3UF4A

Crystal structure of a sh3 and sh2 domains of fyn protein (proto-concogene tyrosine-protein kinase fyn) from mus musculus at 1.98 a resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSEKADGLCFNLTV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Fyn, Isoform 2
publication title Crystal structure of a SH3 and SH2 domains of FYN protein (Proto-concogene Tyrosine-protein kinase Fyn) from Mus musculus at 1.98 A resolution
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 39
structure length 160
sequence length 160
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 3uf4A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 3uf4A02
1OOTA 2DRKA 1K1ZA 1UUEA 4KRTA 1P13A 3BUNB 2VIFA 1FBZA 2DM1A 1O4EA 1BFJA 4OHLA 1WA7A 5GJWB 1BHHB 3M0QA 1WX6A 5GJVB 2KRMA 2FEIA 3VRPA 3N7YA 2DBMA 1WI7A 2L0AA 3I35A 3BUMB 2AOBA 2RNAA 4DEXA 2DX1A 3ZNIA 1LKKA 1A1CA 4L1BB 1PRMC 1YWOA 1UJYA 2JMAA 2LMJA 1O4RA 3I9QA 2JM9A 4OMQA 3UF4A 4RTZA 1UFFA 1A08A 4OHIA 5EEQA 2B3OA 5IBMA 2K9GA 2LJ3A 4RTTA 2A28A 1OPKA 2LX7A 1O4DA 1E7OA 2D8JA 1SRMA 1AD5A 2LJ1A 2RQVA 2ENMA 1HCSB 2YSQA 3MAZA 1KJWA 5EHRA 3VS2A 1ZBJA 1I0CA 4HXJA 1TZEE 2HBWA 1O48A 2RVFA 2RQUA 1Z9QA 2YT6A 2RMOA 2DL3A 2EBPA 3IN8A 1GBQA 1SHGA 4E6RA 4ORZA 1GCQA 2J06A 4AFUC 3JV3A 3US4A 1H92A 1KSWA 5EG3B 4Z89A 1NEBA 2AZVA 2GTJA 1RLQC 4R0KA 1YP5A 2C9WA 3OB2B 5HKZA 1AB2A 2JMCA 1AWJA 2ROLA 3QWYA 1O4GA 5FWBA 3HCKA 1CSKA 3NHNA 3IN7A 2OAWA 2SEMA 1X43A 2KXCA 2MCNA 2KNBB 1UE9A 1X69A 2C0IA 1SSHA 4RUGA 1R1PA 1NYFA 2DL4A 1A1AA 1CKAA 1R1QA 3VROA 2DJQA 4H34A 2O31A 1LCJA 2DMOA 3UA7A 5IHNA 1LUIA 4CC7A 4F16A 2IUIA 1A09A 1AYBA 1BM2A 2L3SA 3PJPA 2LCTA 1ZFPE 2EPDA 1K0SA 1BKLA 1O4FA 2PLEA 4RTYA 3SEMA 3TKZA 1AZEA 3M0UA 4LUDA 1LCKA 1AOTF 1O4NA 1K4US 1AYCA 1I1JA 2JM8A 4U1PA 4CC3A 5J3XA 2L3QA 1AEYA 1GCQC 2GBQA 1O4IA 3VS6A 2VKNA 2ESWA 2VWFA 1M27A 1JXMA 4WCIA 3S8LA 1Z9ZA 1BU1A 2C0TA 3S8OA 2GNCA 4Y92A 4JGHA 3PS5A 1MV0B 4Z88A 1D4TA 4AFSC 4JE4A 2IUHA 1AYDA 3TL0A 3PLFB 5I22A 1IS0A 1SEMA 3H0HA 1A81A 4D8KA 5HKWA 2J6OA 2ABLA 1YCSB 3GXWA 2O9SA 2PNBA 1OO3A 5FWCA 2ED0A 1NRVA 4A4CA 1KA7A 4J9DA 2YSXA 5AULA 