3UKUA

Structure of arp2/3 complex with bound inhibitor ck-869
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
415
structure length
399
Chain Sequence
AGRLPACVVDCGTGYTKLGYAGNTEPQFIIPSCIAIKEMKGVDDLDFFIGDEAIEKPTYATKWPIRHGIVEDWDLMERFMEQVIFKYLRAEPEDHYFLLTEPPLNTPENREYTAEIMFESFNVPGLYIAVQAVLALAASWTSRQVGERTLTGTVIDSGDGVTHVIPVAEGYVIGSCIKHIPIAGRDITYFIQQLLRDREVGIPPEQSLETAKAVKERYSYVCPDLVKEFNKYDTDGSKWIKQYTGINAISKKEFSIDVGYERFLGPEIFFHPEFANPDFTQPISEVVDEVIQNCPIDVRRPLYKNIVLSGGSTMFRDFGRRLQRDLKRTVDARLKLSEELSKPKPIDVQVITHHMQRYAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTKKDYEEIGPSICRHNPVFGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural protein
molecule keywords ACTIN-LIKE PROTEIN 3
publication title Structure of Arp2/3 complex with bound inhibitor CK-869
rcsb
total genus 123
structure length 399
sequence length 415
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-11-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3ukuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3ukuA03
3DXKB 1TYQA 3MDQA 4FWPA 3S41A 3CJ9A 3ZEUA 3O4WA 1X9JA 5ELZA 4B1VA 3B8AX 2I7PA 2GWKA 3ATUA 5FPMA 3FZMA 3MN7A 2A41A 4K25A 3ULEA 5AQFA 5B8HA 3WEEA 3F9MA 2V51B 3ZX0A 5AQNA 5AQUA 5LJWA 2CGKA 1ATRA 3LDOA 5BN8A 3ZX2A 4NB4A 1ZBSA 5AQZA 4WQ5A 1GLFO 3MN5A 3MCPA 3SMPA 2ZF5O 3SMSA 4CZHA 1Q18A 1K8KA 2VYPA 1XUPO 2I7NA 4B1UB 1NGFA 4WQ4A 1NGCA 5BPLA 2Q1NA 1R59O 3BP8A 1NLVA 2E8AA 3QMLA 1TUUA 4CD1A 1NGIA 3O8MA 3VF6A 1QQOA 3I8BA 2DPNA 3EL2A 2FXUA 3R6MA 3UE5A 4B1XB 4BRGA 3WXJA 4FWQA 1KAXA 4CJ7A 5KPTA 4PL7A 3U8XA 3VGLA 4B1WB 3FGUA 2Q0UA 3QBWA 2IVPA 1X3NA 4XH1A 4BROA 1NMDA 4BRDA 4FWOA 3U9DA 3WT0A 5AQTA 3CHWA 3D2EA 5AZIA 3GBTA 3H46O 1HPMA 4BRAA 5E84A 4BR9A 1BWFO 1U2VA 5BPNA 1Z6RA 2A6AA 2HMPA 3M1FA 4MLEA 5AQPA 2GEMA 2J4RA 5AZJA 2GWJA 3LDPA 4BRCA 4H03B 4KBOA 3VEWA 4H0OA 1SQKA 3HI0A 2E2OA 1G99A 3H45C 1HLUA 1JCEA 1C0GA 2QWPA 3P4IA 4H0PA 3O5BA 4WYBA 3M6GA 4FWSA 3A5MC 1YAGA 1QZ5A 4BR2A 2P9KA 3LM2A 3DXMB 4BRKA 2CH5A 1QZ6A 5AQWA 4BGAA 3WXIA 3VETA 3VENA 2ZGYA 4CZFA 1HUXA 3IFRA 3WQUA 1NGJA 3WUHA 3VGKA 4L3QA 5KPRA 4JN4A 3MN6A 3R9PA 5EOYA 3ZETB 5JLFA 4K41A 2BUPA 2IVOA 4FWMA 