3UB5A

Profilin:actin with a wide open nucleotide cleft
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, cytoplasmic 1
publication title Structural basis for profilin-mediated actin nucleotide exchange.
pubmed doi rcsb
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ub5A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ub5A03
2NRHA 3GL1A 4BVPA 5KPTA 4EFHA 3GOIA 1TUUA 2QWNA 3IDHA 5CE3A 2E2PA 2IIRA 1MA9B 4FPBA 4BG9A 2E88A 4ISEA 4CD3A 1DEJA 3S41A 3LL3A 2GWJA 4CZFA 3AY9A 2QW9A 1XQSC 3CJ7A 1HKGA 1C0GA 3M3ZA 2ASMA 2P9KA 3H1VX 3ID8A 3CQYA 3GDQA 3ENOA 1GLEG 4BC5A 1YAGA 1U6ZA 4IJNA 5ELZA 3VF4A 4LC9B 4IZ9A 3VF2A 4B1XB 2YCHA 3R8EA 4BR5A 1NBWA 1XUPO 3CQXA 3A0IX 2KHOA 3O1WA 5EXWA 2HF3A 2P9SA 3VEXA 1NGEA 3H46O 5KPRA 1WOQA 3WEEA 5AZJB 3SK3A 2FSNA 5AFUH 3FZHA 4BRIA 3FZFA 4RCHA 3CJCA 2P9LB 3QBXA 3EO3A 4CZKA 5AQGA 4KBOA 1RDWX 3LM2A 2YHYA 1HLUA 2DPNA 3FLCO 2UYTA 5FPEA 3P4IA 4XH4A 2QWMA 3WXIA 4FWQA 1GLAG 1NMDA 3RSEA 3KVGA 4M7XA 3VPZA 4BGAA 2V7YA 1MWKA 4FL9A 2P9UB 3H45C 1XC3A 4PKHA 3UKRA 4BC2A 4DHYA 2P9PA 4CZGA 3ZEUB 5JICA 4BRQA 5AQHA 5F1XA 4JD2B 1R59O 4B1VA 2H3GX 2Q0RA 4BRDA 3DXKB 4QS8A 3MK6A 4DQ8A 4CZLA 3J8AA 4WQ4A 3MN5A 1NGHA 2E8AA 3VEYA 2CGLA 4YDUA 2E20A 3O1BA 2HOEA 3EKUA 2V52B 2Q36A 4BREA 2E2QA 2P9LA 4BRGA 3FZLA 2A40A 5TKYA 4H03B 3ZETB 4H5VA 3VETA 4A2BA 3UE5A 4BC4A 1Z6RA 5KPZA 1D4XA 5AQTA 3SMSA 4CI6A 3A5NC 3DXMB 1Q18A 1YUWA 3ENHA 2D0OA 4GY2B 3BUZB 2P9UA 4JNEA 2D0PA 4FPAA 4B1ZA 2V7ZA 3QMLA 3CJBA 2FSKA 5AQRA 3W0LA 1GLFO 1K8KA 4JAXA 4XH1A 3ZEUA 3KZBA 3R6MA 4BRKA 4JD2A 4BQZA 4H5NA 1GLLO 5AQKA 1X9JA 3WXLA 5F2RA 4DCHA 5AQVA 1QQMA 4IWVA 3TU5A 3W3DA 4ISFA 1YVNA 2CGKA 3LM9A 4ISGA 2I7PA 1QHAA 3AARA 5FPMA 3VERA 2Q1NA 5AQZA 3VESA 3L0QA 5BRHA 3D2FA 5AQOA 1HPMA 3CIPA 4CZJA 2YHWA 5AQLA 1ESVA 3ZETA 3ZX3A 