3UONA

Structure of the human m2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
TFEVVFIVLVAGSLSLVTIIGNILVMVSIKVNRHLQTVNNYFLFSLACADLIIGVFSMNLYTLYTVIGYWPLGPVVCDLWLALDYVVSNASVMNLLIISFDRYFCVTKPLTYPVKRTTKMAGMMIAAAWVLSFILWAPAILFWQFIVGVRTVEDGECYIQFFSNAAVTFGTAIAAFYLPVIIMTVLYWHISRASKSRINIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYPPPSREKKVTRTILAILLAFIITWAPYNVMVLINTFCAPCIPNTVWTIGYWLCYINSTINPACYALCNATFKKTFKHLLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein/antagonist
molecule keywords Human M2 muscarinic acetylcholine, receptor T4 lysozyme fusi
publication title Structure of the human M2 muscarinic acetylcholine receptor bound to an antagonist.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 159
structure length 438
sequence length 438
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2011-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 3uonA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 3uonA01
4G7SB 1L60A 3HT8A 1S54A 4I7SA 4MD1A 1L87A 1L24A 1SWZA 1L55A 238LA 211LA 255LA 188LA 1L66A 5ITCA 219LA 3BVDB 1C6TA 1QT6A 3HH6A 239LA 145LA 1L98A 1O0AA 216LA 4PK0A 4IB4A 223LA 1L12A 2ANVA 5LZMA 4OV0A 3VI0A 1L19A 4EKPA 248LA 4G72B 5AHZA 1QTCA 5A45A 259LA 4I7TA 186LA 4GBRB 3HWLA 1S51A 5A8EA 3HUQA 127LA 5AZDA 1LGWA 1C69A 1QSBA 5G28A 1C64A 250LA 1QT5A 2B75A 4I7KA 1L96A 1KMEA 2LNLA 4S0WA 253LA 1D2YA 1L63A 3QJRB 3VW7A 2KSBA 1C60A 1G0PA 1QS5A 1OWYA 1PQIA 3SBBC 3HASA 1C66A 1P36A 4W58A 5B35A 1L04A 102LA 1CX7A 246LA 183LA 3RFMA 2OE4X 147LA 4GP5B 1G0MA 1LWGA 2OE9X 4XT3A 3WQJA 3D4SA 4FPDA 237LA 5B34A 3V2YA 4BEZA 1T8AA 2B74A 1G0GA 1D2WA 1GU8A 4MD2A 206LA 2Z6BA 1QTZA 3C7WA 3GUIA 1VJMA 5ITEA 1L01A 1JV7A 1KS3A 1L07A 228LA 2ZZLA 5JJNA 1TN5A 1L48A 1OV5A 5ETZA 5H2NA 4XT1A 199LA 1P56A 1R2NA 192LA 1LI3A 152LA 173LA 3DMVA 185LA 196LA 1PXSA 243LA 3QBLA 1C67A 137LA 1CV4A 1L36A 2RB2X 1T6HA 4AQNA 4IAQA 5J7AA 1CV1A 1D9WA 2ANXA 3ABWA 1L30A 189LA 2O7AA 112LA 148LE 4A4MA 2QPDB 1D3MA 163LA 1QT3A 3CDTA 1HZXA 1P64A 1L0MA 146LA 4BUOA 1G0JA 1LYFA 3KJ6A 139LA 4ARLA 5AWZA 4PXFA 1PQKA 175LA 3COCA 4PJZA 1CV5A 3SB6A 5B6ZA 1LWKA 3OE8A 2RB1X 143LA 2JAGA 1PY6A 3AYNA 4MQSA 1UAZA 3HDFA 1L05A 2Y02A 1CUPA 2HULA 1P46A 1XIOA 1L85A 3HANA 222LA 1MGYA 2YCXA 3QJSB 3C7YA 1OVHA 1R84A 1DYEA 1KY1A 1L47A 3CDRA 1L20A 4YX7C 3PQRA 3HH3A 4QRYA 