3UKRB

Crystal structure of bos taurus arp2/3 complex with bound inhibitor ck-666
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
193
structure length
193
Chain Sequence
GVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIED
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin-related protein 3
publication title Structural characterization and computer-aided optimization of a small-molecule inhibitor of the Arp2/3 complex, a key regulator of the actin cytoskeleton.
pubmed doi rcsb
total genus 54
structure length 193
sequence length 193
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukrB01
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukrB02
2FSNA 2E1YA 4B1ZA 4A2AA 5I9EB 3QBWA 2VCPA 3MN7A 4BC3A 5TKYA 4CBWA 2AA4A 1YXQA 5BRDA 3GBTA 5EOYA 4BREA 3EKUA 3MCPA 5KPTA 2J4RA 4QS7A 3LDNA 1YUWA 3ATVA 2OANA 3DXKB 3H6EA 3MMVA 5LJVA 3W3DA 3A5LC 4BQZA 2QWNA 2IVOA 4H0OA 3ULEB 3LL3A 1NBWA 2E2NA 3VGLA 4M63C 1CZAN 4YDUA 5AQFA 4H03B 2Q36A 2ZWHA 3IUCA 3MDQA 1E4GT 3VEWA 4BRIA 5BREA 1E4FT 2QWPA 2E2QA 1MWMA 5KPRA 1XC3A 2FLOA 3H1VX 3KZBA 2FXUA 2QWRA 2YCHA 5JMVA 3QBXA 4FWKA 4PL8A 5AQMA 4H5NA 5AQHA 5E26A 1NLVA 3MN5A 1JCGA 1KXPA 4I6MB 4CD3A 1C0FA 3H46O 1T6DA 3U9ZA 3VF2A 4EAHD 2F9WA 4BR2A 2ZGYA 3EN9A 3O8MA 3EZWA 5AFUH 3WT0A 4CZMA 1QQMA 4BRFA 2P9NA 2P9PA 4BQLA 4XEIA 3RSEB 3BP8A 4AM6A 3J8AA 5BRHA 3HM8A 1J6ZA 4H5WA 2A5XA 3VGMA 4BC5A 3R9PA 3VEXA 1T44A 3ZX2A 1GLAG 5BN8A 4K42A 5BRFA 4F9OA 5F1XA 3LDPA 4WQ4A 3EL2A 3GE1A 3H45C 2ASMA 3FGUA 2P9SB 4JD2A 3FLCO 5AQPA 2EWSA 2I7NA 5AQGA 2BUPA 1LOTB 2P9NB 3VGKA 4CJ7A 3VEYA 3IMXA 3WUHA 4FWQA 1ZXOA 4H5TA 3KVGA 1X3NA 5KQ8A 3FZHA 4BGAA 4XH4A 5BPLA 3C0BA 3W0LA 4EIAA 3QB0A 2E2OA 2HOEA 4FWSA 3CIPA 3BF1A 2E20A 4RTFD 4MO5A 1JCEA 2CH5A 3FE1A 4H5VA 4FOEA 5AQIA 1ATRA 4JHDA 5AQOA 1V4SA 5FPNA 5JICA 3JS6A 4WYBA 3HTVA 4M7XA 4H5RA 2ZGZA 3U9DA 5EX5A 3VEZA 2IVPA 3WXJA 4BRKA 4FWPA 5KQDA 3I33A 2NRHA 1GLEG 4O5FA 4BVOA 4CZEA 3A8YA 3H3NO 2QW9A 1GLCG 4ISFA 1D4XA 5AQWA 1HKCA 1Z05A 3H1QA 5F0XA 1SZ2A 2Q0UA 3M6GA 3VEOA 3M1FA 4PKIA 3ZETA 4ISGA 