3UDTA

Inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase from a. thaliana in complex with adp and ip5.
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
431
structure length
385
Chain Sequence
LEEKDASDWIYRGEGGANLVLAYAGSSPLFVGKVIRIQKARRVLTSDEQHLWRENNELISSPNKEVLEQRYVQNVIIPLLGPKHVDAGVRVSVSKEFLECVDKKVTKQRPLWRVNAANVDTSHDSALILNDHSLFDCISVEIKPKCGFLPTSRFIGKENILKTSVSRFKMHQLLKLEYIEISEESEYDPLDLFSGSKERVLEAIKALYSTPQNNFRVFLNGSLILGGSGESTGRTSPEIGYAFEDALKGFIQSRTECFLQLVSDAVYGSGVLDRLLEIQKLDKLDIEGAIHCYYDIINQPCPICSLHALPLDESLKIVKEYLIAATAKDCSIMISFQSGDYVSPTNQTFDYKVHFIDLSLKPLKRMESYYKLDKKIISFYNRKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
publication title Inositol phosphate-induced stabilization of inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase and its role in substrate specificity.
pubmed doi rcsb
source organism Arabidopsis thaliana
total genus 122
structure length 385
sequence length 431
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.158: Inositol-pentakisphosphate 2-kinase.
pdb deposition date 2011-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06090 Ins_P5_2-kin Inositol-pentakisphosphate 2-kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.110 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3udtA01
2XARA 4AXFA 4LV7A 4AXEA 3UDTA 3UDSA 2XALA 4AXDA 3UDZA 4AXCA 2XAOA 2XAMA 4AQKA 2XANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2P55A 4NFMA 1WBSA 4I6HA 4L45A 1Q99A 4MWIA 4ZTQA 4BC6A 4DEIA 4B7TA 1XBBA 3DDPA 5ETAA 4GH2A 4G1WA 4BTMA 4UWCA 1SZMA 3BYOA 4QYEA 3ZS5A 3EFKA 4HVDA 2XKEA 5EFQA 5H2UA 4I6LA 4MD9E 1J7UA 4CNHA 4HVGA 4BCQA 5LQFA 4MNFA 5CF6A 2BDFA 3FY2A 4AZSA 1ZZ2A 3JPVA 5LMAA 4I92A 4C3FA 2IZSA 5DT3A 4GT4A 5IUIA 4ACGA 1GZOA 1W8CA 4QP1A 2UW7A 3PRIA 4RWIA 4APCA 4L7SA 4O7ZA 3BQCA 3QCYA 4DEDA 4EOIA 3TDVA 1XH8A 3KIOC 1J7IA 4X2KA 3QYZA 3NW7A 3VBYA 3TACA 3MFSA 4YZ9A 4G3GA 4AZWA 4GRBA 4IAFA 4NT4A 1M2RA 5HU3A 2VGPA 5CNOA 3QXPA 3TZMA 5I0BA 4L67A 3FMMA 2HY81 4AT5A 5D10A 3R8MA 4IB5A 4PL3A 4BF2A 2GSFA 4YJOA 4R78A 3IS5A 3OXZA 2C1AA 1SM2A 3ZCLA 3PJ8A 5I9XA 3A61A 3FE3A 3A62A 5IEYA 3MI9A 2BZKB 1HCKA 3FL5A 2I1MA 3WI6A 3ZM9A 4F7SA 5M44A 3R63A 3BHTA 4GW8A 3BEAA 