3U9DA

Crystal structure of a chimera containing the n-terminal domain (residues 8-24) of drosophila ciboulot and the c-terminal domain (residues 13-44) of bovine thymosin-beta4, bound to g-actin-atp
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
366
structure length
357
Chain Sequence
TALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Contractile protein, protein binding
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title How a single residue in individual beta-thymosin/WH2 domains controls their functions in actin assembly.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 107
structure length 357
sequence length 366
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3u9dA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3u9dA03
1RDWX 3S41A 3DXMA 3GG4A 4BRLA 4CBXA 2P9PA 5KPTA 4O5FA 1V4SA 2P9SB 4EHUA 2W41A 2IVNA 3UKRA 3VPZA 3VEOA 5BN8A 1NGFA 4BQLA 4BR9A 3GE1A 4WQ5C 4CZKA 4K43A 3FE1A 4JN4A 1YAGA 3D2EA 3BF1A 3SLCA 1MWKA 2E2PA 3MN6A 4WQ4C 5F2RA 2A41A 3A5NC 3LDLA 3CQXA 3LDQA 2P9UA 2Q31A 5AQLA 1CZAN 1ATSA 3BF3A 1KXPA 4MO5A 1T44A 1YXQA 4NO7A 4RTFD 4Y0WA 1D4XA 3EL2A 3TPQA 3H3OB 3MN5A 5AZIA 3H6EA 3R6MA 1X9JA 3MDQA 1SQKA 4BRNA 4FO0A 4DQ8A 5AZJB 5AQSA 4FOIA 4CD3A 1T6CA 3OHRA 3CI5A 1IG8A 2E2NA 2V7ZA 2QWRA 5FPNA 1YUWA 4GNIA 4BGAA 3F9MA 3AY9A 3QBXA 1ATNA 3C7NB 2F9TA 4FWSA 3RSEB 4EAHD 4BGBA 1GLAG 3QFUA 3MN9A 2A3ZA 3CERA 5EVZA 4BC2A 5BRDA 5JLHA 2CGKA 2FSKA 1Z05A 3BP8A 3D2FA 3H1QA 3ENOA 3LM2A 3EN9A 4H0XB 3FR0A 5AQPA 4A61A 1U2VB 1R59O 3CHWA 3FZFA 1X3MA 3DAWA 4H0PA 2FF6A 4CZHA 1KAYA 1HPMA 1C0GA 3WUHA 4CI6A 5F1XA 4J8FA 1GLBG 3WEEB 1XC3A 5ADXA 2Q1NA 2Q0UA 2P9NA 5BREA 4PKHA 3B8AX 1JCGA 4BVOA 3ZETB 3TU5A 1U6ZA 1BU6O 4WYBA 3H45C 4AM7A 2D4WA 1KAXA 2KHOA 4M7YA 3G25A 3ZEUA 2YHXA 3FFKB 2E1ZA 2I7NA 1NGBA 5AFUA 2F9WA 3SJHA 5EXWA 1S22A 2QXLA 2H3GX 4BC3A 3P4IA 2P9IB 4DHYA 4BREA 3VEYA 1H1VA 1K8KB 1QQNA 3EO3A 3SMSA 4CZJA 2P9LB 1QQOA 3VEWA 1LOTB 1X3NA 4BRIA 2OANA 2AA4A 3ATUA 2P9SA 4FWPA 5AQGA 1EQYA 4MLHA 5AQRA 5AQKA 4JHDB 2GTDA 3ZX0A 2YJEA 4I6MB 4L3QA 4BR2A 1QZ6A 2VCPA 