4DGXA 1GCPA 1RPYA 2FO0A 1KC2A 1O4AA 1Y57A 2K3BA 1ARKA 2D8HA 2EL8A 3EAZA 1ZUKA 2EW3A 1PHTA 2ROTA 3VRQA 1B47A 1UTIA 1G83A 1SHFA 5BO4A 3EG1A 2JXBA 2K6DA 1O45A 3O5ZA 1NZVA 2HSPA 1AVZC 1JYRA 3WA4A 1M27C 2FG0A 2AK5A 2DL5A 1BB9A 3ULRB 1JO8A 2FPEA 1O44A 2X3WD 2DBKA 1PICA 3M7FA 4AFQC 1WQUA 3KFVA 2BBUA 1H3HA 1OEBA 5D0JA 2EYVA 2HUWA 3BKBA 4U17A 1A1BA 1W1FA 1JYUA 1UDLA 2A08A 2MRKA 3M0PA 4J9CA 3IMJA 4J9FA 2C0OA 3H0IA 2YUOA 1RUWA 1W6XA 1NYGA 3VS3A 1T3SA 1HSQA 2RQTA 4JJBA 2EO6A 2GGRA 2PZ1A 1JQQA 1OO4A 1O4CA 1FMKA 2LJ0A 4JEGA 1UHCA 2LQNA 2DLZA 4LN2A 1WLPB 3TVTA 1D1ZA 1NLPC 2YU7A 1B3QA 3EG3A 2L3PA 1ZX6A 3M0RA 3HHMB 1CKBA 1CSYA 3OV1A 2OJ2A 4JPBW 4JZ4A 1AYAA 4A63B 1T0JA 2YDLA 4XZ1A 5I11A 2KT8A 1T3LA 4NWGA 2DM0A 1CWDL 4K45A 2A37A 3BUWB 2DCRA 5EC7A 1IJRA 1FYNA 2MRJA 4JZ3A 1F2FA 4F59A 5DC9A 1Y0MA 4P9VA 5DC0B 2IZVA 3VS4A 2K7AB 1FYRA 1X2KA 1JYQA 4M4ZA 4X6SA 1PWTA 4D8DA 1O4OA 4OMPA 3A98A 2J6FA 3C7IA 1B07A 1O4PA 2QMSA 5DF6A 1UG1A 2AUGA 1UJ0A 1MILA 1KA6A 4J9IA 1FHSA 2M0YA 1V1CA 4FBNA 1FBVA 2K2MA 1QLYA 1SHDA 4RTWA 3U23A 1BBZA 1BHHA 2EQIA 4GWFA 2Y1MA 4FL3A 1SHAA 4E68A 1H9OA 1K76A 1QKWA 4GLMA 3OVEA 2RPNA 2YUPA 2MIOA 5IHIA 2KRSA 4JJDA 1EFNA 1BKMA 2L4KA 4TZIA 3NGPA 2DILA 3MXCA 2EGCA 1K9AA 1NZLA 2IUGA 1FU5A 4K2RA 1ZUUA 2DE0X 2F2VA 2AKKA 1OPLA 4P9ZA 2JT4A 2K79B 2CR4A 3EHRA 2O88A 2D0NA 1NEGA 1O43A 1O49A 4F17A 1YVLA 2B86A 2CSIA 4FSSA 1QG1E 2DNUA 1AZGB 2LCSA 2EYYA 1NG2A 2KRNA 2L2PA 3EG2A 4JJCA 1M3BA 3EG0A 1O4KA 3IQLA 4F5BA 3BUOB 3PSJA 1UECA 1ZLMA 3VGOA 3VS7A 3EACA 2J05A 1BK2A 4OMLA 1X27A 3VS1A 2ETZA 3VRNA 1UHFA 1A07A 2EO3A 1X0NA 1W70A 4AG2C 5IXBA 2BZ8A 4LE9A 1LUMA 4DGPA 3R6NA 2ECZA 2LNWA 2EKXA 1N5ZA 1WFWA 2F2XA 1GFDA 1H8KA 2J7IA 3IMDA 3S8NA 4IIOA 3EHQA 2KR3A 2YUQA 3VRZA 1O47A 2DVJA 1UGVA 2O2OA 2G6FX 4J9EA 1KIKA 2XP1A 4OHHA 1BMBA 4OHEA 2EYWA 1O4MA 5AXIA 2MC1A 1F1WA 3VS0A 3EGUA 2LNXA 3REBB 4X1VA 4OMMA 2MK2A 3FJ5A 2AOAA 4AG1C 2CUBA 1YN8A 1X6GA 3CD3A 2CI8A 1VA7A 2RQWA 3UA6A 5DC4A 1BG1A 2EGAA 3CXLA 1O4HA 2HEQA 2JS0A 1I3ZA 2CUDA 1MUZA 2CDTA 1NM7A 2KBTA 2V1QA 2W10A 2RQRA 1WYXA 2EKHA 1AWOA 2RN8A 4FL2A 4DEYA 1XOVA 1TUDA 2CSQA 1O4LA 1O42A 1SPSA 