4IX5A 4PMSA 1UNHA 5A4QA 1JOWB 5KHWA 1VR2A 2GQGA 3EMGA 5DEWA 4FKIA 4HGTA 3V5PA 3PLAE 4LUEA 4EH2A 3OCGA 2BKKA 4EZ3A 1DAWA 3FEGA 4U7ZA 4A4XA 1LUFA 3ULIA 5AM6A 2WEIA 3ALOA 1R1WA 3BELA 1PF8A 2YM4A 2BIYA 3QTIA 4X6QC 4FEVA 2UVYA 5L6WL 2RGPA 1KE8A 3TTIA 4G3EA 4FSMA 3U9NA 4MBLA 3CTHA 3G15A 4O7RA 1IG1A 2F4JA 2XJ1A 4AE6A 3GCVA 3O96A 4P4CA 4X6RA 3LW0A 4YZCA 4L52A 4CLIA 3NUAA 4C2WA 3FLYA 2WTVA 1UNLA 4L8MA 2YIQA 5DR6A 4IHPA 1T45A 4DBXA 4Z55A 4FSWA 3UOLA 2PUNA 3IDCA 4JIKA 2YCQA 2WTWA 2X2KA 2ITVA 2WQMA 4PNKA 4ZAUA 5DH3A 4FSTA 4RSSA 5M06A 1M52A 1QMZA 5J9ZA 2WMAA 2XK9A 2VTPA 5AV3A 3WE4A 1YXXA 1OECA 2G9XA 1OUYA 2W4OA 4JAIA 4JRNA 3TKIA 4BRXA 2GTNA 3A4PA 3QRTA 4JI9A 3AGLA 4AW0A 4J97A 3OOMA 3MIAA 4BYJA 4YLLA 4IX6A 2BIKB 2WQNA 3LJ0A 3Q9WA 1WVXA 4H05A 4LRKA 5JEBA 5CZIA 2XP2A 5CI6A 4KABA 5EW9A 5K3YA 4MXOA 4C4HA 5FUTA 3MTLA 4FV8A 3BHYA 4N57A 3ODYX 4AA5A 2W1FA 2VWXA 4FIIA 3ORXA 4GJ2A 3R1NA 4FEXA 4IWDA 3PYYA 3TKUA 4DF3A 3DLSA 1ZYSA 4EHZA 2BDJA 3VN9A 2Z60A 4PL4A 3D7TA 4Q5EA 3W2OA 4USFA 3R2YA 3Q9YA 4YTFA 4TPTA 3ZXZA 3D5VA 5DRBA 5J87A 3NVKI 3S1HA 4AN3A 4BIBA 2BAQA 2XRUA 1OIRA 2I7QA 3D5UA 3MY0A 3TTJA 3QCSA 2X4ZA 3HAMA 3UOHA 4Q2AA 3DBCA 4AOJA 4DG2E 3NYXA 1PHKA 4KINA 3SKCA 4KBKA 1NY3A 3EQPA 4U97A 5M56A 2C0OA 5FLFA 4ZTHA 5BYZA 4YU2A 1DAYA 4QOXA 4B4LA 3AD5A 3E62A 1Q8ZA 3ZEWA 5KMNA 2VTNA 1U46A 3BE9A 4M7IA 3NVMB 4YHTA 4ANLA 4KRDA 3K3IA 1Q8YA 4P7EA 5JKGA 3UE4A 3RAHA 5A54A 4D58A 3COKA 3R9OA 1YWNA 3OZ6A 3Q53A 4DCEA 2C3IB 2VRXA 2Z02A 4C02A 3DB8A 4ZJJA 5FTGA 3HMIA 1XBAA 4PP7A 1ZOHA 5CYIA 3NMUF 2PMLX 3ORIA 4AN2A 4QQJA 1OI9A 1T46A 3V8TA 3A60A 3E7VA 3QUPA 3WBLA 4BR3A 4UXLA 5IQDA 2F2CB 5KMOA 2WXVA 2YDKA 5E4HA 3VUIA 3PIYA 3R2BA 2XK7A 1K9AA 1OKVA 4Y46A 4FMQA 2OIBA 3NUUA 1PXIA 3S4QA 5K5XA 3ODZX 1E1VA 3C0IA 3UMXA 5JFSA 1YVJA 1CKJA 4PDSA 2PPQA 1CTPE 2QLUA 5HG8A 2YM3A 3DFCB 5AV4A 3LFSA 1FINA 1VYWA 2VN9A 2F57A 5FRIA 4ZJIA 1L3RE 4FV1A 5E8UA 2VO3A 3NUSA 2FUMA 5KHXA 4U81A 2UW5A 2VX0A 4FTQA 3PIXA 4ZS0A 3U87A 2VTLA 4XRJA 1ATPE 4H3BA 4CGAA 5JFVA 2W9FB 2H6DA 2GFCA 3MGYA 2VWIA 5J9LA 2C5VA 2W96B 3MVLA 2P0CA 3QUEA 4HCUA 4R77A 1TQPA 4QMVA 4O0TA 4O7NA 4AU8A 2IZRA 2DYLA 4LGHA 4C34A 3QD0A 3I6WA 1MQ4A 3C0HA 4MD7E 2ZYBA 3BLAA 1FVRA 3OS3A 3JY9A 2PTKA 