1KW7A 3DN2A 4ARQA 1CU3A 1AT9A 1C6AA 4MBSA 3S3CB 5H2MA 2NTHA 2Q9EA 1L94A 1PQMA 1P3NA 1EPYA 1LYEA 3CDVA 4EPIA 1L67A 1E0PA 1CU0A 261LA 3ZPQA 177LA 3HAOA 1L25A 4I7PA 2B72A 3ODUA 1LYGA 200LA 1L09A 1L38A 240LA 1CX6A 2Y04A 234LA 1XMEB 2G87A 5FJGA 1L70A 1L79A 2B6YA 3HUAA 2A4TA 4I7OA 4KLYA 2QARC 2B7XA 1LYDA 1L82A 225LA 4I7LA 4G70B 1P2LA 229LA 5H2JA 170LA 205LA 242LA 5B0WA 1L33A 1D3FA 3HU9A 1C65A 230LA 2OEAX 164LA 1P8HA 3SB8A 108LA 3DN1A 157LA 1BM1A 1L83A 1L64A 4HYXA 1P8IA 3EH3B 1L28A 2OU0X 3DMXA 114LA 3HARA 1SX2A 4W53A 184LA 1CV3A 3CODA 3OAXA 1XJIA 2RBNA 1FBKA 1QHJA 2B6WA 107LA 4W56A 3DDLA 1DYDA 181LA 4J4QA 1K28A 4EKQA 171LA 1L52A 1M0MA 165LA 3DN0A 3ZEVA 3F8VA 1S53A 2LZMA 1PQDA 1LI2A 2RAYX 2M3GA 174LA 142LA 3EH4B 4LDEA 4W55A 2NTGA 4NC3A 1P7SA 2I21A 1L37A 4W51A 5G36A 3SB7A 4ARJA 3HT9A 1Q5JA 1U19A 2F93A 3HAPA 1LYHA 109LA 1C6BA 1LYJA 2HUMA 3DQBA 4GYCA 4EXMA 128LA 166LA 1QT4A 151LA 3P0GA 1C6GA 3L64A 3V2WA 1CUQA 1L95A 3QDCA 172LA 4ZPUA 1L97A 1L58A 3VHZA 123LA 2RH1A 3DNAA 245LA 3T45A 1QTBA 3HAQA 4G7RB 1IW9A 1F4ZA 1L29A 2Y00A 5G2DA 1L02A 3HTGA 1JTNA 2L6XA 1QSQA 1LN6A 1BRDA 1L45A 1C62A 2LCBA 4FBZA 1L99A 251LA 5TGZA 149LA 1M0KA 5I14A 3HDEA 110LA 3HH5A 125LA 2F47A 4EPFA 1QUDA 1L84A 1L43A 1L68A 1GZMA 5AHYA 3HU8A 4IAPA 1L73A 231LA 195LA 252LA 3GUPA 1ZURA 3UONA 4I7MA 1L57A 3PXOA 1XJTA 213LA 1L26A 3DN4A 2Z73A 1L27A 4N6HA 2X72A 1G1VA 4BVNA 1XEPA 3S3DB 2RB0X 3C8SA 4GP4B 3UZCA 1BRXA 1TN0A 262LA 3AYMA 1OVKA 1LGUA 4ARQB 1C6NA 1CTWA 1SWYA 3X3CA 1F50A 1L61A 4EKSA 1X0SA 201LA 1L15A 1L31A 1L59A 156LA 4AMJA 2O4WA 2JAFA 1F88A 1C61A 2B6TA 2Y03A 1QUHA 3VGAA 4UHRA 1ZYTA 3GULA 1ZWNA 1S8JA 2KSAA 2B70A 4XTNA 1L10A 1OYUA 198LA 1X0K1 2YCZA 1QTDA 1WTHA 2LC9A 3GUNA 1KG9A 122LA 2YCWA 1L88A 2YDOA 5B6WA 138LA 1DYBA 3AM6A 5DYSA 1P2RA 4X32A 2J4YA 1QM8A 111LA 224LA 1QS9A 4BWBA 1L75A 3K2RA 2L78A 1PQOA 233LA 2WJLA 4WW3A 3G3WA 3L2XA 1JV6A 1C3WA 3HTFA 4W54A 1G1WA 1VGOA 182LA 3CDQA 5KKHA 168LA 1L13A 1QT7A 3JR6A 2NTWA 4DKLA 4WAVA 2RBQA 1C6QA 1L76A 1S52A 3S3BB 217LA 3SBAA 1L86A 5A44A 5G2AA 2OTZX 113LA 2I35A 1L54A 3DMZA 1P5CA 1XJUA 3OE0A 3EH5B 3FADA 4OO9A 1L69A 4JKVA 3S8FB 1T8GA 249LA 3DN8A 141LA 1L44A 247LA 1E12A 3RZEA 1AP9A 5F8UA 5B2NA 3VG9A 4W57A 2B6ZA 4I7NA 3UTYA 4E97A 3PDSA 2ZIYA 119LA 5G2CA 2PEDA 7LZMA 1C6PA 1M0LA 1LI6A 1L50A 2F32A 1P6YA 1OV7A 5G53A 4K5YA 3SB9A 