3UQNA

Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with oxamic acid at 1.9 angstrom resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
TIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from Acinetobacter baumannii complexed with Oxamic acid at 1.9 Angstrom resolution
rcsb
source organism Acinetobacter baumannii
total genus 112
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2011-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uqnA00
2V5LA 2F84A 1KM5A 1Z41A 4MJMA 4RV8A 5E93A 2Y7GA 3LM7A 3TMQA 3W87A 3TU9A 1VH7A 3A24A 1RQEA 1H60A 5C6MA 1XM3A 3ABRA 4O0ZA 1EPXA 3TCEA 1I45A 1UASA 4MUZA 4FXSA 2EF9A 1OG0A 3NOEA 3DENA 5AHEA 3LRMA 2ZRWA 2CW6A 3HGSA 3O16A 3HQ1A 5D2XA 2R94A 3PM6A 3I7QA 5EA9A 3WK3A 3L5LA 4JXCA 4CNNA 2J88A 3NL5A 3TIMA 3FFSA 1MZHA 1A5SA 1J4EA 1JCLA 2WNNA 2TRSA 3G1AA 1M7PA 1B9BA 2ZA2A 1LZOA 1ZENA 1SW0A 1J2WA 4QSHA 2RFGA 1OYBA 4OGZA 2P1FA 3UWYA 3ZFHA 3DAQA 5EY5A 1XBZA 1KV8A 1K7FA 1KFCA 1GVOA 5EMUA 5AYZA 3NPWA 5BOOA 5K7JA 5CZSA 4ORIA 5AHIA 3STGA 2V9DA 3SSJA 4JTIA 3UNDA 1DJQA 1LROA 3FKKA 1EA0A 4QAIA 4OWGA 4WY0B 1CI1A 1SSDA 3SW6A 3GIYA 2FDSA 4TO8A 4AB4A 2Y7FA 2ZFAA 2GUUA 2E5BA 4AH7A 3G8EA 2CZ5A 3W7GA 1FXPA 1E51A 2NWRA 1LP6A 1QDSA 3LHVA 2C16A 2Q8LA 5I3FA 3P74A 1SW3A 1ZCOA 2VFGA 1UUOA 1XXXA 4LWWA 4KFNA 4ICNA 3TXZA 3VKJA 4N9EA 2E09A 1AMKA 3N14A 3W7LA 3Q58A 2V2CA 2NX3A 2XFWA 3ZR4A 1TJPA 1V7YA 2ZZ4A 3C3NA 4LS1A 2C14A 3W73A 3W75A 4X22A 2QAPA 3EXRA 4JTSA 3S5NA 1X1ZA 1TPB1 4TIMA 3QSTA 4NVTA 2BXVA 4NT0A 2P10A 1W0MA 4O16A 4HSNA 4QM1A 2ISWA 4WY0F 2VOMA 4UC5A 4ADSA 3NQ2A 1RQBA 1U83A 4O17A 5F4XA 4O1DA 3FKRA 3N34A 1D3GA 2NX1A 3HF3A 5KZMA 3L2IA 1YYAA 3GDRA 1HL2A 3MHFA 2QUUA 3OA3A 4LVGA 2V2HA 2FPTA 5K2ZA 1M5WA 3CC1A 5EKYA 1VLWA 2BSLA 4DPPA 1K8ZA 3BO9A 3M44A 4JYDA 2C6QA 1DORA 4LT9A 4Z1DA 3RK8A 1BEUA 5DCEA 3W9ZA 3LCHA 4ZQOA 3NZRA 2ZZ5A 3PBYA 3A5FA 2F7FA 3R8RA 4DBEA 3I7SA 3WJWA 4O54A 4DF1A 3A22A 3QEZA 4MZ8A 3C2VA 4QQ3A 3GXNA 2E77A 4A22A 4GXMA 