2D4WA 5ELZA 4H0TB 3DXKA 3SLCA 2A40A 4B1WB 2E8AA 4FWNA 1NGHA 3ULEA 2YJFA 1YVNA 4MO4A 2VWBA 5AQYA 2ASPA 4JAXA 3SK3A 3UB5A 2IVNA 3CJ1A 3FFKB 3EKSA 2Q31A 4H0XB 4YDUC 3ZEUB 4FSVA 1BA1A 4PKGA 1GLFO 1HJOA 1HPMA 2W40A 4FOIA 1GLJO 4PKHA 4IZ9A 1SAZA 2ZF5O 3ZETB 4BRLA 3GL1A 1TUUA 2ASOA 1HUXA 4FWLA 4WQ5A 3FZLA 1R59O 2A42A 1NM1A 5F2RA 4IO8A 1P8ZA 5BPNA 4C23A 3CJ7A 3WXLA 4I6MA 1BA0A 4DQ8A 1GLLO 1Z6RA 2KHOA 3VENA 5FPEA 3HBTA 3HSCA 4XH5A 1U2VB 2D1KA 3VOVA 3O08A 3DWLA 2P9UB 1X9JA 1QZ6A 4A2BA 3RSEA 3ATUA 1NGJA 4QS9A 4BRQA 1GLDG 1S3XA 4RWTA 5AQQA 5ADXA 3VF4A 1NMDA 3CERA 2GUPA 4NB4A 4BR0A 3SMPA 4B1UB 2D0PA 1BUPA 3DAWA 2PBDA 2QM1A 4CZFA 2WUSA 3DXMA 2P9SA 3CI5A 3HZ6A 4WQ4C 1QQOA 2W41A 5AQXA 4K43A 3LDLA 5BPMA 3O4WA 2GEMA 2H3GX 4GY2B 2GTDA 5BR9A 2ITMA 1ATNA 3GOIA 4BRMA 1RDWX 1SQKA 1H1VA 2D0OA 4FWMA 1HKBA 3FZFA 3LDOA 3BUZB 5JLHA 3DXMB 1NGFA 3FZKA 2HMPA 1DEJA 1T6CA 3ENHA 4BRPA 5AQZA 4BRGA 3D2EB 4MLEA 3I8BA 2QWOA 4FWRA 1G99A 1TYQB 1NGEA 4FL9A 3UKUB 4ISEA 5JLFA 3WQUA 5LJWA 2NLXA 4L3QA 2QWMA 3VESA 4CD1A 3CQYA 4RCHA 1YAGA 2FSKA 5AR0A 4BRCA 4M7YA 3O80A 3ZX0A 4FPBA 3VEVA 2GWJA 3SMSA 3BEXA 4B1YB 4BRNA 4DHYA 1JCFA 4PL7A 4CZHA 4CBUA 2Q1NA 4HWIA 1S22A 4CZKA 3WXIA 2E1ZA 5BN9A 1C0GA 4BC2A 2A3ZA 1BG3A 2A6AA 4BC4A 3ZEUA 1NGCA 3AAQA 5AQVA 1OKJA 4DCHA 5FPMA 1IG8A 4KBOA 3P4IA 2E88A 4BR9A 5ADXH 2YHXA 3L6QA 2CGKA 4CBXA 4NO7A 4WQ5C 1MWKA 4B1VA 3WEEB 3A5OC 4CZJA 1HKGA 4BR5A 1U2VA 1U6ZA 3CETA 3WXKA 4DB3A 1ZC6A 2IIRA 3O5BA 3EO3A 3FR0A 3CJAA 3DJCA 1K8KB 2HF4A 2P9UA 3LM2A 4LC9B 2YHWA 3GG4A 1QQNA 4H0YB 5B8HA 1EQYA 3B8AX 4Z94A 2GWKA 5AQKA 1BU6O 2DPNA 1NGDA 2P9IB 2YJEA 3MK6A 4EFHA 1KAXA 3VETA 5LY3A 4Y0WA 1KAYA 2P9KB 4IJNA 1HX1A 3C7NA 1GLBG 1XUPO 1NGBA 3L0QA 4CI6A 4IWVA 4J8FA 4B9QA 4GNIA 2FSJA 4O8KA 3SJHA 4BR7A 3FZMA 1BO5O 1V4TA 3KHYA 5AZJB 3UKRB 2YHYA 2QWLA 5KPZA 5AZIB 1ESVA 2FF6A 3ENOA 4HTLA 3OHRA 5AQRA 4JNEA 5EVZA 2Q97A 3A5MC 3C7NB 1DKGD 2BTFA 2CGLA 2AP1A 1BWFO 4BRHA 2Q2RA 3D2EA 2FF3B 3U4LA 4BG8A 4BRDA 1RFQA 3TPQA 1TYQA 2YI1A 3UKUA 2I7PA 2PAVA 3D2FA 4BVPA 3QFPA 1NGGA 3CJCA 1MA9B 1BOTO 4QS8A 