3E8DA 2X9FA 4UZHA 5EK7A 1KOAA 4R3RA 5DLSA 4BDGA 5HTBA 3ZLXA 5FTOA 2YITA 3SX9A 2R3MA 4MXCA 4WBOA 4XJ0A 2X1NA 4F9YA 3RVGA 1XKKA 2NYAA 4IAZA 2J90A 2AUHA 3VONA 3CEKA 4EWQA 4CKJA 4FK3A 5LXMA 2YA9A 1Q62A 4MTAA 2OZAB 4JG6A 2OH0E 1TKIA 2BILB 3MPTA 3R7YA 3Q2MA 2G15A 3C1XA 3G2FA 3LM5A 4HYIA 4QYGA 2IWIA 2R3IA 3VJNA 3MB6A 4FIHA 1B6CB 2YCSA 1V0OA 3ZRLA 5GNKA 2NRYA 3FQSA 3ZUUA 4OTWA 4U41A 2KTYA 1YDRE 2Q0NA 1PRYA 4XHKB 1F0QA 3IK3A 1FVTA 1OIUA 2CN5A 4GKHA 2PVYA 4KSQA 4F7LA 3LAUA 2WELA 2B9JA 3CIKA 2VTQA 4AGDA 4BIEA 4E4LA 4RQKA 3CBLA 3LFQA 3AKKA 3G0EA 4BDHA 5AP3A 2VUWA 3DJ5A 5DYJA 4G2FA 5I9UA 1ZAOA 4FKRA 3GU8A 3MH0A 3D83A 4C2VA 2ZV2A 4MCVA 1IA9A 4GK3A 2W1DA 4FSRA 4R7BA 5E8WA 3V5JA 3QD2B 3R9NA 1PW2A 3NNUA 5HVJA 3P7CA 3DKGA 4AE9A 4EHEA 5IQEA 4A9SA 1ST4A 4ASXA 2GHMA 2C3KA 3KVXA 3FMJA 3PFYA 4XLIA 4QMMA 1Y91A 4BKJA 3OG7A 3F69A 4ZSGA 1AQ1A 2OJ9A 1OBGA 4V01A 4EUTA 2DQ7X 1PXLA 2E9NA 2XNMA 2YAAA 3MESA 4TWOA 4U8ZA 3RKBA 3SDJA 4CKRA 4F0GA 3UPZA 5GIOE 4ARKA 4PDOA 4II5A 2PVLA 1OB3A 3BBWA 4USDA 5HE3A 2QU6A 5KMJA 4IJ9A 2ZAZA 2WMXA 4I0RA 2B53A 3VUDA 3CLYA 4J52A 3R8LA 4CXAA 5KZ0A 2PZYA 4H39A 5AP4A 4BDFA 4JQ7A 5CY3A 3PY0A 4L3PA 5EOBA 2W0JA 3VUGA 5AP5A 4AAYA 4RWLA 1GY3A 5GJGA 3VC4A 5BPYA 3CTQA 3R71A 3NFGB 4DHZA 1QPDA 4X3FB 4I20A 3SRVB 4U45A 5BQ0A 4NK9A 1ZYCA 3SG9A 3DBQA 3RM6A 4RJ4A 3D94A 4FV2A 5E7RA 5HESA 3EL8A 3PSBA 4G9RA 2QONA 4G6OA 3BYVA 3DZQA 3FZOA 3MB7A 5IH6A 3R21A 2IW9A 5JGBA 2XIYA 4YO6A 3O0GA 4BGHA 1OL2A 5C4KA 4XG8A 4UALA 3FQHA 3LIJA 3VULA 2VWUA 3MY1A 2GNFA 3NAYA 3OVVA 4QDEA 3MN3A 2CCIA 3VS4A 2ZM3A 3F2NA 3C5UA 2X2LA 5HBEA 2C1BA 2RFDA 3PVUA 4ZTRA 2PUUA 5AIRA 3VBVA 2XIRA 4W8EA 3EQGA 3EKKA 4WSYA 4F7NA 5ETIA 3M2WA 3ZSGA 3QLFA 2JDTA 3AGMA 4QYHA 4YJSA 5DR9A 3IPHA 4GEOA 4HW7A 1P4FA 4OTQA 3C51A 2XCKA 3FBVA 5ANGA 5EDRA 2JITA 4AFEA 4APPA 5L8LA 1VYZA 3ZFMA 2JDOA 4CV9A 5CTPA 3W2RA 5F9EA 3TIZA 4Y83A 2YIWA 4OR5A 1U4DA 3NNWA 3OY1A 5HG9A 3W0SA 4PNIA 2ZV8A 4TRLA 4JRVA 5IA5A 1WBWA 3RK5A 3V8SA 3W2QA 4D2RA 4DLJA 4DGMA 1W0XC 3JXWA 2V55A 4ANMA 5EKNA 4OBQA 4ITHA 2IPXA 4FIJA 3FSKA 3D14A 5E8XA 5C01A 5TR6A 3U55A 2QOQA 4JDHA 4KSPA 4UV0A 4J53A 2I0EA 3S2PA 4Y5QA 3DU8A 4FK6A 3UNKA 3FKOA 4I5HA 2XARA 4X3JA 3VRZA 1H28A 4C3RA 4BTKA 4WBBB 2C0TA 