1H5YA 3S5YA 3TSBA 1FBAA 4WJEA 3USBA 3I7RA 3TH6A 4O11A 1R30A 3M5ZA 1BWLA 3ATYA 1W31A 1TV8A 1TV5A 4LOCA 3MI2A 2HSAA 3FLUA 3DKLA 4WZHA 4UFIA 3LHWA 1VRDA 3NL2A 2VFDA 3PF3A 3T55A 3CB8A 1EX5A 4H4IA 4D2JA 4UFLA 2DZWA 3W1QA 1K8XA 3LTPA 3I68A 3W23A 1JVNA 1VCGA 1V5XA 2RDWA 4O14A 2CFFA 4ADUA 1SZGA 3BGJA 4O1CA 1TPH1 3CPRA 3EWBX 4UTUA 3BW2A 2E6AA 1O94A 3FJLA 1WYIA 3GVGA 1F05A 4NZJA 4HNUA 3PUEA 5D38A 1TV7A 2H6RA 4AF0A 2V30A 1KA9F 3BLFA 4UFJA 4GUHA 3TROA 4R7JA 1O5KA 3ABSA 5L6UA 1L2UA 4BWLC 4XZ9A 3HG2A 4M5PA 1VR6A 1H7RA 2ZYFA 5HWJA 3W1RA 5A8GA 2QJIA 3NQDA 4MLRA 4POCA 1FQ0A 1TPDA 1XBXA 3CU2A 2B7PA 3P8IA 3F4WA 3W7HA 4N2YA 3M41A 3W2JA 2WOQA 3WK1A 3QPZA 2NUWA 4NXSA 5LNRA 3GNDA 4RX0A 4O13A 4UTMA 4IXXA 3M9YA 4GE8A 3TC6A 1IF2A 3KRSA 4AHQA 2YYTA 2QJGA 3Q94A 3P84A 5DY3A 4M6QA 4RCXA 3DKJA 3HPZA 1KTNA 4PTNA 4JY8A 3JRKA 3GLCA 3PBWA 4MZ1A 4FX6M 4IMEA 4RJEA 3TV8A 4LV4A 3TA6A 1X6UA 2A2IA 4OBTA 3DH7A 1PIIA 4IWWA 3A5VA 3DFOA 3HO8A 2HS8A 1TQJA 1W56A 3L5AA 3UWVA 3EX2A 4K39A 4ZVJA 2FIQA 2VEIA 2V0TA 3G1HA 3G0SA 4L4MA 5FEXA 4DO6A 3DFNA 3V1PA 3KVMA 1XC4A 3KVLA 4BWLA 4CQAA 5D30A 1SW7A 1WDWA 3IVTA 1Z42A 4N4PA 2VC6A 4O10A 4U28A 3O6CA 3FJ6A 2GVJA 2VELA 3IV3A 2A85A 1B3OA 3PSWA 4MYAA 2X2GA 4FXRA 1P0NA 1S5VA 2TYSA 3LX9A 3BVJA 3TW7A 2V2DA 3UYCA 1VGAA 3L0NA 1YTEA 1JUBA 1R46A 3G3DA 3S0CA 5CSRA 4O8RA 4LRSA 2CLIA 4N9DA 1YDNA 5LZLA 3DBPA 5AOUA 1QPRA 1HO4A 4YCOA 1LOLA 3CTLA 1JRBA 3QH2A 2E6FA 3ABQA 3HG4A 1G6CA 1GYLA 3G1FA 3PSVA 5I3KA 4XUGA 3O15A 2G5WA 1IGSA 4N9BA 4R53A 1C29A 1GVFA 3LLFA 3FYOA 3UD6A 1B4KA 3G24A 3MI6A 4ALDA 1GVQA 1ZAIA 1H63A 1A5BA 4Y96A 4JD4A 4RR4A 1XBVA 1WA3A 3NM3A 5F2LA 3STFA 4JTUA 4WXYA 4LVFA 4JICA 3PG8A 5AYXA 3C0JA 5J5RA 1XBYA 2ATSA 2OX1A 5CZTA 3KVKA 3R13A 2C3ZA 4JN6A 3W70A 4K7YA 1TTPA 2ZRYA 3NNTA 1DBTA 4MY1A 3LTYA 1KFLA 1GZGA 4O50A 3THQA 5L9FA 2J24A 2ALDA 1EUAA 1I8JA 1UUMA 3MUXA 3BW4A 2V81A 3WK0A 3O6YX 1QOPA 2QF7A 2H90A 1VCVA 3HOJA 1G4EA 1H51A 3CWNA 1P0KA 1N55A 2VENA 4O52A 4U4MA 4ORMA 4WUIA 