3UKRA

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
415
structure length
401
Chain Sequence
GRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKESVMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGVM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
total genus 126
structure length 401
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 3ukrA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrA04
1MDUB 2IIRA 3C7NA 4I6MB 4CZMA 3MCPA 3HSCA 2ZWHA 3IDHA 3MN5A 4BRKA 4F9OA 2GWJA 2ASMA 3VESA 2FXUA 4BR5A 1GLLO 1K8KB 2E2OA 2ZF5O 4KBOA 2NRHA 3UKUA 5EVZA 1YVNA 1Q18A 3MN6A 1BA1A 4B1VA 2P9PB 3ID8A 1H1VA 3DXMA 2CH5A 4BRFA 3L4IA 1Z05A 4M63C 1NGEA 4O5FA 3MN9A 3VERA 1U6ZA 4QS9A 5BN9A 1D4XA 1CZAN 1J6ZA 3A8YA 2PAVA 1NGGA 1GLFO 3M1FA 4EHUA 3L0QA 3ENHA 3ULEA 2E2NA 2QWRA 3FLCO 3U9DA 2HMPA 1T6DA 1ATRA 4MLEA 4FWMA 4CZLA 2V52B 3DXKA 1OKJA 2Q2RA 4FPBA 4RTFD 1T6CA 3HBTA 4K42A 1QZ6A 1S3XA 1U2VA 3FZLA 2CGKA 3F9MA 2E1ZA 1KXPA 3JXUA 4BRQA 2ASPA 5AQSA 5FPMA 4Y0WA 4A2BA 4H5VA 4FWLA 3AY9A 1MWKA 2W41A 1WOQA 3O1WA 4H5WA 4FWSA 3VEWA 3MDQA 2P9PA 4BRMA 5AQHA 2Q97A 3QBXA 2HF4A 2YHXA 5CE3A 2E2PA 3A5OC 2A40A 4JNEA 5BRHA 3EL2A 4CZHA 2V51B 1X3MA 4FWRA 4WQ4A 4BGAA 2E8AA 1HPMA 3TPQA 4PKGA 2A41A 1NM1A 1BUPA 4JD2B 4XH1A 3VGKA 1NGAA 4IO8A 2A42A 2AA4A 2D0OA 4WYBA 1NLVA 4A2AA 3ZX0A 4BGBA 3JS6A 4K25A 3SK3A 3O80A 1BG3A 2FF6A 3VOVA 2P9KA 4IZ9A 2H3GX 4YDUA 3WEEB 2QM1A 2A6AA 3EKSA 4WQ5A 2P9NB 5AZIB 1BOTO 3LDLA 1GLJO 2YI1A 5AQXA 3KHYA 1BU6O 2YCHA 4QS8A 3GOIA 5ELZA 5AQOA 1HKBA 4ISEA 3ZEUA 3ZX3A 1HKGA 3D2FB 2VWBA 4MO5A 1JCEA 1EQYA 4IWVA 3CJBA 3U4LA 2FLOA 4XEIA 3B8AX 5ADXH 4CBXA 1QHAA 4O8KA 2YJFA 2YHYA 1Y64A 4FWPA 1QZ5A 3HTVA 4FWNA 3H46O 3QDKA 3W0LA 2Q0UA 3VGMA 1DKGD 3WUHA 4FWKA 1NGCA 3FZHA 4CZFA 2CGLA 3UKRA 4IJAA 5BRDA 4H5NA 3O6WA 4DHYA 1QQMA 2P9NA 3M3ZA 4EAHD 1GLDG 5AZIA 2Q31A 3VEXA 2WUSA 4ISFA 5ADXA 4CZKA 3I33A 1G99A 3OHRA 2V7YA 3IMXA 1NGBA 2FSNA 4FWQA 5AQFA 4BR2A 1YXQA 3A5MC 5AQMA 5AQYA 3FE1A 3D2FA 1KAZA 3VEVA 