2D1KA 4F9OA 1ATSA 4FWOA 2GEMA 4CJ7A 5EOYA 2A42A 1J6ZA 1LOTB 3QBWA 1ATRA 2FSJA 2P9IA 1JCFA 2GELA 3A5LC 2A41A 5AZIB 5EX5A 5BN9A 3WXKA 3H6EA 5BPNA 3U8XA 1ZXOA 3DJCA 1U2VA 1HKCA 1JCEA 5F0XA 3I33A 3UKUA 4GNIA 3H3OB 2F9TA 3AAPA 1IJJA 3WQUA 3VENA 4FOEA 5AFUA 3R9PA 3G25A 4JHDB 4CZIA 3MMVA 1H1VA 4WQ4C 4BGBA 3QFPA 3WT0A 1TYQB 3A5MC 1QZ6A 4YDUC 1NGIA 3UB5A 5JLHA 3ULEB 4M7YA 2FF6A 4CZMA 4IJAA 3WXJA 4FWLA 5BR9A 5FPDA 3CHWA 3WQTA 4M63C 2PAVA 4E1JA 4J8FA 4H0XB 5KQ8A 2A5XA 3ZX2A 4BRHA 2J4RA 3BF1A 4BRNA 3C7NB 1NGBA 2ASPA 2VCPA 3ATUA 2W40A 3KHYA 2ZGZA 3GG4A 5AQUA 2VYPA 1NM1A 2QWRA 2V51B 3ATVA 4BR0A 1SQKA 4JHDA 4PKIA 3CETA 4BR7A 4CZEA 1QQNA 1TYQA 3O5BA 4CBXA 3VGLA 4BRFA 4BRCA 4BR2A 2VWBA 3EKSA 4B1UB 3MDQA 3MN9A 1YXQA 2IVNA 3VEZA 3HTVA 2IVPA 4QS7A 5AZJA 2Q2RA 1KAZA 3HZ6A 5BPMA 1CZAN 3LDPA 2NLXA 3SJHA 4MO4A 1V4TA 3LDOA 2AA4A 1KAYA 2AP1A 4O8KA 4FWPA 4IXCA 3FE1A 1GLJO 1S22A 2QWLA 4AM6A 2PBDA 5KQDA 3BEXA 1SZ2A 4EHTA 2ZWHA 4FWSA 3QDKA 2QWQA 1NGGA 3OHRA 4H5RA 4MLEA 4K25A 5EVZA 2YJFA 1NGAA 3M1FA 3BF3A 3BP8A 2GTDA 1IG8A 3I8BA 4Z94A 5FPNA 4FWKA 1Z05A 1G99A 3DXKA 2YHXA 4AM7A 3CI5A 4H5TA 4L3QA 4BRPA 3JS6A 3GE1A 1BDGA 1X3MA 3L4IA 4NO7A 5E26A 5LJVA 3IUCA 4B1YB 5LY3A 3SLCA 4WYBA 3HBTA 5BN8A 4PL8A 4B9QA 3WUHA 2Q31A 2BTFA 3LDLA 5BRDA 3VEVA 3DAWA 5B8HA 3U9DA 2I7NA 1NWKA 1ZBSA 2P9KB 1S3XA 4K41A 2A6AA 2FLOA 3DXMA 1T6CA 3EZWA 3QFUA 4CZHA 4B1WB 3O08A 1NGJA 5BREA 3CJ9A 3FZMA 3MN6A 1NGFA 4XEIA 2EWSA 2FXUA 1GLDG 4FO0A 1RFQA 5AQQA 3HM8A 1NGDA 5BPLA 3FFKB 4PKGA 3TPQA 5JLFA 4H0VB 3D2EB 1HJOA 5AQNA 3LDNA 2QWPA 4EIAA 4NB4A 5BRFA 4MO5A 4WQ5A 1BUPA 4FWNA 3VEWA 4BVOA 3L6QA 4FWRA 3RSEB 5ADXH 4A61A 2NZTA 2ITMA 3VGKA 3EN9A 4FSVA 1BA0A 3UKRB 5AQIA 5AQMA 1SAZA 2P9PB 2P9NB 4CBWA 5AQPA 5AQYA 5AR0A 3QB0A 1KXPA 5AZIA 2CH5A 2D4WA 3O6WA 4A62A 3HSCA 1BO5O 