1D4WA 2H5KA 3CBLA 2GSBA 1E6GA 5L23A 4CC2A 2M51A 1O46A 1R1SA 1ZSGA 2FRYA 1LUNA 2DLYA 2HDXA 4K44A 5IBSA 1RQQC 3N8MA 4OHDA 1AWWA 2JYQA 1FU6A 2DL7A 1GL5A 3M0SA 1U5SA 3ZL7C 1X6BA 2O9VA 1YVHA 1RLPC 4WWQA 2FRWA 2KYBA 2LZ6B 3GQIB 2I0NA 2BTTA 1TCEA 4E93A 3OP0A 2LQWA 5EHPA 2HCKA 2KYMA 1MV3A 3RNJA 1K0XA 2KEAA 3VRRA 1O4JA 4RTVA 2NUZA 1JEGA 2J6KA 2X3XD 1VYVA 4XZ0A 2FPFA 3S9KA 3N84A 3TSWA 4QT7A 1XA6A 2ECDA 2EU0A 2DL8A 1TG0A 2RORA 5I6VA 3GBQA 4ZNXA 1AOJA 5IH2A 1LUKA 1JXOA 2JS2A 2CS0A 2RMXA 3GXXA 1PKTA 1X6CA 3LH5A 4EIKA 2OZOA 2SRCA 3REAB 1PKSA 3C0CA 3VS5A 1U06A 2CT3A 1HD3A 2L6KA 3KFJA 1GRIA 1I07A 3RBBB 2HDAA 4OMNA 2CREA 2HDVA 4J9HA 4CC4B 2D1XA 1SKJA 1IO6A 2AKLA 2LP5A 2DYBA 1M8MA 1CJ1A 1M3AA 4HVUA 1VYUA 2KROA 1BHFA 1UURA 2PNIA 3CQTA 2GTOA 2KXDA 1OV3A 1QWFA 5GJIA 3NMZC 1X2QA 2EYXA 2H46E 1ABOA 1RJAA 2JTEA 5IXFA 1GFCA 4AFZC 2CH4A 1VYTA 1Z3KA 2VVKA 1E6HA 2DF6A 1S1NA 2CRHA 2FCIA 3K2MA 3THKA 1AWXA 4ESRA 3PE0A 3BUXB 1J3TA 2CI9A 2OQ1A 3PSKA 2GE9A 2JW4A 2K7AA 1KFZA 2LNHB 4J9BA 1RI9A 1G2BA 1PRLC 2NWMA 3M0TA 2KT1A 1LKLA 4HVWA 2FPDA 4RTXA 2DX0A 1AOUF 1MW4A 4HCKA 1SPKA 3H0FA 3QWXX 3PVLA 2GQIA 1YWPA 5IHKA 1TUCA 2MOXA 1SHBA 1U3OA 2CH4W 1O4QA 5GJHA 2CBLA 2CT4A 1GBRA 1CSZA 1WIEA 2OI3A 4GL9E 1O4BA 2KK6A 2CIAA 4ROJA 3HIZB 2MQIA 5HKYA 1Y1UA 1BFIA 2W0ZA 5FW9A 1UUSA 5EELA 2Y1NA 2QDLA 1HJDA 4IIMA 3UYOA 1QCFA 2PNAA 3I5RA 4QSYA 1BLJA 2ED1A 5HCKA 4K11A 3PFVA 1WXBA 2KNOA 2V1RA 4A4BA 3NPFA 2K79A 2KGTA 4J9GA 1JU5A 2EOBA 4GPLB 1T0HA 2F2WA 4GBQA 1A1EA 1GHUA 1PNJA 1SRLA 2KE9A 2DLPA 2PLDA 3VRYA 1M3CA 2YUNA 2RF0A 4EY0A 5CDWA 3UATA 2EVRA 5KAZA 1CWEA 1WDXA 4NWFA 5ECAA 3MXYA 4LUEA 1BLKA 2EYZA 2P4RA 4LNPA 4H1OA 2SHPA 2A36A 1QKXA 1M61A 1NLOC 3TSZA 4Z8AA 1SPRA 4EIHA 3H41A 1O41A 1QADA 2BZXA 1JWOA 1WXUA 3PVQA 1WXTA 1YNZA 3OB1B 1A0NB 4F5AA 1M30A 3CWGA 4HVVA 1ZUYA 2AZSA 2HMHA 4RTUA 4OMOA 3I5SA 2RSYA 2EGEA 2XMFA 2IIMA 2Y3AB 1ABQA 1JU5C 2DA9A 2H8HA 2PTKA 1BF5A 1HCTB 1QWEA 3SHWA 2L3TA 3PQZA 2E5KA 3T04A 4F14A 2BZYA 2DRMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JB0E 1K1ZA 1WJQA 1AT1B 2DM1A 3C4SA 4RG8A 1BFJA 3CMET 1QVFS 1WA7A 2KK4A 2RB6A 5GJWB 1BHHB 3M0QA 