2F9TA 5EY4A 3R6MA 2CH6A 3S41A 3TU5A 3CJBA 4BGBA 3A0IX 4IJAA 3IDHA 4MLHA 4A61A 4K25A 3D2FB 1Q18A 1X3MA 3IFRA 3QDKA 2V51B 4K41A 2P9LA 5FPDA 3O6WA 2V52B 1RGIA 3O1WA 3AAPA 3M3ZA 3R8EA 5CE3A 3D7EO 4A62A 4EHUA 1HLUA 1QHAA 1ATSA 5AQJA 3VPZA 4CZIA 1NGIA 1DGKN 3QMLA 5EXWA 2P9PB 3AY9A 5AQLA 3WEEA 4CZLA 3CJ9A 1BDGA 1QZ5A 2E2PA 4B1XB 4H0VB 4EHTA 2UYTA 4BG9A 2CGJA 2P9LB 2A41A 3GDQA 3LM9A 3QFUA 1K8KA 1ZBSA 3QICA 5AQUA 2HF3A 3VERA 3ZX3A 1WOQA 3LDQA 1TUYA 4JN4A 5AQTA 3UE5A 4FWOA 1IJJA 4XH1A 1NWKA 3MN6A 4JD2B 2P9IA 3A5NC 3U8XA 1Y64A 3CHWA 3AARA 2QWQA 1MDUB 1NGAA 5AFUA 1WUAA 4FO0A 2P9KA 3BF3A 1LCUA 3G25A 3ID8A 1KAZA 3CQXA 2Q0RA 4BROA 4BRAA 2VYPA 3F9MA 3H3OB 4AM7A 3O1BA 5E84A 2V7YA 2V7ZA 5AQNA 3VF6A 1XQSC 3L4IA 2GELA 2NZTA 4FPAA 3UKRA 4CZGA 5AZJA 4JHDB 3HI0A 4IXCA 4E1JA 5AZIA 2QXLA 3JXUA 5AQSA 4BR4A 4H0PA 3WQTA 3MN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EEQA 2OCEA 4E7HA 5I9EB 2PYLA 3ZSZA 4GV6A 1YXQA 5HROA 1QE1A 5EOYA 4K8XA 2YV0X 3M8SA 5KPTA 4FJ8A 2OTJN 1Y97A 3DXKB 3H6EA 4NLCA 4W5OA 2BH1A 3MXIA 3AA5X 2QWNA 3KTQA 3CG7A 4CJUA 5HRPA 2HHVA 1JKHA 2B4JA 2FBTA 4M45A 4YDUA 1CZAN 3JYTA 1RTIA 1R0AA 3ZYYX 1E4FT 3C6TA 4JKCA 2QWPA 3I55N 1DTQA 1MWMA 5KPRA 1ITGA 1VHXA 1RDBA 3IG1A 2NRRA 3QBXA 1IKVA 4ELUA 3THXB 5E26A 3G71N 4JS5A 5LMNK 4CD3A 1L3VA 1KQSM 4KH6A 3CPEA 3H46O 4EAHD 3OW2M 1NOZA 2OPQA 2ZGYA 4C8KA 3O8MA 4M3ZA 3EZWA 5J1EA 2VQFK 4B9NA 2P9NA 4E0DA 3O3GA 5K14A 1XNRK 1S1XA 4XEIA 2HNZA 1W9HA 1WSFA 3J8AA 1C6VA 5BRHA 5C24A 5CZ2A 2A5XA 3KIOA 4FJXA 5C25A 3CF5L 3KD5E 3L2QA 3VA0A 3PX6A 3AVHA 4DSIA 1U49A 3LDSA 3LDPA 4WQ4A 1A5XA 4E89A 2ASMA 3ZLJA 3FLCO 2QEXN 5AQGA 2HBMA 3NH1A 1A5WA 4FWQA 3MWPA 1U47A 3KVGA 3HPGA 3FZHA 2HVHA 1NJWA 4E7KA 4BGAA 4DR3K 4XH4A 5BPLA 3QB0A 4HVJA 3CIPA 2E20A 4RTFD 3TAEA 4FOEA 5AQOA 4WYBA 2ZQBA 1KVBA 3TSQA 4Z0UA 4BRKA 1BIZA 4CGFA 4FLZA 4O5FA 3FFIA 1BI4B 4Z4GA 3U3YA 3A8YA 1IG9A 2QW9A 4JKHA 2HHUA 1HKCA 1EKEA 4LY7A 5M1KA 4N41A 3S3NA 4ILJA 3M1FA 4QOZB 4ISGA 5ELZA 4KKOA 4H0TB 3DXKA 4ID5A 1TKZA 3SLCA 1N32K 1JJ2M 4KHNA 1YVNA 2VWBA 2HHXA 1O1WA 1ZBIA 4CGIA 