3FZHA 1QZ5A 2YI1A 4BRFA 4CZMA 2GEMA 3ULEB 1C0FA 4PKGA 5BRFA 1TUUA 4ISGA 1RFQA 4BR7A 3QDKA 1T6DA 4JNEA 3C0BA 5CE3A 1V4TA 3O4WA 4IJNA 5BRHA 3HBTA 4ISFA 1JCEA 2P9KB 1ZC6A 3WQTA 3WQUA 2D0PA 2QW9A 1TUYA 1NMDA 1MDUB 3AARA 4BRQA 2HF4A 4EIAA 2YCHA 3WT0A 3LDNA 1HX1A 2QWNA 5KPZA 4IZ9A 4PKIA 4CZFA 4H5NA 5AZJA 5AQMA 3U9ZA 4H5TA 2W40A 3A5MC 3CJAA 4B9QA 1SZ2A 1GLEG 3ID8A 2A5XA 5E26A 1GLLO 3DXMB 2E88A 3MK6A 2Q97A 3C7NA 4YDUA 2NLXA 4FSVA 3RSEA 3GOIA 3VEVA 1QQMA 3FGUA 3UE5A 3R8EA 3O08A 4BRCA 4PL7A 4BRMA 3A5OC 2ASMA 2YHWA 3ATVA 4BVPA 1E4GT 1RGIA 2CH5A 3HZ6A 2Q2RA 4H0VB 5FPMA 5LJWA 3IMXA 5EY4A 4FWNA 4M7XA 4FWOA 3VEZA 1NGHA 1BO5O 4XH5A 4F9OA 3WEEA 1BUPA 2A6AA 3ZX2A 2PBDA 4ISEA 2GUPA 3M6GA 2P9UB 1HKGA 2ZWHA 4BC4A 4FWRA 3KVGA 5AQTA 3EZWA 5AQXA 3W0LA 3UB5A 3D7EO 3VESA 3ZETA 4JAXA 2I7PA 3DJCA 4XH4A 2CGJA 1BA1A 2UYTA 4HTLA 3I8BA 4YDUC 4DB3A 5JICA 2AP1A 3KZBA 4FWKA 3VGLA 2IVOA 5ADXH 1HKBA 1HKCA 4JD2B 2E1YA 4FPBA 1NGJA 3FZLA 2QWMA 1HUXA 2D0OA 2E2OA 4QS7A 1HLUA 3WXJA 5AQYA 5BR9A 4CBUA 2FSNA 2P9IA 3EKSA 3VERA 2CH6A 2EWSA 2A40A 2P9LA 1P8ZA 4BC5A 5KQ8A 4IJAA 5AFUH 2A42A 4H03B 4IO8A 2QWPA 3U8XA 3D2FB 4JHDA 5FPEA 1Y64A 2V51B 3A0IX 4I6MA 3U9DA 1J6ZA 4KBOA 2E2QA 4BG8A 4BRKA 4NB4A 3UKUB 3JS6A 3ULEA 3VENA 4EHTA 1GLJO 5AQFA 1JCFA 3VF4A 4BRHA 4FWQA 3VGMA 4A2BA 3VOVA 1BA0A 1NGAA 4BG9A 3GBTA 3MN7A 4BROA 4K25A 1WUAA 3CJBA 1KAZA 5AQHA 3FLCO 4B1ZA 1E4FT 2E8AA 3EKUA 4H5RA 4B1WB 2QWQA 1NGIA 2ZGYA 1MA9B 3H3NO 2IVPA 4B1VA 5F0XA 4AM6A 3L6QA 4MLEA 2ITMA 4IXCA 3QB0A 2HOEA 2VYPA 1XQSC 3IDHA 5AQQA 5BN9A 2ZF5O 1G99A 2PAVA 3CJ7A 1ATRA 1TYQB 5AR0A 1ZBSA 2ASPA 1WOQA 4CZGA 4BR0A 5AQWA 4FL9A 4QS9A 3O80A 2GWJA 3DXKB 5LJVA 2V7YA 3I33A 3O1WA 1LCUA 4FOEA 1ZXOA 4EFHA 3U4LA 4H5VA 3AAQA 1NWKA 3AAPA 2NRHA 4FWMA 3LL3A 2P9PB 4BR4A 4GY2B 5I9EB 2IIRA 3H46O 3R9PA 3UKRB 5LY3A 3CQYA 2FLOA 4CZIA 1XUPO 3KHYA 5AQNA 4LC9B 4FWLA 2Q36A 1ESVA 4BRGA 5FPDA 1OKJA 1NBWA 2GELA 5AQJA 3QICA 4H0TB 1GLDG 2GWKA 3ENHA 1NGEA 3M1FA 1U2VA 3H1VX 4RCHA 5EOYA 3HTVA 2ASOA 5JLFA 2FXUA 4A62A 1S3XA 3O8MA 5BPLA 3D2EB 1NGDA 5ELZA 3VGKA 3M3ZA 4H0OA 1DGKN 2J4RA 3GDQA 