1QTVA 2Z55A 2RAZX 129LA 1L92A 3CDOA 226LA 3UTXA 4EIYA 2RBRA 1QUGA 4L6RA 5H2IA 1LLHA 1CU5A 236LA 1L77A 3PWHA 1QT8A 176LA 4W52A 3F9LA 3NY9A 1LYIA 1T97A 2OE7X 258LA 2EI4A 3C9LA 2KS9A 140LA 1L21A 2BRDA 1BRRA 1SX7A 1L51A 1CU6A 1CV0A 1H68A 1KGBA 3FA0A 3QBGA 2R4RA 4YXCA 4X31A 4XXJA 1L14A 1L46A 3C82A 178LA 1L41A 1S8LA 2AT9A 4XTOA 1L23A 2HUKA 3DN6A 3NYAA 5JJJA 3G3XA 4GRVA 2O79A 191LA 4PXKA 5BR2A 161LA 1P37A 1C6KA 2B6XA 1GUEA 2ZFEA 3MBVA 1L81A 4EJ4A 1DYCA 1JQUA 1CU2A 260LA 3SB5A 1IXFA 1L9HA 3NSBA 1L17A 241LA 3HUKA 1SSYA 3S8GB 4QIDA 1C6CA 1C6EA 1FBBA 5AX0A 2YCYA 1P8UA 1C6HA 1CVKA 1L03A 3QJQB 3QJTB 3QAKA 1L90A 3C80A 1C8RA 6LZMA 4KNFA 1X0I1 4MQTA 4EKRA 1LGXA 4G71B 1OVJA 2I1XA 3C8RA 3HTDA 3NY8A 4QI1A 5G54A 3LZMA 2WJKA 3C9MA 4EA3A 4GPOA 1L35A 1L74A 220LA 4IARA 3QBKA 3HT7A 232LA 5H2PA 159LA 3OE6A 1QTHA 5BR5A 1L39A 4ARMA 130LA 5C1MA 1L18A 197LA 1T8FA 2F95A 1L42A 1IW6A 1C6DA 115LA 1L0JA 227LA 3GUMA 150LA 1L49A 4YXAC 3HT6A 1DYGA 2OU8A 4X1HA 1TLAA 2B73A 5B6XA 4HYJA 221LA 3GUKA 1L53A 4XTLA 244LA 1L89A 3DN3A 1DZEA 4GP8B 4HWLA 1L56A 4W59A 1C6FA 4UG2A 214LA 1L80A 104LA 2Q9DA 4GBRA 1G07A 3RUNA 5DHHA 1G06A 3C8QA 3QAPA 126LA 118LA 167LA 1C63A 210LA 4LDLA 1QKOA 254LA 4I7QA 4LZMA 180LA 169LA 155LA 1EHKB 1L22A 5B6VA 4LDOA 4FA7B 1I6SA 3UTWA 4FAAB 3OE9A 5H2KA 4I7RA 1C6LA 1H2SA 256LA 5EN0A 1L65A 1DYAA 1G0KA 3C7ZA 4N4WA 103LA 257LA 1G0QA 2OU9A 144LA 1G0LA 3C81A 3HTBA 5JJEA 1L62A 5H2OA 1L0KA 3QBIA 2VT4A 5LWEA 1L06A 1L00A 3UTVA 4ARPA 3A7KA 1L93A 131LA 1C6JA 4JR8A 5B6YA 1C6IA 3EMLA 1Q5IA 1UCQA 2Y01A 2RBOA 212LA 3REYA 1L32A 3FI5A 235LA 2OTYX 1L71A 1L34A 4DJHA 1PXRA 4TL3A 3X3BA 2R4SA 1PQJA 5H2HA 3GUOA 1SSWA 3GUJA 3ZPRA 4N4YB 3QJUB 1OWZA 1JTMA 5H2LA 1C6MA 3VVKA 1L40A 1LW9A 3SN6R 1D3NA 1C8SA 1KW5A 3UG9A 4ARMB 3UZAA 4BEYA 3HH4A 162LA 3NS0A 3QJVB 1D3JA 1KNIA 4BV0A 1QKPA 4L35A 218LA 187LA 1QUOA 3C83A 2QPEB 1L91A 4DAJA 209LA 2F2QA 4G7QB 1LPYA 4Y9HA 1KY0A 2CUUA 1JGJA 1L72A 2KSYA 2YDVA 3G3VA 4JQ6A 2NTUA 2I20A 1CWQA 2RBSA 190LA 5AX1A 4AMIA 1DYFA 1CV6A 2RBPA 2HPYA 1KG8A 1JFPA 1C68A 1L16A 2IGCA 1L11A 4I7JA 1L08A 158LA 1NHBA 215LA 3PBLA 5DHGA 3DKEX 120LA 1B6IA 3CAPA 2QB0B 160LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DQDY 2DQIY 3AYQA 1L87A 4KT3A 5I4XA 1IWVA 2YDGA 219LA 3HH6A 3GXRA 1QUSA 1NQIA 4OV0A 3D9AC 1JTPL 4G72B 5A45A 186LA 3HWLA 1S51A 1WQRA 1IWWA 