4BREA 5EXWA 2P9UB 4BRIA 3A0IX 2ITMA 3VOVA 1J6ZA 5FPNA 2V7ZA 3DXKA 4ISGA 3HM8A 1ATSA 1LOTB 5AR0A 1BA0A 3IDHA 4K42A 5E26A 4PKGA 4CI6A 4C23A 3LDQA 3H6EA 2P9LB 1QQNA 2VWBA 3H3NO 2W41A 4JHDB 4IO8A 5LJVA 3VEVA 5KQ8A 1YXQA 5AFUH 5BR9A 3FZFA 1YVNA 3MK6A 5FPEA 1E4GT 3EO3A 5BRHA 4FPAA 4BC5A 2WUSA 4BRHA 3LL3A 2UYTA 2QW9A 1XQSC 2FSJA 1P8ZA 2ZWHA 4H0XB 1Z05A 5BRDA 4BQLA 5AFUA 2ZGZA 4H5NA 4FWRA 3BUZB 5AQLA 1GLLO 3VEYA 3FLCO 4A61A 4JNEA 2H3GX 3UB5A 3FZKA 4CZJA 3BEXA 1X3MA 4BC4A 4CBUA 2A3ZA 1NGAA 1ZC6A 4BG9A 2IIRA 4XH4A 3UKUA 3RSEB 4MO5A 5CE3A 2GUPA 4BC3A 4GNIA 3AY9A 3UKRA 2FSKA 1BOTO 4O8KA 3VERA 3CJAA 2QWLA 1T44A 4DQ8A 5AQYA 4FSVA 1NGGA 4BRPA 4DCHA 3CJ1A 4B9QA 2F9WA 2E1YA 4BRLA 1LCUA 3AARA 2A42A 4BRMA 2YHWA 1WUAA 4H5VA 1ESVA 2NZTA 2P9SB 3JS6A 4H0TB 2QM1A 4A2BA 2D0PA 4BR7A 1GLDG 1NGEA 3A5OC 3CQXA 3QFPA 1KAYA 4I6MB 1NWKA 4HTLA 3SJHA 5F0XA 2E20A 4M7YA 3QICA 3H3OB 3SK3A 4RTFD 3DXMA 3WXKA 1HX1A 4H0VB 3QDKA 3O1BA 3UKUB 5AQKA 5AQJA 2Q0RA 3IUCA 3EKUA 1C0FA 2FLOA 3UKRB 3AAPA 4LC9B 3ZETA 3U9ZA 3QFUA 2P9UA 2CH6A 3ENOA 3LM9A 1DEJA 2CGLA 1WOQA 2D1KA 4XH5A 3O1WA 1ATNA 4CBWA 3GL1A 1BUPA 2QWQA 2V52B 1BDGA 3FZHA 1BG3A 4BRNA 2P9LA 2FF6A 2YCHA 4NO7A 4MO4A 4RCHA 5ADXH 4JHDA 4RWTA 4Z94A 4BC2A 2A40A 5EY4A 5KQDA 2QWOA 3R8EA 4HWIA 3CETA 3L0QA 5BN9A 2AA4A 3L4IA 3KZBA 2PAVA 5TKYA 4YDUA 5AQOA 2Q31A 4GY2B 2E2NA 2V7YA 1GLCG 4F9OA 3ENHA 5AQXA 3DAWA 3W0LA 2GELA 3VEZA 3C0BA 3FR0A 3SLCA 1HKBA 2YJEA 3BF3A 1T6DA 2VCPA 4QS8A 5LY3A 3A5NC 2AP1A 2P9PB 2E88A 1V4TA 5I9EB 3TU5A 4BQZA 4BVOA 5AQMA 1GLAG 1RFQA 2PBDA 4CZGA 5BREA 3CQYA 4BR5A 1IJJA 4ISFA 4EHUA 2D4WA 1GLEG 4FPBA 2E1ZA 3RSEA 3CJ7A 1BA1A 1NGDA 2NRHA 3FE1A 3H1VX 2HOEA 1JCGA 3MN9A 4J8FA 4AM7A 1HJOA 1Y64A 1GLBG 2P9NB 4PKHA 4EFHA 3EZWA 3GG4A 2P9SA 3CJBA 4JD2B 4PL8A 4BR0A 1T6CA 2QXLA 4I6MA 4WQ5C 3LDLA 3CI5A 4M7XA 2GTDA 1E4FT 3VGMA 2YI1A 4WQ4C 2QWNA 4EHTA 4CZLA 1MWKA 2ASOA 3I33A 3D2FB 2P9IB 1HKGA 3O80A 4Y0WA 4H5WA 4B1ZA 3G25A 2OANA 3CERA 3QB0A 3FFKB 2ASMA 3OHRA 4FOIA 3ID8A 4O5FA 2FF3B 3GE1A 2W40A 1ZXOA 3MMVA 4A2AA 4DHYA 2E2QA 1QHAA 4BGBA 4A62A 1KXPA 3ZX3A 1OKJA 4DB3A 3VF4A 5FPDA 1GLJO 3ATVA 3M3ZA 1EQYA 4FO0A 3HBTA 4H0YB 1SAZA 