 3H6EA 4HTLA 4A2BA 5F2RA 1KXPA 1NGJA 4B1XB 2A42A 5I9EB 3DXMA 5AZIA 1U6ZA 1YUWA 4FWOA 5AQPA 3S41A 1HUXA 3M1FA 1GLAG 3C0BA 4IZ9A 3SMSA 2ZWHA 4JD2B 3L6QA 4PKIA 3QFPA 1X9JA 1ATSA 4FPBA 4NB4A 2YJFA 3LDOA 3C7NA 3LL3A 3DXKA 4WQ5C 2YJEA 5BRFA 2P9KB 1HX1A 5AQYA 1BDGA 3AAPA 5BPNA 5BREA 5AFUA 3WEEA 4FOIA 1ATNA 4EAHD 1KAZA 3WXJA 1XC3A 3VEWA 4BQLA 1J6ZA 3A5LC 3W0LA 3AARA 2QXLA 3ZEUA 3JXUA 2QWNA 4K25A 3HTVA 1GLFO 1BG3A 4H0XB 2P9UB 4WQ4A 2E20A 4BC5A 3VEOA 2CGJA 3IDHA 3HBTA 2IIRA 4XH4A 4KBOA 2P9PB 1S22A 3ENHA 4MLHA 3TPQA 3SLCA 4BRKA 5LY3A 2IVOA 4CZFA 1QQOA 2Q36A 2V7YA 1NGIA 1WOQA 3DWLA 4BREA 3D2FA 1NGHA 3R9PA 4BRNA 2AA4A 2QWQA 5F1XA 1BA0A 4FO0A 2P9KA 2HOEA 2E8AA 1U2VA 5EOYA 3ZX2A 5B8HA 1BUPA 1Q18A 1BO5O 3ATUA 3WXLA 2FLOA 1K8KB 1Y64A 5JLHA 5ELZA 5AQNA 5AQGA 5BPMA 3O6WA 3OHRA 3A8YA 1BOTO 3BF3A 3GL1A 2Q97A 3MN7A 5ADXA 3DJCA 1RDWX 3O08A 4PL8A 1TUYA 3MN9A 4YDUC 1QQMA 3U4LA 2J4RA 2P9UA 4H0YB 5JLFA 1ZXOA 3DXMB 5AZIB 1QQNA 4MO5A 2YHYA 2P9PA 4BRHA 4GY2B 3UE5A 3HI0A 2W41A 1E4FT 1QZ5A 4JN4A 5AQZA 4H5RA 2ITMA 5EX5A 1G99A 3ULEA 3C7NB 2I7NA 1D4XA 3VENA 2ZGZA 4DB3A 4I6MB 3CI5A 2QWOA 2P9NB 4QS8A 4Z94A 1GLEG 2YHXA 4M63C 3CERA 4O5FA 3VERA 3IUCA 1K8KA 2Q0UA 5EXWA 3D7EO 4FOEA 1HJOA 4B1WB 2F9TA 5AZJA 1HKCA 2E2QA 3FFKB 4H0PA 4JNEA 3FZHA 5KPTA 1HKBA 2GWJA 3D2EB 4IJAA 4IWVA 4WQ4C 2FXUA 4J8FA 3MMVA 4BC4A 2ASPA 3VGMA 4CI6A 4EHUA 4BRPA 3CJ7A 1SZ2A 3UB5A 4M7XA 1H1VA 3FZFA 3QBWA 4BC3A 4YDUA 2HMPA 2D0OA 3LM9A 3F9MA 4MLEA 4FPAA 2V52B 5KPZA 1WUAA 3UKUA 4H5TA 5JMVA 5LJWA 3O1WA 3VEYA 4ISEA 1JCFA 3ATVA 3VGLA 1DKGD 3D2FB 4L3QA 3KVGA 5KPRA 3MDQA 3A0IX 4I6MA 1C0GA 2P9NA 4B1UB 4BR5A 4BRGA 1DGKN 1U2VB 1NLVA 5BN9A 4BQZA 4FSVA 4CZEA 1NGEA 3VGKA 