1LGWA 2W1XA 1QSBA 3SP3A 5G28A 1KMEA 4DD2A 3VW7A 1C60A 3D3DA 2YVBA 4XENA 4GP5B 1G0MA 3WPKA 2OE9X 4XT3A 3D4SA 1LHIA 3A34A 4FPDA 1JSEA 237LA 5B34A 1HSXA 1GU8A 4MD2A 1QTZA 3WW5A 1JV7A 1L07A 5EBHA 1GBWA 1JITA 1NDGC 1VFBC 1R2NA 152LA 173LA 1CV4A 1EL1A 5J7AA 1D9WA 1LZSA 1L30A 3A3RX 148LE 1KXYA 1D3MA 3CDTA 5APEA 4PHIA 1HZXA 4BUOA 1G0JA 4RDSA 4ARLA 2LZTA 1PQKA 5B6ZA 1LZ9A 2RB1X 3TXEA 2F2NA 5KKIA 1CUPA 1XIOA 1LJGA 1WTMA 3C7YA 2D4IA 1R84A 1DYEA 3PQRA 4DD0A 4H9HA 3HH3A 2LHMA 4MBSA 1GB5A 4DD3A 1LSZA 1JJ0A 1EPYA 1LYEA 4EPIA 1CKGA 1IP6A 2MEAA 5LVGA 1LYGA 200LA 5IDDA 240LA 2B6YA 1KIPC 2A4TA 4KLYA 1QUTA 1L82A 225LA 4I7LA 2G4PA 4YENA 170LA 205LA 242LA 1L33A 2D4JA 2H9JA 1PS5A 1V7SA 1P8IA 1L28A 1JTTL 1BQLY 1GFVA 1CV3A 2BQEA 1B5XA 4J4QA 1DYDA 3E3DA 3ZEVA 1GFAA 1BGIA 1LZNA 1WQOA 1JJ3A 2M3GA 3EH4B 174LA 142LA 2I21A 5G36A 3RU5A 4NGLA 3ZEKA 2F93A 1C6BA 1DI4A 5D5CA 3W6EA 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 249L A;  3DN8 A;  141L A;  1L44 A;  247L A;  1E12 A;  3RZE A;  1AP9 A;  5F8U A;  5B2N A;  3VG9 A;  4W57 A;  2B6Z A;  4I7N A;  3UTY A;  4E97 A;  3PDS A;  2ZIY A;  119L A;  5G2C A;  2PED A;  7LZM A;  1C6P A;  1M0L A;  1LI6 A;  1L50 A;  2F32 A;  1P6Y A;  1OV7 A;  5G53 A;  4K5Y A;  3SB9 A;  1QTV A;  2Z55 A;  2RAZ X;  129L A;  1L92 A;  3CDO A;  226L A;  3UTX A;  4EIY A;  2RBR A;  1QUG A;  4L6R A;  5H2I A;  1LLH A;  1CU5 A;  236L A;  1L77 A;  3PWH A;  1QT8 A;  176L A;  4W52 A;  3F9L A;  3NY9 A;  1LYI A;  1T97 A;  2OE7 X;  258L A;  2EI4 A;  3C9L A;  2KS9 A;  140L A;  1L21 A;  2BRD A;  1BRR A;  1SX7 A;  1L51 A;  1CU6 A;  1CV0 A;  1H68 A;  1KGB A;  3FA0 A;  3QBG A;  2R4R A;  4YXC A;  4X31 A;  4XXJ A;  1L14 A;  1L46 A;  3C82 A;  178L A;  1L41 A;  1S8L A;  2AT9 A;  4XTO A;  1L23 A;  2HUK A;  3DN6 A;  3NYA A;  5JJJ A;  3G3X A;  4GRV A;  2O79 A;  191L A;  4PXK A;  5BR2 A;  161L A;  1P37 A;  1C6K A;  2B6X A;  1GUE A;  2ZFE A;  3MBV A;  1L81 A;  4EJ4 A;  1DYC A;  1JQU A;  1CU2 A;  260L A;  3SB5 A;  1IXF A; 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 254L A;  4I7Q A;  4LZM A;  180L A;  169L A;  155L A;  1EHK B;  1L22 A;  5B6V A;  4LDO A;  4FA7 B;  1I6S A;  3UTW A;  4FAA B;  3OE9 A;  5H2K A;  4I7R A;  1C6L A;  1H2S A;  256L A;  5EN0 A;  1L65 A;  1DYA A;  1G0K A;  3C7Z A;  4N4W A;  103L A;  257L A;  1G0Q A;  2OU9 A;  144L A;  