3T44A 1OVDA 5HMSA 1L6SA 2ABBA 1ZJIA 4KWWA 3UWZA 1SZEA 3PB2A 3WJYA 5C5YA 4GC4A 3W7DA 3UZJA 3W1UA 3W7MA 3B0UX 2WSYA 3IEBA 3NQ8A 4Y6GA 5D03A 1T0OA 3H55A 4UTIA 3EWXA 3L66A 4AWSA 1PL9A 3W7QA 4JTEA 4RKAA 5I3GA 4IXHA 5EL1A 1B57A 3LHTA 2Z2UA 1ICPA 1DKWA 1GVRA 1TB3A 4KFPA 2B7QA 3TC7A 2ZTKA 2A1YA 4GFSA 2ZRVA 3NQAA 4M6VA 4JR5A 3SIZA 1TSIA 2ZA1A 1F76A 4FF7A 1DOSA 1OK6A 5TQLA 3WJSA 3N73A 4R33A 2FB2A 1M6JA 4O12A 2DZXA 3CM4A 2YSWA 4TX9A 3FIGA 3KOFA 3B8DA 2C1HA 3C6CA 1VLIA 2JBMA 1AK5A 1SSGA 1ADOA 3PBVA 1FCVA 3O1NA 1R2TA 4NNAA 4HKPA 2Y70A 4RZ5A 5D37A 1NAL1 2EGZA 2GQ9A 4JTTA 2Y88A 3QW4B 1QPNA 4O1BA 1H7NA 4DF2A 3EX6A 3C56A 1OFEA 3RNDA 3IIZA 1OHLA 2ABAA 4XKYA 1SUXA 1L6YA 1FWWA 3W2KA 2WPBA 2Y61A 3LHYA 2W79A 4XWUA 5IM51 2BWGA 3HPSA 3FS2A 1YPIA 5FI8A 1LTDA 3EXSA 1UBSA 1QPQA 2TPSA 2YCEA 3PS7A 2X1SA 3Q37A 1GQNA 3P62A 1DHPA 1C8VA 4UNLA 2BZNA 1KLZA 2B0MA 4HNTA 2Z1BA 1KM3A 2NUXA 4DBDA 1FCQA 3IIOA 1JQXA 4JYEA 3RLUA 1KV5A 4S2CA 3TE9A 2OCZA 2C0AA 1NVMA 4NJIA 4WQ6A 2X1RA 1LBMA 2Y62A 2ZRZA 4WD0A 4WX2A 4JX6A 4LS2A 4MJZA 1QFEA 1DJNA 5CZ0A 1IIGA 1SR9A 4UFHA 4MOZA 3KVJA 3K30A 4YLWA 1TYGA 3H54A 1VS1A 2CZDA 3LCLA 3NPXA 3UPWA 2HTMA 3MWAA 1KLYA 1OFAA 1I2OA 1LBLA 3TUUA 1GJPA 3P60A 4UIOA 3P5YA 2ISVA 4ZQRA 3NZ1A 3DHFA 2QDGA 3SI9A 3BV4A 5F2MA 2CU0A 4E2BA 5C54A 2HMCA 1G4SA 1GWJA 2V82A 5K4XA 3GDMA 5DCBA 1RV8A 4KKXA 1OX5A 4YL2A 3W72A 4UMCA 2W0UA 3DFSA 3F4NA 4LU0A 3W22A 3FA5A 4DQWA 4E0CA 1KFBA 4L4LA 4MY8A 3IGXA 4C1LA 1GG0A 3JR2A 3F03K 1TPUA 1AL8A 2IQTA 4AVFA 2CZEA 2NV1A 3G1VA 3QPYA 3QZEA 3OEXA 4ADTA 4Z08A 1LDCA 4ONVA 1LBFA 4LVDA 3W71A 2E6YA 1CX9A 2PCQA 3C2FA 1K03A 5D2YA 5TBOA 4RXFA 2B4GA 2YZRA 3T7VA 3T40A 1VJIA 2Y6ZA 1TIMA 1S5WA 3M43A 2YX0A 4AHOA 3R12A 3W7RA 5LNVA 1FY6A 5KTLA 4CQ9A 2WNZA 1YTDA 4HNVA 1NEYA 5LNWA 4LNYA 3BG3A 3OHIA 4PEKA 1SO5A 1XI3A 1TPVA 3VE7A 5CG7A 3ABOA 3OVQA 4NU7A 1JUEA 3C61A 5KSWA 3P7YA 4HIBA 4KFOA 3HG5A 1O5XA 3O06A 1A53A 3NEVA 3RMJA 2ZRXA 3BLIA 1WXJA 3PUOA 1HUVA 4EOUA 1OFRA 4LV9A 