4BG9A 4CD1A 1NBWA 3GDQA 3SJHA 4LC9B 2QWNA 4JN4A 3BP8A 5KPRA 3BF3A 2GUPA 4BRNA 3FZMA 5AQLA 1BWFO 3H1QA 1WUAA 3CJCA 4FO0A 1YAGA 4I6MA 3VEYA 1XQSC 1K8KA 1QQNA 4A62A 3GBTA 5BPLA 4HWIA 5AQNA 1TUUA 3CHWA 3WT0A 2QWLA 3O1BA 2KHOA 3WQTA 5AQGA 3ATUA 2A5XA 3WXLA 2BTFA 3AARA 3L6QA 1NGJA 4H0XB 1V4TA 2ZGZA 1ZXOA 2P9LB 1HKCA 4BVPA 3CQXA 3VENA 1X3NA 4BQZA 1HJOA 1E4FT 1SAZA 4HTLA 3DAWA 3TU5A 3O08A 1JCGA 5AQZA 3H1VX 3CJ7A 1GLCG 4BVOA 3LM9A 4FSVA 4BRIA 3LDNA 3S41A 1E4GT 3O5BA 3VGLA 5BPNA 5KPZA 4CZJA 2QWMA 5AQTA 1ESVA 4FOIA 5BR9A 4BRCA 1MA9B 2Q1NA 4B1WB 3WXJA 3LL3A 4GY2B 4BRGA 4NB4A 5AQWA 1QQOA 1NGDA 5EOYA 2DPNA 4BC2A 2GTDA 1MWMA 3WXIA 3HZ6A 4BC4A 4CBUA 3LM2A 3LDPA 1ATNA 4MLHA 4BR9A 3ATVA 3VF4A 2P9SB 3ZX2A 4MO4A 3H6EA 4H0PA 1DGKN 2YJEA 2GELA 3EO3A 3H45C 2ITMA 2D4WA 3H3NO 3U9ZA 5FPDA 2Q36A 1LOTB 5AZJB 4B1ZA 2GEMA 4CD3A 4FL9A 3QBWA 2D1KA 5EY4A 3VF2A 3A0IX 3UE5A 4JD2A 4BRPA 2CH6A 5E84A 5EXWA 3VEOA 4J8FA 3R9PA 4EHTA 4CZEA 4H0OA 1BDGA 2E88A 1BO5O 3CERA 5BN8A 3CI5A 3DWLA 3KVGA 3I8BA 5F2RA 5BRFA 2NZTA 2VYPA 4AM7A 3FZKA 4JAXA 2F9WA 1V4SA 4ISGA 4PKIA 1XC3A 4AM6A 5KPTA 2YHWA 3CJAA 3WEEA 2P9SA 1RGIA 3MN7A 2OANA 4FPAA 5AQJA 5BPMA 3VPZA 4M7XA 3U8XA 1IG8A 4PL8A 1DEJA 1LCUA 3D7EO 5AQPA 2V7ZA 4B1YB 1HLUA 4CZGA 5B8HA 4CJ7A 3ULEB 3CJ1A 5AZJA 3UB5A 2IVNA 5F1XA 5JLFA 1ZC6A 3DXKB 5KQDA 3IFRA 4EIAA 3QICA 4H0YB 1NGIA 4DQ8A 2AP1A 5AQKA 1SZ2A 1ZBSA 4IJNA 2E20A 1NGHA 1U2VB 4BQLA 4CZIA 2I7NA 1P8ZA 4WQ4C 3EZWA 4EFHA 4B1XB 1GLBG 1NGFA 2HOEA 3VETA 2F9TA 5AQUA 3IUCA 1IJJA 4B9QA 1KAYA 3AAPA 1SQKA 3FGUA 1BA0A 4M7YA 5LY3A 1HX1A 5AQRA 2E1YA 4QS7A 2P9UB 5F0XA 5TKYA 3EKUA 5FPNA 1RFQA 5AFUH 4L3QA 4YDUC 4BRHA 2GWKA 1TYQB 2Q0RA 4WQ5C 3GL1A 3ENOA 1S22A 3VF6A 1X9JA 3FFKB 3HI0A 3M6GA 4DB3A 1C0GA 3ZETB 3P4IA 3R6MA 2HF3A 2QXLA 5KQ8A 2P9IB 2BUPA 3QMLA 3O4WA 1YUWA 2QWQA 5JMVA 1GLEG 4RCHA 4PL7A 3R8EA 5FPEA 3SMSA 3O8MA 4IXCA 3DJCA 2ZGYA 5AFUA 4B1UB 3CJ9A 2P9KB 2J4RA 3CQYA 1NWKA 5AR0A 3CETA 3QFUA 4BR7A 3C0BA 5JLHA 4CI6A 3QFPA 4H0TB 4GNIA 3VEZA 3WQUA 