3CJCA 3D7EO 2D0OA 4CZEA 5AQVA 3O6WA 4H5RA 3GOIA 3U4LA 2Q97A 1SZ2A 5AQQA 1TUYA 1TYQB 3KVGA 3AAQA 3EKSA 3ZEUB 1NGBA 1YUWA 1S22A 4PKIA 2E2PA 3A5LC 4IJAA 3ULEB 1RDWX 3WEEB 4IXCA 1BO5O 1NBWA 5JICA 1H1VA 4K43A 1DGKN 3HSCA 4IZ9A 2A5XA 3LDNA 5EVZA 4IWVA 2YHYA 3A8YA 3DWLA 5AQHA 2F9TA 2P9PA 3WQTA 3TPQA 4YDUC 3BF1A 4CZIA 1K8KB 4JAXA 5BPMA 2YHXA 3VEXA 5AQSA 2QWMA 1V4SA 1U6ZA 4B1YB 3IMXA 4MLHA 3VESA 4FWKA 2YJFA 2HF4A 2Q2RA 3FZLA 4H5TA 5ADXA 1IG8A 5KPZA 5AQGA 3VEOA 4EIAA 2P9NA 4QS7A 5AQIA 3J8AA 1DKGD 3KHYA 4FL9A 4IJNA 4ISEA 4JD2A 5F2RA 4BRQA 1S3XA 3D2EB 2IVNA 5AZIB 4AM6A 1NGHA 2FSNA 3VPZA 4E1JA 4EAHD 2NLXA 3H1QA 5JMVA 4CD3A 1U2VB 3EN9A 3HTVA 4CZMA 4BVPA 3D2FA 1CZAN 3C7NA 2P9IA 5AZJB 3JXUA 4BG8A 5BRFA 4BR4A 4QS9A 1BU6O 1MA9B 3CIPA 4CBXA 5EX5A 1JCFA 2Q36A 1D4XA 3O08A 3VF2A 4CZKA 4XEIA 2QWRA 1QQMA 1KAZA 5F1XA 4M63C 4FOEA 3L6QA 2ASPA 2P9KB 1NM1A 2KHOA 2EWSA 1RGIA 3QBXA 3WXLA 2CGJA 3GDQA 5AQRA 2BTFA 5JLHA 1MWMA 1HKCA 4FWNA 4FWLA 3W3DA 3C7NB 1MDUB 3HZ6A 4BRFA 2HF3A 1XC3A 3DJCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DXKB 3MX5A 4IDKA 4FWPA 3S41A 2B4JA 3CJ9A 1D8YA 3CD6N 3B8AX 3FZMA 1LWCA 3MN7A 1HNVA 4BE1A 3WEEA 3F9MA 3ZSYA 4IEIA 5C25A 5AQUA 2XY6A 4NCAA 1ATRA 3LDOA 1IBMK 2FBVA 4V19S 4J2EA 1A5VA 4DV0K 1ZBSA 3SI6A 3WNEA 4IO9L 3LANA 4B1UB 1XUPO 1RCHA 3CG7A 1R59O 1RT1A 4F3OA 2E8AA 1TUUA 1NGIA 2ETJA 4H8KA 3KWIA 3R6MA 1L3VA 4B1XB 1QSLA 4AHVA 4FWQA 4KPYA 5KPTA 3VGLA 3K0SA 1RTIA 2UU9K 3L2QA 3FGUA 3PY8A 1JLQA 3QBWA 1Q82O 1IKYA 3RMAA 4BDPA 4BRDA 4FYDA 1WNSA 2IGIA 5J2MA 3N4QA 4OJRA 3H46O 2IS3A 3SUNA 2HHIA 3O9UA 1U2VA 2Y1JA 3VN5A 1Z6RA 2HMPA 2HVIA 2J4RA 4BRCA 4KBOA 4FJ7A 2QKBA 1QTMA 1JCEA 4CJRA 1C0GA 1WBDA 1QSYA 1Q9XA 2D0BA 3SJJA 4CK1A 3VQ9A 5T7BA 4FWSA 2ZD1A 1W0HA 3VQDA 5FLXO 4FZZA 2HHVA 2P9KA 2DFHA 5J2QA 4B9NA 4BRKA 5AQWA 4JI4K 3VENA 4M3TA 3TAFA 2RHKA 1UA0A 3VGKA 1BCMA 3ULDA 4NYFA 3DI6A 5EOYA 3DOKA 4DQIA 2HHSA 4FWMA 4GV3A 4DTOA 3A0IX 1S6PA 2G8FA 4A5AA 3DXKA 3HL8A 1LOTB 5CR4A 4PKGA 5E26A 4C23A 3H6EA 3LDSA 4E0DA 3IKMA 4IO8A 4KHUA 4C1NK 5KQ8A 5AFUH 3RMCA 1YVNA 4DFPA 3LAMA 2WUSA 4ELTA 2HHWA 2E4LA 2FSJA 2ZWHA 1VSMA 4DTRA 4E7HA 4B9SA 1GOCA 5KRSA 