3CJ1A 1WUAA 1BOTO 3DWLA 2WUSA 3JXUA 1TUYA 2ASOA 1RGIA 2FF3B 4BG8A 3D2EA 2CH6A 3CJAA 5I9EB 2QXLA 1QQOA 1V4SA 4FOIA 4FWMA 3EL2A 2ZF5O 3O4WA 2HF4A 5EY4A 1DKGD 5AQWA 3ULEA 3IFRA 5AQSA 4PL7A 1LCUA 4RTFD 5AQFA 3O80A 3FR0A 1MWMA 3U9ZA 4BC3A 3O8MA 4I6MB 1X3NA 3LDQA 1BG3A 4QS9A 1BA1A 1T44A 2W41A 2QWOA 3H3NO 3VEOA 4BRAA 4Y0WA 5E84A 1HX1A 4IO8A 1K8KB 4O5FA 4CBUA 2P9NA 3C7NA 1BWFO 4CD1A 1KAXA 3D7EO 1NGCA 3SMPA 4BR9A 2E1YA 3HI0A 2ZGYA 2CGJA 1E4GT 2A3ZA 2E1ZA 3FGUA 4XH5A 3FZKA 1BU6O 3A5OC 3MN7A 3VGMA 5JMVA 4EHUA 4RWTA 3D2FB 4H0PA 4WQ5C 4HTLA 3B8AX 4DB3A 1ATNA 3F9MA 2HMPA 1E4FT 4H0OA 2YJEA 3CERA 1QZ5A 4I6MA 2BUPA 1GLBG 3M6GA 3AAQA 1OKJA 2GWKA 2P9IB 2E2OA 4K42A 1DGKN 2E2NA 4HWIA 2GUPA 4EAHD 1Y64A 1C0FA 4BRLA 5LJWA 1MDUB 1T6DA 3VF6A 5AQJA 4BQLA 1GLCG 2Q97A 3H1QA 3MCPA 1U2VB 1NLVA 4H0TB 3UKUB 4A2AA 4H0YB 1P8ZA 3VOVA 4MLHA 4JN4A 4BRMA 3U4LA 2QM1A 1HUXA 3QICA 4C23A 2Q0UA 3GBTA 4BROA 4BR4A 2OANA 3C0BA 3IMXA 4H5WA 4K43A 5AQXA 2YI1A 1EQYA 2F9WA 2IVOA 3ZX0A 1JCGA 2P9SB 5ADXA 1ZC6A 3A8YA 3WEEB 1HKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5MLCQ 4BVPA 3TAEA 4JKDA 1WLJA 3GOIA 1TUUA 4E0DA 3OYMA 2ZM6K 1N34K 4JK9A 4FCYA 2B6AA 4ISEA 4CD3A 3S41A 1XQSC 3M3ZA 2E5LK 1GLEG 5J2QA 1NK7A 4B9MA 4LC9B 3CPWM 2YCHA 3C6TA 3R8EA 1NBWA 3O1WA 4B9LA 5CHIA 2P9SA 3H46O 4KFBA 3WEEA 3FZFA 3L2VA 4L8RB 4OKKA 1J53A 1RDCA 1RDDA 2P9LB 3QBXA 4C1NI 5HL7L 3N4PA 2W6LA 2DPNA 3QESA 3FLCO 1BGXT 3P4IA 3IS9A 3RSEA 3CD6N 3F5TA 3KVGA 3ZSWA 4M7XA 3V9SA 2Y1JA 3VPZA 3AO4A 1RTDA 3H45C 4DHYA 1QSSA 3VQCA 4H8KA 2XHBA 2HHXA 4I2PA 5T7BA 4B1VA 3OBYA 4CF2A 3PSFA 3DXKB 1UAXA 1NK6A 4DQ8A 4CZLA 2NNWA 4CJRA 2XY6A 1QSYA 2E8AA 2DFEA 2CGLA 4AF1A 1WBDA 4H4MA 2DTUA 3DYAA 3EKUA 2V52B 2Q36A 4BREA 3O9QA 3AVNA 2HHWA 4HCCA 4KB1A 1NJZA 1SS6A 4BWMA 3SYZA 1HR0K 3VETA 2ZE2A 