5EX5A 2FF3B 2QWPA 3BUZB 2P9UA 4K43A 1T44A 2I7PA 3BF1A 5AQIA 4BC5A 4BROA 1XUPO 4NO7A 4DCHA 4FOEA 2A3ZA 1TYQA 2FSJA 2W40A 5LJWA 2D0PA 3EN9A 3ZEUB 1R59O 3AAQA 4JHDB 2P9LA 2EWSA 3HM8A 5LJVA 1C0FA 3D2EB 3GG4A 1KAXA 1Z6RA 1HUXA 3ZETA 3MK6A 4Z94A 4RWTA 3H3OB 2P9IA 4CBWA 2IVPA 3GE1A 4BG8A 2VCPA 3FZFA 1ATSA 3WXKA 3RSEB 2E2QA 3BEXA 2IVOA 4H5TA 5AQQA 3C7NB 3W3DA 2ASOA 2UYTA 3UKRB 3G25A 3LDOA 3LDQA 4BREA 4FWOA 4K41A 2FSKA 3UKUB 2QW9A 5AQVA 4C23A 4H0VB 3A5NC 4H5RA 1GLAG 4XH4A 4BR4A 4BRAA 2QWOA 3DXMB 4XH5A 4H03B 3KZBA 1TUYA 2NLXA 1NMDA 4BRDA 4BR0A 4JHDA 1JCFA 3CIPA 3QB0A 4E1JA 3D2EA 4PKHA 1RDWX 4BC3A 4A61A 2CGJA 3MMVA 3RSEA 3J8AA 3SLCA 5JICA 4BRLA 3FR0A 3SMPA 3A5LC 5I9EB 2PBDA 5E26A 5BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1MDUB 2IIRA 4KTZA 3K2PA 4CJKA 4BR5A 1GLLO 4DTXA 4IFVA 1VSKA 3LANA 3UKUA 4Z4IA 5EVZA 1Q18A 4XJXA 4WFBL 2UXBK 1H1VA 3CMAN 5I42A 3I0SA 5MLCQ 3OS1A 4E72A 5KGXA 1WN7A 3CC2N 4M63C 1NGEA 3HVRA 4M3ZA 1XHXA 2XRIA 1YTAA 3LAMA 3BY5A 4KHYA 3R1XA 3A8YA 1HNWK 3DMJA 1NGGA 3M1FA 2O4GA 3L0QA 4AHVA 3SZ2A 3ULEA 2E2NA 3HOSA 3U9DA 1ATRA 1LWCA 4CZLA 1X1PA 1BISA 1KLMA 2X6SA 1T6CA 3PX4A 3TTCA 1S3XA 3ZT3A 4ID1A 2E1ZA 4LF6K 5AQSA 2VG5A 2O8FA 3SBTA 3IAYA 3AY9A 4OJRA 2IOCA 1WOQA 3DOKA 3VEWA 5JS1A 4LF7K 4H8KA 3OYLA 4FJNA 1RTHA 4O8UA 3WNHA 5CE3A 2E2PA 4YOWA 3A5OC 3N4QA 4R5PA 3CXCM 3DLLL 1SL2A 2HHWA 5HLFA 2V51B 5HRNA 2A41A 2YKNA 3IG1A 4XH1A 3CCRN 2F8TA 1XI1A 2XO7A 1X9SA 5J2PA 4LF8K 4M41A 4IG3A 2P9KA 2P5OA 1QQCA 4JI7K 2H3GX 4E0DA 1WAFA 4YDUA 3KLEA 1WSFA 1S1VA 4JKAA 4DTMA 2Q3SA 4DFKA 4CFBA 3P31A 1G15A 1OH5A 3AGKA 1QVFM 5CZ1A 1WBDA 4KTWA 3LZIA 1GOAA 3L3UA 4DTSA 4QS8A 3GOIA 5AQOA 3VTIA 1VQNN 3ZEUA 4DV6K 4LF5K 2HBMA 2KTQA 2JWLA 1HKGA 4MO5A 3T1AA 1JCEA 1ITGA 4KV8A 3CJBA 5CHIA 1C1CA 4Q0BA 4OO1J 2FLOA 3SQ2A 3B8AX 4NCGA 3PX6A 4FJXA 2YNIA 3O4NA 4Q5VA 1QZ5A 4DR5K 1D8YA 1XWLA 1VRTA 3L4QA 3QDKA 3D45A 3CM5A 1IKVA 1DKGD 3WUHA 4FWKA 3MXJA 4RW4A 4FJ9A 3M3ZA 2NUBA 4WF9L 4FJLA 1N8RO 2WUSA 3QLHA 4ISFA 5ADXA 