2E2OA 2E1ZA 3QFUA 4RTFD 3U9ZA 4CJ7A 3A5NC 4C23A 2QWPA 1NM1A 4H0OA 2PBDA 3D2EA 3CJBA 5AFUH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NGAA 4FJ9A 3E9OA 4O44A 4DV7K 4BR0A 3O3GA 4Z4IA 5FPMA 3H1VX 2E2PA 2JWLA 4KTWA 3OYNA 1BWFO 4JKCA 3V81A 3U6FA 2OPQA 1B9FA 1O1WA 1VQ8N 1L5UA 5J2MA 2UYTA 4JI2K 4ISGA 4DLGA 3O80A 3RSEA 4FJ7A 4FWLA 4DFMA 3UKRA 4F3OA 3DLGA 2QK9A 5F0XA 2HNYA 2HNDA 1BQMA 2QWMA 4FK4A 1QHAA 3NF8A 3C6UA 2JLEA 3QESA 3KLEA 1YJNN 1JLBA 1OH8A 4FLXA 2W42A 4BE0A 3CQYA 3VQ4A 1Q9YA 2HHIA 4YOXA 3H3NO 1NGFA 4ISFA 3CHWA 1C0TA 4Z4GA 4C8OA 2BDPA 1BA1A 2A40A 1ASUA 2CH6A 3G25A 4CHPA 4YOVA 2RN2A 4FWKA 5BN8A 5I3UA 3AVNA 3UIQA 4FWRA 4HWIA 4BGAA 2KLAA 1S6QA 4Z0UA 3PIOL 1J5EK 4E1JA 4KH6A 3NGIA 3THXA 2P9LA 2Z1GA 3F5TA 1LAWA 4JI5K 3L4IA 2WUSA 3PO5A 3VA0A 2X6NA 4CJSA 4BGBA 5CY4A 2IS3A 4DSKA 3J8AA 4JV5K 3QICA 2DFEA 2O8CB 2NRVA 3TSUA 2O8EA 2CH5A 4FJNA 2NRXA 1R59O 3K58A 3JAMO 4JLHA 1YAGA 2YNIA 1W7AA 1RTJA 1SL1A 1IKYA 2YNFA 5BR9A 2BE2A 3E66A 2VG6A 4H4MA 4XJXA 3RRGA 4BRAA 3ZETB 4CD1A 1RBUA 3NVMA 1D9FA 4YOWA 3RMDA 3FZLA 4BACA 1NGCA 1RILA 4H5VA 3CPEA 3O9TA 1TK5A 2KZMA 2ZJQL 4B08A 3THYB 4QAGA 4KH5A 3HK2A 1S1XA 3P5JA 3TTDA 3IS9A 4BR2A 5J2NA 5KRSA 3U3YA 2FBTA 2VGMA 3KD1E 3MN5A 2OPRA 1ESVA 2RPIA 4A5BA 5AQXA 3CMEN 4FJ5A 3KTQA 3O8MA 2A1SA 3QMLA 3SYZA 5LMUK 2BTFA 3Q7BA 3FR0A 4CBWA 3MEGA 3H46O 3CM6A 3OYIA 1KTQA 4DUYK 2E5LK 4O55A 5M1FA 3EKSA 4BG9A 3T7ZA 5AQSA 3RVCA 5M1KA 3OJUA 3MK6A 1UA0A 4PL7A 3EE9A 3P1GA 4ILGB 2O8BB 4E1MA 2PAVA 2HF4A 2HF3A 5MLCQ 2W6LA 1W97L 1U49A 4H0VB 1FJGK 3WT0A 1IG9A 5DM6L 4N41A 4RW6A 3SV4A 3I55N 5KGWA 3O9QA 5E84A 4IOCL 2XHBA 4CJEA 2GELA 1RT3A 4IFVA 4CFCA 4LF9K 2AP1A 4UY8O 1M90O 2P9SB 2ZF5O 1HKGA 