1WX6A 2FEIA 1ZSZB 2DBMA 3CCRQ 3EGXA 2ZPFB 2RNAA 2K5FA 2DX1A 3P8DA 3G6ET 3QZ5B 1LKKA 3I55A 1YWOA 4KT0E 1G3WA 1O4RA 3UF4A 4J7IA 1UFFA 1VQ8A 1N6AA 4OHIA 5EEQA 1QVPA 1RAHB 1E7OA 2RK2A 2O01E 2X4WA 1Y96A 2LJ1A 2YSQA 3MAZA 5A0DA 4BE2A 5GAN6 1VQLT 1BI3A 1W2BA 2EBPA 2QGFB 2FZGB 5GAOq 4AFUC 2J06A 4ZTFA 1H92A 4C5GA 1KSWA 3M55A 4Z89A 3RMQA 1ZA1B 2GTJA 1RLQC 3GNGA 1ZQ1A 3CXCP 1YP5A 4HA8A 3OB2B 3CC4T 5LJ3e 3JCMf 2JMCA 2ROLA 3QWYA 4XK8E 2DYIA 1M5Q1 2QA4T 3NHNA 2EYQA 2SEMA 2C0IA 1SSHA 1UB4A 5FU7C 1R1PA 2DL4A 1CKAA 2O31A 4DOVA 1IREB 3UA7A 5IHNA 5CR2A 1B7TA 4CC7A 3HPWA 1A09A 2L3SA 3HRUA 5KYUA 1M90U 4WF2A 4DBHA 4EMHA 2EPDA 2PLEA 1O4FA 1YJ9A 3M0UA 1TXQA 1K8AC 1I4K1 4U1PA 4CC3A 5CKEA 2L3QA 3CPWS 4BD3A 1VIEA 3H8ZA 4FYVB 1VQ7A 1JXMA 4WCIA 3S8OA 2COZA 1YHQA 4JGHA 1MV0B 3BY7A 5M9OA 1C6VX 4JE4A 2IUHA 3TL0A 4PLIA 4M7DE 5I22A 2KQWA 4XQ3A 3I56Q 1D1AA 4XTXA 4E7LA 3QHSA 5HKWA 4HT9A 2DZ9A 2LC4A 2MMPA 2PNBA 4F7UF 4FIBA 5DLQE 1K9MC 1KC2A 4QQGA 1ARKA 2RHUA 4B9XA 3EAZA 1PHTA 2ROTA 1QVGS 1UTIA 2K3XA 1G83A 3WVEB 1SHFA 2E4HA 2K6DA 3WA4A 3ULRB 1IRXA 4M7DA 2DBKA 4MDXA 4AFQC 4ZGEB 3G71T 1OEBA 3MP6A 1BCOA 2HUWA 5LJ5h 5DM7R 1A1BA 1M9SA 1W1FA 4OVAA 1UDLA 1YI2T 1NJIC 2R58A 1KQSS 4GY5A 4EPCA 4JLIA 2WACA 2YUOA 4BDYA 1W6XA 3URGA 1S72Q 2PZ1A 1JQQA 4PNOA 2LQNA 2Y90A 1G3SA 4LN2A 1RAEB 1WLPB 1RAIB 2XHCA 3WVDB 2GF7A 2LX9A 1CSYA 2CP3A 4JPBW 4C0DC 4IUQA 2YDLA 4M7DC 5J26A 5DLOA 1CWDL 1PD1A 3M4GA 3OYIA 2DCRA 2RI2A 2JTMA 4IKFA 3QKJA 5FU6C 1OULA 2K7AB 4M7AE 2QEXT 1X2KA 1PWTA 1O4OA 3CCVT 1OU9A 4M77E 3C7IA 1UJ0A 4E7JA 4J9IA 1FBVA 1QP2A 5CIUA 2OAUA 1BBZA 3VU3C 3JSCA 1TWBA 1LPLA 4J6WA 2Y1MA 2OX7A 2KAFA 3D7SB 2RPNA 5GANd 5GMKj 2MIOA 2LQKA 1EFNA 2RK1A 3OYFA 3NGPA 4PJNA 2DILA 5GAMf 3MXCA 2EGCA 1K9AA 4K2RA 1FU5A 1ZUUA 3C12A 3CD6A 2AKKA 5LJ3j 3G4SA 4M77A 1Q7YC 2K79B 2OTJQ 2ZPBB 2QQSA 4O6JA 1NEGA 3QPHA 2BIVA 4ZN1A 2DNUA 4BE0A 1YIJT 2LCSA 5GAN8 1NG2A 1O4KA 2ZGWA 1UECA 3VGOA 2E6ZA 3EACA 2O4XB 3L2ZA 3VS1A 2ETZA 1VQOT 1UHFA 2PVDB 4NS5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OOT A;  2DRK A;  1K1Z A;  1UUE A;  4KRT A;  1P13 A;  3BUN B;  2VIF A;  1FBZ A;  2DM1 