4PL8A 5AQVA 1MWMA 4JD2A 3VF2A 4C23A 3L0QA 1NLVA 1DEJA 2D1KA 4MO4A 2BTFA 3HM8A 1IJJA 1SAZA 3W3DA 4E1JA 4BR5A 4M63C 3QBWA 4CD1A 2QM1A 3QFPA 3O1BA 3WXLA 2VWBA 3CJCA 3MMVA 5AQOA 5AZIB 2QWLA 4B1YB 3VETA 2FSJA 4K42A 5E84A 3IUCA 3A5LC 1DKGD 2YJFA 4FPAA 4IWVA 4H0YB 5JMVA 2FF3B 5KPRA 1Q18A 1K8KA 4DCHA 4CBWA 4BRAA 4CJ7A 5BPMA 5TKYA 3HSCA 3MCPA 3FZKA 4O8KA 3UKUA 3DWLA 4Z94A 4BQZA 3HI0A 1Z6RA 1NM1A 2DPNA 4RWTA 1BWFO 3CETA 5EX5A 3O5BA 3LDOA 5AQUA 3A8YA 3BEXA 4B1XB 3BUZB 5BPNA 3CJ9A 4XEIA 4BRDA 3WXIA 5AQZA 3GL1A 2CGLA 2P9NB 4BRPA 1GLCG 3LDPA 4H5WA 3FZMA 2HMPA 3VF6A 3LM9A 2Q0RA 1NGCA 1QHAA 3VEXA 4A2AA 2P9KA 2QWOA 4WQ5A 2WUSA 3QMLA 5AQIA 2E20A 4HWIA 1NGGA 1YVNA 3CJ1A 3ZEUB 2BUPA 3JXUA 1TYQA 3SK3A 3ZX3A 1HJOA 1BG3A 5KQDA 3SMPA 4QS8A 2ZGZA 3DXKA 1BOTO 4WQ4A 5B8HA 2HF3A 3O6WA 2V52B 2NZTA 4XH1A 4CZEA 3WXKA 3L4IA 1BDGA 1GLFO 2YHYA 3J8AA 3IFRA 4B1UB 3CIPA 4K41A 4CZLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NK9A 4CGGA 3GG4A 3NBPA 5KPTA 4O5FA 3ID6A 3T1YK 2W41A 3UKRA 5D3GA 3M8QA 3ZT1A 1N33K 3OYDA 1VHXA 2VG5A 4Q0BA 1VQ9N 3FFIA 3GE1A 4WQ5C 3L2WA 2RKIA 2PY5A 1NJZA 4KRFA 4FCYA 1OVQA 1YAGA 1HNVA 3D2EA 3QLHA 3J7YP 3BF1A 2KZMA 3SLCA 1T8EA 1MWKA 4JS4A 4OKKA 3CYGA 1XHXA 2ZM6K 3CQXA 2P9UA 1TAUA 4W5NA 4A57A 4E7JA 1ATSA 4DR4K 1T44A 4FJLA 3U3GA 3TPQA 3H3OB 4CF1A 1NG9A 4JLHA 3PO5A 1X9JA 3MEDA 4FM1A 3V9SA 1IKXA 1EWQA 3TAFA 5LL6Z 3TTDA 4FO0A 2YKNA 3TR8A 3DLHA 3IS9A 4CJUA 3KD5E 3V81A 4DF8A 3JYTA 1DT9A 2V7ZA 4CK3A 3MXMA 5FPNA 2G8VA 3AY9A 1WAFA 1ATNA 2I5JA 4FWSA 4CJVA 4GV9A 5C24A 5E41A 2A3ZA 5BRDA 4DFMA 3BP8A 2FSKA 3H1QA 1JL1A 3EN9A 5HROA 3V9WA 4E7IA 1QVFM 4BACA 3FZFA 1KFSA 3CG7A 4NCGA 2HVHA 2G8FA 3KK7A 3SQ0A 3NH2A 1GLBG 3OYNA 3E9LA 5I3UA 3B8AX 1SL0A 1EO1A 2O8CA 4CEFA 1JJ2M 3TU5A 1KSPA 1BI4A 1BU6O 1C1BA 4R5PA 1KAXA 4PWDA 3CCVN 2E1ZA 2I7NA 4Q5VA 5EXWA 2NNWA 5DM6L 1RT5A 3EZ5A 2P5GA 3DMJA 4E3SA 4BREA 3CPWM 1QQNA 1LOTB 1WLJA 4M3WA 3SUNA 2HNZA 2OANA 2HVIA 4DTJA 1UA1A 3LP0A 5AQGA 2YNFA 2HBJA 1EQYA 5AQRA 3THYA 1NK6A 1WB9A 4LFAK 3E66A 3O9TA 4DFKA 4OGEA 3FZHA 2OYQA 1LAVA 3QETA 1QZ5A 2YI1A 4DU4A 3THXB 1E3MA 