1RBUA 5M1QA 4HUFA 4IEEA 4J2BA 3PV8A 4YDUC 1RDDA 3ZEUB 4CHPA 4FSVA 1GLFO 1HJOA 1HPMA 5J2PA 3ASMA 4FLTA 3GL1A 1TUUA 4FWLA 3NGYA 3ZT1A 2A42A 3E9OA 3ZSOA 4Y1CA 4JKEA 3KKSA 5BPNA 4CIEA 4FLVA 4KH4A 4R79A 1BA0A 4DR1K 1TKDA 4CJSA 4FLXA 1S6PA 3VENA 4FVUA 3HSCA 1ILYA 3VOVA 1T05A 3CFOA 1VRUA 1S3XA 1HNIA 5JS1A 4B3MK 5AQQA 4CJKA 2RF2A 4AHSA 2GUPA 2PFUA 4E7LA 4BR0A 4MFBA 2O8DB 4OPHA 4JKGA 1C0TA 3DAWA 4CZFA 3DXMA 1OH5A 4CIGA 4DLGA 4WQ4C 4AF1A 4DV6K 5AQXA 1RILA 1KSPA 3WNGA 4LFCK 2GEMA 4GY2B 1ZBHA 5BR9A 1ATNA 1OVYA 2KZZA 2W00A 5GADP 3OYJA 4JRQA 1QTMA 4OVLA 1UA0A 3JSMA 1HKBA 2HBLA 4DMNA 4JI8K 3HM9A 2ZE2A 5JLHA 1NGFA 5DMRA 4CJ4A 2HSTA 4JK8A 1BI4A 1G99A 4F2SA 3PX0A 3UKUB 4WFNL 3CFPA 4FJIA 3SUQA 4Q5VA 3RWUA 4B9MA 3VESA 3SAFA 4RCHA 5FROA 2NRWA 2DFFA 3K9KA 1QQCA 3VEVA 2GWJA 3SMSA 4B1YB 4E3SA 2KLAA 5C0YA 4EZ9A 1LV5A 4X62K 4HWIA 1S22A 3WXIA 4H4MA 4BACA 4FJLA 3F73A 5GIOA 1L3UA 4W5RA 4BC4A 3D45A 3ZEUA 5KGWA 1Z25A 1D9DA 5AQVA 3ID6A 4CJVA 1EETA 1IG8A 4KBOA 4WE1A 3ULDA 3THWB 4BR9A 3P31A 1SKWA 4JKAA 3A5OC 3KK2A 4BDPA 3C6HA 4DR5K 1HKGA 2R7YA 4WCEL 1HR0K 3IAYA 1ZC6A 1WSGA 3O5BA 3E66A 3MX5A 3HPOA 3BZKA 4LC9B 4ELVA 2YHWA 3GG4A 1HYZA 2RE2A 1EQYA 2GWKA 5AQKA 1BU6O 4BE2A 2PZSA 3VETA 3OYCA 2YNHA 5LY3A 4NCGA 1KAYA 2P9KB 4FW2A 4IJNA 2O8DA 4AHRA 1XUPO 1NGBA 4FLYA 3L0QA 4F3TA 4J8FA 4GNIA 4Q0BA 4MDAA 4O8KA 1QHTA 4BR7A 1VQ9N 3CD6N 5GINA 3OYEA 4DU1A 3PX4A 2FBXA 3KHYA 2O8BA 5AZJB 1JL2A 3UKRB 4OLAA 4DQRA 1U45A 3E9PA 2KFNA 5HRNA 1NKCA 3OHRA 1KC8O 2HMIA 1B9DA 1VQ4N 4FW1A 4JNEA 1NMNA 2Q97A 3A5MC 3C7NB 1NK8A 4A57A 4KHPK 2DFHA 1RBSA 5DM7L 4OKEA 3CCUN 4BRHA 2E4LA 2BDPA 4BRDA 4CJLA 4QAGA 3QESA 2Y1JA 4IKFA 3UKUA 4OX9K 4JKBA 3QFPA 4YOWA 4B3SK 3I56N 3R3LA 1K9MO 3CYGA 3K57A 4F4KA 1VAZA 1T3VA 3VQEA 4DUZK 4LF4K 3S41A 3P5JA 3D6RA 1YF5L 3V1QA 4IJAA 3IDHA 4A61A 3AVFA 5FDLA 3IFRA 1NK5A 1JLQA 2V51B 2YHBA 2P9LA 5FPDA 3O6WA 3BGRA 4HCBA 3HT3A 3PSFA 3AAPA 1XNQK 3G4SN 3THWA 1WBBA 1KLNA 5C12A 4EHUA 4DLEA 4O0IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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