1XWLA 3UE5A 4FLTA 1U48A 2O8BA 1U45A 3KIOA 3SMSA 1S5JA 3BUZB 3BDPA 2P9UA 2JLEA 4JNEA 3QMLA 5IT9O 1K8KA 1S9GA 3DOLA 4JAXA 4CJEA 2QEXN 4CESA 4JS5A 4BRKA 4B3OA 4H5NA 1X9JA 4ILHA 1J5OA 4KI4A 1YTAA 3THXB 4KH4A 2IS3A 4I2QA 2P51A 4KRFA 3W3DA 4ISFA 3LM9A 3L2WA 4X62K 1REVA 3L0QA 3QEVA 4Z4IA 1RT5A 3D2FA 4BWJA 4IG3A 1ESVA 3KK2A 4BECA 1A5VA 3LAMA 2GEMA 4CIFA 4Z4GA 1J6ZA 2UUAK 4YOYA 2F8TA 4E7JA 1SKWA 1OH6A 2VWKA 2OPRA 3H6EA 1X9WA 1Q8IA 1U2VA 1HKCA 4BE1A 1Z25A 1HPZA 3AAPA 1IJJA 2WONA 3VENA 4FOEA 4GVMA 3R9PA 5AFUA 2F8SA 2D0AA 4CZIA 1RT7A 3U3YA 5I3UA 3MMVA 1H1VA 1S1WA 4WQ4C 3QFPA 5DM7L 4RW9A 3K5NA 1JXBA 5JLHA 4DLGA 4O0IA 4OLAA 4WFNL 1VQNN 1W7AA 3ID6A 2FF6A 1D8YA 1W0HA 4CZMA 1WSFA 4DSEA 3SUQA 4DSLA 4A59A 4N56A 3CHWA 3WQTA 4E1NA 4JI6K 2HHUA 3SAGA 3ZX2A 3ZYYX 2J4RA 2VG6A 3BZCA 3VQQA 3C7NB 4BRNA 5SZTA 4YHHK 4AHCA 2W40A 2R7YA 1EXQA 2X78A 3SAFA 1NM1A 4GMJB 4EZ6A 1QTMA 3AVFA 2RE2A 1L3TA 4DTUA 4YY3K 4JHDA 3HRGA 5JS1A 2W00A 4BR7A 1QQNA 1TYQA 3QINA 4CBXA 4BRFA 1VQKN 1JLGA 4B1UB 3OYGA 2JWLA 3MDQA 2NRTA 1N6QA 3SBTA 4KHUA 3HTVA 3AVMA 4QS7A 3J7YP 1SL2A 1KAZA 3LDPA 4TSXA 4DR2K 4PY5A 2AP1A 2YNIA 4IXCA 1GLJO 2QWLA 4JK8A 2QKBA 3BEXA 5E41A 4FWSA 4CGDA 3OJSA 3SUOA 3CQ8A 1NJIO 4I7FA 2QWQA 3JSMA 1RBTA 5HRPA 3BF3A 2UXBK 1TL3A 3CYGA 3PSIA 1JKHA 1G99A 3CI5A 3JS6A 5LY3A 3MWPA 4BDZA 3P5JA 4WYBA 4ZHRA 3MXJA 2RHKA 2Q31A 2YNHA 4Q0BA 5BRDA 1IV0A 3NH2A 2KLAA 4LSNA 1KC8O 1L3SA 4PQUA 2O8FA 5GIOA 2I7NA 4CJQA 1NU0A 3CFOA 3DLRA 4KHYA 4NLBA 3DXMA 3THWB 3WNEA 5IWAK 5H1SQ 4IOAL 3FZMA 4KHQA 1ASWA 4XEIA 5J1EA 4GV6A 4B9SA 1UWBA 4IDHA 5HRSA 1T03A 1HNIA 4FJ8A 4H0VB 1M1KO 3ZSXA 1KFDA 3AVHA 4LF6K 2OZSA 1RT4A 2EX3A 2HVHA 3VEWA 4BVOA 1FW6A 2NRRA 1BISA 1S1UA 2NZTA 1BCMA 4JK7A 4FJGA 4FSVA 4CGJA 3HO1A 4M3WA 4KPYA 4MDAA 4PUOA 3TR8A 4KO0A 1BO5O 4ILGB 3CJ1A 