3CMAN 4FWRA 4JLHA 3ZT2A 4KH5A 4CJPA 3TTDA 3KK7A 3RRHA 3V4IA 4CBUA 2X78A 3R3LA 3PV8A 3KLEA 3IG1A 3NGIA 4XH4A 4MO5A 5CE3A 3UKRA 4CF0A 2NRXA 3NH1A 5J1EA 4BE0A 2QWLA 4DQ8A 1QHTA 5AQYA 4FSVA 4BRLA 1JLGA 1T7PA 2A42A 4Q5VA 4FJ9A 3JS6A 4CEQA 4BR7A 3I55N 1NGEA 1S1VA 2ITGA 3CYMA 3LZIA 5F0XA 2EHGA 3BZKA 3H3OB 3EZ5A 1HX1A 4CFAA 3OBWA 3QDKA 4FW2A 4N47A 5AQJA 4KO0A 2Q0RA 1NG9A 2XHBA 4ID5A 4JK7A 2RF2A 4DUYK 1MU2A 2IOCA 1S1UA 3U9ZA 3QFUA 4CJLA 3LM9A 1JL2A 3SUPA 1NNEA 1WOQA 3QESA 5C15A 5DMRA 3T7ZA 1XNQK 1ATNA 3GL1A 3TABA 1NJZA 4RW6A 4FK4A 5I42A 3THVA 1IKXA 4BC2A 5EY4A 1NMNA 3DLRA 4WFBL 3NH2A 3L2UA 3K59A 4GVEA 4OPJA 4KHSA 3E9OA 4YHHK 1QQCA 5AQOA 3KK3A 3V9WA 4FLTA 3ENHA 5AQXA 3EEQA 3HYFA 4CGIA 4AILC 3ITHA 1JLEA 4DTPA 1Z26A 3QERA 3CCVN 2O8CB 1XMQK 2VCPA 3SQ2A 5LY3A 3OYFA 4LH4A 1V4TA 2HBLA 3RRGA 1P90A 3K5OA 4YOUA 1GLAG 2PBDA 1ZBUA 3SUOA 4BR5A 3V81A 1NOZA 3H08A 4F3TA 3TAGA 2YV0X 1VQON 4ZTJA 4YORA 3VQ5A 2NRZA 1L3TA 4LFAK 4LY7A 4K8XA 4OO1J 3SV4A 3AGRA 2GV9A 4J8FA 4CECA 1VHXA 3ZSXA 4CIEA 4DR5K 3EZWA 2Z1GA 1NK8A 2QXLA 3OYKA 1DT9A 1X9WA 1VQ9N 4M7XA 4WFAL 2YI1A 3MEDA 3THWB 4CZLA 1MWKA 1CZBA 2ASOA 4YNQA 2YNHA 3O80A 4CGHA 4B1ZA 4DV5K 2OANA 3RR7A 3FFKB 3WNGA 3OHRA 2D0CA 1UA1A 4E7IA 3GE1A 4FZYA 1KD1O 4FK0A 4DUZK 2GUIA 1C0TA 1X1PA 4BGBA 3AO1A 1A5XA 1KQSM 4DLEA 1OH5A 1LWEA 5D3GA 1EQYA 3HBTA 4O8UA 3AO3A 3K9JA 5FRNA 2F8TA 4H5RA 3U4LA 4U67L 3SAHA 3QEWA 2WC9A 3ZEUB 1YUWA 1S22A 4PKIA 5M1QA 3OYDA 3A5LC 1WSFA 4DR2K 1N36K 3V1RA 1BO5O 5JICA 1H1VA 2WTUA 1XC9A 3HSCA 2LSNA 2O8CA 3G4SN 2Q3SA 2YHYA 3HO1A 3DWLA 4HHTA 3J81O 3WQTA 4WCEL 4FJXA 1IO2A 1K8KB 4LF9K 1RT7A 1U45A 3AVGA 1BCOA 4DQRA 1J54A 3VEXA 4N5SA 3PIPL 1V4SA 1NJWA 3U3GA 1KFSA 5CYMA 4FCYA 4QOZB 4M41A 4Y1DA 2ZJQL 2UXDK 2YJFA 1TV6A 2OA8A 2HF4A 2Q2RA 4H5TA 5ADXA 4I2PA 4FW1A 4OKKA 1O1WA 2HNDA 4KTZA 4LF6K 4CHQA 3PX0A 4CF9A 4QS7A 4KAZA 3J8AA 3AVBA 4FL9A 4IJNA 4KTWA 3SNNA 4BRQA 4E1JA 3AA2A 3NBPA 5C2DA 2NLXA 1Q9YA 4LF8K 2EX3A 4JRQA 1OH6A 4BG8A 1CLQA 1Z25A 4CJTA 1EXQA 1FK9A 3WNHA 3O08A 1D4XA 3SPZA 4DU3A 5F1XA 3KLFA 4FOEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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