1G0L A;  3C81 A;  3HTB A;  5JJE A;  1L62 A;  5H2O A;  1L0K A;  3QBI A;  2VT4 A;  5LWE A;  1L06 A;  1L00 A;  3UTV A;  4ARP A;  3A7K A;  1L93 A;  131L A;  1C6J A;  4JR8 A;  5B6Y A;  1C6I A;  3EML A;  1Q5I A;  1UCQ A;  2Y01 A;  2RBO A;  212L A;  3REY A;  1L32 A;  3FI5 A;  235L A;  2OTY X;  1L71 A;  1L34 A;  4DJH A;  1PXR A;  4TL3 A;  3X3B A;  2R4S A;  1PQJ A;  5H2H A;  3GUO A;  1SSW A;  3GUJ A;  3ZPR A;  4N4Y B;  3QJU B;  1OWZ A;  1JTM A;  5H2L A;  1C6M A;  3VVK A;  1L40 A;  1LW9 A;  3SN6 R;  1D3N A;  1C8S A;  1KW5 A;  3UG9 A;  4ARM B;  3UZA A;  4BEY A;  3HH4 A;  162L A;  3NS0 A;  3QJV B;  1D3J A;  1KNI A;  4BV0 A;  1QKP A;  4L35 A;  218L A;  187L A;  1QUO A;  3C83 A;  2QPE B;  1L91 A;  4DAJ A;  209L A;  2F2Q A;  4G7Q B;  1LPY A;  4Y9H A;  1KY0 A;  2CUU A;  1JGJ A;  1L72 A;  2KSY A;  2YDV A;  3G3V A;  4JQ6 A;  2NTU A;  2I20 A;  1CWQ A;  2RBS A;  190L A;  5AX1 A;  4AMI A;  1DYF A;  1CV6 A;  2RBP A;  2HPY A;  1KG8 A;  1JFP A;  1C68 A;  1L16 A;  2IGC A;  1L11 A;  4I7J A;  1L08 A;  158L A;  1NHB A;  215L A;  3PBL A;  5DHG A;  3DKE X;  120L A;  1B6I A;  3CAP A;  2QB0 B;  160L A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5LVG A;  1LYG A;  200L A;  5IDD A;  240L A;  2B6Y A;  1KIP C;  2A4T A;  4KLY A;  1QUT A;  1L82 A;  225L A;  4I7L A;  2G4P A;  4YEN A;  170L A;  205L A;  242L A;  1L33 A;  2D4J A;  2H9J A;  1PS5 A;  1V7S A;  1P8I A;  1L28 A;  1JTT L;  1BQL Y;  1GFV A;  1CV3 A;  2BQE A;  1B5X A;  4J4Q A;  1DYD A;  3E3D A;  3ZEV A;  1GFA A;  1BGI A;  1LZN A;  1WQO A;  1JJ3 A;  2M3G A;  3EH4 B;  174L A;  142L A;  2I21 A;  5G36 A;  3RU5 A;  4NGL A;  3ZEK A;  2F93 A;  1C6B A;  1DI4 A;  5D5C A;  3W6E A;  128L A;  1DI5 A;  1QT4 A;  1RJC B;  3L64 A;  2ZIK A;  2ZWB A;  2DQA A;  5F9X A;  5T3F A;  1XGT C;  2YBH A;  1L95 A;  1LSD A;  1TDY A;  1B7M A;  1OUC A;  2RH1 A;  1NBY C;  1XSF A;  3HAQ A;  2Y00 A;  1L29 A;  5G2D A;  4G4B A;  1BRD A;  1Z55 A;  2IFF Y;  5B1F A;  1GFG A;  149L A;  4EPF A;  1L43 A;  3LZT A;  1L68 A;  3W6F A;  5A3Z A;  252L A;  3PXO A;  4I7M A;  2MEH A;  1XJT A;  1L26 A;  1UUZ C;  3S3D B;  5KXX A;  262L A;  1LGU A;  1C6N A;  1SWY A;  1GFK A;  1L61 A;  1OQM A;  3A95 A;  1V7T A;  4DDC A;  1DKJ A;  2MEG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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