4DFJA 1A5WA 4CEFA 3MCAB 2ASOA 4BG8A 3CJAA 5I9EB 4FOIA 5HRRA 4PHTX 2YHBA 3TARA 3P38A 4M3ZA 3O4WA 2HF4A 3M5RA 1IO2A 5EY4A 5LMUK 1DKGD 1BL3A 4JKHA 3ULEA 1MU2A 5C2DA 2P1JA 5AQSA 4PL7A 4RTFD 5AQFA 2E4LA 3WXMB 4JI2K 4BY9C 4I6MB 3NF9A 1TKZA 4CERA 4B9TA 3S3OA 1NK8A 4OX9K 4Y0WA 4DFMA 1WAJA 2GBZA 4FW2A 3KLIA 4B9UA 1KAXA 2VG7A 2KFNA 3D7EO 1HNZK 1FJGK 2CGJA 1E4GT 4OLBA 3FGUA 1I39A 4G1QA 4JYAK 4CJTA 2O8CA 4HUEA 3ZT1A 3CCEN 4H0PA 4HTLA 4IEIA 3B8AX 2XRIA 3JYTA 3CXCM 3CC7N 4FM0A 4KHNA 4H0OA 2YJEA 3CERA 1QZ5A 4CGHA 3RRGA 1EO1A 3OA9A 2JGUA 4DWIA 4K42A 2E2NA 1T6DA 3VF6A 3MCPA 5CY4A 4FJXA 3K58A 1QSLA 1NLVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2WUS A;  1RGI A;  3D2E A;  4KHS A;  1NG9 A;  2QXL A;  4CJ3 A;  2ZF5 O;  3QER A;  1RDA A;  3ZSY A;  4JKB A;  3VTI A;  2YKN A;  2O8E B;  3FR0 A;  1MWM A;  4BC3 A;  2RN2 A;  4QS9 A;  1WSE A;  3H3N O;  2QWO A;  3C6H A;  3VEO A;  4BRA A;  1ZBH A;  4O5F A;  2P9N A;  5M1O A;  3PO4 A;  4ICL A;  3O9S A;  2C1G A;  3SMP A;  4BR9 A;  2OPP A;  3B6P A;  4E89 A;  1YI2 N;  1BIZ A;  2ZGY A;  5HBM A;  3V9X A;  2E1Z A;  1NKC A;  3FZK A;  3ENB A;  3MN7 A;  3AO5 A;  5JMV A;  4RWT A;  3CG7 A;  1WSG A;  2D0C A;  5KRS A;  3LZJ A;  2HMP A;  4W5Q A;  4WFA L;  3CCQ N;  4FZX C;  3DRR A;  2BUP A;  4KI6 A;  3M6G A;  2HNZ A;  3AAQ A;  1RBU A;  2E2O A;  5GIP A;  4FYD A;  4HWI A;  3WNF A;  2GUP A;  1Y64 A;  5DMR A;  4BRL A;  3CCR N;  2Q97 A;  4NXM K;  1XNR K;  3V4I A;  4DTR A;  1TAQ A;  5M1K A;  1P8Z A;  3E1Y A;  1XMO K;  1RCH A;  5KGW A;  4IOC L;  2Z1J A;  3NMU A;  1EWQ A;  3ZLJ A;  3SAH A;  3C0B A;  4DTP A;  4K43 A;  3T3F A;  1EQY A;  1TKT A;  1KVA A;  5ADX A;  2C1I A;  4OGE A;  4ELV A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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