3P86A 4KIPA 4YC3A 2VTTA 2R3FA 5C1QB 4UYNA 2SRCA 3R83A 3PZEA 5ANOA 2PU8A 4I22A 5DG5A 5EG3A 5HIBA 1XH7A 3A8XA 3Q6UA 2ETKA 4HZRA 1PXOA 5HNGA 5HIDA 3HAVA 1B38A 3FDNA 3WYYA 4EL9A 3AC1A 2QI8A 3QTWA 3R8ZA 4FC0A 2BZIB 4O2ZA 4D4RA 2CNVA 4GT5A 3WARA 4WNKA 4AX8A 3CSVA 2VTJA 4G3FA 3LCSA 4FOBA 2PE0A 4RJ3A 3HDNA 3SAYA 4EH5A 3CPBA 3HGKA 5HLPA 4NFNA 3H3CA 3K5UA 4RIXB 3D0EA 2BROA 2W1IA 3R9DA 2OK1A 5EH0A 3D2IA 4LOPA 3A7FA 5M4IA 3CQEA 3KC3A 2CCHA 5FEQA 3V8WA 4FV5A 4G17A 2BTRA 5D12A 1S9JA 5HORA 3G6HA 4RIYB 4BI0A 2ZV9A 4FTTA 4XV1A 2OBJA 2PVJA 1SYKA 2J51A 4G6LA 4LV5A 5GINE 2Z2WA 3QL8A 3RGFA 4FKQA 2UW6A 3IOKA 3TYKA 4ANSA 2VV9A 5IQFA 4D4VA 5K9IA 3C5IA 4NTSA 4C4FA 2R3HA 3HZTA 3VUMA 2HWOA 1IEPA 1V0BA 3TZ8A 2I40A 3Q4UA 2QOBA 3OTVA 1Q3WA 4TY1A 3ZONA 1XBCA 1XQZA 4FJVA 4X3FC 1DS5A 5LOHA 4LOOA 4GT3A 1RE8A 4EC8A 4DH5A 2H8HA 4YSJA 4XP2A 3G5DA 5AP1A 5DVRA 3GT8A 3RPVA 3DK7A 3AG9A 2FYSA 3FPQA 4TZRA 2ITWA 2P2IA 4HYUA 1WVYA 4V04A 3W33A 4LGGA 4TWCA 2NO3A 2HOGA 3BU5A 5DEYA 4KWPA 1ZRZA 3AC5A 4XNEA 1NW1A 2G01A 3NLBA 5CAPA 2WTIA 4F4PA 2UVZA 5CZHA 2CMWA 2XM9A 5FM2A 2AEGA 1A48A 2HZ4A 3ET7A 3V04A 5BVEA 3EQBA 5FXRA 3NPCA 3G9LX 4NYEA 3QQGA 4PP9A 5J1VA 3FZRA 2B4SB 2UZDA 4O0UA 4OTRA 5EHLA 4CQEA 5IA2A 3P7AA 3QKLA 5KMLA 2EU9A 3EHAA 3M1SA 4YMJA 3FLWA 4O27B 5CWZA 3UGCA 1ZZLA 3KCFA 2GS2A 5E92A 1Q24A 2UZLA 4IMYA 2R7BA 3CS9A 1VEBA 5BUEA 3DFAA 3ZBXA 2CGVA 4JNWA 4C38A 4YURA 4FKLA 3NX8A 4XX9A 3QGWA 2W4KA 2WMWA 3A99A 1BL6A 4RIWB 3DXQA 3FPMA 4L3JA 4ZZMA 2VWBA 3CXWA 4O0XA 3FXZA 4Z7HA 5CF4A 5FD2A 4L68A 3IQ7A 3LKMA 4FVPA 3HDMA 3HRCA 5B0XA 2FSLX 2XCHA 3WZUA 4BDKA 2BAJA 2X7GA 3GNIB 4YTHA 3PFQA 4H36A 4K1BA 2VWWA 5EDQA 5JZNA 3ZTXA 3SV0A 4FZDB 3QZIA 5DE2A 5CEMA 4BDDA 4XYFA 5FP5A 2V5QA 1XJDA 1YOLA 3PXKA 4S32A 4RVKA 3TZ9A 4ZZNA 5AIKA 2CGXA 4YPDA 5HVYA 3TJCA 4UB7A 4CLJA 5HG7A 4IC7A 1H27A 2BZJA 1WCCA 3H9RA 5A4TA 4USEA 4M68A 3U51A 3K5VA 1M14A 4QEBA 5CQUA 4PRJA 2GS7A 4PMTA 4E4XA 3N9XA 3GOKA 1H00A 4FGRA 2PUPA 4MX9A 4OBPA 4KD1A 3ORMA 3UO6A 1R78A 3FZ1A 5JZJA 4RJ5A 2R0UA 3SW7A 2IW8A 3CQUA 2JBPA 3QLGA 3KGAA 3KXMA 3KL8A 4XS2A 1Y57A 4IVDA 3OWPA 1ZARA 4FNZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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