A;  1O4E A;  1BFJ A;  4OHL A;  1WA7 A;  5GJW B;  1BHH B;  3M0Q A;  1WX6 A;  5GJV B;  2KRM A;  2FEI A;  3VRP A;  3N7Y A;  2DBM A;  1WI7 A;  2L0A A;  3I35 A;  3BUM B;  2AOB A;  2RNA A;  4DEX A;  2DX1 A;  3ZNI A;  1LKK A;  1A1C A;  4L1B B;  1PRM C;  1YWO A;  1UJY A;  2JMA A;  2LMJ A;  1O4R A;  3I9Q A;  2JM9 A;  4OMQ A;  3UF4 A;  4RTZ A;  1UFF A;  1A08 A;  4OHI A;  5EEQ A;  2B3O A;  5IBM A;  2K9G A;  2LJ3 A;  4RTT A;  2A28 A;  1OPK A;  2LX7 A;  1O4D A;  1E7O A;  2D8J A;  1SRM A;  1AD5 A;  2LJ1 A;  2RQV A;  2ENM A;  1HCS B;  2YSQ A;  3MAZ A;  1KJW A;  5EHR A;  3VS2 A;  1ZBJ A;  1I0C A;  4HXJ A;  1TZE E;  2HBW A;  1O48 A;  2RVF A;  2RQU A;  1Z9Q A;  2YT6 A;  2RMO A;  2DL3 A;  2EBP A;  3IN8 A;  1GBQ A;  1SHG A;  4E6R A;  4ORZ A;  1GCQ A;  2J06 A;  4AFU C;  3JV3 A;  3US4 A;  1H92 A;  1KSW A;  5EG3 B;  4Z89 A;  1NEB A;  2AZV A;  2GTJ A;  1RLQ C;  4R0K A;  1YP5 A;  2C9W A;  3OB2 B;  5HKZ A;  1AB2 A;  2JMC A;  1AWJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1OOT A;  2DRK A;  1K1Z A;  1UUE A;  4KRT A;  1P13 A;  3BUN B;  2VIF A;  1FBZ A;  2DM1 A;  1O4E A;  1BFJ A;  4OHL A;  1WA7 A;  5GJW B;  1BHH B;  3M0Q A;  1WX6 A;  5GJV B;  2KRM A;  2FEI A;  3VRP A;  3N7Y A;  2DBM A;  1WI7 A;  2L0A A;  3I35 A;  3BUM B;  2AOB A;  2RNA A;  4DEX A;  2DX1 A;  3ZNI A;  1LKK A;  1A1C A;  4L1B B;  1PRM C;  1YWO A;  1UJY A;  2JMA A;  2LMJ A;  1O4R A;  3I9Q A;  2JM9 A;  4OMQ A;  3UF4 A;  4RTZ A;  1UFF A;  1A08 A;  4OHI A;  5EEQ A;  2B3O A;  5IBM A;  2K9G A;  2LJ3 A;  4RTT A;  2A28 A;  1OPK A;  2LX7 A;  1O4D A;  1E7O A;  2D8J A;  1SRM A;  1AD5 A;  2LJ1 A;  2RQV A;  2ENM A;  1HCS B;  2YSQ A;  3MAZ A;  1KJW A;  5EHR A;  3VS2 A;  1ZBJ A;  1I0C A;  4HXJ A;  1TZE E;  2HBW A;  1O48 A;  2RVF A;  2RQU A;  1Z9Q A;  2YT6 A;  2RMO A;  2DL3 A;  2EBP A;  3IN8 A;  1GBQ A;  1SHG A;  4E6R A;  4ORZ A;  1GCQ A;  2J06 A;  4AFU C;  3JV3 A;  3US4 A;  1H92 A;  1KSW A;  5EG3 B;  4Z89 A;  1NEB A;  2AZV A;  2GTJ A;  1RLQ C;  4R0K A;  1YP5 A;  2C9W A;  3OB2 B;  5HKZ A;  1AB2 A;  2JMC A;  1AWJ A; 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