3ULEB 5BRFA 4ISGA 3LZJA 1RFQA 3R3LA 3TAPA 5A2QO 1N8RO 3C0BA 4M3RA 4EP4A 5BRHA 2NRWA 3QERA 1VQLN 3V9ZA 3OYHA 3WQUA 2QW9A 4FW1A 3OY9A 4O55A 3S3OA 5J2PA 1JLGA 2HF4A 4PUOA 4OPKA 4KHNA 1HX1A 4CZFA 3OYEA 5KGXA 4FLYA 3VQQA 3OYFA 2W40A 3A5MC 4V19S 3OJUA 1C0MA 5JS2A 3KJVA 1GLLO 1HNWK 4KHWA 2Z1HA 3C7NA 2NLXA 4FSVA 1OH7A 4E7HA 3VEVA 4K8ZA 1QQMA 4HHTA 3ZT4A 3DLBA 4C1NK 1YT3A 2ASMA 4DU1A 5C25A 1TL3A 2Q2RA 4H0VB 2HHTA 1JLBA 5LJWA 1YJNN 4BE7B 3VEZA 1NGHA 3B6PA 4H4MA 3WEEA 2F4VK 3ZX2A 3TTFA 3HM9A 1EXQA 5C2FA 4BC4A 1HRHA 3VQCA 4JAXA 3AA5X 2I7PA 1BA1A 4DB3A 3I8BA 3KZBA 4DTRA 4CJ3A 4OPAA 1VK0A 4W5RA 2E2OA 4QS7A 3WXJA 1HLUA 3K5NA 1IBMK 4CBUA 1LWEA 2FSNA 3EKSA 5GIPA 1GOCA 4ILHA 1G15A 2CH6A 3CCMN 2ZD1A 2EWSA 4CGHA 4HCBA 1QVGM 4CFCA 3OYAA 5KQ8A 4A5AA 1LAWA 5M1OA 4AHTA 4DLEA 1LWCA 3S3MA 1VQON 4DSIA 1Z26A 4O8UA 4B9SA 4H03B 3ISNC 1OH6A 4IO8A 1TK5A 3U8XA 4YOWA 1Y64A 3A0IX 3NDKA 5I42A 3CYMA 4DTPA 3QEIA 1D5AA 5HRRA 2FBXA 1OH5A 4BRKA 3IAYA 3UKUB 3JS6A 1VQMN 3LP1A 2O8BB 4EHTA 1GLJO 3LZIA 1RBSA 3VF4A 5J2NA 5FLXO 1I94K 1NGAA 3GBTA 3MN7A 4BROA 5CR4A 2RF2A 3AA3A 1WUAA 4KI4A 1CZ9A 2HSTA 4NCBA 1T7PA 4JKDA 3S9HA 1NKCA 4B9VA 2HHXA 3EKUA 4AH9A 2HHVA 4NYNA 1NGIA 2ZGYA 2ZJQL 3NH1A 3KKRA 4B1VA 4AM6A 3V4IA 4IXCA 4NXMK 4FXDA 4CEEA 2HOEA 3T3FA 4OGCA 2EX3A 3KTQA 3AVAA 5AR0A 2ASPA 5AQWA 2HHWA 1VSJA 4YY3K 4LFBK 3I33A 4JEPA 3ZSYA 1CXUA 3PIOL 4CW7B 4FJGA 1XMQK 4MFBA 1NWKA 4FWMA 2UXDK 4BDYA 2P9PB 4BR4A 4YORA 1SUQA 5I9EB 3R9PA 4AQYK 3CQYA 5AQNA 1D9DA 2Y1IA 1ESVA 3HOSA 4LF7K 2GELA 3QICA 1GLDG 1IKYA 2GWKA 3ENHA 4O0JA 3H1VX 3JSMA 5EOYA 4ZTJA 3HTVA 3TARA 2FXUA 3O9SA 5BPLA 5ELZA 4JI7K 2VQFK 1RT4A 3M3ZA 4H0OA 2J4RA 4PL8A 4DTXA 2OPRA 1ZBLA 4JD2A 1OH8A 1WAJA 2D1KA 3MX2A 4CJFA 4DV6K 4B9TA 2BTFA 4KB0A 3HM8A 3PUFA 1HR0K 1OVYA 3QBWA 2D5RA 4FJ9A 2O8DB 2QM1A 3QFPA 3SUQA 3O1BA 2HHIA 3NGIA 2OPPA 2VWBA 3CCLN 3MMVA 4WFAL 3ZSXA 1NJIO 4M41A 2F96A 4WFBL 1DLOA 3G0ZA 2FSJA 4K42A 3A5LC 4LF9K 1DKGD 5C0YA 4HVJA 3S3NA 2D0BA 3I8DA 2XY6A 4QOZB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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