4S2BA 2DU2A 1B4EA 3A9IA 5KZEA 4H6KA 1A5AA 3LV6A 1WV2A 3IVSA 3TFXA 2C19A 3O63A 3NAVA 1H61A 3L0GA 7TIMA 3B06A 3BG9A 1ME8A 5CKSA 3T4CA 2HS6A 3PWAA 4GBUA 2AGKA 3TQKA 5SWUA 2NXGA 2VFFA 1XL9A 4FNQA 2QCGA 3DU0A 1FUYA 5CPMA 3UY8A 5C55A 4NJKA 4JTLA 1UCWA 3IRDA 1Q6QA 1F74A 4EIVA 2Z0IA 1GTEA 3W3OA 2A6LA 1A5CA 1Q6OA 4FIQA 4GNJA 3AO0A 3SGZA 2NWSA 4FNUA 3W2NA 3PR2A 1SU5A 2EPHA 2FJKA 3TQVA 4K36A 1A50A 1W3TA 4WXZA 3G8RA 3MP3A 2UV8G 2QAFA 3W1XA 4FNRA 3CWOX 3NL3A 4FB7A 1Q6RA 4GUGA 4HPXA 3M7WA 3EWZA 4AF0B 4AEOA 1W3NA 5KINA 3DHDA 3S1XA 2Q3OA 1W8SA 1PE1A 4WOZA 4IPJA 1DL3A 4OE7A 3NQCA 3SR7A 3W7IA 3RLVA 1JRCA 2Y85A 1G4TA 2PURA 3M47A 3KHJA 2X1TA 1ZAHA 3BARA 4NJGA 3SY5A 5HWMA 4XQ6A 1K7EA 4GUIA 1PS9A 2NUYA 1G69A 1VYRA 4JX4A 4EWND 4S1FA 3W7JA 3G1SA 2YYUA 3S42A 1TRDA 4TU1A 3UPBA 3EKZA 1IXOA 1MO0A 3EWUA 4Z0JA 2X1UA 3RF9A 4PFMA 2LLEA 3UXAA 1LLZA 2DZPA 2PC4A 1YADA 3BLEA 4FNPA 1VHCA 1PHQA 5E0KA 3C4UA 2Y63A 1JCJA 4N02A 3FEMA 2YFOA 2W6RA 3IVUA 1D3HA 3IGUA 1BTMA 1OX4A 3EKLA 1ZNNA 2I9EA 5FF0A 3B05A 4R34A 1XCFA 4ZQCA 1I2NA 3M16A 5G4EA 2YGYA 1ZALA 2A6NA 1FDZA 2R8WA 3MMTA 2OT1A 1R47A 1OF8A 4MLJA 1O4UA 5DBUA 4QJ1A 2J9YA 4BFAA 2QUTA 1KTCA 4Y8FA 2JKAA 2ZZ2A 3W2MA 2ZCGA 1C9DA 2EKCA 3B0VC 2QEZA 2X30A 2CLLA 2GVLA 3KX6A 2A7NA 4X3ZA 3S1UA 2QKFA 3R2GA 2WSRA 3LCGA 3DFPA 3LXCA 4AAJA 4RLIA 3LXAA 4Z0SA 2DP3A 5CSSA 3M5YA 1TTIA 1YXCA 1TCDA 2NX9A 4JS3A 4PL2A 3W7EA 1WAUA 4PCFA 3RFAA 3HGOA 4UNKA 1DQXA 1SQ7A 1F5ZA 4MIMA 2WSQA 1KW1A 2JGYA 1PVNA 1Q45A 3W2LA 1GPWA 1SZFA 3BG5A 4JTFA 1O60A 4A3UA 1XFBA 1H7PA 2QCLA 3QF0A 2NZLA 4UUIA 2I1OA 2QUVA 3GDKA 1JCNA 1NFBA 3GB6A 2QCDA 3THAA 1OX6A 3R5EA 3LGEA 1I4NA 3R89A 3WJZA 5ABTA 2OJPA 4CQ8A 3MBDA 4M7SA 1FWRA 1X1OA 3N2XA 4UR8A 2G95A 1L6WA 3VE9A 5FF3A 2ZA3A 1NSJA 5D32A 4DXVA 1JQVA 3BK0A 5HJLA 3VI2A 1TTQA 4IMDA 3CIWA 1YPFA 1QAPA 5FEWA 1TRIA 1J5TA 1RD5A 3SFKA 2D73A 3OVPA 4ML9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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