1TK5A 5HL7L 3OYFA 4DQIA 4NCAA 1NGBA 4DR6K 3HOTA 3AA2A 5AQFA 3BGRA 4C8LA 3LDSA 2QK9A 5AQYA 3TSPA 3VA3A 1WSJA 4YOXA 3SJHA 2FBVA 4YORA 2QWNA 4JN4A 4CGDA 3PIPL 1S1WA 2QXFA 3CMEN 2GUPA 4BRNA 1Q82O 5AQLA 4H4OA 1WUAA 3CJCA 4FO0A 3SPZA 2BH1A 1TK0A 2NRXA 1NNEA 1BL3A 1XQSC 4JI8K 5KRTA 1J5EK 1IKXA 1TUUA 3WT0A 3V4IA 4ID5A 3L2WA 3NVMA 1LWFA 1VK0A 4QAGA 5FRMA 1SV5A 3L6QA 1NGJA 1ZXOA 3J7AP 4CJPA 4FJGA 3CQXA 3AVKA 4BQZA 3O08A 2ZJRL 1BGXT 4IOXA 4ILGB 5E41A 2G8KA 4BRIA 4OPKA 3OYIA 3TAEA 3O5BA 3VGLA 3WNFA 3VQ7A 4CF0A 4BRCA 4QCLA 4M3TA 3WXJA 4BWMA 3S3MA 4E1MA 3J7YP 4B3OA 4NB4A 1QQOA 4CFDA 3TAGA 2WONA 1NKCA 1VQ9N 2XY8A 2GTDA 1RDBA 5FROA 2E6LA 2ZJPL 2KFZA 1JKHA 4KH6A 4TSXA 3ZX2A 4H0PA 1DGKN 4GV9A 2HNDA 3H45C 2ITMA 3NE6A 1T05A 2RF2A 2D4WA 3H3NO 5FPDA 2KZMA 3T7ZA 4CD3A 3VQ8A 4E7IA 4JI6K 2IC3A 3UE5A 2PFUA 3LP3A 5M1FA 4XIUA 3SUPA 4J8FA 3ISNC 3AO1A 4CEBA 1BDGA 5BN8A 4GKJK 3DWLA 3KVGA 3I8BA 2RHKA 3J7ZO 5F2RA 3SQ4A 2KKZA 4YFUA 3VTHA 3ZYYX 4JAXA 3SUNA 4ISGA 3HP6A 4DU3A 2YHWA 3HSTB 1RGIA 3CM6A 5BPMA 1K9MO 1FXXA 1DEJA 1LCUA 3D7EO 4NXMK 2V7ZA 4CEOA 1RILA 3O9RA 3CYMA 4BEBA 2PYJA 1NJYA 1CZ9A 3DLHA 2AP1A 5AQKA 1LAWA 1EXQA 3OBYA 3WNEA 4C8MA 4KHUA 4CEAA 2HHIA 4B1XB 4CJTA 4G1QA 4DSLA 3VETA 4CJ4A 5AQUA 4DKWA 1JLQA 3IUCA 1IJJA 4Z4FA 4FLVA 3G6EN 1KAYA 5I3UA 2XY6A 4PQUA 4MFBA 4M7YA 1HX1A 3OBWA 5FPNA 2QEXN 1RFQA 1VQ7N 1BQMA 1Z25A 3P38A 1TYQB 4M3WA 4DV7K 2Q0RA 3GL1A 4CHQA 4O55A 1S22A 3VF6A 2KW4A 3HI0A 5J2QA 1C0GA 3P4IA 1VSFA 3R6MA 3K5OA 3JAMO 2P9IB 1JLEA 1U4BA 5JMVA 3UIQA 3TSUA 5AFUA 3CJ9A 4ELTA 4LSLA 5C15A 4JS4A 2OPRA 5AR0A 3CETA 4F4KA 3QFPA 2C1IA 5FRNA 2FF3B 3CC4N 4K43A 3OS2A 3O9QA 1X9WA 1XUPO 4NO7A 4LY7A 5LJWA 3EN9A 1VRUA 4DLGA 1R59O 4JHDB 1EO1A 3AVNA 5HP1A 3D2EB 4FJ8A 1KAXA 3ZETA 3J81O 2IVPA 3GE1A 4BG8A 2PZSA 2VCPA 3WXKA 3M8RA 3RSEB 2E2QA 3HT3A 4JS5A 4DWIA 5HBMA 1K8AO 1QVGM 1NK5A 3E1YA 4W5RA 4HUEA 1U04A 3OYBA 5J2MA 3LDQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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