4EZ9A 3DOKA 2PZSA 5GIOA 1WAJA 4JD2A 5KRTA 4A2AA 1NU0A 1Z05A 3ZT2A 3I0RA 2Z1JA 4BE7B 4DSJA 3EO3A 4QOZB 3ZT4A 1REVA 4JS5A 1WBBA 4AHCA 3VPZA 5FPEA 3CCJN 1SL2A 4DTMA 1BI4A 4H5NA 3OTOK 4A62A 4CJUA 5LJVA 4Y0WA 4J2EA 4LFAK 4EZ6A 3M8PA 5DMRA 5EVZA 3TWHA 3AVHA 3K5MA 3QNOA 3PO4A 2NRHA 4LF8K 3CCRN 4JI4K 4DFPA 5AR0A 1BU6O 2OA8A 1WAFA 2RHKA 1DTQA 4ELVA 1KVBA 4DCHA 5GAHP 1S5JA 2HHTA 2FF3B 3KD5E 4DQ8A 3BUZB 3V9SA 3IFRA 1L3UA 5HRSA 3R8EA 1RDAA 4FLWA 1ZC6A 3MN6A 5J1EA 3K5LA 4H5WA 3EL2A 4FWMA 3LAMA 5HRRA 1XNQK 2LSNA 3EKUA 4OVLA 4CZLA 4DTUA 4J2DA 4DV5K 2G8VA 4BC2A 1ZBLA 3HO1A 4CF2A 4JKFA 1XI1A 4JKAA 3VEVA 3J7AP 4BRMA 3I33A 1UAXA 3DAWA 3ZEUB 4AM6A 4BVPA 4HHTA 4XH1A 3HL8A 1XWLA 1WSHA 4A2BA 3NH2A 5F2RA 1NGJA 1IH7A 2A42A 5I9EB 3K9JA 3DXMA 3DLHA 4YOYA 1WSGA 1RDCA 2HHQA 4IZ9A 4LSLA 4O8UA 4FJGA 4BDYA 1TK8A 4FPBA 3TARA 3LL3A 5GIPA 3V9ZA 2OCEA 3THVA 4NLBA 5BRFA 1HX1A 1NK5A 5AQYA 1BDGA 5BPNA 1GOCA 3WEEA 4KHYA 3V9WA 3VQAA 4BQLA 3VQCA 3A5LC 4H8KA 4DSIA 1QSLA 3AGRA 1WLJA 4Y1DA 3AVCA 4NCBA 1BG3A 4Z4CA 1N8RO 3NVKA 3PX6A 3ULDA 4WQ4A 2E20A 5T7BA 1WN7A 3HBTA 2JWKA 2P9PB 3RR8A 4GW6A 5HP1A 4GV3A 3R1XA 2YHAA 2F7TA 1QQOA 2Q36A 1BIUA 1MU2A 4KH4A 1WOQA 3DWLA 1JLAA 1NGHA 3U3GA 3JSMA 4CGFA 2A1RA 4GKKK 3LWMA 1VSHA 3AO1A 3CFRA 2P9KA 1OH7A 5EOYA 1BUPA 1HNVA 1T7PA 2FLOA 3I56N 3L2RA 4DUZK 3GL1A 2QI2A 3DJCA 3HPOA 3SI6A 4LFCK 4PL8A 1TUYA 1OVQA 3CCLN 4CIEA 4ELTA 4I2QA 3N4PA 1YVUA 4KV8A 3VTIA 1NJIO 3HP9A 2ZM6K 3QEPA 4B9VA 2YHYA 3AVJA 4BRHA 4GY2B 3UE5A 2FBVA 1YHQN 1VSFA 1E4FT 1RT1A 5AQZA 4H5RA 3NE6A 1N6QA 1OH5A 3C7NB 1S9EA 2ZGZA 3CCEN 3KIOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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